成都市2009年流感病毒H3N2亚型血凝素基因分析

[目的]了解某市流行的H3N2流感病毒分子生物学特征、进化情况,及其血凝素基因与猪流感病毒血凝素基因的关系。[方法]对该市分离的2009年H3N2亚型流感病毒40株血凝素基因进行逆转录-聚合酶链(RT-PCR)扩增,然后测序,分析该市流感病毒H3N2亚型的核酸序列和氨基酸序列,与2009年疫苗推荐株及四川省猪流感病毒基因序列比对分析。[结果]该市2009年流感病毒H3N2亚型的流行株,与2009年的疫苗株比较,碱基同源性为99.5%,抗原性有一定的差异,但不是重组变异病毒,其流行强度有限。与A/swine//Sichuan/1/2006(H3N2)比较,同源性为94.4%,说明人源流感病毒A/H3N2与猪源流感病毒A/H3N2具有一定的同源性,但抗原决定簇区和受体结合位点具有差异,在种间互相流行的可能性较低。[结论]该市流感A/H3N2流行株虽然有一定的变异,但没有大流行的预警提示出现。长期监测具有必要性。     

宁夏H3N2流感病毒血凝素基因分子特征分析

目的 了解2014-2020年宁夏H3N2流感病毒血凝素(Haemagglutimin,HA)基因变异情况,为宁夏的流感防控提供科学依据.方法 选取2014-2020年宁夏分离的30株H3N2流感毒株,提取病毒RNA,采用RT-PCR方法扩增HA片段并测序,利用生物信息软件对测序结果进行比对分析.结果 与疫苗株A/Te...     

2014 - 2015年度淮安市甲型H3N2流感病毒的流行及血凝素基因特征分析

目的 了解淮安地区甲型H3N2流感病毒的流行特征和基因型别。方法 收集2014年4月 - 2015年3月间2家哨点医院采集的流感样病例咽拭子,利用实时荧光RT - PCR方法进行流感病毒的快速检测,对流感病毒核酸阳性的样本进行流感病毒HA基因扩增、测序。利用Lasergene软件进行序列比对及核苷酸同源性分析,并分析血凝素主要的抗原位点,利用Mega6.0软件构建系统进化树,对该时间段内的H3N2病毒流行情况进行统计分析。结果 H3N2亚型流感病毒淮安株的核苷酸同源性为98.9 %～99.9 %,所收集的淮安株均为H3N2亚型的3C.3a系,在进化关系上与广西株A/Guangxi - Longan/1100/2015和淮安株A/Jiangsu - Qingpu/1660/2015关系较近,H3N2流行主要发生在秋冬季节。结论 与疫苗株相比,淮安地区H3N2病毒发生变异,提示疫苗株免疫效果下降。     

无锡地区H3N2流感病毒流行情况实验室分析

目的 了解无锡地区H3N2流感病毒血凝素基因变异情况和人群中HI抗体水平,分析H3N2流感病毒流行情况.方法 选取2007～2010年哨点医院的H3N2流感病毒进行基因序列比对;选择2008年9月～2009年5月健康体检人群及流感监测哨点医院就诊病例血清140份,2010年9月～2011年1月血清98份进行人群中HI抗体分析.结果 对无锡地区分离的42株H3N2流感病毒的HA基因进行分析,核苷酸序列同源性为98.1％～99.6％,病毒之间的核苷酸序列同源性差异较小.2008年9月～2009年5月人群中H3N2 H1抗体阳性率为86.40％、保护率为84.30％、GMT为1∶58.56,2010年9月～2011年1月人群中为100.00％、100.00％、1∶78.88,两者之间HI抗体阳性率、保护率和GMT差异有统计学意义(P均=0.000).结论 根据对无锡地区2007 ～2011年H3N2亚型流感病毒监测、基因进化分析和人群中抗体保护检测情况分析,推测近期H3N2流感病毒不会有较大流行.     

