阴虚体质中lnc RNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

目的:体质在疾病的形成、发展和转归中起着重要作用.本研究从转录组学水平首次初步揭示阴虚体质者外周血中lncRNA和mRNA的表达谱及相关作用网络.方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA(4×180 k)表达谱芯片,从阴虚体质(n=10)和平和体质(n=9)者的外周血中分离单个核细胞(PBMCs),...     

血瘀体质中lncRNA和mRNA表达谱分析及调控网络研究

目的:为了更客观地探索血瘀体质的微观特征,本研究从转录组学水平首次初步揭示血瘀体质外周血中lncRNA和mRNA的表达谱特征及其相关作用网络。方法:运用Agilent Human lncRNA+mRNA 4×180 k表达谱芯片,从血瘀体质(BSC,n=11)和平和体质(BC,n=9)者的外周血中分离单个核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cells, PBMCs),采用"limma"方法筛选出2组差异有统计学意义的lncRNAs和mRNAs,对差异基因进行GO功能和KEGG信号通路的显著性富集分析,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图并寻找其作用通路中关键的hub基因。结果:差异表达的lncRNAs和mRNAs均能够将血瘀体质和平和体质进行区分。血瘀体质中差异有统计学意义的lncRNAs 394个(139个上调,255个下调)和mRNAs 410个(159个上调,251个下调)。结果显示,血瘀体质差异基因显著聚集在生长发育调节和细胞信号传导相关作用通路,例如,MAP激酶活性的正向调控、血管生成的正向调控、腺苷酸环化酶活性的激活、卵巢卵泡发育、γ-氨基丁酸能突触以及PI3K-AKT信号通路等。通过构建PPI并筛选了一些核心基因,如,FGF2、VEGFA、HIST1H2BK和PHF5A等。结论:血瘀体质易感冠心病,脑卒中等循环系统疾病和疼痛性疾病等物质基础可能与lncRNAs/mRNAs的生长发育调节和细胞信号传导失调相关。     

172例乳腺肿块患者的中医体质辨识研究

目的:了解乳腺肿块患者的中医体质特点,探讨病理类型与中医体质类型的关系,为预防和治疗乳腺肿块提供辨证依据。方法:172例乳腺肿块手术患者,术前通过统一制定的体质辨识表进行中医体质辨识,明确病理类型后,再对每一种病理类型患者的术前体质进行分析。结果:总体体质辨识发现,单一体质91例,复合体质81例。单一体质中气郁质居多(54例),复合体质中也以气郁质兼其他体质多见。术后病理显示,纤维腺瘤78例,导管内乳头状瘤24例,浆细胞性乳腺炎15例,乳癌55例。纤维腺瘤患者中体质类型占比最高的是气郁质37例(47.4%),导管内乳头状瘤患者最多见阳虚质(9例,37.5%),浆细胞性乳腺炎患者最多见湿热质(5例,33.3%),乳癌患者最多见气郁质夹杂阳虚质、瘀血质(17例,30.9%)。结论:总体来说,乳腺肿块患者的中医体质特点以气郁质居多,不同病理类型乳腺肿块患者也存在不同中医体质特征,为从中医体质学寻找防治乳腺肿块的方法提供证据。     

200例门诊患者体质心理相关性分析及治未病干预思路

目的了解气虚兼气郁体质患者主要的心理状态,描述与分析气虚兼气郁体质患者的情志病患病倾向并提出心身整合治未病健康管理思路。方法采用标准化的《中医体质量表》和《SCL-90项症状量表》对祈福医院中医养生心理康复科门诊200例被评估符合气虚兼气郁体质的患者进行数据统计分析。结果入选200名气虚兼气郁体质的中医门诊患者中,9种心理状态的分布按人数多少排列依次为:焦虑(153例)、强迫(147例)、躯体化(145例)、抑郁(140例)、敌对(131例)、敏感(123例)、恐怖(96例)、偏执(94例)、精神病性(93例)。结论气虚兼气郁体质患者普遍存在焦虑、强迫、抑郁等的心理状态,同时性别因素也影响着心理状态的分布,因此在中医体质调养的同时,更需注重人文关怀和心理健康干预。     

