散发性结直肠癌4号染色体长臂的杂合缺失分析

目的:通过在4号染色体长臂高频杂合缺失(LOH)位点寻找结直肠癌相关的肿瘤抑制基因.方法:荧光标记的微卫星引物与83例结直肠癌的肿瘤和正常组织进行聚合酶链反应(PCR).PCR产物在ABI 377DNA测序仪进行电泳分析,用Genescan 3.7和Genotype 3.7软件进行扫描及LOH分析.LOH结果与临床、病理因素进行χ2检验.结果:4号染色体长臂(4q)的平均LOH率为28.56%,发现明显的2个高频LOH区间,一个在D4S3000和D4S2915位点之间(4q12～21.1);另一个在D4S407和D4S2939位点之间(4q25～31.1).在D4S3018位点,肿瘤直径>5 cm的LOH明显高于直径<5 cm的LOH(56% vs 13.79%.P=0.01).在D4S1534位点.肝转移的LOH明显高于未发生肝转移的患者(80% vs17.25%,P=0.012).结论:2个4号染色体长臂的高频杂合缺失区域4q12-21.1、4q25-31.1可能存在散发性结直肠癌发生、发展相关的肿瘤抑制基因.     

结直肠癌的杂合性缺失研究进展

染色体上特定位点遗传物质的丢失是肿瘤发生的通常特征，此区域有抑癌基因的存在：近年来杂合性缺失(LOH)在肿瘤基础研究方面应用渐广．现综述其在结直肠癌中的研究进展，阐明LOH与结直肠癌的发生、临床病理因素及预后等方面的关系．     

结直肠癌的杂合性缺失研究进展

染色体上特定位点遗传物质的丢失是肿瘤发生的通常特征,此区域有抑癌基因的存在.近年来杂合性缺失(LOH)在肿瘤基础研究方面应用渐广.现综述其在结直肠癌中的研究进展,阐明LOH与结直肠癌的发生、临床病理因素及预后等方面的关系.     

胃癌7号染色体长臂的杂合性缺失分析

目的:检测胃癌患者7号染色体长臂微卫星位点的杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH),以初步确定7号染色体长臂上与胃癌相关基因连锁最密切的微卫星多态位点及LOH的临床意义.方法:在70例原发性胃癌中应用多重PCR技术扩增覆盖整个7号染色体长臂的9个微卫星位点(平均遗传距离为10cm),聚丙烯酰胺凝胶电泳分离PCR产物,用GeneScan、Genotyper软件进行分析.结果:9个微卫星位点的LOH均可发生于原发性胃癌,总的LOH频率为34.3%(24/70),其中D7S486和D7S798位点的LOH频率较高,分别为24.0%(12/50)和19.2%(5/26);总的LOH频率随临床分期而显著增高(P=0.046),D7S486位点的LOH频率在淋巴结转移者显著高于无淋巴结转移者(P=0.015).结论:在7号染色体长臂D7S486和D7S798位点附近,可能存在与胃癌发展相关的抑癌基因.     

散发性结直肠癌患者5号染色体杂合缺失分析

目的：探讨散发性结直肠癌患者5号染色体上与抑癌基因相关的杂合缺失（LOH）情况,并探讨新的抑癌基因位点,方法：对83例散发性结直肠癌患者基因组DNA,以15个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物（平均遗传距离12．67cm)扩增相应的微卫星位点,用ABI PRISM 377测序仪进行基因扫描,统计各位点杂合缺失率。结果：在15个微卫星位点中,平均杂合缺失率为25．80％,5p中最高为D5S416,占48．15％,5q中最高为D5S471,占38．71％,D5S471周围的3个位点（D5S428,D5S2027 和 D5S2115）也存在高频的杂合缺失（＞30．00％）,结论：5号染色体上存在着高频的杂合缺失,其中5q13.3-31.1区域中,有与结直肠癌发生密切相关的APC,MCC,CTNNA1及IL家族等基因,而在5p15.1上的D5S416的杂合缺失率高达48．15％,此区域至今尚未发现与结直肠癌相关的基因位点,估计可能有未知的抑癌基因存在。     

肺癌6号染色体长臂的杂合性缺失研究

目的 检测原发性肺癌中6号染色体长臂的杂合性缺失。方法 应用PCR－SSLP－银染的方法,选用6号染色体长臂上的5对多态性微卫星标记,对36例原发性肺癌进行了杂合性缺失的研究。结果 36例肺癌中有19例至少在一个位点发生LOH,占52.8％,其中有1例同时在三个位点（D6S310、D6S314、D6S281）发生杂合性缺失。5个位点的LOH频率分别为：16.7%、13.9%、19.4％、5.6%和19.4％。结论 6号染色体长臂的杂合性缺失在原发性肺癌中是常见的染色体改变,并且在丢失的位点附近有一种或几种肿瘤抑制基因与人类原发性肺癌的发生与发展相关联。     

