广州地区扎幌样病毒的检出及基因型分析

目的 了解广州腹泻儿童是否存在扎幌样病毒(Sapporo-likevirus,SLV)感染。方法 在2003年秋冬季腹泻流行期间在南方医院儿科收集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本,并采用半套式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测。纯化阳性标本PCR产物并测序,然后将其同GenBank中的参比毒株序列比较。结果 收集的169份标本中有1份SLV(CH03354)PCR扩增阳性,检出率为0.59%,同源性分析表明该毒株属于SLVGⅠ-1群。结论 广州地区存在SLV所致感染,本次实验检出毒株基因型与安徽毒株不同,说明我国不同地区可能存在不同的SLV基因型。     

江门成人散发急性腹泻者星状病毒的检测及毒株型别分析

目的 研究江门地区成人腹泻者星状病毒感染情况及型别特点.方法 收集江门地区病毒性腹泻流行期散发成人腹泻患者粪便标本,经胶体金法、RT-PCR法分别检测轮状病毒和诺如病毒后,运用实时荧光PCR进行星状病毒检测,并对阳性标本进行RT-nested PCR测序,鉴定型别.结果 56份成人病毒性腹泻粪便标本中,荧光PCR法测出3份星状病毒株(5.4%),经RT-PCR测序1份,序列分析鉴定为HAtsV-4型.结论 江门成人散发病毒性腹泻者存在星状病毒感染,型别为HAstV-4,未发现多致泻病毒混合感染.     

青岛市冬春季儿童腹泻腺病毒感染分子流行病学特点

目的 了解青岛市2007年冬春季儿童腹泻腺病毒(EADV)感染的流行病学特点.方法 收集2007年1～5月临床诊断为病毒性腹泻病儿的粪便标本,采用ELISA及PCR方法检测EADV.结果 106例标本检测阳性率为38%,随机抽取10例阳性标本进行DNA诊断,均为EADV.结论 青岛市冬春季儿童腹泻与EADV感染有关,流行株为40、41型的病毒株.     

2017—2021年呼和浩特市哨点医院5岁以下儿童病毒性腹泻监测分析

目的 了解2017—2021年呼和浩特市5岁以下儿童病毒性腹泻及主要病原的流行特征，为呼和浩特市儿童病毒性腹泻的疾病预防、监测和疫情处置提供科学依据。方法 收集2017年1月至2021年12月呼和浩特市哨点医院5岁以下腹泻住院患儿的个案信息和粪便标本，采用酶联免疫吸附试验和实时荧光定量PCR分别对样本进行轮状病毒、杯状病毒、肠道腺病毒和星状病毒检测。数据采用Excel 2010软件进行处理，并通过SPSS 20.0软件进行统计分析。结果 本研究共收集呼和浩特市哨点医院2017年1月至2021年12月符合条件的腹泻样本1 350份，其中男性患儿784份(58.07%),女性患儿566份(41.93%),阳性样本449份，占全部病例的33.26%。单一感染以杯状病毒(17.11%)和轮状病毒(12.22%)为主，混合感染以轮状病毒合并杯状病毒为主(2.07%)。<1岁年龄组患儿的病毒阳性检出率最高(37.52%)。发病高峰主要集中在每年9月至次年3月。结论 呼和浩特市2017—2021年5岁以下病毒性腹泻住院患儿以轮状病毒和杯状病毒感染为主，阳性病例多数集中在2岁以下患儿，以秋冬季高...     

实时荧光PCR和RT—PCR方法检测登革病毒的比较研究

目的通过2种检测登革病毒方法的比较，以提高检测登革病毒的灵敏度和特异性。方法利用Taqman MGB技术，根据登革病毒3’端非编码区的一段高度保守序列，设计登革1～4型荧光PCR通用引物和TaqmanMGB探针，以登革热毒株作为标准，以乙脑毒株作对照，建立实时荧光PCR检测登革病毒的快速方法。并对10份ELISA法检测阳性的临床血清标本进行RT—PCR及荧光PCR扩增。结果RT—PCR检测10份临床血清标本，2份阳性，阳性率为20％。实时荧光PCR检测登革病毒与乙脑病毒无交叉反应，检测10份临床血清标本，5份阳性，阳性率为50％。从RNA提取到检测结果仅需4h。结论Taqman MGB实时PCR检测方法快速、敏感性高、特异性强，可作为登革病毒的快速检测方法，应用于登革热的临床早期诊断。     

