DNA结构与蛋白质合成过程教具的制作

生物化学抽象概念多 ,在教学过程中师生普遍感到枯燥难讲 ,抽象难懂。ＤＮＡ结构与蛋白质的合成就是这一部分的代表。为了提高教学的直观性 ,我们在近几年的教学实践中自制了ＤＮＡ结构及蛋白质合成过程的教具来配合教学 ,效果颇佳 ,现加以介绍。1　制作方法1.1　ＤＮＡ结构教具的制作　将ＤＮＡ结构做成一“绳梯” ,这个梯子两侧用两条软绳 ,软绳上分段涂上颜色代表单核苷酸 ,分别在两绳的各端涂上彩色的箭头 ,代表 3′5′走向 ,梯子中间的梁用 1ｃｍ宽橡胶条做成 ,在每个橡胶条中分别用彩笔写出相互补的碱基。中间画 3条短线代表氢键 ,碱…     

蛋白质参与DNA解螺旋

多年来,科学家们一直就究竟是一种还是多种蛋白质参与DNA解螺旋这一问题争论不已。最近,美国伊利诺斯大学物理系的Taekjip Ha教授与华盛顿大学的Wei Cheng和斯坦福大学的Hazen P.Bab-cook等人合作,利用光学荧光显微镜检测酶的活动,解开了这一困扰在科学家心头已久的谜团,要使双链DNA解螺旋,至少需要两个蛋白质的参与。这项发现涉及到一种解旋酶(Rep helicases)蛋白。Taekjip Ha及其同事通过对大肠杆菌中的解旋酶进行研究,发现解旋酶可以沿着DNA链移动以分解DNA的双链。当解旋酶缺陷的,罹患癌症、Bloom     

重组人铜锌SOD在脱水过程中的二级结构变化及保护剂的作用

用衰减全反射(ATR)傅立叶变换红外光谱技术研究了重组人铜锌S0D(rhCu，Zn—S0D)在脱水过程中的二级结构变化及保护剂的作用。结果显示，在脱水过程中，蛋白质结构发生了重排，无论是真空干燥还是冷冻干燥，子峰峰位都发生偏移，α—螺旋结构消失，产生无规卷曲结构。糖和硼酸盐能够有效地维持酶的天然构象，其中海藻糖对冻干过程中rhCu，Zn—S0D的α—螺旋结构维持率为93％。     

从DNA结构模型的提出看科学审美对科学认识的作用

存在是永恒的,因为有许多法则保存了生命的宝藏,而宇宙从这些宝藏中汲取了美。——歌德[1]沃森—克里克(Watson—Crick)阐明DNA双螺旋结构,距今已有40多年了。综观其研究过程,不难看出,科学发现既是一个认识过程,又是一个审美过程,而科学审美对于科学认识的作用,比起我们通常承认的要大得多。1　DNA双螺旋结构的发现被称为20世纪生物学中最伟大成果的DNA双螺旋结构的发现,一般认为是美国生化学家沃森和英国物理学家克里克在1953年共同作出的。其实,确切地说应该是,沃森—克里克针对当时生物学所面临的基因的本质问题,提出了一个假说,双…     

三螺旋结构寡核苷酸序列对DHBV基因的连接及封锁抑制作用 …

目的 筛选与鸭乙肝病毒（ＤＨＢＶ）－ＤＮＡ Ｘ／Ｃ区目标基因特异连接的三螺旋结构寡核苷酸（ＴＦＯ）,探讨ＴＦＯ对ＤＨＢＶ－ＤＮＡ的特异连接及抑制作用。方法 将人工合成的ＴＦＯ与目标基因片断和含（ＤＨＢＶ）ＤＮＡ的重组细胞反应,用电泳转移印迹、ＰＣＲ和鸭肝原代细胞培养等技术观察ＴＦＯ对相应基因的连接以及对细胞内ＤＨＢＶ－ＤＮＡ复制的抑制效应。结果 在所设计的多条ＴＦＯ中,（３）ＴＦＯ和（５）ＴＦＯ在     

三氯乙酸对蛋白质结构稳定性的影响

0　引言　 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS- PAGE)是蛋白质化学中最常用的研究技术之一 ,常用于检测蛋白质的纯度和测定蛋白质的分子量 .当生物样品的浓度很低或样品中盐浓度 >0 .1mol· L- 1 ,需要对待测样品溶液进行浓缩或除盐 .最常用的方法是三氯乙酸 (TCA)沉淀法 .实验中我们观察到TCA对蛋白质的结构稳定性有较大的影响 ,它可使蛋白质分子间相互聚集或断裂成碎片 ,干扰分析结果的准确性 .本研究选取了几种蛋白质 ,使用 TCA沉淀 ,然后在不同时间进行电泳分析和活性测定 ,探讨 TCA对蛋白质结构稳定性的影响 .1　材料和方法1.1　材…     

