河北地区汉族人群HLA-C位点基因多态性分析

目的:了解河北汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-C位点基因多态性及分布特征。方法:对1 912例河北地区汉族人群献血者采用基于测序的分型技术(SBT)进行HLA-C位点高分辨基因分型,直接计算等位基因频率,并与中国其他地区人群进行比较。结果:1 912例河北汉族献血者中共检出41个HLA-C等位基因,其中频率大于0.050的常见等位基因共7个,分别为C*07:02(0.13546),C*06:02(0.118985),C*08:01(0.101726),C*03:03(0.10068),C*01:02(0.09022),C*03:04(0.089174),C*04:01(0.071391)。与我国其他文献中汉族人群数据进行群体比较后发现,河北汉族人群HLA-C位点频率除与最高的常见基因与中国造血干细胞捐献者均为C*07:02外,与其他地区无论是分布规律还是常见等位基因的频率均存在显著差异,四川、广东、湖南岳阳3省市与中国南方汉族人群基因分布规律却较为相近。结论:获得了河北地区汉族人群HLA-C位点基因分布规律和特征,与南方汉族人群差异显著,本研究为中国人群HLA-C位点基因研究和应用提供了参考数据。     

贵州汉族类风湿关节炎患者HLA-DR4亚型多态性的研究

类风湿关节炎 (ｒｈｅｕｍａｔｏｉｄａｒｔｈｒｉｔｉｓ ,ＲＡ)的发病机制尚未彻底阐明。研究发现ＲＡ与ＨＬＡ ＤＲ4有不同程度的相关性 ,但ＤＲ4至少包括 2 2种亚型[1] ,不同亚型与ＲＡ的相关性不尽相同。为此我们采用序列特异性引物聚合酶链反应 (ＰＣＲ ＳＳＰ)技术 ,检测了贵州地区汉族ＲＡ患者ＤＲ4基因亚型的多态性 ,现报告如下。1　材料和方法1 1　研究对象本院风湿科 2 0 0 0— 2 0 0 1年住院ＲＡ患者 35例 ,诊断符合美国风湿协会 (ＡＣＲ) 1987年诊断标准[2 ] ,其中男性 7例 ,女性 2 8例 ,年龄 9～ 75岁 ,平均 4 6岁。 5 1份对照…     

PADI4在类风湿关节炎发病中的作用

类风湿关节炎（rheumatoid arthritis，RA）是一种病因尚未明了的自身免疫病，以慢性、多滑膜关节炎和关节外病变为主要临床表现。该病多发于手、腕、足等小关节，对称分布，反复发作。早期RA关节有红、肿、热、痛和功能障碍，晚期RA关节可出现不同程度的僵硬畸形，并伴有骨和骨骼肌的萎缩,极易致残。除此之外，RA在临床上还表现出发热、疲乏无力、心包炎、皮下结节、胸膜炎、动脉炎以及周围神经病变等。     

载脂蛋白E基因多态性与河北地区汉族人群缺血性脑卒中发病的关系

目的 分析河北地区汉族人群载脂蛋白E(ApoE)基因多态性与缺血性脑卒中发病的关系.方法 选择河北地区128例缺血性脑卒中患者(观察组)和125例健康查体者(对照组),采集两组空腹静脉血,采用聚合酶链反应—荧光探针法进行ApoE基因型检测,包括ε2/ε2、ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4、ε4/ε4共6种...     

苗族人群抗原处理相关转运体基因多态性与类风湿关节炎

９０年代初，一些学者发现在抗原递呈细胞（ＡＰＣ）内存在作者单位：１０００８９北京，解放军第４６６医院内一科（闵伟琪）；解放军总医院风湿科（施桂英）抗原处理相关转运体（ＴＡＰ）蛋白，其功能是介导抗原多肽穿过内质网，其有ＴＡＰ１和ＴＡＰ２两种形式。编码ＴＡＰ的基因位于ＭＨＣⅡ类区域，并有遗传多态性。我们试图分析我国苗族正常人及类风湿关节炎（ＲＡ）患者ＴＡＰ等位基因分布特点，以了解ＴＡＰ等位基因多态性与ＲＡ的关联。一、对象和方法１－实验对象：选择湖北恩施市医院住院或门诊苗族ＲＡ患者（ＲＡ组）３１例以及…     

