中医药治疗慢性心力衰竭的网络药理学研究进展

近年来网络药理学的出现为阐释中医药治疗慢性心力衰竭的作用机制提供了新的方法,相关研究也不断涌现。从网络药理学的主要研究方法、常用工具、中药活性成分及单药防治慢性心力衰竭的网络药理学研究、中药复方防治慢性心力衰竭的网络药理学研究以及网络药理学所面临的问题与挑战几方面进行综述,总结目前研究进展,并为今后的相关研究提供参考。     

计算机药理学的主要方法及其在中医方药治疗慢性肝病研究中的应用

中医药在慢性肝病、尤其对慢性炎症损伤、肝纤维化的治疗中具有一定的优势,但其药效成分和作用机制的研究仍面临巨大的挑战。介绍了近年来以虚拟筛选技术、各种组学技术以及网络药理学为主要内容的计算机药理学方法及其在中医药研究领域中的应用;结合研究实践对计算机药理学方法解析中药治疗慢性肝病的有效成分及作用机制的进展作了评述。认为综合运用计算机药理学的技术,结合传统的分子生物学、药理学方法,是解析治疗慢性肝病有效中药药效物质基础及作用机制的重要研究策略。     

基于网络药理学探究莪术油治疗胃癌的潜在活性成分及作用机制

目的:基于网络药理学探讨莪术油治疗胃癌的潜在活性成分及相关分子机制.方法:查阅相关文献,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合数据库(TCMID)及PubChem数据库检索莪术油的化学成分,并上传至Swiss Target Prediction平台获得潜在作用靶点;从GEO数据库获取GSE54129...     

中药有效成分治疗新冠病毒感染的网络药理学分析研究

在当今人工智能、医药大数据的背景下,基于网络药理学进行药物研发在医学领域具有重要价值。本文综述了网络药理学在中药领域的应用、中药在防治新冠病毒感染中的应用及基于网络药理学治疗新冠病毒感染的中药有效成分。     

桑枝总生物碱片研发历程回顾（二）：现代药理学理念诠释中药的药效特点及药理作用机制

2020年3月,我国原创降血糖天然药物"桑枝总生物碱片"获批上市,成为10几年来我国首个获批的中药创新药,也是糖尿病治疗领域唯一有效组分天然药物。在桑枝总生物碱的研发秉承中药传统理论并结合现代药理学研究方法,以确定桑枝中具有降血糖作用的有效组分及评价其药效特点及药理作用机制,故桑枝总生物碱具有其他中药不可比拟的作用靶点清晰、物质基础明确和降血糖作用显著等特点,其广泛的糖尿病治疗综合获益优于单纯糖苷酶抑制剂,具有天然药物独特的多重药理作用优势。本文从药理学研究角度,回顾利用现代药理学研究手段从"中药宝库"中寻找降糖药物过程,以及采用现代药理学手段及理念完善药效学评价体系,并广泛挖掘桑枝总生物碱多重药理作用特点及潜在机制。评述利用现代药理学研究理念,从天然药物中获取有效活性成分和新药研究中需要突破的技术瓶颈和理念创新,旨在为创新中药发展的"传承精华、守正创新"提供参考。     

“药物临床评价与定量药理学”国家级继续教育学习班第一轮通知

《中国临床药理学与治疗学》杂志社及中国药理学会数学药理专业委员会将于2008—10-25—29在安徽芜湖共同举办国家继续教育项目药物临床评价与定量药理学培训班[批号:2007—13-05—004(国);学分10分]。该项目由国内知名专家主讲,可为广大医药工作者提供系统、全面的药物临床评价和定量药理学知识和应用技能,让学员理解、掌握其     

第八次全国心血管药理学术会议（第一轮通知）

第八次全国心血管药理学术会议将于 2 0 0 3年 8月 6 - 9日在新疆乌鲁木齐召开。会议由中国药理学会心血管药理专业委员会主办 ,新疆医科大学承办。本次会议将邀请国内外著名心血管药理学家和相关学科的专家作大会学术报告。会议还将举行研究论文报告 ,并进行优秀论文评选 ,交流近年来国内心血管药理学研究的新成果。这是我国心血管药理学三年一度的盛会 ,欢迎药理学工作者及相关学科专家积极参加 ,推动心血管药理学的发展。美丽的新疆期待着您 ,热情的八月欢迎您的到来 !现将有关事项通知如下。征文内容 :药理学各个领域及其相关学科的研究…     

