福建省志贺菌PFGE分型研究

目的了解福建省志贺菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况,描述基因群的流行及分布特征,探讨优势血清群的变迁规律。方法收集2005-2010年志贺菌96株,分离自临床患者。选择NotⅠ进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准。采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱,运用BioNumer-ics软件进行聚类分析。结果按照100%的相似度可将34株福氏志贺菌酶切图谱分为27种PFGE型别;将62株宋内志贺菌酶切图谱分为43种PFGE型别。根据TENOVER原则,福氏志贺菌有2个优势基因群G1-G2,宋内志贺菌有4个优势基因群GI-GIV。优势基因群集中分布于7～10月,其他PFGE型别分布比较分散,无明显时间和地区的聚集性。结论福建省志贺菌分子分型呈现多样性,宋内和F4c的某些基因群可能逐渐演变为福建省优势且稳定的志贺菌流行菌株。     

舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

水产品中副溶血性弧菌脉冲场凝胶电泳分型

目的 采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对水产品中副溶血性弧菌进行分子分型。方法 采用PFGE技术,对80株分离自11个国家和中国浙江省和山东省的水产品中的副溶血性弧菌进行分子分型;基因组DNA用Not I和Sfi I 2种酶进行消化。结果 Not I和Sfi I 2种内切酶均得到68种带型,综合系统树图中分成70种带型;Not I和Sfi I的分辨率分别为78.8%和76.3%;14株来自加拿大的菌株分聚成相似度100%的4组,其中有4株菌和10株菌分别聚成相似度91.8%和93.3%的2组;挪威和新西兰分别有3株和2株菌相似度为100%;其他国家的菌株无与本国相同的菌株。结论 2种酶均适合于副溶血性弧菌的PFGE分型,Not I的效果略好于Sfi I;菌株间的亲缘关系与来源地无明显关联,但具有毒性基因的菌株更易在系统发育树上处于较近的分枝上。     

食品及环境阪崎肠杆菌分离株的MLST和PFGE分型方法比较

目的:对PFGE和MLST方法在阪崎肠杆菌分型研究中的分辨力和潜在价值进行了比较研究和论述。方法:采用PFGE和MLST方法对本实验室分离的19株阪崎肠杆菌和一株标准菌株ATCC51329进行分型研究。结果:PFGE方法可将20株阪崎肠杆菌分为6大类群,共16个PFGE型,分辨力为0.9474。而MLST方法可将20株菌株分为12个ST型,分辨力为0.9263。结论:PFGE法较MLST法具有较高的分辨力,可用于阪崎肠杆菌的溯源研究,而MLST分型方法能通过全球比对数据库得到更多的关于进化和亲缘关系的分析资料,在致病研究、流行病学调查、进化研究方面优于PFGE法。     

四川省B群脑膜炎奈瑟菌脉冲场凝胶电泳分型分析

[目的]对四川省B群脑膜炎奈瑟菌分离菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,了解四川省B群脑膜炎奈瑟菌菌株的分子流行病学特征.[方法]对健康人群和流行性脑脊髓膜炎病例密切接触者分离的55株B群脑膜炎奈瑟菌使用限制性内切酶NheI酶切、脉冲场凝胶电泳,电泳结果用BioNumerics软件进行聚类分析.[结果]55株B群脑膜炎奈瑟菌共分为33种PFGE型,呈现高度的多态性.其中健康带菌者的45株菌分为24个型,带型分布在年份和地区上没有关联,但局部地区的菌株呈现出PFGE型别一致的特征;10株病例的密切接触者分离的菌株分为9个型,无优势型别.[结论]四川省B群脑膜炎奈瑟菌菌株具有高度的遗传多样性,但在局部地区菜一时间段存在优势的PFGE型别的B群脑膜炎奈瑟菌菌株.     

用脉冲场凝胶电泳方法对O139霍乱弧菌分型的研究

目的：利用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术探讨O139群霍乱弧菌的分子分型方法。方法：用SfiⅠ酶和NotⅠ酶切O139群霍乱弧菌染色体DNA，经脉冲场凝胶电泳进行片段分离。结果：14株O139群霍乱弧菌经SfiⅠ酶切后电泳分离可得一个PFGE型，用NotⅠ酶切电泳可分为2个PFGE型。结论：脉冲场凝胶电泳技术分析O139群霍乱弧菌，分型发现微小差别有助于分析追踪疫情和来源。     

福建省50株沙门菌PFGE指纹图谱研究

目的 分析福建省鼠伤寒及肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱,研究其分型特征.方法 收集2009年50株沙门菌临床分离株,其中30株鼠伤寒沙门菌分离自婴幼儿腹泻患者,20株肠炎沙门菌分离自感染性腹泻患者.选择XbaⅠ酶对沙门菌染色体DNA进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准.采用PFGE技术分析电泳酶切...     

