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目的 分析2014-2017年甘肃省酒泉市外环境中禽流感病毒监测结果,为人感染H7N9禽流感预警和防控提供依据。方法 采集酒泉市各县(区)集贸市场活禽销售点的不同类型标本,应用实时荧光聚合酶链式反应方法进行检测,并进行统计学分析。结果 共检测外环境标本1 091份,流感病毒核酸阳性率为21.17%(231/1 091);H9N2、H7N9及两者混合阳性分别为162、51、18份,未检出H5亚型病毒。2014-2016年流感病毒核酸阳性率分别为3.23%、22.05%和31.32%,均为H9N2亚型,2017年阳性率为19.31%,其中H9N2、H7N9及两者混合阳性分别为阳性76、51、18份。城乡活禽市场流感病毒阳性率最高(30.14%),其次规模养殖户(11.79%)和家禽屠宰加工场所(10.23%)。不同类型标本中,清洗禽类的污水检出率最高,宰杀或摆放禽肉案次之,禽类饮水最低,均差异有统计学意义(P<0.001)。在禽类外环境中检出H7N9核酸阳性后通过主动监测,检出甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例。结论 甘肃省酒泉市2014-2017年每年均检出禽流感H9亚型,H7N9仅在2017年检出,外环境禽流感监测结果是人感染H7N9疫情预警的重要依据;应加强监测。 相似文献
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目的 测定浙江省丽水市1株H7N9禽流感病毒8个基因序列,从分子水平分析其基因特征和遗传变异特点。方法 对人感染H7N9禽流感确诊病例标本在P3实验室进行犬肾传代细胞培养;反转录-聚合酶链反应扩增病毒8个RNA片段后测定基因序列;通过生物信息学软件将8个序列与GISAID和GenBank数据库下载的序列进行多重比对和匹配,发现基因特征,分析病毒关键位点的分子变异情况,最大似然法绘制系统进化树用于基因进化分析。结果 从病例标本中分离到病毒:A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9),测序获得8个基因核苷酸全序列。HA裂解位点只包含2个碱性氨基酸,HA蛋白受体结合关键氨基酸位点发生A134T、G186V和Q226L变异;在PB2蛋白上发现E627K突变;M2蛋白上发现耐药位点S31N。LS01株HA基因与A/chicken/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9)的同源性最高(98.90%),NA基因与A/chicken/Changzhou/C08/2013(H9N9)的同源性最高(98.60%),LS01株其他6个编码内部蛋白的基因均与禽源H9N2株高度同源(99.10%~99.89%)。LS01株HA和NA基因与沪苏浙一带流行的H7N9禽流感病毒株位于同一亚分支,有着直接的进化关系,在相近地域有进化关系较近的禽类流感病毒存在。结论 A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株8个基因序列均符合禽源H7N9亚型禽流感病毒特征,其病原基因均为禽类来源。HA裂解位点具有低致病性禽流感病毒基因特点,Q226L和E627K位点发生变异可能与其对人具有高致病力相关。 相似文献
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目的对H9N2禽流感病毒分离株进行全基因进化特征分析,为禽流感的防控提供研究数据。方法对24株2017-2019年广州市禽类市场H9N2禽流感毒株进行测序,通过生物信息学软件,分析全基因组遗传进化特点。结果24株H9N2病毒核苷酸同源性为86.20%~100.00%,核苷酸进化距离为0.00~1.54,其中HA基因的核苷酸和氨基酸进化距离变化最大,其次为PB2基因。遗传进化分析显示,所有毒株各基因在系统发生树上聚为一簇,属于G57基因型。分子特征分析显示,所有毒株属于低致病性禽流感病毒,在HA蛋白受体结合位点均发生Q226L突变,提示H9N2更容易识别人源受体。在HA-N166D、PB2-L89V/292V、PB1-I368V、L473V、PA-K356R、S409N、M1-N30D、T215A、NS1-P42S等致病性相关位点上,大部分毒株发生致病性增强突变。耐药性上,所有毒株对神经氨酸酶抑制剂敏感,对烷胺类药物耐药。结论2017-2019年期间广州市禽类市场H9N2禽流感病毒为G57基因型,该基因型病毒普遍发生与人受体结合能力增强的稳定变异,且大部分毒株发生致病性增强的突变,需加强监测。 相似文献
