中国部分地区结核分支杆菌耐利福平、异烟肼和链酶素耐药基因的检测

目的研究我国部分地区耐利福平（RFP）、异烟肼（硼）和链酶素（SM）结核分支杆菌临床分离株rpoB基因、KatG、rpsL基因突变情况，评价其耐药分子机制。方法采用PCR和聚合酶链反应．单链构象多态性（PCR-SSCP）对373株结核分支杆菌临床分离株（其中敏感株148株，耐RFP、INH、SM株共225株）rpoB基因、KatG和砒基因进行检测。并对其中19株SSCP阴性的耐RFP株用双脱氧末端终止法进行测序分析。结果安徽省、北京市、上海市、河北省、河南省、辽宁省、吉林省结核分支杆菌耐RFP临床分离株rpoB基因突变率分别为90％、91％、90％、91％、90％、93％、91％；KatG基因突变率分别为69％、63％、71％、68％、67％、68％、65％，rpsL基因突变率71％、69％、74％、68％、70％、61％、76％，分别为经统计学处理不同地区间无显著性差异（X^2=0．46，P＞0．05）。同时rpoB基因敏感株均无突变，特异性为100％；KatG基因有3株发生突变，特异性为98％。19株SSCP阴性耐药株中经测序6株在531位密码子TCG→TIE，1株526位密码子CAC→TAC，7株发生在516位密码子GAC→GTC，5株未改变。结论我国不同地区耐利福平、异烟肼和链霉素的rpoB、KatG、rpsL耐药基因突变率大致相同，rpoB基因、KatG和rpsL基因突变分别是耐RFP、INH和SM结核分支杆菌耐药性产生的主要分子机制，PCR-SSCP可快速检测结核分支杆菌RFP、INH和SM耐药性。     

用反向斑点杂交法检测结核杆菌对链霉素和乙胺丁醇的耐药性

目的建立结核分支杆菌对链霉素（SM）和乙胺丁醇（EMB）耐药基因突变的快速检测方法。方法根据结核分支杆菌标准株H37Rv序列,自行设计针对rpsL和embB基因常见耐药突变的系列寡核苷酸探针,制成膜芯片,并对64例结核分支杆菌临床株的基因突变情况进行检测。结果在34株SM耐药菌中,有25株被检出在rpsL基因分析部位发生突变,检出率为73．5％（25／34）,其中23株（67．6％）为第43位密码子AAG→AGG突变,2株（5．9％）为第88位密码子AAG→AGG突变;在32株EMB耐药菌中,有19株在embB基因分析部位发生突变,检出率为59．4％（19／32）,其中12株（37．5％）为ATG→GTG突变;6株（18．8％）为ATG→ATA突变;1株（3．1％）为ATG-＊CTG突变。膜芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论用膜芯片检测结核分支杆菌对链霉素和乙胺丁醇的耐药性,具有较高的特异性和敏感性,可作为常规药敏方法的补充,用于指导开展早期、有效的临床化疗。     

结核分支杆菌rpoB基因突变与对利福平耐药的关系

目的:研究结核分支杆菌耐利福平(RFP)分离株rpoB基因突变情况并评价英应用价值.方法:采用多聚合酶链式反应-单链构象多态性分析法(PCR-SSCP法)对60株结核分支杆菌rpoB基因进行检测.结果:以结核分支杆菌标准株H37Rv为对照,60株PCR扩增阳性的结核分支杆菌中,共有32株发生突变,总突变率为53.3%(32/60);24株药物敏感株有4株rpoB基因有突变,突变率为16.7%;36株耐药株中,28株rpoB基因有突变,突变率为77.8%.耐药菌株突变率明显高于敏感菌株的突变率(P<0.05).结论:rpoB基因突变是耐RFP结核分支杆菌耐药性的主要分子机制;应用PCR-SSCP可快速检测结核分支杆菌对RFP的耐药性.     