PFGE分子分型法在副溶血弧菌腹泻散发病人中的应用研究

目的:运用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对腹泻门诊病人的副溶血弧菌分离株进行分子分型,对缺乏聚集性信息的病例开展实验室监测。方法:对2010年7月27日至29日分离到的40株副溶血弧菌进行PFGE分子分型,利用BioNu-merics分析软件对图谱进行聚类分析。结果:40株副溶血弧菌PFGE指纹图谱可分为16个PFGE型(P1-P16),其中有6个型别分别有多株菌株处于同一聚类(P1、P2、P3、P8、P10、P13),结果显示在不同的腹泻监测点该时段可能存在多起聚集性病例。结论:应用PFGE分子分型,通过实验室监测可提示可能出现聚集性病例或暴发,结合流行病学调查资料可分析和确诊聚集性病例事件发生。     

PFGE技术对一起副溶血性弧菌引起食物中毒的同源性研究

目的:了解一起食物中毒事件中副溶血性弧菌(VP)分离株的同源性。方法:按国标方法进行VP的分离与鉴定;对分离出的VP做血清分型及tdh、trh毒力基因检测;用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术进行基因分型。结果:从10例患者肛拭子和1份砧板涂抹物中分离到的11株VP,血清型均为O3:K6,tdh毒力基因均为阳性,PFGE分型图谱也完全相同。结论:这是一起因VP污染了食品加工环节而导致的食物中毒事件。     

河南省登封市哨点医院布鲁氏菌病原学鉴定与分子型别研究

目的 分析河南省登封市2014-2016年30株布鲁氏菌的生物型别及PFGE分子分型特征,为布鲁氏菌病的病原学监测,暴发预警、溯源提供基线数据。方法 采集试管凝集试验(SAT)阳性病人静脉血10ml,双相血培养瓶培养与生化鉴定,AMOS-PCR鉴定布鲁氏菌生物型别;阳性菌株利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和BioNumerics7.0软件进行指纹图谱分析。结果 阳性病例以青壮年男性职业和密接人群为主;30株布鲁氏菌经鉴定28株为羊种,2株为牛种。羊种布鲁氏菌经脉冲场凝胶电泳后可分为2种带型,带型相似度在97.7%~100%之间;牛种布鲁氏菌可分为2种带型,带型相似度96.3~100%。结论 河南省监测哨点医院人感染布鲁氏菌存在羊种和牛种两种型别,羊种为优势型别;羊种与牛种菌株在PFGE带型特征上存在较大差异度。     

荧光PCR和PFGE在副溶血弧菌食物中毒诊断中的应用研究

[目的]探讨荧光PCR和脉冲场电泳（PFGE）在副溶血弧菌食物中毒调查中的应用。[方法]对中毒样品进行荧光PCR检测,副溶血弧菌临床分离株基因组DNA经NotI酶切,通过PFGE获得电泳图谱,利用BioNumerics软件对图谱进行聚类分析。[结果]部分样品荧光PCR检测结果呈阳性,同起食物中毒菌株PFGE图谱一致。[结论]荧光PCR可以快速准确的鉴定病原体。PFGE具有很强的菌株同源性分析能力,适用于食物中毒病原菌学鉴定和传染源溯源。荧光PCR和PFGE在食物中毒的快速诊断中可发挥重要作用。     

扬州市2014年食品从业人员沙门菌血清学及PFGE分型分析

目的 了解扬州市食品加工从业人员感染沙门菌的血清学分布及分子流行病学特征。 方法 采集2014年扬州市专项监测的14家餐饮单位食品从业人员肛拭子标本,增菌后取可疑菌落作血清学鉴定,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。 结果 共检查食品从业人员肛拭子标本1 035份,检出沙门菌14份,带菌率1.35%。分群中以D群和E群为主。对11株沙门菌经行PFGE分型共分为7个型别(P1～P7),相似性系数60.9%～100.0%。其中一所大学食堂(P5,N=4)与一家酒店(P3,N=2)的分离株带型分别一致。 结论 扬州市食品加工从业人员沙门菌血清型以D群和E群为主。PFGE结果显示不同监测地点的分离得到的沙门菌没有共同的感染来源,有两处食品加工场所分别存在特定的传染源,具有可能发生食品安全事件的风险。     

Appearance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) sensitive to gentamicin in a hospital with a previous endemic distinct MRSA

Since 1990 a clone of gentamicin and methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) has remained endemic in our hospital, but since January 1996 a gentamicin-sensitive strain has progressively replaced the previous clone. We characterized the phenotypic and molecular pattern of the MRSA strains isolated in our hospital in 1996 and compared prospectively the epidemiological, clinical and evolutionary characteristics of ninety patients infected or colonized by gentamicin-sensitive MRSA (GS-MRSA) (49) and by gentamicin-resistant MRSA (GR-MRSA) (41). Finally we studied the variation of aminoglycoside consumption in our hospital from 1989 to 1996. We observed two antibiotypes (GS-MRSA and GR-MRSA) corresponding to two major chromosomal patterns. Patients with GS-MRSA usually acquired the infection 72 hours after hospital admission. No significant differences were observed in epidemiological characteristics, clinical presentation and evolution between patients with GS-MRSA and GR-MRSA. Since 1989 aminoglycoside intake in our hospital has decreased by 46%.     

