猪型(H1N1)流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因来源的研究

目的 研究2002年我国内地从猪群中分离的猪型(H1N1)毒株HA和NA基因来源。及其使猪致病的原因。方法 用PCR扩增目的基因，用P^GEM-T Easy Vector，4℃过夜连接，重组质粒转入DH-10B细菌，筛选阳性菌落，酶切鉴定，送六合通公司自动测序，并作进化树分析。结果 3株猪型(H1N1)病毒的HA和NA基因属猪型(H1N1)流感病毒，而不同于其他禽或人的H1N1亚型流感病毒。2002年猪型毒株由1991年猪型毒株演变而来。近来我国内地猪群中猪型毒株活动增强，其对猪能致病是由于病毒粒HA和NA蛋白抗原性发生变异所造成。结论 3株猪型病毒的HA和NA基因来源于猪型(H1N1)毒株。近来猪型毒株对猪具有致病性和活动增强是由于其HA和NA蛋白分子上氨基酸序列发生替换所造成。     

2009H1N1流感病毒神经氨酸酶基因克隆与表达

目的制备2009H1N1流感病毒神经氨酸酶（NA）重组蛋白,为建立H1N1快速检测方法和神经氨酸酶抑制剂筛选模型奠定基础。方法采用MDCK细胞方法分离2009H1N1流感病毒,提取病毒RNA,RT-PCR生成NA基因,构建原核表达载体PET-102/D-TOPO-NA,IPTG诱导表达重组蛋白,SDS-PAGE凝胶电泳、WersternBlotting鉴定重组蛋白。结果成功分离2009H1N1流感病毒,NA蛋白119、152、275、292位氨基酸分别为Glu、Arg、His和Cys。SDS-PAGE凝胶电泳蛋白分子相对分子质量约为64000,与预期一致。WesternBlotting证实该蛋白具有神经氨酸酶抗原活性。结论 IPTG诱导原核表达神经氨酸蛋白的最适浓度为0.1mmol/L。实验得到的蛋白尚需进一步纯化。     

1994～1997年深圳地区流感病毒活动及H3N2亚型毒株HA1基因演变特点

目的　了解近几年流感病毒在深圳地区活动的特点及甲３（Ｈ３Ｎ２） 亚型毒株ＨＡ１ 基因演变概况。方法　病毒分离采用常规的鸡胚双腔接种,毒株检定用常量半加敏ＨＩ测定。新鲜收获含病毒粒的鸡胚尿囊液用来提取ＲＮＡ,经逆转录合成ｃＤＮＡ,经聚合酶链反应（ＰＣＲ） 扩增,产物纯化,采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果　近几年来深圳地区流感活动概况与全国情况相一致：在人群中仍同时流行Ｈ３Ｎ２,Ｈ１Ｎ１ 亚型和乙型毒株,当甲型毒株活动减弱时,乙型毒株活动就增强,反之,甲型毒株增强时,乙型毒株就减弱。随着时间的推移,Ｈ３Ｎ２ 亚型毒株ＨＡ１ 基因不断地发生点突变,这种突变严重受人群免疫压力所影响,１９９６ 年的毒株与１９９５ 的毒株相比,不仅氨基酸替换点中多数是位于抗原决定簇区或受体结合部位上,并增加两个糖基化位点,故导致Ｈ３Ｎ２ 毒株於１９９６ 年活动明显增强。结论　近来在深圳地区人群中仍同时流行着Ｈ３Ｎ２,Ｈ１Ｎ１ 亚型和乙型流感病毒。然而,不同年其优势毒株是不一样的。１９９６ 年Ｈ３Ｎ２ 毒株活动增强是由于其ＨＡ１ 区氨基酸序列发生替换所造成。     

我国猪群中H9N2亚型毒株HA和NA基因特性的研究

目的 了解我国内地从猪中分离到H9N2亚型毒株HA和NA基因来源及它们使猪致病的原因。方法 用PCR扩增目的基因，与P^GEM-T Easy Vector4℃过夜连接，重组质粒转化DH-10β细菌，筛选阳性菌落，酶切鉴定，测序。然后，进行进化树分析。结果 两株猪H9N2毒株HA蛋白分子上第226位上氨基酸为L，这与从人和猪所分离出的H9N2毒株相同，其连接肽属对禽致病的毒株，但它们的序列为R-L-S-R，而不是R-S-S-R；其NA蛋白茎区第62～64位存在掉失，这与A／Shaoguarn/408／98，A／Swine／Hong Kong／9／98及A／Duck／Hong Kong／y280／97(H9N2)毒株相同；HA与NA基因进化树分析表明，两株猪H9N2毒株的HA基因接近于A／Chicken／Hong Kong／G23／97和A／Chicken／Hong Kong／G9／97．而NA基因接近于A／Shaoguan／408／98毒株。结论 两株猪H9N2亚型毒株的HA和NA基因可能性最大来自禽H9N2毒株。由于其HA蛋白分子上连接肽氨基酸序列发生替换，可能造成了它们对猪具有致病性。禽H9N2毒株NA蛋白茎区氨基酸掉失，造成了它们能直接感染猪。     

