筛选介导化学合成siRNA转染原代肝癌细胞的最佳试剂

背景：理想的细胞转染试剂应具有高效安全的特点。 目的：筛选能够高效介导化学合成siRNA转染原代肝癌细胞的最佳转染试剂。 方法：应用Lipofectamine RNAiMAX,Lipofectamine 2000和DharmaFECT1转染试剂介导FAM-siRNA和多药耐药基因MDR1siRNA转染原代肝癌细胞,分别于转染6和48 h后应用流式细胞仪和实时荧光定量PCR检测转染效率,然后用MTT法检测3种转染试剂处理原代肝癌细胞24 h后的细胞毒性。 结果与结论：对于Lipofectamine RNAiMAX,Lipofectamine 2000和DharmaFECT1转染试剂介导的FAM-siRNA和MDR1 siRNA转染,流式细胞仪和实时荧光定量PCR仪检测出RNAiMAX转染效率最高(P < 0.05),分别为70.3%和71.5%。MTT法检测结果表明RNAiMAX对原代肝癌细胞没有表现出细胞毒性。结果提示,由于RNAiMAX介导的FAM-siRNA和MDR1 siRNA转染的效率最高,并且对细胞的毒性最小,所以RNAiMAX是最适合介导化学合成siRNA转染原代肝癌细胞的转染试剂。     

RNA干扰抑制小鼠OX40基因表达的实验研究

目的研究靶向小鼠OX40基因的二聚体小干扰RNA(siRNA-OX40)对靶基因表达的沉默作用。方法建立并筛选稳定表达OX40基因的293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-OX40转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR检测靶基因OX40 mRNA表达情况。结果用不同浓度的siRNA-OX40转染细胞48h,10nmol/L浓度对293T细胞靶基因表达的抑制作用最强(抑制率76.4%),1nmol/L浓度仍有一定的抑制作用(39.4%);25、10nmol/L siRNA转染293T细胞后,均在24h内起效(24.9%,20.5%),抑制作用至少能维持72h(74.4%,38.8%)。结论siRNA-OX40对293T细胞外源性靶基因表达有较强的特异性沉默作用,siRNA在24h内起效,48～72h达高峰,抑制作用至少能维持72h。本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据。     

小干扰RNA对人乳头状瘤病毒6bE7基因表达的沉默作用

目的研究靶向人乳头状瘤病毒HPV-6b型E7基因的二聚体小干扰RNA(siRNA- HPV-6bE7)对靶基因表达的沉默作用。方法建立并筛选稳定表达HPV-6bE7基因的B16和293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-HPV-6bE7转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR分析靶基因HPV-6bE7的mRNA表达情况。结果用不同浓度的siRNA-HPV-6bE7转染细胞48 h,50 nmol/L浓度对B16细胞中靶基因表达的抑制作用最强(抑制率87.05%),1nmol/L抑制作用较低(9.14%);而在293T细胞,10nmol/L的siRNA对靶基因表达的抑制效应最大(78.87%),1nmol/L仍有一定抑制作用(46.92%)。50 nmol/L siRNA-HPV-6bE7转染B16细胞后,靶基因的mRNA表达在24 h内开始受抑制(32.47%),48h作用最强(74.72%),96h作用很低(8.91%);25nmol/L和10nmol/L的siRNA转染293T细胞后,均在24h内起效(26.66%、20.31%),抑制作用至少能维持72h(65.93%、35.23%)。结论siRNA-HPV-6bE7对B16和293T细胞外源性靶基因表达均有较强的特异性沉默作用,在不同细胞株达到最大抑制效应的siRNA浓度不同,但时效曲线的变化趋势基本一致,siRNA均在24h内起效,48～72h达到高峰,抑制作用至少能维持72h。本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据。     

RNA干扰技术沉默星形胶质细胞Cdk5模型的建立

目的建立星形胶质细胞细胞周期蛋白依赖性激酶5(Cdk5)沉默模型。方法新生24 h内无特定病原(SPF)级SD雄性大鼠乳鼠240只。培养及鉴定SD雄性大鼠星形胶质细胞。设计合成针对星形胶质细胞Cdk5的小干扰RNA(siRNA)3种(Si-r-Cdk5-001、Si-r-Cdk5-002及Si-r-Cdk5-003),将3种siRNA分为SiT1组、SiT2组、SiT3组,在Lipofectamine 2000介导下转染星形胶质细胞;阴性对照组加入阴性对照si RNA。应用荧光染色观察转染效率,通过实时聚合酶链反应(PCR)和Western blot检测沉默效率。结果成功将Cdk5 siRNA转染入星形胶质细胞,转染效率为85%。与阴性对照组相比,SiT1组、SiT2组及SiT3组Cdk5 mRNA及蛋白表达均降低(P0.01),其中SiT3组沉默效果最佳,分子水平沉默效率为68%,蛋白水平沉默效率为79%。结论成功通过RNA干扰技术建立星形胶质细胞Cdk5特异性沉默模型。     