结核分枝杆菌rrs和rpsl基因突变与二线氨基糖苷类耐药关系分析

目的：了解耐二线氨基糖苷类结核分枝杆菌临床分离株rrs与rpsl基因突变特征及其与耐药的关系。方法对136株活动性肺结核患者痰标本分离的结核分枝杆菌进行菌型鉴定及结核分枝杆菌药敏试验,提取耐二线氨基糖苷类结核分枝杆菌DNA,应用PCR扩增rrs和rpsl目的片段,并进行测序、比对验证。结果从136株临床结核分枝杆菌中筛选出耐二线氨基糖苷类菌株25株（18.3%,25/136）,其中耐卷曲霉素13株（9.56%,13/136）、耐卡那霉素9株（6.62%,9/136）、耐卷曲霉素和卡那霉素2株（1.47%,2/136）、耐卷曲霉素、卡那霉素、阿米卡星1株（0.73%,1/136）。经测序分析,25株均存在rrs和（或） rpsl基因突变（100%,25/25）,其中双基因联合突变3株,共计两种类型：rrs A1401G和rpsl AAG43AGG、AAA121AAG （2株）;rrs A1401G和rpsl AAG88AGG、AAA121AAG（1株）;rpsl单基因双突变3株,共计两种类型：rpsl AAG43AGG、AAA121AAG（2株）;rpsl GGT11GTT、AAA121AAG（1株）,rpsl 基因的GGT11GTT突变尚未见相关文献报道,为新的突变位点;余19株为单基因单突变rpsl AAA121AAG。结论结核分枝杆菌对二线氨基糖苷类耐药与rrs和rpsl基因突变有关,rrs A1401G与rpsl基因GGT11GTT突变为进一步研究耐药机制以及耐药结核病的快速检测提供了依据。     

痰耐药结核分支杆菌rpsL基因的快速检测及链霉素耐药机制研究

[目的]快速检测痰耐药结核分支杆菌rpsL基因及了解链霉素（SM）耐药的分子机制。[ 方法]用PCR方法直接从耐药肺结核患者痰及临床分离菌株扩增rpsL基因片段,对扩增获得的rpsL基因片段进行序列测定,比较分析全耐、对SM耐药的耐多药、对SM敏感的耐多药、全敏感或标准结核分支杆菌株之间的基因序列差异。[结果]于6h内从耐药肺结核痰中快速检测到rpsL基因。从所有临床分离菌珠均扩增获得267bp片段,序列测定比较发现,全耐菌和对SM耐药的MDR—TB菌株均检测有rpsL基因点突变,突变密码子为CCT突变为CTT,而全敏感株和标准菌株均未检测到基因突变。其中从一株对SM敏感的MDR-TB中也检测到突变。[结果]PCR及序列分析方法可快速、准确检测结核分支杆菌rpsL基因及其突变,结核分支杆菌对EMB的耐药性与rpsL基因点突变有关。     

结核分支杆菌利福平和链霉素耐药基因的快速检测

目的 :评估采用聚合酶链反应 -单链构象多态性 (PCR SSCP)同时检测rpsL基因、rpoB基因突变在结核分支杆菌耐链霉素 (SM )和利福平 (RFP)耐药性测定中的应用价值。方法 :采用PCR SSCP技术对 86株结核分支杆菌临床分离株rpsL基因、rpoB基因突变同时进行检测。即首先用PCR方法同时扩增RFP、SM的rpoB基因和rp sL基因 ,然后进行SSCP分析。结果 :以结核分支杆菌H3 7RV为对照 ,41株药物敏感株的rpsL基因、rpoB基因均未见SSCP图谱异常。特异性为 10 0 %。 45株同时耐链霉素和利福平的耐药株中 ,3 4株 (75 6% )有rpsL基因图谱异常 ;41株 (90 1% )有rpoB基因图谱异常。结论 :rpoB基因突变和rpsL基因突变与结核分支杆菌耐利福平和链霉素密切相关 ,应用PCR SSCP技术可同时快速检测结核分支杆菌对链霉素和利福平耐药性。     

结核分支杆菌耐异烟肼分子机制的研究

目的探讨耐异烟肼结核分支杆菌KatG基因突变在结核分支杆菌耐异烟肼耐药性测定中的应用价值。方法采用聚合酶链反应——单链构象多态性(PCR-SSCP)分析72株结核分支杆菌KatG基因突变。其中32株为异烟肼(INH)敏感株,40株为INH耐药株,用PCR-SSCP图谱鉴定扩增产物有无突变,H37RV标准株作对照。结果所有INH敏感株SSCP带谱与对照相同;40株INH耐药株中15株与对照相同,25株有不同程度的差异,INH耐药KatG基因突变或缺失的阳性率为62.5%。结论多数结核分支杆菌耐INH是由于其KatG基因突变所致,用PCR-SSCP筛选突变株可达到快速检测结核分支杆菌INH耐药的目的。     