《临床药理学与治疗学》2015年征订启事

<正>本刊为中国科学技术协会主管,中国药理学会主办的全国性、学术性刊物,国家科技部中国科技论文统计源期刊,中国科技核心期刊。月刊,幅面尺寸280 mm×205 mm,120页,CN34-1206/R,ISSN1009-2501。以从事新药研究、临床药理学与治疗学工作的高中级医疗、科研、教学人员为主要读者对象。设有专论、综述与讲座、基础研究、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、临床药理学(包括药物基因组学及药物     

香港肝癌及胃肠道出血治疗新药研讨会

本刊编委会主席、白求恩医科大学肝病研究所名誉所长、中国药理学会药理学通报顾问叶维法教授及本刊编辑部钟振义主任应Jacobson Van den Berg Ltd邀请,将于今年9月     

《中国临床药理学与治疗学》2016年征订启事

<正>本刊为中国科学技术协会主管,中国药理学会主办的全国性、学术性刊物。月刊,全年12期,幅面尺寸280 mm×205 mm,120页,刊号CN34-1206/R,ISSN 1009-2501。以从事新药研究、临床药理学与治疗学工作的高中级医疗、科研、教学人员为主要读者对象。设有专论、综述与讲座、基础研究、定量药理学(包括药代动力学、药效动力学及药物临床评价等)、临床药理学(包括药物基因组学及药物蛋白组学等)、药物治     

柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的网络药理学作用机制

目的 应用网络药理学和分子对接方法探讨柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的作用机制。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库获得柴胡加龙骨牡蛎汤的活性成分及对应靶点,结合GeneCards数据库获取冠心病和焦虑症相关的疾病靶点;对药物与疾病靶点映射得到的柴胡加龙骨牡蛎汤治疗冠心病和焦虑症的共有靶点,通过STRING平台构建蛋白互作网络;运用R语言对共有靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用 Cytoscape3.7.1软件构建“活性成分-靶点-通路”网络;应用Auto Dock vina软件对PPI网络中关键靶点与主要活性成分进行分子对接。结果 网络分析结果显示,柴胡加龙骨牡蛎汤中74个有效活性成分参与调控92个共有靶点,通过调节丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、5-羟色胺能突触、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、蛋白激酶B(Akt)等121条信号通路实现对冠心病和焦虑症“异病同治”的作用。结论 现有研究初步揭示了柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症多成分、多靶点、多通路的作用机制,可能为后续深入研究提供新方向。     

Potential active compounds and molecular mechanism of Xuefu Zhuyu decoction for atherosclerosis,based on network pharmacology and molecular docking

To explore the potential active compounds and molecular mechanism of Xuefu Zhuyu decoction (XFZYD) in the treatment of atherosclerosis (AS) based on network pharmacology and molecular docking.The effective components and action targets of XFZYD were screened by using TCMSP database. And then, the action targets of AS were collected by GeneCards database. The intersection targets between the effective components’ targets of XFZYD and AS-related action targets were used to construct PPI networks. GO and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes enrichment analysis were performed on these intersection targets. Finally, molecular docking software was used to excavate the active compounds of the core targets VEGFA and AKT1.We detected 225 active components of XFZYD, and found that quercetin, kaempferol, luteolin, naringenin, β-sitosterol, isorhamnetin, stigmasterol, baicalein, nobiletin, and β-carotene are the potential active compounds of XFZYD; STAT3, IL6, JUN, VEGFA, MAPK14, and AKT1 are the core target proteins of the active compounds, among which VEGFA and AKT1 are the key target proteins. PPI network results showed that β-carotene, quercetin, kaempferol, luteolin, and naringenin had higher degree values and more corresponding targets than other 5 active compounds and had the stable binding ability to regulatory proteins VEGFA and AKT1. The core components β-carotene, quercetin, kaempferol, and luteolin exerted their therapeutic effects on AS by acting on the key target proteins VEGFA and AKT1 to regulate fluid shear stress and the AGE-RAGE signaling pathway and IL-17 signaling pathway of diabetic complications of AS. The molecular docking results showed that VEGFA and AKT1 had great docking ability with the targeted active compounds, and β-carotene is the best.The active components of XFZYD, including β -carotene, quercetin, kamanol, and luteolin, can act on VEGFA and AKT1. These active ingredients play a role in alleviating and treating AS by regulating fluid shear stress and participating in signaling pathways such AS AGE-RAGE of atherosclerosis and diabetes mellitus complicated with AS. β-carotene is a potential inhibitor of VEGFA and AKT1 and treats AS through antioxidant action.     

