乳腺癌组织中AXIN2基因启动子区甲基化表达及临床意义

目的本研究旨在通过检测乳腺癌组织中AXIN2基因启动子区甲基化状态,分析其与乳腺癌相关危险因素、临床病理特征及mRNA表达间的关系,探讨其在临床应用中的价值。方法选取2018年1月至2019年12月在山东第一医科大学附属肥城市人民医院普外科经手术切除治疗的84例女性乳腺癌患者的乳腺癌组织和癌旁组织,检测组织的AXIN2基因启动子的甲基化状态和mRNA表达量,使用不同浓度的甲基转移酶抑制剂(5-Azacytidine,5-Aza)处理人乳腺癌ZR-75-1细胞,且进行乳腺癌相关危险因素和临床病理特征的收集与分析。结果乳腺癌组织的AXIN2基因启动子甲基化阳性率(40.5%)显著高于癌旁组织的甲基化阳性率(19.0%)(χ2=10.401,P=0.001)。AXIN2甲基化阳性率与乳腺癌患者的初产年龄(χ2=5.467,P=0.019)、是否有人工流产史(χ2=8.372,P=0.006)有关;AXIN2甲基化阳性率与是否发生淋巴结转移(χ2=5.338,P=0.021)、ER表达状态(χ2=9.141,P=0.002)及PR表达状态(χ2=6.918,P=0.009)有关。此外,乳腺癌组织的AXIN2基因mRNA相对表达量(00.22±0.03)显著低于癌旁组织的mRNA相对表达量(0.46±0.06)(t=3.527,P<0.001);甲基化阳性乳腺癌组织的mRNA相对表达量(0.13±0.02)显著低于甲基化阴性乳腺癌组织的mRNA相对表达量(0.29±0.04)(t=3.616,P<0.001)。ZR-75-1细胞使用5-Aza处理后,AXIN2基因mRNA相对表达量显著升高(t=3.824,P<0.001)。结论AXIN2基因启动子区DNA甲基化与乳腺癌发生机制有关,在临床中有一定应用价值。     

CDKN2A基因启动子区甲基化对乳腺癌的影响及其临床意义

目的:研究细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN2A)启动子区甲基化对乳腺癌的影响及其临床意义。方法:应用甲基化特异性聚合酶链反应(PCR)、West ern-bl ot检测乳腺癌及癌旁组织65例,比较CDKN2A基因启动子区甲基化及其蛋白质与乳腺癌发生发展的关系。结果:乳腺癌组织CDKN2A甲基化产物明显多于癌旁组织,差异有统计学意义(χ2=13.7,P=0.001);乳腺癌组织和癌旁组织CDKN2A mRNA甲基化产物的PMR水平差异有统计学意义(t=3.37,P=0.001);乳腺癌组织CDKN2A蛋白的表达水平显著低于癌旁组织(t=2.784,P=0.012)。结论:CDKN2A基因启动子区甲基化及其编码蛋白质的失活与乳腺癌明显相关。     

肝细胞癌中SFRP1和APC基因启动子甲基化与其mRNA的表达

目的探讨肝细胞癌（HCC）中SFRP1和APC基因启动子甲基化状态及其mRNA表达的关系。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）和逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）技术，检测30例肝细胞癌（HCC组）及相应的癌旁组织（癌旁组）和10例正常肝组织（正常对照组）中SFRP1及APC基因启动子甲基化状态和mRNA的表达水平，分析甲基化与某些临床参数与mRNA表达的关系。结果HCC组、癌旁组及正常对照组中的SFRP1和APC基因启动子甲基化率分别是11／30，4／30，0／10和14／30，5／30，0／10；HCC组明显高于其余两组（P〈0．05）。SFRP1基因启动子甲基化与临床资料无关（P〉0．05）；APC基因启动子甲基化与年龄（〈60）岁和癌肿无假包膜有关（P〈0．05）。HCC组SFRP1基因mRNA表达明显低于其余两组（P〈0．05），各组APC基因mRNA表达差异无显著性。两基因甲基化之间无相关性。结论SFRP1和APC基因启动子甲基化与HCC的形成和进展有关，但HCC组织中基因甲基化与mRNA表达的关系尚不明确。     

