IL-9基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的比较系统性红斑狼疮患者（systemic lupus erythematosus,SLE）和正常对照者白细胞介素9（in-terleukin 9,IL-9）基因的2个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点（rs1859430,rs2069868）的等位基因的差异以及基因型频率的差异,从而探讨IL-9基因单核苷酸多态性与SLE的相关性。方法采用病例对照的研究,应用TaqMan基因分型技术,检测研究对象的基因单核苷酸多态性。结果两个SNP位点（rs1859430,rs2069868）的等位基因和基因型频率在正常对照组和SLE患者组的差异均无统计学意义（均有P>0.05）,狼疮肾炎患者组（lupus nephritis,LN）和非狼疮肾炎患者组（non-lupus nephritis,Non-LN）的分布差异均无统计学意义（均有P>0.05）。结论未发现IL-9基因的rs1859430和rs2069868位点的多态性与中国汉族人群的易感性有关。     

IL-6基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的探讨白细胞介素（interleukin,IL）6单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）（rs1800796）与系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）的易感性。方法选取SLE患者666例作为病例组,年龄、性别匹配的569例正常人作为对照组,采用TaqMan基因分型技术检测rs1800796基因型频率。结果 Rs1800796 SNP的基因型（CC,CG和GG）频率和等位基因（C和G）频率在SLE患者和对照间差异均无统计学意义（均有P>0.05）。Rs1800796与SLE临床表现的关联性分析发现,C等位基因频率在伴有浆膜炎的SLE患者中低于不伴有浆膜炎的SLE患者（P=0.019）。但C等位基因频率的分布在是否表现有颧部红斑、盘状红斑、光敏感、口腔溃疡、关节炎及狼疮肾炎的SLE病人间差异均无统计学意义（均有P>0.05）。结论尚未发现IL-6rs1800796在中国汉族人群与SLE遗传易感性有关。Rs1800796 C等位基因可能对SLE病人并发浆膜炎起保护作用。     

IL-6基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的探讨白细胞介素（interleukin,IL）6单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）（rs1800796）与系统性红斑狼疮（systemic lupus erythematosus,SLE）的易感性。方法选取SLE患者666例作为病例组,年龄、性别匹配的569例正常人作为对照组,采用TaqMan基因分型技术检测rs1800796基因型频率。结果 Rs1800796 SNP的基因型（CC,CG和GG）频率和等位基因（C和G）频率在SLE患者和对照间差异均无统计学意义（均有P〉0.05）。Rs1800796与SLE临床表现的关联性分析发现,C等位基因频率在伴有浆膜炎的SLE患者中低于不伴有浆膜炎的SLE患者（P=0.019）。但C等位基因频率的分布在是否表现有颧部红斑、盘状红斑、光敏感、口腔溃疡、关节炎及狼疮肾炎的SLE病人间差异均无统计学意义（均有P〉0.05）。结论尚未发现IL-6rs1800796在中国汉族人群与SLE遗传易感性有关。Rs1800796 C等位基因可能对SLE病人并发浆膜炎起保护作用。     

脂联素基因多态性与妊娠期子痫前期遗传易感性的相关性分析

目的探讨脂联素(ADIPOQ)基因多态性与妊娠期子痫前期遗传易感性的相关性,为临床诊治提供参考依据。方法分别选择86例妊娠期子痫前期患者(观察组)和50例健康孕妇(对照组)为研究对象,采用多聚酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测ADIPOQ rs1501299基因分型和多态性。观察组间差异,分析ADIPOQ rs1501299基因分型与妊娠期子痫前期易感性的相关性。结果两组ADIPOQ rs1501299基因分型和等位基因分布差异无统计学意义(均P0.05),妊娠期子痫前期不同分度和年龄之间ADIPOQ rs1501299基因分型和等位基因分布差异亦无统计学意义(均P0.05)。Logistic回归分析显示ADIPOQ rs1501299位点加性模型和隐性模型下TT基因携带者发生妊娠期子痫前期风险较高(P0.05)。结论加性模型和隐性模型下ADIPOQ rs1501299位点多态性与妊娠期子痫前期发病有关,携带TT基因型女性是妊娠期子痫前期易感性人群。     

