基于网络药理学研究葛根汤治疗偏头痛的作用机制及实验验证

目的：基于网络药理学探究葛根汤治疗偏头痛的作用机制,并通过细胞实验验证。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台检索葛根汤的化学物质及药物靶点,通过Genecard数据库检索偏头痛的疾病靶点。将二者靶点取交集得到葛根汤治疗偏头痛的潜在靶点。构建有效化合物-作用靶点-疾病网络、蛋白质相互作用(PPI)网络。进行GO功能及KEGG通路富集分析。采用BV-2小胶质细胞进行细胞实验,分为空白对照组(control),模型组[脂多糖(LPS)组],葛根汤高(800μg·m L^-1)、低剂量组(400μg·m L^-1)。结果：筛选得到葛根汤治疗偏头痛的潜在有效成分共122个,潜在靶点144个,其中槲皮素、木犀草素、山奈酚等可能是关键成分,STAT3、JUN、IL6等可能是关键靶点。氧化应激反应、DNA信号转录传导、受体结合、细胞因子活性等是葛根汤治疗偏头痛的可能生物学途径。高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、脂质与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-17(IL-17)等信号通路是葛根汤治疗偏头痛的可能信号通路。Western Bl...     

基于网络药理学、分子对接及体内实验探讨二至丸改善认知障碍的作用机制

目的 基于网络药理学、分子对接及体内实验探讨二至丸改善认知障碍的潜在作用机制。方法 (1)通过TCMSP数据库检索并结合文献资料补充,筛选二至丸的活性成分;通过TCMSP、Pubchem、Swiss Target Prediction数据库进行二至丸活性成分作用靶点预测;通过OMIM、DisGeNET和GenCards数据库筛选认知障碍疾病相关靶点;取二至丸活性成分作用靶点和认知障碍疾病相关靶点的交集靶点(共同靶点),作为二至丸治疗认知障碍的潜在作用靶点;将交集靶点导入STRING平台进行蛋白互作(PPI)网络分析,筛选出关键靶点;采用Cytoscape 3.8软件构建“药物-活性成分-关键靶点”网络,筛选出二至丸治疗认知障碍的关键活性成分及核心靶点;利用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析;采用Discovery Studio 2.5软件的CDOCKER模块对前3位关键活性成分与前5位核心靶点进行分子对接验证。(2)将昆明种小鼠随机分为6组：空白组、模型组、多奈哌齐组(3 mg·kg^-1·d^-1)及二至丸低、...     

基于网络药理学和实验验证探讨加味孔圣枕中丹治疗痴呆的分子机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术研究加味孔圣枕中丹(JWKSP)治疗痴呆的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)筛选JWKSP活性成分及靶点;利用DrugBank、disGeNET数据库以及治疗靶点数据库(TTD)筛选痴呆靶点。活性成分作用靶点和疾病靶点交集获得JWKSP治疗痴呆的潜在作用靶点,Metascape数据库进行潜在作用靶点的基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路归类分析。Cytoscape 3.6.0软件构建JWKSP-中药-活性成分-潜在作用靶点-通路网络。AutoDock 4.2.6软件进行分子对接验证实验。体内复制大鼠血管性痴呆(VD)模型,JWKSP灌胃给药干预30 d, Morris水迷宫实验评价其记忆力,免疫组织化学法检测大脑皮质脑源性神经营养因子(BDNF)表达水平。结果：筛选获得JWKSP活性成分88个,对应痴呆潜在作用靶点80个,主要涉及血液循环、血管直径调节、化学突触传递调控等生物过程;铵离子结合、儿茶酚胺结合、神经递质结合等分子功能以及膜微区等细胞组分。通路分析显...     