2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征的研究(摘要)

目的：研究2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征．方法：2002年9月～12月在昆明医学院第一附属医院儿科收集秋冬季腹泻患儿便样标本，利用ELISA和PAGE（聚丙烯胺凝胶电泳）方法，检测100例秋冬季腹泻患儿A组轮状病毒的感染情况，尽可能的降低检测中出现的假阳性和假阴性．并采用RT-PCR及net-PCR方法对PAGE阳性的80份标本进行A组轮状病毒4种主要的VP7血清型（G1、G2、G3和G4）分型．结果：（1）经ELISA检测，有83份阳性，检出率为83％；PAGE检测有80份阳性，检出率为80％；     

广州成人散发急性腹泻中诺瓦克样病毒感染及毒株型别初步研究

目的探讨诺瓦克样病毒与广州成人散发急性腹泻的病原关系和感染毒株的基因型别。方法采用ELISA方法筛检轮状病毒,RT-PCR方法检测诺瓦克样病毒,诺瓦克样病毒阳性样品的PCR产物经纯化、测序后进行基因分型。结果35份成人散发急性腹泻患者粪便标本中检出轮状病毒8例,诺瓦克样病毒4例,测序分析确定1株为诺瓦克样病毒GⅡ-3型,另1株为GⅡ-4型。结论广州成人散发急性腹泻患者中存在诺瓦克样病毒感染,且感染毒株的基因型别不一。     

广州儿童秋冬腹泻中人类杯状病毒感染的分子流行病学研究

目的了解广州某医院秋冬季儿童腹泻中人类杯状病毒（HuCV）感染的分子流行病学特点。方法连续2个秋冬季腹泻流行季节收集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本。采用ELISA检测轮状病毒，RT-PCR检测HuCV。部分阳性标本PCR产物进行纯化、测序，结合参考株相应核苷酸序列进行进化分析。结果诺瓦克样病毒（Norwalk-like virus，NLVs）阳性率为12-35％（80／648），扎幌样病毒（Sapporo-like virus，SLVs）阳性率为0．31％（2／648）。NLVs各月阳性率无显著性差异，主要感染2岁以下患儿。2003年流行株为GⅡ-3群和GⅡ-4群，2004年为GⅡ-4群。2株SLVs均为GⅠ-1群。结论NLVs是广州地区秋冬季节儿童腹泻的重要病原体，其流行株为GⅡ-3群、GⅡ-4群病毒株， 但在不同的时间段可能存在不同的流行优势株；广州地区存在SLVs所致感染，与我国报告的SLV基因型不同。     

兴化地区住院腹泻患者艰难梭菌感染的流行病学研究

目的 了解兴化地区艰难梭菌的感染情况，为预防艰难梭菌感染的暴发流行提供参考依据。方法 收集2018年5月至2021年4月兴化市某医院住院腹泻患者(年龄≥18岁)的粪便标本229例，进行艰难梭菌毒素基因检测(Xpert实时荧光PCR法，赛沛公司)、艰难梭菌谷氨酸脱氢酶抗原(glutamate dehydrogenase antigen, GDH)和毒素检测(酶联免疫层析法，美艾利尔公司)。结果 229例腹泻患者粪便标本，Xpert法检出艰难梭菌阳性19例(tcdB阳性，未检测到cdtA和tcdC缺失)、酶联免疫层析法检出艰难梭菌阳性19例(GDH阳性15例、毒素阳性3例、2者同时阳性1例),诊断为艰难梭菌感染19例(感染率8.30%)。结论 兴化地区住院腹泻患者存在艰难梭菌感染病例，应做好相关预防控制工作。     

献血者巨细胞病毒感染筛查的初步研究

目的：探讨检测人巨细胞病毒(HCMV)的低基质磷酸化蛋白(pp65)抗原对健康献血巨细胞病毒感染情况的筛查。方法：对2003年2～7月收集的103份EDTA抗凝外周血标本，用免疫组化方法进行pp65抗原血症检测，同时以ELISA法检测其中的86份血清中的IgM和IgG抗体。结果：103份标本中共有10份pp65抗原阳性，阳性率为9．71％；ELISA法检测86份标本CMV—IgM抗体全部阴性，CMV—IgG抗体56例阳性，阳性率为62％(56／86)，10份pp65抗原阳性的标本中，CMV—IgG阳性9例。结论：pp65抗原是检测CMV感染的一种敏感、特异的方法，而检测CMV—IgM、CMV—IgG不能预测CMV的活动性感染，因此对需要输注全血、成分血的免疫力低下或各种移植病人，应进行CMVpp65抗原的检测。     