斑秃患者中医体质特点研究

目的:探讨斑秃患者中医体质类型特点;方法:对103例斑秃患者采用中医体质问卷进行中医体质调查,采用聚类分析对其进行体质分型;结果:103例患者中,单一体质32例,占总病例数的31.07%,兼杂体质71例,占总病例数的68.93%;平和质(正常体质)16例,占总病例数的6.22%;病理体质者87例,占总病例数的93.78%,气郁质出现频率最高(31.91%)。结论:兼杂体质是斑秃患者的主要病理体质,气郁质在本病发生发展中占重要地位。     

河南省中医体质类型流行病学2133例调查分析

目的:了解河南省自然人群的中医体质类型分布状况。方法:采用标准化的9种中医体质量表对自然人群中2133例进行横断面现状调查。结果:平和质1283例,单纯偏颇体质599例,兼夹偏颇体质251例。8种偏颇体质分布状况是,气虚质最多(276例,单纯气虚质与兼夹体质中气虚质例数之和,下同),其次为阳虚质(161例)、气郁质(121例)、阴虚质(114例)、湿热质(104例)、痰湿质(82例)、瘀血质(72例)、特禀质(20例);瘀血质和特禀质最少,阴虚质与瘀血质主要出现在兼夹体质中。结论:9种体质类型在自然人群中的分布存在一定的差异性,兼夹体质在人群中占有一定的比例。     

中医体质在肺结节早期诊治中的应用探讨

目的:观察肺结节患者中医体质分布情况,探讨中医体质在肺结节中的应用,为肺结节早期诊治和中医药治疗提供思路。方法:采用问卷调查的研究方法,对就诊于我院呼吸科门诊的肺结节患者180例,收集患者的一般资料,运用《中医体质分类与判定表》进行体质辨识,观察患者体质分布情况;同期进行追踪随访,对观察期间内明确恶性肺结节患者的体质进行回顾分析。结果:180例肺结节患者中医体质分布如下:平和质51例(28.3%),阳虚质34例(18.9%),气郁质27例(15.0%),气虚质22例(12.2%),湿热质14例(7.8%),特禀质10例(5.6%),其他体质总计22例(12.2%)。恶性肺结节62例,阳虚质18例(29.0%),气郁14例(22.6%),平和质11例(17.7%),气虚10例(16.1%),其他类共9例(14.5%)。结论:(1)肺结节患者大部分存在体质偏颇,以阳虚质、气郁质、气虚质最为多见。(2)恶性肺结节中阳虚质、气郁质、气虚质比率更高,可能是恶性肺结节的好发体质。(3)运用中医治未病中"既病防变"原则改善体质偏颇,平衡肺结节的生长环境,可能减少恶性肺结节的发生率。     

温州地区耐多药结核病患者中医体质特点分析

目的:对耐多药结核病患者中医体质类型开展研究,探讨体质因素和发病的关系,为中医治未病提供相应的理论依据。方法:选取耐多药结核病患者201例,其中男145例,女56例,年龄18～79岁。运用中医体质辨识量表进行中医体质类型分类,进而探讨体质因素和耐多药结核病发病的关系。结果:201例耐多药结核病患者中,平和质者3例(1.5%),偏颇体质者198例(98.5%)。其中气虚质66例(32.8%),气郁质43例(21.4%),痰湿质31例(15.4%),阳虚质21例(10.4%)。耐多药结核病患者的中医体质类型得分中,相关性最大的体质类型依次是气虚质、气郁质、痰湿质及阳虚质。结论:耐多药结核病患者体质以气虚质、气郁质、痰湿质及阳虚质为主,对指导耐多药结核病的个体化治疗、预防耐药性产生有重要意义。     