汉族人群抗原处理相关转运体(TAP)基因多态性及与类风湿关节炎的相关性

目的探讨汉族人群抗原处理相关转运体（ＴＡＰ）基因多态性及与类风湿关节炎（ＲＡ）的相关性。方法用ＰＣＲＡＲＭＳ,ＲＦＬＰ,ＳＳＯＰ检测ＲＡ患者７８例及健康献血者７３名ＴＡＰ１３３３位和６３７位,ＴＡＰ２３７９,５６５,６５１,６８７位氨基酸等位基因多态性。结果汉族健康人ＴＡＰ１３３３位的６３７位等位基因基因型分别以Ｉ和Ｄ为主,表现型主要为Ⅱ和ＤＤ,有１Ａ１Ｄ４个亚型,以１Ａ和１Ｂ为主,有６种表型,ＴＡＰ２３７９,５６５,６５１,６８７位基因型分别以ＶＡＲＴＳ为主,表型以ＶＶＡＴＲＲＡＴＳＳ为主,有２Ａ２Ｇ７个亚型,以２Ａ和２Ｂ为主,有９种表型。ＲＡ患者ＴＡＰ２５６５ＴＴ和６６５ＡＡ及ＴＡＰ２Ｄ频率升高,并可使ＤＲ４阳性者患ＲＡ的相对危险性增加８２６倍。２Ｄ及ＤＲ４阳性ＲＡ患者的ＲＦ滴度显著高于ＴＡＰ２Ｄ阴性而ＤＲ４阳性的ＲＡ患者及前者的病程较长。结论汉族人群ＴＡＰ基因多态性有其基本特点。ＴＡＰ２Ｄ可使ＤＲ４阳性者患ＲＡ的相对危险性增加并可能影响其临床表现。     

河北地区人群骨桥蛋白基因多态性与冠心病的相关性

目的探讨河北地区人群骨桥蛋白基因启动子-443T/C-、156delG/G和-66T/G三个多态性位点与冠心病发生之间的相关性。方法随机选择中国河北地区95例经冠状动脉造影检查并确诊为冠心病的患者及129例正常对照。提取外周血基因组DNA,采取特异性引物对所选区域进行PCR扩增,将扩增产物进行测序后统计基因型和等位基因在病例组和对照组中的分布情况。结果 -443T/C-、156delG/G两个SNP位点在冠心病患者组与正常人对照组中分布无明显相关性(P0.05),而-66T/G位点在该地区不具备明显多态性。结论骨桥蛋白基因启动子区-443T/C、-156delG/G两个SNP位点与冠心病发病无关。     

中国汉族人群B细胞表面调节蛋白基因1单核苷酸多态性与类风湿关节炎的相关性研究

目的 探究B细胞表面的调节蛋白基因(BANK1)单核苷酸多态性(SNPs)与类风湿关节炎(RA)的关系.方法 221例确诊RA组和310名健康对照组的外周全血提取DNA,采用非标记探针-高分辨率熔解曲线法分别检测rs10516487,rs17266594和rs3733197 SNPs位点,采用X2检验分析3个位点与RA的相关性.结果 RA患者rs17266594 TT基因型频率较健康对照显著升高(X2=6.241,P=0.044);rs10516487、rs17266594和rs3733197的等位基因频率(分别是G、T和G等位基因)较健康对照呈升高的趋势,但差异无统计学意义;rs10516487和rs17266594呈强连锁不平衡(D'=0.993,r2=0.985);3个SNPs的TGG单倍体型在RA患者频率较健康对照显著升高[P=0.037,OR=1.345,95％CI(1.018～1.776)].结论 BANK1 rs17266594与RA相关,3个SNPs TGG单倍体型可能是RA的易感因素.     