RT—PCR法与血凝抑制法鉴定流感病毒的比较

目的比较逆转录聚合酶链反应法(RT—PCR)与血凝抑制法在流感病毒鉴定中的优劣，以期建立能快速、特异地从临床标本中检测并鉴定流感病毒的新方法。方法用常规细胞培养法增殖病毒后，分别用RT—PCR反应法和常规血凝抑制法进行流感病毒鉴定。结果在13份发生细胞病理变化的标本中RT—PCR阳性标本为9份，其中甲型7份(6份甲3亚型、1份甲1亚型)，乙型2份；而用血凝抑制法鉴定阳性标本仅6份。结论RT—PCR法快速、特异、灵敏，在流感病毒鉴定中具有较大的应用价值。     

菏泽市2018—2021年病毒性腹泻病原学监测结果及流行特征分析

目的 分析2018—2021年菏泽市病毒性腹泻病原学和流行病学特征,为防控工作提供更多科学依据。方法 收集2018年1月至2021年12月菏泽市9县区病毒性腹泻监测哨点医院采集的感染性腹泻患者的粪便标本。采用实时荧光定量PCR方法检测轮状病毒和诺如病毒。结果 944份粪便标本检出阳性131份,总阳性率为13.88%(131/944),轮状病毒阳性率为4.98%(47/944),诺如病毒阳性率为8.26%(78/944)。诺如病毒阳性标本中GⅠ型占1.59%(15/944);GⅡ型占6.67%(63/944)。轮状病毒和诺如病毒混合感染阳性6份,混合阳性率为0.64%(6/944)。0～5岁组阳性率高于>5岁组,差异有统计学意义(P<0.05)。不同县区阳性检出率不同,差异有统计学意义(P<0.05)。巨野县阳性检出率最高为23.71%,成武县阳性检出率最低为2.00%。病毒性腹泻发病呈秋冬季高发特点。结论 菏泽市2018—2021年病毒性腹泻以轮状病毒和诺如病毒GⅡ型为主,多发生在秋冬季,易感人群以5岁以下婴幼儿为主,无性别差异。监测部门需进一步加强病毒性腹泻多种病原...     

湖北省不同年份汉坦病毒的RT-PCR检测及分型

目的：探讨湖北省不同年份引起肾综合征出血热的汉坦病毒的主要型别，为进一步研究该型汉坦病毒的基因变异打下基础。方法：根据汉坦病毒M基因片段G1编码区核苷酸序列设计I型和Ⅱ型分型引物，利用RT—PCR对105份不同年份的病程在7日以内的肾综合征出血热(HFRS)患(经临床诊断和ELISA确诊)血清标本进行检测及基因分型，并对扩增出的基因片段选用3种限制性内切酶AluI、RsaI、MboI进行酶切分析。结果：用I型引物通过：RT—PCR检测75份血清标本(1996～2000年)和30份血清标本(1986～1987年)的阳性率分别为77．3％和10％，而用Ⅱ型引物检测前阳性率为8．0％，后均为阴性。对4份I型引物扩增产物用3种限制性内切酶进行酶切分析，发现4份阳性产物其限制性片段长度多态性均与I型汉坦病毒标准株76～118完全不同，但其中3份与I型汉坦病毒湖北地方株HV114相同，1份与HV114不完全相同。结论：不同年份引起湖北地区HFRS的主要毒株均为I型汉坦病毒(HTN)湖北地方株。     

2013年太原市迎泽区水痘-带状疱疹病毒基因型分析

目的分析太原市迎泽区2013年引发水痘疫情的水痘-带状疱疹病毒(VZV)流行株的基因型别,为预防控制水痘疫情提供依据。方法收集23份水痘患儿的临床标本。实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)鉴定是否为VZV核酸阳性。PCR扩增447 bp大小的部分开放阅读框(ORF)22片段,并测序。用Vector NTI Suite 6和Clustalx软件分析核酸序列并与参考菌株进行聚类分析。结果 19份临床标本鉴定为VZV野毒株核酸阳性,其中有12份标本的PCR产物在约447 bp处有明显的特异性条带。12条VZV的447 bp片段核酸序列的6个单核苷酸多态性关键位点与J基因型参考株完全一致。结论太原市迎泽区2013年引发水痘疫情的VZV主要流行株为J基因型野毒株。     