不孕症患者抑郁状态与中医体质的相关性研究

目的:探讨不孕症患者中医体质类型的分布规律及患者抑郁状态与中医的体质类型是否存在相关性。方法:以2014年9月~2015年5月就诊于北京中医医院顺义医院妇科门诊的不孕症患者为研究对象,对符合纳入标准的患者进行问卷调查,现场收集入组患者的一般资料,通过填写汉密尔顿抑郁量表(HAMD)和中医体质量表,统计分析不孕症患者的中医体质分布规律及其与患者抑郁状态的相关性。结果:78例入组的不孕症患者中,气郁质26例(33.3%)出现频率最高,阳虚质、血瘀质也是不孕症患者中常见的中医体质类型。气郁质体质类型的抑郁症患病率显著高于其他体质类型。结论:气郁质、阳虚质、血瘀质体质类型可能为不孕症患者的主要体质类型,气郁质体质类型与抑郁状态密切相关,提示发生抑郁症的风险较高。     

初产妇253例中医体质辨识及母乳喂养分析研究

目的:对初产妇进行中医体质辨识及对母乳喂养情况进行分析,以便于有针对性实施中医护理健康教育。方法:观察对象为本院分娩的初产妇共253例,应用《中医体质调查量表》进行体质调查,以明确其体质类型。结果:体质以平和质和气虚质最为常见,其分布频率由高到低依次为:气虚质60例(23.71%)、平和质52例(20.55%)、气郁质45例(17.79%)、瘀血质21例(8.30%)、痰湿质20例(7.90%)、阴虚质19例(7.50%)、阳虚质18例(7.11%)、湿热质16例(6.32%)、特禀质2例(0.79%)。平和质的初产妇产后72 h开始母乳喂养率及产后4周母乳喂养率均高于其他体质类型;气虚质、气郁质、瘀血质、痰湿质、湿热质产妇4周母乳喂养率下降显著(P<0.05)。结论:结合深圳本地的特殊人群分布,产后体质大致以平和质、偏血瘀、气血虚、气郁质主,指导初产妇进行体质调治及母乳喂养,有一定的临床意义。 更多还原     

高通量测序筛选冠心病血瘀证相关lncRNA-miRNA-mRNA调控网络

目的:筛选冠心病血瘀证相关差异表达非编码RNA(lncRNA),微小RNA(microRNA,miRNA),信使RNA(mRNA),构建基因间调控网络,从转录组层面研究冠心病血瘀证物质基础和病理机制。方法:使用高通量测序技术,分别检测冠心病血瘀证、冠心病非血瘀证和正常(各5例)lncRNA,miRNA和mRNA表达情况,通过交联分析筛选冠心病血瘀证相关的差异基因表达谱。对获得的差异基因进行功能通路分析,根据基因间Pearson相关分析和star Base靶基因预测平台,构建基因间调控网络,通过网络拓扑分析,筛选其中的关键基因。在另一匹配队列中(每组各15例)对基因调控网络中的关键节点进行实时荧光定量PCR(Real-time PCR)验证。结果:39个lncRNA,229个miRNA和221个mRNA与冠心病血瘀证密切相关。功能与通路分析结果显示,冠心病血瘀证差异表达基因主要与免疫和炎症相关。共有9个lncRNA(均为下调),31个mRNA(11个上调,20个下调)和24个miRNA(14个上调,10个下调)构成共调控网络,包括76个基因间调控关系。CTA-384D8.35,CTB-114C7.4,RP11-567M16.6和hsa-miR-3158-3p是冠心病血瘀证基因调控网络中的关键节点。Real-time PCR结果验证了上述结果。结论:冠心病血瘀证存在lncRNA-miRNA-mRNA差异表达基因谱,其与免疫和炎症密切相关;差异表达基因间存在相互调控关系,并可依此构建冠心病血瘀证相关lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。对冠心病血瘀证的物质基础进行深度挖掘,可为从转录组层面开展中医证型相关研究提供了一定的科学基础。     

