TCF7L2、CDKAL1、SLC30A8和HHEX基因多态性与2型糖尿病微血管并发症的相关性

目的 研究TCF7L2、CDKAL1、SLC30A8和HHEX基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与2型糖尿病微血管并发症的相关性.方法 采用病例-对照方法分析研究对象[糖尿病视网膜病变组(diabetic retinopathy,DR)479例,糖尿病肾病组(diabetic nephropathy,DN) 248例,对照组650名]的TCF7L2基因rs7903146、rs6585205、rs11196218位点,CDKAL1基因rs10946398、rs4712527位点,SLC30A8基因rs13266634、rs3802177、rs11558471位点,HHEX基因rs1111875、rs7923837位点多态性与DR、DN发病风险的关系.结果 SLC30A8 rs11558471的等位基因及基因型频率在DR与对照组间差异有统计学意义(P＜0.05),等位基因A、基因型AA的OR值分别为1.27、1.68,TCF7L2 rs11196218的A等位基因在DN与对照组之间差异有统计学意义(P=0.0051,OR=1.37),但对P值做Bonferroni校正后差异无统计学意义.SLC30A8 rs13266634和rs3802177,CDKAL1 rs10946398,TCF7L2 rs6585205、rs7903146、rs11196218,HHEX rs7923837的等位基因及基因型频率在DR组与对照组间比较差异无统计学意义(P＞0.05),TCF7L2 rs6585205,CDKAL1 rs4712527,SLC30A8 rs13266634、rs3802177和rs11558471和HHEX rs7923837的等位基因和基因型频率在DN与对照组间差异无统计学意义,但是其相应的OR值都大于1.结论 SLC30A8基因多态性可能与DR发病相关;TCF7L2基因多态性可能与DN发病相关;不能排除CDKAL1、TCF7L2、HHEX基因多态性与DR的相关性及SLC30A8、CDKAL1、HHEX基因多态性与DN的相关性.     

ADAM33 基因rs2280090, rs487377, rs2787094 多态性与哮喘的相关性研究

目的:探讨ADAM33 基因多态性与青岛地区汉族成人哮喘的相关性。方法:采用SNaPshot 方法检测研究对象ADAM33 基因rs2280090、rs487377、rs2787094 共3 个位点的基因多态性。结果:rs2280090、rs487377 和rs2787094 基因型频率在哮喘组与对照组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:ADAM33 基因rs2280090、rs487377 和rs2787094 多态性与青岛地区汉族成人哮喘无相关关系。     

OX40L基因多态性与复发性流产相关性的研究

目的通过检测OX40L基因rs1234315、rs2205960、rs17568、rs2298212位点多态性基因频率,探讨这些位点与复发性自然流产之间的关系。方法采用EILSA方法检测65例复发性自然流产患者以及75例正常妊娠患者外周血血清IL-10、IL-2细胞因子;采用直接测序法检测上述患者OX40L基因rs1234315、rs2205960、rs17568、rs2298212等位点多态性。结果复发性自然流产组患者血清中IL-2水平(83.82±50.29pg/m L)显著高于正常妊娠组(66.42±30.64pg/m L)(P0.05);复发性自然流产组患者血清中IL-10(18.86±12.63pg/m L)显著低于正常妊娠组(24.96±9.42pg/m L)(P0.05)。两组OX40L基因rs1234315、rs2205960、rs17568多态性位点的基因型和等位基因频率均无统计学差异(P0.05):复发性自然流产组rs2298212基因A/A基因型频率显示高于正常妊娠组(P0.05),两组G/G基因型与G/A基因型无显著差异(P0.05)。结论 OX40L基因SNPrs2298212基因A/A基因型可能是复发性自然流产危险因素,需要进一步研究证实。     

PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨PD-1基因多态性与肺结核发病风险以及临床特征的相关性。方法采用PCRRFLP分析方法,检测262例肺结核患者和255例健康志愿者基因组DNA中PD-1基因SNP位点rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布情况,分析PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系;并收集了肺结核患者的临床资料,考察PD-1基因多态性与肺结核临床特征的相关性。结果对照组rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;rs2227981位点T等位基因(OR=2.721,95%CI:2.003~3.697,0.001)、rs2227982位点C等位基因(OR=1.614,95%CI:1.262~2.064,0.001)均与肺结核易感性相关;与rs2227981 CC基因型相比,携带PD-1 rs2227981 CT或TT基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=2.937,95%CI:2.018~4.274,0.001),且患者病灶范围较大(=0.009),痰菌阳性率较高(0.001);与rs2227982 TT基因型相比,携带rs2227982 TC或CC基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=1.706,95%CI:1.187~2.452,=0.004),且患者结核空洞的发生率较高(=0.021)。结论 PD-1基因rs2227981和rs2227982位点SNP多态性与肺结核易感性及临床特征相关。     

DNMT1和DNMT3B基因多态性与食管癌发病风险的关联分析

目的 探讨DNMT1基因多态性位点(rs16999593,rs2228611)和DNMT3B基因多态性位点(rs2424908)的基因型与食管癌及其病理参数的关联.方法 采用病例对照研究,使用MassARRAY检测技术对258例食管癌患者和260例健康对照的3个多态性位点基因型分布进行分析.采用Logistic回归模型分析各基因型与食管癌发生的关系并比较不同基因型与食管癌病理参数的关系.结果 DNMT1基因rs16999593位点TC基因型(OR =0.69,95％ CI:0.47～1.00)和rs2228611位点GA基因型(OR =0.67,95％ CI:0.46 ～0.98)与食管癌的低风险相关,rs16999593 TC、CC基因型与食管癌分化程度相关(中分化:TC vs.TT:OR =0.53,95％ CI:0.33 ～0.86;低分化:CC vs.TT:OR=2.79,95％ CI:1.12～6.91),rs2228611 GA基因型与高分化食管癌(GA vs.GG:OR=0.47,95％ CI:0.25 ～0.88)和无周围淋巴结转移(GA vs.GG:OR=0.62,95％ CI:0.39 ～0.98)有关,DNMT3B基因rs2424908 CC基因型与肿瘤Ⅲ～Ⅳ分期(CC vs.TT:OR=0.38,95％CI:O.15～0.92)及远端淋巴结转移(CC vs.TT:OR =0.18,95％ CI:0.40 ～0.80)相关.结论 本研究发现rs16999593和rs2228611位点与食管癌的发生及分化程度相关,rs2228611和rs2424908位点和淋巴结转移相关,rs2424908位点和肿瘤分期有相关性.     

脑源性神经营养因子相关基因与创伤后应激障碍患者的人格特征关联性

目的:分析脑源性神经营养因子(BDNF)主要传导通路中BDNF、PKB1、GSK-3B、PRKCG基因多态性与创伤后应激障碍(PTSD)康复人群艾森克人格的关联性,探讨其单基因及联合作用对人格的影响。方法:严格按照入组标准筛选创伤后应激障碍患者114例,采用PTSD进行诊断,用艾森克人格问卷(EPQ)测量人格特征。采用聚合酶链反应(PCR)直接测序法检测BDNF、PKB1、GSK-3B以及PRKCG基因的单核苷酸多态性(SNP)。结果:Hardy-Weinberg遗传平衡检验到BDNF、PKBI、GSK-3B、PRKCG 4个基因的6个SNPs,即BDNF rs6265和rs712444,PKBl rs2494746和rs2494738,GSK-3Brs6782799以及PRKCG rs3745406间PTSD患者临床痊愈后所测人格差别无统计学意义。6个SNP基因型分布在总样本中均符合Hardy-weinberg遗传平衡(P0.05),样本具有群体代表性。结论:BDNF rs6265,BDNF rs712444,PKB1rs2494746,PKB1rs2494738,GSK-3Brs6782799,PRKCG rs3745406位点与PTSD患者临床痊愈后所测人格可能无关联。     

IL-4R、IL-13、ADAM33基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性研究

目的:探讨IL-4受体基因Arg551Gln(rs1801275)、IL-13基因Arg130Gln(rs20541)、ADAM33基因T1(rs2280091)位点基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例-对照的方法,用聚合酶链反应及直接基因测序法比较116例支气管哮喘组与70例正常人对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组和对照组IL-4受体基因Arg551Gln位点和IL-13基因Arg130Gln位点的基因型和等位基因型频率的差异有统计学意义,ADAM33基因T1位点基因型哮喘组和对照组差异有统计学意义,等位基因型频率在哮喘组和对照组差异无统计学意义。结论:提示IL-4R Arg551Gln(rs1801275)位和IL-13基因Arg130Gln(rs20541)位的多态性可能与中国皖南地区汉族哮喘有相关性;ADAM33基因(rs2280091)T1位点位的多态性可能与中国皖南地区汉族哮喘无相关性。     