原发性肝癌p14ARF基因CpG岛甲基化研究

目的探讨p14ARF基因启动子区CpG岛甲基化与原发性肝细胞肝癌发生、发展的关系。方法采用逆转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）检测42例原发性肝癌组织及癌旁组织中p14ARFmRNA的表达,同时用甲基化特异PCR（methylation-specific PCR,MSP）方法分析p14ARF基因启动子区域甲基化状况。结果42例肝癌组织有7例呈p14 mRNA的表达,表达率17%。癌旁正常组织均有p14表达。p14mRNA在原发性肝癌组织中明显表达缺失（χ^2=56.62,P〈0.05）;42例原发性肝癌组织中,有19例检测到p14基因启动子的甲基化,甲基化发生率45%。相应癌旁组织未发现甲基化。p14ARF基因在原发性肝癌呈现明显高甲基化（χ^2=22.04,P〈0.05）。在p14mRNA表达的7例肝癌组织中没有检测到p14基因启动子的甲基化,而在p14mRNA表达缺失的35例肝癌组织中。19例p14基因启动子呈现甲基化。肝癌组织中p14ARF基因启动子甲基化与p14mRNA表达缺失明显相关（χ^2=4.66,P〈0.05）。结论在原发性肝癌p14 mRNA明显表达缺失,原发性肝癌p14ARF基因启动子频繁甲基化可能是p14ARF失活的原因之一。     

miR-34b基因启动子区甲基化与甲状腺乳头状癌的关系

目的探讨甲状腺乳头状癌（PTC）中微小RNA-34b（miR-34b）基因的表达及其启动子区的甲基化情况,并分析甲基化与其临床病理特征的关系。方法收集2008年9月至2010年10月期间南京医科大学附属淮安第一医院行手术切除的25例PTC患者的癌组织和癌旁组织。采用实时定量PCR法检测其miR-34b mRNA的表达,采用甲基化特异性（MSP）PCR法检测miR-34b基因启动子区的甲基化情况。结果 PTC癌组织中miR-34bmRNA的相对表达量为0.85±0.05,较癌旁组织的1.62±0.09低（P=0.030）。25例PTC癌组织中,有18例（72%）患者的miR-34b基因启动子区发生甲基化,癌旁组织组有10例（40%）,癌组织的甲基化比例较高（P=0.021）。甲基化与PTC患者的年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期和包膜浸润均无关（P〉0.05）,而与淋巴结转移有关,发生淋巴结转移者的甲基化比例高于未发生淋巴结转移者（P〈0.05）。结论 PTC癌组织中miR-34b基因启动子区的异常甲基化可能是该基因失活的原因之一,并且可能与PTC的发生、发展以及转移均有关,其机理值得进一步研究。     

肝癌细胞NFAT2基因启动子区甲基化与其mRNA表达的关系

目的:探讨肝癌细胞中NFAT2基因启动子CpG岛甲基化状态及与其mRNA表达的关系。方法:用重硫酸盐测序法检测肝癌组织与癌旁组织及不同肝细胞系与正常肝细胞中NFAT2启动子甲基化状态,用qRT-PCR检测肝癌组织与癌旁组织NFAT2 mRNA表达,并分析肝癌组织NFAT2启动子甲基化与mRNA水平的相关性。结果:肝癌组织中NFAT2基因CpG岛甲基化率明显高于癌旁组织(33.0%vs.21.6%,P=0.003);人肝癌细胞系HuH7、HepG2、Hep3B中NFAT2基因CpG岛甲基化率分别为34.8%、40.4%、37.0%,均明显高于人正常肝细胞系L02中NFAT2基因CpG岛甲基化率(16.2%)(均P0.05)。肝癌组织NFAT2 mRNA相对表达量明显低于与癌旁组织(0.000 602 4 vs.0.001 469,P0.05),肝癌组织中NFAT2 mRNA水平与其启动子甲基化程度呈明显负相关(r=-0.661,P=0.027)。结论:肝癌细胞中NFAT2基因表达下调可能与其启动子区CpG岛高甲基化状态有关     

