乳腺癌中GFRA1表达临床意义的生物信息学分析

  目的  通过生物信息学的方法分析胶质细胞系源性神经营养因子受体1（glial cell line derived neurotrophic factor α1,GFRA1）在乳腺癌组织中表达情况及其临床意义。  方法  全面检索GEO、TCGA、Oncomine、Kmplot数据库分析GFRA1在乳腺癌中表达情况,分析其预测化疗、内分泌治疗疗效和预后的价值。  结果  GFRA1在不同类型乳腺癌组织中高表达（P < 0.05）,与ER（r= 0.66）、PR（r=0.22）表达水平呈正相关,与HER-2（r=-0.09）、Ki-67（r=-0.12）表达水平呈负相关。GFRA1低表达乳腺癌患者对他莫昔芬和多柔比星易产生耐药。GFRA1表达水平与乳腺癌患者预后显著相关（P < 0.05）,GFRA1高表达患者总生存率、无复发生存率高于低表达患者。  结论  GFRA1在乳腺癌组织中高表达,低表达乳腺癌患者对他莫昔芬和多柔比星耐药,且预后较差。      

IQGAP1在乳腺癌中的表达及意义

  目的  探讨IQGAP1（IQ motif containing GTPase activating protein 1）在乳腺癌组织中的表达及意义。  方法  采用免疫组织化学链霉菌抗生物素蛋白-过氧化物酶（S-P法）染色法检测IQGAP1在乳腺癌组织及癌旁组织各110例中的蛋白表达水平。在正常乳腺上皮细胞系MCF-10A和乳腺癌细胞系MCF-7中开展IQGAP1表达调控实验。  结果  IQGAP1在乳腺癌组织中的表达高于癌旁正常乳腺组织（P=4.23×10-6）。IQGAP1的表达与浸润性导管癌的肿瘤大小（P=0.006）相关,在肿瘤>2 cm组明显高于肿瘤≤2 cm组。未发现与淋巴结转移（P=0.870）,临床分期（P=0.278）,ER状态（P=0.412）和PR状态（P=0.248）相关。IQGAP1高表达与乳腺癌术后无病生存时间（P=0.008）和总生存时间（P=0.029）相关。在乳腺癌细胞系MCF-7中,IQGAP1降低导致细胞增殖活性显著下降。  结论  IQGAP1可能在乳腺癌的发生发展过程中发挥重要作用。      

半胱氨酰白三烯受体在乳腺癌组织中的表达及意义

  目的  通过临床病例的研究, 检测CysLT1R和CysLT2R在乳腺癌中的表达情况, 并分析CysLT1R和CysLT2R与乳腺癌患者病理特征及预后的关系。  方法  采用实时荧光定量PCR方法, 从mRNA水平上检测90例原发乳腺癌组织和30例匹配的癌旁组织中CysLT1R和CysLT2R基因的表达量, 分析二者与临床病理学参数之间的关系, 以及与乳腺癌患者预后的关系。  结果  乳腺癌组织CysLT1R基因的表达明显高于癌旁组织, 乳腺癌组织CysLT2R基因的表达明显低于癌旁组织, 两者差异具有统计学意义（P < 0.01）。乳腺癌组织中CysLT1R的表达程度与肿瘤大小、组织学类型、淋巴结转移、TNM分期的表达呈正相关（P < 0.05）, CysLT2R的表达程度与肿瘤大小、组织学类型、淋巴结转移的表达呈负相关（P < 0.05）。Kaplan-Meier生存分析结果显示, CysLT1R mRNA高表达者的总的5年生存率显著低于低表达水平者（P=0.035）, CysLT2R mRNA高表达者的总的5年生存率显著高于低表达水平者（P=0.025）。  结论  CysLT1R和CysLT2R可作为乳腺癌判断预后的分子标志物。      

