内含子miRNA反馈调节宿主基因的表达与功能研究进展

miRNA是近年来发现的一类重要的基因表达调控因子。研究发现,许多miRNA位于编码蛋白基因（宿主基因）的内含子中,称为内含子miRNA。现有的证据表明,大多数内含子miRNA和它们的宿主基因表达一致,提示这些内含子miRNA参与宿主基因在功能和表达上的调控,本文就这方面的最新研究进展做一综述。     

电离辐射与microRNA

MicroRNA(miRNA)是一类18～24 nt的非编码RNA分子.miRNA普遍存在于生物界,具有高度的保守性,广泛参与细胞分化与发育、细胞凋亡、肿瘤发生等多方面的基因表达调控.Lee等~([1])首先发现Lin-4作为一种调控线虫发育的miRNA之后,科学家对miRNAs调控的基因表达进行了广泛深入的研究,到日前为止,成熟miRNAs的总数已达10 581种,其中,在人类基因组中已发现721种(miRBase 14.0:http://microrna.sanger.ac.uk/)~([2]).据推测,人类miRNA的     

microRNA与细胞周期调控

microRNA(miRNA)是一类长度为22～25个核苷酸的小RNA,这类非编码的小RNA分子在转录后水平上特异性地调节基因的表达.研究表明,miRNA可调控在细胞周期进程中直接或间接发挥作用的蛋白质分子;其表达水平的改变会使得细胞周期进程失去控制从而导致肿瘤的发生.此外,miRNA可分别作为癌基因和抑癌基因发挥作用从而参与细胞周期进程的调控,尤其是对细胞周期检查点的调控;它们通过协同调控多个靶基因参与细胞周期进程.     

miRNA参与p53基因调控网络研究进展

在细胞增殖和细胞死亡等过程中均发现一些miRNA可以作为肿瘤抑制基因或癌基因参与调节。研究发现miR-34作为p53转录激活的靶分子,参与了包括细胞周期阻滞和细胞凋亡等过程的调节,miR-34的缺失可使p53介导的细胞效应受阻。miR-29可激活p53的表达并诱导p53介导的细胞凋亡。此外,还有许多miRNA分子受到p53的转录抑制。一种miRNA可调节多种不同的靶蛋白分子,因此大大拓展了p53调控网络的层面。越来越多的证据表明miRNA参与了癌基因和抑癌基因网络的调控,同时为肿瘤治疗提供了新的治疗策略。     

hsa-miR-221调控非小细胞肺癌分子网络的生物信息学分析

目的应用生物信息学的方法研究hsa-miR-221在非小细胞肺癌（non-small cell lung carcinoma,NSCLC）中的分子调控网络。方法运用UCSC基因组浏览器、人类miRNA疾病数据库、TF-miRNA结合数据库、miRNA靶基因预测数据库、GeneCards数据库、肺癌相关因子整合数据库和转录因子结合谱数据库等,研究hsa-miR-221上游转录因子、下游靶基因及与其有相互作用的lncRNA的多个调控途径,绘制hsa-miR-221在NSCLC中分子调控网络。利用GEO数据库验证关键基因。结果UCSC数据库显示hsa-miR-221位于X染色体,在多个物种中保守。hsa-miR-221与多种癌症包括NSCLC相关。分析表明hsa-miR-221受6个与NSCLC相关的转录因子如MYC、MYCN等的调控,同时又调控下游基因PTEN、RB1和BCL2等26个基因。另外,lncRNA基因GAS5、HOTAIR和TUG1及其转录因子Snail、n-MYC、ARNT和SOX5等也可能参与调控hsa-miR-221,从而构成一个以hsa-miR-221为核心的调控网络,在NSCLC的发生和发展中起重要作用。通过对GEO数据库hsa-miR-221高表达NSCLC细胞系差异基因分析,最终验证了5个基因。结论用生物信息学的方法预测hsa-miR-221的分子调控网络,为阐明其调控NSCLC的发病机制提供指导。     

microRNA在眼内的表达及其与常见眼部疾病的关系

miRNA是一种小的内源性非编码RNA分子,大约由21~25个核苷酸组成。1个miRNA可以调节下游百余个靶mRNAs,而1个mRNA又可以受多个miRNAs所调控。Lee等[1]于1993年在对线虫发育研究时发现了第1个miRNA—lin-4。2000年第2个miRNA lin-7被发现[2]。miRNAs存在于所有的多细胞生物中,其数量约相当于每种生物体蛋白编码基因的1％。     