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目的 了解丽水市外环境H5、H7、H9亚型禽流感病毒的动态分布情况,为防治人感染禽流感提供依据。方法 对2009-2015年1月丽水市外环境标本(清洗禽类污水、禽类粪便及笼具表面等)采用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测禽流感病毒核酸,阳性者进一步检测 H5、H7、H9 亚型核酸,监测数据用 Excel 软件进行统计分析。结果 监测各类外环境场所87个,检出禽流感病毒场所28个,占32.18%,以家禽宰杀加工场所和城乡活禽交易市场的病毒检出比例最高,分别为100.00%和92.30%。不同场所来源标本病毒阳性率以家禽宰杀加工场所最高,达46.34%,其次为城乡活禽市场的23.54%,最低为家禽散养集中地区,为1.25%。H5、H7、H9 和其他未分型禽流感病毒的检出率分别为0.99%、4.08%、5.83%和 9.33%,检出的H7均为H7N9亚型。禽流感病毒检出率最高的标本为清洗禽类污水(40.00%),最低为笼具表面涂抹物(12.07%),平均检出率达19.37%。H5亚型的检出率以三季度为高;H7亚型的检出率一、四季度较高,二、三季度较低;H9亚型检出率一季度最低,四季度最高;总体上H5亚型的检出率最低。结论 丽水市城乡活禽市场与宰杀加工场所等外环境中常年有H5、H9、H7N9 等多种亚型禽流感病毒存在,有感染人的风险,应积极采取综合性防控措施。 相似文献
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目的了解H7N9禽流感病毒在人、禽间的分布情况,指导人感染H7N9禽流感防制工作。方法对2013年4月至2014年2月浙江省丽水市医疗机构发热伴呼吸道症状病例及外环境标本采用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测H7N9亚型禽流感病毒核酸,对监测结果进行分析。结果轻症流感样病例和严重呼吸道感染病例分别检测768份和605份,H7N9禽流感病毒全部阴性,不明原因肺炎病例检测92份,阳性1份,阳性率1.09%;家禽粪便标本、笼具表面涂抹物、鸡蛋外壳涂抹物及不明原因死亡家野禽咽拭子和肛拭子共检测1317份,H7N9禽流感病毒阳性22份,阳性率1.67%,阳性标本分布在4个县(区)的8个活禽交易市场。结论首次在丽水市检测到人感染H7N9禽流感病毒,并在多个县(区)的活禽交易市场外环境检测到H7N9禽流感病毒,提示H7N9禽流感病毒已在丽水市禽间传播,存在人感染H7N9禽流感病毒的风险。 相似文献
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目的 监测湖北省十堰市城乡活禽市场中禽流行性感冒(禽流感)病毒的分布状况,为人禽流感防控提供参考依据。方法 2011-2012年,设置十堰市区和郧县两个监测点,每季度从各监测点采集10~15份外环境标本(冲洗水、污水、禽类粪便及笼具表面等),累计采集210份,以实时荧光定量RT-PCR方法检测禽流感病毒核酸FluA,阳性者检测H5、H7、H9亚型核酸和N1核酸。结果 FluA、H5、H7、H9和N1的检出率依次为47.62%、19.52%、0、34.76%和17.62%。FluA检出率最高的环境标本为冲洗禽类的污水(65.22%),最低的为禽类粪便(36.62%),阳性标本多数明确来自鸡源,少数来自鸽和鸭。FluA、H5与H9的检出率均在一、三季度较低,二、四季度较高,H5检出率总体上低于H9。市区禽流感病毒核酸FluA、H5、H9和N1检出率均明显高于郧县。结论 十堰市城乡活禽市场的禽类与外环境中常年流行着H5和H9等多种亚型禽流感病毒,应积极采取综合性防控措施。 相似文献
