浙江省宁海县柯萨奇病毒A组6型手足口病伴脱甲症特征研究

  目的  了解宁海县柯萨奇病毒A组6型（Cox A6）所致手足口病伴脱甲症的流行特征,为手足口病病原学监测、诊疗和预防控制提供科学依据。  方法  对2018—2019年宁海县确诊为Cox A6核酸阳性的手足口病患者病后连续24周随访观察,同时采用反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）对手足口病伴脱甲症病例脱落甲碎片标本进行核酸检测和病毒分离。  结果  感染Cox A6手足口病412例,166例出现不同数量脱甲,脱甲率为40.29%（166/412）,平均脱甲6.02个,脱甲时间越早脱甲数越多,按大拇指（趾）—食指—中指—无名指—小指顺序呈依次递减（趋势χ2=117.39,P<0.001）;脱甲时间最短7 d,最长达116 d,70%发生在15～42 d（3～6周）;指（趾）甲脱落程度不等,脱甲最多的是大拇指（趾）,脱甲右手多于左手,右脚多于左脚,指甲脱落率高于趾甲（χ2=103.61,P<0.001）,四肢指（趾）甲的总体病变率不相同（χ2=105.40,P<0.001）;RT-PCR检测脱落甲碎片Cox A6阳性率为91.67%（11/12）,未脱甲及新生甲均为阴性。 宁海县流行的手足口病伴脱甲症相关Cox A6 D3基因亚型的D3a.2分支与我国目前主要流行型别一致。  结论  Cox A6感染手足口病患者伴脱甲发生率为40%,可能是Cox A6病毒直接对指（趾）甲侵害所致,脱甲可再生。宁海县流行的手足口病伴脱甲症相关Cox A6 D3a.2分支基因亚型与我国目前主要流行型别一致。     

2017年北京儿童医院就诊北京地区疱疹性咽颊炎病例分析

目的了解北京儿童医院就诊北京地区疱疹性咽颊炎流行特征和病原学情况,为疱疹性咽颊炎的防控提供依据。方法收集2017年在北京儿童医院就诊治疗的北京地区疱疹性咽颊炎患者的基本信息及病原学监测资料,运用描述性流行病学方法进行分析。结果共纳入符合条件的疱疹性咽颊炎病例6 922例,疾病流行高峰为6 — 9月,＜5岁儿童占86.04%。 病原学监测阳性率53.42%（86/161）, 以其他肠道病毒为主（47/86,54.65%）,其次为柯萨奇病毒A组6型（Cox A6）（28/86,32.56%）,Cox A10（7/86,8.14%）,肠道病毒71型（EV71）（3/86,3.49%）和Cox A16（1/86,1.16%）。 7月阳性率最高（76.92%）,不同月份阳性率差异有统计学意义（χ2＝29.98,P＜0.05）,夏秋季病例报告数较多同时肠道病毒阳性率也较高,两者间呈正相关有统计学意义（r_s＝0.294,P＜0.05）。结论2017年北京儿童医院就诊北京地区疱疹性咽颊炎流行高峰为夏秋季,易感人群为＜5岁儿童,病原体主要为其他肠道病毒和Cox A6,引起疱疹性咽颊炎的部分肠道病毒（EV71、Cox A16、Cox A6）可同时引起手足口病,应重视疱疹性咽颊炎,参考手足口病进行疾病预防控制。     

