039 一种新的CTLs检测方法-可溶性MHC-肽四聚体方法

抗原特异性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic Tlymphocytes,CTLs)的鉴定是研究CTL疫苗的基础.传统的鉴定方法费时费力,敏感性低,近年来出现了一种新的检测方法,即可溶性MHC-肽四聚体(soluble-MHC-peptide tetramer)法,该方法克服了已有检测手段的缺点和局限性,提高了检测效率和敏感性,为鉴定特异性CTLs及研究细胞免疫的工作提供了简便、有效的途径.本文就可溶性MHC-肽四聚体法的原理及应用做一简要综述.     

基于氨基酸结构信息的MHCⅠ类抗原表位的定量构效关系建模

目的主要组织相容复合物(MHC)在细胞免疫中具有重要作用,MHC与表位亲和力的大小直接影响T细胞免疫响应的强弱,因此准确预测MHC-表位的结合亲和力可以提高表位的筛选效率并且降低实验成本。方法筛选89种天然氨基酸的理化性质用于15个MHCⅠ类分子亚型表位的结构表征,然后使用逐步线性回归(STR)方法优选对亲和力具有重要贡献结构参数建立预测模型,最终用多元线形回归法(MLR)方法建立了15个MHC亚型的QSAR模型。结果建立的QSAR模型具有稳定性高、预测能力强等优点,能确定表位中各氨基酸及其相应理化性质队对亲和力的贡献,并可很好解释MHC与表位的相互作用机理。结论 STR-MLR建模方法具有计算简便、易于解释、性能优异、物化意义明确等优势。     

β2M-绿色荧光蛋白在MHC-Ⅰ肽亲和力实验中的应用

目的 构建并表达β2微球蛋白-绿色荧光蛋白融合蛋白,并应用该蛋白建立一种全新的MHC-Ⅰ肽亲和力实验方法.方法 构建β2M-ZsGreen-6×His标签的融合蛋白真核表达质粒,转染293FT细胞表达,并以镍亲和层析法纯化,将该融合蛋白与表位肽共同与,12细胞反应,通过流式细胞术检测T2细胞标记绿色荧光的情况鉴定表位.结果 构建了B2微球蛋白-绿色荧光蛋白真核表达质粒并表达、纯化得到融合蛋白,该蛋白可应用于亲和力实验,进行表位鉴定.结论 β2微球蛋白-绿色荧光融合蛋白应用于亲和力实验鉴定CTL表位方法可行,步骤简便,适用于大通量表位鉴定.     

ERAP与MHC-I类分子抗原提呈研究新进展

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)-I类分子限制性提呈抗原在细胞免疫应答中占有着重要地位,对其抗原加工呈递机制的研究一直是基础免疫学研究的热点.内源性抗原主要通过MHC-I类分子途径加工处理,由于所有有核细胞均表达MHC-I类分子,因此所有有核细胞均具有通过该途径加工处理抗原的能力.     

H-2~b和H-2~d单体型小鼠MHCI类分子结合的HFRSV蛋白抗原表位的预测

本文通过对Ｈ－２ｂ和Ｈ－２ｄ单体型小鼠主要组织相容性抗原Ｉ类分子结合抗原肽的分析，建立了一个计算机预测模型，并对肾综合征出血热病毒核蛋白（ＮＰ）及囊膜糖蛋白Ｇ１和Ｇ２可与Ｂａｌｂ／ｃ小鼠（Ｈ－２ｄ）和Ｃ５７ＢＬ／６（Ｈ－２ｂ）小鼠ＭＨＣＩ类分子相结合的抗原表位进行了分析，预测出可分别与Ｈ－２Ｋｂ，Ｈ－２Ｄｂ，Ｈ－２Ｋｄ，Ｈ－２Ｄｄ和Ｈ－２Ｌｄ结合的核蛋白表位，依此各有７，１４，４，０和８个；囊膜糖蛋白Ｇ１＋Ｇ２的表位，依次有１４，１９，２７，２和４４个。     

T细胞表位预测研究进展

T细胞表位是指抗原经过抗原提呈细胞加工后 ,由MHC分子提呈给T细胞受体的短肽。随着分子生物医学和分子免疫学技术的发展 ,尤其是计算机在生物学中的广泛应用 ,对T细胞表位可以进行初步预测。本文就T细胞表位预测的分子基础、CTL抗原表位和Th抗原表位预测研究进展作一简要综述。     

MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的对比评价

比较不同MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的优缺点,为后续应用提供依据.在众多HLA-Ⅱ类抗原表位中,选取HLA-DR的6个表位(DRB1*0101, 0301, 0401, 0701, 1101和1501)为代表,选取MHCBN数据库中的309条已知抗原表位的肽链为待测肽链.使用近年来常用的7个表位预测软件,根据不同软件的临界值确定入选结果数据,比较各软件所得结果与已有的实验结果之间的差距以确定其优劣.综合7个软件预测结果进行评价,得出NetMHCⅡ和NetMHCⅡpan所得结果准确率最高.可以用NetMHCⅡpan及NetMHCⅡ进行MHC-Ⅱ类分子抗原表位预测.不同软件HLA的各个亚型的预测所得指标不一致,提示综合运用不同软件对多肽表位进行预测十分必要.     