GPER1在EGFR突变的肺腺癌中的表达

  目的  探讨肺腺癌中表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor,EGFR）与G蛋白偶联雌激素受体1（G-protein cou? pled estrogen receptor 1,GPER1）/GPR30之间的关系。  方法  采用免疫组织化学方法检测83例术后肺腺癌组织样本中GPER1的表达,同时收集患者的临床病理资料,采用二代基因测序方法检测相应组织中EGFR基因突变状态,并分析GPER1与EGFR之间的相关性,Western blot检测EGFR野生型肺腺癌细胞A549,EGFR突变型肺腺癌细胞PC-9以及使用吉非替尼处理的PC-9细胞的GPER1表达水平。  结果  GPER1的阳性表达与患者性别、年龄、肿瘤大小、吸烟、分化程度无显著性差异（均P > 0.05）;EGFR突变与肿瘤TNM分期无显著性差异（P=0.542）;GPER1阳性表达与EGFR突变呈正相关（P=0.003）;GPER1在Ⅲ、Ⅳ期肺腺癌中较Ⅰ、Ⅱ期高表达（P=0.008）;在PC-9细胞中使用吉非替尼抑制EGFR活性引起GPER1表达下调。  结论  GPER1在EGFR基因突变型的肺腺癌中的表达高于EGFR野生型肺腺癌,GPER1的表达可能受EGFR活性调控。      

乳腺浸润性微乳头状癌组织β1 integrin及Rac1和RhoA表达的研究

  目的  探讨极性蛋白β1 integrin及Rac1和RhoA在乳腺浸润性微乳头状癌（invasive micropapillary carcinoma,IMPC）组织中的表达及其意义。  方法  采用免疫组织化学法检测天津医科大学肿瘤医院自2007年1月至2008年12月89例乳腺IMPC患者组织中β1 integrin、Rac1及RhoA的表达,并选取该院同期诊断的90例乳腺浸润性导管癌非特殊型（invasive ductal carcinoma-not other? wise specified,IDC-NOS）病例作为对照,分析3种蛋白间及其与临床病理学特征之间的关系。  结果  IMPC组织中β1 integrin及Rac1蛋白高表达率分别为78.7%（70/89）和76.4%（68/89）,显著高于IDC-NOS组织的63.3%（57/90）和54.4%（49/90）,差异均具有统计学意义（P < 0.05）;IMPC组织中RhoA阳性表达率为68.5%（61/89）,显著高于IDC-NOS组织的44.4%（40/90）,差异亦具有统计学意义（P=0.001）。IMPC组织中β1 integrin与Rac1表达均与淋巴结转移呈正相关（P < 0.05）,且二者之间呈正相关（P=0.006）;RhoA表达与淋巴结转移、ER及PR呈正相关（P < 0.05）,但与β1 integrin及Rac1的表达无显著相关性（P>0.05）。  结论  极性蛋白β1 integrin、Rac1及RhoA在乳腺IMPC组织中过表达,提示其可能均在IMPC的高转移中发挥重要作用,且可能成为靶向治疗研究的新靶点。      

乳腺癌组织BAG-1表达及其与临床病理因素相关性的分析

目的:进一步了解BAG-1在乳腺癌组织中的表达及其与乳腺癌临床病理因素的相关性。方法:利用组织芯片技术以及DAKOEnVision免疫组织化学方法对乳腺癌组织及其对应的癌旁组织和正常组织中BAG-1进行检测,同时分析BAG-1与乳腺癌临床病理因素的相关性。结果:BAG-1经免疫组化DA-KOEnVision染色呈棕黄色颗粒状,BAG-1表达主要定位于阳性细胞的胞质和胞核中。BAG-1在癌组织中的阳性表达率高于癌旁组织和正常组织,P均<0.05。BAG-1的表达与乳腺癌肿块大小、分级及腋窝淋巴结转移无相关性;但与乳腺癌的ER、PR、5年生存率表达呈正相关,与HER-2表达呈负相关,P均<0.01。结论:检测乳腺癌组织中BAG-1的表达,对评估乳腺癌的临床特性及预后有一定的意义。     

Sipa1在胃癌组织中的表达及临床意义

  目的  探讨Sipa1基因（signal-induced proliferation-associated gene 1）在胃癌组织中的表达水平及其与临床病理、预后之间的关系。  方法  分别应用实时荧光定量PCR方法和Western blot法检测43例新鲜胃癌组织及相应癌旁正常组织中Sipa1 mRNA及蛋白的表达量。应用免疫组织化学SP染色法检测122例胃癌和64例正常胃黏膜石蜡组织中Sipa1蛋白的表达水平。  结果  新鲜胃癌组织中Sipa1 mRNA（ΔCt:7.94±1.12）及蛋白（0.305 6±0.108 4）的表达水平较癌旁正常组织（ΔCt:0.531 9±0.072 0;0.531 9±0.072 0）显著下降。胃癌石蜡组织中Sipa1蛋白表达阳性率36.1%较正常胃黏膜石蜡组织中阳性率73.4%低,二者之间差异有统计学意义（P < 0.01）。Sipa1蛋白表达与胃癌分化程度、淋巴结转移、浸润深度、临床分期有关（P < 0.05）,与年龄、性别、肿瘤大小、部位等表达无关（P>0.05）。Sipa1蛋白阴性表达患者比阳性表达患者的5年生存率显著降低（P < 0.01）。  结论  Sipa1基因的表达与胃癌的生物学行为关系密切,对判断预后有参考作用。      

