3种耐药结核分枝杆菌检测及临床应用

目的探讨耐链霉素(SM)、利福平(RFP)、异烟肼(INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG3种基因突变情况及在耐药检测中临床应用的可行性。方法采用聚合酶链反应单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对221株临床分离株,100例涂片阳性肺结核病痰标本进行rpsL、rpoB、KatG3种基因突变分析。221株临床分离株中敏感株34株,单耐SM、RFP、INH分别为32株、37株、28株,耐SH、SR、HR、SHR分别为14株、30株、8株、52株,100例痰标本耐SM、RFP、INH分别为51例、54例、40例。结果以结核分枝杆菌H37RV为对照,34株敏感株rpsL、rpoB基因SSCP图谱正常,特异性为100%,KatG基因2株SSCP图谱异常,特异性为94.1%。单耐SM、RFP、INH结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为78.1%(25/32)、86.5%(32/37)、53.6%(15/28),耐多药(SM、RFP、INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为78.1%(75/96)、88.9%(80/90)、55.4%(41/74)。100例涂片阳性肺结核患者痰标本经PCR扩增67例阳性,直接检测耐SM、RFP、INH结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别为74.1%(25/35)、89.1%(33/37)、48.0%(12/25),阳性检出率分别为49.0%、61.1%、30.0%。结论耐单药和耐多药(SM、RFP、INH)结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率分别经χ2分析差别无统计学意义(P>0.05),也就是耐单药和耐多药结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG基因突变率相同,耐多药结核分枝杆菌rpsL、rpoB、KatG3种基因突变相互之间无影响。PCR-SSC技术有望直接用于检测涂片阳性肺结核患者痰标本中rpsL、rpoB、KatG基因突变判定耐药,但还需在方法学上进一步改进以达到技术容易掌握、操作简便、影响因素少,结果检出率高等。     

广东地区临床分离结核分枝杆菌KatG、rpoB、rpsL耐药基因变异研究

目的本研究主要针对从广东地区500例疑似结核病患者痰液中分离的结核分枝杆菌对异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)耐药情况与其对应的突变基因katG、rpoB、rpsL 关系研究.方法采用PCR和DNA测序法对结核分枝杆菌临床分离株katG、rpoB 和rpsL 基因进行序列分析.结果分离得到耐INH 35株、耐RFP 27株、耐SM 25株.INH耐药株katG 基因突变率为71.4%(25/35),RFP耐药株rpoB 基因的突变率为81.5%(22/27),SM 耐药株rpsL 基因突变率为76%(19/25);INH以Ser315Thr突变60%(21/35)最常见,RFP以Ser531Leu突变55.6%(15/27)最常见,SM以Lys43Arg位氨基酸突变72%(18/25)常见.结论 katG、rpoB 和rpsL 基因突变被证实是广东地区结核分枝杆菌INH、RFP和SM耐药性产生的主要分子机制,PCR-DNA测序法可快速检测结核分枝杆菌INH、RFP和SM耐药性.     

结核分支杆菌耐药基因的杂交检测

目的采用PCR-反向斑点杂交检测结核分支杆菌中rpoB基因、KatG基因和rpsL基因突变。评价该方法检测结核分支杆菌利福平（RFP）、异烟肼（INH）和链霉素耐药性,探讨直接检测结核患者痰标本的可行性。方法用PCR-反向斑点杂交技术分析对75株临床分离株和45例肺结核患者涂阳痰标本进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测。结果临床耐药株分离株进行rpoB、rpsL和KatG基因突变的检测,其突变率分别为83.9%、62.5%、57.1%。肺结核患者涂阳痰标本中耐药株突变率分别为81.0%、60.0%、52.9%。结论rpoB基因、KatG基因和rpsL基因突变与结核分支杆菌耐利福平、异烟肼和链霉素密切相关,应用PCR-反向斑点杂交技术可快速检测结核分支杆菌对异烟肼、链霉素和利福平耐药性。PCR-反向斑点杂交技术有望成为结核分支杆菌耐药性检测的重要方法之一。     

