贵州地区丙型肝炎病毒基因亚型分布状态

目的:探讨贵州地区丙型肝炎病毒(HCV)基因亚型分布状态.方法:在164份抗HCV抗体和HCVRNA均阳性的血清标本中,分别提取HCV RNA,通过逆转录巢式PCR(RT nested-PCR)扩增C基因的羧基端至E1基因的氨基端长度为474 bp的片段,测定其核苷酸序列,与GenBank中已知的HCV序列进行系谱分析,确定HCV基因亚型.结果:164份HCV感染者血清标本通过RT-nested均获得阳性条带,特异性和敏感性均较好,序列与系谱分析显示1a3例(1.8％)、1b 58例(35.4％)、2a 2例(1.2％)、3a 25例(15.2％)、3b 38例(23.2％)及6a 35例(21.3％).结论:贵州地区HCV流行的基因亚型有1a,1b,2a,3a,3b,6a共6种,主要为1b、3a、3b和6a亚型,提示贵州地区HCV流行的基因亚型呈现多样性.     

丙型肝炎病毒基因分型

<正> 自1989年Choo等成功地从一只黑猩猩身上分离出HCV cDNA克隆以来,世界各地不断有新的HCV病毒株被发现。HCV的基因变异从5’UT区开始一直延伸到3’末端,贯穿于整个基因组序列。根据其基因的变异程度,可以将HCV分为数个基因型,各型之内尚可分出数个亚型。型间的基因变异程度可达33％。这种程度的基因变异很可能导致病毒     

不同人群丙型肝炎病毒基因分型

目的 研究不同人群丙型肝炎病毒的基因分型。方法 对141例抗HCV（ ）、60例抗HCV（-）及28例正常献血员的共132份HCV-RNA阳性血清,运用限制性片段长度多态性分析（RFLP）法作酶切分型。结果 3组人群不同基因型检出率分别是1b/Ⅱ型87.18%、100%、100%;2a/Ⅲ1.71%、0、0;两者混合型（1b/2a型）11.11%、0、0。对抗HCV（ ）血清,分为ALT正常组和异常组,2组人群不同基因型检出率分别是1b/Ⅱ型93.33%、83.33%;2a/Ⅲ型0、2.78%;两者混合型7.14%、13.89%。结论 我国不同人群中HCV感染者均以HCV1b/Ⅱ型为主,今后应以HCV1b/Ⅱ型为重点,加强HCV的诊断、治疗和疫苗研制工作。     

丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus，HCV)是单股正链RNA病毒，属黄病毒科丙型肝炎病毒属。全长约9．4kb，其序列为：341b的5’非编码区(5’URT)，编码3011个氨基酸的长开放读框，约27b的3’非编码区(3’URT)。在病毒复制中，氨基端有三个蛋白(C、E1、E2／NSl)，羧基端有四个蛋白(NS2、NS3、NS4、NS5)。由于RNA复制酶的低保真性及缺乏校正功能，HCV呈高度异质性；不同地区，不同患者，甚至同一患者在不同病程中HCV分离株，无论是核苷酸序列，还是氨基酸序列均有显著差异^[1][2][3]。本文就丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作一综述。     

广西地区丙型肝炎病毒的基因分型及其临床意义

目的：探索广西地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型的分布特征。方法：收集广西地区137例HCV—RNA阳性患者的血清样本,采用逆转录巢式PCR法扩增HCVNS5B区段,对PCR终产物纯化测序,测序结果与Genbank中的标准株全基因序列比对,并构建HCVNSSB区段系统进化树。结果：广西地区137例样本中,主要基因型为1b型（58．4％）,其次是6a型（12．4％）,3b型（10．2％）,la型（7．3％）,2a型（7．3％）,3a型（4．4％）。进一步分析表明,HCV基因型分布与性别无关（P〉0．05）,而与年龄有关（P〈0.05）,3型及6a型主要见于年轻患者。结论：构建HCVNSSB区段系统进化树能得到准确的HCV基因型;广西地区HCV基因型呈多样化,以1b型为主,6a型和3b型次之,且新发现6例3a型;基因分型为不同基因型的HCV感染者的治疗和疗效预测提供了理论依据。     