Prediction and validation of potential molecular targets for the combination of Astragalus membranaceus and Angelica sinensis in the treatment of atherosclerosis based on network pharmacology

Since the 20^th century, mortality rate due to cardiovascular diseases has increased, posing a substantial economic burden on society. Atherosclerosis is a common cardiovascular disease that requires urgent and careful attention. This study was conducted to predict and validate the potential molecular targets and pathways of Astragalus membranaceus and Angelica sinensis (A&A) in the treatment of atherosclerosis using network pharmacology. The active ingredients of A&A were obtained using the TCMSP database, while the target genes of atherosclerosis were acquired using 2 databases, namely GeneCards and DrugBank. The disease-target-component model map and the core network were obtained using Cytoscape 3.8.2 and MCODE plug-in, respectively. The core network was then imported into the STRING database to obtain the protein-protein interaction (PPI) network diagram. Moreover, gene ontology (GO) and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) enrichment analyses were performed using the HIPLOT online website. Finally, the small molecules related to key signaling pathways were molecularly docked and visualized. Under the screening conditions of oral bioavailability ≥ 30% and drug-likeness ≥ 0.18, 22 active ingredients were identified from A&A, and 174 relevant targets were obtained. Additionally, 54 active ingredients were found in the extracted core network. Interleukin (IL)-17 signaling pathway, tumor necrosis factor (TNF) signaling pathway, and Toll-like receptor (TLR) signaling pathway were selected as the main subjects through KEGG enrichment analysis. Core targets (RELA, IKBKB, CHUK, and MMP3) and active ingredients (kaempferol, quercetin, and isorhamnetin) were selected and validated using molecular docking. This study identified multiple molecular targets and pathways for A&A in the treatment of atherosclerosis. A&A has the potential to treat atherosclerosis through an antiinflammatory approach.     

基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的作用机制

目的基于网络药理学探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的作用机制。方法检索中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库中各中药化合物,并将化合物的靶蛋白信息导入UniProt网站进行基因名转换。将整合的数据导入Cytoscape 3.5.1软件,构建“中药-化合物-靶点”可视化网络图。登录DisGeNET、GeneCards、DrugBank、OMIM、GAD、TTD数据库对冠心病基因靶点进行检索,并将疾病与药物的交集靶点录入STRING网站构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,对节点信息进行分析与计算后筛选得到核心靶点。将靶点基因导入Metascape网站进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,同时对通路进行预测。运用AutoDock 4.2、PyMOL 2.3.2软件对核心靶点进行分子对接验证。结果共筛选出瓜蒌薤白半夏汤包含的32种化合物,度值较高的是β-谷甾醇、豆甾醇、柚皮素等。通过Cytoscape 3.5.1软件构建的PPI网络包含98个节点、1318条边,核心靶点为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基a(PIK3CA)、基质金属蛋白酶2(MMP2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等。通过GO及KEGG富集筛选出与冠心病相关的磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)等10条核心通路,并采用分子对接方法对结果进行了验证。结论柚皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、松柏苷、槲皮素可能是瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病发挥关键作用的化合物,可能通过作用于PTGS2、PIK3CA、MMP2、VEGFA等靶点对肾素-血管紧张素系统(RAS)、RAS相关蛋白-A(Rap1)、血管内皮生长因子(VEGF)等通路进行调控,而PI3K-Akt可能是瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的核心通路。     

基于网络药理学探讨附子理中汤治疗非酒精性脂肪性肝病作用机制

目的:运用网络药理学方法分析附子理中汤(FZLZD)治疗非酒精性脂肪肝性病(NAFLD)的潜在作用机制。方法:检索TCMSP数据库筛选出FZLZD药物活性成分及作用靶点,并借助Uniprot平台进行靶点蛋白规范化处理。检索GeneCards与OMIM数据库得到NAFLD靶点基因,进一步获取药物和疾病共有靶点,即为FZLZD治疗NAFLD的潜在靶点基因。利用Cytoscape 3.7.2绘制药物活性成分-靶点-疾病网络图,利用Cytoscape 3.7.2结合String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,利用Metascape数据库对共有靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:最终筛选出80种药物活性成分、43个潜在作用靶点;富集分析获取808个生物学过程及25条与NAFLD相关信号通路。结论:FZLZD通过多成分-多靶点-多信号通路协同调控NAFLD。     

