非小细胞肺癌中FHIT基因异常甲基化对其蛋白、mRNA表达的影响

背景与目的 脆性组氨酸三联体(fragile histidine triad,FHIT)是一种新的抑癌基因,其启动子甲基化在肿瘤的发生和发展过程中发挥重要作用.本研究的目的 是通过检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中抑癌基因FHIT启动子CpG岛异常甲基化和蛋白、转录表达情况及其相互关系,探讨FHIT基因在NSCLC发生发展中的作用.方法 应用甲基化特异性PCR(Methylation-specific PCR,MSP)、免疫印迹(Western Blot)及RT-PCR测定52例NSCLC组织及其癌旁正常组织(>5 cm)中FHIT的甲基化、蛋白表达和转录水平.结果 NSCLC癌组织中FHIT甲基化率为38.46%(20/52),在癌旁正常组织中FHIT甲基化率为7.6996(4/52),两者差异存在统计学意义(P<0.05);癌组织中FHIT蛋白表达率为28.8%(15/52),癌旁正常组织FHIT蛋白表达率为88.5%(46/52),两者差异存在统计学意义(P=0.000);FHIT mRNA在癌组织中表达率为51.9%(27/52),在癌旁正常组织中全部表达,且表达量明显高于癌组织(P=0.000).结论 在NSCLC中,FHIT基因启动子甲基化频率明显升高,其蛋白表达率明显下降,mRNA表达率下降,提示FHIT启动子甲基化在肺癌的发生和发展中起着一定作用,而且FHIT基因的甲基化与蛋白及mRNA的表达存在一定的关系.     

甲基化导致SOCS3表达下调与NSCLC淋巴结转移和临床病理分期相关

背景与目的已有的研究结果表明:细胞因子信号通路抑制因子3(suppressor of cytokine signaling 3,SOCS3)能够抑制细胞过度生长、诱导凋亡,具有维持细胞稳定的作用。本研究的目的旨在探讨SOCS3在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达,及其与淋巴结转移和临床病理生理特征的关系。检测NSCLC组织中SOCS3基因甲基化状态,分析SOCS3表达与基因甲基化的关系。方法应用Western blotting方法检测30例NSCLC和癌旁肺组织中SOCS3的表达。应用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测SOCS3基因甲基化状态。采用免疫组化SP法,检测90例NSCLC组织中SOCS3的表达,分析其与淋巴结转移和临床病理参数的关系。结果30例NSCLC组织中SOCS3的表达显著低于癌旁肺组织(平均灰度值分别为26.3±12.3和78.4±14.5,P=0.000)。NSCLC组织中SOCS3基因甲基化阳性率为(20/30)66.7%,癌旁肺组织为(4/30)13.3%,SOCS3表达下调或缺失与基因异常甲基化相关(r=0.454,P=0.012)。90例癌旁肺组织上皮细胞均有SOCS3表达,NSCLC组织中SOCS3阳性表达率为(41/90)45.6%,淋巴结转移组SOCS3阳性表达率(35.4%)低于无淋巴结转移组(57.1%,P=0.039),Ⅲ期NSCLC中SOCS3阳性表达率(36.4%)低于I Ⅱ期(60.0%,P=0.028)。SOCS3的表达与组织学类型和分化程度等临床病理参数无关(P>0.05)。结论基因异常甲基化导致SOCS3在NSCLC组织中表达下调,并与NSCLC淋巴结转移和临床病理分期相关。     

PTEN基因甲基化及其表达异常与胃癌的关系

目的：探讨PTEN基因表达、启动子区甲基化与胃癌及其临床病理特征的关系。方法：采用甲基化特异性PCR法（MSP）和逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）法，分析胃癌组织及相应癌旁正常组织中PTEN基因启动子区甲基化及其mRNA表达情况。结果：48．2％（27／56）的胃癌组织和3．6％（2／56）的癌旁胃组织PTEN基因启动子区发生甲基化．癌组织PTEN基因启动子区甲基化率显著增高（P〈0．05）：其中，2例甲基化癌旁胃组织均为胃癌组织中有甲基化的病例．发生淋巴结转移的29例胃癌组织中．19例PTEN基因启动子甲基化；发生淋巴结转移的PTEN基因启动子甲基化显著高于无淋巴结转移组（P〈0．05）。RT—PCR结果显示，所有甲基化的胃癌组织中PTEN mRNA均无表达，结论：胃癌中PTEN基因mRNA失表达与其启动子区甲基化有关，这可能是胃癌发生、发展以及转移的原因之一。     