散发性结直肠癌D10S1265位点的杂合缺失分析

目的:染色体上某特定位点遗传物质的丢失是肿瘤发生中的常见现象,抑癌基因的杂合缺失是结直肠癌形成中的关键步骤之一.本实验通过对83例散发性结直肠癌中D10S1265位点杂合缺失的研究,探讨其在结直肠癌演变中的作用.方法:荧光标记的多态性微卫星引物D10S1265与83例结直肠癌的肿瘤和正常组织进行PCR反应.PCR产物在ABI Prism 377自动荧光测序仪电泳3h,以GeneScan3.1和Genotyper 2.1软件进行扫描以及杂合缺失分析.其结果与临床病理因素进行卡方检验.结果:D10S1265位点(10q24.3)的杂合缺失率是50.0%,肝转移的7例未发现LOH,无肝转移病例达58.97%(23/39,P=0.014),但与淋巴结转移无关.另外,此位点的杂合缺失与Dukes'分期显著相关(P=0.013),与其他临床病理因素无关.结论:D10S1265位点附近可能存在与散发性结直肠癌有关的抑癌基因,此基因与结直肠癌的进展和肝转移相关.     

胃癌8号染色体等位基因杂合性缺失及其临床相关性研究

近年来，人们认为染色体上等位基因缺失或失活是肿瘤形成和演进的一个重要机制。应用从人类染色体上分离出的克隆──Ｄ８Ｓ７作为探针，采用ＳｏｕｔｈｅｒｎＢｌｏｔ方法检测了２０例胃癌病员的癌组织及其相应的癌旁组织基因组ＤＮＡ８号染色体等位基因杂合性丢失（ＬＯＨ），结果发现，２５％（５／２０）的胃癌组织以及１５％（３／２０）的癌旁组织中存在染色体８Ｐ上等位基因缺失或丢失，早期和晚期胃癌均存在这种分子遗传学改变，提示人类８号染色体短臂上存在肿瘤抑制基因，此基因正常等位基因缺失或丢失参与胃粘膜细胞癌变及其胃癌的演化和进程。     

肝癌1号染色体等位基因杂合性缺失及临床意义

研究肝癌１号染色体等痊基因杂合性缺失（Ｌｏｓｓ ｏｆ ｈｅｌｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔｙ,ＬＯＨ）及临床意义。方法采用ＰＣＲ及微卫星多态技术,对６５例肝癌１号染色体上２８个微卫生标志位点杂合性缺失进行检测。结果：６５例肝癌中６３例为杂合子,５７例至少在１个微卫星标志位点上发生ＬＯＨ,１号染色体ＬＯＨ率为９１％（５７／６３）,１ｐ７６％（４８／６３）,１ｑ８８％（５２／５９）;１ｐ３６．３２－ｐ３６．３３     

散发性结直肠癌1号染色体短臂遗传位点杂合缺失

目的：抑癌基因的杂合缺失（loss of heterozygosity，LOH）被认为是结直肠癌形成的关键步骤之一。本实验研究了结直肠癌1号染色体短臂杂合的缺失情况，并探讨其临床意义。方法：选取11个微卫星DNA标记与83例结直肠癌病例的肿瘤和正常组织进行PCR。PCR产物在ABI Prism 377自动荧光测序仪上进行电泳，以GeneScan3．1和Genotyper 2．1软件进行遗传位点扫描以及杂合缺失分析。结果：1号染色体短臂的平均杂合缺失率为18．00％，D1S468（1p36．33—36．31）位点的杂合缺失率最高，达36．54％。D1S2726位点的杂合缺失现象主要存在于直肠癌，缺失率为28．57％（6／21），而结肠癌的缺失率为0．00％（0／33），二者差异具统计学意义（P=0．002）。结论：在1号染色体短臂上可能存在与结直肠癌发生相关的抑癌基因，位于1p36．33—36．31这个区域。     

Prognostic Value of Loss of Heterozygosity around three Candidate Tumor Suppressor Genes on Chromosome 10q in Astrocytomas