Sp110基因rs1135791、rs722555多态性与结核病的相关性研究

[目的]研究Sp110基因rs1135791、rs722555多态性与肺结核易感性的关系。[方法]采用病例对照研究，选取重庆地区100例肺结核患者和106例健康对照，运用嵌套式等位基固特异性引物PCR技术检测Sp110基因rs1135791C／T位点和rs722555A／G位点基因型，运用X＾2检验分析其基因型频率和等位基因频率与肺结核的相关性。[结果]病例组rs1135791CT基因型、C等位基因频率均高于对照组．差异有统计学意义（P〈0．05），OR值分别为1．9795和1．6951；病例组rs722555GG基因型、G等位基因颊率均高于对照组，差异有统计学意义（P〈0．05）、DR值分别为2．0235和1．5874。[结论]Sp110基因rs1135791、rs722555多态性可能是重庆地区汉族人群肺结核遗传易感性的危险因素。     

Nogo基因多态性与鼻咽癌相关性的病例对照研究

目的 探讨Nogo基因rs2255393和rs968998多态性与鼻咽癌（nasopharyngeal carcinoma,NPC）易感性关系。方法 SNaPshot技术和DNA测序法检测276例NPC患者与276例健康对照者的rs2255393和rs968998基因型。用统计学分析两组基因型、等位基因与NPC易感性的关系。结果 rs968998位点基因型及等位基因在两组中比较差异均无统计学意义（均有P>0.05）。但rs2255393位点TT基因型（OR=0.58,95% CI:0.34~0.97,P=0.039）和显性模型（AA+TA）（OR=0.62,95% CI:0.44~0.87,P=0.006）在NPC组和对照组中的分布差异有统计学意义。此外,T等位基因在NPC组的频率低于对照组,分布差异也有统计学意义（OR=0.72,95% CI:0.56~0.92,P=0.009）。而rs2255393多态性和NPC患者临床分期,淋巴转移和远处转移比较,差异均无统计学意义（均有P>0.05）。结论 Nogo基因rs2255393位点多态性与NPC发病风险存在关联,但与临床肿瘤分期无关。     

HLA—DM基因遗传多态性对系统性红斑狼疮易感性的影响

目的：探索HLA－DM等位基因频率与基因型分布对系统性红斑狼疮（SLE）易感性的影响。方法：用多聚酶链反应－限制性片断长度多态性（PCR－RFLP）确定DM的基因型，用病例对照研究的方法探索DM与SLE的关联性。结果：检测到的7种DMA与DMB等位基因和42例种单体型在SLE线与正常对照组分布一致。DMB*0102／0103基因型在对照组的分布频率明显高于SLE组（P＜0．05），但校正后差异无显性，其余13种基因在两组差异均无显意义。结论：HLA－DM基因的遗传多态性对SLE的发病没有直接影响。     

IL-4基因多态性与HBV遗传易感性的研究

目的 探讨白介素4(interleukin-4,IL-4)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与皖汉族人群乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)遗传易感性的关系.方法 采用病例对照研究,501位慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者和301位急性自限性HBV感染者分别组成病例组和对照组;采用多重单碱基延伸SNP分型技术(Multiplex SNaPshot),检测两组人群的IL-4基因rs2227284G/T、rs2243283C/G和rs2243288A/G 3个标签SNPs位点的单核苷酸多态性,分析两组间的等位基因频率、单体型频率、基因型是否存在统计学差异.结果 IL-4基因3个多态位点的基因型频率在两组间差异均无统计学意义(均有P＞0.05);IL-4基因3个态位点最小等位基因及其频率在两组间差异均无统计学意义(均有P ＞0.05);4个单体型GCA、TCA、TCG及TGG两组间差异均无统计学意义(均有P＞0.05).结论 皖汉族人群中IL-4基因的3个tagSNPs(rs2227284,rs2243283和rs2243288)位点的基因多态性与HBV感染的基因易感性可能无相关性.     