胃癌组织及相关淋巴结中端粒酶逆转录酶基因启动子区域甲基化检测的临床意义

[目的]检测胃癌患者肿瘤组织及其相应的癌旁组织和淋巴结组织中端粒酶逆转录酶(hTERT)基因启动子区域甲基化状态,并探讨其甲基化状态的改变与临床病理特征的关系.[方法]运用甲基化特异性PCR(MSP)方法,检测52例手术切除胃癌组织、癌旁组织及相关淋巴结中hTERT基因启动子区域甲基化状念、以同一标本正常组织作为阴性对照.[结果]正常胃黏膜组织未检测出hTERT表达、胃癌组织及癌旁组织、转移淋巴结中均检测出hTERT表达.转移淋巴结、胃癌组织中hTERT基因的甲基化阳性率分别为81.6％(31/38)、71.1％(37/52),明显高于癌旁组织的29.5％(13/52)(P＜0.01).胃癌组织hTERT基因甲基化阳性率与胃癌的临床分期、组织分化程度、肿瘤大小有相关性(P＜0.05).癌旁组织hTERT基因甲基化阳性率和胃癌的临床分期、肿瘤大小、组织分化程度、淋巴结转移具有相关性(P＜0.05).转移淋巴结hTERT基因 甲基化阳性率则与临床及病理特征无关.[结论]胃癌组织及转移淋巴结中存在hTERT基因启动子区域的异常甲基化调控、可能参与了胃癌的发生与发展.     

非小细胞肺癌组织MGMT基因启动子过甲基化与临床病理特征相关性的研究

目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织中DNA修复酶O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)过甲基化状况与临床病理特征的关系.方法:甲基化特异性PCR(MSP)检测120例病理确诊的非小细胞肺癌组织及癌旁正常肺组织和30例病理确诊为肺炎症组织中MGMT的甲基化状况.结果:120例NSCLC组织中MGMT基因启动子甲基化率(35%)显著高于癌旁正常组织甲基化率(5%,P<0.05),亦显著高于30例正常肺组织中甲基化率(0,P<0.05).NSCLC中MGMT基因启动子过甲基化状态与淋巴结转移、TNM分期、吸烟史、肿瘤分化程度有关(P值均<0.05),与患者年龄、性别、病理组织类型无关(P值均>0.05).结论:在NSCLC中,MGMT基因启动子甲基化可能与肺癌的发生、发展相关.     

食管鳞状细胞癌组织Bin1基因启动子甲基化状态及其临床意义

目的:探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)患者的食管鳞癌组织、癌旁组织中Bin1基因启动子甲基化状态及其mRNA的表达及其临床意义.方法:采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分别检测58例经病理证实的ESCC患者的食管鳞癌组织、癌旁组织中Bin1基因mRNA的表达情况;用甲基化特异性PCR(MSP)检测上述食管鳞癌组织中Bin1基因启动子甲基化状态,比较ESCC患者Bin1甲基化状态与临床病理分期的关系.结果:ESCC组织中Bin1基因启动子甲基化率明显高于癌旁组织(58.62％ vs 25.86％,x2=12.76,P＜0.01),Bin1甲基化状态与患者TNM分期、肿瘤侵润深度、分化程度、淋巴结转移相关(均P ＜0.05).ESCC组织中Bin1 mRNA的表达水平明显低于癌旁组织[(0.78 ±0.05) vs (1.03±0.03),t=9.643,P＜0.01)];发生Bin1甲基化的组织中Bin1 mRNA表达水平明显低于未发生甲基化的组织[(0.68±0.04) vs (0.85±0.07),t=2.476,P＜0.05].结论:Bin1基因启动子区甲基化状态可能与ESCC的发生密切相关,它是ESCC中Bin1 mRNA低表达或缺失的机制之一,且与ESCC进展和淋巴结转移有关.     

