基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

基因芯片也称为基因微阵列 (Microarray) ,是近几年发展起来的一项前沿生物技术 [1 ] ,是指采用原位合成或直接点样的方法将 DNA片段或寡核苷酸片段排列在硅片、玻璃等介质上形成微阵列 ,待检样品用荧光分子标记后 ,与微阵列杂交 ,通过荧光扫描及计算机分析即可获得样品中大量的基因序列及表达信息 ,以达到快速、高效、高通量地分析生物信息的目的。基因芯片能将 c DNA文库中的已知和未知序列固定于玻片上 ,可同时检测比较生物样品中多个已知或未知的序列表达状况 ,向研究者报告所要比较样品中的差异基因 ,为进一步有效地进行基因测序和…     

基因芯片在肿瘤研究中的应用

人类已逐步进入功能基因组时代,基因芯片作为近期发展起来的一项新技术,能够研究细胞内所有基因的表达谱,同时获得成千上万基因活化的模式,并为研究肿瘤发生发展过程中的基因表达情况提供了强有力的工具。本文对基因芯片技术在肿瘤研究中的应用,包括寻找新的肿瘤相关基因,基因表达谱研究、基因功能研究,肿瘤分子病理分型及诊断芯片等方面进行了探讨。     

基因芯片技术在肿瘤研

基因芯片又称DNA芯片、DNA阵列、DNA微集阵列等,是生物芯片技术的一种,具有快速、高效、高通量、高度并行性及高度敏感性、自动化程度高等特点。基因芯片是近年来新兴的一项生物技术,前景十分乐观。     

基因芯片及其在肿瘤研究中的应用

基因芯片技术是将成千上万个寡核苷酸序列或cDNA序列规律的排列在1-2cm^2的支持物上，然后将荧光标记的样本DNA／mRNA与芯片杂交，并用计算机对杂交信号作出检测从而研究基因表达谱。目前，基因芯片在肿瘤诊断中的应用主要包括肿瘤的分子学分类，预测肿瘤对某些化疗或激素治疗的敏感性，肿瘤的分期，发现新的治疗靶点等方面。本文还对基因芯片的应用前景作一简要介绍。     

基因芯片技术及其在肿瘤研究中的应用

生物芯片由美国Affymetrix公司首先开发 ,在短短数年中 ,芯片技术进步迅速 ,并呈现发现高峰。所谓生物芯片是由固定于不同种类支持介质上的高密度的寡核苷酸分子、基因片段或多肽分子的微阵列组成 ,其中每个分子的位置及序列为已知 ,当荧光标记的靶分子与芯片上的探针分子结合后 ,可通过激光共聚焦荧光扫描或电荷耦联摄影像机 (CCD)对荧光信号强弱的检测而判断样本中的靶分子数量 ,以实现对化合物、核酸、蛋白质、细胞及其他生物组分的准确、快速和大信息量的筛检 ,其特点是高度平行性、多样性、微型化和自动化[1] 。按芯片上探针的不同 ,…     

基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

<正> 基因芯片又称DNA微阵列(DNA microarray),是90年代兴起的一项前沿DNA分析技术。它是指固着在固相载体上的高密度DNA微点阵,即将大量靶基因或寡核苷酸片段有序地。高密度地(点与点间距一般用于500μm)排列在玻璃、硅等载体上,用不同的荧光染料通过逆转录反应将不同组织或细胞的     

基因芯片－同时研究数以千计的生物技术

The introduction of microarray technology represented a paradigm shift in the way that biological science is performed. This shift involved a switch from conducting purely hypothesis driven research to hypothesis generating research. It is no longer necessary for a biologist to attempt to determine which gene or class of genes they would like to study. Instead, researchers can now look at an entire collection of genes, in deed for several organisms, all the potential genes, to determine which are implicated in a particular process. Once a key set of genes are identified, then the biologist can return to more classical means to undertake a hypothesis driven approach. Coincident with this change in focus is a change in terminology. No longer do we simply study gene expression, with microarrays, we now study genomics : gene expression on a global scale. Originally, microarrays were used to study processes such as cell cycle regulation, or to profile diseases such as cancer; areas of research that studied gene expression as a matter of course. Now however, as the technique grows in popularity, and the cost has been reduced through economies of scale, new areas of research are beginning to employ microarrays. Microarrays are now being used in agricultural research, toxicology, and food safety. In addition, although, arrays were originally designed to assay gene expression, they have now been adapted to study genetic mutation, protein expression, and protein function. The past couple of years have seen the introduction of arrays of protein, cells, tissues and even small molecules. Each of these tools will allow microarrays to find footholds into ever more areas of research.This review will attempt to give a general overview of microarray technology and then look at the application of microarrays to two aspects of disease, genetic based disease and infectious disease. Issues of experimental design and data analysis will also be addressed.     