2007-2009年郴州市H3N2亚型流感病毒HA1基因特性研究

目的了解2007-2009年郴州市H3N2亚型流感病毒流行情况及血凝素基因变异特征。方法 按时间先后顺序随机选择2007-2009年流感病原学监测中分离到的H3N2亚型毒株8株,提取病毒核糖核酸（RNA）,采用RT-PCR法扩增病毒HA1基因,纯化产物进行核苷酸序列测定并推导其氨基酸序列进行基因特性分析。结果H3N2亚型流感病毒在2007年为优势株,2008-2009年相对H1N1亚型流感病毒为弱势株;2007年分离株与该年疫苗株（A/Wisconsin/67/2005）比较,变异位点主要为G50E、S138A、K140I、R142G、N144D和L157S,抗原性发生了漂移;2008年分离株与2008-2009年疫苗株（A/Brisbane/10/2007）比较,变异位点主要为R142G、L157S;2009年分离株与该年疫苗株比较,变异位点主要为L157S、K173Q,2008-2009年分离株与该年疫苗株比较未发生明显变异。结论郴州市2007年H3N2亚型流感病毒HA1发生了明显变异,H3N2流感病毒较活跃,当年生产的疫苗预防效果较差;2008-2009年H3N2亚型流感病毒HA1与该年度疫苗株相比未发生明显变异,人群对其建立较好的免疫屏障,这是郴州市2008-2009年H3N2亚型流感病毒活动水平较低的主要原因。     

H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶基因特性研究

目的 了解H3N2亚型人流感病毒神经氨酸酶(NA)基因变异规律 方法 采用狗肾传代细胞法对流感病毒进行分离培养,提取病毒RNA,逆转录-聚合酶链式反应,扩增NA基因后进行核苷酸序列测定.测序结果与WHO全球流感疫苗株序列进行氨基酸序列同源比对,并采用MEGA 4.0构建系统进化树,计算遗传距离.结果 NA氨基酸序列的...     

四川省甲型H1N1流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析

目的 了解四川省甲型H1N1流感病毒的抗原性和血凝素(HA)基因的变异情况.方法 对四川省2009-2011年分离的流感病毒采用单项血凝抑制试验鉴定毒株型别,在此基础上选取分离自中国内地首发甲型H1N1流感病例、首起甲型H1N1流感疫情、甲型H1N1流感死亡病例以及哨点医院流感样病例标本的甲型H1N1流感病毒株共计11株,进行HA基因核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因特征分析.结果 与中国代表株A/四川/SWL1/2009(H1N1)相比,2009-2011年四川省甲型H1N1流感毒株单项血凝抑制效价均无4倍以上差异,与疫苗株A/California/7/2009(H1N1)相比,HA氨基酸具有高度同源性(96.6％ ～99.4％).结论 四川省甲型H1N1流感病毒的HA基因特性和抗原性没有发生明显变异.     

长沙市2009年甲型H1N1流感病毒血凝素基因特性分析

2009年4月21日,美国疾病预防控制中心(CDC)检出2名儿童感染新甲型H1N1流感病毒~[1],该病毒属于正黏病毒科(orthomyxoviridae),甲型流感病毒属(influenza virus A),单股负链RNA病毒,由大小不等的8个独立片段组成,共编码11种蛋白,主要通过飞沫或气溶胶经呼吸道传播,极易造成流行.     

石家庄市2009年H3N2亚型流感病毒血凝素重链区基因变异分析

目的:了解石家庄市2009年H3N2亚型流感病毒流行情况,研究2009年分离H3N2亚型流感病毒株血凝素重链(HA1)的基因特性及变异情况。方法:用MDCK细胞分离流感病毒,采用血抑实验分型鉴定。随机选取24株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取、逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因序列测定,之后用DNAStar软件的MegAlign功能进行序列比对和分析。结果:经MegAlign将24株毒株与WHO疫苗推荐株A/Wisconsin/67/200(07～08)、A/Bris-bane/10/2007(08～10)进行比对,发现与同年疫苗株同源性较高,为98.2%～98.6%,仅有个别位点出现氨基酸替换。结论:2009年石家庄市H3N2亚型流感毒株HA1区与同年疫苗株基因序列符合率较高,尚未形成一个新的变异株。     

2013-2017年河南省H3N2亚型流感病毒流行特征分析

目的 分析河南省2013-2017年H3N2亚型流感病毒流行特征,为流感防控策略的制定提供依据。方法 采集河南省22家流感监测哨点医院的流感样病例(Influenza like illness,ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR检测和病毒分离,对H3N2亚型流感病毒检测阳性标本进行统计分析。结果 河南省2013-2017年共检测62 307例ILI病例标本,其中H3N2亚型流感病毒核酸检测阳性4 791例,四个监测年度H3N2亚型阳性占流感总阳性的率分别为14.9%、95.68%、12.36%、76.57%,男女发病率差异无统计学意义;有三个监测年度不同年龄组的H3N2感染率差异有统计学意义;H3N2亚型流感病毒感染人群职业分布以散居儿童(24.73%-35.41%)、托幼儿童(21.94%-30.17%)、学生(16.77%-27.66%)检出人数最多;各个监测年度各市核酸阳性率和病毒分离率不同;H3N2病毒分离株以低血凝滴度(1〖DK〗∶16)二代细胞分离毒株为主(62.33%)。结论 2河南省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,是近些年流感流行的的主要型别,儿童和学生是H3N2亚型流感防控的重点人群,且该病毒在细胞中不易培养,呈低滴度高代数特点,应加强病毒分离工作。     