非小细胞肺癌组织中Apaf-1基因表达及启动子区甲基化研究

目的:探讨Apaf1基因表达及启动子区甲基化在非小细胞肺癌(nonsmallcelllungcancer,NSCLC)发生中的作用。方法:应用免疫组化、半定量RTPCR和甲基化特异性PCR方法分析45例NSCLC及癌旁正常对照组织中Apaf1(apoptoticproteaseactivatingfactor1)基因的表达及启动子区甲基化情况。结果:60%(27/45)NSCLC组织Apaf1表达明显下调,与癌旁正常组织相比差异有统计学意义,P=0.0005。在Apaf1基因表达明显下调的27例NSCLC中19例出现甲基化,表达水平无明显变化的18例NSCLC中5例出现甲基化;二者对比差异有统计学意义,P=0.005。45例癌旁正常对照组织未检测到Apaf1基因启动子甲基化,提示启动子区甲基化是Apaf1基因表达下调的主要原因。结论:Apaf1基因与NSCLC相关,启动子区甲基化是该基因失活的重要机制。     

肺癌患者EGFR基因启动子甲基化状态研究

目的:探讨肺癌组织中EGFR基因启动子的甲基化水平及甲基化状态与EGFR外显子突变的关系.方法:应用聚合酶链技术、基因克隆测序技术和荧光偏振技术,检测肺癌患者病理组织中EGFR基因启动子的甲基化水平.结果:76例肺癌组织中EGFR基因启动子甲基化阳性者23例,检出率为30.3％,甲基化状态与肺癌患者的性别、年龄、吸烟史、淋巴结转移、浸润程度和TNM分期均无明显相关性,与患者的病理类型密切相关,吸烟对甲基化的相对危险度(OR)为1.88,40例NSCLC患者中,29例未检测到敏感突变的患者中有10例甲基化为阳性,甲基化率为34.5％,而11例TKI敏感突变的患者中均未检测到甲基化.结论:肺癌患者EGFR基因存在启动子甲基化,EGFR外显子的突变状态与启动子甲基化有密切关系.     

肝细胞癌ASC基因启动子区甲基化及其mRNA表达研究

目的:探讨肝细胞肝癌(HCC)ASC基因启动子区甲基化与mRNA表达及其临床病理特征的关系.方法:运用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和实时荧光定量PCR技术,检测58例肝细胞癌及其相应癌旁组织、15例肝硬化肝组织、5例慢性病毒性肝炎肝组织和5例正常肝组织中ASC基因启动子区甲基化状态及其mRNA的表达水平.结果:58例肝细胞癌组织中有40例(69.0%)发生ASC基因启动子区甲基化,其相应癌旁组织中有27例(46.6%)发生该基因启动子区甲基化,而在肝硬化、肝炎和正常肝组织中均未检测到该基因启动子区甲基化.ASC基因在肝细胞癌组织中甲基化频率高于其相应癌旁组织(P=0.015).ASC基因启动子区甲基化与肿瘤直径(P=0.001)、生长方式(P=0.003)以及国际抗癌联盟第6版TNM(TNM6)分期(P=0.001)有关.以ASC基因在正常肝组织中的表达量为参照,58例肝细胞癌组织中有33例出现ASC基因mRNA低表达或表达缺失,其相应癌旁组织中有14例出现低表达或表达缺失,而在肝硬化及肝炎肝组织中ASC基因mRNA均呈正常表达.与癌旁组织相比,肝细胞癌组织中ASC基因mRNA表达明显下调(P<0.05).在发生ASC基因启动子区甲基化的40例肝细胞癌组织中有26例出现mRNA低表达.结论:ASC基因启动子区甲基化是肝细胞癌中的频发事件,可能在肝细胞癌的进展中起重要作用.     

乳腺癌Runx3基因启动子甲基化状态及其与病理特征的关系

目的探讨乳腺癌组织中Runx3基因启动子甲基化状态及其与乳腺癌临床病理特征之间的关系。方法 2007年2月至2009年4月收集经病理确诊的56例乳腺癌患者癌组织及相应的癌旁组织。采用甲基化特异聚合酶链反应检测Runx3基因启动子区CpG岛的甲基化状态,并检测其对Runx3基因表达的影响和分析其与乳腺癌临床病理特征之间的关系。统计学分析采用χ2检验和Pearson相关分析法。结果乳腺癌组织中Runx3基因启动子区CpG岛甲基化率(55.4%)显著高于癌旁组织中的甲基化率(10.7%),二者之间差异有统计学意义(χ2=25.225,P=0.000)。Runx3基因的异常甲基化和乳腺癌患者的临床分期及淋巴结转移有关(P=0.018,P=0.010),但与患者的年龄、肿瘤直径大小及组织学类型无关(P0.050)。Runx3mRNA表达与Runx3启动子甲基化呈弱相关(r=0.343,P=0.010)。结论 Runx3基因启动子甲基化状态导致Runx3基因mRNA表达降低或缺失。Runx3基因启动子区甲基化可能是导致Runx3基因在乳腺癌中失活的分子机制之一。