水通道蛋白-4 mRNA沉默可抑制离体缺氧星形胶质细胞水通道蛋白-4的表达

目的:研究水通道蛋白-4(AQP4) mRNA沉默对体外缺氧星形胶质细胞AQP4表达的影响.方法: 用氯化钴诱导体外星形胶质细胞缺氧,建立AQP4 mRNA沉默缺氧星形胶质细胞模型.随机分为正常组、对照组、缺氧组和干扰组,观察星形胶质细胞形态,免疫细胞化学、荧光定量PCR、免疫印迹法检测AQP4 mRNA 及蛋白表达....     

siRNA沉默LBH基因促进人支气管上皮细胞周期进展

目的: 利用合成的小分子干扰RNA(siRNA)转染人支气管上皮细胞16HBE,观察LBH(limb-bud and heart) 基因表达下调对16HBE细胞周期及相关基因表达的影响。方法: 脂质体2000转染靶向LBH 基因的siRNA到16HBE细胞,荧光定量RT-PCR检测siRNA转染后LBH基因表达,流式细胞术检测LBH基因沉默后16HBE 细胞周期的改变,荧光定量RT-PCR及Western blotting检测LBH基因沉默后细胞周期素E1和E2表达水平。结果: 50 nmol/L siRNA转染16HBE细胞48 h后, LBH基因的表达水平只有对照组的14%;siRNA转染16HBE细胞48 h,其G₁期细胞百分率比对照组减少9.28%,而S期细胞百分比增加14.08%;16HBE细胞在50 nmol/L siRNA的转染后,细胞周期素E2的表达水平为对照组的2倍,而细胞周期素E1的表达没有发生明显改变。结论: 靶向于LBH基因的siRNA能有效沉默16HBE细胞中LBH基因的表达,LBH基因的表达下调促进了16HBE细胞周期G₁/S期的进展;细胞周期素E2的表达上调参与了LBH沉默导致的细胞周期G₁/S期的进展。     

异丙酚通过抑制p38激活下调氨处理的大鼠脑星形胶质细胞AQP4的表达并减轻细胞水肿

目的:研究异丙酚对氨处理的大鼠脑皮质星形胶质细胞水通道蛋白-4(AQP4)表达的影响以及相关机制。方法:原代培养Sprague Dawley大鼠大脑皮质星形胶质细胞。用细胞免疫荧光标记星形胶质细胞特异性的神经胶质酸性蛋白,星形胶质细胞纯度达95%以上的细胞备用。实验分为正常对照组(N)、氯化铵(5mmol/L)处理24h组(NH4Cl-24h)、p38抑制剂SB203580(10μmol/L)预处理组(SB)、异丙酚(10μmol/L)预处理组(P)和溶剂二甲亚砜(DMSO)对照组(C)。p38抑制剂、异丙酚和溶剂均预处理星形胶质细胞30min后再加入氯化铵作用24h。用光学显微镜观察各组细胞水肿情况,同时用Western blotting检测AQP4、p38和磷酸化p38的表达情况。结果:光学显微镜观察发现氯化铵处理后星形胶质细胞较正常对照组细胞肿胀明显,异丙酚和p38抑制剂预处理能明显减轻星形胶质细胞水肿。Western blotting检测发现各组星形胶质细胞总p38蛋白表达无明显变化(P0.05)。异丙酚预处理组和SB预处理组磷酸化p38蛋白和AQP4蛋白表达均较氯化铵处理组和溶剂对照组明显降低(P0.05)。结论:AQP4蛋白表达受p38信号途径的调节,异丙酚可通过抑制p38信号途径的激活,降低氨引起的星形胶质细胞AQP4蛋白表达上调,减轻细胞水肿。     

小干扰RNA对大鼠OX40基因表达的沉默作用

目的:研究靶向大鼠OX40基因的二聚体小干扰RNA(siRNA-OX40) 对靶基因表达的沉默作用.方法:建立并筛选稳定表达OX40基因的293T转染细胞株,用脂质体转染法将体外合成的siRNA-OX40转染上述细胞株,采用实时荧光定量PCR检测靶基因OX40 mRNA表达情况.结果:用不同浓度的siRNA-OX40转染细胞48小时,10 nmol/L浓度对293T细胞靶基因表达的抑制作用最强 [抑制率(68.3±8.7)%],1 nmol/L浓度仍有一定的抑制作用[(37.2±4.8)%];25、10 nmol/L siRNA转染293T细胞后,均在24小时内起效[(21.4±3.2)%,(26.8±3.8)%],抑制作用至少能维持72小时[(61.7±8.4)%,(39.6±5.6)%].结论:siRNA-OX40对293T细胞外源性靶基因表达有较强的特异性沉默作用,siRNA在24小时内起效,48～72小时达高峰,抑制作用至少能维持72小时.本研究结果为下一步在动物或临床进行siRNA干扰试验提供了实验依据.     

