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目的利用网络药理学方法探索桃红四物汤治疗股骨头坏死的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards、OMIM、Drugbank数据库获取桃红四物汤治疗股骨头坏死活性成分与靶点,构建活性成分-靶点互作网络,绘制蛋白互作(PPI)网络并进行分子对接,最后行GO富集和KEGG通路富集分析。结果从桃红四物汤中筛选出活性成分69个,作用于股骨头坏死的主要活性成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素;关键靶点为血管内皮生长因子(VEGF)、白细胞介素-6(IL-6)及成骨细胞特异性转录因子2(Runx2)。分子对接服务器分析发现,桃红四物汤的活性成分与关键靶点能够紧密结合。GO富集分析显示,分子功能主要包括转录因子结合、类固醇激素受体活性、蛋白激酶结合等方面。生物过程主要涉及到细胞因子介导的信号通路、对类固醇激素的反应及细胞凋亡信号通路等生物学过程,细胞组成主要包括核转录因子复合体、蛋白激酶复合体、蛋白质-DNA复合物等。KEGG富集分析获取相关信号通路为VEGF、Janus激酶/信号转导与转录激活子(JAK/STAT)及核转录因子-kappa B(NF-κB)信号通路。结论桃红四物汤治疗股骨头坏死的作用机制在于应用槲皮素、山奈酚、木犀草素等活性成分,以VEGF、IL-6及Runx2为靶点,通过VEGF、JAK/STAT及NF-κB信号通路参与治疗股骨头坏死。 相似文献
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目的 通过网络药理学和分子对接方法预测黄连温胆汤治疗缺血性脑梗死的潜在机制。方法 利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)等数据库资料,并查阅文献获取黄连温胆汤的成分与靶点,导入Cytoscape 3.7.2软件创建中药-活性成分-靶点-疾病网络。借助在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类基因综合数据库(GeneCards)、治疗目标数据库(TTD)、DisGeNET和药物靶标数据库(DrugBank)等数据在线平台获取疾病相对应的靶点,基于STRING线上平台构建黄连温胆汤与缺血性脑梗死重合的蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络图。运用DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,利用PyMOL及Auto Dock等软件进行分子对接。结果 获得黄连温胆汤活性成分167种,包括豆甾醇和β-谷甾醇等,相对应的作用靶标322个;缺血性脑梗死疾病靶点2 529个,如肿瘤坏死因子(TNF)及细胞肿瘤抗原p53(TP53)等;药物与疾病交集靶点167个;GO富集分析共得到407条基因功能信息,KEGG富集分析发现133条通路,包括TNF信号通... 相似文献
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目的 采用网络药理学方法探讨定喘汤治疗支气管哮喘的作用机制.方法 利用TCMSP筛选定喘汤药物的有效活性成分,并通过GeneCards等数据库进行检索获得支气管哮喘相关的疾病靶点.采用DAVID v.6.8数据库进行GO富集分析及KEGG通路富集分析.结果 经数据库分析,定喘汤与支气管哮喘的共同靶基因为286个.GO-... 相似文献
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目的 观察辛伐他汀联合阿仑膦酸钠对酒精性股骨头坏死(AIANFH)的疗效及对Toll样受体4(TLR4)/核因子κB (NF-κB)通路的影响.方法 将90例AIANFH患者随机分为观察组和对照组,每组45例.对照组采用阿仑膦酸钠口服治疗,观察组在对照组基础上联合应用辛伐他汀治疗,疗程均为3个月.比较2组治疗后髋关节优... 相似文献
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正股骨头坏死也称股骨头缺血性坏死(Avascular necrosis of femoral head,ANFH)是不同病因导致股骨头血液供应中断或受损,骨细胞、骨髓造血细胞、脂肪细胞等发生一系列坏死及凋亡的病理生理过程,从而引起软骨下变性、坏死,造成股骨头塌陷,最终导致髋关节破坏性改变~([1])。据统计,股骨头坏死的发病率呈逐年递增趋势,既是一种临床常见性病,又属于临床难治性疾病。它不仅影响患者日常生活质量、心理健康,而且给家庭和社会带来巨大的负担。因此,ANFH的发病机制以及如何有效的治疗ANFH受到广大医 相似文献