宁波地区结核分枝杆菌基因突变位点确证及与异烟肼、利福平耐药关系研究

【摘要】： 目的 阐明宁波地区初治肺结核患者结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA基因突变特征,深入分析基因突变与异烟肼（INH）、利福平(RFP)耐药关系,为临床抗结核治疗提供科学依据。方法 采用1%比例法对889例结核分枝杆菌临床分离株进行药敏检测,对其中的耐药菌株提取DNA,PCR扩增,对耐药菌株katG、inhA、rpoB基因测序,分析三种基因特征及基因突变与单耐药、耐多药关联性。结果 889例结核分枝杆菌临床分离株中,发现39例耐药结核分枝杆菌,其中单耐药24例,单耐药率2.70%,15例耐多药,耐多药率1.69%。39例耐药菌株中,有14例耐多药菌株发生rpoB、katG基因错义突变,突变率93.33%,3例发生inhA基因错义突变,突变率20.00%,rpoB基因450位点（ser450leu）突变率53.33%,katG基因315位点（ser315thr）突变率86.67%,463位点（arg463leu）突变率93.33%。3例单耐利福平菌株rpoB基因在463位点（arg463leu）全部发生错义突变。21例单耐异烟肼菌株中有19例发生katG基因错义突变,突变率90.47%,315位点（ser315thr）突变率63.16%,463位点（arg463leu）突变率78.95%;9例发生inhA基因错义突变,突变率42.86%,145位点（val145gly）突变率77.77%;5例发生rpoB基因错义突变,突变率23.81%,位点较分散。另外,39例耐药菌株中,有10例发生rpoB、katG、inhA多基因联合突变,突变率25.64%。结论 rpoB、katG、inhA基因突变与初治肺结核患者耐药密切相关,上述三种基因在450（ser450leu）、315（ser315thr）、463（arg463leu）、145（val145gly）等位点突变是本地区结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药的重要机制之一。     

结核分枝杆菌异烟肼耐药基因katG点突变的快速检测

目的：探讨快速检测结核分枝杆菌异烟肼（INH）耐药基因型的分子药敏方法。方法：用聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）检测了30株INH敏感菌株及30株耐药株的katG基因，随后用SSCP方法鉴定扩增产物有无突变，以结核分枝杆菌H37Rv作对照。结果：所有INH敏感株均观察到katG基因扩增产物，30株INH耐药株中28株观察到katG基因扩增产物。以H37Rv标准株为对照，30株敏感株SSCP带谱与对照相同；28株INH耐药株中13株与对照相同，15株有不同程度的差异。与药敏试验比较，PCR－SSCP检测INH耐药结核菌的敏感性为57%，特异性为100％。结论：多数结核分枝杆菌耐INH是由于katG基因突变所致，用PCR－SSCP筛选突变株可达到快速检测结核分枝杆菌INH耐药基因型的目的。     

结核分支杆菌rpoB基因突变与耐利福平的临床应用

目的：研究结核分支杆菌耐利福平（RFP）分离株rpoB基因突变情况并评价其应用价值。方法：采用聚合酶链反应一单链构象多态性（PCR—SSCP）方法对355株结核分支杆菌临床分离株（其中敏感株109株，耐RFP或含耐RFP株246株）rpoB基因进行检测，并对其中17株耐药株用双氧末端终止法进行测序分析。结果：以结核分支杆菌H37RV为对照，109株药物敏感株的rpoB基因均无突变，特异性100％；246株耐药株中，225株rpoB基因SSCP图谱异常，其敏感性91．5％。17株耐药株（其中SSCP异常11株，正常6株）PCR扩增产物经测序证实，11株在531位密码子TCG-TTG，4株在526位密码子CAC-TAC，1株在516位密码子GAC—GTC，1株未改变。结论：rpoB基因突变是耐RFP结核分支杆菌耐药性的主要分子机制；其最常见的突变位点是531位色氨酸和526位组氨酸，应用PCR—SSCP技术可快速检测结核分支杆菌对RFP的耐药性。     

用分子生物学技术快速检测耐多药结核分枝杆菌

目的：用PCR—SSCP技术检测耐INH、RFP、SM结核分枝杆菌分离株KatG、rpoB、rpsL基因突变，评价其在快速检测结核分枝杆菌耐药性方面的临床价值。方法：以结核分枝杆菌H；vRv为对照，20株耐多药菌株和20株敏感株，分别用PCR—SSCP方法检测KatG、rpoB、rpsL基因突变，并将SSCP结果与药敏试验结果作对照分析。结果：PCR—SSCP方法检测20株敏感株SSCP带语均与H37RV标准株相同，而20株耐多药结核分枝杆菌KatG、rpoB、rpsL基因突变的阳性率分别为70％，100％和75％。发现20株耐多药菌株中有11株(55％)共INH、RFP、SM3种耐药遗传标志均发生突变，7株(35％)有2种耐药遗传标志突变，2株(10％)只有RFP耐药标志突变。结论：PCR—SSCP方法敏感、特异，可快速检测结核分枝杆菌KatG、rpoB、rpsL耐药基因突变，有利于耐多药结核分枝杆菌耐药性的快速检测。     