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目的分析2014-2015年3例新型人感染高致病性禽流感(HPAI)H5N6毒株的血凝素(HA)与神经氨酸酶(NA)基因序列,探讨该病毒的遗传变异及分子生物学特征。方法收集Gen Bank、全球共享禽流感数据倡议组织(GISAID)及浙江大学传染病诊治国家重点实验室提供的H5N6病毒基因序列,利用生物信息软件MEGA6.0及Net Nglyc服务器对基因序列进行遗传进化和分子变异特征分析。结果 3例感染HPAI-H5N6患者毒株的HA与NA氨基酸序列的同源性分别为96.5%~98.7%和90.1%~98.2%;HA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014(H5N6)和A/Sichuan/26221/2014(H5N6)与A/duck/Eastern China/1111/2011(H5N2)同源性最近,分别为97.7%和98.5%;A/Yunnan/0127/2015(H5N6)与A/muscovy duck/Vietnam/LBM631/2014(H5N1)同源性最近(97.2%);NA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014(H5N6)和A/Yunnan/0127/2015(H5N6)与A/swine/Guangdong/K6/2010(H6N6)同源性最近,分别为97.2%和97.6%,A/Sichuan/26221/2014(H5N6)与A/duck/Guangdong/S3073/2010(H6N6)同源性最近(97.4%);进化树分析显示3例患者毒株处于2个不同的分支;HA基因包含有S137A、T160A等突变,糖基化分析显示有6~7个N-糖基化位点。结论新型人感染HPAI-H5N6病毒是一种重组病毒,其HA基因来源于亚洲禽类H5亚型,NA基因来源于亚洲禽类H6N6;HA基因位点突变及N-糖基化改变可能有助于增强对人类的感染。 相似文献
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目的 了解九江市2011年至2015年职业暴露人群H5N1禽流感病毒抗体水平和环境中禽流感病毒的感染状况,以期为九江市人感染高致病性禽流感的防控提供技术支持.方法 马红细胞血凝抑制试验(HI)检测禽类养殖人群H5N1血凝素抗体;real-time PCR对环境标本进行A型检测,对A阳性进一步检测H5、H7和H9亚型;结果 1340份职业人群血清H5N1血凝素抗体均为阴性;5个年度中1461份环境标本禽流感病毒核酸检测A型阳性率为30.94%,其中H5、H7、H9阳性率分别为10.47%(153/1461)、0.55%(8/1461)、21.77%(318/1461),A未分型阳性率为3.90%(57/1461).结论 九江市禽类中存在H5、H7、H9亚型感染,存在人感染高致病性禽流感的风险,应加强禽流感病毒感染监测. 相似文献
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目的 了解广东省江门市活禽市场外环境中H7N9病毒污染情况及人感染H7N9禽流感流行情况,指导H7N9禽流感防控工作。方法 于2014年1月26日至2015年2月23日,在江门市选取5个禽类批发市场和33个居民肉菜市场,以擦拭涂抹法采集活禽档口外环境粪便、地面以及各种用具表面拭子,采用荧光定量RT-PCR方法检测甲型流感病毒核酸,并对人感染H7N9禽流感疫情进行流行病学分析。结果 监测14个月中,采集样品989份,检出H7亚型阳性74份,阳性率为7.48%。鸡相关标本的阳性率最高(8.88%),鸡与其他禽种相关标本的阳性率差异有统计学意义(2=10.02,P0.05)。砧板与刀具涂抹物阳性率高于笼框内面与笼子地面涂抹物等,差异有统计学意义(2=74.39,P0.01)。冬春季(12月至次年5月)阳性率稍高,为8.44%(70/829),夏秋季(6-11月)阳性率稍低,为2.50%(4/160),二者差异有统计学意义(2=6.01,P0.05)。期间报告了9例人感染H7N9禽流感病例,1-2月发病8例。结论 江门市冬春季活禽市场外环境普遍存在H7亚型禽流感病毒污染,人感染H7N9禽流感疫情流行具有明显的季节性,冬春季为发病高峰期。 相似文献