DNA芯片法检测耐多药结核分支杆菌耐药性

目的 :应用新型DNA芯片快速检测结核分枝杆菌对异烟肼利福平的耐药性。方法 :2 0株耐INH、RFP结核分支杆菌临床分离株 ,PCR扩增并荧光标记包含结核分支杆菌katG、rpoB基因突变热点的片段 ,与芯片杂交。结果 :耐INH、RFP2 0株经DNA芯片检测 ,14株katG基因突变 ( 70 % )、17株rpoB基因突变 ( 85 % )。结论 :用DNA芯片检测结核分支杆菌株耐药性有较高的特异性和灵敏度 ,且快捷     

340株痰结核分支杆菌耐药结果分析

目的探讨340例肺结核病人痰培养阳性菌株对常规抗结核药物的耐药性。并对耐INH、RFP、SM及耐HR者进行敏感药物的选择。方法应用Baetec或改良罗氏法，采用绝对浓度法进行结核分支杆菌药物耐受性测定。结果耐药顺位次序为RFP45．9％、SM45．3％、INH34．4％、EMB18．6％、PAST．4％、HR23．8％。结论我市属于高耐药区域．以耐RFP、SM、INH居前三位，耐HR率亦很高。DIP、OFLX、PCM对耐HR菌株敏感。     

临床分离结核分枝杆菌耐药性质与rpoB、rpsL基因变异的研究

目的:对从疑似结核病患者痰液中分离的结核分枝杆菌的rpoB和rpsL基因突变情况进行研究,分别探讨其与耐利福平(RFP)和耐链霉素(SM)之间的关系.方法:采用PCR和DNA测序法对结核分枝杆菌临床分离株和1株卡介苗株(BCG)的rpoB和rpsL基因进行序列分析.结果:分离得到耐利福平27株,耐链霉素25株,经测序分析,所有利福平、链霉素敏感株rpoB、rpsL基因均未发生氨基酸突变;RFP和SM耐药株rpoB和rpsL基因的突变率各为81.5％(22/27)和76％(19/25);耐利福平以Ser531Leu突变最为常见,突变频率为55.6％(15/27),耐链霉素以Lys43Arg位突变最为常见,突变频率为72.0％(18/25).结论:rpoB和rpsL基因突变分别是结核分枝杆菌RFP和SM耐药性产生的主要分子机制,PCR-DNA测序法可快速检测结核分枝杆菌RFP和SM耐药性.     

Drug-resistant tuberculosis at the University Hospital in Gaziantep, South-eastern Turkey

We aimed to determine the present status of drug resistance of Mycobacterium tuberculosis at the Gaziantep University Hospital in south-east Turkey. Data for 1995 to 1999 were retrospectively evaluated with respect to smear-positive cases, first positive culture for Mycobacterium tuberculosis for each patient and drug-susceptibility tests for the major antituberculous drugs. Cultures were done using the Bactec 460 TB method. A total of 106 (40.2%) strains were resistant to at least one drug. Single drug resistance was observed in 47 strains (17.8%) and resistance to two or three drugs was found in 28 and 29 strains (10.6 and 11.0%), respectively. Two strains (0.8%) were resistant to all four drugs. While multidrug resistance was observed in 52 (19.7%) strains, resistance to isoniazid + rifampin was observed in 20 (7.6%) strains. This retrospective study showed that combined drug resistance of M. tuberculosis is highly prevalent in southeastern Turkey. Possible reasons for the failure of current control policies were considered.     