基质金属蛋白酶-3基因多态性与儿童大骨节病关联分析

目的：探讨基质金属蛋白酶-3（MMP-3）基因多态性在儿童大骨节病（KBD）发病中的作用。方法收集35例KBD患儿（病例组）和84例健康儿童（对照组）全血并提取全血基因组DNA,应用Sequenom assARRAY RS1000分型技术对MMP-3上8个单核苷酸多态性（SNP）位点进行基因分型,比较病例组与对照组等位基因和基因型的分布差异,用非条件Logistics回归模型衡量各等位基因在3种遗传模型（显性、隐形和加和模型）下的效益。结果 rs679620等位基因在两组儿童中分布有显著性差异（χ2＝4．18,P＜0．05）,2个SNP位点rs679620、rs591058与KBD显著相关（χ2值分别为9．43和6．65,均P＜0．05）。在隐性遗传模式下,rs679620基因型T/T和rs591058基因型T/T与儿童KBD的高风险相关联,OR（95％CI）分别为5．05（1．98～12．91）、3．68（1．40～9．67）。结论 MMP-3在儿童KBD发病中起重要作用,rs679620基因型T/T和rs591058基因型T/T与儿童KBD易感性有关。     

张家口地区白细胞介素-28B基因单核苷酸多态性与肝细胞癌的相关性研究

目的 探讨白细胞介素-28B（IL-28B）基因rs12979860位点单核苷酸多态性与张家口居民肝细胞癌遗传易感性的关联及与环境因素间的交互作用。方法 采用以医院为基础1[DK]∶1配比病例对照研究方法,选取肝细胞癌患者218例作为观察组,同期健康体检者218例作为对照组,应用改良多重高温连接酶检测反应技术检测两组IL-28B基因rs12979860位点单核苷酸多态性。采用二分类logistic回归模型分析IL-28B基因rs12979860位点单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性的关系,并探究rs12979860位点单核苷酸多态性与环境因素的交互作用对肝细胞癌发病影响。结果 对照组与观察组间IL-28B基因rs12979860位点基因型分布差异无统计学意义（P>0.05）。IL-28B基因rs12979860位点T等位基因可增加肝细胞癌发病风险（P<0.05）。分层分析发现,在饮酒、乙型肝炎病毒（HBV）及丙型肝炎病毒（HCV）感染人群中rs12979860位点TT基因型相比TC+CC基因型,肝细胞癌发病风险升高,差异具有统计学意义（P<0.05）。交互作用分析示,IL-28B基因rs12979860位点单核苷酸多态性与饮酒、HBV及HCV感染均存在正交互作用。结论 在张家口地区,IL-28B基因rs12979860位点单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性明显相关,并与饮酒、HBV及HCV感染存在正交互作用,可增加肝细胞癌发病风险。     

锌指蛋白基因IKZF3多态性与中国长江以南汉族人群系统性红斑狼疮的病例对照研究

目的 研究IKZF3基因多态性与中国长江以南汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）易感性间的关联性。方法 采用病例对照研究（SLE 213例,正常健康对照者234例）,应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测IKZF3基因多态性。在多个遗传模型（加性、隐性、显性）下,利用多因素logistic回归模型和广义多因子降维模型（GMDR）,分析基因与疾病易感性、疾病临床表型之间的关系,以及基因-基因交互作用,并进行生物信息学分析。结果 IKZF3基因rs114509391位点CA基因型的个体较AA基因型的个体患SLE的风险下降（OR=0.14,95%CI：0.03～0.56,P=0.006）;且在显性模型仍存在统计学意义（OR=0.26,95%CI：0.09～0.81,P=0.02）。分层分析提示rs9635726和rs9909593两位点可能与SLE发病也存在关联。表型研究显示,rs907091位点与肾脏损害（加性模型：OR=0.59,95%CI：0.35～0.98,P=0.043）、抗SSB抗体阳性（显性模型：OR=0.41,95%CI：0.18～0.96,P=0.040）相关;rs9909593位点GG、GA基因型的患者出现抗SSB抗体阳性的风险也较AA基因型患者下降（OR=0.37,95%CI：0.16～0.88,P=0.025）。生物信息学分析提示研究位点为功能位点。结论 IKZF3基因rs114509391、rs9635726和rs9909593可能与SLE易感性相关,rs9909593、rs907091与SLE的临床表型相关。     