TACC3 mRNA及蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义

  目的  探讨转录相关酸性卷曲蛋白3（transforming acidic coiled-coil proteins, TACC3）mRNA和蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义。  方法  收集手术切除乳腺癌及癌旁正常组织标本各85例, 进行免疫组织化学染色、RT-PCR、Western blot的检测。  结果  乳腺癌组织中的TACC3 mRNA和蛋白的表达水平高于癌旁组织（P < 0.05）, 且TACC3的表达与乳腺癌的分化程度、肿瘤直径、淋巴结的转移、P53表达相关, 而与患者的年龄、是否绝经、ER、PR、Ki-67、HER-2等无明显相关。  结论  TACC3在乳腺癌中的表达程度与临床病理特征有关, 在乳腺癌发生发展过程中可能具有一定的作用。      

乳腺癌外周血标记物NPY1R的检测及临床意义

  目的  鉴定一种新的检测乳腺癌循环癌细胞的肿瘤标记物NPY1R(neuropeptide Y receptor Y1)。探讨NPY1R在乳腺癌外周血中的表达水平及其与临床病理学特征的关系。  方法  通过肿瘤基因组解剖计划(cancer genome anatomy project, CGAP)数据库的数字基因表达演示工具(digital gene expression displayer, DGED), 发现了一种新的乳腺癌外周血标记物NPY1R。采用实时半定量巢式PCR技术, 检测了142例乳腺癌和60例正常人外周血中NPY1R的表达水平, 并进一步分析了NPY1R表达与乳腺癌临床病理特征的相关性。对131例患者随访38个月, 观察NPY1R的表达对乳腺癌患者生存时间的影响。  结果  证实NPY1R在142例乳腺癌外周血中的表达水平明显高于正常组(P < 0.01)。并且, NPY1R在外周血中的表达水平与临床分期、淋巴结转移和ER、PR、HER2具有相关性(P < 0.05)。131例随访患者中, NPY1R表达阳性组的生存率显著低于阴性组(P < 0.01)。  结论  NPY1R是外周血循环癌细胞一种新的肿瘤标记物, 可作为判断乳腺癌转移和预后的评估指标。      

结直肠癌中KRAS基因突变与SETDB1表达的相关性及临床意义

  目的  探讨KRAS基因突变与SETDB1（set domain bifurcated 1）蛋白表达在结直肠癌中的临床意义及两者间的关系。  方法  收集2017年1月至2017年12月于西南医科大学附属医院住院接受诊治的122例结直肠癌患者的组织标本及病例资料,采用二代测序技术（NGS）检测KRAS基因突变情况,免疫组织化学染色检测SETDB1蛋白的表达情况。  结果  122例结直肠癌组织中KRAS基因突变率为41.8%,KRAS基因突变状态与肿瘤部位、术前血清CEA水平相关（P < 0.05）,与年龄、性别、分化程度、肿瘤大小、pT?NM分期、淋巴结转移等无关（P>0.05）。KRAS基因突变状态与SETDB1蛋白表达呈正相关（r=0.232,P=0.008）。SETDB1蛋白水平与肿瘤分化程度、大小及术前血清CEA水平相关（P < 0.05）,与年龄、性别、肿瘤部位、pTNM分期、淋巴结转移等无关（P>0.05）。  结论  SETDB1蛋白在KRAS突变型结直肠癌组织中呈现高表达,KRAS基因突变可能影响SETDB1蛋白表达。      

