中国人TFPI-2基因的克隆及测序分析

目的对中国人的组织因子途径抑制物-2(TFPI-2)基因进行克隆并测序。方法从人新鲜肝组织提取总RNA，经逆转录PCR(RT—PCR)扩增出TFPI-2的全长cDNA，经亚克隆、筛选、鉴定后，进行正反测序。结果中国人TFPI-2基因cDNA全长1222bp，除258bp、585bp和884bp处与目前GenBank中收录的国外学者克隆的TFPI-2基因序列不同外，其他完全一致。其序列GenBank登记号：TFPI AY691946。结论中国人TFPI-2基因序列与已经报道的西方人的TFPI-2基因序列基本相同，但三处单核苷酸多态性的意义何在，目前尚不清楚。     

组织因子途径抑制物2基因真核表达载体的构建及鉴定

目的:构建人组织因子途径抑制物2(tissuefactorpathwayinhibitor2,TFPI-2)基因的真核表达载体pEGFP-C1-TFPI-2,并对其进行酶切鉴定。方法:实验于2006-09/12在安徽省立医院中心实验室完成。实验方法:①从人胎盘组织中提取总RNA,反转录合成cDNA,以特异性引物扩增TFPI-2基因全长mRNA。②扩增产物回收纯化后用限制性内切酶酶切,与经同样处理的载体pEGFP-C1进行连接反应,连接产物转化感受态大肠杆菌DH5α。③碱变性法提取质粒进行限制性内切酶酶切分析,并进行DNA序列测定。结果:①成功克隆了708bp的TFPI-2基因片段。②构建了人TFPI-2基因的真核表达载体pEGFP-C1-TFPI-2,经限制性内切酶酶切,电泳分析后得到了大小分别为708bp的目的基因片段和4.6kb的载体片段,测序结果与TFPI-2mRNA的cDNA序列吻合。结论:通过基因重组技术,构建了稳定表达TFPI-2的人TFPI-2的真核表达载体pEGFP-C1-TFPI-2。     

体外促进血管内皮细胞分化的实验观察:人血管生成素相关蛋白2全长编码基因的克隆

目的:克隆人血管生成素相关蛋白2(angiopoietin-relatedprotein2,ARP2)全长编码基因,使其以体外方式促进血管内皮细胞分化,拟构建PET32a载体。方法:采用反转录多聚酶链反应(RT-PCR)从人脾脏组织中扩增ARP2cDNA,构建PET32a载体,采用EcoRI,HindIII双酶切以及DNA测序进行鉴定。结果:RT-PCR扩增长度为1492bp的基因片段。EcoRI,HindIII双酶切结果显示重组T载体中含有目的基因片段,测序结果显示编码区无基因突变。结论:顺利构建PET32a载体,人ARP2全长cDNA基因克隆成功。ARP2有非常明显的促进血管内皮细胞生长的作用,可能对缺血性心脏病的促血管形成治疗有较大帮助。     

巢式逆转录-聚合酶链反应扩增人骨形成蛋白2全长cDNA及其真核表达载体的构建

目的:利用巢式逆转录-聚合酶链反应扩增的方法,从肌肉组织中扩增人骨形成蛋白2全长cDNA并构建真核表达载体系统。方法:实验于2003-10/2005-10在苏州大学基因工程教研室和北京大学第三医院骨科实验室完成。提取成人肌肉组织内的总RNA,设计内外两对引物以巢式逆转录-聚合酶链反应扩增方法分两次扩增出人骨形成蛋白2全长1188bp基因,经T-A克隆装入pUCM-T质粒载体内,测序验证后,将克隆质粒以Hind Ⅲ和Xba Ⅰ双酶切后与pcDNA3.0载体相连接,构建真核表达载体系统。结果:利用巢式逆转录-聚合酶链反应扩增方法能从成人肌肉组织内扩增出1188bp的人骨形成蛋白2全长cDNA基因,其测序结果显示与Genebank报道序列完全相符。将扩增序列双酶切后与pcDNA3.0载体相连接,经电泳验证,能构建人骨形成蛋白2全长基因的真核表达系统。结论:巢式逆转录-聚合酶链反应扩增方法能从成人肌肉组织内扩增出人骨形成蛋白2全长cDNA基因,并克隆构建真核表达载体系统,为下一步基因组织工程人工骨实验奠定基础。     