We thoroughly examined loss of heterozygosity (LOH) around three candidate tumor suppressor genes on chromosome 10q to determine whether LOH of each tumor suppressor gene is associated with the previously defined clinical prognostic indices. We also examined whether LOH can help predict prognostic variables in astrocytomas.We selected samples from 40 astrocytomas (grades 2–4), performed Ki-67 immunostaining, and counted positive cells. Using DNA from aliquots of tumor blocks and leukocytes, we investigated LOH around the PTEN, NEURL, and DMBT1 genes (10q23.3–26.1) with the silver staining procedure. We then statistically evaluated the relationship among histological features, regional LOH on chromosome 10q, and survival. The mean survival period for patients with LOH around PTEN was 7.2 months after surgery, while that for patients without LOH around PTEN was 21.4 months. Thus, LOH around PTEN was closely associated with a reduced overall survival (p = 0.0020) but LOH at NEURL or DMBT1 was not (p > 0.05).The combined features of an increase in histological grading and Ki-67-positive cells and the presence of LOH around PTEN significantly correlated with poor prognosis. These factors may be useful predictors of survival, and LOH analysis of tumor suppressor genes on chromosome 10q can contribute greatly to the treatment of patients with astrocytoma.     

人结肠癌染色体1q杂合性缺失分析

目的揭示人结肠癌1q杂合性缺失与临床病理特征的关系。方法应用15对微卫星标志结合PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳等技术检测人结肠癌染色体1q杂合性缺失。结果检测发现人结肠癌染色体1q至少1个位点存在杂合性缺失的占74.2%（69/93）;平均缺失频率为17.7％,缺失频率较高的微卫星有D1S413、D1S305等,分别为34.62%、43.75%;缺失图谱分析显示常见缺失区域位于D1S2878~D1S2346(1q21.3~1q23.2)及D1S413~D1S249(1q31.3~1q32.1)之间。最小缺失区域为D1S413~D1S249,大约7.1cM的遗传距离。1q LOH(loss of heterozygosity, LOH)频率与癌细胞分化程度相关,低分化结肠癌的LOH频率显著高于高分化及中分化结肠癌（P<0.05）。结论人结肠癌染色体1q31.3 ~1q32.1及1q21.3~1q23.2区域频繁发生LOH,在这些区域附近可能存在与结肠癌相关的抑癌基因;结肠癌1q LOH率与癌细胞分化程度相关。     

Loss of Heterozygosity on Chromosome 13q: Suggestion of a Candidate Tumor Suppressor Gene in Sporadic Breast Cancer

In order to corroborate the assumption that a candidate tumor suppressor gene is located on chromosome 13q21-22 between D13S1313 and D13S162, we examined loss of heterozygosity of six microsatellite markers in this region in 98 sporadic breast tumors. Our data demonstrate that loss of heterozygosity at 13q21-22 is not solely caused by genetic changes in BRCA2, but is also attributable to another gene in this region. There is strong indication of a new tumor suppressor gene located between D13S1313 and D13S162, most probably adjacent to D13S1308, which could play a role in sporadic breast cancer.     

急性白血病7q杂合性缺失和微卫星不稳定性研究

目的探讨等位基因杂合性丢失及微卫星不稳定性在白血病发病过程中的作用及意义。方法采用PCR-非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和硝酸银染色技术，选择位于7q多态微卫星标志序列引物探讨急性白血病等位基因杂合性丢失（LOH）现象。结果在D7S487位点LOH发生率为3．0％（1／33），D7S523发生率为6．1％（2／33），D7S515发生率为15．2（5／33），D7S636发生率为9．1％（3／33），在33例患者中无1例出现微卫星不稳定性（MSI）。20例正常对照标本中无1例出现LOH和MSI。结论7q区域可能存在肿瘤抑制基因（TSG）参与急性白血病的发生发展。     

食管鳞状细胞癌染色体13q12-13 杂合性丢失

 目的 分析食管鳞状细胞癌（ESCC）在13号染色体长臂12—13区（13q12—13）上的等位基因杂合性丢失（LOH），以期寻找13q12-13区上可能存在的与ESCC有关肿瘤抑制基因（TSG）的缺失区域。方法 用8个位于13q12—13区的微卫星标志物，对56例ESCC患者进行PCR-LOH分析，56例ESCC患者包括34例有上消化道癌家族史，22例无上消化道癌家族史。结果 56例ESCC患者中，48例（86％）显示一个或更多位点LOH；并发现一个LOH高频率区，位于位点D13s267和D13s219之间，物理距离仅有2．83Mb；在位点D13S1242有上消化道癌家族史组LOH为68％，明显高于无上消化道癌家族史组的18％，（P=0．003）；在位点D13S289有上消化道癌家族史组LOH为82％，明显高于无上消化道癌家族史组的31％（P=0．008），有显著意义。结论 研究提示染色体13q12-13的LOH可能在食管癌发生发展中起重要作用，在染色体13q12-13区上，可能存在一个或多个与ESCC发生发展有关肿瘤抑制基因（TSG）。     