基于网络药理学研究复健片治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的：借助网络药理学平台技术探究复健片治疗缺血性脑卒中（IS）的作用机制。方法：利用中药系统药理学与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、Batman-TCM数据库筛选出复健片中何首乌、桑寄生、决明子、淫羊藿、海马的活性成分及其靶点;利用Uniprot数据库对复健片中靶点信息进行校对;运用GeneCards数据库获取IS的疾病靶点基因;通过Cytoscape 3.7.2软件及STRING 11.0数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行生物富集分析。结果：获取复健片治疗IS的共45个活性成分和144个靶点,关键靶点涉及IL6、IL1β、TNF、VEGFA、NOS3等;IS相关靶点1 485个;获得300条GO生物过程和84条相关信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、cGMP-PKG信号通路、cAMP信号通路、核因子κB信号通路等。结论：复健片是通过多成分、多靶点、多通路相互作用的机制来达到治疗IS的目的,通过本研究为复健片面向临床进一步推广应用提供理论支持,并为未来研究提供思路。     

固本解毒方调控肺腺癌免疫微环境的分子机制研究及实验验证

目的：通过网络药理学探究固本解毒方干预肺腺癌免疫微环境的作用机制,并通过动物实验验证。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库筛选出固本解毒方的候选化学成分及其相关靶点,利用疾病靶点数据库获取肺腺癌及肿瘤免疫微环境的相关靶点,取交集后获得潜在作用靶点;运用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析数据库(STRING)建立PPI网络,以Cytoscape软件构建“中药-活性成分-靶点”网络图。最后,通过分子对接及动物实验进行结果验证。结果：共获得固本解毒方的候选活性成分251种,潜在作用靶点217个;中药的核心有效成分包括槲皮素(Quercetin)、β-谷甾醇(Beta-sitosterol)等,关键潜在作用靶点为促分裂原活化的蛋白激酶1(MAPK1)、促分裂原活化的蛋白激酶3(MAPK3)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)、促分裂原活化的蛋白激酶14(MAPK14);所涉及的主要信号通路主要包括磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)、促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)等信号通路;分子对接结果显示Beta-sitosterol与各核心潜在作用靶点均...     

靶细胞捕集联用网络药理学、分子对接及实验验证分析桃红四物汤活性成分及调控缺血性脑卒中潜在作用机制研究

通过靶细胞捕集联用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF-MS)筛选鉴定桃红四物汤(Taohong Siwu Decoction, THSWD)潜在的抗脑卒中活性成分，并采用网络药理学、分子对接及实验验证探究THSWD活性成分对缺血性脑卒中(ischemic stroke, IS)治疗的潜在作用机制。利用UPLC-Q-TOF-MS技术联合UNIFI数据分析平台分析THSWD与靶细胞共孵育后的细胞破碎液成分，通过网络药理学对其潜在活性成分与IS疾病进行靶点搜集，将两者交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)、基因本体论(Gene Ontology, GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)信号通路富集分析，构建靶细胞捕集成分-核心靶点-信号通路可视化网络，将活性成分与PPI网络排名靠前的靶点进行分子对接，并通过体外药效学进行验证。靶细胞破碎液中共鉴定出15个潜在的活性成分，包括双环单萜类、氰苷类、黄酮醇类、醌式查耳酮类、苯...     

基于网络药理学-分子对接及实验研究探讨当归效应组分治疗原发性痛经的作用机制

目的:采用网络药理学-分子对接的方法，探讨当归效应组分治疗原发性痛经(PD)的物质基础及作用机制，并进行动物实验验证。方法:利用气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)检测当归效应组分的化学成分；通过TCMSP、UniProt Database、Pubchem、Swiss Target Pridiction数据库检索当归效应组分化学成分的作用靶点；采用TTD、Drugbank、pharmGKB、Uniprot、DisGeNET数据库检索PD相关的靶点，并建立数据集；筛选成分靶点和疾病靶点映射的共同靶点；利用David和KOBAS数据库对共同靶点进行通路的富集与分析；采用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-通路”的可视化网络关系图，分析当归效应组分治疗PD的物质基础及作用机制；以Discovery Studio软件对网络模型分析结果进行分子对接验证；根据预测结果进一步进行实验验证：将72只雌性KM小鼠随机分为正常对照组、模型对照组、布洛芬0.07 g/kg组、丁苯酞0.05、0.10、0.20 g/kg组，每组12只。采用戊酸雌二醇联合缩宫素建立小鼠原发性痛经模型。观察丁苯酞对模型小鼠...     