动物胚胎发育中的MicroRNAs研究进展

MicroRNA（miRNA）是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA,具有调控功能,长度约有20～25个核苷酸,它通过与靶基因特异性的碱基配对引起靶基因的降解或者抑制其翻译,从而实现对靶基因的转录后表达的调控。文章综述了miRNA的发现、体内生成机制、作用机制及不同动物种类胚胎发育过程中miRNA的鉴定和研究．并并阐述了miRNA研究中的问题及应用前景。     

人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析

目的：该研究从整体水平比较microRNA（miRNA）对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3′UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析,以获得miRNA对两类基因的调控情况,同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3′UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3′UTR上有显著地高密度绑定,管家基因的3′UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用,对于重新理解miRNA对真核生物基因表达调控作用具有一定的参考价值。     

微小RNA在基因表达调控中的作用研究进展

微小RNA是近年来在多种真核生物及病毒中发现的一类长度为19-26nt(或bp)、具有基因表达调控作用的单链或双链RNA分子。目前已发现的微小RNA分子包括siRNA、miRNA以及新近发现的调节性小RNA(small modulatory RNA，smRNA)。它们具有基因表达调控等重要作用，因而受到了较为广泛的关注。本文对3种微小RNA在基因表达调控方面的作用作一综述。     

miRNA-33对胆固醇合成的调控作用及其在肉牛上的研究进展

心血管疾病与人类长期摄入高脂肪、高胆固醇食物有着很大的关系。小分子核糖核酸(miRNA)是一类高度保守的非编码小RNA,其对脂质代谢的调控作用已经成为脂质代谢研究领域尤其是胆固醇逆向转运方面的一个热点。众多的miRNA中,miRNA-33与细胞中胆固醇合成和转运息息相关,它可通过与其靶基因SREBP结合来调控胆固醇的流向,进而调节胆固醇的平衡。本文主要阐述了miRNA-33在体内外胆固醇合成过程中的调控作用,以及在胆固醇动态平衡调节中扮演的角色,以期通过对miRNA-33的表达调节,实现对胆固醇转运和合成的调控,为通过营养调控手段安全高效生产功能性牛肉提供理论基础,同时为人类高胆固醇疾病的研究提供科学思路。     

miRNA参与的动物发育调控研究进展

动物的发育是一个严格受控的复杂过程,需要在时空上精确控制相关基因的表达.miRNA通过抑制靶mRNA翻译或使之降解失稳从而在转录后降低基因的活性.近期的实验研究表明,miRNA在动物发育的诸多方面发挥着重要调控功能,并表现出特有的调控模式.本文对miRNA参与动物发育过程的调控研究进行了综述.     

14 q32 miRNA基因簇与肝细胞癌的发生发展

肝细胞癌（肝癌,hepatocellular carcinoma ,HCC ）是全球范围内发生率和死亡率较高的恶性肿瘤之一。微小RNA（ microRNA,miRNA）是一类内源性、非编码、高度保守的单链小分子RNA,主要在转录后水平抑制靶基因的表达。有些位置相近的miRNA基因在染色体上成簇排列,在一个多顺反子内形成miRNA基因簇,通常以共表达的形式协同作用。在人类14号染色体长臂端的14q32印迹基因区域约215 kb的基因组范围内,聚集了52个miRNA基因。已有研究发现此miRNA基因簇的异常表达与肝癌的发生发展密切相关。该文概括了14 q32 miRNA基因簇的结构特点,并对其在肝癌发生发展过程中所发挥的作用进行了综述。     

