奶牛环形泰勒焦虫病的综合诊断

环形泰勒焦虫病是一种蜱传性血液原虫病,对养牛业危害严重。笔者将2011年7月伊犁奶牛环形泰勒虫临床诊断、实验室血液检查及PCR诊断方法及结果进行报告,为奶牛环形泰勒焦虫病的综合诊断提供新思路。     

新分离呼肠病毒基因组片段S1全长cDNA克隆及其序列分析

目的：克隆测序新分离呼肠病毒的S1全长基因组片段，并对其进行序列分析。方法：从接种呼肠病毒的L929细胞中提取病毒基因组，用改进的单引物扩增技术获得S1片段的全长cDNA克隆井测定其全序列。结果：新分离呼肠病毒的S1片段长1437bp，其核苷酸序列与已知的1—3型呼肠病毒标准株的同源性分另1为59％，61％和48％；推测的cr1序列与标准株的同源性分别为52％，60％和26％。结论：新分离呼肠病毒的S1片段与目前已知的分离株相比有很大差异，有可能是2型呼肠病毒的一个独立分支。     

人红细胞单链抗体基因的克隆及其序列分析

目的：获得抗人红细胞的单链抗体基因。方法：以分泌抗人红细胞单抗（ＨＲＣ）的杂交瘤细胞总ＲＮＡ为模板，分别扩增出轻链可变区（ＶＬ）和重链可变区（ＶＨ）基因，用连接肽将其连接成具ＶＬ－ｌｉｎｋｅｒ－ＶＨ结构的单链抗体基因。结果：ＤＮＡ序列分析证实，获得的单链抗体基因的轻，重链分别属于鼠Ｉｇｋａｐｐａ轻链第Ⅲ亚组和Ｉｇ重链第Ⅱｃ亚组，结论：构建了抗人红细胞单链抗体的载体，提供了与其它基因连接，为建立病人     

人白细胞介素—1β基因片段的DNA序列分析

本文先对 pIL-1β质粒进行了系统的酶切鉴定,肯定该质粒的 PstI 位点插入有一大小约 460bp 的外源基因片段,然后利用 M13序列分析体系通过对该外源基因片段进行序列分析,证实了该片段系人白细胞介素-1β基因片段。弄清了该片段两端的 DNA结构情况,了解到作为人的成熟的 IL-1β,该基因片段是不完整的,在 N-末端缺少十三个氨基酸的碱基密码。这对于研究 IL-1β基因重组、探针制备以及高效表达都具有重要的意义。     

小鼠β-酪蛋白基因的克隆及序列分析

目的：从129Sv小鼠基因组文库中分离克隆β－酪蛋白基因。方法：PCR方法扩增部分β－酪蛋白基因作为探针，用原位杂交和PCR方法从小鼠基因组文库中分离克隆β－酪蛋白基因。结果和结论：通过3轮原位杂交分析，获得了包括小鼠β－酪蛋白全长基因在内的阳性克隆，为进一步构建乳腺特异表达基因打靶载体创造了条件。     

白色瘤胃球菌内纤维素酶celB基因的克隆及序列分析

本实验是将作者本人分离并鉴定的白色瘤胃球菌的总DNA作为模板,自行设计合成了一段引物,进行克隆,结果经大连宝生物工程有限公司进行序列测定,并对其测定结果进行分析.     

人血管生成素-1基因cDNA的克隆及结构分析

 目的 克隆人血管生成素-1基因,并分析其结构特征,为研究生理及病理性血管生成奠定基础。方法 提取人胎盘组织总RNA,用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术扩增逆转录产物,经克隆及序列测定获得人血管生成素-1 cD-NA;用计算机软件分析基因序列及编码蛋白质结构。结果 获得高质量的胎盘组织总RNA。RT-PCR扩增出—1.5 kb的cD-NA片段,将PCR产物的阳性克隆测序,显示含1534 bp的插入片段,可编码503个氨基酸的蛋白质,与小鼠的血管生成素-1氨基酸高度同源。编码的氨基酸中含3个功能结构域。结论 为从基因及蛋白质水平研究人血管生成素-1与生理、病理性血管生成奠定了基础。     

人胰岛素原基因的PCR扩增、克隆和鉴定

根据已知的人胰岛素原基因序列设计引物 ,用PCR直接从人基因组DNA中获得天然的人胰岛素原基因 ,并将其克隆到 pUC1 8载体中 ,通过内切酶图谱及序列分析 ,证实所获得的人胰岛素原基因与已报道的序列完全一致。对于已知序列的基因克隆 ,PCR扩增法操作简捷 ,结果可靠     