山东地区汉族人群KIR基因多态性分析

目的 分析山东地区汉族人群杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因多态性及基因型和单倍型多态性,为进一步研究KIRs与疾病的关系奠定基础.方法 采用序列特异性引物PCR法(PCR-SSP)对412例山东地区无血缘关系的汉族健康志愿者进行KIR基因频率检测及基因型和单倍型分析.结果 ①KIR基因频率:可检测到目前已知的18种KIR基因;所有个体均检测到3个框架基因(2D14、3DL2、3D13)以及KIRZ,其基因频率均为100%.3DP1、2DL3、2DL1、3DL1和2DS4基因较为常见,频率分别为99.03%、98.79%、98.79%、98.79%、96.84%;而2DL2、2DS2、3DP1v基因频率较低.②KIR基因型频率:共检出基因型28种,以AJ(2,2)、AF(1,2)型最常见,其次为AH(5,2)、G(4,5)、M(1,5);另外有11种基因型在自人中尚未见报道.③KIR基因单倍型频率:共检出单倍型16种,最常见的是单倍型2,频率为46.36%;其次为单倍型1,频率为25.61%.结论 山东地区汉族人群有其独特的KIRs基因频率、基因型频率和单倍型频率分布;本研究可为进一步研究KIRs与疾病的相关性提供依据.     

类I-κB基因多态性与湖南汉族类风湿关节炎的相关性

类风湿关节炎(RA)是以慢性对称性多关节损害为主要表现的一种全身性自身免疫性疾病,其病因及发病机制尚不十分明确,但环境与遗传因素的交织作用共同促成RA的发生已成为医学界的共识。以往对RA遗传因素的研究主要集中在HLA、尤其是HLA-Ⅱ类分子。随着生物技术的飞速发展,新近发现许多候选基因与RA易感性有关,且独立于HLA-Ⅱ类分子而起作用。我们采用PCR-单链构象多态性(SSCP)技术结合DNA直接测序法,在国内首次检测了湖南汉族RA患者和对照人群中类Ⅰ-_kB(I_kBL)基因-62位点的多态性,并以RA患者的临床资料为依据,探讨基因型和临床表现型的关系。     

4型肽酰基精氨酸脱亚胺酶单核苷酸多态性与河北汉族人群类风湿关节炎的相关性

目的 探讨4型肽酰基精氨酸脱亚胺酶( PADI4)单核苷酸多态性(SNP)与中国河北汉族人群类风湿关节炎(RA)易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性( PCR-RFLP)法检测该地区105例RA患者和96名健康者的PADI4 92基因型并与先前报道的PADI4其他位点进行连锁不平衡分析,构建单倍型,进行相关性分析.采用Pearson x2检验及Woolf方法计算并相对危险度及95％可信区间(95％CI).结果 3个位点的碱基均存在二态性,通过对padi4_92、padi4_ 94、padi4_104 3个位点的连锁不平衡分析,构建成5种主要功能单倍体,功能单倍体CCC和GTT所占频率达到了80％,并且均与RA的发病存在相关性.功能单倍体GCC虽然所占频率不到10％,但是却与RA的发病有着强烈的关联,分布明显趋向病例组.结论 PADI4基因SNP单核苷酸多态性以及基因功能单倍体表达多样性均与河北汉族人群RA易感性相关.     

肽酰基精氨酸脱亚胺酶4单核苷酸多态性与河北汉族人群类风湿关节炎的相关性研究

目的 研究肽酰基精氨酸脱亚胺酶(PADI)4基因padi4_94位点及padi4_104位点的单核苷酸多态性(SNP)与河北汉族人群类风湿关节炎(RA)易感性的关系.方法 采用基于医院的病例-对照研究方法 ,收集河北地区汉族人群无血缘关系的115例RA患者和年龄、性别相当的106名健康体检者的外周血,用DNA测序法对PAD14基因第三内含子区域padi4_94位点及第四外显子区域padi4_104位点2个SNP进行检测.结果 在两组人群中,padi4_94及padi4_104的基因型分布均符合Hardy-weinberg平衡.两个SNP位点构建单倍型,得到3个单倍型,分别为AA、AG和GG,没有GA型.两SNP的AA、AG、GG基因型和A、G等位基因分布在RA病例组与健康对照组相比差异均无统计学意义,经Logistic回归分析无一单倍型为影响RA患病的危险因素.结论 在河北汉族人群中,PAD14基因的pa-di4_94、padi4_104位点存在SNP,此多态性与RA的易感性可能不存在相关性,尚不足以构成RA的独立遗传因素.     