麦门冬汤合千金苇茎汤对小鼠Lewis原位肺癌lncRNA，mRNA表达谱的影响

目的:通过对Lewis肺癌原位移植小鼠肿瘤组织长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和mRNA表达谱的检测,探讨麦门冬汤合千金苇茎汤(金方)抗肺癌的作用机制。方法:C57BL/6小鼠随机分为正常组、模型组、金方组(20 g·kg-1·d-1),构建小鼠Lewis原位肺癌模型成功后,次日用金方灌胃开始治疗。应用基因芯片技术,检测与金方抗肺癌作用密切相关的差异lncRNA,mRNA,进行聚类分析,并利用t检验和差异表达的倍数变化,筛选出关键lncRNA,mRNA。运用生物信息学方法预测差异lncRNA调控的靶基因,并对其进行功能和通路分析。应用病理组织学技术,检测各组小鼠肿瘤组织光镜下的差异表现。结果:lncRNA,mRNA芯片杂交结果显示,金方调控了887个lncRNA差异表达,其中上调442个,下调445个(P0.05)。差异表达的mRNA共610个,其中上调376个,下调234个(P0.05)。使用GO分析方法,发现下调或上调的靶基因主要参与了细胞代谢调控、信号通路调控等生物学过程(biological process,BP)。靶基因分子功能(molecular function,MF)分析显示,下调或上调的靶基因主要具有DNA结合、蛋白质结合、受体结合和转录因子活性等功能。信号通路预测显示金方可调控Janus激酶/信号转导与转录激活因子(JAK/STAT)等与肺癌的发生发展密切相关的信号通路。病理组织学检查结果证实,与模型组比较,金方能明显改善小鼠肺组织的病理改变。结论:金方可能通过调控多种lncRNA和mRNA的表达及下游相关信号通路来发挥其抗肺癌的作用。     

基于ceRNA探讨白藜芦醇干预肾透明细胞癌的有效机制

目的 利用从肾透明细胞癌（ccRCC）数据集中筛选的差异表达基因、差异lncRNA及其上游miRNA，探索白藜芦醇可能的作用靶点，构建ccRCC的ceRNA网络。方法 从基因表达综合数据（GEO）及转录组数据库（TCGA）中检索并筛选ccRCC基因及lncRNA表达数据集，对差异表达基因（DEGs）进行富集和功能注释，使用在线数据库预测miRNA及长链非编码RNA（lncRNA），通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定该机制中可能的lncRNA，建立竞争性内源性RNA（ceRNAs）调控网络，并通过网络药理学分析确定白藜芦醇的药物靶点，探索白藜芦醇治疗ccRCC的分子作用机制。结果 构建了AL136040.1、SNHG17与上游hsa-miR-25-3p、hsa-miR-23a-3p及COL1A2、HRG的ceRNA调控网络，白藜芦醇与两个mRNA均显示良好的对接打分。结论 可能存在AL136040.1、SNHG17两个lncRNA与hsa-miR-25-3p、hsa-miR-23a-3p竞争性调控COL1A2、HRG，进一步影响ccRCC预后，可能是白藜芦醇治疗ccRCC的潜在机制。     

Microarray Expression Analysis for the Paradoxical Roles of Acanthopanax senticosus Harms in Treating α‐Synucleinopathies