体外促进血管内皮细胞分化的实验观察：人血管生成素相关蛋白2全长编码基因的克隆

目的：克隆人血管生成素相关蛋白2(angiopoietin-related protein2．ARP2)全长编码基因，使其以体外方式促进血管内皮细胞分化，拟构建PET32a载体。方法：采用反转录多聚酶链反应(RT-PCR)从人脾脏组织中扩增ARP2cDNA，构建PET32a载体，采用EcoRⅠ，HindⅢ双酶切以及DNA测序进行鉴定。结果：RT-PCR扩增长度为1492bp的基因片段。EcoRⅠ，HindⅢ双酶切结果显示重组T载体中含有目的基因片段，测序结果显示编码区无基因突变。结论：顺利构建PET32a载体，人ARF2全长cDNA基因克隆成功。ARP2有非常明显的促进血管内皮细胞生长的作用，可能对缺血性心脏病的促血管形成治疗有较大帮助。     

核干细胞因子基因在人肝癌组织及细胞中转录特征及临床意义

目的 研究核干细胞因子(nucleostemin,NS)基因在肝癌组织和细胞中的表达特性,探讨其在肝癌发生中的意义.方法 用PCR方法从人肝癌cDNA中分别进行NS片段和全长基因的扩增,并将扩增产物连接到pMD18-T载体进行测序验证;在40例肝癌和癌旁组织,以及3种肝癌细胞系cDNA中进行NS片段的PCR扩增及分析.结果 分别从肝癌cDNA克隆到了NS基因的部分片段(450 bp)及全长(1 650 bp);发现在肝癌组织中NS的表达高于癌旁组织,临床病例分析表明3期和4期病例NS基因上调表达显著高于下调表达;肝癌细胞株分析结果提示,NS基因随肝癌细胞转移能力的增加表达量增加.结论 NS基因参与肝癌细胞的增殖过程,对肝癌的发生起促进作用.     

日本血吸虫微管蛋白基因的获得和分析

目的从日本血吸虫(schistosoma japonicum，Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的表达基因，为日本血吸虫病的防治提供药物靶标或侯选疫苗。方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库，随机挑取重组阳性克隆进行测序，对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA，并进行生物信息学分析和登录。结果获得了1个日本血吸虫新基因，全长1439bp，编码443个氨基酸，与肝片形吸虫微管蛋白基因具有79％的同源性。结论表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合，有利于发现日本血吸虫新基因。     

与人体肥胖相关的神经肽Y基因克隆及序列分析

目的 克隆与肥胖相关的人神经肽Y(NPY)基因,并鉴定该克隆基因序列的正确性.方法 根据GeneBank中收录的NPY基因序列,设计该基因上下游序列,经过PCR反应合成NPY的cDNA.然后与pET28a+载体重组,筛选阳性克隆和DNA序列分析鉴定,测序后与GeneBank中NPY基因进行同源性比较和序列分析.结果 PCR扩增出一个100 bp左右的DNA片段,与载体重组后和DNA序列分析鉴定,DNA序列分析显示克隆的DNA片段是人NPY基因.且所克隆的基因共编码36个氨基酸,分子量为4.2 kD,与GeneBank中NPY基因序列同源性达100%.结论 克隆的人NPY基因与Genebank中NPY序列完全一致,为进一步应用分子生物学技术深人研究NPY与人体肥胖发生、发展及转化等相关作用机制及应用该基因进行其基因蛋白表达奠定了基础.     

扇贝防御素基因改良5′cDNA末端快速扩增聚合酶链反应筛选方法的研究

目的应用改良5′cDNA末端快速扩增聚合酶链反应(RACE)筛选扇贝抗菌肽基因,寻找基于基因序列同源性的双壳类抗菌肽(AMP)的筛选方法。方法 TRIzol法提取扇贝血淋巴中总RNA。根据贻贝抗菌肽的保守序列设计基因特异性简并引物,进行改良5′RACE钓取可能防御素基因cDNA的5′端序列、AT克隆、DNA测序和同源性分析。结果采用改良5′RACE从扇贝血淋巴RNA中得到多个未知基因的cDNA 5′端序列,挑选600bp以下的基因片段进行AT克隆和DNA测序后得到3个插入片段序列,其长度分别为257、275和511bp。通过BLAST程序搜索GenBank核酸数据库,未发现与之高度同源的基因。结论从扇贝血淋巴中获得的3个5′端cDNA序列可能属于新的基因。应用改良5′RACE能钓取含防御素保守序列的新基因片段,由此表明此方案具有可行性。     

骨缺损再生修复中人骨形成蛋白2基因的克隆和序列分析

目的克隆人骨形成蛋白 2 (hBMP2)基因全长,用于临床难治性骨折和骨缺损的再生修复.方法以成骨肉瘤细胞总 RNA为模板,应用反转录-聚合酶链反应法(RT-PCR)克隆 hBMP2的 cDNA全长;将获得的基因插入 pGEM-T-Easy载体质粒,并转化至大肠杆菌后挑选阳性克隆,利用限制性内切酶酶切分析鉴定重组质粒.结果通过质粒酶切分析和序列测定,获得的基因为 hBMP2全长 DNA序列.结论克隆获得 hBMP2的基因,为其进一步开发利用提供了前提条件.     