碱性成纤维生长因子基因单核苷酸多态性与广西壮族男性骨质疏松的关系

目的 探讨碱性成纤维生长因子(bFGF)基因5个单核苷酸多态性（SNPs）与广西百色地区壮族男性骨密度（BMD）的关系。方法 选取壮族男性147例跟骨骨量减少患者和154例骨量正常对照进行病例对照研究,采用单碱基延伸的单核苷酸多态性分型技术对广西百色地区301例壮族男性的脂联素基因的5个位点（rs308379、rs12644427、rs3789138、rs308442和rs3747676）进行了基因分型,采用法国生产的Osteospace干式超声骨密度仪测量右侧跟骨超声振幅衰减（BUA）。结果 rs308379、rs12644427、rs3789138、rs308442和rs3747676多态性分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律（ P >0.05）。以5个多态性位点作为自变量的多元Logistic回归显示,仅rs308442多态性与跟骨骨量减少显著相关（OR =1.831,95% CI :1.075~3.116, P =0.026）。 结论 bFGF基因第1内含子rs308442多态性与壮族男性 BMD可能有一定关联,其中TT型可能对BMD具有一定的保护作用,TA型是BMD降低的危险因素。rs308379、rs12644427、rs3789138及rs3747676多态性与壮族男性BMD无相关性。     

AKT1基因多态性与利培酮治疗精神分裂症8周疗效的关联研究

目的:探讨AKT1基因多态性与利培酮治疗首发、未用药精神分裂症8周后疗效的关联。方法:共入组150例符合美国精神障碍诊断与统计手册第4版(DSM-IV)诊断标准的汉族精神分裂症门诊或住院患者,其中完成利培酮(治疗剂量4~6 mg/d)治疗8周者为128例。采用治疗8周后阳性与阴性症状量表(PANSS)减分率评估药物疗效;采用DNA测序方法,在128例汉族精神分裂症患者中,检测AKT1基因4个单核苷酸多态性(SNP)位点(rs1130214、rs10149779、rs1130233、rs2494732)的基因型,并采用数量性状位点分析方法(QTL)探索AKT1基因多态性与利培酮治疗精神分裂症疗效的关联。结果:AKT1基因rs1130233(GA)及rs2494732多态性(CT)与利培酮治疗精神分裂症8周后PANSS减分率关联显著(P0.05),经多重检验Bonferroni校正后仍有统计学意义。而rs1130214与rs10149779在本样本中与利培酮疗效的关联无统计学意义(P0.05)。结论:本研究提示在中国汉族人群中,AKT1基因多态性可能与利培酮治疗精神分裂症急性期疗效关联,有望对个体化药物疗效预测提供依据。     

TPH2基因多态性与重度抑郁发作治疗反应的关系研究CSCD

目的分析TPH2基因多态性与重度抑郁发作（major depressive disorder,MDD）治疗反应之间的相关性。方法收集304例接受抗抑郁药治疗的MDD患者。用MassArray质谱分析法对TPH2基因的3个单核苷酸多态性（rs1007023、rs1023990和rs4570625）进行基因分型。用HAMD-17量表评估基线和治疗1、2、4和6周后的效果。结果共290名受试者完成了研究,其中rs4570625基因多态性与抗抑郁治疗的效果存在显著的相关性,有效组和无效组的基因型、等位基因分布频率差异具有统计学意义（P=0．013,P=0．007）,经错误发现率校正后,上述差异仍具有统计学意义（P=0．039,P=0．021）,治疗有效的患者中等位基因G和GG基因型的频率更高（OR=1．70,95％CI=1．15～2．51;OR=3．34,95％CI=1．40～7．98）。未发现rs1007023和rs1023990基因多态性和抗抑郁药疗效存在相关性（P〉0．05）。结论TPH2基因rs4570625多态性可能与抗抑郁药疗效存在一定的关联。     