AIB1与上皮间质转化相关蛋白在浸润性乳腺癌中的表达及其相关性

目的 探讨浸润性乳腺癌组织中乳腺癌扩增性抗原1（AIB1）与上皮间质转化（EMT）相关蛋白的表达情况及其相关性。方法 采用免疫组织化学方法检测80例浸润性乳腺癌组织、40例癌旁正常组织、40例乳腺纤维腺瘤组织中AIB1、上皮性钙粘蛋白（E-cadherin）、神经性钙粘附蛋白（N-cadherin）的表达情况,分析其表达与临床病理特征的关系,并探讨AIB1与EMT相关蛋白表达的关系。结果 AIB1、E-cadherin和N-cadherin在浸润性乳腺癌组织中的阳性表达率分别为47.5％、36.3％、51.3％。AIB1表达与乳腺癌淋巴结转移、分子分型有关（P＜0.05）;E-cadherin表达与组织学分级、淋巴结转移、肿块大小及TNM分期有关（P＜0.05）;N-cadherin表达与淋巴结转移、TNM分期有关（P＜0.05）。AIB1与E-cadherin表达呈负相关（r=-0.249）,与HER-2、N-cadherin表达呈正相关（r=0.243,r=0.277）;E cadherin与ER表达呈正相关（r=0.232）。结论 在浸润性乳腺癌中,AIB1及EMT相关蛋白可能与浸润性乳腺癌的发生、发展密切相关,并且AIB1可能通过调控EMT相关蛋白的表达,在乳腺癌的侵袭、转移过程中发挥重要作用。     

TFF1和TFF3在结直肠癌中的表达与临床病理特点及预后的关系

  目的  检测三叶因子1（trefoil factor,TFF1）和三叶因子3（TFF3）在结直肠癌组织、癌旁组织及转移淋巴结中的表达,评价其与肿瘤发生、转移和预后的关系。  方法  采用免疫组织化学SP法检测65例结直肠癌、30例癌旁组织、25例转移淋巴结中TFF1和TFF3的表达,分析二者表达的差异及其与临床病理特征和预后的关系。  结果  TFF1在癌旁组织、癌组织和转移淋巴结中表达逐渐增高（26.7%,70.8%,96%,两两比较均P < 0.05）。癌组织和转移淋巴结与癌旁组织比较,TFF3表达率均有降低（100% vs. 84.6%或80%,均P < 0.05）,癌组织和转移淋巴结之间差异无统计学意义（P>0.05）。TFF1在结直肠癌中的表达仅与肿瘤分化程度相关（P < 0.05）;TFF3表达与淋巴结转移及TNM分期有关（均P < 0.05）。TFF1在结直肠癌中的表达与TFF3呈负相关（P=0.014,r=-0.291）。TFF1表达水平与总生存率无相关性（P=0.639）,而TFF3表达水平与总生存率有关（P=0.045）。Cox比例风险模型单因素分析显示,浸润深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期等为影响预后的相关因素。多因素分析显示,淋巴结转移、远处转移、TNM分期和TFF3为预后的影响因素。  结论  TFF1和TFF3表达率与结直肠癌的发生、转移和预后密切相关。两者可能在结直肠癌的侵袭、转移中存在共同作用,相互影响。      

溶血磷脂酸及其受体和IL-6 IL-8在乳腺癌进展中的表达变化与意义

  目的  探讨溶血磷脂酸(lysophosphatidic acid, LPA)及其受体和IL-6与IL-8在乳腺癌进展中的表达及临床意义。  方法  采用半定量RT-PCR方法检测乳腺肿瘤组织和瘤旁组织中LPA受体的表达水平。采用LPA生化测定法和酶联免疫吸附(ELISA)法分别检测乳腺肿瘤患者和健康妇女的血浆LPA、IL-6和IL-8水平。  结果  术后复发转移乳腺癌患者血浆LPA、IL-6、IL-8的表达水平均显著高于局限期乳腺癌和良性乳腺肿瘤患者及健康妇女(P均 < 0.05);LPA1在乳腺癌组织中的表达水平显著高于良性乳腺肿瘤组织和正常乳腺组织(P < 0.05);乳腺癌患者血浆LPA水平与IL-6和IL-8水平均呈正相关(P均 < 0.01)。  结论  LPA对乳腺癌患者内源性IL-6和IL-8的表达可能具有上调作用, 检测LPA、IL-6和IL-8的表达水平对乳腺癌的转移可能有一定的预测作用, 尤其是骨转移。      

HO-1和Nrf-2在髓母细胞瘤中的表达和意义

  目的  髓母细胞瘤是儿童后颅凹常见恶性肿瘤, 本研究目的在于检测Nrf-2和HO-1在髓母细胞瘤中的表达, 并探讨其在髓母细胞瘤发生发展的意义。  方法  应用免疫组化SP法检测41例髓母细胞瘤及27例瘤旁对照脑组织中Nrf-2和HO-1的表达, 并结合研究病例的临床资料(患者性别、年龄、临床症状、肿瘤大小、肿瘤病理分型), 进行相关性分析。  结果  在髓母细胞瘤病例中, Nrf-2和HO-1的阳性表达率(分别为82.9%, 78.0%)与瘤旁对照组织的阳性表达率(分别为37.0%, 29.6%)相比明显升高, 差异具有显著统计学意义(P < 0.001), 并且二者之间呈显著正相关关系(P < 0.05)。但Nrf-2和HO-1的表达与分析的病例的临床特征无显著相关性(P > 0.05)。  结论  Nrf-2和HO-1的高表达可能在髓母细胞瘤的发生发展中发挥重要作用。      