基于GEO 芯片联合网络药理学探讨化瘀通络汤治疗缺血性脑卒中作用机制

目的：基于GEO 芯片联合网络药理学探讨化瘀通络汤治疗缺血性脑卒中（IS） 的作用机制。方法：通过GEO 芯片结合GeneCards 数据库获取IS 的疾病靶点,利用TCMSP、文献检索结合SwissTargetPrediction 筛选出化瘀通络汤治疗IS 的有效成分和作用靶点,通过STRING 数据库与Cytoscape 3.8.2 软件构建蛋白质相互作用（PPI） 网络及拓扑分析,采用DAVID 数据库和R 语言对共同靶点进行GO 功能及KEGG 通路富集分析,并对化瘀通络汤的主要成分与关键治疗靶点进行分子对接验证。结果：共筛选出疾病靶点3 964 个,化瘀通络汤作用靶点565 个,化瘀通络汤治疗IS 的关键靶点有非受体酪氨酸激酶（Src）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、表皮生长因子受体（EGFR） 等;富集分析主要涉及神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、缺氧诱导因子-1 信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。分子对接结果显示,化瘀通络汤主要活性化合物（木犀草素、槲皮素） 与主要治疗靶点（Src、EGFR） 有较高的结合效能。结论：化瘀通络汤可能通过作用于Src、EGFR 等核心靶点,减轻神经炎症反应、促进血管新生等多个方面发挥治疗IS 的作用。     

基于GC-MS技术和网络药理学探讨蛇床子挥发油止痒作用的机制

目的：采用GC-MS技术和网络药理学对蛇床子挥发油成分进行分析,筛选潜在活性成分及作用靶点与机制。方法：采用水蒸气蒸馏法提取蛇床子挥发油,通过GC-MS技术分析鉴定其中的主要成分;利用TCMSP网络药理学平台对蛇床子潜在活性成分及其作用靶点进行筛选;通过STRING数据库构建PPI网络模型;利用David数据库对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,采用Cytoscape软件构建“成分-靶点-通路”图;将潜在活性成分与关键靶点进行分子对接,验证之前的预测。结果：采用GC-MS技术结合网络药理学方法最终从蛇床子挥发油中分离鉴定14个主要成分;通过构建Venny图得到成分-疾病交集的20个关键靶点,这些靶点共同作用9条关键通路,并通过分子对接模拟进行验证后显示与预测结果相符合。结论：利用GC-MS技术联合网络药理学方法,揭示了蛇床子挥发油中α-蒎烯、β-罗勒烯、β-红没药烯等潜在活性成分与PTGS2、CASP3、ABCB1、CYP1A1等关键靶点,关键靶点通过调控雌激素信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等通路发挥药效的相互作用关系,从而进一步阐明了蛇床子挥发油是通过多成分、...     

基于网络药理学和分子对接探讨肉苁蓉苯乙醇总苷对肝细胞癌的潜在分子机制

目的：通过网络药理学及分子对接技术,探讨肉苁蓉苯乙醇总苷(CPhGs)治疗肝细胞癌(HCC)的潜在分子机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库及文献收集肉苁蓉苯乙醇总苷的活性成分及潜在作用靶点。通过TTD,GeneCards等数据库获得与HCC相关的疾病基因,得到药物靶点与疾病靶点的交集为肉苁蓉苯乙醇总苷治疗HCC的潜在作用靶点,将交集靶点导入蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选关键靶点。将关键靶点导入DAVID数据库,进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最终,利用Autodock vina软件对筛选出的蛋白与肉苁蓉苯乙醇总苷活性成分进行分子对接。结果：肉苁蓉苯乙醇总苷中有29种活性成分及410个靶基因,涉及PI3K-AKT信号通路、癌症信号通路、癌症蛋白聚糖通路、VEGF信号通路等以发挥治疗HCC的作用。分子对接结果显示,筛选的靶点受体蛋白与活性成分具有较好的结合活性。结论：肉苁蓉苯乙醇总苷可能通过多组分、多靶点和多途径的方式调节癌细胞、血管生成等相关靶标和途径,从而对HCC产生治疗作用。     

