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目的 了解2013-2014年漳州市手足口病的病原构成及分子流行病学特征,为漳州市手足口病的防治工作提供科学依据。方法 采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)方法,检测2013-2014年漳州市哨点医院送检的1421份临床诊断手足口病疑似病例的标本,进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)的核酸检测;通过RT-PCR方法,扩增VP1区基因部分片段并测序,对非EV71及非Cox A16的肠道病毒进行分型鉴定;扩增完整VP1区基因片段并测序,构建系统进化树对EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10进行基因进化分析。结果 1063份标本肠道病毒通用型阳性,阳性率为74.81%,其中222份标本EV71阳性,340份Cox A16阳性,8份EV71+Cox A16阳性,493份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性。随机抽取40份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性标本经RT-PCR和测序进一步分型,共鉴定出38份非EV71及非Cox A16的肠道病毒,其中Cox A6型25份(65.79%,25/38),Cox A10型8份(21.05%,8/38),Cox A5型1份(2.63%,1/38),Cox A4型3份(7.89%,3/38)和Cox A9型1份(2.63%,1/38)。VP1区完整基因的进化分析显示,漳州市的EV71均属C4基因亚型的C4a进化分支,Cox A16分属B1基因亚型的B1a和B1b两个分支;Cox A6和Cox A10均与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近。结论 2013-2014年漳州市非EV71及非Cox A16的肠道病毒在手足口病病原谱中占有重要位置;非EV71及非Cox A16的肠道病毒型别多样,Cox A6和Cox A10为其中的优势型别。漳州市的EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10标本在进化树上与国内地区相应分离株共进化共循环。 相似文献
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目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型(Cox A6)和A组10型(Cox A10)基因特征进行分析。方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析。结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型(EV71)阳性率为29.4%(599/2 035),柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)阳性率为25.7%(522/2 035),其他肠道病毒阳性率为44.9%(914/2 035)。对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6%(47/83),Cox A10阳性检出率为22.9%(19/83),还检测出其他肠道病毒如Cox A2(2株)、Cox A4(7株)、CB4(2株)、CB5(2株)、CB6(1株)、Echo5(1株)、Echo9(1株)和Echo25(1株)。对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1%~100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2%~100.0%。我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个(A~H)和7个基因谱系(A~G)。湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其他Cox A10位于G基因谱系上。结论 2016年湖北省部分地区手足口病病原体除了EV71和Cox A16两种主要病毒外,还检测出Cox A6和Cox A10等手足口病的病原。其他肠道病毒中以Cox A6和Cox A10为主,仍需进一步加强对其他肠道病毒的监测和分子流行病学特征的分析。 相似文献