The association between SNPs and hepatitis B virus related acute-on-chronic liver failure

ObjectiveThis study intended to investigate the association between ten single nucleotide polymorphisms (rs1143623, rs12692386, rs1799983, rs2297518, rs2910164, rs3129859, rs4251961, rs4846085, rs641738, rs873457) with susceptibility and prognosis of hepatitis B related acute-on-chronic liver failure (HBV-ACLF).MethodsThis is a hospital-based case-control study included 274 patients with HBV-ACLF and 534 patients with chronic hepatitis B. The patients who were successfully followed were divided into the survival group and the death group according to the clinical outcome during the hospitalization and 90 days after discharge. The ten SNPs were genotyped in all subjects by using imLDR. Genotype, allele frequency, dominant model, recessive model and codominant model were constructed to investigate the association between single nucleotide polymorphisms with susceptibility and prognosis of HBV-ACLF.ResultsThe genotype distribution of rs1143623 was statistically different between the two groups (P = 0.04), but the allele frequency was not statistically significant (P = 0.44). GC and GG + CG genotypes at rs1143623 reduced the risk of HBV-ACLF. There were only two GG and GT genotypes in rs1799983 in our study, and the genotype and allele frequency were statistically different between the death group and the survival group (P = 0.027, P = 0.023). Patients with T allele may reduce the risk of death in patients with HBV-ACLF. The genotype and allele frequency of rs2297518 showed no significant difference. In dominant models, patients with GA + AA genotypes at rs2297518 had a reduced risk of death.     

易感基因与环境因素的交互作用对女性系统性红斑狼疮发病的影响

目的 探讨中国长江以南汉族女性系统性红斑狼疮(SLE)患者细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)及程序性细胞凋亡-1(PDCD-1)基因多态与环境因素的交互作用.方法 采用单纯病例研究设计,收集258例符合条件的患者,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)技术检测CTLA-4与PDCD-1基因的单核苷酸多态性(SNPs),分别在显性、隐性、相加及相乘遗传模式下,选择Poisson对数线性模型估计基因-基因、基因-环境交互作用.结果 在PDCD-1基因的PD1.6位点,隐性及相加遗传模式下均存在GG基因型与紫外线暴露史的交互作用,OR值分别为3.714(95%CI:1.235～11.179)和3.199(95% CI:1.023～10.004).在CTLA-4-1722位点,显性遗传模式下,存在TT或TC基因型与紫外线暴露史的交互作用,OR值为4.874(95%CI:1.119～21.242);相乘遗传模式下存在PDCD-1基因的T等位基因与紫外线暴露史的交互作用,OR值为1.470(95%CI:1.047～2.065);而在相加遗传模式下,TT和TC基因型分别与紫外线暴露史存在交互作用,OR值分别为4.744(95% CI:1.037～21.737)和4.973(95% CI:1.110～22.287).结论 在中国长江以南汉族女性SLE患者中,紫外线暴露史分别与CTLA-4及PDCD-1基因多态存在交互作用,提示基因-环境交互作用可能与SLE有关.     