2013-2014年漳州市手足口病的病原学特征及分子流行病学研究

目的 了解2013-2014年漳州市手足口病的病原构成及分子流行病学特征,为漳州市手足口病的防治工作提供科学依据。方法 采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应（Real-time RT-PCR）方法,检测2013-2014年漳州市哨点医院送检的1421份临床诊断手足口病疑似病例的标本,进行肠道病毒通用型、肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）的核酸检测;通过RT-PCR方法,扩增VP1区基因部分片段并测序,对非EV71及非Cox A16的肠道病毒进行分型鉴定;扩增完整VP1区基因片段并测序,构建系统进化树对EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10进行基因进化分析。结果 1063份标本肠道病毒通用型阳性,阳性率为74.81%,其中222份标本EV71阳性,340份Cox A16阳性,8份EV71+Cox A16阳性,493份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性。随机抽取40份非EV71及非Cox A16的肠道病毒阳性标本经RT-PCR和测序进一步分型,共鉴定出38份非EV71及非Cox A16的肠道病毒,其中Cox A6型25份（65.79%,25/38）,Cox A10型8份（21.05%,8/38）,Cox A5型1份（2.63%,1/38）,Cox A4型3份（7.89%,3/38）和Cox A9型1份（2.63%,1/38）。VP1区完整基因的进化分析显示,漳州市的EV71均属C4基因亚型的C4a进化分支,Cox A16分属B1基因亚型的B1a和B1b两个分支;Cox A6和Cox A10均与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近。结论 2013-2014年漳州市非EV71及非Cox A16的肠道病毒在手足口病病原谱中占有重要位置;非EV71及非Cox A16的肠道病毒型别多样,Cox A6和Cox A10为其中的优势型别。漳州市的EV71、Cox A16、Cox A6和Cox A10标本在进化树上与国内地区相应分离株共进化共循环。     

2016年湖北省部分地区手足口病肠道病毒病原谱及柯萨奇病毒A6型和A10型基因特征分析

目的 了解2016年湖北省部分地区手足口病病原谱特征,对其中的柯萨奇病毒A组6型（Cox A6）和A组10型（Cox A10）基因特征进行分析。方法 采集2016年湖北省部分地区手足口病患者阳性标本,提取病毒核酸,通过一步法反转录-PCR扩增肠道病毒VP1序列并测序,经Blast比对确定病毒基因型。对其中Cox A6和Cox A10的VP1全长序列进行同源性和系统进化分析。结果 病原学监测结果显示,肠道病毒71型（EV71）阳性率为29.4%（599/2 035）,柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）阳性率为25.7%（522/2 035）,其他肠道病毒阳性率为44.9%（914/2 035）。对该地区收集的83份肠道通用阳性的非EV71和非Cox A16进行病毒分型分析,Cox A6阳性检出率为56.6%（47/83）,Cox A10阳性检出率为22.9%（19/83）,还检测出其他肠道病毒如Cox A2（2株）、Cox A4（7株）、CB4（2株）、CB5（2株）、CB6（1株）、Echo5（1株）、Echo9（1株）和Echo25（1株）。对Cox A6和Cox A10的VP1基因同源性比对及系统进化分析显示,2016年湖北省22株Cox A6的VP1基因核苷酸同源性为95.1%~100.0%,11株Cox A10的VP1基因核苷酸同源性为95.2%~100.0%。我国与其他国家Cox A6和Cox A10可分别划分为8个（A~H）和7个基因谱系（A~G）。湖北省Cox A6与我国其他Cox A6位于H基因谱系上;湖北省Cox A10与我国其他Cox A10位于G基因谱系上。结论 2016年湖北省部分地区手足口病病原体除了EV71和Cox A16两种主要病毒外,还检测出Cox A6和Cox A10等手足口病的病原。其他肠道病毒中以Cox A6和Cox A10为主,仍需进一步加强对其他肠道病毒的监测和分子流行病学特征的分析。     

2011年广东省深圳市手足口病的病原学监测

目的 了解2011年广东省深圳市手足口病的病原构成情况,为科学防治手足口病提供实验室依据。 方法 对2011年哨点医院上送的临床诊断为手足口病病例的粪便标本,先用荧光RT-PCR进行肠道病毒71型(Enterovirus 71, EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)以及肠道病毒核酸检测,再对肠道病毒核酸检测为阳性的标本进一步用巢式RT-PCR(RT-Nested PCR)的方法扩增片段,PCR产物测序后,通过Blast软件进行分型。 结果 409例病例中,5岁以下占93.64%,主要集中在1~2岁年龄组;5-9月为发病高峰期,11月出现一个小高峰。EV71阳性142例,构成比为43.83%;Cox A16阳性53例,构成比为16.36%;非EV71、非Cox A16的其他肠道病毒阳性129例,构成比为39.81%;129例其他肠道病毒阳性标本中,95例的序列测定结果Cox A6有69例,构成比为72.63%;Cox A10有12例,构成比12.63%; Cox A12、Cox A9、Cox A2、Cox A4、Cox B2、Cox B4、ECHO2、ECHO14和ECHO18各有少部分病例。 结论 2011年深圳市手足口病最主要病原为EV71,Cox A6次之,Cox A16位居第3位,应加强对手足口病的病原学监测。     

