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??OBJECTIVE To investigate the material basis and action mechanism for preventing osteoporosis of Erzhi Pill through network pharmacology. METHODS Autodock 4.0 was used to establish the interactions of compounds from Erzhi Pill with 36 target proteins related to OP, and the ??ingredient-target-pathway?? network of Erzhi Pill for OP treatment was constructed and analyzed by Cytoscape3.6.0. RESULTS 21 ingredients of Erzhi Pill were found to dock with 35 target proteins(POR,CYP17A1,PTH, et al) and 15 pathways, such as HIF-1 signaling pathway, Rheumatoid arthritis and Thyroid hormone signaling pathway, were affected. CONCLUSION The mechanism of Erzhi Pill for OP treatment may be linked with regulating metabolism pathways, intervening related diseases,adjusting the level of estrogen, and so on, reflecting the action features of multi-ingredients, multi-targets and multi-pathways of traditional Chinese medicine.This study provides new clues for further basic study on the pharmacological mechanism of Erzhi Pill.     

基于网络药理学的脑震宁颗粒治疗脑外伤的机制分析

目的借助网络药理学技术预测脑震宁颗粒主要成分的潜在作用靶点,探讨其治疗脑外伤多成分-多靶点-多通路的作用机制。方法依据反向分子对接服务器(DRAR-CPI)和Coo LGe N数据库预测和筛选脑震宁颗粒主要成分的作用靶点;采用Cytoscape软件Clue GO插件对靶点进行GO富集分析,借助生物信息学注释数据库(DAVID)对获取的靶点信息进行KEGG通路注释分析;采用Cytoscape软件构建药材-成分-靶点-通路-疾病网络。结果脑震宁颗粒的33个主要成分涉及丝裂原活化蛋白激酶-1(MAPK1)、胱天蛋白酶-3(CASP3)、糖原合成酶激酶-3β(GSK3B)等34个靶点,GO富集分析和KEGG通路注释分析提示脑震宁颗粒可作用于活性氧的生物合成、平滑肌细胞增殖等生物过程,以及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)、MAPK通路、JAK/STAT、m TOR等信号转导通路;网络分析显示脑震宁颗粒的作用机制可能与调控氧化应激、抑制炎症反应和神经细胞凋亡、调节脑内硫化氢生成和纤溶酶原(PLG)活性、改善认知功能及脑外伤后抑郁等相关。结论揭示了脑震宁颗粒多成分、多靶点、多通路的作用机制,为进一步深入研究脑震宁颗粒药效物质基础及作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学的降脂理肝汤治疗非酒精性脂肪肝病作用机制研究

目的筛选降脂理肝汤主要活性成分,预测其活性成分的作用靶点,探讨降脂理肝汤治疗非酒精性脂肪肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)的多成分-多靶点-多通路作用机制。方法通过多个数据库联合检索并筛选降脂理肝汤活性成分和其作用靶点以及NAFLD相关靶点,并预测降脂理肝汤治疗NAFLD的潜在靶点。采用Cytoscape软件构建降脂理肝汤活性成分-作用靶点网络,通过Cytoscape的插件Clue GO对靶点基因功能及通路进行富集分析。结果网络分析结果表明,从降脂理肝汤中筛选得到82个活性成分,涉及NAFLD靶点53个,靶点主要关联NAFLD中胰岛素抵抗、氧化应激和炎症反应,并且参与了NAFLD中PI3K/Akt信号通路、炎症小体途径、白细胞介素-10(IL-10)信号通路以及T细胞信号通路,这些生物过程和信号通路介导了降脂理肝汤干预NAFLD潜在机制。结论为进一步深入研究降脂理肝汤治疗NAFLD作用机制提供了重要依据。     

三拗汤主要功效成分多靶点网络构建

目的采用网络药理学方法对三拗汤治疗哮喘的功效成分及作用机制进行分析,探讨多成分-多靶点-多通路的网络关系。方法检索近20年文献中治疗哮喘疗效确切的方剂,分析具有代表性配伍关系组方的功效成分,依据Pharm Mapper数据库构建多成分-蛋白网络,获取的靶点信息利用博奥数据库MAS3.0系统得到相应通路,通过Cytoscape软件建立成分-靶点-通路网络模型。结果文献检索发现三拗汤组成麻黄、杏仁、甘草为现代哮喘方剂中主要的配伍。通过成分-通路-靶点网络分析表明,三拗汤11个主要功效成分作用于76个靶点,涉及免疫-内分泌-信号传导-细胞过程中如T细胞受体、PPAR、Erb B等46条通路。结论三拗汤组成药物的功效成分既有共同的作用靶点及通路,又各有侧重,为明确药物之间的配伍关系和探讨哮喘方剂的作用机制提供了参考。     