荧光定量PCR和ELISA检测乙肝病毒的应用比较

目的　探讨荧光定量PCR检测HBV—DNA的应用价值。　方法　从 2 92 0份用ELISA检测乙肝 5项的体检血清标本中 ,抽取 2 88份HBsAg阳性标本及 10 0份全阴标本 ,进行荧光定量聚合酶链式反应 (FQ—PCR)HBV—DNA定量分析。　结果　经FQ—PCR检测 ,80份HBsAg、HBeAg、HBcAb都阳性的标本 ,HBV—DNA阳性率为 10 0 % ( 80 /80 ) ,平均HBV—DNA拷贝数为 2 2× 10 8cp/ml ;164份HBsAg、HbeAb、HBcAb都阳性的标本 ,HBV—DNA阳性率为79 3 % ( 13 0 /164 ) ,平均HBV—DNA拷贝数为 1 5× 10 6cp/ml;12份HBsAg单项阳性的标本 ,HBV—DNA的阳性率为83 3 % ( 10 /12 ) ,平均HBV—DNA拷贝数为 1 6× 10 5cp/ml;10 0份HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb、HBcAb都阴性的标本 ,HBV—DNA的阳性率为 2 % ( 2 /10 0 ) ,平均HBV—DNA拷贝数为 4 5× 10 5cp/ml。　结论　FQ—PCR可以检测HBV的感染和复制情况 ,对准确报告HBV感染 ,指导其选择治疗方案和观察疗效具有重要的临床意义     

青岛地区1983～1987年婴幼儿急性腹泻的轮状病毒检测与分子流行病学分析

用核酸电泳法对1983～1987年秋、冬季收集的318份急性腹泻患儿的粪便标本进行了轮状病毒的分子流行病学研究,阳性187份。研究表明,轮状病毒始终是本地区秋、冬季节婴幼儿急性腹泻的病原体。轮状病毒的RNA 电泳型分析提示,5年中本地区一直系长型毒株(笫Ⅱ亚群)为流行的优势株,其中4年同时伴有短型毒株(第Ⅰ亚群)流行。从187份阳性标本中检出差异型21个。4个属短型,17个属长型。每年都有数个电泳型毒株流行,但仅有其中的一个占流行优势。多数毒株仅流行1～2年,但有2个毒株持续4～5年被检出。提示轮状病毒的基因组有一定稳定性。     

儿童急性病毒性腹泻病原流行趋势分析

目的 探讨儿童急性病毒性腹泻的病原流行趋势.方法 对2013年3月至2014年12月在首都儿科研究所附属儿童医院感染科门诊就诊的急性腹泻患儿的粪便标本进行病毒学检测(包括轮状病毒、诺如病毒、肠腺病毒),新鲜粪便标本冷藏保存,使用Trizol和DNAzol试剂提取粪便标本核酸(RNA和DNA),分别用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测粪便标本中的轮状病毒,RT-PCR方法检测诺如病毒核酸,PCR方法检测肠腺病毒DNA.结果 留取粪便标本共1 295份,病原学阳性411份(阳性率31.7％).其中轮状病毒单一阳性282份,占阳性标本的68.6％;诺如病毒单一阳性78份,占阳性标本的19.0％;肠腺病毒单一阳性25份,占阳性标本的6.1％;2种病毒混合感染26例,占阳性标本的6.3％.不同病毒检出率呈明显季节变化,轮状病毒检出率高峰在11月份,诺如病毒检出率高峰在10月份,肠腺病毒检出率高峰在6月份,检出率分别为67.9％、18.7％、5.4％.混合感染以轮状病毒和诺如病毒感染为主.结论 轮状病毒是儿童急性病毒性腹泻的主要病原,诺如病毒成为儿童急性病毒性腹泻的第2大病原.秋冬季节为轮状病毒腹泻的高发期,诺如病毒流行季节较轮状病毒略早,肠腺病毒流行主要发生在夏季.混合感染以轮状病毒合并诺如病毒感染多见,且好发于轮状病毒流行季节.3种病毒引起的腹泻在非流行季节均有散发病例.     