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目的 了解2011年广东省深圳市手足口病的病原构成情况,为科学防治手足口病提供实验室依据。 方法 对2011年哨点医院上送的临床诊断为手足口病病例的粪便标本,先用荧光RT-PCR进行肠道病毒71型(Enterovirus 71, EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)以及肠道病毒核酸检测,再对肠道病毒核酸检测为阳性的标本进一步用巢式RT-PCR(RT-Nested PCR)的方法扩增片段,PCR产物测序后,通过Blast软件进行分型。 结果 409例病例中,5岁以下占93.64%,主要集中在1~2岁年龄组;5-9月为发病高峰期,11月出现一个小高峰。EV71阳性142例,构成比为43.83%;Cox A16阳性53例,构成比为16.36%;非EV71、非Cox A16的其他肠道病毒阳性129例,构成比为39.81%;129例其他肠道病毒阳性标本中,95例的序列测定结果Cox A6有69例,构成比为72.63%;Cox A10有12例,构成比12.63%; Cox A12、Cox A9、Cox A2、Cox A4、Cox B2、Cox B4、ECHO2、ECHO14和ECHO18各有少部分病例。 结论 2011年深圳市手足口病最主要病原为EV71,Cox A6次之,Cox A16位居第3位,应加强对手足口病的病原学监测。 相似文献
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目的 采用肠道病毒核酸和抗体检测,分析2015年杭州市手足口病肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)构成变化及检测方法学评价。方法 收集2015年4-8月手足口病患儿663例,采用荧光定量反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测肠道病毒核酸,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清EV71-IgM、Cox A16-IgM。结果 663例手足口病患儿通用核酸阳性组58.52%(388/663),EV71组19.16%(127/663),与2014年比较,通用核酸阳性组比例(2=166.306,P=0.000),EV71组比例(2=134.418,P=0.000)差异有统计学意义。手足口病患儿轻症487例,占73.45%,以通用核酸阳性组65.91%(321/487)为主;重症176例,占26.55%,EV71组43.75%(77/176)、通用核酸阳性组38.07%(67/176)位居前2位。不同组别出现重症的比例(2=98.395,P=0.000)差异有统计学意义,EV71出现重症比例最高,为60.63%(77/127)。病毒核酸检测和血清抗体检测阳性率比较差异有统计学意义(2=44.487,P=0.000)。其中,127例EV71阳性患儿,核酸和抗体检测双阳性率为59.85%(76/127),单阳性率为40.15%(51/127);64例Cox A16阳性患儿,核酸和抗体检测双阳性率为9.38%(6/64);单阳性率为90.62%(58/64)。以核酸定量RT-PCR为标准,EV71/Cox A16-IgM抗体特异度86.61%,敏感度69.49%。结论 2015年与2014年比较,杭州市手足口病病原学流行特征有明显变化。采用病毒核酸和抗体联合检测,可提高实验室的检测阳性率,临床分型有助于辅助指导临床治疗;通用型重症病例增多,需寻找更适合的联合检测方法。 相似文献
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目的 对山东省泰安市2007-2008年流行期流行性感冒(流感)病毒进行分离鉴定及分析,了解泰安市流感流行情况。方法 采集流感样病例(ILI)的咽拭子标本用犬肾传代细胞(MDCK)进行病毒分离,采用血凝抑制方法(HAI)进行流感病毒型别鉴定。结果 2007年10月至2008年3月共检测2所哨点医院ILI咽拭子标本281份,分离到流感病毒94株,阳性分离率为33.45%,经分型鉴定A型H3N2亚型51株,H1N1亚型1株;B型的 Yamagata系39株,Victoria系3株。结论 2007-2008流行季中,泰安市流感病毒流行的优势毒株为A型H3N2亚型和B型Ymagata系,同时有A型H1N1亚型和B型Victoria系毒株的存在。 相似文献
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目的了解2010—2011年绵阳市流感流行状况,为制定预防控制策略提供依据。方法收集绵阳市2010~2011年流感样病例(ILI)监测资料、流感病毒病原学监测结果以及暴发疫情信息进行分析。结果2010年共上报ILI12100例,ILI就诊比(ILI%)为2.72%。2011年报告ILI 8364例,ILI%为1.83%,较2010年减少32.47%。两个年度中,ILI就诊比例的时间分布均呈“双峰”型增高。病例以0岁~最多,占46.24%。发热门诊的ILI%最高,为88.56%。共采集788份ILI病例标本,核酸检测阳性标本共34份,阳性率为4.31%,包括甲型HIN1流感病毒5份(0.63%),A型未分型流感病毒8份(1.02%),季节性H3型流感病毒1份(o.13%),B型流感病毒20份(2.54%)。两年中未发生流感暴发疫情。结论2010~2011年绵阳市流感发病相对稳定,未发生较大规模的暴发流行。哨点医院ILI报告质量有待提高,流感监测网络实验室应积极准备开展流感病毒分离工作,加强对各型流感病毒的监测,以预防、控制流感的流行。 相似文献