中国北方汉族人群哮喘患者受体基因多态性研究

支气管哮喘是一种多基因遗传病 ,本研究通过检测支气管哮喘患者 β2 肾上腺素受体基因第 46、79位点及高亲和力免疫球蛋白Ｅβ 链受体基因第 5 189、5 191、5 195、6 843位点的多态性 ,探讨其与支气管哮喘发病的相关性。一、对象与方法1.对象 :哮喘组 :支气管哮喘患者 5 5例 ,男 30例 ,女 2 5例 ,年龄 2 0～ 6 6岁。诊断符合中华医学会呼吸病学分会1997年制定的诊断标准。根据临床症状和所需药物情况 ,将患者分为轻度 (包括间歇发作 )和中重度 ,轻度患者 2 5例 ,中重度患者 30例。正常对照组 :正常健康成人 38例 ,男 15例 ,女 2 3例 ,年龄 2…     

STAT4基因多态性与类风湿关节炎病情活动的关系

目的研究STAT4基因多态性与唐山地区类风湿关节炎（RA）患者病情活动度和疾病严重度的相关性。方法采用PCR-LDR法检测RA患者的STAT4基因型,记录其年龄、性别、病程、双手/双腕关节X线分期,检测血沉（ESR）,计算DAS28评分。结果 STAT4 rs7574865位点T等位基因为RA发病的危险基因;T等位基因与患者的年龄、性别、病程、双手/双腕关节X线分期、ESR及DAS28评分均无相关性（P均〉0.05）。结论 STAT4基因多态性与唐山地区汉族人群RA病情活动度及疾病严重度不相关。     

肿瘤坏死因子受体相关因子1基因多态性与上海市汉族人群类风湿关节炎患者疾病易感相关性的研究

目的 对肿瘤坏死因子受体相关因子1(TRAF1)基因的单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,分析其与上海市汉族人群类风湿关节炎(RA)的易感相关性.方法 采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱方法 对汉族RA患者(RA组,100例)和健康人(健康对照组,100名)TRAF1基因的6个SNPs位点进行了基因分型,并使用Haploview软件进行分析.数据分析采用χ2检验和Fisher确切概率法.结果 在中国汉族RA患者中位于TRAF1基因的6个位点中,RA组rs4836834位点A/A、A/T、T/T基因频率分别为:22.22%、49.49%、28.28%,健康对照组rs4836834位点A/A、A/T、T/T基因频率分别为:28.57%、30.61%、40.82%,2组差异有统计学意义(P<0.05);其他5个位点,包括已有报道与白种人RA易感相关的rs10818488位点,RA组与健康对照组相比差异均无统计学意义(P>0.05).而连锁不平衡及单倍体型频率分析结果 发现,rs7021049与rs7021880,rs7021049与rs4836834,rs7021880与rs4836834之间存在较强的连锁不平衡,3组连锁不平衡关系单倍体频率RA组与对照组差异均无统计学意义.结论 TRAF1可能是汉族人RA的易感基因,但其SNPs与白种人的表现有所不同.

Abstract：

Objective To detect TRAF1 gene single nucleotide polymorphism in Han population ,and analyze its association with increased risk of rheumatoid arthritis (RA) in Han people. Methods The study group was comprised with 100 healthy Han subjects and 100 Han RA patients. Six SNPs was detected by matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOFMS), and the result was analyzed by Haploview software. Fisher's exact test and χ2 test were used for statistical analysis.Results The rs4836834 A/A, A/T, T/T allele frequencies of RA group were 22.22%, 49.49%, 28.28% respectively. The rs4836834 A/A, A/T, T/T allele frequencies of healthy control group were 28.57%, 30.61%,40.82% respectively. There was significant difference (P<0.05) of rs4836834 between Hah patients with RA and healthy controls. For other five sites, including rs10818488, which had been reported to be associated with increased risk of Caucasians RA patients, there was no significant difference (P>0.05) between RA group and the control group. The linkage disequilibrium and haplotype frequency analysis results showed that there was strong linkage disequilibrium between rs7021049 and rs7021880, rs7021049 and rs4836834, rs7021880 and rs4836834, but there was no significant difference between RA group and the control group in the haplo-type frequencies of the three classes of linkage disequilibrium. Conclusion TRAF1 gene may be a susceptible gene associated with Han RA people, but its single nucleotide polymorphisms and performance may be different between Caucasians and Han people.     