旋毛虫抗原分子克隆及其T细胞和B细胞表位预测

目的 克隆旋毛虫肌幼虫Mr21 000抗原蛋白基因(Ts21),预测其T细胞和B细胞表位.方法 旋毛虫(河南地理株)感染小鼠后收集肌幼虫,提取肌幼虫总RNA,应用RT-PCR技术获取目的基因Ts21,构建重组质粒pUC18-Ts21并测序,应用生物信息分析软件预测其T细胞和B细胞表位.结果 成功构建克隆载体pUC18-Ts21.旋毛虫Mr21 000抗原的T细胞表位位于第9～23、135～150位氨基酸位点;B细胞表位位于第31～35、53～56、98～104、124～130、133～157、160～172位氨基酸位点.结论 成功克隆了旋毛虫河南地理株肌幼虫Mr21 000抗原的编码基因,T细胞和B细胞表位预测结果表明该抗原蛋白具有较好的抗原性,可作为旋毛虫病免疫诊断和预防的候选抗原.     

T淋巴细胞抗原表位的预测

Ｔ淋巴细胞抗原表位，就是抗原蛋白中经抗原提呈细胞处理由主要组织相容性抗原分子提呈给Ｔ淋巴细胞受体的多肽片断。确定Ｔ淋巴细胞抗原表位，对于研究细胞免疫的机理、过程，对于研制针对病毒的亚单位多肽及基因疫苗具有重要意义。随着对ＭＨＣ分子构象的阐明，ＡＰＣ细胞提呈抗原过程的逐步了解及试验资料的积累，有可能对Ｔ淋巴细胞抗原表位进行初步预测。     

一种新的CTLs检测方法—可溶性MHC肽四聚体方法

抗原特异性细胞毒性T淋巴细胞 (cytotoxicTlymphocytes ,CTLs)的鉴定是研究CTL疫苗的基础。传统的鉴定方法费时费力 ,敏感性低 ,近年来出现了一种新的检测方法 ,即可溶性MHC 肽四聚体 (soluble MHC peptidetetramer)法 ,该方法克服了已有检测手段的缺点和局限性 ,提高了检测效率和敏感性 ,为鉴定特异性CTLs及研究细胞免疫的工作提供了简便、有效的途径。本文就可溶性MHC 肽四聚体法的原理及应用做一简要综述     

整合法预测HBV相关抗原的HLA-A* 0201限制性结合肽

目的 预测HBV的相关抗原HBsAg、HBcAg、DNA polymerase新的HLA-A*0201限制性结合肽.方法 选取SYFPEITHI、BIMAS、SVMHC、IEDB、EpiJen预测工具以及整合法预测抗原对应蛋白序列P03146,P03138,P03156的HLA-A*0201限制性结合肽,并与现有表位数据库中的结合肽比较.结果 整合法与单个预测算法相比提高了预测的灵敏度和特异性,对3种抗原的预测准确性均有提高,MR(misclassification rate)值分别降为1.14%、3.41%、1.46%;利用此方法发现3种抗原尚未得到实验验证的HLA-A*0201结合肽,分别为,HBcAg:ELMTLATWV(64-72)、LMTLATWVGV(65-74);HBsAg:LMT-LATWVGV(246-254)、IIFLFILLL(244-252)、FLFILLLCU(246-255)、SLYSILSPFL(367-375)以及LLCLIFLLvL(251-260);DNA polymerase:SLFTAVTNFL(513-522)、GLLGFAAPFT(554-563);在HBsAg蛋白序列中发现了31个氨基酸的免疫热点区域FIIFLFILLLCLIFLLVLLDYQGMLPVCPLI(243-273).结论 整合法比单个预测算法性能更好,能够更准确地预测抗原的HLA限制性结合肽,采用该方法所发现的9条可能表位和1个免疫热点区域为后续HBV新表位的鉴定及其功能研究提供了有价值的线索.     