斜带石斑β-珠蛋白cDNA的克隆和序列分析

从斜带石斑Epinepheluscoioides白细胞cDNA文库随机挑取噬菌斑 ,做为模板 ,用λTriplEx5’3’长距离插入子筛选引物 ,进行插入片断的PCR扩增 ,并进行表达序列探针 (ESTs)测定。从中克隆到了血红蛋白β亚基cDNA。cDNA包含长达 4 4 4bp的开放阅读框 ,编码 1 4 7个氨基酸的多肽。用www .expasy .ch网站的computepl/MW程序计算其可能的相对分子质量为 1 65 4 4 ,等电点为 6 .95。其氨基酸序列与草鱼β -珠蛋白III的同源性最高 ,为 73.0 %。在远端和近端的与血红素结合的组氨酸都是保守的。另外 ,与其它鱼类及蛙、鸡和人的 β -珠蛋白比较 ,在血红素结合区及亚基结合区的氨基酸残基均是高度保守的     

Wistar大鼠c-ski基因部分序列的克隆、测序及实时荧光定量PCR的建立

目的 测定Wistar大鼠c-ski基因部分序列,并应用于检测大鼠c-ski基因表达的实时荧光定量PCR的建立.方法 提取培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞总RNA,通过RT-PCR扩增,将扩增产物克隆到PMD-18T载体上并测序.根据获得的c-ski基因部分序列设计实时荧光定量PCR引物,建立SYBR green定量PCR检测方法,并检测培养的大鼠皮肤成纤维细胞c-ski mRNA表达水平.结果 获得的Wistar大鼠c-ski基因cDNA序列长561bp,为未曾报道的新序列,其与人、小鼠具有较高的同源性,Gen-Bank收录(收入号DQ409171).建立的SYBR green定量PCR检测标准品在103～109拷贝范围内的相关系数为0.991 49.体外培养的Wistar大鼠皮肤成纤维细胞样晶中c-ski mRNA水平为(1.024±0.18)×106拷贝/μl.结论 新获得了Wistar大鼠c-ski基因部分序列,该序列可用于实时荧光定量PCR的建立.     

绵羊c-Myc的克隆与序列分析

参照GenBank上绵羊c-Myc序列设计引物,利用RT-PCR技术从60d左右胎羊生殖嵴总RNA中扩增得到绵羊c-Myc基因编码区序列,其为包括终止密码子在内的1320 bp,编码有439个氨基酸。同源性分析结果显示,绵羊c-Myc基因编码区与牛、猪、猫、人、大鼠、小鼠、鸡、爪蟾和斑马鱼的核苷酸序列同源性分别为98.0%、94.1%、92.4%、90.4%、86.9%、86.2%、75.2%、66.4%和63.9%,其氨基酸序列同源性分别为98.0%、94.0%、92.5%、90.3%、87.2%、86.5%、72.2%、65.5%和64.6%;生物信息学软件分析显示,绵羊c-Myc含有细胞核定位模体和HLH结构域。本研究为进一步研究c-Myc基因的功能及探讨其中绵羊体细胞重编程中的作用奠定了基础。     

绵羊Oct4基因的克隆及序列分析

为了克隆出绵羊的Oct4基因的编码区序列,研究利用RT-PCR技术,根据GenBank中小鼠、人,猪、牛等的Oct4基因编码区序列设计出特异性引物,从绵羊囊胚中扩增绵羊Oct4编码区序列并进行测序,分析。结果表明,绵羊Oct4基因的编码区长度为1083bp,其中包括终止密码子,可以编码360个氨基酸。绵羊Oct4基因CDS区的核苷酸序列与牛、猫、人、恒河猴、小鼠、兔、大鼠和猪等物种相似,比较相应序列,同源性分别为97.8%、91.1%、89.1%、89.0%、82.3%、85.7%、83.2%和94.7%;比较其氨基酸序列,同源性分别为98.3%、93.1%、91.4%、91.1%、83.8%、85.7%和97.2%;使用生物信息学软件分析结果表明,绵羊Oct4基因含有两个POU特异结构域和1个HOMEOBOX-1结构域。本研究为进一步探索Oct4基因的功能及探讨其在绵羊体细胞重编程的过程中的作用奠定了基础。     

一个新的Ⅰ型咪唑啉受体可变剪接体的克隆、鉴定及亚细胞分布

目的克隆Ⅰ型咪唑啉受体（I1R,Nischarin）新的可变剪接体,并对其进行表达特征和亚细胞定位研究,探索其表达与I1R的差异,从而为解释I1R药理学作用多样性奠定基础。方法在本课题组前期研究基础上设计引物,通过RT-PCR从大鼠肝组织中克隆新的可变剪接体,将其克隆到pcDNA3.1、pEGFP-N1和PCMV-myc3个真核表达载体中,并通过细胞转染探索其在293T细胞中的分布,应用Western印迹测定其在真核细胞中表达蛋白的相对分子质量特征。结果成功克隆获得一个新的I1R可变剪接体（命名为I1R-ISO-472）,编码472个氨基酸,与GenBank中序列号AK036043.1的新基因的序列完全一致。生物信息学分析表明,该基因染色体定位于14号染色体14B,含有磷酯酰肌醇结合位点（PX_domainsuperfamily）与亮氨酸富集重复（LRR-RIsuperfamily）两个重要的功能结构域。I1R-ISO-472在293T细胞中表达的蛋白相对分子质量约为52×103,与预测基本一致。细胞免疫荧光结果表明,其在293T细胞内呈均匀弥散分布。结论成功克隆一个新的I1R可变剪接体,其表达特征及亚细胞分布提示其药理学作用可能与已知的I1R不同。     