脂质体介导RNAi的研究

本文选用阳离子脂质体Lipofectamine 2000为基因载体,使用沉默荧光素酶基因的小干扰RNA(siRNA)进行体外RNA干扰(RNAi),对阳离子脂质体转运siRNA的效率进行研究。首先以阳离子脂质体运载质粒DNA转染细胞,并以延滞实验对阳离子脂质体与siRNA的结合能力进行检测;然后通过基因载体将荧光素酶基因载入细胞,转运不同浓度的siRNA对其进行沉默,应用酶标仪对荧光素酶基因的表达进行分析,并用MTT法对转染后细胞存活率进行检测。结果表明:阳离子脂质体Lipofectamine 2000可以高效转运质粒DNA,并可与siRNA很好地结合。在较低的siRNA浓度下,对荧光素酶基因的沉默率达到较高的水平,转运siRNA转染细胞对细胞活性的影响很小,但细胞存活率随着siRNA浓度的增加而逐渐降低。通过优化实验条件,阳离子脂质体转运较低浓度的siRNA即可高效沉默目的基因。     

小RNA转染人外周血原代T淋巴细胞的转染试剂筛选

目的探讨人工合成RNA转染人外周血原代T淋巴细胞的有效方法。方法从人外周血分离原代T淋巴细胞,采用Lipofectamine2000、Lipofectamine RNAiMAX、FuGENE6、Hiperfect和EntransterTM-R 5种不同转染试剂介导荧光标记的RNA转染原代T淋巴细胞,通过荧光显微镜观察及流式细胞术检测进行转染效率评价。结果分离的人外周血原代T淋巴细胞的纯度达到87.4%。采用上述5种转染试剂介导荧光标记的RNA转染T淋巴细胞,24 h后转染效率分别为(14.81±1.03)%、(14.33±1.24)%、(2.10±0.16)%、(1.69±0.08)%、(72.24±1.26)%。采用EntransterTM-R转染100及50 nmol/L对照RNA,24 h后转染效率分别为73.7%和56.0%;EntransterTM-R转染100 nmol/L对照RNA后48、72 h荧光标记细胞阳性率分别为62.0%、56.6%。结论转染试剂EntransterTM-R可有效介导人工合成RNA转染人外周血原代T淋巴细胞。     

RNA干扰对成肌细胞系L6中FOXO3a基因表达的影响

背景：最近的研究发现,一些因子在失神经骨骼肌萎缩的过程中发挥关键性作用,其中“feak-headbox”(Foxo)转录因子是调控骨骼肌萎缩最关键的分子。 目的：探讨RNA干扰技术体外抑制FOXO3a基因表达的效果。 方法：6孔细胞培养板中培养大鼠成肌细胞系L6,使用pEGFP-N1与siRNA重组质粒等比例在Lipofectamine2000介导下转染,优化与检测系统的转染效率;将2 μg FOXO3a基因siRNA重组质粒转染L6,转染48 h与72 h。 结果与结论：①pEGFP-N1与siRNA重组质粒转染后48 h,荧光显微镜下可见细胞中有大量明亮的绿色荧光表达,显示系统有较高的转染效率。②实时定量PCR分析结果显示,转染后48 h和72 h,干扰序列FOXO3a-Ⅰ、FOXO3a-Ⅱ、FOXO3a-Ⅲ、FOXO3a-Ⅳ对FOXO3a mRNA的抑制率与未转染对照组相比差异均有显著性意义(P < 0.05),转染72 h与48 h相比,抑制效应更为明显,并以FOXO3a-Ⅰ的抑制效果最为明显。③Western印迹灰度分析结果显示,转染后48 h和72 h,干扰序列FOXO3a-Ⅰ、FOXO3a-Ⅱ、FOXO3a-Ⅲ、FOXO3a-Ⅳ对FOXO3a蛋白表达的抑制率与对照组相比差异有显著性意义(P < 0.05),转染72 h与48 h相比,抑制效应更为明显,与mRNA水平的影响一致。结果可见RNA干扰技术在体外能够明显抑制叉头蛋白转录因子FOXO3a基因的表达,FOXO3a基因siRNA重组质粒转染其干扰序列对FOXO3a的mRNA和蛋白抑制效果尚不明确,这可为RNA干扰介导的失神经骨骼肌萎缩基因治疗提供一种新的思路。     