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股骨头坏死(osteonecrosis of the femoralhead,ONFH)指由多种病因造成股骨头血液循环中断或受损,导致骨细胞、骨髓造血细胞、脂肪细胞等股骨头骨的有活力成分的不同程度地死亡,并且坏死与修复同时进行,股骨头坏死区的力学强度逐渐下降,继而引起股骨头塌陷[1],最终发展为严重的骨性关节炎嘲,患髋出现疼痛、功能障碍等症状。 相似文献
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目的:运用网络药理学方法,分析天南星-生姜药对治疗疼痛的潜在靶点和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索出天南星和生姜的活性成分和靶点。以“pain”为关键词,通过Dis Ge Net数据库检索出和疼痛相关的靶基因,并得到共同的靶点。通过String数据库构建蛋白互作网络图(protein-protein interaction, PPI)并进行分析,筛选出重要靶点。通过DAVID网站对共同靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果:从天南星和生姜药对中共筛选出10个有效成分,药物与疾病有63个共同靶点,包括CNR1、ESR1、MAPK3、CYP3A4、JUN、HDAC1等。GO分析得出的生物学过程包括炎症反应过程、EKR1和EKR2级联的正向调控、RNA聚合酶II启动子转录过程、G蛋白偶联受体信号通路等。KEGG富集共得到53条通路,其中与疼痛关系较为密切的包括钙信号通路、胆碱能突触信号传递、雌激素信号通路、癌症途径、5-羟色胺能通路等。结论:天南星-生姜药中的豆甾醇、β-谷甾醇、二氢辣椒碱等有效成分可能通过作用于CNR1、ESR1、MAPK3、C... 相似文献
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目的:基于网络药理学和分子对接分析丹栀逍遥散治疗失眠障碍的相关成分、靶点及通路,探讨其作用机制.方法:检索TCMSP数据库,获取丹栀逍遥散中各药物的活性成分及其靶点,在UniProt数据库中规范靶点名;在GeneCards、OMIM、TTD3个数据库中检索失眠障碍相关基因,筛选复方与疾病的交集靶点,将其导入String数据库,导出蛋白互作关系,并使用CytoscapeV3.8.0构建疾病-药物-成分-靶点网络和核心蛋白互作网络;利用Metascape平台分别对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将核心成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:共获得丹栀逍遥散活性成分102种,对应靶点147个,与失眠障碍交集靶点52个,其中核心成分12种,核心靶点7个;GO富集分析共得762条结果,其中主要涉及神经递质水平调节、肾上腺素受体活性以及突触膜的组成部分等;KEGG通路富集分析共获得61条通路,主要涉及:神经活性配体-受体相互作用通路;分子对接结果显示核心靶点与核心成分均能形成稳定结合.结论:初步获得丹栀逍遥散治疗失眠障碍的关键成分、关键靶点和关键通路,为临床使用和进一步研究提供参考. 相似文献
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老年股骨头缺血性坏死的探讨胡锬王鸿图由创伤、使用皮质激素等引起的股骨头缺血性坏死已有较多的报导;由内源性原因导致的老年股骨头缺血性坏死报导甚少。笔者近年来收集13例老年股骨头缺血性坏死的X线检查,就其发病原因和机理作如下探讨。资料与方法11一般... 相似文献
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股骨头坏死(osteonecrosis of the femoral head)是股骨头内骨组织死亡所引起的病理生理过程。目前认为股骨头坏死不是一个单一的过程,而是遗传因素和一个或多个危险因素综合作用的结果[1-2];股骨头坏死病因近年来研究报道较多,但本病的发病机制认识仍不够完善,因 相似文献
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目的 通过生物信息学、网络药理学和分子对接探讨洗腿又方治疗骨关节炎的药理学机制。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中获取骨关节炎滑膜的差异表达基因,使用TCMSP、HERB、TCMID等数据库搜集洗腿又方的活性成分及其作用靶点,并与疾病靶点取交集。通过STRING数据库及Cytoscape3.8.2软件对交集靶点进行蛋白互作和富集分析,最终将关键活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 获得骨关节炎滑膜的差异表达基因2072个,洗腿又方的活性成分20种,其治疗骨关节炎的靶点30个,进一步通过蛋白互作筛选获得HIF1A、CASP8、RAF1等关键靶点,富集分析发现洗腿又方主要通过干预细胞周期、炎症和内分泌等信号通路治疗骨关节炎,分子对接结果显示,关键有效成分芹黄素、槲皮素分别与关键靶点HIF1A、CASP8有良好的对接活性。结论 本研究探讨了洗腿又方治疗骨关节炎的可能活性成分、靶点及作用通路,为其应用于骨关节炎的治疗提供了理论依据。 相似文献