高迁移率族蛋白B1cDNA的克隆与表达

目的克隆人高迁移率族蛋白B1（HMGB1）cDNA,构建重组原核表达载体,对其诱导表达并鉴定,为设计HMGB1 cDNA突变体及诱导表达可竞争性抑制HMGB1炎症效应的突变体蛋白奠定基础。方法提取人新鲜扁桃体组织总RNA,经RT-PCR扩增出人HMGB1 cDNA序列,并克隆至载体pUC18进行序列测定,随后构建于原核表达载体pQE-80L中,经IPTG诱导4小时后,可表达Mr约30 000的蛋白。Western Blotting鉴定所表达的目的蛋白。结果经RT—PCR扩增得到了648bp的cDNA,经序列分析与GenBank中报道的已知序列完全一致,构建了HMGB1蛋白的重组表达质粒,诱导表达了目的蛋白,经Western Blotting证实,在Mr约为30000处有一条清楚的蛋白带。结论获得了HMGB1 cDNA的克隆与原核表达载体。     

丙型肝炎病毒F蛋白结合蛋白1基因的克隆化与序列分析

目的 对命名为F蛋白结合蛋白1(FBP1)的未知基因,克隆其全长基因并进行生物信息学分析.方法 应用酵母双杂交技术得到FBP1,应用分子生物学技术克隆FBP1的基因编码序列.结果 经酶切和测序鉴定,结果完全正确,成功克隆了FBP1的基因编码序.结论 FBP1通过与F蛋白结合,在病毒蛋白与宿主细胞蛋白相互作用过程中发挥重要作用.     

登革2型病毒NS3基因的扩增及序列测定

采用热酚法从登革２ 型病毒４３ 株（Ｄ２ ４３） 感染的Ｃ６／３６ 细胞中提取了病毒ＲＮＡ,以病毒ＲＮＡ 为模板,进行Ｄ２ ４３ 株ＮＳ３ 基因ｃＤＮＡ 片段的反转录 ＰＣＲ 扩增,片段长度为１１７６ ｂｐ。将扩增的ｃＤＮＡ 片段克隆到Ｔ 载体ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ｋｓⅡ（ ＋ ） 中。通过双脱氧法测定了ｃＤＮＡ片段序列,与国际标准株ＮＧＣ株序列一致。     

青藏高原高原鼠兔肌红蛋白(MGB)基因编码区的克隆与分析

目的：克隆青藏高原高原鼠兔肌红蛋白（MGB）基因编码区，并分析其序列特征。方法：采用RT—PCR技术从高原鼠兔骨骼肌中扩增出MGB基因编码区cDNA序列并进行序列测定，采用生物信息学技术对其进行分析。结果：MGB基因编码区由465bp组成，编码154个氨基酸。在根据cDNA推测出的高原鼠兔MGB氨基酸序列中，发现两个不同于Dene等根据氨基酸直接测序所报道的美洲地区高原鼠兔MGB的多态性位点。结论：成功克隆出青藏高原高原鼠兔MGB基因编码区，为进一步了解高原鼠兔低氧适应的分子机制提供了有益参考。     

黑色素瘤抗原基因-1,3基因在肺癌组织中的表达及其意义

目的了解肺癌组织中和黑色素瘤抗原基因(MAGE)1,3基因的表达,并探讨其作为免疫治疗的靶抗原在肺癌中的应用价值。方法采用RTPCR法检测72例肺癌患者的肿瘤组织和相应的癌旁“正常”组织中MAGE1,3基因的表达情况。结果72例肺癌组织中,MAGE1表达阳性率为72%(52/72例)MAGE3表达阳性率为69%(50/72例)MAGE1,3表达双阳性率为52%(38/72例),MAGE1,3任一基因表达阳性者64例,阳性率为89%(64/72例)。癌旁"正常"组织中MAGE1,3基因表达阳性率分别为47%(34/72例)和44%(32/72例),MAGE1,3表达双阳性率为31%(22/72例)。肺癌组织MAGE1,3基因表达阳性率均高于癌旁“正常”组织,5株肺细胞株MAGE1,3基因表达均为阳性。结论基于MAGE1,3基因在肺癌中的高表达率,可利用其作为靶分子进行免疫治疗,同时也可作为一种有临床价值的随访指标。