肺结核抗结核药物致肝损伤患者HMGB1基因多态性

目的探讨肺结核抗结核药物致肝损伤患者HMGB1基因多态性。方法选择2016年8月-2019年8月中南大学湘雅医院附属海口医院滨江分院收治的肺结核患者200例,发展成ATDH的患者纳入ATDH组(n=79),未发展成ATDH的患者纳入非ATDH组(n=121),检测HMGB1基因单核苷酸多态性(SNPs)位点多态性,采用Logistic回归分析HMGB1多态性位点与ATDH的关系。结果ATDH组HMGB1基因rs1045411位点GG、GA、AA基因型分布频率和G、A等位基因频率与非ATDH组比较,差异有统计学意义(P<0.05),rs1412125、rs1360485以及rs2249825位点基因型分布和等位基因频率与非ATDH组比较,均无统计学差异;在共显性、显性、隐性模式下,ATDH组HMGB1基因rs1045411位点基因型分布与非ATDH组比较,差异有统计学意义(P<0.05),与GG基因型比较,GA和AA基因型与肺结核易感性有关,在超显性模式下,ATDH组HMGB1基因rs1045411位点基因型分布与非ATDH组比较,无统计学差异,而在超显性、共显性、显性以及隐性模式下,rs1412125、rs1360485以及rs2249825位点基因型分布与非ATDH组比较,均无统计学差异;rs1045411位点基因多态性与ATDH的发生存在相关性,且突变型诱发ATDH可能性更大,而rs1412125、rs1360485、rs2249825位点基因多态性与ATDH发生风险无关。结论HMGB1基因为ATDH的易感基因,其rs1045411位点多态性与ATDH的发生密切相关,其中突变型发生ATDH风险升高。     

CC趋化因子细胞受体5基因多态性与慢性丙肝干扰素疗效关联性的研究

目的 探索CC趋化因子细胞受体5（C-C chemokine receptor type 5,CCR5）基因多态性与慢性丙型肝炎（chronic hepatitis C,CHC）患者治疗效果的关联,为指导今后丙肝治疗方案及预后评价提供依据。方法 本研究共纳入CHC患者348例,所有患者均接受标准干扰素治疗48周并随访24周。利用Taqman-MGB探针技术,对CCR5基因上rs10800874和rs746492位点进行基因分型,分析其多态性与患者治疗效果的关系。结果 经Logistic回归分析结果显示,与rs10800874 TT基因型的CHC携带者相比,TG（调整OR=1.87,95%CI=1.08~3.25,P=0.026）和GG（调整OR=1.96,95%CI=1.01~3.82,P=0.048）基因型的携带患者更容易获得持续性病毒学应答（sustained virological response,SVR）。分层分析发现,在女性、高葡萄糖水平以及低甲胎蛋白水平亚组中,携带rs10800874-G等位基因与SVR之间的仍然显著相关（所有P<0.05）。结论 CCR5 rs10800874-G等位基因是CHC患者接受标准干扰素治疗获得SVR的保护因素。     

rs2507800、rs4880、rs1799895单核苷酸多态性与中国东北地区汉族妇女子痫前期相关性研究

目的:探讨Ang-1 rs2507800、SOD2 rs4880及SOD3 rs1799895多态性与中国东北地区汉族妇女子痫前期(PE)是否存在关联。方法:采用飞行时间质谱对181例PE患者(病例组)及203例健康孕妇(对照组)的上述3个位点进行分型,分型结果采用SPSS12.0软件进行统计分析。结果:病例组与对照组rs2507800、rs4880、rs1799895等位基因频率和基因型频率均无统计学差异(P0.05)。对rs2507800、rs4880分别在显性、隐性模型下进行分析,两组仍无统计学差异(P0.05)。结论:rs2507800、rs4880、rs1799895多态性与PE不相关。     