树Qu胆固醇酯转运蛋白的cDNA和蛋白质结构分析

目的 获得不易感动脉粥样硬化动物树Qu胆固醇酯转运蛋白（CETP）的cDNA和蛋白质序列,分析其结构特点,寻找其可能的抗动脉粥样硬化分子机制。方法 以从树Qu肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板,应用SMART－RACE技术,获得了树QuCETP的cDNA序列,并推导出其蛋白质氨基酸序列,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较。结果 获得的树QuCETP cDNA（在GenBank中的注册号为AF334033）长1636bp,编码485个氨基酸,其成熟蛋白由477个氨基酸组成,比人多一个氨基酸（Gly318),该蛋白与人、家兔的同源性分别为88％和82％。序列中与CETP结合和转运中性脂质功能相关的区域均非常保守,但在Asm342位的N－糖基化位点缺失,可能使其转运胆固醇酯的活性增加,利于外周组织和血浆中的胆固醇及其酯的清除。通过对不同种属蛋白序列的比较,初步分析了树QuCETP蛋白与功能相关的结构特点。结论 树QuCETP糖基化的特点有可能是该动物对动脉粥样硬化具有不易感性的分子机理之一。     

蛋白质：乱中取性

圣裘德儿童研究医院的研究人员首次发现，许多蛋白质实际上利用了其结构上的无序性来完成各种不同的任务一而此前多数科学家一直认为，蛋白质必须维持固定的结构才能完成既定的任务。这一研究报告发表在《自然结构与分子生物学》杂志网站上。     

蛋白质三维结构预测的研究进展

蛋白质三维结构研究方法主要分为实验研究和理论研究。实验研究是结构研究的基础 ,采用的方法主要有Ｘ射线晶体衍射分析 ;多维核磁共振分析 ;电子和中子衍射技术 ;波谱技术以及近年来发展起来的扫描隧道显微术 (ＳＴＭ )和原子力显微术等 ,目前只有前两种方法较为成熟 ,如在Ｂｒｏｏｋｈａｖｅｎ蛋白质结构数据库中源于Ｘ射线晶体衍射的结构占 80 %以上 ,源于核磁共振谱的占16 %左右。由于三维结构研究较为困难 ,其进展速度远远落后于一级序列测定的速度。目前在测出了氨基酸序列的蛋白质中了解三维结构的仅占 1/ 3,而且这一比例仍在不断减…     

D蛋白与细胞分化、细胞周期调控及肿瘤的发生

ID(inhibitors of DNA binding)蛋白具有螺旋 -环 -螺旋(helix- loop- helix,HL H)结构 ,缺乏 DNA结合域 ,可与一些转录因子 (主要是 b HL H蛋白 )形成非活性异二聚体 ,使其不能与 DNA上的 E基序结合 ,从而负向调控细胞分化 ,因而被称为“分化抑制因子”(inhibitor of differentiation) [1 ]。在哺乳动物细胞中 ,ID蛋白由 ID1～ 4四个亚型构成 ,其功能不尽相同 ,它们在细胞发育、周期调控及肿瘤发生等方面有重要作用 [2 ] 。1　 ID蛋白与细胞分化ID蛋白作为一种分化抑制因子 ,参与多种细胞的定型与分化 ,如神经细胞、支持细胞、…     

ID蛋白与细胞分化、细胞周期调控及肿瘤的发生

ID(inhibitors of DNA binding)蛋白具有螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix，HLH)结构，缺乏DNA结合域，可与一些转录因子(主要是bHLH蛋白)形成非活性异二聚体，使其不能与DNA上的E基序结合，从而负向调控细胞分化，因而被称为“分化抑制因子”(inhibitor of differentiation)。在哺乳动物细胞中，ID蛋白由ID 1～4四个亚型构成，其功能不尽相同，它们在细胞发育、周期调控及肿瘤发生等方面有重要作用。     

布鲁克海文蛋白质数据库结构分析

1 PDB数据库简介布鲁克海文蛋白质数据库(The Brook Haven Protein Data Bank,PDB)是由美国布鲁克海文国家实验室所维护的关于生物大分子三维结构的数据档案^[1～3],其内容包括生物大分子的原子坐标、参考文献、1级和2级结构信息,也包括了晶体结构因数以及NMR实验数据.PDB由美国国家科学基金等组织提供资助,对全球的科研工作者、教育工作者以及学生等提供免费服务.     