肝细胞癌中WIF-1基因启动子甲基化状态及mRNA表达的研究

目的 探讨细胞癌中WIF-1基因启动子甲基化状态及其对mRNA表达的影响。方法 应用甲基化特异性聚合酶链反应和实时定量逆转录-聚合酶链反应技术,检测33例肝细胞癌及相应的癌旁组织和20例正常对照肝组织中WIF-1基因启动子甲基化状态和mRNA表达水平,分析上述组织WIF-1基因甲基化及mRN表达与临床资料的关系并分析甲基化对mRNA表达的影响。结果 WIF-1基因在癌组织中甲基化率明显高于癌旁组织和正常组织（Х^2=4．89,P〈0．05）,而癌旁组织和正常组织中WIF-1基因甲基化率相比无明显差异;癌组织中WIF-1基因甲基化与乙肝表面抗原、肝硬化有关;WIF-1基因mRNA表达量在三种组织中比较无明显差异。结论 WIF-1基因启动子甲基化与HCC的发生相关;WIF-1基因启动子甲基化与其mRNA表达的关系有待进一步研究。     

肾透明细胞癌中分泌型卷曲相关蛋白1基因甲基化及其表达与亚甲基四氢叶酸还原酶C677T基因多态性的关系

目的探讨人肾透明细胞癌组织中分泌型卷曲相关蛋白1基因（SFRP 1）的甲基化状态及其mRNA表达与亚甲基四氢叶酸还原酶C677T（MTHFR C677T）基因多态性的关系。方法采用PCR-RFLP技术分别检测38例手术切除的肾透明细胞癌区和外周正常肾脏组织标本MTHFR基因677（C→T）多态,并分别以Real-time PCR和和甲基化特异性PCR（MSP）技术检测SFRP 1基因的表达和甲基化状态。结果 SFRP 1基因失表达和/或低表达的肾透明细胞癌组织其启动子区处于高甲基化状态,MTHFR 677CC基因型的肾透明细胞癌组织SFRP 1甲基化升高且其表达降低,SFRP 1的甲基化及其表达与MTHFRC677T基因多态性有明显相关性。结论 MTHFR基因多态性通过影响SFRP 1基因的甲基化状态而调控其表达,可能在肾癌的发生、发展中具有重要作用。     

肾透明细胞癌中分泌型卷曲相关蛋白1基因甲基化及其表达与亚甲基四氢叶酸还原酶C677T基因多态性的关系

【摘要】 目的 探讨人肾透明细胞癌组织中分泌型卷曲相关蛋白1基因（SFRP-1）的甲基化状态及其mRNA表达与亚甲基四氢叶酸还原酶C677T（MTHFR C677T）基因多态性的关系。方法 采用PCR-RFLP技术分别检测38例手术切除的肾透明细胞癌区和外周正常肾脏组织标本MTHFR基因677 (C→T)多态, 并分别以Real-time PCR和和甲基化特异性PCR (MSP)技术检测SFRP 1基因的表达和甲基化状态。结果 SFRP 1基因失表达和/或低表达的肾透明细胞癌组织其启动子区处于高甲基化状态，MTHFR 677CC基因型的肾透明细胞癌组织SFRP 1甲基化升高且其表达降低，SFRP 1的甲基化及其表达与MTHFR C677T基因多态性有明显相关性。结论 MTHFR基因多态性通过影响SFRP 1基因的甲基化状态而调控其表达，可能在肾癌的发生、发展中具有重要作用。     