基于网络药理学的血必净注射液治疗急性肺损伤作用机制研究

目的预测血必净注射液抗急性肺损伤主要活性成分的作用靶点,探索其"多成分-多靶点-多通路"的复杂网络调节机制。方法针对血必净注射液中38个主要活性成分,利用反向分子对接技术预测活性成分的作用靶点,并与通过文献挖掘及多种数据库检索得到的急性肺损伤疾病相关靶点进行比对;采用Cytoscape软件构建蛋白互作网络并进行拓扑分析,筛选血必净注射液抗急性肺损伤的关键靶点,借助DAVID数据库对得到的关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路注释分析。结果网络分析结果显示,血必净注射液中38个化合物直接或间接作用于143个关键靶点,共涉及71个生物学过程、29种细胞组分、40种分子功能及25条KEGG通路(P0.05,FDR0.05),说明血必净注射液主要通过对基因调控、蛋白合成、炎症反应等过程的调节和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)等信号通路的干预发挥抗急性肺损伤作用。结论血必净注射液发挥抗急性肺损伤的作用体现了中药多成分、多靶点、多途径的协同作用特点,为深入阐明血必净注射液治疗急性肺损伤的作用机制提供了重要的科学依据。     

三七化学成分分析及其抗炎机制的网络药理学探讨

目的 利用超高效液相色谱与四极杆飞行时间质谱联用（ultra performance liquid chromatography quadrupole-time-of-flight hybrid mass spectrometry,UPLC-Q-TOF-MS）分析三七的主要化学成分,运用网络药理学研究三七抗炎的多成分、多靶标、多途径作用机制。方法 通过UPLC-Q-TOF-MS分析三七的主要化学成分,使用DAVID数据库进行基因本体论（Gene Ontology,GO）分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes,KEGG）通路分析,并运用Cytoscape 3.6.1软件绘制网络互作图,Image GP工具绘制GO气泡图。结果 研究得到人参皂苷Rh₁、人参皂苷Rg₁、月桂酸单甘油酯（monolaurin）等22个关键抗炎作用的活性成分和表皮生长因子受体（EGFR）、信号传导蛋白和转录激活物3（STAT3）、丝裂原活化蛋白激酶-14（MAPK14）等31个关键靶点。GO、KEGG通路富集分析发现,三七可能主要通过人参皂苷Rh₁、人参皂苷Rg₁、月桂酸单甘油酯、β-胡萝卜苷（β-daucosterol）和人参环氧炔醇（panaxydol）等活性成分,作用于EGFR、STAT3、MAPK14、白介素-2（IL-2）等靶点,调节癌症信号通路（Pathways in cancer）、细胞因子受体相互作用（Cytokine-cytokine receptor interaction）、突触细胞黏附分子（CAMs）等信号通路发挥抗炎作用。结论 三七抗炎体现了多成分、多靶点、多途径的特点,为进一步开展三七抗炎作用药效物质基础和作用机制研究提供了新的思路和方法。     

基于网络药理学探讨胡芦巴丸化裁方治疗糖尿病肾病的作用机制

目的利用网络药理学方法探讨胡芦巴丸化裁方治疗糖尿病肾病的作用机制。方法利用TCMSP数据库和BATMAN-TCM数据库筛选得到胡芦巴丸化裁方的有效成分及相关作用靶点,并运用UniProt数据库和SwissTargetPrediction数据库对靶点信息进行矫正和补充;使用GeneCards数据库、TTD数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库获得糖尿病肾病的疾病相关靶点;利用在线作图工具Jvenn获得胡芦巴丸化裁方与糖尿病肾病的共同靶点;运用String11.0构建蛋白相互作用(PPI)网络,对网络图中的关键靶蛋白进行筛选和分析;运用cytoscape3.8.0构建"药物—成分—疾病—靶点"网络图,并对主要活性成分进行分析;利用DAVID 6.8数据库对胡芦巴丸化裁方和糖尿病肾病共同靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,对共同靶点的生物过程及主要代谢通路进行讨论。结果经过筛选去重得到胡芦巴丸化裁方的有效活性成分55个,药物作用靶点538个,糖尿病肾病疾病靶点6971个;利用Jvenn取交集得到药物—疾病共同靶点413个;GO富集分析显示这些靶点涉及对药物的反应、对缺氧的反应、炎症反应、信号转导等生物学过程,KEGG富集分析显示共同靶点所富集的通路包括PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗、钙离子信号通路、TNF信号通路等。结论胡芦巴丸化裁方对于DKD的治疗具有多成分、多靶点、多通路的特点,有可能是通过胰岛素(INS)、蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、白介素-6(IL-6)等核心靶点对PI3K-Akt信号通路、钙离子信号通路、TNF信号通路等进行调控从而发挥治疗作用。     