TLR7基因单核苷酸多态性与江苏淮安哮喘患者易感性的相关性研究

目的:探讨Toll样受体7(TLR7)基因rs179009、rs179019、rs5935436位点多态性与江苏淮安地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例对照方法,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法比较158例支气管哮喘组与137例健康对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组TLR7基因rs179009、rs170019位点基因型及等位基因型频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。rs5935436位点基因型及等位基因型频率在哮喘组和对照组间差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:TLR7基因rs179009位点和rs179019位点的多态性可能与江苏淮安地区汉族人群哮喘相关;而rs5935436位点的多态性可能与江苏淮安地区汉族人群哮喘无关。     

湖北汉族健康人群肿瘤转移抑制基因Nm23基因多态性的测定及分布

目的:建立Nm23基因上10个单核苷酸多态性位点基因型的检测方法,并探讨这些位点在湖北武汉地区健康汉族人群中基因型分布特点,为研究Nm23基因多态性与相关疾病或药物不良反应关联性提供依据。方法:随机选取武汉地区健康体检人群200例,其中男性115例,女性85例。采用实时荧光Taq Man-MGB探针等位基因分型技术进行Nm23基因启动子及内含子区域共10个单核苷酸位点多态性检测。并采用分片段扩增直接测序方法对上述位点进行抽样验证。结果:建立的方法能够准确、快速地对Nm23基因单核苷酸多态性位点进行分型检测。所选Nm23基因上10个位点在湖北汉族人群中分布同国内其他地区研究及Hap Map数据库中北京地区汉族人群相近。且均符合Hardy-weinberg平衡,其中rs16949649与rs7207370、rs34214448,rs2159359与rs2302254、rs8075231、rs2041296、rs8071647位点间高度连锁不平衡,并运用Heploview软件筛选出4个Tag SNPs:rs34214448、rs2302254、rs11868380、rs2318785。结论:试验中建立的基因型测定方法可满足Nm23基因遗传多态性研究的需要,在Nm23基因多态性与相关疾病及药物不良反应关联性研究中可能具有重要应用价值。     

白介素受体相关激酶-1基因多态性与类风湿关节炎的相关性

目的探讨白介素受体相关激酶-1(IRAK1)rs3027898和rs1059703多态性性与类风湿关节炎(RA)易感性及临床参数的关系。方法收集RA患者123例和体检的220名健康对照者外周血标本,采用聚合酶链反应-连接酶检测反应(PCR-LDR)方法检测IRAK1 rs3027898和rs1059703基因多态性,收集并计算RA患者临床参数:发病年龄、性别、RF抗体、抗CCP抗体、RA疾病活动(DAS28≥3.2)、骨破坏和用药情况。结果 RA组IRAK1 rs3027898和rs1059703的基因型频率和等位基因频率与健康对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。RA患者IRAK1 rs3027898和rs1059703基因型与发病年龄、性别、RF抗体和抗CCP抗体阳性率、骨破坏阳性率均无相关性(P>0.05)。RA患者IRAK1 rs3027898基因型与RA疾病活动无相关性(P>0.05),RA患者IRAK1 rs1059703基因型与RA疾病活动存在相关性(P<0.05),携带CT+TT基因型RA患者疾病活动的风险是携带CC基因型RA患者4.243倍(P=0.023,OR=4.243,95%CI为1.223～14.715)。结论我国汉族人群中,IRAK1 rs3027898和rs1059703多态性与RA的易感性无关,但IRAK1 rs1059703多态性可能是RA患者疾病活动的一个遗传危险因素。     