某地区吸毒人员丙型肝炎病毒的流行病学和基因分型研究

目的：了解吸毒人群中丙型肝炎病毒（HCV）的流行和基因分布现状,探索HCV的传播规律。方法：采集本市强制戒毒所576份吸毒人员和本站体检的从业人员210份血清标本,用ELISA法对所有标本进行抗HCV的检测;检出抗HCV阳性的血清进一步用特异性引物RT－PCR法进行基因分型。结果：576份标本中,经血途径（静脉吸毒、共用注射器）吸毒或有输血史和用血制品史的吸毒者,其抗HCV检出率（13．8％）明显高于经口吸毒者（6．3％）,说明静脉吸毒、共用注射器吸毒、用血制品、输血都是感染HCV的危险因素。经口吸毒者抗HCB检出率明显高于从业人员,提示经口吸毒在传播HCV上具有重要意义。此外,本地籍吸毒者的抗HCV检出率（5．7％）明显低于外省吸毒者（27．7％）、外省有血途径感染机会的吸毒者,83．3％都感染了HCV,本地有同样途径有吸毒者,仅有8．6％感染了HCV;这可能与外省有关城市的高感染率有关。结果还显示,山西省吸毒人群的HCV基因型的分布与从业人员较一致,均以1b型为主（78．9％）,其次为2a型（15．8％）和1b/2a混合型（5．3％）;未检出1b型、2b型和3a型。结论：该吸毒人群中HCV基因以1b型占优势。其分布与南方城市和本省的其他人群相近^[6]。血途径仍是HCV感染的主要途径,但经口吸毒在HCV传播上的重要意义应引起重视。     

2009~2013年四川大学华西医院1 998株丙型肝炎病毒基因分型研究

目的 了解四川大学华西医院近年来检测出的丙型肝炎病毒基因型分布特点。方法 收集2009年1月至2013年12月间在四川大学华西医院就诊的丙型肝炎病毒感染者的基因分型结果,分析基因型分布特征。结果 1 998例丙型肝炎病毒感染者中,共检出5种基因型、15种基因亚型,其中4例为2种基因亚型的混合感染。其基因型或亚型分布:1a型8例（0.40%）、1b型1 368例（68.47%）、1c型18例（0.90%）、2a型78例（3.90%）、2b型1例（0.05%）、2i型16例（0.80%）、3a型291例（14.56%）、3b型154例（7.71%）、3k型4例（0.20%）、5a型1例（0.05%）、6a型50例（2.50%）、6b型3例（0.15%）、6h型1例（0.05%）、6n型1例（0.05%）,混合感染中1b/1c型、1b/6h型、2c/2a型、3b/3k型各1例（各占0.05%）。不同性别间主要基因亚型分布差异无统计学意义（P ＞0.05）,不同年龄段间分布差异有统计学意义（P <0.05）。结论 四川大学华西医院就诊患者丙型肝炎病毒基因亚型主要为1b亚型,其次为3a、3b、2a、6a亚型,同时还存在1a、1c、2b、2i、3k、5a、6b、6h、6n、1b/1c、1b/6 h、2c/2a、3b/3k等单一或混合基因型,提示患者基因型存在多样性。     

延边地区341例慢性丙型肝炎病毒基因分型的检测临床观察

[背景]观察延边地区慢性丙型肝炎病毒(HCV)基因分型情况.[病例报告]采用荧光PCR法检测HCV RNA含量,并对含量≥104 U/mL的341例标本进行HCV基因分型检测.结果见,慢性HCV基因Ⅰ型阳性的朝鲜族和汉族分别为48,68例,阳性率分别为37.2%,32.1%,两者间差异无统计学意义(χ~2=0.942,P>0.05);慢性HCV基因Ⅰ型阳性的男性和女性分别为97,19例,阳性率分别为36.7%,24.7%,两者间差异有统计学意义(χ~2=3.867,P<0.05).[讨论]延边地区朝鲜族和汉族慢性HCV基因Ⅰ型感染阳性率间无明显差异,但性别间有显著差异.     