Antigenic heterogeneity within influenza A (H3N2) virus strains

On the basis of their antigenic properties, influenza virus strains are classified into types and subtypes, which are further subdivided into variants that differ to various degrees in haemagglutination-inhibition assays. Evidence is presented that during infection with an influenza A(H3N2) virus the respiratory tract of a human patient often harbours more than one antigenic virus variant. These variants are frequently propagated by embryonated fowl eggs and monkey cells with different efficiencies, and this may lead to the selection of different variants by either of these host systems. Also, passage of virus by a given host is sometimes attended by changes in reactivity in haemagglutination-inhibition tests. In some cases the heterogeneity described also affects the specific immunogenicity of the virus in ferrets. Virus strains cloned in monkey kidney cell cultures gave variants that were stable upon further passage. These results may have implications for antigenic and biochemical investigations of epidemiologically relevant virus variants. It is argued that the antigenic drift of influenza A(H3N2) viruses is best characterized by analyses, both with post-infection ferret antisera and with panels of monoclonal antibodies, of virus strains isolated and passaged in monkey kidney cell cultures only.     

Laboratory characteristics of an attenuated influenza type A (H3N2) virus ('Alice' strain).

The Alice strain of live attenuated influenza virus was obtained by selection of a gamma inhibitor-resistant strain from a virus recombinant between A/PR/8/34 (HON1) and A/England/42/72 (H3N2). Its behaviour in vitro and in vivo was studied. Three marker systems were investigated: resistance to serum inhibitors, growth capacity at high temperature and low sensitivity to amantadine hydrochloride. In ferrets the strain was found to be attenuated and immunogenic. Passages in man, animals and eggs have not affected its resistance to gamma inhibitors.     

Laboratory characteristics of an attenuated influenza type A (H3N2) virus ('Alice' strain).

The Alice strain of live attenuated influenza virus was obtained by selection of a gamma inhibitor-resistant strain from a virus recombinant between A/PR/8/34 (HON1) and A/England/42/72 (H3N2). Its behaviour in vitro and in vivo was studied. Three marker systems were investigated: resistance to serum inhibitors, growth capacity at high temperature and low sensitivity to amantadine hydrochloride. In ferrets the strain was found to be attenuated and immunogenic. Passages in man, animals and eggs have not affected its resistance to gamma inhibitors.     

2005年广西H1N1亚型流感病毒基因特性研究

目的阐明2005年广西流行的H1N1亚型流感病毒血凝素基因变异情况。方法挑选3株2005年广西流感病毒分离株,进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后使用DNA—STAR分析软件进行进化特性分析。结果HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,与2005年的国际疫苗推荐株A／New Caledonia／20／1999（H1N1）比较,三株分离株的HA1蛋白均含有7个糖基化位点。分离株A／Gx／566／2005发生以下氨基酸位点替换：82T〉K、94Y〉R、145R〉K、165V〉A,208R〉K、251W〉R、266T〉N,其中165位点位于HA1的抗原决定簇上。分离株A／GX／8／2005及分离株A／GX／13／2005发生了以下位点变异：165V〉A、194E〉G、251W〉R、252Y〉F、314V〉A,其中165及194位于HA1抗原决定簇上。结论2005年在广西同时流行着三系不同的H1N1病毒。一系接近国际疫苗推荐株A／New Caledonia／20／1999（H1N1）东部江苏的2000—2002年毒株,一系接近江苏2005—2006年毒株。尤其需要密切关注与疫苗株HA1蛋白发生较大变异一系H1N1,避免此系H1N1病毒的流行和暴发。     