α‐Synuclein is a key player in the pathogenesis of neurodegenerative disorders with Lewy bodies. Our previous studies have also showed that Acanthopanax senticosus harms (AS) could significantly suppress α‐synuclein overexpression and toxicity. Identifying the RNAs related to α‐synucleinopathies may facilitate understanding the pathogenesis of the diseases and the safe application of AS in the clinic. Microarray expression profiling of long non‐coding RNAs (lncRNAs) and mRNAs was undertaken in control non‐transgenic and human α‐synuclein transgenic mice. The effects of AS on central nervous system (CNS) in pathology and physiology were investigated based on the lncRNA/mRNA targets analysis. In total, 341 lncRNAs and 279 mRNAs were differentially expressed by α‐synuclein stimulus, among which 29 lncRNAs and 25 mRNAs were involved in the anti‐α‐synucleinopathies mechanism of AS. However, the levels of 19/29 lncRNAs and 12/25 mRNAs in AS group were similar to those in α‐synuclein group, which may cause potential neurotoxicity analogous to α‐synuclein. This study demonstrated that some of lncRNAs/mRNAs were involved in α‐synuclein related pathophysiology, and AS produced the bidirectional effects on CNS under pathological and physiological conditions. Copyright © 2015 John Wiley & Sons, Ltd.     

针灸对克罗恩病患者结肠黏膜基因表达谱的影响

目的 从基因表达谱的角度,探讨针灸治疗克罗恩病(CD)的效应机制.方法 受试者签署知情同意书进行结肠镜检查,收集CD患者和健康者结肠劲膜.采用基因芯片技术检测健康志愿者及CD患者针灸治疗前后结肠劲膜的基因表达谱,筛选出针灸治疗CD的差异表达基因,结合生物信息学方法,对差异表达的基因进行GO和Pathway分析.结果 针...     

补阳还五汤对急性脑梗死患者血清外泌体lncRNA表达谱的研究＊

目的 分析补阳还五汤对急性脑梗死患者血清外泌体lncRNA表达谱的影响，以期阐明其治疗脑梗死的机理。方法 选取6例符合纳入标准的急性脑梗死患者，随机分为观察组和对照组。其中观察组4例患者给予补阳还五汤联合西医基础治疗，对照组2例患者给予单纯西医基础治疗。在治疗第7天后采集静脉血，离心后分离血清并提取外泌体，运用基因芯片高通量检测lncRNA，筛选差异表达的lncRNA，最后对其cis作用靶基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 两组间共有20个差异表达的lncRNA，其中19个下调，1个上调；GO富集分析前30的结果涉及生物过程19个，细胞组分7个，分子功能4个；KEGG 通路富集主要为MAPK信号通路、雌激素信号通路等，这些通路与脑缺血后的氧化应激、炎症反应、细胞凋亡及细胞自噬等病理过程密切相关。结论 补阳还五汤会改变急性脑梗死患者的血清外泌体lncRNA表达谱，涉及诸多生物过程和信号通路。本研究可为后续的临床及基础研究提供了新思路。     

基于iTRAQ技术研究滋阴降火方药知柏地黄丸对阴虚“上火”SD大鼠血清蛋白组的影响

目的:研究知柏地黄丸治疗阴虚"上火"的生物学机制。方法:应用iTRAQ-2DLC-MS/MS蛋白组学技术检测阴虚"上火"大鼠在知柏地黄丸治疗前后的血清蛋白组学表达谱,筛选并鉴定与知柏地黄丸治疗作用相关的蛋白质群,并应用生物信息学对差异表达的蛋白进行功能富集分析,揭示知柏地黄丸对阴虚"上火"治疗作用的生物学机制。结果:与正常大鼠比较,阴虚"上火"对照组大鼠血清中有47个差异蛋白,其中有20个表达上调,27个表达下调。知柏地黄丸治疗后,有19个差异蛋白恢复至正常或接近正常水平。通过生物信息学分析,发现这些蛋白主要集中在免疫反应与物质代谢过程。其中参与免疫反应的蛋白主要有有补体成分4(C4)、凝血因子X(F10)、激酶相关磷蛋白2(Skap2);参与代谢作用的蛋白有L乳酸脱氢酶A链(Ldha)、果糖二磷酸醛缩酶A(Aldoa)、花生四烯酸脂肪氧合酶(Alox12)、GDP分解酶抑制剂1(Arhgdia)、肌球蛋白轻链(Myl6)。结论:阴虚"上火"主要表现为机体免疫反应与物质代谢发生紊乱,知柏地黄丸可以通过调节免疫与物质代谢反应治疗阴虚"上火"。     

