100例乙型肝炎病毒基因分型的探讨

目的:为了解宁波及毗邻地区乙型肝炎患者HBV基因型分布、优势型与临床的相关性。方法:选择宁波及毗邻地区HBV DNA阳性的HBV感染者100例,应用基因芯片对其进行基因分型,其中7例优势基因型进行S基因序列同源性测序复核。结果:100例HBV阳性的血清标本分型率为96.0%,其中B基因型36例(37.5%),C基因型47例(48.9%),BC混合基因型11例(11.5%)及BCD混合基因型2例(2.1%),未分出型的4例。乙型肝炎感染者检出的基因型以B、C型为主;重型肝炎与肝癌组中C型检出率分别为60%和55%,明显高于其他基因型(P<0.05),B、C基因型与HBV DNA拷贝数、丙氨酸氨基转移酶水平及总胆红素在统计学上无显著差异(P>0.05)。结论:基因芯片分型方法可应用于HBV基因的分型。宁波及毗邻地区的HBV基因型以B、C为优势基因型,重型肝炎和肝癌患者检出的基因型多为C型,提示C基因型患者预后较差。     

儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型分析

目的检测温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型和Ba／Bj亚型的分布，及其与病毒复制水平的关系。方法采用实时荧光PCR技术进行HBV基因分型和HBVDNA定量，对鉴定为B基因型标本，采用PCR-RFLP结合PCR产物直接序列测定其基因亚型（Ba／Bj）。结果温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型B、C、B＋C混合型和D型分别占43．92％、53．44％、1．59％和1．06％；C基因型的HBVDNA含量与B基因型之间差异无统计学意义（P2〉0．05）；83例B基因型HBV均为Ba亚型，未发现Bj亚型。结论温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型主要为c基因型和B基因型，B基因型HBV主要为Ba亚型。     

山东省乙型肝炎病毒基因型分布及临床研究

[目的]探讨山东地区HBV基因型的分布情况,研究不同HBV基因型感染者的临床特点及病毒学特点。[方法]设计针对HBV S基因片段扩增的引物,采用PCR-RFLP的基因分型方法,对128例HBV感染者进行了HBV基因分型并检测了HBV前C及基本核心启动子（BCP）变异。[结果]128份血清中,基因C型104例,占81.25%;基因B型22例,占17.19%,未检测到其它基因型。有2份血清未能明确分型。[结论]山东地区HBV基因型以C型为主,其次为B型。HBV基因C型与基因B型比较有显著不同的临床特点。在慢性HBV携带者中基因C型的比例明显低于慢性肝炎、重型肝炎及肝细胞癌患者;HBV基因B型患者的平均年龄明显小于基因C型。HBV基因C型与基因B型比较有显著不同的病毒学特点。HBV DNA基因C型感染者的HBeAg阳性率、病毒载量及BCP变异率均明显高于基因B型。提示有可能基因B型更容易出现HBeAg的血清转换,高HBV复制水平的基因C型更容易导致反复的肝脏炎症活动。不同HBV基因型的病毒学特点部分决定了其临床特点。     

长春地区乙型肝炎病毒基因分型与肝病发病关系的研究

目的了解长春地区乙型肝炎(乙肝)患者基因型特点及与肝炎严重程度、疾病转归的关系,以指导临床对疾病进展的判断和指导临床用药。方法选择216例乙肝病毒(HBV)阳性肝炎患者,年龄33-87岁,平均(60．5±11．4)岁。病变程度的判断根据2000年《病毒性肝炎防治方案》中的诊断标准。应用巢式聚合酶链反应方法(nPCR)扩增HBV S基因组序列,用第二轮PCR产物直接进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析;然后用HBV S基因扩增产物采用Sanger双脱氧链终止法进行DNA测序,将所得到的核苷酸序列及推测的相应氨基酸序列通过DNASIS软件处理,并与GenBank中已发表的HBV中国株及国外株进行同源性比较以确定HBV的基因型,证明用S基因序列的RFLP法HBV分型结果与用全基因组序列的基因分析是一致的。表明S基因序列RFLP法的基因分型结果与S基因测序分型结果是一致的。结果216例HBV DNA阳性标本中单基因型分别检测出A、B、C、D四种,其中单基因型中A型有1例(0．46％),B型有19例(8．8％),C型有175例(81．02％),D型有21例(9．72％)。86例HBV DNA阳性住院患者标本中,C型为感染的主要基因型,69例(80．23％)。B型次之,9例(10．47％)。6例原发性肝癌均为C型;20例肝炎后肝硬化的患者中有17例(85．0％)为C型。结论长春地区HBV基因型仍以C型为主(81．02％),B、D型次之(分别是8．8％和9．72％)。同时结果显示长春地区HBV感染有基因多样性趋势,表现在检测出了A单基因型。肝癌、肝硬化与C基因型HBV的相关性最大。C基因型HBV DNA拷贝数较非C基因型高,提示与HBV DNA在C型患者体内长期存在有关。HBV病毒载量与肝脏病变严重程度的关系无统计学意义。     