siRNA沉默Ikaros基因对K562细胞中γ珠蛋白表达的影响

目的:通过siRNA干扰靶基因Ikaros,观察人红白血病细胞株K562细胞中γ珠蛋白的表达变化。方法:设计合成三条针对Ikaros的siRNA寡核苷酸序列,采用阳离子脂质体Lipofectamine 2000转染siRNA至K562细胞,采用RT-PCR方法筛选出最佳siRNA序列和最佳干扰时间。运用Real-time PCR和Western blotting技术分别检测siRNA沉默Ikaros后K562细胞Ikaros和γ珠蛋白mRNA及蛋白的表达水平,应用联苯胺染色法检测siRNA沉默Ikaros后K562细胞内血红蛋白(Hb)含量。结果:筛选试验表明siRNA3的转染效率最高,达58.7%,siRNA3对Ikaros基因抑制率最高(86.7%),其最佳干扰时间为72h。应用siRNA3沉默Ikaros基因可以上调γ珠蛋白mRNA和蛋白的表达水平,增加K562细胞内Hb含量。结论:siRNA3沉默Ikaros上调γ珠蛋白mRNA和蛋白表达,可能成为治疗重型β-地中海贫血的一种新策略。     

NEK2基因沉默促进卵巢癌细胞SKOV3凋亡

目的研究siRNA干扰NEK2表达对卵巢癌细胞SKOV3增殖和凋亡的影响及其分子机制。方法设计合成3条对NEK2的siRNA,转染进SKOV3细胞,采用real-time PCR和Western blot技术筛选出抑制效率最高的NEK2-siRNA序列,进行后续实验;分别采用MTT和流式细胞学技术检测细胞增殖和凋亡,用Western blot检测BAD、BCL-2和caspase-3的表达。结果 1)RNA干扰序列2对SKOV3细胞NEK2的抑制效果最明显;2)与空白组和阴性对照组相比,NEK2-siRNA转染48 h后,SKOV3细胞增殖能力下降,发生凋亡的细胞增加(P<0.01);3)与空白组和阴性对照组相比,NEK2-siRNA转染48 h后,SKOV3细胞中BAD和caspase-3的蛋白表达上调,而BCL-2的蛋白表达下调(P<0.01)。结论 NEK2-siRNA可能通过沉默NEK2的表达,促进卵巢癌细胞SKVO3的凋亡。     

Smad3基因促进大鼠卵巢颗粒细胞增殖

目的 探讨Smad3基因对大鼠卵巢颗粒细胞增殖功能的影响.方法 21d SD雌性大鼠,腹腔注射孕马血清20IU/只,48h后收集卵巢颗粒细胞进行原代培养,用Smad3 基因特异的siRNA基因沉默后,采用免疫细胞化学法检测颗粒细胞中Smad3蛋白表达的变化,以判定基因沉默效率,Smad3基因沉默后用免疫细胞化学法检测...     

siRNA干扰沉默S100A4基因表达对喉癌Hep2细胞周期和侵袭的影响

目的应用RNA干扰技术下调喉癌Hep2细胞中S100A4基因的表达,探讨其对Hep2细胞周期和细胞侵袭力的影响。方法脂质体法转染S100A4siRNA至Hep2细胞。Real-time PCR和Western blot验证S100A4基因mRNA和蛋白水平的表达,流式细胞术和transwell实验分别检测下调S100A4表达对Hep2细胞周期和侵袭能力的影响。结果 S100A4 mRNA和蛋白表达水平明显降低,细胞增殖指数显著降低,并且处于G1期细胞数明显增多,细胞侵袭能力显著降低。结论 S100A4siRNA转染喉癌Hep2细胞能有效下调S100A4基因的表达,从而影响Hep2的细胞周期和抑制细胞的侵袭能力。     