肝癌基因治疗研究新进展

肝癌是我国常见的恶性肿瘤,目前治疗方法较多,其中基因治疗是当前热点问题。本文对肝癌基因治疗的几个方面:反义基因治疗、自杀基因治疗、免疫基因治疗、抑癌基因治疗、联合基因治疗、基因载体等方面进行了综述。     

miRNA介导的病毒-人相互作用研究进展

微小RNA（microRNA,miRNA）是一类内源性,长度约为22核苷酸的单链RNA分子,可通过5′端的种子区与靶标转录本mRNA的3′UTR配对,导致靶mRNA的降解或翻译抑制。越来越多的研究发现,miRNA在介导病毒-人相互作用过程中发挥着重要的作用,作用模式包括病毒miRNA靶向人及自身的转录本、人miRNA靶向病毒及自身的转录本、病毒的miRNA介导人miRNA调控的网络、RNA干扰（RNAi）相关和干扰素相关的宿主对病毒的抑制及反抑制。miRNA介导的病毒-人相互作用的研究对于全面理解病毒-宿主相互作用的机制、开发抗病毒的药物具有重要意义。     

外泌体miRNA在脑卒中的作用机制研究进展

外泌体作为合适的基因载体并能精确调控基因而被认为是生物治疗靶点。外泌体因其自身特点可以规避细胞疗法的限制,静脉注射不仅便捷,而且其疗效近似于来源干细胞。miRNA作为外泌体主要内容物参与机体众多生理过程,如血管新生、神经修复、炎症和氧化应激,这与脑卒中的病理生理机制高度重合。近年来,大量研究表明外泌体miRNA治疗脑卒中效果显著。本文现对外泌体miRNA在脑卒中的作用机制作简要综述。     

X射线诱导非小细胞肺癌A549细胞凋亡的适应性反应及相关miRNA筛选的研究

目的 研究X射线辐射诱导非小细胞肺癌（NSCLC）A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选适应性反应相关的微RNA（miRNA）。 方法 将NSCLC A549细胞分为6组,包括 50 mGy+20 Gy、200 mGy+20 Gy、20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组及对照组（0 Gy）,前2组细胞分别用50、200 mGy初始剂量进行照射,培养6 h后用20 Gy的效应剂量进行照射,20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组同时进行照射。培养24 h后使用流式细胞仪检测细胞凋亡情况。利用小RNA测序技术筛选差异表达miRNA,并对其靶基因进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路的功能富集分析。采用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）对部分差异表达miRNA进行验证。2组间数据的比较采用Welch t检验。 结果 50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组的A549细胞早期凋亡率分别为（1.81±0.11）%和（2.17±0.19）%,低于20 Gy照射组的（4.54±0.23）%,且差异均有统计学意义（t=10.680、8.006,均P<0.01）。与20 Gy照射组相比,50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组共同差异表达趋势miRNA有1个上调（miR-3662）、15个下调（miR-185-3p、miR-1908-5p、miR-1307-5p、miR-182-3p、miR-92a-3p、miR-582-5p、miR-501-3p、miR-138-5P、miR-1260b、miR-484、miR-378d、miR-193b-3P、miR-127-3p、miR-1303及miR-654-5p）。GO富集分析结果显示,差异表达miRNA调控靶基因功能显著富集于细胞通讯调节、代谢过程的正向调节、代谢信号的调节、酶结合及催化活性等过程。KEGG富集分析结果显示,靶基因相关信号通路显著富集于溶酶体、丝裂原活化蛋白激酶、Ras和内吞作用等信号通路。qRT-PCR检测结果显示,miRNA表达情况与基因芯片结果趋势一致（10个miRNA表达水平得到验证）。 结论 X射线50、200 mGy照射剂量均能诱导NSCLC A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选到一组共同差异表达的miRNA,可能在X射线辐射诱导细胞凋亡的适应性反应中发挥了重要作用,有可能成为调节电离辐射生物效应的潜在靶点。