贵州省四城市乙型肝炎病毒感染者病毒基因型调查研究

目的 调查贵州省4城市乙型肝炎病毒（HBV）感染者的病毒基因型及其与临床的关系。方法 选择贵阳、遵义、凯里、都匀4城市慢性HBV感染患者共786例，其中无症状携带者（ASC）346例，慢性肝炎（CH）313例，肝硬化（LC）77例，肝细胞肝癌（HCC）50例。用S基因限制性片段长度多态性确定基因型，直接测序分析B基因亚型，比较主要基因型地区分布及临床特征。结果 786例中，B基因型497例（63．23％），C型275例（34．99％），A型7例（0．89％），D型7例（0．89％），未发现E、F型。B型的分布：凯里市最高（96．04％），遵义、都匀市其次（78．79％、64．52％），贵阳市最低（53．14％）。C型的分布，贵阳（45．84％）高于都匀（34．41％）、遵义（13．13％）及凯里市（3．96％），差异有统计学意义（P〈0．05或P〈0．01）。94例B型感染者中，93例为Ba（98．94％）、1例为目亚型。从ASC、CH、LC到HCC组，B型的分布逐渐降低，而C型在各组的分布逐渐增高。与B型相比，C型感染者年龄较大；ALT水平较高（P〈0．05）；HBeAg阳性较低（P〈0．025）。结论 贵州省存在A、B、C、D4种HBV基因型，但以B型为主，C型其次，A、D型极少。B型中又以Ba亚型为主。B、C基因型在贵州省4城市的分布有一定差异。     

166例南京地区HBV-DNA阳性患者病毒基因型分析

目的初步了解南京地区乙型肝炎病毒（HBV）感染者基因型分布特点。方法采用上海克隆生物的HBV-DNA定量检测试剂盒和HBV基因分型诊断试剂盒对166例南京地区HBV感染者进行HBV-DNA和HBV基因型检测。结果 B基因型71例占42.77%,C基因型81例占48.79%,B/C混合型14例占8.43%,未检出非B非C型。HBV基因型B型、C型、B/C混合型在HBV-DNA水平方面差异无统计学意义。结论南京地区HBV感染者基因型以B、C型为主。     

PCR微流芯片技术检测HBV基因分型

目的探讨PCR微流芯片技术检测HBV基因分型的临床意义以及沈阳地区慢性HBV感染者基因型的分布.方法应用PCR微流芯片技术对55例慢性HBV感染者血清进行HBV基因分型,HBVDNA定量检测采用FQ-PCR方法.结果55例慢性HBV感染者中,C型38例(69.0%),B型14例(25.5%),3例(5.5%)未检出基因型.B型患者HBV病毒载量为8.43±2.95、C型患者HBV病毒载量为9.14 4±3.48,二者比较差异不显著(P＞0.05).B、C型患者的发病年龄无差异(P＞0.05).结论沈阳地区慢性HBV感染者基因型分布以C型为主.B型和C型患者的发病年龄和病毒复制水平无差异.PCR微流芯片技术灵敏、特异,结果客观,简便易行,可用于临床分型诊断和流行病学调查.     

天津口岸出入境人员乙型肝炎病毒基因分型研究

[目的]探讨天津口岸出人境人员乙型肝炎病毒（HBV）的基因类型分布特征。[方法]调查天津口岸出入境人员HBV血清学指标，采用实时荧光定量PCR结合Taqman探针技术对180份乙型肝炎表面抗原（HBsAg）阳性血清标本中的HBVDNA进行定量检测和基因分型；对非B非C型HBsAg阳性血清标本采用通用引物PCR方法结合序列分析进行基因分型。[结果]180份HBsAg阳性血清标本中，B型23份（40．35％）；C型30份（52．63％）；D型4份（7．02％），其余123份血清HBVDNA浓度均低于定量检测试剂盒的下限（500IU／ml）。[结论]天津口岸出入境人员中HBV基因型以C型为主，B型次之，D型极少。     