基于网络药理学和实验验证探究黑果小檗花色苷防治AD的作用机制

基于网络药理学、分子对接技术和体外实验验证探究黑果小檗花色苷防治阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease, AD)的潜在作用机制。借助数据库和在线平台筛选黑果小檗花色苷活性成分的潜在靶点和AD相关作用靶点，运用STRING数据库和Cytoscape软件对两者共同靶点进行蛋白相互作用网络构建和拓扑学分析，利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，对活性成分和NF-κB/TLR4通路相关靶点进行分子对接，然后利用脂多糖诱导BV2细胞构建AD神经炎症模型进行体外实验验证。该研究共筛选出黑果小檗活性成分潜在作用靶点426个，药物-疾病共同靶点329个，蛋白-蛋白网络互作筛选出14个关键靶点，富集分析得到623个GO功能富集条目和112个KEGG通路富集条目；分子对接结果显示活性成分和NF-κB、IκB、TLR4和MyD88有较好的结合能力，其中结合能力最强的是锦葵素-3-O-葡萄糖苷；同时，与模型组比较，不同剂量锦葵素-3-O-葡萄糖苷在不影响BV2细胞存活率的情况下，一氧化氮浓度均显著下降；同时锦葵素-3-O-葡萄糖苷可下...     

基于网络药理学和细胞实验探讨参苓白术散对肝纤维化中TGF-β通路的作用机制

目的：基于网络药理学预测参苓白术散抗肝纤维化（HF）的潜在作用靶点及可能相关的信号通路，同时通过体外细胞实验验证其潜在的分子机制。方法：运用TCMSP和BATMAN-TCM数据库初步获取参苓白术散的活性成分和作用靶点，借助Gene Card和OMIM数据库收集疾病相关的靶点，两者取交集绘制韦恩图，采用Cytoscape 3.7.2软件建立“药物-活性成分-靶点”网络图，并通过STRING数据库获得PPI网络，通过GO及KEGG富集分析筛选出主要作用通路和靶点蛋白。根据预测情况通过细胞实验对生物学分析进行验证。建立大鼠肝星状细胞（HSC-T6）模型，设置空白组，低、中、高剂量组分别给予100、200、400μg/mL参苓白术散处理，阳性对照组给予200μg/mL秋水仙碱处理。MTT法检测不同组别细胞增殖的抑制率，划痕实验检测用药后HSC-T6的迁移能力，ELISA法检测给药后各组细胞内α-SMA蛋白含量，Western blot法检测各组细胞中TGF-β1、Smad2和Smad7蛋白的表达水平。结果：经筛选最终获得参苓白术散潜在靶点970个，疾病靶点513个，药物与疾病交集靶点117个，...     

基于网络药理学及体内实验探讨射麻止喘液治疗中性粒细胞型哮喘的分子机制

目的 基于网络药理学及体内实验探讨射麻止喘液治疗中性粒细胞型哮喘(NA)的分子机制。方法 (1)利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、文献检索及Swiss ADME、Swiss Target Prediction数据库检索、筛选射麻止喘液的活性成分及其作用靶点。利用OMIM、Gene Cards、Dis Ge NET及Drug Bank数据库检索、筛选NA疾病相关靶点。通过微生信平台对射麻止喘液活性成分作用靶点与NA疾病相关靶点取交集,得到射麻止喘液治疗NA的潜在作用靶点(共有靶点)。采用Cytoscape 3.8软件构建“中药-活性成分-潜在作用靶点”网络。通过STRING数据库建立潜在作用靶点蛋白互作(PPI)网络,使用内置Mcode插件分析获得核心靶点。使用Metascape平台对潜在作用靶点进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。(2)将BALB/C小鼠适应性喂养1周后,随机分为空白组、NA模型组、射麻止喘液低剂量组(2.5 g·kg^-1)、射麻止喘液高剂量组(10 g·kg^-1)、地塞米松...     