食管鳞状细胞癌染色体13q12-13杂合性丢失

目的分析食管鳞状细胞癌(ESCC)在13号染色体长臂1213区(13q1213)上的等位基因杂合性丢失(LOH),以期寻找13q1213区上可能存在的与ESCC有关肿瘤抑制基因(TSG)的缺失区域。方法用8个位于13q1213区的微卫星标志物,对56例ESCC患者进行PCRLOH分析,56例ESCC患者包括34例有上消化道癌家族史,22例无上消化道癌家族史。结果56例ESCC患者中,48例(86%)显示一个或更多位点LOH;并发现一个LOH高频率区,位于位点D13S267和D13S219之间,物理距离仅有2.83Mb;在位点D13S1242有上消化道癌家族史组LOH为68%,明显高于无上消化道癌家族史组的18%,(P=0.003);在位点D13S289有上消化道癌家族史组LOH为82%,明显高于无上消化道癌家族史组的31%(P=0.008),有显著意义。结论研究提示染色体13q1213的LOH可能在食管癌发生发展中起重要作用,在染色体13q1213区上,可能存在一个或多个与ESCC发生发展有关肿瘤抑制基因(TSG)。     

脑胶质瘤中EGFR基因扩增和10号染色体杂合性丢失的研究

目的：探索素皮生长因子受体（ＥＧＦＲ）基因扩增及１０号染色体杂合性丢失（Ｌ０Ｈ１０）与胶质瘤发生、发展的关系。方法：采用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ印迹杂交和ＲＦＬＰ方法对５５例各种类型的脑胶质瘤的ＥＧＦＲ基因扩增和１０号染色体杂合性丢失情况进行检测分析。结果：１７例Ⅲ－Ⅳ级恶性星细胞肿瘤中的７例（７／１７），１例髓母细胞瘤（１／１０），１例极性成胶质细胞瘤（１／５）和１例室管膜母细胞瘤，存在ＥＧＦＲ基因的扩     

PTEN/MMAC1 Mutation and Frequent Loss of Heterozygosity Identified in Chromosome 10q in a Subset of Hepatocellular Carcinomas

Frequent allelic losses on chromosome 10q have been reported in several types of cancers, suggesting the presence of a putative tumor suppressor gene(s) on the chromosomal arm. We examined loss of heterozygosity (LOH) on chromosome 10q in 37 hepatocellular carcinomas (HCC) using eleven dinucleotide microsatellite markers, spanning the entire chromosome arm of 10q. Twelve (32%) out of 37 informative cases showed allelic losses of at least one locus on 10q and eight tumors showed a partial deletion of 10q. Analysis of deletion mapping of these eight cases identified two commonly deleted regions within the distal part of 10q (10q24-q26), a 20-cM interval flanked by D10S597 and D10S216 and a 24-cM interval flanked by D10S216 and D10S590. Moreover, we detected a somatic missense mutation (Met→Val) of a candidate tumor suppressor gene PTEN/MMAC1, located at 10q23.3, in one HCC with LOH of 10q. Our findings indicated the presence of putative tumor suppressor gene(s) in the distal region of 10q that might be involved in the development and progression of HCC. Inactivation of PTEN/MMAC1 gene located outside the commonly deleted region of 10q might also play an important role in a subset of HCCs.     

Loss of Heterozygosity for Loci on Chromosome Arms 1p and 10q in Oligodendroglial Tumors: Relationship to Outcome and Chemosensitivity

Oligodendroglial tumors frequently have deletions of chromosomal loci on 1p and 19q. Loss of heterozygosity (LOH) of chromosome 10 may be a negative prognostic factor. We reviewed 23 patients with oligodendroglial tumors, to evaluate the frequency of 1p and 10q LOH and correlate with clinical outcome. Three loci (D1S402, D1S1172, MCT118) on 1p and 2 loci (D10S520 and D10S521) on 10q were analyzed for LOH using PCR techniques. Sixteen oligodendrogliomas (6 low grade and 10 anaplastic) and 7 oligoastrocytomas (1 low grade and 6 anaplastic) were studied. Overall 14/22 (64%) showed 1p LOH and 7/23 (30%) showed 10q LOH. Of 7 patients with some response to chemotherapy, all showed 1p LOH and none had 10q LOH. Of 5 patients with stable or progressive disease, 1 had 1p LOH and 2 showed 10q LOH. The presence of 1p LOH was significantly associated with response to chemotherapy (p = 0.02). Median progression free survival (PFS) was 31 months for 1p intact patients and 118 months for the 1p LOH group (p = 0.014). Median PFS for 10q LOH patients was 31 and 118 months for patients with intact chromosome 10 (p = 0.016). 1p LOH is a predictor of response to chemotherapy and a good prognostic factor. 10q LOH is less common in oligodendroglial tumors but predicts for worse outcome. Molecular genotyping of oligodendroglial tumors is recommended as part of the standard diagnostic workup.