克拉玛依地区HBV基因分型及进化分析

目的：研究克拉玛依地区乙肝病毒（HBV）的基因分型，并且进行进化分析。方法：利用限制性片段多态性分析的方法对272例慢性乙型肝炎患者血清进行基因分型，采用限制性内切酶MboI、Earl酶切扩增产物，以A、B、c、D基因参照品作为对照，12例扩增产物进行测序证实其基因型。结果：272例样品有241例成功分型。C型44．8％，B型36．9％，D型4．2％，B／C型10．8％，B／D型3．3％。少数民族c型40．4％，B型30．8％，D型9．6％，B／C型11．5％，B／D型7．7％，未检测到A型。12例测序结果与39例GenBank中已发表的B、C、D型的同源性在97．8％～98．7％，96．9％～99．3％，97．5％～99．0％。结论：克拉玛依地区HBV基因型主要是C型和B型，其次是D型和混合型，未见A型。进化树分析图显示12例B、C、D型毒株与GenBank序列毒株分别属于同一分支。克拉玛依地区2例D型与新疆哈密地区D型进化距离最近。     

中国11城市乙型肝炎病毒慢性感染者中乙型肝炎病毒基因型分布

目的了解中国乙型肝炎病毒（HBV）慢性感染者中HBV基因型的分布情况。方法收集北京、清远、深圳、石家庄、汉川、南京、长春、济南、聊城、宁波和温州市共1214份HBV DNA阳性的慢性HBV感染者血清样本,用型特异性引物聚合酶链反应法（PCR）进行基因型测定,并对其中部分样本以PCR产物直接测序验证。结果在1214份血清中,检测到A基因型9例,占0．7%;B基因型345例,占28．4%;C基因型709例,占58．4%;B、C混合基因型（B＋C）151例,占12．4%。未检测到其他基因型。北方地区（长春、北京、石家庄市等）慢性HBV感染者中,C基因型比例较高,分别为58．2%、67．5%和63．6%,山东省聊城和济南市的C基因型比例分别高达90．2%和87．9%。随地理位置南移,B基因型比例逐渐增加,广东省清远和深圳市的B基因型比例分别为71．4%和63．6%。结论HBV基因型分布有明显地区差异。在中国慢性HBV感染者中,HBV C和B基因型为主要流行株。北方地区以C基因型为优势株,而南方地区则B基因型较为多见。     

Hepatitis B virus (HBV) genotypes in the Czech Republic

Hepatitis B virus (HBV) was genotyped based on sequencing and analysis of nucleotide sequences of HBV S gene in sera samples from 176 patients with viral hepatitis B from all over the Czech Republic. The most frequent genotype A was detected in 118 (67.1%) of the patients, followed by genotype D found in 50 (28.4%) of the patients. Genotypes B and C were identified in 6 (3.4%) and 2 (1.1%) of the patients, respectively. The incidence of genotype A statistically significantly increases with age. There is no statistically significant correlation between genotypes A and D and gender or locality (region). Genotypes B and C, found mainly in South East Asia, were first detected in the Czech Republic. Detection of these genotypes in both foreigners and Czech population is suggestive not only of import but also of transmission of these genotypes in the Czech Republic. Fylogenetic analysis documents dissimilarity levels between HBV isolates. Based on the amino sequence derived, the percentages of HBV subtype determinants d (68.6%) and y (31.4%) were established. The gene S sequencing analysis proved suitable for HBV genotyping.     

乙肝基因分型与耐药位点突变的关系

目的:检测本地区乙肝病毒复制病人中基因型分布情况,探讨HBV基因型与抗病毒疗效关系。方法:应用乙肝病毒型特异性引物采用巢式PCR方法,对45例HBV-DNA阳性患者进行HBV基因型分析,用DNA测序方法检测耐药位点突变。结果:B型7例,占15.56%;C型34例,占75.56%;未分型3例,占6.67%;B+C混合型1例,占2.22%。未发现其他型别。C型病人人均病毒载量5.67±1.61(1oglncopies/m1)较B+C混合型5.54(只有1例)、B型(4.42±1.39)及未分型(2.65±0.57)高。C型病人耐药变异位点多,病人比例高。结论:浙江等地区HBV—DNA基因分型以C、B为主,而B基因型抗病毒治疗疗效最好,C型、混合型及其它型对抗病毒治疗药物疗效较差。     

病毒基因型对联合抗病毒治疗慢性乙型肝炎患者的HBV DNA、HBeAg变化的影响

目的:分析慢性乙型肝炎患者在拉米夫定和阿德福韦酯联合治疗过程中不同基因型对HBV DNA、HBeAg及ALT变化的影响。方法:对2009年9月-2011年3月在我院就诊的51例服用拉米夫定和阿德福韦酯慢性乙型肝炎患者进行基因分型、HBV DNA及肝功能指标的测定。结果:51例患者的HBV病毒基因型主要为B和C型,C型32例,占62.7%,B型19例,为37.3%,以C型基因型为主;B、C不同基因型组在治疗48周后,除12周时的HBV DNA、HBeAg有统计学意义,其余均无显著性差异。结论:拉米夫定和阿德福韦酯联合治疗的慢性乙型肝炎患者在治疗12周时,B和C基因型对患者的HBV DNA、HBeAg的变化有影响;但随着治疗时间的延长,基因型对HBV DNA、HBeAg及ALT的变化均无显著影响。     