湖北省十堰市59例柯萨奇病毒A组6型手足口病流行病学特征与临床特点分析

目的 探讨柯萨奇病毒A组6型（coxsackievirus A6，Cox A6）手足口病的流行病学特征与临床特点，为该病的诊治与防控提供参考。方法 2012年10月至2013年9月，收集十堰市570例手足口病临床诊断病例标本，以实时荧光定量聚合酶链反应（real time RT-PCR）法进行手足口病病毒核酸检测并分型，对判定为Cox A6的手足口病确诊病例，采用描述流行病学方法进行流行病学特征与临床特点分析。结果 Cox A6在手足口病确诊病例的病原构成中居第3位（占13.41%，59/440）；5岁以下儿童占100.00%，3岁以下占86.44%，散居、幼托儿童构成比为83.05%和16.95%，全市各县（市、区）全年均有发病，高峰期出现在10-11月，有1起聚集性疫情发生；所有病例在手、足、口或臀部出现皮疹，34.53%的病例出现发热，87.72%的病例出现口腔炎，26.32%的病例出现呼吸系统症状，3例白细胞计数偏高。结论 Cox A6肠道病毒可引起典型的手足口病及聚集性疫情，是手足口病的重要病原体之一，应加强监测与研究。     

2012年江西省南昌市手足口病病原学监测结果分析

目的 分析江西省南昌市2012年临床诊断为手足口病患者标本的病原学检测结果,为手足口病的临床诊治和防控提供实验室依据。方法 采用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应（real time RT-PCR）对2012年1-12月间1028例医院诊断为手足口病的患者标本核酸进行鉴定分型,并统计分析。结果 临床诊断为手足口病的患者标本1028 份中,632 份为肠道病毒通用阳性,总阳性率为61.48%,其中肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）、EV71 和 Cox A16 混合感染、其他肠道病毒阳性检出率分别为39.0%、10.21%、0.09%和12.16%。病原学检测阳性标本中男女性别比为1.8:1;发病年龄段主要集中在5岁以下儿童（94.36%）,尤其是 3 岁以下男童。结论 2012年南昌地区手足口病的主要病原体为EV71,且较2009-2011年有上升趋势。     

2015年杭州市手足口病肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型构成变化与联合检测方法分析

目的 采用肠道病毒核酸和抗体检测,分析2015年杭州市手足口病肠道病毒71型（EV71）和柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）构成变化及检测方法学评价。方法 收集2015年4-8月手足口病患儿663例,采用荧光定量反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）检测肠道病毒核酸,采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测血清EV71-IgM、Cox A16-IgM。结果 663例手足口病患儿通用核酸阳性组58.52%（388/663）,EV71组19.16%（127/663）,与2014年比较,通用核酸阳性组比例（2=166.306,P=0.000）,EV71组比例（2=134.418,P=0.000）差异有统计学意义。手足口病患儿轻症487例,占73.45%,以通用核酸阳性组65.91%（321/487）为主;重症176例,占26.55%,EV71组43.75%（77/176）、通用核酸阳性组38.07%（67/176）位居前2位。不同组别出现重症的比例（2=98.395,P=0.000）差异有统计学意义,EV71出现重症比例最高,为60.63%（77/127）。病毒核酸检测和血清抗体检测阳性率比较差异有统计学意义（2=44.487,P=0.000）。其中,127例EV71阳性患儿,核酸和抗体检测双阳性率为59.85%（76/127）,单阳性率为40.15%（51/127）;64例Cox A16阳性患儿,核酸和抗体检测双阳性率为9.38%（6/64）;单阳性率为90.62%（58/64）。以核酸定量RT-PCR为标准,EV71/Cox A16-IgM抗体特异度86.61%,敏感度69.49%。结论 2015年与2014年比较,杭州市手足口病病原学流行特征有明显变化。采用病毒核酸和抗体联合检测,可提高实验室的检测阳性率,临床分型有助于辅助指导临床治疗;通用型重症病例增多,需寻找更适合的联合检测方法。     