类Ⅰ-κB基因多态性与湖南汉族类风湿关节炎的相关性

类风湿关节炎（RA）是以慢性对称性多关节损害为主要表现的一种全身性自身免疫性疾病，其病因及发病机制尚不十分明确，但环境与遗传因素的交织作用共同促成RA的发生已成为医学界的共识。以往对RA遗传因素的研究主要集中在HLA、尤其是HLA-Ⅱ类分子。随着生物技术的飞速发展，新近发现许多候选基因与RA易感性有关，且独立于HLA-Ⅱ类分子而起作用。我们采用PCR-单链构象多态性（SSCP）技术结合DNA直接测序法，在国内首次检测了湖南汉族RA患者和对照人群中类Ⅰ-κB（IκBL）基因-62位点的多态性，并以RA患者的临床资料为依据，探讨基因型和临床表现型的关系。     

中国汉族人群TRAIL基因多态性的研究

目的 探讨中国汉族人群中TRAIL基因的分布情况及其在相关疾病发生中的作用.方法 应用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)技术,对265例中国汉族人TRAIL基因第5外显子3′-非编码区1595位点(以mRNA为标准)进行检测,分析基因型频率和等位基因频率在不同性别人群中的分布.结果 Hardy-Weinberg平衡吻合度检验显示,本组各等位基因频率期望值和观察值无显著差异,且其基因多态性分布无性别差异,与日本人相比无显著差异(P>0.05),等位基因频率与非洲及美洲高加索人相比均有显著差异(P<0.05).结论 PCR-RFLP方法 检测TRAIL基因型特异性高,成熟、稳定;中国汉族人群TRAIL基因第5外显子3′-非编码区1595位点存在C/T突变.     

北方汉族人群HLA-DM基因多态性的研究

最近,人们陆续在人和动物MHC Ⅱ类区域内发现了一系列参与抗原加工和转运的基因,其中HLA-DM基因编码的产物参与了抗原多肽的转运和MHC Ⅱ类分子的折叠。这一基因由DMA和DMB组成,在遗传学上也有一定的多态性。本研究旨在探讨HLA-DM基因多态性在北方汉族正常人群中的分布规律及其对类风湿关节炎(RA)的影响。     

中国汉族人群系统性红斑狼疮患者信号传导和转录激活子4基因多态性研究

目的 探讨信号传导和转录激活子4(STAT4)基因多态性与中国汉族人群系统性红斑狼疮(SLE)的相关性.方法 运用焦磷酸测序的方法对SLE患者与健康对照组DNA中存在的3个单核苷酸多态性位点进行分型,并作统计学分析.结果 STAT4基因的3个单核苷酸多态性(SNP)及其构成的单倍型在患者与健康对照组间差异均有统计学意义[rs11889341:P=012 02,0R(95%CI)=1.22(1.044～1.424);m7574865:P=0.003 454,OR(95%CI)=1.25(1.076～1.451);rs8179673:P=0.004 275,OR(95%CI)=1.274(1.079～1.505)].结论 STAT4基因上ra11889341、rs7574865和rs8179673与中国汉族人群SLE的发病有关联,且STAT4是-个多种族均存在的SLE相关基因.     

TIM-1外显子4基因多态性与类风湿关节炎关系的研究

目的探讨湖北地区汉族人群T细胞免疫球蛋白域黏蛋白域蛋白-1(TIM-1)外显子4基因多态性与类风湿关节炎(RA)之间的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)法检测86例RA患者和1130名正常对照的TIM-1外显子4插入,缺失多态性,同时检测类风湿因子(RF)、抗CCP抗体和抗角蛋白抗体(AKA)三种自身抗体。结果正常对照组TIM-1外显子4 del/del、ins/del和ins/ins基因型频率分别为0．650、0．280、0．070；RA组TIM-1外显子4 del/del、ins/del和ins/ins基因型频率分别为0．616、0．302、0．082,与对照组相比,差异无统计学意义(P＞0．05)。RA组RF、抗CCP抗体和AKA检测阳性率分别为79．08%、73．26%和53．49%,与对照组比较均有统计学意义(P＜0．01)。通过统计分析发现RA组中RF、抗CCP抗体检测阳性率与TIM-1外显子4基因分型均无相关性(P＞0．05)；AKA检测阳性率与TIM-1外显子4基因分型显著相关(P＜0．01)。结论湖北地区汉族人群TIM-1外显子4插入/缺失多态性与RA无相关性,TIM-1外显子4基因分型可能影响RA患者抗角蛋白抗体的表达。