西安市结核分枝杆菌耐药性初步调查

目的　了解西安市结核分枝杆菌临床分离株耐药状况。方法　采用抽样调查方法，于2005年5-8月调查收集西安市13个区（县）结防所门诊所有拟诊病例痰标本，用改良罗氏培养基进行病原分离，鉴别培养基培养法进行菌型鉴定。对分离到的结核分枝杆菌采用绝对浓度法对4种一线抗结核药物， 异烟肼（INH）、 利福平（RFP）、 链霉素（SM）和乙胺丁醇（EMB）， 进行药物敏感性检测。结果　104株结核分枝杆菌对4种一线抗结核药物, INH、 RFP、 SM和EMB，全部敏感的菌株为71株（68.3%）；耐药菌株33株（31.7%），其中， 单耐药菌株12株（11.5%），耐多药菌株21株（20.2%）。结核分枝杆菌对4种一线药物INH、 RFP、 SM和EMB的耐药率分别为24.0%（25/104）、 18.7%（19/104）、16.3%（17/104）和2.9%（3/104）。结论　西安市结核分枝杆菌的耐药情况较为严重，在结核病防治工作中应给予充分重视。     

Evaluation of a radiometric method for pyrazinamide susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis

Pyrazinamide susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis requires an acid environment. By controlling the method of acidification and the quality and quantity of the inoculum, the test can be performed with the BACTEC radiometric system (Johnston Laboratories, Towson, Md.). We acidified BACTEC 7H12 medium with buffered phosphoric acid and adjusted the test inoculum to 1/10 of that usually employed in BACTEC protocols; after 5 days of growth we correctly identified 36 of 36 strains susceptible to 50 micrograms of pyrazinamide per ml. All 18 resistant strains were classified as pyrazinamide resistant. (Susceptibility or resistance had been determined by standard plate assays.) The test was able to detect small resistant populations in artificial mixtures of 1 or 2% resistant bacteria with a susceptible strain (10 mixtures each). We tested 70 M. tuberculosis strains in acidified BACTEC 7H12 medium and by the plate dilution test at pH 5.5. All strains grew in the BACTEC medium, but three strains failed to grow on plates and were not tested further; the results of both methods agreed for the remaining strains.     

浙江省杭州市结核分枝杆菌氧氟沙星耐药研究

目的 了解杭州市结核分枝杆菌对氧氟沙星的耐药情况及耐药菌株gyrA基因的突变特点。 方法 收集2010年4月至2012年6月杭州市各结核病定点医院分离培养的临床菌株,进行一线抗结核药物、氧氟沙星和卡那霉素敏感性检测,测定氧氟沙星耐药菌株gyrA基因的喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)序列。 结果 收集的1242株临床菌株中, 67株(5.39%)对氧氟沙星耐药,其中32株(47.76%)对氧氟沙星单耐药,23株为耐多药结核病(MDR-TB)菌株,占MDR-TB菌株的22.77%。选取55株耐药株进行gyrA序列分析,其中33株(60%)携带gyrA基因突变位点。突变位点包括第90和94位密码子,突变率分别为27.27%和32.73%。 结论 杭州市氧氟沙星单耐药患者的比例较高,MDR-TB患者中氧氟沙星耐药情况较严重,需加强结核患者的早期发现和用药管理。     

检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究

目的：建立聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的方法，并评价共临床应用的价值。方法：依据结核分枝杆菌rpoB基因的耐利福平决定区设计引物，用PCR从临床分离株和直接从痰标本中扩增rpoB基因片段；对扩得的rpoB基因片段做DNA SSCP分析，并随机测定rpoB片段的序列。结果：PCR从所有212株结核分枝杆菌中均扩得230bp片段135份抗酸染色阳性的痰标本中，有113份扩得阳性片段（83．7％），在SSCP分析中，140份经L－J药敏试验检测为利福平耐受的结核分枝杆菌，有130份有rpoB基因突变（符合率为92．9％），72份经L－J药敏试验检测为利福平敏感的菌，有67份的rpoB基因无突变（符合率为93．1％），测序分析发现57份经SSCP检测为突变的rpoB片段均有序列改变，10份经SSCP分析为无突变的有8份无序列改变，SSCP与测序结果的符合率为94．0％，在本研究的菌株中，耐多药结核病（MDR－TB）占76．4％（107／140），有92．5％（99／107）耐多药菌株经SSCP检测有rpoB突变。结论：建立的PCR－SSCP分析方法，是一种较准确和稳定的检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的方法，可用于临床快速分析患者结核分枝杆菌对利福平的耐药性，并可作为MDR－TB判断的一个重要指标。     