2009-2010年江苏省徐州市儿童手足口病病原学检测分析

目的了解江苏省徐州地区2009-2010年儿童手足口病流行的病原学特征。方法 2009年3-8月和2010年1-12月共采集徐州儿童医院门诊、住院及常规监测的511例疑似手足口病(HFMD)儿童患者的咽拭、肛拭标本,提取病毒RNA,用实时荧光定量PCR(real-time PCR)方法同时进行肠道病毒(EV),肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16(Cox A16)的特异性基因检测。结果 511例疑似手足口病患儿的标本中,总肠道病毒阳性288例,占56.36%;288个肠道病毒核酸阳性病例中,EV71核酸阳性202例,Cox A16核酸阳性55例,构成比分别为70.14%和19.10%。≤5岁儿童感染的肠道病毒有EV71型、Cox A16型及非EV71非Cox A16的其他肠道病毒感染,>5岁儿童则只有EV71感染病例。结论 2009-2010年徐州地区儿童手足口病患儿以1～3岁儿童为主,其主要病原是肠道病毒EV71型,其次是Cox A16型。     

2017-2018年浙江省温州市流感病毒检测阴性的流感样病例中肠道病毒病原谱调查

目的研究流感病毒检测阴性的流感样病例（ILI）中肠道病毒（EV）的病原谱及其主要流行病毒型,为其防治提供基础科学依据。方法收集2017 — 2018年温州市ILI,利用荧光定量PCR技术检测流感病毒甲型和乙型,流感阴性病例进行EV检测;利用反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）扩增EV的VP1区序列,扩增产物进行基因测序和基因分型。 对结果进行统计学分析,P＜0.05为差异有统计学意义。结果共调查病例2 298例,流感病毒检测阳性488例（21.23%）,流感病毒阴性 1 810例（78.76%）,其中,EV检测阳性254例（14.03%）。 EV感染全年均有发生,流行高峰为4 — 7月（70.47%）。 254例EV阳性标本中,测序成功并经基因序列比对获得基因分型的135例,可分为包含EV-A、EV-B和EV-C型的13个EV亚型,主要感染型别为柯萨奇病毒 A 组 6 型 （Cox A6）、Cox A2和Cox A10,分别占24.44%、22.22%和13.33%。 不同年份、月份、性别和年龄EV阳性率差异有统计学意义（χ2＝9.399、329.380、4.311、29.246,均P＜0.05）。结论流感病毒检测阴性的ILI中EV是主要病原体之一,其病原谱复杂。 应重点加强低年龄组病例的诊断和监测。     

2009-2011年浙江省宁海县手足口病疫情分析

目的 分析浙江省宁海县手足口病流行特征,探讨适宜的防控措施。 方法 收集国家疾病监测信息报告管理系统手足口病个案资料,采用描述性流行病学方法进行分析比较。 结果 2009-2011年宁海县共报告手足口病7217例,死亡1例;2009-2011年分别报告2648、2509和2060例,报告发病率分别为454.44/10万、425.24/10万和313.89/10万;2009年和2011年无重症及死亡病例报告,2010年报告重症3例,死亡1例。2009年和2010年手足口病病原体以肠道病毒71型(EV71)为主,2011年由EV71转化为柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)。 结论 2009-2011年宁海县手足口病疫情呈逐年下降态势,病原学由EV71转化为Cox A16,疫情具有地区持续性。     