应用噬菌体肽文库筛选mAb F3特异性结合肽

目的 应用噬菌体展示肽文库筛选可与汉坦病毒囊膜蛋白中和性单抗（mAb） F3特异性结合的配体肽。方法 以F3mAb为筛选配基，对噬菌体展示和随机12肽文加进行3轮生物亲和淘选；用夹心ELISA和竞争ELISA鉴定筛选克隆的结合特性，并进一步对阳性克隆进行序列测定和分析。结果 通过3轮生物淘选，能被抗体捕获的噬菌体克隆为21／22，ELISA测定显示，筛选到的噬菌体短肽能与F3mAb特异性结合。序列分析表明，7个阳性克隆氨基酸序列相同，均为－MHGPTKNQMWHT；同源性分析显示，该序列与HTNV／SEOV M蛋白G2区第750－759位氨基酸有较高的同源性。结论 本研究为基于表位水平的HFRSV特异性分子多肽疫苗的设计提供了重要的依据。     

MHCⅠ类分子及与之结合的抗原肽

细胞内生性抗原需降解成抗原肽，由ＭＨＣⅠ类分子呈递给ＣＤ８￣＋Ｔ细胞识别，从而诱导特异性细胞免疫应答。ＭＨＣⅠ类分子与抗原肽之间的结合表现出ＭＨＣ等位基因特异性，根据此特点可以预测抗原的Ｔ细胞识别表位，对于阐明自身免疫病和器官移植排斥反应的机理，指导人工合成肽疫苗用于病毒感染及肿瘤的免疫防治均具有重要意义。     

尿酸对HBV表位肽S28-39负载DC诱导免疫效应的影响

目的 观察尿酸对由HBV表面抗原表位肽负载的树突状细胞诱导免疫效应的影响.方法 以负载肽S28-39的小鼠骨髓来源树突细胞,联合尿酸(uric acid, UA)尾静脉注射接种小鼠,每周1次,共2次.分为DC对照组,联合尿酸组,尿酸对照组,正常对照组.流式细胞仪法检测特异性CTL活性;ELISA法检测小鼠脾细胞培养上清液IFN-γ水平.结果 体内S28-39特异性CTL,以联合尿酸接种组杀伤活性最强;联合尿酸接种组脾细胞IFN-γ分泌较对照组增高.结论 尿酸能够增强乙肝表位肽负载的树突细胞诱导的S28-39特异性CTL杀伤活性;能促进免疫小鼠脾淋巴细胞分泌IFN-γ.尿酸具有增强负载S28-39树突细胞诱导的细胞免疫效应的活性.     

树突状细胞经MHC-Ⅰ类分子替代递呈途径诱导CTL产生特异性抗肿瘤作用

树突状细胞作为最有效的专职抗原递呈细胞，表面存在结合抗原的ＤＥＣ－２０５受体，随着细胞的不断成熟，对抗原俘获加工能力减弱，细胞迁移能力增强，共刺激分子表达增强，Ｔ细胞粘附能力和抗原递呈能力增强，细胞因子合成增加。树突状细胞不但可以经ＭＨＣ－Ⅱ类分子途径递呈外源性抗原Ｔ辅助细胞，而且经ＭＨＣ－Ⅰ类分子替代途径递呈抗原肽段给杀伤性Ｔ淋巴细胞，以发挥对肿瘤细胞的特异性杀伤溶解作用。     

CPP Tat49-57促进外源CTL表位进入MHC-Ⅰ类抗原呈递途径的机制研究

目的 研究穿膜肽（cell-penetrating pepfides,CPP）促进外源CTL表位进入抗原呈递细胞（antigen-presenting cell,APC）内MHC-Ⅰ类抗原呈递途径的效应及呈递机制。方法应用多肽固相合成技术,将源于HIV-Tat的穿膜序列Tat49-57连接在H-2K^b限制性CTL表位0VA257-264的氨基端形成融合肽即Tat49-57-CTL257-264,同时合成该表位和氨基端自然延伸的对照肽NH2 extended-0VA257-264。采用流式细胞仪（FACS）分析技术,检测APC对各肽的MHC-Ⅰ类抗原呈递动力学,并进行MHC-Ⅰ类抗原呈递阻断和TAP依赖性实验。结果在所测时间点,APC对于Tat49-57-CTL257-264的呈递强度均明显高于NH2 extended OVA257-264;氨基肽酶抑制剂Bestatin可部分抑制APC对于Tat49-57-CTL257-264的MHC-Ⅰ类抗原呈递,而蛋白酶体抑制剂Lactacystin则无抑制效应;Tat49-57-0VA257-264可被TAP缺陷细胞RMA-S内MHC-Ⅰ类分子有效呈递,其呈递强度远超过RMA-S细胞对NH2 extended-0VA257-264的呈递。此外,RMAS固定后则丧失对Tat49-57-0VA257-264和NH2 extended-0VA257-264的MHC-Ⅰ类限制性呈递能力,但其表面的“空”MHC-Ⅰ类分子仍可呈递单纯表位肽0VA257-264。结论CPP Tat49-57可有效促进与之融合的CTL表位肽被细胞内MHC-Ⅰ类分子提呈,表现为动力学显著增强,且该过程表现为蛋白酶体／TAP非依赖、氨基肽酶依赖。     