耐药基因检测在初次复治肺结核患者中的应用价值

目的 研究耐药基因检测在初次复治肺结核中的临床价值.方法 选取河北省胸科医院2014年1月-2015年12月收治的初次复治时痰液或支气管肺泡灌洗液浓缩集菌抗酸染色阳性的肺结核患者128例,采用BACTEC MGIT 960培养基对痰标本进行培养,同时分别选取高浓度和低浓度异烟肼(INH)和利福平(RFP)进行药敏试验,并采用基因芯片法对药敏阳性菌株进行耐药基因突变检测,分析药敏阳性菌株的耐药基因突变率.结果 128例初次复治肺结核患者中,对RFP的耐药率为25.00％,对INH的耐药率为22.66％.基因芯片检测耐RFP结核分枝杆菌的rpoB基因的符合率为96.23％、特异性为97.46％、敏感度为91.67％;基因芯片检测耐INH结核分枝杆菌的katG基因的符合率为94.89％、特异性为98.14％、敏感度为81.94％.结论 对初次复治肺结核患者耐药基因的检测,可快速、准确的检测出结核分枝杆菌耐药基因,准确推断耐药种类,为临床早期诊断及治疗提供科学指导.     

糖尿病合并肺结核患者耐多药结核分枝杆菌基因突变的检测

目的：探讨耐多药结核分枝杆菌临床分离株rPOB、KatG和rpsL基因突变在糖尿病合并肺结核患者耐药性检测中的应用价值。方法：采用聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）技术对41株自糖尿病合并肺结核患者痰液中培养分离的同时耐利福平（RFP）、异烟肼（INH）、链霉素（SM）的多耐药临床分离株和46株对RFP、INH、SM敏感株的rPOB、KatG、rpsL基因突变状况。结果：46株药物敏感株的rPOB、KatG、rpsL基因SSCP图谱正常，特异性为100％。PCR扩增产物SSCP分析结果显示：41株多耐药临床分离株中，36株rPOB基因图谱异常，26株KatG基因图谱异常，29株rpsL基因图谱异常，检测敏感性分别为rPOB（87．8％）、KatG（63．4％），rpsL（70．7％）。结论：结核分枝杆菌对RFP、INH、SM产生耐药性的机制主要是由于rPOB、KatG和rpsL基因突变所致。     

59株耐药结核分枝杆菌DNA芯片检测结果分析

目的 探讨结核分枝杆菌基因突变和耐药性的关系。方法 用DNA芯片检测和测序对59株耐药结核分枝杆菌进行耐异烟肼(katG、inhA、ahpC)、耐利福平(rpoB)基因检测。结果 59株耐药分枝杆菌菌株中。分别有40株(40／59)测出ropB基因突变。有32株(32／59)测出katG基因突变。另有三株katG缺失．同时测出两种及两种以上基因突变32株，改良罗氏培养法检测出27株为耐异烟肼、利福平菌株中，基因芯片检测24株(24／27，占88．9％)有基因突变。其中18株存在两种或两种以上基因突变(18／27)。另抽取11株进行DNA测序，与芯片检测结果完全相符。结论 用DNA芯片检测结核分枝杆菌对异烟肼、利福平的耐药性有较高的特异性和灵敏度，与培养法检测结果基本吻合。     

结核分枝杆菌katG和inhA基因突变的研究

为了解结核分枝杆菌耐异烟肼（ＩＮＨ）分离株ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列的突变情况，探讨其在ＩＮＨ耐药性中的可能作用。应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）和ＰＣＲ－单链构象多态性（ＳＳＣＰ）方法对６２株结核分枝杆菌临床分离株的ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列进行分析。ＰＣＲ分析结果显示：ｋａｔＧ基因和ｉｎｈＡ调节序列的敏感性为１～１０ｐｇＤＮＡ；其引物ＰＣＲ扩增都具有较高的特异性。以Ｈ３７Ｒｖ标准株为对照，１３株敏感株中，１２株ｋａｔＧ基因扩增产物ＳＳＣＰ泳动正常，１株ｋａｔＧ异常；２４株耐非ＩＮＨ抗结核药物株中，８株ｋａｔＧＳＳＣＰ异常；上述２７株的ｉｎｈＡ调节序列ＳＳＣＰ均泳动正常。２５株耐ＩＮＨ株中，３株ｋａｔＧ基因ＰＣＲ扩增阴性，２２株ｋａｔＧ扩增阳性，其中１６株ＳＳＣＰ泳动异常；４株ｉｎｈＡ调节序列ＳＳＣＰ泳动异常，其ｋａｔＧ基因ＳＳＣＰ也异常。结果表明，某些结核分枝杆菌ＩＮＨ耐药性可能是由于其ｋａｔＧ基因完全缺失、ｋａｔＧ基因或ｉｎｈＡ调节序列突变所致，但某些菌株也可能与其无关，是其它耐药基因所致或存在多种机制，尚需进一步探讨。     