基因芯片及其在癌症研究中的应用

基因芯片是随着人类基因组计划应运而生的一项新兴的生物技术。该技术具有高通量、敏感性和准确度高等突出的特点,因此广泛应用于遗传学、细胞遗传学、遗传药理学、癌症及病原体等临床研究中。本文就基因芯片的制作过程及其在癌症研究中的应用进行了概述。     

基因芯片技术在肿瘤研究中的应用

基因芯片又称DNA微阵列(DNA m icroarray)是近年发展起来的一项DNA分析技术,一般包括寡核苷酸芯片和cDNA芯片2种,其基本原理是在固相载体上按照特定的排列方式固定上大量已知的DNA片段,形成DNA微矩阵,将样品DNA/RNA通过PCR/RT-PCR扩增、体外转录等技术渗入荧光标记分子后,与位于芯片上的已知序列杂交,最后通过扫描仪及计算机进行综合分析,比较不同荧光在各点阵的强度,即可获得样品中大量基因表达的信息。基因芯片在一张微小的芯片上能够在同一时间内平行分析大量的基因,进行大量信息的筛选和检测分析。目前研究认为,肿瘤的发生和发展是一个多阶段、多基因参与的复杂过程。正常基因的突变、癌基因的异常激活以及肿瘤抑制基因的失活、基因本身的多效性和机体免疫因素,决定了肿瘤表型的表达与否[1]。基因芯片不仅为研究肿瘤发生发展过程中相关基因的激活和失活提供了强有力的工具,也为肿瘤的诊断和治疗提供了新的武器。1基因芯片用于寻找肿瘤相关基因用cDNA微阵列技术通过比较组织细胞基因的表达谱差异,可以发现新的可能致病基因或疾病相关基因。G ress等[2]从胰腺癌细胞株PATU、胰腺癌组织、慢性胰腺炎及对照胰腺组...     

组织芯片技术在病理学中的应用

组织芯片(tissue microarray)是在cDNA微阵列的基础上发明的一种特殊的生物芯片。其原理是根据不同需要，利用特殊的仪器，将组织高密度的排列在固相载体上，用各种酶、基因、寡核苷酸、抗体与之进行杂交或标记染色，以研究目的基因或基因产物在不同组织中的特异表达。组织芯片的应用广泛，特别是对肿瘤易感因素的判定、特殊基因和抗体的筛选，临床早期诊断和治疗方案的制订及预后的判断都具有重要的意义。与传统的病理研究方法相比，组织芯片具有体积小、信息含量高、并可根据不同的需要进行组合和设计的特点。对某些基因和蛋白质与疾病关系的研究、疾病相关基因的验证、新药的开发与筛选、疾病的分子诊断、治疗过程的动态观察和预后的判断等方面具有重要的实际意义和广阔的市场前景。     

基因芯片技术在肿瘤病理诊断中的应用研究

一、基因芯片的基本概念 基因芯片(gene chip)或称为DNA芯片,DNA微点阵(DNA microarray)、寡核苷酸阵列(oligonucle-tidearray)是20世纪90年代随着人类基因组研究的深入而迅速发展起来的新兴的革命性技术.     

基因芯片技术在免疫学研究中的应用及其对中医药研究的启发

基因芯片技术是一种高通量的研究手段,可以在同一时刻对成千上万个基因的表达情况进行分析,形成完整的细胞基因表达谱.目前该技术已应用于免疫学研究中,如免疫细胞发育、成熟、活化、分化及其免疫应答的调控机制,变态反应的分子基础,疾病的临床表型和基因表达谱的关系,免疫药理学等,加深了人们对免疫系统的认识.同样,它也将有助于中医药对免疫细胞和免疫应答的调控机制研究、中医药治疗变态反应性疾病机制的研究、中医辨证的标准化以及中药药理研究等.基因芯片实验结果的数据分析一是比较不同种类样本基因表达量的差异,二是为了获得特征性的基因表达谱,但关于样本量的多少、统计方法的使用尚没有统一的认识,研究人员正努力制定关于基因芯片实验的标准.     