一株鹅H5N1亚型流感病毒基因特性的分析

目的 弄清了Ａ／鹅／广东／２／９６（Ｈ５Ｎ１）毒株对鹅致病的分子生物学基础 ，研究香港区人群中发生的禽（Ｈ５Ｎ１）流感的病因，方法 病毒ＲＮＡ经逆转录合成ｃＤＮＡ经聚合酶链反应（ＰＣＲ）扩增，产物纯化，采用双脱链末端终止法测定核苷酸序列，结果 Ａ／鹅／广东／２／９６（Ｈ５Ｎ１）与Ａ／ＨＫ／１５６／９７（Ｈ５Ｎ１）毒株ＲＮＡ４核苷酸序列有２２个位点不同（同源性为９８．８％）无任何掉失或插入。它与人和     

禽H9N2亚型流感病毒能感染人的发现

目的了解禽（Ｈ９Ｎ２）亚型流感病毒是否能感染人。方法对人、鸡和猪进行Ｈ９亚型毒株血清流行病学调查。对流感样患者和鸡咽喉部采样,用常规鸡胚双腔法分离流感病毒并进行毒株鉴定。对分离出Ｈ９Ｎ２亚型毒株的患者进行个案调查。结果约１９％的人含有对Ｈ９Ｎ２毒株的抗体,其ＨＩ滴度为≥２０,从流感样患者中分离到５株Ｈ９Ｎ２病毒。结论Ｈ９Ｎ２亚型毒株能自然感染人。     

用MDCK细胞分离出禽H9N2亚型流感病毒

对患儿咽拭子用MDCK细胞病毒分离、患儿及其母亲血清H1测定以确定广州市是否有禽流感(H9N2)感染.咽拭子分离出禽流感H9N2及出现自身H9N2抗体,H1滴度160,母亲H9N2抗体1:20.可确定广州市有H9N2感染,并提示H9N2可通过人传播人而感染.     

靶向甲型流感病毒N1亚型神经氨酸酶抗体的制备及鉴定

目的制备1株靶向甲型流感病毒N1亚型神经氨酸酶(neuraminidase, NA)的功能性抗体FNA1, 并对其进行鉴定。方法依据单链抗体(single-chain antibody fragment, scFv)序列信息, 合成FNA1重链以及轻链可变区序列, 连入抗体哺乳细胞表达载体pFRT-IgG1κ, 构建重组表达质粒pFRT-IgG1κ-FNA1。利用瞬时高效表达系统ExpiCHO以及亲和纯化技术获取抗体蛋白FNA1。ELISA检测FNA1与甲型流感病毒N1亚型NA抗原的结合, 流式细胞术分析FNA1与细胞膜表面表达N1亚型NA抗原的结合。通过抗体抑制NA蛋白活性试验检测抗体FNA1的体外功能活性。结果蛋白质电泳结果显示制备获取了高纯度FNA1。FNA1特异性识别结合N1亚型的NA抗原, 且呈浓度依赖效应。FNA1能通过结合细胞膜表面表达的N1亚型NA蛋白, 有效阻断细胞膜表面的NA活性, 从而抑制包装的假病毒从细胞表面释放, 继而抑制进一步的靶细胞感染。结论获得1株具有体外功能活性的靶向甲型流感病毒N1亚型NA蛋白的抗体FNA1。     

1999-2007年佛山市流感病毒活动情况及甲3亚型病毒HA1基因分析

目的总结1999-2007年佛山市流感病毒流行情况,分析甲3亚型（H3N2）毒株流行与其HA1基因进化的关系。方法用MDCK细胞分离流感病毒,培养后血凝阳性者进行型别鉴定。随机抽取每年2～3株甲3亚型毒株的细胞培养物提取RNA后进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果甲型和乙型流感病毒在佛山市人群中同时流行。甲型流感毒株是人群感染流感的主要型别。HA1区氨基酸序列与历年的流感疫苗推荐株相比,点突变率为0.3%～6.08%。发生替换的重要位点包括了抗原决定簇的17个位点、抗体结合部位的10个位点和1个糖基化位点。结论佛山市的甲1和甲3亚型流感毒株活动呈此起彼伏的优势株转换现象。甲3亚型新旧毒株交替迅速,大致按照毒株分离的年代聚类成进化树的不同小侧枝,表明新的流行株出现后可能迅速突破地域局限。提示地区实验室及时监测和研究流感毒株的发生和发展是流感监测网络建设的基础。     