一种快速比较蛋白质结构预测模型相似性的方法

根据相同立体结构中的各部分只需一个旋转矩阵就能将两者叠合在一起的基本原理,对原有的结构比较方法作了改进,使其比较速度得到很大提高。尤其是对相似蛋白质结构的比较,速度的提高更为显著。由于在蛋白质天然构象的一致性分析中,模型结构之间的比较是其计算时间的瓶颈,因此本法对提高一致分析方法的计算效率有着重要的意义。     

结构脂肪乳对蛋白质和脂质代谢的影响

目的观察结构脂肪乳对消化道手术患者蛋白质和脂质代谢的影响。方法选择消化道手术患者60例,随机分为结构脂肪乳(ST)组和物理混合的中/长链脂肪乳(MCT/LCT)组,每组各30例,于术后第1～5天接受等氮、等热量的肠外营养(PN)。分别于术前、术后第1天PN前和术后第6天测定肝功能、肾功能、前白蛋白、三酰甘油和胆固醇。其中每组各有20例于术后第2天PN输注前、后再次测定血清三酰甘油、胆固醇和游离脂肪酸(FFA)。结果①两组患者肝、肾功能变化的差异均无显著性。②PN支持5 d后,两组患者的血清前白蛋白仍明显低于术前水平。③PN第2天输注后,ST组患者PN后的血清三酰甘油和胆固醇水平明显低于PN前;两组患者血清FFA中仅油酸(C18：1)显著增加,其余无显著改变;ST组血清总FFA量低于MCT/LCT组,但两组间差异无显著性。结论消化道手术患者术后短期应用结构脂肪乳是安全的;结构脂肪乳对蛋白质代谢的作用与物理混合的中/长链脂肪乳相似,且前者对血脂的影响较小。     

一个有效的蛋白质结构预测评分函数

目的设计一个预测蛋白质结构的评分函数。方法根据蛋白质两两残基中Cα-Cα、N-N、C-′C′的空间距离分布及主链二面角(Φ,φ)的分布构建该评分函数。结果通过国际共享的评估数据证明,该评分函数的各个组成部分是协同一致的。结论所设计的评分函数能有效地识别蛋白质的天然结构。     

一个有效的蛋白质结构预测评分函数

目的 设计一个预测蛋白质结构的评分函数.方法 根据蛋白质两两残基中Cα-Cα、N-N、C′-C′的空间距离分布及主链二面角(φ, ψ)的分布构建该评分函数.结果 通过国际共享的评估数据证明,该评分函数的各个组成部分是协同一致的.结论 所设计的评分函数能有效地识别蛋白质的天然结构.     

蛋白质结构与变性说

蛋白质分子的基本结构是由肽键（主键)、二硫键（副键)维系的共价结构。其主要内容包括组成蛋白质的氨基酸种类、数量、排列顺序及共价连接方式。蛋白质分子的空间结构是由非共价作用维系的空间构象。其主要内容包括肽键的卷曲、折叠及侧链R基的空间排布所形成的特定空间构象。蛋白质分子特定的有规则的空间构象是蛋白质特定生物活性的基础。蛋白质变性是由于空间构象的破坏，不包括肽键、二硫键所维系的共价结构。     

三螺旋多糖的链结构与功能研究进展

三螺旋多糖是自然界中存在的具有特殊链结构的一类生物大分子,它不仅具有较高的生物活性,而且具有特殊的分子识别能力以及其他多糖无法比拟的功能特性。本文主要概述三螺旋多糖的链结构及其构象转变,分析其变性和复性过程中分子链间的相互作用,阐明三螺旋结构形成和形态变化的科学规律。同时,综述了三螺旋多糖的链构象与其生物活性之间的构效关系,以及基于螺旋构象转变构建的多糖基功能材料的最新研究进展。     

蛋白质二级结构的红外光谱

蛋白质的多肽锭组成了各种特定的三维空间构象，氢键在维系这种构造中起着十分重要的作用。本文通过红外光谱法研究了蛋白质的二级结构和氢键在维系这种构造中的作用，发现具有螺旋和折叠构象的多肽链主要以反式构象为特征排布。     

胶原模拟多肽三螺旋结构的热变性过程

氨基酸重复序列是很多纤维状蛋白质特征,这些序列促进每种蛋白形成自己的拓扑结构[1].胶原蛋白Gly-X-Y肽段的重复出现使得胶原二级结构呈现特征性的聚脯氨酸Ⅱ型(P2)结构,P2结构进一步形成稳定的三螺旋结构,这是胶原蛋白区别于其他蛋白质的特征性结构[2].