超抗原TSST－1的T细胞表位预测

本文采用可及性和可塑性方案对超抗原ＴＳＳＴ－１的Ｔ细胞表位进行预测，结果显示：Ｔ细胞表位可能位于残基６５～７８、９０～９５、１０８～１１２、１４４～１５２和１５８～１８０或它们附近。它们的二级结构均含无规则卷曲。在这些预测的Ｔ细胞表位中，有一个与文献报道的ＴＳＳＴ－１之Ｔ细胞表位基本相符，还有一个含有数个已确定的ＴＳＳＴ－１超抗原之必需氨基酸残基。本研究为用合成肽对ＴＳＳＴ－１Ｔ细胞表位的研究提供了线索。     

H—2^b和H—2^d单体型小鼠MHC I类分子结合的HFRSV蛋白抗 …

本文通过对Ｈ－２＾ｂ和和Ｈ－２＾ｄ单体型小鼠主要组织相容性抗原Ｉ类分子结合抗原肽的分析，建立了一个计算机预测模型，并对肾综合征出血热病毒核蛋白（ＮＰ）及囊膜糖蛋白Ｇ１和Ｇ２可与Ｂａｌｂ／ｃ小鼠（Ｈ－２＾ｄ）和Ｃ５７ＢＬ／６（Ｈ－２＾ｂ）小鼠ＭＨＣ Ｉ类分子相结合的抗原表位进行了分析，预测出可分别与Ｈ－２Ｋ＾ｂ，Ｈ－２Ｄ＾ｄ，Ｈ－２Ｄ＾ｄ和Ｈ－２Ｌ＾ｄ结合的核蛋白表位，依此各有７，１４，４，０和８个     

基于氨基酸性质的EB病毒抗原MHC-Ⅰ类分子限制性表位的定量构效关系建模

目的建立EB病毒(EBV)抗原表位的理论计算模型并用于其定量预测,为肿瘤免疫的多肽疫苗设计提供理论基础。方法从表位数据库中收集33条EBV抗原表位,使用逐步回归(STR)方法筛选2个对平衡解离常数(KD)贡献较大的结构参数用于表位的结构表征,最后用多元线性回归(MLR)方法建立结构参数与KD的定量构效关系(QSAR)模型。结果该模型具有较好的稳定性(R2=0.637,Q2=0.581)与预测能力(R2test=0.501)。结论此方法可确定表位中各个氨基酸的物理性质对于平衡解离常数的贡献,为表位设计与改造提供直接线索;STR和MLR相结合建模方法具有物化意义明确、易于解释及操作简便易行等优点。     

MUC1模拟表位肽致敏DC治疗宫颈癌荷瘤小鼠

目的 研究黏蛋白1(MUC1)模拟表位肽致敏树突状细胞(DC)对宫颈癌荷瘤小鼠生长和T淋巴细胞亚群的影响。方法 培养小鼠骨髓细胞，诱导并刺激DC成熟，将MUC1模拟表位肽加入成熟DC，形成负载MUC1模拟表位肽的DC。建立稳定表达MUC1的宫颈癌U14细胞株荷瘤BALB/c小鼠模型。空白对照组注射0.2 mL生理盐水；DC组注射2×10⁵个未加MUC1模拟表位肽的DC;DC+MUC1组注射2×10⁵个经过负载MUC1模拟表位肽的DC。免疫1周后，进行二次免疫。结果 肿瘤体积与治疗前比较，空白对照组、DC组和DC+MUC1组均升高(P<0.05)；治疗前，各组间比较差异无统计学意义(P>0.05)；二次免疫1周后，DC+MUC1组低于空白对照组和DC组(P<0.05)，空白对照组和DC组间差异无统计学意义(P>0.05)；小鼠抑瘤率DC组和DC+MUC1组均高于空白对照组(P<0.05),DC+MUC1组高于DC组(P<0.05)；小鼠外周血CD3⁺、CD4⁺、CD...