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摘要:目的:应用网络药理学方法及分子对接技术,探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路。方法:通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分,运用SwissTarget Prediction 数据库预测活性成分相关靶标,同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点,再将获得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1得到药物治疗疾病的潜在靶点;再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图(PPI)并筛选关键靶点。利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,再用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-通路”图并筛选核心成分与核心靶点。最后运用AutoDock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果:获得10个药物活性成分,得到相关潜在靶点284个,疾病潜在靶点11414个,药物治疗疾病的相关靶点260个,有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1等关键靶点58个;涉及PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等133条通路。结论:泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白,激活PI3K-Akt信号通路,从而抑制细胞凋亡;另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白,介导ErbB信号通路,从而干预炎症细胞生长。本研究基于网络药理学方法和分子对接技术,阐释了泽泻通过多种成分、多靶点、多信号通路发挥抗炎作用与机制,为该药的进一步研究提供了有益参考和科学依据。 相似文献
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目的:应用网络药理学方法探究益气化瘀补肾方治疗骨延迟愈合的潜在药效作用机制。方法:在TCMSP数据库中获取益气化瘀补肾方的主要化学成分,通过String数据库获取药物作用靶点并在Genecards数据库、OMIM数据库及TTD数据库中获取骨延迟愈合的疾病靶点后使用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-靶点网络,使用拓扑学分析此网络获得核心活性成分,使用String数据库绘制靶点蛋白交互作用网络,使用拓扑学分析此网络获得核心靶点,采取Bioconductor数据库对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,探讨潜在作用靶点可能具有的生物学功能及通路。结果:从益气化瘀补肾方中筛选出251个活性成分,核心成分56个,治疗延迟愈合的靶点84个,核心靶点24个;GO分析结果显示生物过程1980个、细胞组分60个和分子功能128个,KEGG分析结果显示信号通路133条。结论:本研究初步证实益气化瘀补肾方治疗骨延迟愈合具有多成分、多靶点的特点,为进一步阐释其药理作用机制奠定了理论基础。 相似文献
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分米波治疗股骨头缺血性坏死 总被引:8,自引:0,他引:8
目的:观察分米波治疗股骨头缺血性坏死的疗效。方法:选择不同分期不同病因的股骨头坏死患者60例75髋关节进行分米波治疗,以髓芯减压作对照,以髋关节功能测定及X线平片作评价标准。结果:分米波能改善股骨头缺血性坏死的临床症状及X线平片表现。特别是对Ⅱa、Ⅱb期损伤疗效好,临床和X线平片显示治愈率Ⅱa分别达79%和74%;Ⅱb达70%和65%;与髓芯减压组差异无显著性(P>0.05)。结论:分米波可减轻股骨头缺血性坏死Ⅱ、Ⅲ期的临床症状和X线进展,并能延缓Ⅱ、Ⅲ期股骨头塌陷的发生。 相似文献