丙型肝炎病毒基因分型检测方法的研究

丙型肝炎病毒(HCV)是一极易变异的正链RNA病毒，因其易变异及含量低等原因，常能逃避机体的免疫应答使感染慢性化。HCV存在多种基因型，而不同基因型与HCV感染的临床表现、预后、干扰素疗效、肝硬化及肝癌的关系等均有一定相关性。因此HCV基因型别的研究对丙肝慢性化的作用以及研制有效的疫苗等，均具有重要的     

山东地区丙型肝炎病毒基因型及相关因素分析

目的 探索山东地区丙型肝炎病毒(HCV)基因分型及其相关关系.方法 采用基因芯片技术检出了448例HCV感染者的血清HCV基因型,同时检测了其中388例血清HCV RNA的含量,并对HCV基因型与HCV感染者的性别、年龄和HCV RNA含量进行了相关性分析.结果 检测到4种基因亚型(1a、1b、2a、3b),呈8种组合;其中1b和2a亚型多见,分别占61.2%(274例)和32.8%(147例).Logistic多因素分析表明,基因1b型与HCV高病毒载量独立相关.结论 山东地区HCV基因分型以1b型为主,且与HCV高病毒载量相关.     

广州地区丙型肝炎患者HCV基因分型研究

目的研究广州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布的变化情况。方法收集207例HCV RAN阳性丙型肝炎患者血清,对其HCV Core区(C区)和NS5B区基因序列进行RT-nPCR扩增,两区扩增成功的PCR产物进行基因测序,测序结果分别与相应的参照株序列比对,构建系统进化树,两区基因分型结果一致者确定HCV基因亚型。结果 185例HCV C区和NS5B区都扩增成功,其中179例两区基因分型结果一致。共检出1、2、3、6型4种基因型和8种基因亚型,其中1b型占40.78%(73/179),6a型占27.37%(49/179),3b型占11.73%(21/179),3a型占8.94%(16/179),2a型占6.15%(11/179),1a型占3.91%(7/179),2b型占0.56%(1/179),6n型占0.56%(1/179)。1b株可分为A、B、C三大簇,A簇与中国广泛流行1b株接近、B簇与中国中部及南部地区流行1b株接近,6a株分为Ⅰ、Ⅱ两大簇,与献血人群及静脉吸毒人群中6a型株接近。结论广州地区丙型肝炎患者HCV基因型以1b、6a、3型为主,存在多种亚型;1b型株包含中国大部分地区的1b型株,6a、3型已取代2a型分别成为第二、三主要流行基因型;未发现6型变异株。     

乙肝病毒基因分型检测芯片的构建及初步应用

目的:构建乙肝病毒(HBV)常见基因型的分型芯片,并应用分型芯片调查HBV基因型分布。方法:应用生物信息学软件针对乙肝病毒4种常见基因型的特征区域和保守区域分别设计分型探针和通用探针,在优化条件下通过重复杂交及分型测序检验芯片的重复性与可靠性后应用于临床,对150例不同类型的乙肝患者进行HBV基因分型。结果:分型探针和通用探针检测重现率分别为94.7%及100%,反馈的测序结果与芯片分型结果完全一致;经芯片分型发现辽宁省HBV基因型分别为C型占68.7%,B型占22.7%,B、C混合型占8.7%,未发现A、D型。结论:基因芯片技术为乙肝病毒基因分型提供了快速准确的检测方法,辽宁地区HBV基因型分布以B、C两型为主,C型占主要优势。     

Detection of hepatitis G virus RNA in hepatitis C patients and hepatitis C virus infected hemodialysis patients

AlthoughsensitiveandspecificimmunoassayandmolecularbiologicaltechniquesforthedetectionofthehepatitisA--Evirusesareavailable,theetiologyofasubstantialfractionofpost--transfusionandcommunity--acquiredhepatitiscasesremainsundefined[1],suggestingtheexistenceofadditionalcausativeagents.Anewhumanhepatitisviruswasisolatedbytwoindependentgroups.ThenewvirusisprovisionallydesignatedashepatitisGvirus(HGV)[ZJorGBvirusC(GBV~C)[3'4),whichwasthoughttobetheagentofpartofthenon--A--Ehepatitispatients.Fro…     

丙型肝炎病毒基因分型的研究进展

丙型肝炎病毒是一个高度异质性的RNA病毒,目前可分为6个基因型与不同的亚型.本文就 HCV基因型构成、HCV基因分型的检测方法与命名、HCV基因型的流行病学的意义、HCV基因型与疾病严重性、急性HCV感染的转归、IFN-α疗效、HCV基因分型与疫苗的研制等有关的研究作一综述.     