核酸脉冲电泳场技术在霍乱分子流行病学调查中的应用

目的：对深圳市某一霍乱疫点进行流行病学调查和传染来源追踪。方法：采用病原学方法和核酸脉冲电泳场技术，分析霍乱阳性菌株的酶切图谱，并比较图谱的差异。结果：同一疫点的5株霍乱阳性菌株均表现为DNA片段大小一致和数量相同的电脉图谱。结论：5株菌株为同一克隆的流行株。核酸脉冲电泳场分析技术适用于分析菌株的同源性和传染来源追踪。     

伤寒沙门菌的脉冲场凝胶电泳分型方法研究

目的：运用脉冲场凝胶电泳研究宁波市伤寒沙门菌的分子流行病学。方法：选择XbaⅠ酶对伤寒沙门菌染色体DNA进行酶切，采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱，了解其流行状况。结果：14株伤寒沙门菌，根据电泳图谱分析，可分为3个带型。结论：PFGE具有分辨力高，重复性好的特点，是研究伤寒沙门菌分子流行病学较好的基因分型方法。     

布鲁菌脉冲场凝胶电泳图谱分型方法建立

目的 建立我国95株布鲁菌的染色体DNA脉冲场凝胶电泳图谱,进行布鲁菌的分子遗传学分类鉴定。方法 选择我国不同地区、不同时限分离的布鲁菌100株(包括19株标准布鲁菌株),应用SeaKem Gold琼脂糖胶块纯化布鲁菌完整的染色体DNA,限制性内切酶XbaI消化后,进行脉冲场凝胶电泳分离(PFGE)。结果 XbaI酶切布鲁菌基因组DNA后,可产生20~500kbp范围的15~25条酶切片段,并可以在PFGE凝胶上被很好的区分开。PFGE可在种的水平上区分布菌各种标准株,76株中国分离株可被分为39种PFGE类型,并聚为4大类。PFGE与传统分型方法比较,2者的一致性达63%。结论 脉冲场凝胶电泳图谱可对布鲁菌进行遗传学分类鉴定,在布鲁菌的分子流行病学研究中具有重要意义。     

中国六省致病小肠结肠炎耶尔森菌的脉冲场凝胶电泳分析

目的 对中国致病小肠结肠炎耶尔森菌分离株进行脉冲场凝胶电泳分析。方法 参照美国疾病预防控制中心PulseNet实验方法对中国6省165株致病小肠结肠炎耶尔森菌进行脉冲场凝胶电泳分析，使用BioNumerics软件进行聚类分析，并按照PulseNet命名原则对带型进行命名。结果 将114株O：3血清型小肠结肠炎耶尔森菌分成25个带型；K6GNllC30012（50株）、K6GNllC30015（19株）及K6GNllC30016（10株）是其主要带型，三个主要带型之间聚类相似性很高。将51株O：9血清型小肠结肠炎耶尔森菌分为14个带型；其中K6GNllC90004（22株）与K6GNllC90010（13株）是其主要带型，K6GNllC90004与K6GNllC90010带型之间有一定的差异。O：3与O：9血清型的主要带型之间有明显的差异。结论 O：3血清型的小肠结肠炎耶尔森菌可能起源于一个克隆系，且在不同地区和年代变异很小；O：9血清型的小肠结肠炎耶尔森菌可能起源于两个不同的克隆系，且各自有一定的变异。O：3与O：9血清型的小肠结肠炎耶尔森菌亲缘关系较远。     

亚胺培南耐药铜绿假单胞菌耐药性及同源性分析

目的：了解亚胺培南耐药铜绿假单胞菌耐药表型与基因型的关系。方法：采用KB纸片扩散法进行药敏试验,脉冲场凝胶电泳技术分析其同源性,并对其耐药表型与基因型的关系进行了分析。结果：21株IRPA菌株分为A-H共8型,其中A型又分为A1、A2两个亚型。在病人和环境标本中的IRPA菌株均以A1型为主。结论：采用优化的实验室条件可以较好的对IRPA菌株进行PFGE分型,PFGE结果提示本院存在一个PFGE-A1型的IRPA引起的院内感染,PFGE结果为探明病原菌的流行情况提供理论依据,应根据分型结果,加强相关病区的消毒、隔离工作,切断IRPA的医院感染途径,避免IRPA医院感染的发生和流行。