原发性肝癌RUNX3基因启动子区甲基化及mRNA表达及其意义

目的 观察原发性肝癌中人RUNT相关转录因子3(RUNX3)基因启动子甲基化及mRNA表达,探讨其甲基化与临床特征的关系.方法 收集75例原发性肝癌患者的肿瘤标本及其癌旁组织、10例正常肝组织,应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)测定RUNX3基因CpG岛甲基化状态,并采用实时定量聚合酶链反应(PCR)分析RUNX3基因在75例原发性肝癌中的表达水平及甲基化与肝癌临床特征的关系.结果 75例肝癌组织中有34例(45.3％)存在RUNX3基因CpG 岛的异常甲基化,癌旁组织中有7例(9.3％),而正常肝组织中未检测到RUNX3基因CpG岛的异常甲基化,RUNX3基因异常甲基化在肝癌组织、癌旁组织及正常组织中的发生率差异有统计学意义(x2=29.18,P＜0.01);75例原发性肝癌实时定量PCR分析有45例肝癌组织中存在RUNX3 mRNA 表达缺失或下调,其中60％ (27/45)伴随启动子甲基化,即RUNX3 mRNA表达下调与RUNX3基因甲基化密切相关(x2=9.77,P＜0.01);而肝癌组织非甲基化组RUNX3基因表达量高于甲基化组4倍以上;RUNX3基因CpG岛甲基化与患者肝硬化关系密切(x2=5.07,P＜0.05).结论 原发性肝癌存在RUNX3基因CpG岛异常甲基化,CpG岛的甲基化可能是导致其基因表达降低的主要原因之一,并与患者肝硬化密切相关.     

乳头状甲状腺癌中谷胱甘肽过氧化物酶3启动子区高甲基化与表达缺失

目的 探讨乳头状甲状腺癌(PTC)中谷胱甘肽过氧化物酶3(GPX3)基因启动子区域甲基化状态,分析GPX3甲基化与其基凶表达的关系.方法 应用甲基化特异性聚合酶链式反应(MSP)检测47例PTC、10例非癌组织标本和乳头状甲状腺癌细胞株TPC-1中GPX3的甲基化状态,并用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测TPC-1细胞中GPX3的mRNA表达.结果 48.9％( 23/47) PTC发生GPX3基因启动子区域甲基化,而10例非癌组织均未发生甲基化;TPC-1中GPX3启动子区甲基化,而且GPX3的mRNA不表达,经5-aza-2’-deoxycytidine干预96h后GPX3重新表达.结论 GPX3基因启动子区域频繁发生甲基化.,可能作为PTC的诊断标志物;GPX3启动子区的甲基化是其基因表达的重要调节机制.     

结直肠癌侵袭性与脾酪氨酸激酶基因Syk启动子甲基化的关系

目的　探讨脾酪氨酸激酶 (Syk)基因启动子甲基化与结直肠癌侵袭转移之间的关系。方法　采用巢式双重甲基化特异性聚合酶链反应 (MSP)和逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)的方法检测Syk基因在 12 0例结直肠癌肿瘤组织、癌旁正常组织中的甲基化和表达情况。 结果　 12 0例结直肠癌患者中 ,48例未检测到SykmRNA的表达 ,而癌旁正常组织均有表达。癌旁正常组织未检测到Syk基因启动子甲基化 ,3 7例肿瘤组织发生Syk基因启动子甲基化(3 0 .8% ) ,癌组织Syk基因启动子甲基化率显著增高 (P <0 .0 0 0 5 )。在淋巴结转移的 5 6例中 ,2 4例发生Syk基因启动子甲基化 ,而无淋巴结转移的 64例中 ,13例发生甲基化 ,有淋巴结转移的Syk基因启动子甲基化发生率显著高于无淋巴结转移组 (P =0 .0 0 8)。发生甲基化的肿瘤组织中 ,均无SykmRNA的表达。结论　结直肠癌中 ,SYK基因启动子过甲基化导致其mRNA的失表达 ,从而引起结直肠癌的侵袭性增强 ,它可能是结直肠癌发生侵袭转移的又一种机制。     