北京市甲型H1N1型流感病毒基因检测与流行趋势分析

目的 通过对甲H1N1型流感病毒基因的检测分析,揭示其基因变异情况及探讨甲型流感病毒的流行趋势,为甲型流感的防控提供理论依据.方法 样本为患者鼻咽部的粘膜上皮细胞和分泌物.取200μL标本置于核酸分离纯化系统中提取核酸,然后以LightCycler 480 PCR仪进行核酸扩增,最后分析曲线判断结果.每份标本均对甲型H1N1流感病毒基质蛋白基因（M基因）、核蛋白基因（NP基因）、血凝素基因（HA基因）、人类的RNA酶P基因（RNase P基因）进行检测和分析.结果判定：M基因、NP基因、HA基因、RNase P基因均阳性,为真阳性;HA基因阴性,其它三种基因阳性,为可疑阳性.结果 共检测3673份样本,其中,阴性2404份,甲型流感阳性样本共1269份,阳性率34.5％;阳性样本中季节性甲型流感641份,占50.5％;甲型H1N1流感阳性628份,占49.5％（真阳性433份,占68.9％,可疑阳性195份,占31.1％）.在整个流行季,真阳性与可疑阳性在相同时间的检出率比值基本不变.甲型H1N1检出高峰在10月,季节性甲流则分别在9月和12月.中青年人群的阳性检出率为57.5％,儿童为39.9％,而60岁以上的老年人仅占2.6％.结论 甲型H1N1流感以M、HA、NP、RNaesP四种基因阳性毒株为主,其流行高峰出现在10月份,感染人群以中青年和儿童为主.     

2011-2014年青岛地区甲型H3N2流感病毒基因进化分析

目的 了解2011-2014年青岛地区人群甲型H3N2流感病毒流行株基因进化及抗原变异趋势.方法 选取2011-2014年间青岛地区流行的甲型H3N2流感病毒64株,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HA、NA、MP 3个基因片段,并进行序列测定,对各基因片段进行系统发育分析及基因和氨基酸位点变异分析.结果 HA进化树分析表明,甲型H3N2流感病毒基本上分为三大分支,并且每个分支与当年的疫苗株都不在同一分支上;HA1蛋白抗原决定簇共有8个位点发生了变化;NA蛋白酶活性中心及周围相关位点氨基酸组成保守,未检测到耐奥司他韦和扎那米韦的变异位点.M2蛋白均发生S31N突变.结论 2011-2014年青岛地区流行的H3N2流感病毒在持续不断地发生基因变异而产生抗原漂移;毒株全部为烷胺类药物耐药株,但对神经氨酸酶抑制剂敏感.     

人与猪群中H3N2亚型流感病毒间关系的研究

通过血清流行病学调查、毒粒ＨＡ１基因核苷酸序列分析和ＨＡ１蛋白氨基酸序列比较，证实了人与猪Ｈ３Ｎ２亚型毒株间存在着极为密切的关系，即Ｈ３Ｎ２亚型毒株新变种在人群中出现后，很快在猪群中就能找到它存在的依据。同时猪群中Ｈ３Ｎ２亚型毒株抗体阳性率高低反映出了人群中Ｈ３Ｎ２病毒活动程度的强弱。这些结果说明，猪可能在人流感疾病发生、流行和大流行株起源中起着重要的作用。同时猪群中流感病毒抗体阳性率可做为判断人群中流感活动程度的一个指标。     

猪型流感病毒血凝素基因的核苷酸全序列分析

对我国大陆首次从猪群中分离到的猪型（Ｈ１Ｎ１）流感病毒血凝素（ＨＡ）基因核苷酸全序列进行了测定，其长度为１７７８ｂｐ，共编码５６６个氨基酸，其中信号区１７个，ＨＡ１区３２６个，多肽连接区１个，ＨＡ２区２２２个。与Ａ／ＮＪ／１１／７６（Ｈ１Ｎ１）毒株ＨＡ蛋白分子上氨基酸序列相比，其同源性多１个糖基化点，然而其余的包括２个重叠的糖基化点均相同。     

应用巢式RT-PCR扩增HA和NA基因片段并测序鉴定甲型H1N1流感病毒

目的 建立一种利用巢式RT-PCR特异扩增HA和NA基因片段并测序鉴定甲型H1N1流感病毒的技术.方法 设计两套共7条特异引物,通过巢式RT-PCR分别扩增甲型H1N1流感病毒HA和NA基因片段并测序,所得序列与人感染甲型流感病毒主要HA和NA亚型序列进行进化树分析以对结果作进一步鉴定,蛋白序列比对后分析其特征.结果 4例甲型H1N1流感患者流感病毒HA和NA基因RT-PCR扩增均分别得到442 bp和543 bp片段产物.核苷酸序列进化分析表明,该4例患者HA和NA序列分别与2009年爆发的甲型H1N1流感病毒HA及NA序列聚集在一起,与季节性H1、H2、H3、人禽流感H5亚型及季节性N1、N2、人禽流感N1亚型特异分开.蛋白序列分析表明,4例患者流感病毒HA蛋白裂解位点附近氨基酸序列均为PSIQSR↓GLF,不具有高致病性流感病毒的特性,NA蛋白第275位氨基酸为His,未出现H275Y的耐药变异.结论 本方法能特异扩增甲型H1N1流感病毒HA和NA基因片段,测序后可用于甲型H1N1流感病毒的进一步鉴定;同时,得到的序列也可用于流感病毒致病力及耐药性的分析.