骨形态发生蛋白/维甲酸诱导的神经特异性蛋白3在丙戊酸钠诱导神经干细胞向神经元分化过程中的作用

目的 探讨骨形态发生蛋白/维甲酸诱导的神经特异性蛋白3（Brinp3）在丙戊酸钠（VPA）诱导神经干细胞向神经元分化过程中的作用。方法 体外培养大鼠海马神经干细胞,运用Real-time PCR和Western blotting技术在VPA诱导神经干细胞分化后24 h和48 h检测Brinp3的表达;Real-time PCR检测Brinp3在成年大鼠各组织中以及在神经干细胞、星形胶质细胞和神经元中的表达水平;在神经干细胞中转染Brinp3小干扰RNA（siRNA）并诱导分化24 h后,运用Real-time PCR、Western blotting和免疫荧光技术检测Brinp3和神经元标志分子的表达。以上实验均包含5次生物学重复。结果 与对照组相比,VPA处理组中Brinp3的mRNA和蛋白水平在24 h和48 h均显著上调（P<0.05）;Brinp3在脑组织中呈优势表达;Brinp3在星形胶质细胞中表达较低,而在神经元中表达较高（P<0.001）;在神经干细胞中转染Brinp3 siRNA,诱导分化24 h后,Brinp3的表达被显著抑制（P<0.001）,神经元标志分子的表达均显著下调（P<0.01）,第4天分化成的神经元比例减少（P<0.001）。结论 Brinp3表达的上调可能介导了VPA促神经干细胞向神经元分化的功能。     

大鼠siTLR4重组腺病毒载体的构建及功能鉴定

目的构建特异性针对大鼠TLR4基因的siRNA重组腺病毒载体,为进一步研究TLR4在不同疾病中的免疫调节机制奠定重要基础。方法设计并合成3对大鼠TLR4基因的siRNA序列,退火处理后定向克隆到pSES-HUS穿梭质粒中,获得pSES-HUS-siTLR4,经Pme I线性化后与pAdEasy-1骨架质粒在BJ5183细菌中进行同源重组,从而构建pAd-siTLR4质粒,通过脂质体转染,在HEK293细胞中包装形成Ad-siTLR4腺病毒颗粒,用该病毒感染PC12细胞,从基因和蛋白质水平分别检测3对siTLR4的抑制效果,同时从蛋白质水平检测TLR4下游关键分子NF-κB的表达。结果 PCR、酶切和测序均证实目的基因正确克隆到所构建的pAd-siTLR4重组腺病毒载体中;经包装获得的Ad-siTLR4病毒颗粒在PC12细胞中能够有效地抑制TLR4 mRNA和蛋白水平的表达,并显著地降低了NF-κB的表达。结论成功构建了pAd-siTLR4重组腺病毒质粒,同时包装获得了Ad-siTLR4重组腺病毒,转染PC12细胞后不仅能明显降低TLR4的表达,而且有效地抑制了TLR4通路下游关键分子NF-κB的表达。     

增殖细胞核抗原 siRNA 序列的设计、合成与筛选

目的：设计并筛选能有效抑制人肝癌SMMC-7721细胞、人结肠癌Caco2细胞、人胃癌SCG-7901细胞增殖的增殖细胞核抗原(PCNA) siRNA。方法:总结以往提出的siRNA 设计原则的基础上，设计4 条PCNA siRNA，体外转录合成PCNA siRNA；并作用于3 种肿瘤细胞，WST-8法检测细胞增殖活性，筛选能有效抑制肿瘤细胞增殖的siRNA序列；RT-PCR检测细胞PCNA mRNA水平；免疫细胞化学方法检测 PCNA 蛋白表达水平。结果:4 条PCNA siRNA中，有3 条序列（No.2、No.4、No.3）的siRNA能有效抑制3 种肿瘤细胞的增殖；其中No.2、No.4作用效果最优，以50 nmol/L浓度作用48 h，对3种肿瘤细胞的增殖抑制率均可达到62％以上，No.2、No.4 PCNA siRNA均能在mRNA和蛋白水平显著下调PCNA的表达。结论:PCNA siRNA能在体外有效抑制SMMC-7721细胞、Caco2细胞、SCG-7901细胞的增殖，其适宜作用浓度为50 nmol/L，适宜作用时间为48 h。     

沉默hHBrk1基因对肺癌细胞增殖及迁移能力的影响

目的：研究玉米Brick1的人类同源基因hHBrk1（human homology of Brick1）对肿瘤细胞增殖及迁移能力的影响。方法：用质粒介导的siRNA（small interfering RNA）技术建立hHBrk1基因表达沉默的肺癌细胞模型；用细胞生长曲线、克隆形成率实验及流式细胞术分别比较不同处理的95D细胞增殖及细胞周期的变化；用Transwell细胞侵袭实验系统研究hHBrk1表达沉默对肺癌细胞迁移能力的影响。结果：成功筛选出hHBrk1基因表达抑制的细胞模型；hHBrk1表达沉默细胞增殖能力和细胞周期与对照组相比无明显改变，但hHBrk1表达沉默细胞迁移能力明显减弱。结论：hHBrk1可能参与调控肺癌细胞迁移能力。