Molecular analysis of isoniazid-resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from India

The presence of mutations in specific regions of katG, inhA, oxyR-ahpC and kasA associated with isoniazid (INH)-resistant clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis from India were analysed by DNA sequencing. Point mutations in the katG gene at codon 315 and a mutation at codon 138 were detected in 64.3% (45/70) and 4% (1/25) of isolates, respectively. Polymorphisms at codon 463 of the katG gene were found both in resistant and sensitive isolates. Mutation at the inhA and oxyR-ahpC promoter regions occurred in 11.4% (8/70) and 35.0% (14/40) of the isolates, respectively. No mutation was found to occur in kasA and inhA structural gene regions. Of the 70 resistant isolates studied, 55 (78.6%) showed mutation in the regions sequenced. This is the first comprehensive molecular analysis of INH resistance in India, which suggests that point mutation rather than deletion and insertion is the major cause of INH resistance.     

234例痰菌阳性肺结核患者的耐药性分析

目的对234例住院患者痰标本获得的结核杆菌做耐药性检测,为临床制订抗痨方案提供一定的参考依据。方法统计2012年1月～2013年8月234例痰培养阳性患者痰标本的耐药情况,同时分别做一线药物：异烟肼（INH）、利福平（RFP）、乙胺丁醇（EMB）、链霉素（SM）的药敏试验,了解各药在初治和复治患者中的耐药情况。结果234例中。175例存在耐药情况,109例初治患者和125例复治患者对INH的耐药例数分别为43、73例,耐药率分别为18．4％、31．2％,对RFP的耐药例数分别为36、52例,耐药率分别为15．4％、22．2％,对EMB的耐药例数分别为14、35例．耐药率分别为5．98％、14．96％,对SM的耐药例数分别为21、33例,耐药率分别为8．97％、14．1％。结论初治和复治患者均对INH的耐药率最高,复治患者的耐药率明显高于初治患者。     

PhaB和FQ-PCR两种快速检测结核分枝杆菌方法的比较

目的比较裂解型分枝杆菌噬菌体检测技术(Phage amplified biologically assay,PhaB)和荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)快速检测临床标本中结核分枝杆菌的优缺点及临床应用价值。方法对142例肺结核患者的痰标本和41份非结核性痰标本应用PhaB法和FQ-PCR进行检测和结果比较。结果PhaB法阳性76例,阳性率53.5%;FQ-PCR法阳性84例,阳性率59.1%。PhaB法和FQ-PCR法相比,有统计学差异(P<0.05)。2种方法检测41份非结核性痰标本均为阴性。结论两种方法能快速、简便、灵敏、特异检测结核分枝杆菌,同时又有不同的特点。     

