Has-miR-204的生物学信息分析及研究进展

MicroRNA(miRNA)是一类由 21 ～ 25 个核苷酸组成的非编码蛋白质的单链小分子 RNA,它们广泛存在于真核生物中,在物种进化中相当保守,其表达具有组织特异性和阶段特异性.miRNA 基因通常位于基因间或内含子区域,在核内由 RNA 聚合酶 II 转录产生具有帽子结构多聚腺苷酸尾巴的初级 miRNA(primary miRNA,Pri-miRNA).     

基于生物学信息分析及推测PCGEM1在前列腺癌中的表达分子调控网络

非编码 RNA,包括以 miRNA、siRNA 和 piRNA 等为代表的短小 RNA 和长链非编码 RNA（long non-coding RNA,lncRNA）。长链非编码 RNA,有别于其他小分子非编码 RNA,是目前非编码 RNA 研究的热点。随着研究的不断推进,人们发现 lncRNA 与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等都有着密切的联系[1]。miRNA 是一类长度为21~25个核苷酸（nt）的单链 RNA,属于非编码蛋白 RNA,广泛存在于生物界,miRNA 调节人类1/3基因的表达,miRNA 是一类新发现的基因调节剂,可以在转录水平或转录后水平调节基因的表达,在肿瘤的发生与发展中扮演着“癌基因”与“抑癌基因”的角色[2]。前列腺癌基因表达标记1（prostate cancer gene expression marker 1, PCGEM1）全长1643 nt,在前列腺组织及前列腺癌组织中呈特异表达的长链非编码 RNA,但其表达调控网络目前未知[3],本文旨在运用生物学软件对其进行生物学信息分析,为下一步实验验证其表达分子调控网络机制提供线索。     

妊娠时间生物学的研究进展

与妊娠相关的时间生物学研究不断涌现,这些研究成果渐成系统,催生了时间生物学新的亚领域妊娠时间生物学。本文从妊娠的各个时间段对众多的研究成果加以综述,并探讨该领域前景及临床可研究的方向。     

RNA聚合酶Ⅱ启动子shRNA表达载体构建的研究进展

一系列研究表明,一些小分子RNA操纵着许多细胞功能,它们通过互补序列的结合反作用于DNA,从而关闭或调节基因的表达。RNA是生物体内最重要的物质基础之一,它与DNA和蛋白质一起构成生命的框架。microRNA（miRNA,即微小RNA）可以通过与特定mRNA结合或调节特定mRNA的蛋白质翻译过程来调控基因表达。目前人类基因组中已确认的miRNA有几百个,可能参与30％人类蛋白质的表达调控。     

Flt3配基的生物学特性研究进展

Flt3配基(FL)是一种新近发现的、能够刺激早期造血的细胞因子。该因子通过与造血干细胞表面酪氨酸激酶受体3(Flt3)结合,刺激造血干细胞的增殖和分化,增加淋巴细胞、树突状细胞(DC)、自然杀伤(NK)细胞及体外长期培养的干细胞等的数量。若与其它造血细胞因子合用,FL的作用可以得到明显加强。最近的研究还发现,FL通过促进体内DC、NK细胞、细胞毒T细胞(CTL)的增殖、分化和成熟,发挥抗肿瘤作用。本文对FL的基因克隆及蛋白质结构作一简单介绍,并重点对近年来FL生物学特性研究状况作一综述。     

DNA甲基化分析技术的研究进展

在生物中 ,特别是在真核生物中 ,DNA甲基化已成为阐明正常和病理基因表达现象的重要机制 ,因而已成为当前分子生物学的研究热点之一。由之而产生的 DNA甲基化分析技术也有了长足的发展。目前至少已报道了三类 10种此类技术。而近几年迅速发展起来的以 HSO3-转化为基础的各种 DNA甲基化检测技术 ,因其具有简便可行、准确灵敏等诸多优点 ,最令人瞩目。本文仅就这些方法的原理、灵敏度和准确性以及应用作一简要的综述     

骨性关节炎滑膜病变的生物信息分析

目的：通过生物信息分析探索骨性关节炎中滑膜组织的基因变化。方法：从GEO数据库中获取GSE55235和GSE12021数据,分析数据得到差异表达基因（DEGs）。再对DEGs进行功能富集分析、蛋白互作网路分析、hub基因分析等。最后分析预测与hub基因相关的转录因子和miRNA,构建互作网络。结果：通过分析得到249个DEGs,再对其进行功能富集分析发现炎性反应、细胞外基质和细胞外区域以及TNF信号通路有更多的基因富集。此外,从DEGs中筛选出10个hub基因,进行转录因子和miRNA分析,得到242个转录因子和212个miRNA与之相关。结论：对OA滑膜组织的差异基因分析,不难发现,在OA的发展过程中,滑膜组织的基因发生明显的变化,并主要涉及炎性调控、炎性反应等过程。同时预测了可能与一些关键基因相关的转录因子和miRNA,进一步揭示了分子调控网络。     