上皮钙黏素1基因启动子甲基化对结肠癌上皮钙黏素和β-连接素表达的影响

目的 探讨上皮钙黏素基因(CDH1)启动子甲基化与结肠癌上皮钙黏素(E-cadherin)及β-连接素(β-catenin)的表达及临床病理特征的关系.方法 采用甲基化特异性PCR技术检测68例结肠腺癌组织、癌旁组织及正常黏膜组织中CDH1基因启动子甲基化的状况.采用免疫组织化学法检测E-cadherin及β-catenin蛋白的表达.结果 癌旁组织及癌组织中CDH1启动子甲基化的阳性表达分别为32.4%(22/68)、57.4%(39/68),正常组织均为阴性表达(P<0.05).E-cadherin在正常组织、癌旁组织及腺癌组织中阳性表达率分别为92.6%、66.2%和44.1%.正常组织中β-catenin均表达于细胞膜上,无胞质和(或)胞核表达,而β-catenin在癌旁组织及癌组织中胞质和(或)胞核表达分别为29.4%和50.0%.CDH1基因启动子甲基化阳性率与E-cadherin表达则呈负相关(r=-0.312,P=0.01),与β-catenin胞质和(或)胞核表达呈正相关(r=0.309,P=0.018).CDH1基因启动子甲基化及E-cadherin、β-catenin的异常表达均与结肠癌分化程度及转移密切相关(P<0.05).结论 CDH1基因启动子甲基化可能是导致结肠癌E-cadherin与β-catenin异常表达及肿瘤侵袭性增强的重要原因.

Abstract：

Objective To investigate the relationship between methylation of the CDH1 gene promoter on the expression of E-cadherin and β-catenin, and to evaluate the correlation with clinicopathological characteristics of the colonic carcinoma. Methods Methylation specific PCR (MSP) was used to detect CDH1 gene promoter methylation in the cancer tissue, adjacent tissues and normal tissues in 68 patients. The expression of E-cadherin and β-catenin was determined by immunohistochemistry staining. Results The positive rate of CDH1 gene promoter methylation was 32.4% in adjacent tissues and 57.4% in cancer tissue, while no detectable methylation was found in all the normal tissues. The difference was statistically significant. The positive rate of E-cadherin was 92.6% in the normal tissues, 66.2% in the adjacent tissues and 44.1% in the cancer tissues. In all normal tissues, β-catenin was expressed only at the cellular membrane but not in the cytosol or nucleus, while the expression of β-catenin was present in the cytosol or nucleus in 29.4% of the adjacent tissues and 50.0% of the cancer tissues. The positive rate of CDH1 gene promoter methylation was negatively correlated with E-cadherin expression (r =-0.312,P =0.01) and positively correlated with β-catenin cytosolic/nucleus expression(r=0.309,P=0.018). The differentiation and metastasis of colonic carcinoma were associated with the aberrant expression of E-cadherin, β-catenin, and methylation of CDH1 promoter (P<0.05). Conclusion CDH1 gene promoter methylation may lead to aberrant expression of E-cadherin and β-catenin in colonic carcinoma, and may play an important role in promoting the invasion of tumor.     

肝细胞癌中APC基因启动子甲基化和mRNA表达检测

目的探讨肝细胞癌中APC基因启动子甲基化状态及其对mRNA表达的影响。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术,检测30例肝细胞癌及相应的癌旁组织和10例正常对照肝组织中APC基因启动子甲基化状态和mRNA表达水平,分析甲基化与临床资料以及与mRNA表达的关系。结果在肝细胞癌、癌旁及正常对照肝组织中检测到APC基因启动子甲基化率分别是46.6%、16.6%、0%。肝细胞癌组织中APC基因启动子甲基化率明显高于相应的癌旁和对照组(P<0.05),并且与年龄和癌肿有无假包膜有相关性(P<0.05)。各组织中APC基因mRNA表达无显著差异。结论APC基因启动子甲基化与肝细胞癌形成和侵袭有关,但不影响癌组织中mRNA表达。