六味地黄汤干预肾纤维化作用机制的网络药理学分析

目的 基于网络药理学方法 及体内外实验探讨六味地黄汤(LWDHD)干预肾纤维化的潜在作用机制。方法 (1)通过TCMSP平台检索筛选LWDHD的活性成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库检索肾纤维化疾病相关靶点;利用R语言VennDiagram包对LWDHD活性成分靶点和肾纤维化疾病相关靶点取交集,得到共同(交集)靶点,即为LWDHD治疗肾纤维化的关键靶点;运用Cytoscape 3.9.1软件构建LWDHD治疗肾纤维化的“活性成分-关键靶点”网络,分析核心活性成分;通过STRING平台构建共同靶点蛋白互作(PPI)网络;分别通过DAVID数据库、R语言软件的Pathview包对共同靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析;采用AutoDock Vina软件对核心活性成分与核心靶点进行分子对接。(2)体内实验：将24只雄性SD大鼠随机分为4组：假手术组、模型组、LWDHD组(6.75 g·kg^-1)及依那普利组(10 mg·kg^-1),每组6只。采用单侧输尿管结扎术(UUO)建立肾纤维化大鼠模型。各组以相应药物灌胃给...     

基于网络药理学和体外验证实验探索斑蝥素治疗肝癌的作用机制

目的：利用网络药理学分析斑蝥素抗肝癌的作用机制,并通过分子对接技术和体外实验进行验证。方法：采用TCMSP数据库和Swiss Target Prediction平台预测斑蝥素的潜在靶点集。通过检索GeneCards和TTD数据库获取肝癌的靶点,取肝癌和斑蝥素靶点的交集,构建疾病药物共同靶点网络图,并依据拓扑网络分析得到斑蝥素抗肝癌的核心靶蛋白。通过DAVID数据库对作用靶点进行GO注释和KEGG通路富集分析,利用AutoDock将核心靶点与斑蝥素进行分子对接,并通过Real-time PCR和Western blot实验对相关的核心靶蛋白及通路进行验证。结果：共筛选出31个共同靶点和12个核心靶点。共同靶基因主要参与调控细胞凋亡、增殖等生物学过程,在蛋白质磷酸化和去磷酸化过程中发挥作用,主要涉及PI3K/Akt、MAPK、p53等信号通路。分子对接结果显示斑蝥素和核心靶点具有较稳定的结合活性。细胞实验表明,斑蝥素能够抑制HepG2细胞的增殖,显著提高TP53、PTEN、ABCB1和PTGS2的mRNA表达,降低PI3K/Akt信号通路中PI3K、Akt的蛋白表达。结论：斑蝥素主要通过上...     

基于网络药理学与实验验证探讨资木瓜治疗类风湿关节炎的作用机制

运用网络药理学方法探讨资木瓜治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的物质基础和作用机制,并通过分子对接和实验验证资木瓜抗RA的潜在靶点。从中药系统药理学数据库与分析平台筛选资木瓜中的活性成分及靶点。利用GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库获取RA相关靶点,两者取交集,即资木瓜治疗RA的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.9.0软件,构建“中药-活性成分-共同靶点-疾病”网络。利用STRING建立蛋白相互作用(PPI)网络,运用RStudio 4.1.0软件对核心基因进行可视化。运用DAVID数据库进行基因本体(Gene Ontology, GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析,预测其富集的信号通路并进行可视化展示。将筛选出来的活性成分作为配体,与筛选得到的RA核心靶点进行分子对接分析,最后通过动物实验进一步验证实验结果。资木瓜的主要活性成分4种、对应靶点137个,药物疾病共同靶点37个;GO富集分析得到239个条目(P<...     

基于网络药理学与分子对接探讨丹参-石菖蒲-丁公藤治疗排卵障碍性不孕症的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接,探讨丹参-石菖蒲-丁公藤治疗排卵障碍性不孕症的作用机制。方法：采用TCMSP筛选出丹参、石菖蒲、丁公藤的有效活性成分及对应靶点,通过GeneCards数据库找出疾病靶点,并在UniProt数据库中将靶点基因名称标准化。通过韦恩图的绘制寻找出药物-疾病的潜在靶点基因,运用STRING数据库和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Cytoscape选出关键靶点,导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过AutoDock与Pymol将关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果：共获得丹参-石菖蒲-丁公藤的70种有效活性成分,1071个潜在靶点。共得到GO功能富集条目376个,其中生物过程234个、细胞组分68个、分子功能74个。KEGG通路富集分析共得到通路93条。分子对接结果显示,药物主要活性成分与疾病关键靶点均有较好的结合活性。结论：丹参-石菖蒲-丁公藤的多种有效成分通过不同的通路发挥其治疗排卵障碍性不孕症的作用,具有良好的临床运用前景。     