长链非编码RNA与胃癌的关系研究新进展

长链非编码RNA（10ngnon—codingRNA,LncRNA）是调节性非编码RNA之一,转录本长度〉200nt,表达具有时空特异性,无明显可读框,不编码蛋白质。在细胞质,会影响RNA稳定性和miRNA活性;在细胞核,主要调控基因转录和mRNA剪接。根据与最近编码蛋白质基因的关系,LncRNA可分为五类：     

Smad3基因siRNA表达载体的构建及沉默效应

背景：研究提示抑制Smad3可望抑制纤维增生和胶原的大量产生。 目的：构建针对Smad3基因的siRNA表达载体,观察RNA干扰对增生性瘢痕成纤维细胞Smad3基因表达的抑制作用。 方法：根据siRNA设计原则,设计3条针对Smad3基因的siRNA靶序列,分别合成两条互补的寡核苷酸链,退火后与载体pRNAT-U6连接,然后进行酶切鉴定和DNA序列测定。用脂质体包裹转染增生性瘢痕成纤维细胞,荧光定量PCR和Western blot方法检测Smad3基因的表达情况。 结果与结论：测序分析结果显示：克隆入pRNAT-U6载体的针对Smad3基因的siRNA的双链寡核苷酸片段插入正确;荧光定量PCR和Western blot检测显示：转染的增生性瘢痕成纤维细胞Smad3基因的表达水平明显降低,尤以AGA CAG ACT GTG ACC AGT A(1156)为靶序列的siRNA沉默作用最强,抑制效率于转染后48 h可达45%。证实实验构建的沉默增生性瘢痕成纤维细胞Smad3基因表达的siRNA载体获得成功。     

人脐带间充质干细胞生物学特性及其研究进展

背景：人脐带间充质干细胞是一类具有自我更新和多向分化潜能的成体干细胞,具有来源丰富,对供者无影响,易于采集和运输,无异体排斥反应,避免伦理争议等诸多优点。 目的：综述人脐带间充质干细胞的生物学特性及其应用进展。 方法：以“人脐带间充质干细胞,生物学特征,基因分析,诱导分化, human umbilical cord mesenchymal stem cells(hUMSCs),biocharacteristics, gene analysis,induce differentiation”为关键词应用计算机检索CNKI数据库、万方数据库、PubMed数据库文章。 结果与结论：人脐带间充质干细胞呈典型的成纤维状,其表达的表面标志抗原具有非单一性,高表达间质细胞标志、整合素受体,不表达造血系标志、协同刺激分子CD80、CD86 和CD40、人白细胞抗原HLA-DR,HLA-G,HLA-DP,HLA-DQ、内皮标志CD31或CD33、CD14、CD56等。人脐带间充质干细胞与造血干细胞和胚胎干细胞类似,在体外可以分化为骨细胞、软骨细胞、肝细胞、心肌细胞等;在体内可以分化为多巴胺能神经元、骨骼肌细胞、内皮细胞、胰岛细胞等。但人脐带间充质干细胞的研究仍存在亟需解决的问题,如分离方法、培养条件的规范化,如何控制其生长和分化等。     

Hyper-IL-6的结构与生物学功能研究进展

利用基因工程技术,将具有相互作用的两种细胞因子重组为一种独特的融合细胞因子,这种分子往往可发挥超越单因子的生物学活性和/或具有其它特殊生物学功能.Hyper-IL-6是Fischer等依据已知的关于膜结合和可溶性白细胞介素6受体（sIL-6R）的结构信息设计的一种“设计细胞因子”（Designer cytokines），即将IL-6基因与截短形式的sIL-6R基因通过基因操作共价连接，     

组织特异性表达基因PLUNC调控元件的生物信息学分析

目的分析组织特异性表达基因PLUNC的调控元件。方法采用进化足迹法,结合生物信息学工具,预测PLUNC基因的顺式作用元件和反式作用因子。结果预测的PLUNC基因的转录起始位点位于-1～＋10bp区域间、-29bp存在TATA盒子,启动子集中在-490bp～＋89bp内,在人和小鼠PLUNC基因的启动子保守区内存在29个共同的转录因子结合部位及5个增强子。结论PLUNC基因调控元件的分析可为探讨上呼吸道特异性表达基因的调控机制提供模型。生物信息学技术结合进化足迹法,在基因表达调控机制的研究中具有重要的应用价值。     

长链非编码RNA MEG3对肿瘤细胞调控作用的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200 nt的不编码蛋白的RNA分子。lncRNA最初被认为是转录噪音,在近年的研究中发现越来越多功能性的lncRNA,其重要性才渐渐被阐述。母系表达基因3(materally expressed gene 3,MEG3)是一种由母系印记基因编码的lncRNA,在对其功能的研究中发现MEG3几乎参与了所有的生理和病理过程,其在多种肿瘤中表现出抑制作用。本文就lnc RNA MEG3对肿瘤细胞调控的作用机制作一综述。     