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成人股骨头缺血性坏死保留股骨头的手术治疗 总被引:1,自引:1,他引:1
成人股骨头缺血性坏死(avascular necrosis of the femoral head,ANFH),保守治疗效果常不满意,而手术是遏制股骨头坏死进程和防止塌陷的基本方法和重要前提,笔者就近年来国内外对保留股骨头的ANFH手术治疗作一综述。 相似文献
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目的 基于网络药理学探讨止痛消炎膏治疗慢性湿疹的分子作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、PubChem数据库筛选止痛消炎膏的潜在活性成分[口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18]。采取SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点,与DisGeNET数据库、GeneCards数据库、治疗靶点数据库(TTD)获得慢性湿疹疾病靶点相映射,得到止痛消炎膏治疗慢性湿疹的潜在靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建止痛消炎膏-活性成分-靶点网络图,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,并在R软件中使用Bioconductor生物信息软件包对止痛消炎膏的作用靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。结果 止痛消炎膏中有186个潜在活性成分,将止痛消炎膏与湿疹作用靶点相匹配,两者取交集后获得药物-疾病共同靶点115个;番泻叶甙、白当归醚、白当归脑、大黄酸、大黄苷、迷迭香酸等可能是止痛消炎膏治疗慢性湿疹的主要活性成分,其作用于TNF、IL-6、AKT1、CXCL8、IL-2、STAT3等靶点,... 相似文献
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目的:了解成人股骨头缺血性坏死诊断治疗的新进展。
资料来源:检索Medline 1988—01/2000—12与成人股骨头缺血性坏死的诊断治疗相关的文章,检索词“adult hip,anoxic,therapy”,并限定文章语言种类为英语。同时检索清华全文数据库1990—01/2000—12关于成人股骨头缺血性坏死的诊断治疗相关的文章,限定文章语言种类为中文,检索词“股骨头缺血性坏死,诊断,治疗”。
资料选择:对资料进行初审,对剩余的文献开始查找全文。纳入关于股骨头缺血性坏死诊断和治疗的临床研究。排除重复性研究。资料提炼:共收集到109篇关于成人股骨头缺血性坏死的诊断治疗研究文章,26个临床研究符合纳入标准。排除的82篇文章均为重复性研究。
资料综合:随着科学技术的不断发展,各种新的影像检查对发现股骨头早期缺血坏死有很大帮助。采用微循环技术对成人股骨头坏死进行检测,认为无论何种病因诱发,微循环病变始终存在于股骨头坏死的各个阶段。成人股骨头缺血性坏死的治疗归纳起来主要可以分为3大类:中西医结合的非手术治疗、姑息性手术治疗、人工关节置换术。
结论:成人的股骨头缺血性坏死的发病率较高,其理想的治疗应在早期阶段,非手术治疗一般疗效比较差,近几年随着影像学技术、分子生物学技术、物理治疗技术的发展,非手术治疗也有一些进展。姑息性手术治疗方法多,疗效相对比较肯定,是股骨头缺血性坏死早期治疗的主要方法。 相似文献
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目的:利用网络药理学方法和分子对接技术分析山奈酚治疗去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的靶点,并探讨其相关分子机制。方法:从DisGeNET数据库中检索CRPC的靶点,同时,从药物靶点数据库Swiss Target Prediction数据库获取山奈酚治疗靶点,通过韦恩图工具获取靶点交集作为山奈酚抗CRPC的核心靶点,通过R studio中的“clusterProfiler”包对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析,预测山奈酚治疗CRPC的生物学过程和关键信号通路。结果:挖掘了山奈酚治疗CRPC的29个核心靶点:ESR1、SRC、EGFR、AKT1、PTGS2、CYP19A1、MMP9、ABCG2、ESR2、IGF1R等,主要通过调控内分泌抵抗通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、蛋白聚糖在癌症、PI3K-Akt信号通路、雌激素信号通路等信号通路。结论:本研究预测了山奈酚治疗CRPC的核心靶点、生物学过程以及关键信号通路,将有助于山奈酚在去势抵抗性前列腺癌治疗中的临床应用。 相似文献