2003年广州市登革1型病毒流行株的分离及NS2基因序列分析

目的对广州市区2003年仲夏—批疑似登革病毒感染的患进行确诊，并从基因水平分析流行株的可能来源。方法用免疫层析法(ICT)检测早期疑似患的DV—IgN和IgG抗体；同时用逆转录-聚合酶链反应(RT—PCR)、细胞培养病毒分离分别进行病原的分离和鉴定；对所分离到的毒株进行基因克隆、测序，并与国际参考株及国内流行株相应的序列进行同源性分析，结合患的流行病学资料推测本次流行株的可能来源。结果发病5d内患DV—IgM抗体阳性率为56．5％(13／23)，发病5～10d的患DV—IgM抗体阳性率为66．7％(16／24)；DV—IgG抗体无1例阳性。从18份发病5d内患的血标本中分离病毒7份，经RT—PCR和基因测序检测证实为DVI感染；用RT—PER检测30份早期患血标本，患的阳性率为83．3％(25／30)。基因序列分析表明，2003年流行株与登革1型病毒柬埔寨流行株及我国1997、1999年登革1型病毒流行株的同源性最高，分别为97％、97％、98％。所有患在发病前两个月均在广州市区某大院内居住，无输血史、无外出史。结论2003年广州登革热流行为登革1型病毒感染所致，推测广东可能存在登革1型病毒的疫源地。     

手足口病和腹泻病患儿肠道病毒71型的基因型检测和分析

目的检测和分析手足口病和腹泻病患儿肠道EV71和基因分型.方法收集2007和2008年10～12月30名腹泻患儿和2009年4～6月40名手足口病患儿的粪便标本,同时收集手足口病患儿的临床资料.用试剂盒提取粪便标本病毒RNA,用PCR荧光探针法对上述标本进行EV71的检测;对EV71阳性的标本进行VP1基因节段的RT-PCR,选EV71感染重症和轻症各3份的阳性标本扩增产物纯化后进行核苷酸序列测定和分析,结果与GenBank中的EV71参考毒株进行比较,并依据VP1片段构建种系发生树;应用SPSS13.0软件进行对比统计分析.结果 （1）EV71的感染：40例手足口病患儿的粪便标本,27例EV71阳性,阳性率为67.5%.30例腹泻患儿的粪便标本中,1例EV71阳性,阳性率为3.3%.40例手足口病的患儿中：轻症23例,EV71阳性率52.17%（12/23）;重症17例,EV71阳性率88.24%（15/17）,两者的差异具有统计学意义（P〈0.05）.（2）EV71的基因分型：本次EV71均为C基因型,与中国大陆流行的基因型基本一致.与A、B基因型参考毒株的核苷酸同源性分别为39.7%～41.3%和83.3%～84.9%;而与C基因型中的C4亚株代表株的核苷酸同源性高达90.5%～96.4%;在种系进化树上证实本次分离到的EV71毒株属于C4亚型.（3）EV71核苷酸同源性的区域性：本次分析的6毒株其核苷酸同源性达92.6%～100%,与2008年昆明的3株参考株比较,核苷酸同源性为92.6%～99.2%.与2008年安徽、深圳、山东、武汉和北京等省份的分离毒株比较,核苷酸同源性为91.8%～99.2%;与匈牙利、澳大利亚、日本、马来西亚、新加坡等地流行时的毒株比较,核苷酸同源性为80%～86.5%;与2008年广州、浙江和2009年上海的分离毒株比较,核苷酸同源性为45.1%～45.9%.结论 EV71是昆明2009年手足口病的主要病原之一.秋冬季腹泻患儿存在EV71的感染,但感染率低.本次的EV71感染均为C基因型,属C4亚型,其核苷酸同源性与国内外流行时的毒株各有不同.     

贵阳市412例腹泻病例空肠弯曲菌的检测分析

目的建立常规的空肠弯曲菌检测方法,了解贵阳市腹泻人群空肠弯曲菌的感染状况。方法采用简单生化及多重PCR方法对贵阳市412例腹泻人群进行空肠弯曲菌检测。结果 412份腹泻标本中,7份空肠弯曲菌阳性,平均检出率1.70%。1岁以下婴幼儿感染率与其它人群差异无统计学意义(P>0.05)。男女患者感染率差异无统计学意义(P>0.05)。粘液便空肠弯曲菌检出率(7.69%)显著高于水样便(0.60%)(P<0.01)。结论利用简单生化及多重PCR方法能很好地检出空肠弯曲菌;贵阳市腹泻人群中存在空肠弯曲菌的感染,且主要感染婴幼儿,需加强婴幼儿腹泻中空肠弯曲菌感染的监测。