土拨鼠α干扰素新亚型基因的克隆及生物学活性分析

目的 克隆土拨鼠α干扰素（IFN-α）新亚型基因，用于土拨鼠HBV模型探索IFN-α治疗慢性乙型肝炎策略；调查慢性土拨鼠肝炎病毒（woodchuck hepatitis virus，WHY）感染的土拨鼠外周血单个核细胞（PBMC）干扰素功能状况。方法 poly（I-C）体外刺激正常和慢性WHV感染的土拨鼠PBMC，分析其表达的干扰素生物学活性。利用分子克隆技术对土拨鼠IFN-α家族基因进行克隆，并对所克隆的系列基因进行测序、分型并进行真核表达后检测表达产物生物学活性。结果 poly（I-C）刺激体外培养的土拨鼠PBMC后，慢性感染土拨鼠PBMC分泌的干扰素的活性显著差异低于正常土拨鼠（P〈0．01）。获得36个土拨鼠IFN-α基因序列克隆，测序分析后，发现有10个克隆是新亚型基因，其中8个为功能基因亚型，2个为假基因亚型，病毒保护试验证明只有功能基因亚型具有生物学活性。结论 慢性WHV感染的土拨鼠细胞免疫功能受损。新的土拨鼠IFN-α亚型基因的克隆为在土拨鼠HBV动物模型上进行干扰素基因治疗和研究干扰素治疗策略提供了新的材料。     

恶性肿瘤中MNX1反义RNA 1的作用及机制研究进展

<正>长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是一类广泛存在于细胞核和细胞质内、长度在200 nt以上、缺少开放阅读框、不参与或很少参与蛋白质编码、主要从蛋白编码基因的反义链及间隔区转录出来的RNA^[1-6]。已有大量研究证实,lnc RNA涉及调控多种生物学功能,比如细胞增殖、凋亡及血管生成^[7-9]。表达异常的lnc RNA与诸多肿瘤的发生发展密切相关^[10-11]。     

长链非编码RNA的功能及与心血管病的研究进展

真核基因组经转录产生了上万种无或少有蛋白编码能力的长链非编码RNA（longnon—codingRNA,lncRNA）。lncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的功能性RNA分子,它们参与表遗传学的调控,转录及转录后的修饰等,还有一部分lncRNA是小RNA产生的前体。虽然lncRNAs的功能和作用机制尚不完全清楚,但是已有一些研究显示lncRNAs参与心血管疾病的发展,其表达水平的改变可能成为一种新的诊断标志。此文就lncRNA的功能及其在心血管病方面的最新研究进展作一综述。     

微RNA调控间充质干细胞成软骨分化的研究进展

间充质干细胞（mesenchymal stem cells,MSC）来源于胚胎时期的中胚层组织,具有自我更新修复和向软骨、骨、韧带、肌腱等多种组织定向分化的能力,因此在软骨组织工程中,MSC是理想的种子细胞来源。MSC成软骨分化过程受遗传和表观遗传机制调控,此外,越来越多的研究显示微RNA（microRNA,miRNA）在MSC成软骨分化过程中亦扮演着非常重要的角色。miRNA是一类具有组织特异性或发育阶段特异性表达特征的非编码调控RNA,参与调控30％以上的蛋白质编码基因,广泛影响细胞的增殖、分化、凋亡及个体生长发育。近来miRNA与软骨形成的关系受到关注,本文就miRNA在MSC成软骨分化过程中的双向调节作用进行综述。     

急性髓系白血病患者血清lncRNA DANCR、lncRNA SNHG7表达及与病理特征、预后的关系

目的 探究急性髓系白血病(AML)患者血清长链非编码RNA抗分化非编码RNA(lncRNA DANCR)、长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因7(lncRNA SNHG7)表达及与病理特征、预后的关系。方法 选取2017年10月至2018年10月期间在本院就诊后出院的120例AML患者记为AML组,另选取120例在本院体检的志愿者记为对照组。观察并记录所有参与者年龄、性别、AML形态学分型等临床指标。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测lncRNA DANCR、lncRNA SNHG7表达量;t检验方法分析lncRNA DANCR、lncRNA SNHG7表达差异及其与病理特征的关系;Pearson相关性分析二者表达水平的相关性;根据二者表达水平均值将AML患者分为lncRNA DANCR高表达组(n=65)和lncRNA DANCR低表达组(n=55)及lncRNA SNHG7高表达组(n=74)和lncRNA SNHG7低表达组(n=46);Kaplan-Meier法进行生存分析。结果 AML患者lncRNA DANCR、lncRNA SNHG7水平显著高于对照组(P<...