IL-2（rs6822844）和IL-2Ra（rs2104286）单核苷酸多态性与原因不明复发性流产的相关性研究

目的：探讨白细胞介素2基因（IL-2）及其受体α（IL-2Rα）单核苷酸多态性（SNPs）与原因不明复发性流产（URSA）的相关性。方法：采用病例对照研究,应用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）技术,对中国浙江地区145例URSA患者及220例健康对照IL-2（rs6822844）G/T及IL-2Rα（rs2104286）A/G进行分析。结果：URSA组IL-2Rα（rs2104286）AA基因型及A等位基因频率均高于对照组,差异均有统计学意义（P＜0.05）。A等位基因携带者URSA患病风险是G等位基因携带者的2倍（OR=2.06,95%CI：1.34～3.16,P=0.001）,AA基因型较AG+GG基因型URSA患病风险增加约1倍（OR=2.27,95%CI：1.40～3.68,P=0.001）。URSA组及对照组IL-2（rs6822844）GG基因型频率均为100%,差异无统计学意义（P＞0.05）。结论：IL-2Rα（rs2104286）A等位基因可能是浙江地区URSA的遗传易感基因,IL-2（rs6822844）基因多态性与浙江地区URSA无相关性。     

Polymorphisms in sodium taurocholate cotransporting polypeptide are not associated with hepatitis B virus clearance in Chinese Tibetans and Uygurs

An association between polymorphisms in the sodium taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) and the natural course of hepatitis B virus (HBV) infection in the Chinese Han population has been noted. However, it is not known whether these polymorphisms are associated with the risk of developing chronic HBV infection in other racial or ethnic populations. Accordingly, we conducted a candidate single nucleotide polymorphism (SNP) association study in Tibetan and Uygur HBV-infected patients. A total of 1302 subjects including 871 Tibetans and 431 Uygurs were recruited. According to their serological and clinical characteristics, each ethnic group was divided into two groups comprising spontaneous clearance individuals and persistently infected patients. Three SNPs were genotyped by a high resolution melting curve methodology. Among the SNPs, rs2296651 exhibited a minor allele frequency of < 0.01. The frequency of allele A at rs4646287 was much higher in Tibetans (9.4% for Tibetans and 4.6% for Uygurs, p < 0.001) than in Uygurs, but the frequency of allele A at rs7154439 was the opposite (15.7% for Tibetans and 20.5% for Uygurs, p = 0.002). Irrespective of race, no significant differences in the frequency distributions of the three SNP alleles or genotypes were observed between the case and clearance groups. Moreover, none of the NTCP haplotypes were statistically different between the two groups. Data from the Tibetan patients could be grouped by HBeAg status, viral load and HBV genotype; however, no significant differences were found in the SNP genotype distribution for each characteristic. In conclusion, the NTCP polymorphisms we identified tended to be ethnicity-dependent. For Tibetans and Uygurs, no association of the three SNPs (rs7154439, rs4646287 and rs2296651) and their haplotypes with HBV chronicity was observed. Examination of SNPs in NTCP for their specific associations with the course of HBV infection in other ethnic minority groups is now required.     

中国老年人HDAC9和PPP3CA基因多态性与衰弱的关联

  目的  探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9, HDAC9) rs2074633及钙调神经磷酸酶催化亚基A(calcineurin catalytic subunit A, PPP3CA) rs17030795的多态性与中国老年人衰弱发生的关联。  方法  本研究纳入衰弱组665例,对照组3 388例。基于基因型频率及五种遗传模型(共显性、加性、显性、隐性和超显性),评估rs2074633及rs17030795多态性与衰弱之间的关联。  结果  在共显性模型中,与携带rs2074633 TT基因型相比,携带TC型(OR=1.99,95% CI: 1.36~2.90)、CC型(OR=2.15,95% CI: 1.48~3.13)的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.47)、显性(OR=2.07,95% CI: 1.44~2.98)及隐形模型(OR=1.21,95% CI: 1.01~1.45)中rs2074633多态性均增加衰弱的发生风险;在共显性模型中,与携带rs17030795 AA基因型相比,携带AG(OR=1.72,95% CI: 1.19~2.51)、GG(OR=1.98,95% CI: 1.37~2.87)型的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.48)、显性(OR=1.85,95% CI: 1.29~2.66)及隐性(OR=1.25,95% CI: 1.04~1.50)中rs17030795多态性均增加衰弱的发生风险。   结论  HDAC9 rs2074633及PPP3CA rs17030795多态性与中国老年人衰弱发生风险有关。