基于网络药理学及斑马鱼模型的瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病的作用机制研究

目的基于网络药理学方法和斑马鱼模型探讨瓜蒌薤白半夏汤干预慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmoriary disease,COPD)的潜在作用机制。方法运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)、中医药综合数据库(TCMID)以及国内外相关文献检索瓜蒌薤白半夏汤的主要活性成分,通过TCMSP和SwissTargetPrediction数据库预测靶点;通过GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和TCMSP数据库获取COPD相关靶点,并采用交集法筛选出与瓜蒌薤白半夏汤活性成分作用的共同靶点。运用Cytoscape 3.7.1软件构建"中药-活性成分-靶点"网络,通过String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;通过DAVID数据库对共有基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;借助斑马鱼炎症模型对筛选的靶点进行实验验证。结果瓜蒌薤白半夏汤共筛选出成分955个,潜在活性成分106个,核心活性成分如芹菜素、茴香酸、美迪紫檀素、金圣草黄素、香叶木素等74个,对应靶点1134个;PPI网络分析获得瓜蒌薤白半夏汤干预COPD的关键作用靶点408个,包括碳酸酐酶9(carbonic anhydrase 9,CA9)、前列腺素内过氧化物合酶1(prostaglandin-endoperoxide synthase 1,PTGS1)、胰岛素(insulin,INS)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(serine/threonine protein kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、MAPK3、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等;GO功能及KEGG通路富集分析得出与瓜蒌半夏薤白汤干预COPD作用相关的生物过程1096个,如炎症反应、细胞溶质、酶结合等;相关信号通路125条,如癌症通路、TNF信号通路、前列腺癌、缺氧诱导因子1信号通路、神经活性配体-受体相互作用等。斑马鱼炎症模型实验结果显示,瓜蒌薤白半夏汤显著降低IL-6、B淋巴细胞2(B-cell lymphoma 2,BCL2)和EGFR mRNA表达水平(P0.05),降低半胱氨酸蛋白酶8(Caspases 8,CASP8)m RNA表达水平。结论瓜蒌薤白半夏汤可能通过作用于EGFR、IL-6、BCL2、CASP8等靶点,调节多条信号通路,从而发挥对COPD的治疗作用。     

基于网络药理学研究黄芪抗动脉粥样硬化的作用机制

目的 利用网络药理学研究黄芪治疗动脉粥样硬化的潜在靶点和作用机制,并通过体外实验进行初步验证.方法 通过多个数据库筛选出黄芪的活性成分以及与其作用的动脉粥样硬化相关靶点,借助Cytoscape软件构建中药-成分-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,确定相关的靶点和通路.体外实验通过MTT法...     

基于网络药理学与体外实验探讨川芎活性成分治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的 运用网络药理学和体外细胞实验探究川芎活性成分治疗缺血性脑卒中的潜在作用机制。方法检索TCMSP数据库、Genecards数据库、Drugbank数据库等及相关文献,获得川芎活性成分、作用靶点及缺血性脑卒中相应疾病靶点,并将作用靶点与获得的疾病靶点的交集作为潜在靶点;利用String平台,对潜在靶点构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络;采用R语言软件包对潜在靶点进行基因本体（Gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析,然后使用Cytoscape软件分析其网络拓扑结构,筛选其核心靶点,并进行分子对接验证。在此基础上,通过CCK-8法检测川芎中的活性成分对缺氧缺糖/再灌注损伤细胞模型的作用,免疫印迹法（Western blot）验证川芎单体成分对相关靶点蛋白的影响。结果 川芎治疗缺血性脑卒中的主要潜在活性成分有16个;药物-疾病靶点有53个;涉及的信号通路主要有神经元神经活性配体-受体相互作用信号通路、钙离子信号通路、血管内皮生长因子信号通路等;关键核心靶点与活性成分藁...