2013-2017年广东省中山市手足口病重症病例流行病学和病原学特征分析

目的了解广东省中山市手足口病重症病例流行病学和病原学特征，为防控工作提供依据。方法对2013 — 2017年中山市报告的手足口病重症病例开展个案调查和实验室检测，采用Excel 2007和SPSS 13.0软件进行数据整理和描述性分析，率的比较用χ2检验。结果2013 — 2017年共报告手足口病重症病例209例，占手足口病病例的0.25%（209/84 021），年均发病率为1.31/10万，每年3 — 7月为发病高峰。 病例主要为1～3岁的散居儿童，占73.68%（154/209）；男性发病高于女性（χ2＝15.171，P＝0.000）；以农村的常住人口为主。 209例重症病例均有出疹，95.22%的病例有发热，皮疹类型以疱疹为主（71.29%）。 病例发病到初诊时间间隔＜3 d的占91.87%（192/209）；初次就诊时能被正确诊断为手足口病的占63.64%（133/209）；不同级别的医院手足口病诊断正确率差异具有统计学意义（χ2＝23.831，P＝0.000）。 203例手足口病重症病例采集了标本送检，阳性率为93.10%（189/203）。 病原体以肠道病毒71型（EV71）为主（118例，占58.13%），4 — 5月为检出高峰。结论中山市重症手足口病有明显的时间、人群和地区分布特征, EV71是主要病原体。 应针对其特征落实综合性的防控措施，并提高EV71灭活疫苗的接种率，以降低手足口病重症的发生率。     

2010年广东省深圳市首例手足口病死亡病例的病原学研究

目的 对广东省深圳市2010年首例临床诊断为手足口病死亡患儿的粪便和咽拭子标本进行病原体型别鉴定,从而追踪其病原的可能来源。 方法 先用实时荧光定量反转录-聚合酶链反应(rRT-PCR)方法检测病毒核酸,再用细胞培养方法从粪便和咽拭子标本中分离病毒,并将分离到的毒株提取核酸后,用普通RT-PCR方法分别扩增肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)的VP1区全长基因并进行序列测定,序列测定结果与不同国家和地区的肠道病毒株A、B、C基因型代表株进行同源性比较和进化树分析。 结果 该病例的2份标本均为EV71核酸阳性,Cox A16核酸阴性;毒株基因经过核苷酸和氨基酸同源性分析,确定该病例病原体为EV71 C4亚型。 结论 2010年深圳市首例手足口病死亡病例的病原体为EV71的C4亚型。     

2019年冬季青岛市手足口病患者感染柯萨奇病毒A组16型基因特征分析

  目的  调查2019年冬季青岛市妇幼医院和中心医院手足口病（HFMD）住院患儿病原感染情况,分析柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）基因进化特征。  方法  收集2019年冬季青岛地区HFMD住院患儿104份咽拭子,采用实时荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测。 使用肠道病毒通用分型引物扩增阳性样本,扩增序列测序后进行Blast比对。 设计Cox A16 VP1全长引物,通过半巢式PCR扩增测序,使用DNAStar进行核苷酸和氨基酸的基因分析,使用MEGA软件构建进化树。  结果   HFMD住院患儿的咽拭子样本肠道病毒总体阳性率为57.7%（60/104）。 其中Cox A16阳性率为30.8%（32/104）,Cox A6阳性率为26.9%（28/104）。 对32份Cox A16阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析,其核苷酸同源性为87.0%～100%,氨基酸同源性为98.3%～100%。 系统进化分析表明,32株Cox A16中有17株为Cox A16 B1a基因型,另外15株为Cox A16 B1b基因型。  结论  引起2019年冬季青岛地区住院HFMD的病原体之一是Cox A16,且同时流行Cox A16的B1a和B1b型。     

2011-2012年杭州市手足口病的病原构成及肠道病毒71型的分子流行病学特征

目的 探讨杭州市手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型(human enterovirus 71,EV71)的分子特征。 方法 采集210例疑似手足口病感染者的粪便标本及其相关临床资料,采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real time RT-PCR)方法进行初步检测,利用RT-PCR扩增部分EV71和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16, Cox A16)阳性样本VP1基因区并测序分析。 结果 荧光定量RT-PCR检测表明,210例疑似感染者的粪便中, EV71、Cox A16 和其他肠道病毒的阳性率分别为60.95%(128/210)、21.43%(45/210)和9.05%(19/210)。10株EV71病毒VP1区核酸序列与JX509922、JX509924、JX509926、JX509927、 JX509928和 JX509929的同源性最高为95.7%~98.0%,且均属于EV71中 C4a亚型。 结论 EV71和Cox A16是杭州市儿童手足口病的主要病原体。因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。