参芪降糖颗粒通过多层次互作网络治疗糖尿病微循环障碍作用机制研究

目的基于网络药理学方法研究参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍的潜在分子机制。方法通过GeneCards数据库查询糖尿病肾脏病、糖尿病视网膜病变、糖尿病神经病变、糖尿病足病和糖尿病合并脑小血管病的疾病靶点,整合为糖尿病微循环障碍疾病靶点。借助PubChemSearch和Swisstargetprediction在线工具得到参芪降糖颗粒药效成分治疗糖尿病微循环障碍的作用靶标,利用Cytoscape 3.3.0软件构建参芪降糖颗粒化学成分-糖尿病微循环障碍作用靶标网络,通过STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络,利用Clue GO插件进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果从参芪降糖颗粒中共筛选出85个化学成分,以及10个与糖尿病微循环障碍相关的作用靶点,分别为ACE、VEGFA、TNF、IL6、STAT3、ALB、PON1、PTPN22、PPARG、NOS3。经GO和KEGG通路富集分析,发现参芪降糖颗粒治疗糖尿病微循环障碍可能参与HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、AGE-RAGE信号通路、炎症性肠病、类风湿性关节炎、肥厚性心肌病信号通路等多条信号通路。结论参芪降糖颗粒治疗糖尿病微...     

基于网络药理学探讨黄芪-川芎药对对糖尿病周围神经病变作用机制的研究

目的系统探讨黄芪-川芎(QX)药对治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的关键靶点及作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄芪-川芎的主要有效成分及作用靶点,通过GeneCard数据库检索DPN的主要靶点,然后通过R语言绘制Venn图得出QX治疗DPN的共同靶点;利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药-成分-疾病-靶点调控网络,然后通过String数据平台建立PPI网络,最后利用Bioconductor平台和R语言进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果 QX中发挥治疗DPN的成分主要是槲皮素、山柰酚、叶酸、谷甾醇等19个活性成分;发挥治疗作用的靶点可能包括PTGS2、NOS2等69个关键靶点;影响治疗DPN的生物学过程主要为细胞因子活性、细胞因子受体结合等93个条目;发挥治疗的关键作用通路包括AGE-RAGE信号通路、IL-17通路等143个通路。结论 QX对DPN的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多通路的特点,提示其作用机制可能是通过多成分、多靶点、多通路实现,为进一步探讨QX对DPN的治疗和作用机制提供了思路和依据。     

蒙古族药芯芭治疗2型糖尿病的网络药理学研究

该文采用网络药理学方法探讨蒙古族药芯芭治疗2型糖尿病潜在的活性成分和作用机制。根据文献收集汇总建立蒙古族药芯芭成分数据库,结合活性成分筛选、靶点预测技术及生物信息学手段,获取与降糖效应相关的重要活性成分和关键靶点来预测作用机制。分子对接预测主要活性成分与关键靶点结合活性,体外实验验证活性成分的降糖作用机制。该文共收集芯芭中含有177个化学成分,确认90个化学成分结构,34个化学成分存在有效靶点,显著影响过氧化物酶体增殖物激活受体信号代谢通路等脂肪酸代谢、调节蛋白激酶活性和胰岛素反应等61条生物过程,关键靶点为Akt1和TNFα。预测降糖活性成分主要为槲皮素、木犀草素和梓醇,分子对接预测关键靶点Akt1与木犀草素、槲皮素和梓醇有较强的结合活性;TNFα与木犀草素有较强的结合活性,与槲皮素和梓醇有一定的结合活性。体外细胞模型验证梓醇具有降糖药效,上调p-Akt(Ser473)/Akt,PPARα,PPARδ水平,降低FABP4蛋白水平,调节糖脂代谢改善肝胰岛素抵抗。网络药理学方法预测蒙古族药芯芭降糖多成分、多通路、多靶点的作用机制,为芯芭降糖研究提供科学视野和提示研究方向。