雪峰虫草子座不同生长发育时期的转录组研究

目的：挖掘调控雪峰虫草生长发育的相关通路和基因,揭示其子座生长发育的内在分子机制。方法：采用转录组测序技术（RNA-Seq）对雪峰虫草子座菌丝体（MD1）、子座原基（PD2）和子座（SD3）生长发育3个不同阶段进行测序;数据通过非冗余蛋白（NR）、Swiss-Prot、Pfam、京都基因与基因组百科全书（KEGG）、真核生物相邻类的聚簇（KOG）、基因本体（GO）数据库进行功能注释。利用EdgeR软件进行差异表达基因分析,挖掘调控雪峰虫草子座生长发育的相关通路和基因。结果：测序结果显示,MD1、PD2、SD3分别获得了8.15、7.51、6.87 GB分析数据,拼接分析数据共获得34 218个转录本,平均长度为5502 bp,组装及去冗余后获得10 511条unigenes,平均长度为2470 bp。KOG功能注释和GO富集分析显示,细胞和细胞组分、新陈代谢过程、信号转导及碳代谢是雪峰虫草子座发育过程中的关键基因类别。对子座不同生长发育时期的基因进行差异表达分析发现,PD2和SD3相比差异表达基因最多,其中上调基因1073个,下调基因1036个,MD1和SD3相比差异表达基因最少,上调...     

糖尿病肛瘘lncRNA芯片分析及CNC图搭建＊

目的 研究糖尿病肛瘘创面特异表达LncRNA与mRNA基因功能之间调控网络。方法 用基因芯片技术对糖尿病肛瘘创面和普通肛瘘创面组织中差异性表达的LncRNA及mRNA进行基因表达谱检测，筛选的标准为2倍差异及P < 0.05,再进行差异表达分析，然后对差异表达的mRNAs进行KEGG通路分析及Pathway Map展示，挑选出显著mRNA指标，将这些显著mRNA指标进行q-PCR验证，得到有意义的阳性指标，再将阳性指标与差异LncRNA交集得出LncRNA-mRNA共表达网络，并基于LncRNA-mRNA共表达网络挑选出不同LncRNA进行功能验证。结果 将芯片标准化后分析差异表达的长链非编码RNA和mRNA，发现上调差异有502个，下调差异有1204个；mRNA分析发现上调差异621个，下调差异505个，KEGG通路分析发现上调和下调的通路均有10条；通过分别对上调、下调最明显的通路进行Pathway Map展示，挑选出显著mRNA指标8个：BMP2、IFNB1、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7、SMAD9、β-actin，分别将其进行q-PCR验证，得到有意义的阳性指标个5个：BMP2、IL6、IL18、PIK3CB、SMAD7，将5个阳性指标和差异LncRNA交集得出LncRNA-mRNA共表达网络，并基于LncRNA-mRNA共表达网络挑选出不同LncRNA进行功能验证。结论 挑选出的20个LncRNA（NR_125383、T323486、ENST00000582334、TCONS_00018312、ENST00000418393、TCONS_00017190、TCONS_00019532、ENST00000601559、ENST00000566575、NR_109882、NR_026913、T301537、NR_109774、ENST00000415536、ENST00000610000、ENST00000412485、ENST00000573220、T175957、ENST00000580756、TCONS_00014747）所调控的mRNA居于LncRNA-mRNA共表达网络，其在各个领域当中均有不同程度的报道，为后续的功能和机制研究提供了方向和重点，为加速慢性难愈合和创面愈合的研究提供了新的思路，为开发促愈药物提供基础研究借鉴。