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目的 了解浙江省奉化市手足口病患者及其密切接触者病原分布情况,分析2013-2014年手足口病疫情和病原学监测结果,为手足口病防控提供科学依据。方法 每月采集手足口病患者5例及其15名密切接触者粪便标本检测肠道病毒,同时开展住院病例病原学监测,对2013-2014年病原学监测结果和手足口病疫情进行描述性流行病学分析。结果 2013-2014年奉化市手足口病发病率分别为225.99/10万和365.07/10万;街道发病率高于乡镇;发病率最高为1岁组。病例肠道病毒A组71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)和其他肠道病毒阳性率分别为20.94%、20.42%和38.74%;2013年优势病毒为其他肠道病毒(占61.00%),2014年为Cox A16和EV71;EV71发病年龄大于其他肠道病毒(Z=-3.70,P=0.00);肠道病毒阳性病例和阴性病例的密切接触者阳性率分别为48.44%和18.75%,差异有统计学意义;不同病毒阳性病例的密切接触者其他肠道病毒阳性率在44.96%~48.15%之间,差异无统计学意义;病例与密切接触者肠道病毒以同型为主(Kappa值0.53);1~8岁密切接触者阳性率42.08%,12~66岁密切接触者阳性率31.73%,差异无统计学意义。结论 奉化市手足口病处于高流行态势,流动人口密集地区高发。多种病毒流行,优势病毒处于变化中,流行特征与病原体有关,病原监测有助于采取适当的防控措施,必要时应对其他肠道病毒开展进一步分型。密切接触者带病毒率高,应关注密切接触者管理。 相似文献
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目的了解浙江省余姚市引起手足口病的病原构成,研究Cox A16基因特征及变异情况。方法收集手足口病患者标本,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)检测并分型,每年选择几个样品进行Cox A16 VP1基因的扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用DNAstar和Blast软件进行比对分析。结果 2010—2012年从1651份标本检出柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)25.86%,肠道病毒71型(EV71)39.85%,其他肠道病毒19.38%;Cox A16 VP1蛋白氨基酸序列相似性为99.3%~100%,7株Cox A16基因分型属于B1基因亚型。结论 2010—2012年余姚市手足口病流行的主要病原体为Cox A16和EV71,流行的Cox A16属于B1基因亚型,并具有高度相似性。 相似文献
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目的了解江苏省徐州地区2009-2010年儿童手足口病流行的病原学特征。方法 2009年3-8月和2010年1-12月共采集徐州儿童医院门诊、住院及常规监测的511例疑似手足口病(HFMD)儿童患者的咽拭、肛拭标本,提取病毒RNA,用实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法同时进行肠道病毒(EV),肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16(Cox A16)的特异性基因检测。结果 511例疑似手足口病患儿的标本中,总肠道病毒阳性288例,占56.36%;288个肠道病毒核酸阳性病例中,EV71核酸阳性202例,Cox A16核酸阳性55例,构成比分别为70.14%和19.10%。≤5岁儿童感染的肠道病毒有EV71型、Cox A16型及非EV71非Cox A16的其他肠道病毒感染,>5岁儿童则只有EV71感染病例。结论 2009-2010年徐州地区儿童手足口病患儿以1~3岁儿童为主,其主要病原是肠道病毒EV71型,其次是Cox A16型。 相似文献