DNA芯片在研究酵母基因组中的应用

人们对酿酒酵母 (ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ)分子遗传学方面的认识最早。最先完全了解的基因组序列也是酿酒酵母基因组序列。基因组工程接下来的工作就是阐明酵母基因表达模式和其基因产物的功能。为了得到精确有效的结果 ,必须寻找一种既系统又全面的方法 ,来解释酵母细胞中基因表达的模式和产物的功能以及产物之间的相互作用。近年来发展起来的生物高技术———ＤＮＡ芯片技术提供了这种可能。ＤＮＡ芯片是运用大规模集成电路光刻技术以及生物分子的自组装技术 ,在一微小芯片上组装成千上万个不同的ＤＮＡ或ｃＤＮ…     

组织芯片技术在消化道肿瘤研究中的应用

组织芯片是一种高密度的组织微点阵,它能高度集中多种不同类型的组织标本,从而一次性完成大样本指标筛选工作。相比于传统的石蜡切片,组织芯片有着更高的效率,在肿瘤学研究中得到广泛的应用。本文根据国内外研究成果,就组织芯片技术的概念、分类及其在消化道肿瘤研究中的应用进展等方面予以综述。     

RAPD技术及其在肿瘤研究领域中的应用

遗传标记是一类易于识别．遵循孟德尔遗传模式．具有个体特异性或其分布规律具有种系特征的表型特征或遗传物质,早期的遗传标记涉及的基因位点数目少,多态水平低,随着分子生物学和分子遗传学的发展,多态性丰富的DNA分子遗传标记大量出现并被广泛应用。1990年Williams和     

基因芯片技术在医学研究中的应用

基因芯片 (Ｇｅｎｅｃｈｉｐ)又称ＤＮＡ芯片 (ＤＮＡｃｈｉｐ)、ＤＮＡ阵列 (ＤＮＡａｒ ｒａｙｓ)、寡核苷酸微芯片 (Ｄｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｍｉｃｒｏｃｈｉｐ) ,是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具 ,它综合了分子生物学、半导体微电子技术、激光化学、计算机科学等众多学科领域的相关技术 ,使研究者得以自动化、快速、平行地对大量的生物信息加以分析 ,从而成为基因测序、基因突变分析、基因表达等方面研究的高效手段之一。这项技术是 90年代初由美国Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ公司首先发展起来的 ,在随后的几年内技术不断…     

应用基因芯片技术筛选前列腺癌转移相关基因

目的:筛选前列腺癌转移相关基因,为研究前列腺癌的转移分子标志奠定基础.方法:将DU145细胞接种于裸鼠前列腺腹叶,5周后分别从原发灶和肺转移灶分离肿瘤细胞,利用cDNA芯片技术检测2种细胞中差异表达基因.结果:成功建立了前列腺癌细胞系原位移植自发转移裸鼠模型,经多轮筛选获得了前列腺癌原位及肺转移细胞.通过基因芯片筛选获得284条差异表达基因,基因功能涉及细胞信号转导、细胞周期、细胞凋亡、转录、黏附和代谢等.结论:基因芯片高通量筛选提示200余条基因中的某些基因可能与人前列腺癌转移有关.本研究为前列腺癌转移分子机制提供参考.     

高通量技术在肿瘤临床检测中的应用

肿瘤因高发病率,高病死率而成为严重威胁人类健康的一种恶性疾病。肿瘤发生是多因素诱导,多阶段逐步发生的,目前传统方法不能有效的评估肿瘤对化疗药物的反应性,肿瘤的复发及预后。高通量技术的出现将给肿瘤的临床检测带来新的契机。高通量技术是指快速检测大量样本的一类技术,它们的共同特点是速度快、检测样本多、敏感性高、信息量大、可自动化。高通量技术在不同研究领域有其代表性技术,如基因组水平的     

蛋白质芯片质谱仪及其在肿瘤研究中的应用

表面加强激光解析电离飞行时间质谱仪(SELD I-TOF MS)是一种新的蛋白质检测技术,与传统的蛋白质组学方法相比,该技术具有快速、灵敏、高通量等特点。运用该技术制成的蛋白质芯片质谱仪已成为蛋白质组学研究中的重要工具。本文简要介绍了该技术及其在恶性肿瘤诊断、治疗及预后等方面的应用。