Transmission of avian influenza virus (H3N2) to dogs

In South Korea, where avian influenza virus subtypes H3N2, H5N1, H6N1, and H9N2 circulate or have been detected, 3 genetically similar canine influenza virus (H3N2) strains of avian origin (A/canine/Korea/01/2007, A/canine/Korea/02/2007, and A/canine/Korea/03/2007) were isolated from dogs exhibiting severe respiratory disease. To determine whether the novel canine influenza virus of avian origin was transmitted among dogs, we experimentally infected beagles with this influenza virus (H3N2) isolate. The beagles shed virus through nasal excretion, seroconverted, and became ill with severe necrotizing tracheobronchitis and bronchioalveolitis with accompanying clinical signs (e.g., high fever). Consistent with histologic observation of lung lesions, large amounts of avian influenza virus binding receptor (SAalpha 2,3-gal) were identified in canine tracheal, bronchial, and bronchiolar epithelial cells, which suggests potential for direct transmission of avian influenza virus (H3N2) from poultry to dogs. Our data provide evidence that dogs may play a role in interspecies transmission and spread of influenza virus.     

北京市甲型H1N1流感病毒病原学监测分析

目的 分析北京市2009年5-12月甲型H1N1流感病毒检测结果,探讨流感大流行时期甲型H1N1流感病原流行病学特征.方法 2009年5月1日至2009年12月27日,共采集101 852份咽拭子样本,北京市传染病网络实验室利用荧光定量PCR方法检测,并做统计分析.结果 101 852份检测样本中,甲型H1N1流感病毒核酸阳性9843份,总阳性率为9.66%,其中5-6月阳性率为2.85%,7-8月阳性率为3.32%,9-10月阳性率为8.35%,11月阳性率为29.67%,12月阳性率为24.33%.可疑病例排查阳性率为8.40%,病例密切接触者阳性率为4.75%,门诊流感样病例(ILI)阳性率为11.46%,聚集性发热病例及其他病例阳性率为7.33%.年龄分布以5～14岁和15～24岁年龄段为主,男女性别构成比为1.5:1.结论 北京市2009年5-11月甲型H1N1流感病毒感染呈持续上升,12月呈下降趋势,具有一定的流行病学特征.     

吉林省2018-2020年甲型H3N2亚型流感病毒耐药基因分析

目的掌握2018-2020年吉林省内H3N2亚型流感流行株对金刚烷胺类药物以及神经氨酸酶抑制剂类药物的耐药情况,为流感的临床治疗及预防控制提供参考依据。方法选取甲型H3N2亚型流感毒株34株,对M2和NA基因进行PCR扩增,测序后对耐药位点进行分析。结果 2018-2020年吉林省分离到流感毒株981株,其中甲型流感病毒毒株934株,乙型流感毒株47株。在分离到的甲型流感病毒毒株中,57.49%为H1N1pdm亚型毒株,39.61%为H3N2亚型毒株。对34株H3N2亚型流感病毒测序结果显示M2基因S31N耐药位点上发生了突变;在NA耐药相关基因位点E119V、Q136K、D151A、I222V、H274Y、R292K、N294S均未发生突变。结论吉林省2018-2020年以甲型流感流行为主。34株甲型H3N2亚型流感病毒均对金刚烷胺类药物耐药,但仍对神经氨酸酶抑制剂敏感。     

人感染新型H10N8禽流感病毒基因特征检测分析

目的 了解新型H10N8禽流感病毒基因进化特征,分析血凝素（HA）及神经氨酸酶（NA）关键氨基酸位点变异。方法 2013年12月江西省发现首例人感染新型H10N8禽流感病毒病例,分析其病毒基因核苷酸及氨基酸变异。结果 新型H10N8禽流感病毒[（A/Jiangxi-Donghu/346/2013（H10N8）,JX346）]HA基因与A/duck/Hunan/S11205/2012（H10N3）同源性为97.0%,NA基因与A/mallard/Korea/1041/2010（H10N8）的同源性为98.8%,6个内部基因与江西分离的H9N2病毒同源性≥99.0%;JX346的HA的氨基酸裂解位点为PELIQGR↓G,存在5个糖基化位点,在其130环处存在突变为A135T、K137R和S138A;NA存在7个糖基化位点,其抗原决定簇有3个氨基酸位点变异,S199A、A331S和K431N;HA有2个正向选择位点（119N,261I）,NA有1个正向选择位点（263V）。结论 新型H10N8禽流感病毒可能由H10N3、H10N8及H9N2禽流感病毒重排产生的一种低致病性禽流感病毒,其关键氨基酸位点的突变可能是人易感染的原因。