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目的 探讨杭州市手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型(human enterovirus 71,EV71)的分子特征。 方法 采集210例疑似手足口病感染者的粪便标本及其相关临床资料,采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real time RT-PCR)方法进行初步检测,利用RT-PCR扩增部分EV71和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, Cox A16)阳性样本VP1基因区并测序分析。 结果 荧光定量RT-PCR检测表明,210例疑似感染者的粪便中, EV71、Cox A16 和其他肠道病毒的阳性率分别为60.95%(128/210)、21.43%(45/210)和9.05%(19/210)。10株EV71病毒VP1区核酸序列与JX509922、JX509924、JX509926、JX509927、 JX509928和 JX509929的同源性最高为95.7%~98.0%,且均属于EV71中 C4a亚型。 结论 EV71和Cox A16是杭州市儿童手足口病的主要病原体。因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。 相似文献
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2006-2007年江苏省流行性感冒流行特征分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 了解2006-2007年江苏省流行性感冒(流感)流行特征。方法 收集国家级监测哨点医院的流感样病例(ILI)资料、 全省病原学分离检测结果以及流感或ILI暴发疫情资料进行分析。 结果 2006年和2007年(计1-52周)2年度,徐州、南京、无锡、丹阳4个监测点共登记ILI分别为94 231、102 099例, 流感样病例百分比(ILI%)分别为4.67%、4.87%,两构成比差异有统计学意义(I/Isup2/sup=85.18,IP/I=0.0000),其中徐州、南京、无锡、丹阳市的 ILI%分别为7.18%、5.06%、3.66%、2.00%。2006-2007年流感或ILI暴发中,采集标本进行实验室检测的为56起(94.92%),其中流感病毒阳性52起(92.86%)。实验室确诊流感暴发疫情年度分布显示:2006年主要以B型(94.12%)为主,2007年主要以A型H3N2亚型(66.67%)和B型(33.33%)为主,根据月份分布显示:所有暴发疫情均分布在1-5月和9-12月,其中1-3月是流行高峰,共45起(86.54%),病原学显示2006年1-2月全省发生大范围的B 型(Victoria系)流感暴发,2007年1月发生较大规模的H3N2亚型流感暴发。结论 2006-2007年江苏省流感活动相对稳定,但仍存在局部暴发,哨点医院的ILI和暴发疫情的病毒分离均显示A型H3N2亚型、B型Victoria系为优势毒株。流感流行季节的变化趋势及其预警机制的建立需要进一步探讨。 相似文献
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目的分析辽宁省本溪市儿童流感流行特征和流感病毒流行的规律,为流感防控提供依据。方法通过"中国流感监测信息系统"收集2009年10月至2014年3月本溪市国家级流感哨点医院流感样病例(ILI)及病毒分离资料,用描述流行病学方法进行分析。结果 2009年10月至2014年3月本溪市共报告儿童ILI病例36 108例,占同期儿科门急诊总量的8.95%。2012年6~9月达最高峰(16.60%~18.02%)。流感病毒分离阳性率5.71%,其中,季节性A(H3N2)占27.35%,新甲型A(H1N1)占43.59%、BV型占14.53%、BY型占11.11%。各监测年份流感毒株型别不同(χ^2=82.67,P〈0.01)。0~2岁、3~5岁、6~14岁年龄组人群流感毒株阳性率分别为3.62%、6.98%、6.55%,差异有统计学意义(χ^2=8.616,P〈0.05)。ILI占门急诊总数比例和流感病毒分离阳性率有相关性(r=0.027,P〈0.01)。结论本溪市儿童流感流行季节为冬春季,流行期内呈双峰分布;本溪市儿童流感呈现每隔1年流行1次的趋势,预计其2015年儿童流感流行强度会有所减弱。 相似文献
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江西省儿童医院2006-2010年度门诊病人流行性感冒监测结果分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的分析江西省儿童医院2006-2010年流行性感冒(简称流感)的病原学及流行特征。方法 2006年4月至2010年3月在本院儿内科门诊、急诊就诊的病例1 833 507例,其中流感样病例(ILI)129 062例。每周采集门诊就诊的ILI鼻咽拭子10~15份送省疾病控制中心作病毒分离鉴定。结果共统计上报ILI 129 062例,采集ILI鼻咽拭子1 796份,分离出流感病毒320株,检出率为17.82%。其中H1N1型51株(15.94%),H3N2型76株(23.75%),B型122株(38.12%),新甲型H1N1型71株(22.19%)。2009-2010年度新甲型H1N1型为流行优势株。结论 4年的流感病原学监测中发现了新的突变株,流感病毒的流行每年都发生了型别的变化。流感样病例就诊无明显季节变化,0~5岁年龄段患儿ILI就诊率高于〉5~15岁年龄段的患儿;就诊的流感患儿由H1N1型、H3N2型、B型、新甲型H1N1型流感病毒引起。 相似文献