miRNA-613在乳腺癌中的表达及作用机制

  目的  探讨乳腺癌中微小RNA (microRNA,miRNA)-613表达及作用机制。  方法  收集2017年5月至2018年5月91例于南充市中心医院手术切除的乳腺癌患者的组织标本,实时荧光定量PCR检测乳腺癌组织及癌旁组织标本、乳腺癌细胞系(MDAMB-231、MDA-MB-468、MCF-7)和正常乳腺上皮细胞系HBL-100中miRNA-613的表达水平,分析其与乳腺癌患者临床病理特征的关系。TCGA数据库分析miRNA-613与乳腺癌患者预后的关系。双荧光素酶报告实验检测miRNA-613与SOX9的3'UTR区的结合情况。将miRNA-613模拟物转染至MDA-MB-231细胞,CCK-8法和Transwell侵袭及迁移实验分别检测细胞增殖活性、侵袭和迁移能力的变化,Western blot检测细胞中SOX9、β-catenin、E-Cadherin和Vimentin蛋白的表达变化。  结果  miRNA-613在乳腺癌组织中表达明显低于癌旁组织(P < 0.05),并且miRNA-613表达与TNM分期和淋巴结转移密切相关(P < 0.05),TCGA生存数据显示miRNA-613表达与乳腺癌患者的总生存率无关(P>0.05)。乳腺癌细胞系中miRNA-613的表达明显低于正常乳腺上皮细胞系(P < 0.05),并且高侵袭转移性乳腺癌细胞系MDA-MB-231、MDA-MB-468中miRNA-613的表达明显低于低侵袭转移性乳腺癌细胞系MCF-7(P < 0.05)。双荧光素酶报告实验显示miRNA-613可与SOX9的3'UTR特异性结合。上调miRNA-613的表达能抑制MDA-MB-231细胞的增殖和侵袭迁移能力(P < 0.05),同时下调SOX9、β-catenin和Vimentin蛋白的表达(P < 0.05),并上调ECadherin蛋白的表达(P < 0.05)。  结论  在乳腺癌组织和细胞中miRNA-613异常低表达,miRNA-613可能通过调控SOX9、Wnt/β-catenin信号通路抑制乳腺癌细胞的增殖、侵袭转移及上皮间质转化。      

乳腺癌组织中EGFR、IGF-1R、HER2/neu和p53蛋白的表达及意义

目的:探讨乳腺癌组织中表皮生长因子受体(EGFR)、胰岛素样生长因子- 1 受体(IGF 1R)、HER2/neu和p53的蛋白表达状况与临床分期、病理和生存的关系。方法:用免疫组织化学SP法检测210例乳腺癌患者原发肿瘤组织和其中49 例转移淋巴结组织中的EGFR、IGF -1R 、HER2/neu和p53蛋白表达水平。结果:210 例乳腺癌原发组织中,EGFR、IGF -1R 、HER2/neu和p53的表达阳性率分别为47. 1% ( 99/210 )、40. 5% ( 85/210 )、63. 8% (134/210)和55. 7% (117/210); 49 例乳腺癌中, HER2/neu 11 例、IGF 1R 6 例、p53 和EGFR各2例,在转移淋巴结组织与原发肿瘤组织中表达程度不一致。除IGF 1R外,不同的TNM分期,EGFR、HER2/neu、p53表达阳性率差异有统计学意义,P值分别为0 .25、0. 005、0 .025和0. 01;但均与病理类型无关,P值分别为0. 002、0. 6、0. 3和0 .1。Cox模型回归分析TNM分期、病理类型、年龄、EGFR、IGF- 1R 、HER2/neu、p53、ER 和PR的表达9 个因素对生存时间影响, TNM分期、年龄和IGF 1R表达状况的增加对生存时间为危险因素,P<0 .05,OR>1。3 年生存率为87%,5 年生存率为66%,中位生存期85个月。结论:检测乳腺癌组织中EGFR、IGF -1R、HER2/neu和p53的蛋白表达对乳腺癌的诊断、指导治疗及评价预后有重要的临床意