耐拉米夫定乙型肝炎病毒聚合酶P区变异与基因分型

目的：分析拉米夫定耐药的慢性乙型肝炎患者HBV P区变异和基因分型的关系,为制定针对不同HBV基因型抗病毒的个体化方案提供依据。方法应用聚合酶链反应（ PCR）和酶联免疫吸附试验（ ELISA）对187例拉米夫定耐药患者的HBV DNA载量及HBV-M进行检测,用特异的引物对待检标本HBV P区进行全序列测定,对不同性别、年龄的测序结果的基因分型作比较;并对C、B基因型发生实变模式作分析。结果187例慢性乙型肝炎患者感染的HBV均为B和C基因型,B基因型51例（27.27%）,C基因型134例（71.66%）,并存在混合感染2例（1.07%）;HBeAg含量在B基因型和C基因型间差异有统计学意义（ P〈0.05）;P区基因突变结果显示,B基因型以单纯YMDD突变为主,C基因型以YMDD突变＋ rtL180M 突变为主。结论本研究对象的HBV基因型主要是C型,不同基因型可能决定了与耐药相关的P区变异模式。     

Pattern and molecular epidemiology of Hepatitis B virus genotypes circulating in Pakistan

The continuously mutating nature of Hepatitis B virus (HBV) is responsible for the emergence of varying genotypes in different regions of the world affecting the disease outcome. The objective of the current study was to find out the pattern of HBV genotypes circulating in Pakistan. HBV genotypes were determined in HBV chronic patients of different age and gender from all the four different geographical regions (provinces) of Pakistan for a period of 2 years (2007–2009). Out of the total 3137 consecutive patients, 300 (175; 58.3% males and 125; 41.7% females) were randomly selected for HBV genotype A through H determination using molecular genotyping methods. Total 269 (89.6%) isolates were successfully genotyped where as 31 (10.3%) samples failed to generate a type-specific PCR band and were found untypable. Out of the successfully genotyped samples, 43 (14.3%) were with type A, 54 (18%) were with type B, 83 (27.6%) were with type C, 39 (13%) were with type D, 2 (0.6%) were with type E, 4 (1.3%) were with genotype F and total 44 (14.6%) were with mixed HBV infections. Of the mixed genotype infection cases, 16 were with genotypes A/D, 9 were B/C, six were A/D/F, five were with genotypes A/F, two were with A/B/D and B/E and one each for A/C as well as A/E genotypes. Four common genotypes of HBV found worldwide (A, B, C & D) were isolated from Pakistan along with uncommon genotypes E and F for the first time in Pakistan. Overall Genotype C is the most prevalent genotype. Genotypes B and C are predominant in Punjab & Balochistan and Khyber Pakhtoonkhwa, respectively whereas genotype A in Sindh.     

DNA芯片检测乙型肝炎病毒基因型

目的 制备检测HBV基因型的DNA芯片并进行杂交验证.方法 设计多条HBV分型寡核苷酸探针,固定于醛基基片的特定位置,制备成芯片,采用酶呈色技术(BCIP/NBT显色)检测杂交信号,进行杂交验证分析.结果 106例临床样本均测出基因型,其中B型37例,C型69例;对所有样本进行测序分析,结果与芯片杂交一致,杂交的灵敏度和重复性等指标均佳.结论 DNA芯片检测HBV基因型,操作简便易行,技术要求不高,适于临床推广应用.     

乙型肝炎拉米夫定耐药的发生与乙型肝炎病毒基因型的关系

目的:探讨拉米夫定耐药的发生与乙型肝炎病毒(HBV)B、C基因型的关系。方法:选取65例拉米夫定治疗耐药患者的血清采用基因芯片技术检测其乙肝病毒的基因型。结果:65例拉米夫定耐药患者中,B基因型为27例(41.54%),C基因型为38例(58.46%);C基因型的Y IDD变异率明显高于B基因型(86.84%对37.04%,P<0.01),且病毒复制水平明显高于B基因型,而B基因型的YVDD变异率明显高于C基因型(62.96%对13.16%,P<0.01)。结论:发生拉米夫定变异时乙肝C基因型多发生Y IDD变异,乙肝B基因型多发生YVDD变异,且变异后基因型C的病毒复制水平比B基因型要高。拉米夫定耐药患者B、C基因型病毒学特性的研究可对拉米夫定耐药患者的临床用药有指导意义。