新疆结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping基因型的初步研究

目的研究新疆结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型,初步了解其基因型多态性状况及主要流行株。方法在新疆维吾尔自治区胸科医院收集一个连续时间段的结核分枝杆菌临床分离菌株,采用比例法检测进行耐药性检测、间隔寡核苷酸分型(Spoligotyp ing)方法进行分型研究。基因聚类分析采用B ioNum erics 5.0数据库软件,统计学分析采用χ2检验,P0.05为差异有统计学意义。结果共收集到结核分枝杆菌临床分离菌株175株,其中对利福平、异烟肼、链霉素和乙胺丁醇全敏感115株,耐药60株(包括单耐药31株和耐多药29株)。经Spoligotyp ing分型,这些菌株可分为4个基因群49种基因型,最大的1个基因群为北京家族,占68.57%(120/175)。北京家族中,敏感菌株63.87%(76/119),耐药菌株占36.13%(43/119);非北京家族中,敏感菌株68.52%(37/54),耐药菌株占31.48%(17/54),北京家族与非北京家族的耐药率之间差异无统计学意义(P=0.551)。结论新疆结核分枝杆菌临床菌株存在明显的基因多态性,主要流行菌株为北京基因型。北京基因型与耐药性无明显相关性。     

结核分枝杆菌利福平耐药基因的检测

以药物敏感试验为标准，应用聚合酶链反应－单链构象多态性分析方法对６８例利福平耐药菌株和２０例利福平敏感菌株进行测定，结果８８例结核分枝杆菌均扩增出目标ＤＮＡ条带，１０例非结核分枝杆菌和８例非分枝杆菌未出现目标ＤＮＡ条带，所用引物扩增ｒｐｏＢ基因２１５ｂｐ片段为结核分枝杆菌复合群异性的。     

医院感染肠球菌的分布特点及其药敏分析

目的了解医院感染肠球菌的分布特点及其药敏情况,供临床参考。方法对2007年9月至2008年12月期间,从各临床科室送检标本中分离到的肠球菌223株进行分析与药敏实验。结果分离到的肠球菌中,粪肠球菌和尿肠球菌分离率最高,分别是68．24％和26．61％,分离出肠球菌最多的标本是尿液、痰和胆汁,分别是88株、45株和36株,粪肠球菌和屎肠球菌对万古霉素敏感率最高达97．48—98．38％,其次呋喃妥因和氨苄西林,敏感率在53．23～84．27％,对环沙星和氧氟沙星6种抗生素敏感率在24．50～53．22％。结论医院感染肠球菌以泌尿道和呼吸道最为常见,感染的肠球菌对常用抗菌素耐药性高,且呈多重性耐药,并已出现对万古霉素不敏感株,应引起关注。     

聚合酶链反应-单链构象多态性技术快速筛选结核杆菌的利福平耐药性

目的：探讨利用分子生物学方法直接快速检测结核分枝杆菌利福平（RFP）药物敏感性的可行性。方法：应用聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）技术分别检测了40株RFP药物敏感及耐药的结核分枝杆菌临床分离株。先用PCR扩增rpoB基因，随后用SSCP方法鉴定其扩增产物有无突变，并与药敏试验结果作对照分析。结果：所有临床分离株均观察到rpoB基因PCR扩增产物。40株RFP敏感的临床分离株SSCP带谱与结核分枝杆菌H37RV标准株相同，40株RFP耐药株中37株检测到突变图谱。与Bactec结果对照，用PCR-SSCP技术检测结核分枝杆菌RFP耐药性的敏感性为93％，特异性为100％。结论：结核分枝杆菌耐RFP是其rpoB基因突变所致。PCR-SSCP技术可用于结核分枝杆菌RFP药物敏感性的直接快速检测。     

结核分枝杆菌的耐药性研究

目的研究临床分离结核分枝杆菌耐药性,为科学选择抗结核药物提供依据。方法采用病人标本分离培养和药敏试验方法,对617例结核分枝杆菌临床分离株进行耐药性调查。结果本医院2011年度从住院结核患者痰标本中分离到617株结核分枝杆菌,均进行了临床常用抗结核药物敏感试验。所分离的临床株结核分枝杆菌对异烟肼和利福喷叮的耐药率均超过31%;对利福平和链霉素的耐药率超过27%,对利福布叮、丁胺卡那霉素耐药率超过15%。结论该医院临床分离的结核分枝杆菌耐药率处于较高的水平,提示临床应根据药敏试验结果选择抗结核药物,控制耐药结核菌株的产生。