人脂联素基因的克隆构建及其序列分析

背景:脂联素已经成为缺血性疾病基因治疗的新靶点,而成功进行脂联素基因治疗的关键是脂联素基因的克隆.基因克隆主要有定向克隆法和T-A克隆法,定向克隆法操作较复杂;而T-A克隆法操作简便,成功率高.目的:应用T-A克隆法克隆人脂联素基因编码区,对其进行测序验证,并与GenBank比对.设计、时间及地点:基因水平的验证实验,于2006-061/2008-12在福建医科大学附属第一医院高血压研究所及福建中医学院中西医结合研究院完成.材料:脂肪组织取自福建医科大学第一附属医院外科患者术中切除的大网膜脂肪垫,液氮中冻存.Trizol为Invitrogen公司产品:M-MLV,Gel Extract Kit为PROMEGA公司产品;Taq酶为TIANGEN公司产品;限制性内切酶BamH Ⅰ,Sal Ⅰ,pMD18-T载体为TAKARA公司产品.方法:从人大网膜脂肪组织提取总RNA,经反转录-聚合酶链反应扩增出人脂联素编码区基因,再将人脂联素基因编码区克隆入载体pMD18-T中,通过限制性内切酶酶切鉴定后,对其进行测序验证,并与GenBank比对.主要观察指标:人脂联素克隆质粒酶切鉴定结果,人脂联素基因克隆序列与GenBank比对结果.结果:扩增得到人脂联素基因编码区,获得人脂联素的正向和反向克隆,与GenBank中人脂联素基因编码区序列比对均为完全一致.结论:成功地克隆出人脂联素基因编码区.     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌PBP2a的原核表达及多克隆抗体的制备

目的 研究耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)青霉素结合蛋白2a (PBP2a)的原核表达,及PBP2a多克隆抗体的制备.方法 根据基因文库登录的mecA基因的编码序列,设计合成了1对寡核苷酸引物,应用PCR法从MRSA基因组中获得编码PBP2a全长的DNA,将此目的 基因片段克隆至pET32a(+)载体,转化E.coli BL21(DE3);经异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导表达后,利用Ni2+亲和层析技术纯化目的 蛋白;用目的 蛋白免疫小鼠3～8次后,收获血清并鉴定.结果 成功构建了PBP2a原核表达载体,并获得了高效表达;利用纯化的蛋白制备了理想的多克隆抗体.结论 利用分子克隆技术,获得了高纯度的PBP2a蛋白并制备了多克隆抗体,为其进一步研究奠定了基础.     

HMGB1A盒与LBPK95A融合基因的构建和原核表达

目的克隆、表达高迁移率族蛋白1A盒（HMGB1 A box）与LBPK95A的融合基因。方法经加端-PCR获得HMGB1A盒与LBPK95A的融合基因。该基因克隆到pGEX-4T-2载体中转化TOP10感受态细胞，测序鉴定。将A—LBP质粒转化E．coli BL21，30℃诱导表达4h，超声裂解后经GSTrapFF蛋白纯化柱纯化，进行SDS—PAGE分析。结果DNA测序证明，获得了HMGB1A盒与LBPK95A的融合基因。SDS—PAGE分析表明，A—LBP融合蛋白在原核中获得高效表达，表达量约占菌体总蛋白的28％，GSTrapFF纯化后获得目的蛋白。结论成功表达和纯化了HMGB1A盒与LBPK95A的融合蛋白。     

白念珠菌烯醇化酶重组蛋白质的制备及鉴定

目的 制备具有高免疫原性的白念珠菌重组烯醇化酶蛋白质。 方法 以白念珠菌C1标准株基因组DNA作为模板,用PCR法扩增烯醇化酶的全长DNA序列,以pET28a(+)为载体,构建重组表达质粒,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导重组融合蛋白质表达。用抗his标签的单克隆抗体和白念珠菌抗体阳性的病人血清进行western blot鉴定,亲和层析柱纯化重组蛋白质。 结果 获得了含白念珠菌烯醇化酶全长基因的重组表达载体和相应工程菌株,经IPTG诱导后能高效表达重组融合蛋白质。经已含抗体的病人血清进行western blot鉴定,表明诱导的重组蛋白质有良好的免疫原性。 结论 成功克隆了白念珠菌烯醇化酶全长基因并在大肠埃希菌中获得高效表达;重组蛋白质具有良好的免疫原性。     

Molecular cloning and sequence of the complementary DNA encoding human mitochondrial acetoacetyl-coenzyme A thiolase and study of the variant enzymes in cultured fibroblasts from patients with 3-ketothiolase deficiency.