基于网络药理学和分子对接探究余甘子治疗肝细胞癌的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接虚拟预测方法,探究余甘子治疗肝细胞癌的潜在分子机制。方法:通过公共数据库获取余甘子的有效活性成分及作用靶点,并筛选肝细胞癌相关靶点,构建“活性成分-靶点”关系图与PPI网络,进行GO分析和KEGG、Reactome通路富集,采用分子对接评价活性成分与核心靶点的结合活性。结果:共获得19个有效活性成分和12个重要靶点。通过GO分析获得了1794个细胞生物过程,而KEGG和Reactome富集分析分别涉及315和391个相关通路。结论:余甘子的主要有效活性成分为鞣花酸、木犀草素、槲皮素和山奈酚,可能作用于AKT1、MMP9、SRC、ESR1、PPARG和AR等关键靶点,调控内分泌抵抗、癌症中的蛋白多糖、癌症通路、受体酪氨酸激酶信号、白细胞介素信号通路、生长因子受体和第二信使信号转导、PI3K/AKT信号通路等以治疗肝癌。除了直接的肿瘤相关信号通路,间接的炎症、代谢通路在抑制肝癌进展中发挥了重要作用。     

Network pharmacology-based screening of the active ingredients and mechanisms of Huangqi against aging

Studies have shown that Huangqi (HQ) has anti-aging efficacy. However, its active ingredients and mechanisms for anti-aging are still unclear. In this study, we will systematically screen the active ingredients of HQ and explore the possible mechanism of HQ in prevention from aging through network pharmacology technology.The main active ingredients of HQ were obtained from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). The possible targets were predicted by TCMSP. The related targets for aging were obtained from GeneCards (The Human Gene Database) and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database. The common targets of HQ and aging were obtained using R 3.6.3 software. The protein–protein interaction (PPI) network and the ingredient-target-disease network were constructed using Cytoscape 3.7.2 software for visualization. In addition, the Gene Ontology (GO) functional enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway annotation of potential targets were performed using R 3.6.3 software.Based on the screening conditions, 16 active ingredients and 28 drug targets were obtained. The PPI network contained 29 proteins, including PTGS2, AR, NOS2, and so on. GO functional enrichment analysis obtained 40 GO items (P < .05). KEGG pathway enrichment analysis obtained 110 aging related pathways (P < .05), including hypoxia inducible factor 1 signaling pathway, PI3K-Akt signaling pathway, AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complication, among others.Sixteen effective ingredients of HQ and 28 targets against aging were identified through network pharmacology. Multiple pathways were involved in the effect of HQ on preventing aging.     

基于网络药理学探究灵宝护心丹治疗急性心肌梗死的潜在机制

目的利用网络药理学和分子模拟对接的方法探究灵宝护心丹治疗急性心肌梗死(AMI)的分子机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、中医综合数据库(TCMID)获得灵宝护心丹所含9味中药相关活性化合物和作用靶点;通过人类基因数据库Gene Cards获得AMI相关基因,利用String 11.0数据库获得目标基因;利用Cytoscape 3.7.2软件构建化合物-靶标网络,根据拓扑学参数筛选灵宝护心丹治疗AMI的核心靶点;利用Cytoscape 3.7.2插件ClueGO+Cluepedia对疾病和药物交集靶点进行基因本体(GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析。结果灵宝护心丹化合物-AMI靶点网络包含57个疾病靶点和104个活性化合物,核心靶点包括叉头转录因子(FoxO1)、沉默信息调节因子1(Sirt1)、CASP3、白介素-6(IL-6)、AKT1、SOD2、Bcl2等。GO功能富集得到73个条目;KEGG富集到111个通路,并且被分类为16个具有统计学意义的亚组,主要涉及FoxO信号通路、HIF-1信号通路、凋亡信号通路、NF-κB信号通路等。使用GeneMANIA数据库构建核心靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并对其进行生物学功能分析。利用分子对接模拟软件Autodock Vina 1.1.2,对关键药效分子与核心靶标进行配体-受体对接模拟计算。结论基于网络药理学预测灵宝护心丹治疗AMI的潜在分子机制,为进一步研究其药效和作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制

目的运用网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出清痰化瘀方的化学成分和潜在靶点,利用DrugBank、治疗靶点数据库(TTD)、DisGeNET、美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选冠心病靶点,将疾病靶点与药物靶点进行Venn分析,筛选二者共同靶点,应用String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,并通过DAVID(6.8)数据库对共同靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3.5.1构建"中药-化合物-共同靶点-疾病"网络,预测其作用机制。结果通过筛选获得清痰化瘀方101种化学成分和253个作用靶点,共同靶点112个,获得640条生物学过程和108条信号通路。通过对112个靶蛋白进行PPI分析发现,肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、MAPK8、血管内皮生长因子A(VEGFA)、原癌基因蛋白(FOS)等靶蛋白度值较大,KEGG通路富集结果显示,清痰化瘀方治疗冠心病的较多...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。