糖尿病合并肺结核患者结核分枝杆菌L型感染的研究

目的研究糖尿病合并肺结核患者结核分枝杆菌L型的感染情况,探讨其对临床的指导意义。方法选取2009年1月至2011年12月淮南东方医院总院收治的初诊肺结核患者128例。其中,糖尿病合并肺结核患者60例(研究组),单纯涂阳肺结核(没有合并糖尿病)患者68例(对照组)。两组患者均进行痰结核分枝杆菌细菌型和L型培养,并对培养物进行涂片镜检、鉴定,同时对L型培养物进行PCR鉴定,并对所分离到的L型菌株进行回复性的实验。结果研究组60例糖尿病合并肺结核患者中,结核分枝杆菌细菌型培养阳性13例(21.67%),L型培养阳性28例(46.70%),两者之间差异极其显著(χ2=7.86,P<0.05);其中糖化血红蛋白(HbA1c)≤6.5%的糖尿病合并肺结核患者L型阳性检出率为33.40%,糖化血红蛋白(HbA1c)>6.5%L型阳性检出率为86.10%;两者之间差异显著(χ2=8.76,P<0.05)。经PCR鉴定,28例L型培养阳性物中,23例呈阳性反应,5例呈阴性反应。对照组68例单纯性肺结核患者中,细菌型培养阳性38例(55.89%),L型培养阳性4例(5.89%),PCR鉴定均呈阳性反应。结论糖尿病患者合并肺结核后结核分枝杆菌L型的感染率较高;其中血糖控制不佳的患者结核分枝杆菌L型的感染率比血糖控制较好的患者感染率高。大多数结核分枝杆菌L型具有回复为细菌型而导致结核病的内源性复发的潜在倾向。糖尿病是并发结核的高危因素,我们通过结核分枝杆菌L型检测可以发现隐藏的糖尿病合并肺结核阳性患者,减少漏诊、误诊现象。而治疗效果不佳的糖尿病合并肺结核患者,能通过结核分枝杆菌L型的检测证实有结核分枝杆菌L型的存在,能够及时调整治疗方案,提高诊疗效果,缩短病程。取得良好的社会效益。     

单管半套式PCR-SSCP用于结核分支杆菌rpoB基因突变的研究

目的 ①证明单管半套式聚合酶链反应(PCR)是检测结核分支杆菌的特异性方法;②研究结核分支杆菌rpoB基因突变与利福平耐药性的关系。方法 设计三条针对结核分支杆菌的特异性引物,采用单管半套式PCR-单链构象多态性(SSCP)方法对结核分支杆菌、其它分支杆菌和富含GC碱基的细菌进行分析。结果 ①结核分支杆菌标准菌株H_(37)Rv和55株临床分离株均扩增出一条193bp片段,其特异性为100％,敏感性约为10pgDNA;15株非结核分支杆菌和8株富含GC的细菌均未得到扩增;②55株结核分支杆菌临床分离株193bp扩增片段SSCP图谱特点:以H_(37)Rv为对照,15株利福平敏感株均无区别;40株耐药株除6株外其余34株SSCP图谱有明显区别,检测阳性率为85％。结论 单管半套式PCR检测结核分支杆菌简便、敏感、特异,结合SSCP可检出耐利福平结核分枝杆菌rpoB基因突变,此突变与利福平耐药关系密切。     

基因芯片在分支杆菌菌型鉴定及耐药检测分析

目的比较基因芯片技术鉴定分支杆菌菌型及检测其耐药性与传统培养药敏方法的一致性。方法应用基因芯片技术对713例涂阳肺结核患者的痰标本进行分支杆菌菌型鉴定及对异烟肼和利福平耐药检测,并与传统罗氏培养及比例法药敏试验进行比较。结果基因芯片技术对涂阳痰标本分枝杆菌菌型鉴定的灵敏度和特异度分别为99．83％和80．00％,Kappa值为0．85;检测异烟肼、利福平和异烟肼与利福平同时耐药的灵敏度和特异度分别为80．00％-93．44％和94．21％～98．33％,Kappa值分别为0．65—0．89。结论基因芯片技术对涂阳痰标本进行分枝杆菌菌型鉴定以及对异烟肼、利福平耐药性的检测,与传统培养药敏比较具有较高的一致性。     

基因芯片技术检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性的研究

目的探讨基因芯片技术在检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性的应用。方法收集21例临床诊断结核病患者体液标本经培养得到的分离菌液,进行基因芯片检测,包括利福平的rpoB基因位点和异烟肼的KatG和inhA基因位点,从而判断其耐药性。结果 21例样本中,利福平rpoB基因有10例突变,总突变率为47.6%,其中9例为531位点的（C-T）突变,1例526位点的（C-G）突变。与药敏试验的符合率为81.0%。异烟肼基因突变有6例,总突变率为28.6%,其中4例为KatG 315（G-C）突变,2例为inhA-15（C-T）突变。与药敏试验的符合率为90.5%。利福平的11例耐药株中,基因芯片检测8例为突变型,突变率为72.7%,在利福平的10例敏感株中,基因芯片检测2例为突变型,突变率为20.0%。在异烟肼的6例耐药株中,基因芯片检测5例为突变型,突变率为83.3%,在异烟肼的15例敏感株中,基因芯片检测1例为突变型,突变率为6.7%。结论基因芯片技术检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药性具有较高的特异性和敏感性,快速准确,可以应用于结核分枝杆菌耐药性的检测。