Complementary DNAs encoding the precursor of human hepatic mitochondrial acetoacetyl-CoA thiolase (T2) (EC 2.3.1.9) were cloned and sequenced. The cDNA inserts in these clones were 1,518 bases in length when overlapped, and encoded the 427-amino acid precursor of this enzyme (45,199 mol wt). This amino acid sequence included a 33-residue leader peptide moiety and a 394-amino acid subunit of the mature enzyme (41,385 mol wt). The T2 gene expression in fibroblasts from four patients with 3-ketothiolase deficiency was analyzed by Northern blotting. The T2 mRNA in all four cell lines had the same 1.7 kb as that of the control. However, the amounts of T2 mRNA differed: the content was reduced in two cell lines (cases 1 and 3), whereas it was within a normal range in others (cases 2 and 4). Pulse labeling followed by subcellular fractionation revealed that the T2 proteins in the fibroblasts from these patients are present in the mitochondria. These results suggest that different mechanisms are involved in the enzyme defects in the four patients.     

Delivery of TFPI-2 using ultrasound with a microbubble agent (SonoVue) inhibits intimal hyperplasia after balloon injury in a rabbit carotid artery model

Here we report a new, simple and efficient method by using ultrasound and a microbubble agent (SonoVue) for delivering a gene to balloon-injured carotid arteries for restenosis prophylaxis. The tissue factor pathway inhibitor-2 (TFPI-2) has been shown to inhibit the postinjury intimae hyperplasia in atherosclerotic vessels. New Zealand white rabbits were divided into 4 groups with 14 in each, a treatment control for balloon injury, a gene vehicle control, a gene delivery of TFPI-2 without using ultrasound and a gene delivery of TFPI-2 using ultrasound. After four weeks, the injured artery neointimal proliferation was significantly lower in the TFPI-2 group with ultrasound than the control groups (p < 0.01) according to the measurement of the mean luminal diameters by B-mode ultrasonography. The ratio of intimal/media area and the stenosis rate in the gene delivery facilitated by ultrasound were significantly lower than those of the nonultrasound gene delivering method (p < 0.01).     

肺炎链球菌重组PrtA蛋白克隆与表达的相关研究

目的 构建携带PrtA基因的原核表达载体,诱导表达具有活性的重组PrtA融合蛋白.方法 根据GenBank中肺炎链球菌表面蛋白细胞壁相关丝氨酸蛋白酶A(PrtA)蛋白基因序列,设计合成了一对特异性引物,扩增目的 片段,建立了RT-PCR检测方法.应用RT-RCR方法 扩增得到PrtA蛋白基因,并克隆到pMD18-T载体上,筛选、鉴定阳性重组子pMD18-T-PrtA,然后克隆到原核表达载体pET-30a(+)上,经双酶切、PCR鉴定,获得重组表达质粒pET-30a-PrtA.将含有pET-30a-PrtA的重组菌,经终浓度为0.6 mmol/L的IPTG诱导后,重组PrtA蛋白获得高效表达.通过Western blot检测结果,检测表达的重组PrtA蛋白的反应原性.结果 所获PrtA基因与GenBank的基因序列同源性为99%;重组质粒经IPTG诱导,不同浓度的IPTG均能诱导重组蛋白表达,且IPTG终浓度为0.6 mmol/L时,目的 蛋白的表达量最高,约占菌体总蛋白的18%.通过抗-His标签单克隆抗体在IPTG诱导6 h的重组菌蛋白中检测到一条大小约为40×103的特异性清晰条带,与预期结果 相符,表明表达的蛋白为肺炎链球菌重组PrtA蛋白.结论 成功地克隆和表达了肺炎链球菌表面蛋白细胞壁PrtA,为进一步研究以PrtA蛋白作为免疫原预防和治疗由肺炎链球菌引起的疾病奠定基础.     

TFPI-2基因CpG岛甲基化与胰腺癌的关系

目的:检测胰腺癌组织组织因子途径抑制物-2(TFPI-2)基因CpG岛甲基化的状态,并分析甲基化改变与胰腺癌的关系。方法:应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测45例胰腺癌组织、相应癌旁组织中TFPI-2基因的甲基化状态。结果:胰腺癌组织中TFPI-2基因的甲基化阳性率为71.1%(32/45),明显高于癌旁组织的31.1%(14/45)(P<0.01)。8例正常胰腺组织中均未发生甲基化。TFPI-2基因甲基化阳性率还与胰腺癌的临床分期、组织分化程度、肿瘤直径有相关性(P<0.05)。结论:TFPI-2基因在胰腺癌组织中出现异常甲基化,可能与胰腺癌的发生发展关系密切。