丙型肝炎患者血清中丙型肝炎病毒交叉中和抗体的检测

[摘要]目的分析HCV感染者血清中是否存在交叉反应性中和抗体。 方法以分泌表达HCV包膜E2蛋白真核表达质粒转染的293T 细胞培养上清液中的HCV E2蛋白作为检测抗原,建立检测HCV E2抗体的ELISA方法,检测32份HCV抗体阳性的慢性丙肝患者血清,然后用免疫荧光分析血清与HCV全长包膜蛋白表达质粒转染的293T细胞的结合反应,再用5株HCV假病毒(HCVpp)及两株细胞培养产生的HCV(HCVcc)为模型分析血清的病毒中和活性。 结果32份HCV抗体阳性血清中,26份血清可检测出E2抗体,阳性率81.3%。其中HCV RNA阳性的12份血清均为E2抗体阳性,E2抗体水平与HCV RNA水平负相关。HCV E2抗体阳性血清对5株HCVpp以及两株HCVcc的感染性均有不同程度的中和作用,中和活性与E2抗体水平相平行。结论HCV感染可诱导保护性体液免疫应答,丙肝患者血清中存在交叉中和抗体,提示开发能诱导广泛交叉中和抗体的丙肝疫苗具有可行性。     

新疆汉族、维吾尔族丙型肝炎感染者 HCV 基因型研究

目的：了解新疆不同地区汉族和维吾尔族（以下简称维族）丙型肝炎感染者丙型肝炎病毒（HCV）基因分型的特征,为新疆丙型肝炎的诊断和治疗提供依据。方法对380份汉族和维族丙型肝炎感染者血清样本先进行荧光定量 PCR 检测病毒载量,载量大于1×103 copies／mL 的再采用 PCR-反向点杂交法进行 HCV 基因分型。结果基因分型确定355份样本,成功分型率为93．4％,汉族和维族基因型检出率1b 型分别为59．91％、69．92％,2a 型分别为30．17％、12．20％,3a 型分别为5．60％、8．13％,3b 型分别为3．88％、8．94％。新疆乌鲁木齐和其他地区丙型肝炎感染者中,维族、汉族病例分布差异有统计学意义（P＜0．05）,且乌鲁木齐和其他地区男性、女性病例分布差异有统计学意义（P＜0．05）。乌鲁木齐地区病例中,维族、汉族男性感染者2a 型和女性感染者1b 、3b 型差异均有统计学意义（P＜0．05）。新疆其他地区,仅2a 型男性维族、汉族感染者发病有差异有统计学意义（P＜0．05）,其他基因型差异无统计学意义（P＞0．05）。结论新疆地区汉族和维族丙型肝炎感染者 HCV 基因型分布与国内大多数地区不同,汉族以1b 、2a 型为主,而维族以1b 型为主,其次是2a 、3a 、3b 型。     

Investigation of the genotype distribution of hepatitis C virus among Turkish population in Turkey and various European countries

Hepatitis C virus(HCV)infection is a global healthproblem.HCVis one of the leading causes for acuteand chronic hepatitis,liver cirrhosis and hepatocellularcarcinoma.1The prevalence of HCV infection variesfrom0.1%to0.2%in the West,to3%inMediterranean countries and up to6%in tropical areas.2The prevalence in Turkey is about1.8%.HCV isclassified into six different genotypes(genotypes1-6),each consisting of different subtypes.3-8HCV genotypesand their subtypes coexist in various geographic …     

RFLP基因分型在动态监测乙型肝炎病毒基因变异中的应用

目的探讨基因分型结合克隆后测序方法在动态监测ＨＢＶ基因变异中的价值。方法分析１例重型肝炎患者发 病后血清,用 ＰＣＲ扩增血清中 ＨＢＶ ｐｒｅＳ／Ｓ基因片段并克隆,２份标本各随机挑取 ３个阳性克隆进行测序;同时用 ＲＦＬＰ方法分析２份血清中ＨＢＶ毒株的基因型。结果ＰＦＬＰ分析２份血清为Ｂ基因型为主的Ｂ／Ｃ基因型混合毒株感 染;６个克隆中仅１株为Ｃ基因型。比较２份血清ＨＢＶ ｐｒｅＳ／Ｓ克隆核酸序列,有１７０个点位的差异,剔除Ｃ基因型株 后,仅５４个位点差异。结论克隆后测序结合ＲＦＬＰ对ＨＢＶ基因型测定有助于更准确地对ＨＢＶ基因变异进行动态分 析。