白细胞介素1B基因连锁不平衡与原发性冻结肩的易感性

背景:国内外大量文献证实白细胞介素1β的升高与原发性冻结肩相关,白细胞介素1B(IL-1B)基因多态性能够影响白细胞介素1β相关基因的转录及蛋白表达,使得体内细胞因子水平发生改变,从而改变原发性冻结肩的发生率。拟通过对白细胞介素1B基因多态性与原发性冻结肩易感性的研究,从分子生物学角度为原发性冻结肩的发病机制探索新的突破口,寻找原发性冻结肩的易感基因。目的:探索白细胞介素1B基因中3个基因位点连锁不平衡与原发性冻结肩易感性的关联性。方法:采用病例对照研究,将研究对象分为2组,一组为184例原发性冻结肩患者,另一组为260名健康对照人群。通过聚合酶链反应和限制性片段长度多态性方法检测两组白细胞介素1B基因位点-511C/T(rs16944)、+3954C/T(rs1143634)和-31C/T(rs1143627)的基因型,并比较分析这3个位点连锁不平衡概率以及形成单倍体与原发性冻结肩患病风险率之间的相关性。结果与结论:经非条件Logistic回归分析发现,在原发性冻结肩中rs1143634位点和rs1143627位点CT基因型比例明显增加且差异有显著性意义;连锁不平衡分析显示对照组中rs16944、rs1143634、rs1143627位点趋于平衡(D’值<0.1),而原发性冻结肩组中rs1143627与rs1143634位点之间存在一定程度上的连锁不平衡(D’值=0.595);单倍体型TTT相较于CCT型可使得原发性冻结肩风险增加6.66倍(TTT,OR=6.66,95%CI=1.59-27.88,P=0.0097)。结果表明,在原发性冻结肩患者中白细胞介素1B基因rs1143627与rs1143634位点之间存在一定程度上的连锁不平衡;由3个基因位点形成的单倍体型TTT可能会增加罹患原发性冻结肩的风险。     

SIRT1基因多态性与广西永福地区人群长寿的关联性

目的 探讨SIRT1基因多态性与广西永福地区人群长寿的关联性.方法 采用长寿对照设计,选取广西壮族自治区永福县共500人为研究对象,包括长寿组223人、平均年龄(93.17±3.08)岁,对照组277人、平均年龄(46.92±17.12)岁.应用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线技术结合测序验证法检测SIRT1基因上的rs3758391,rs3740051,rs2273773,rs4746720和rs10997870位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的分布情况,比较长寿组与对照组人群的等位基因、基因型频率的分布特征,分析SIRT1基因多态性与长寿的关联性.结果 长寿组rs4746720位点CT基因型频率高于CC和TT基因型频率,差异具有统计学意义(P=0.000,OR=2.098,95％CI:1.412-4.117),其等位基因频率在两组间分布的差异无统计学意义.rs3758391 、rs3740051 、rs2273773位点的基因型频率和等位基因频率在长寿组和对照组间分布的差异均无统计学意义.结论 SIRT1基因rs4746720单核苷酸多态性与广西永福地区长寿人群相关联.     

clock基因rs3817444多态性与大学生抑郁症、原发性失眠的关联分析

目的:探讨clock基因与大学生抑郁症、原发性失眠的关联。方法:用Snapshot SNP分型技术对88例(其中抑郁睡眠障碍65例)大学生抑郁症患者、55例原发性失眠患者和110名大学生正常对照进行clock基因rs3817444位点分型,比较三组间该基因多态性基因型和等位基因频率的差异。结果:与对照组相比,抑郁症组rs3817444多态性的基因型和等位基因的频率差异无统计学意义(P0.05);与对照组相比,原发性失眠组rs3817444多态性的等位基因频率差异有统计学意义(P0.05);对rs3817444多态性三种基因型C/C、A/C、A/A抑郁症和原发性失眠大学生的临床资料比较,显示各项没有明显差异(P0.05)。结论:clock基因rs3817444多态性可能与大学生抑郁症的发病无关联,但与大学生原发性失眠可能关联。     

干扰素诱导跨膜蛋白3基因rs12252多态性与新型冠状病毒肺炎关联性研究

目的:了解干扰素诱导跨膜蛋白3（IFITM3）基因rs12252多态性与新型冠状病毒感染之间的关联。方法:选择2020年1月至2021年1月北京市监测发现的新型冠状病毒肺炎病例及无症状感染者446例和健康对照人群65例。提取呼吸道样本基因组DNA,使用Sanger测序法检测IFITM3基因rs12252多态性。结果:无...     

精氨酸加压素基因多态性在广西人群中的分布

目的探讨精氨酸加压素(AVP)基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2282018、rs3787482和rs1887854在303例广西人群中的分布,并对比不同族群间AVP基因型及等位基因频率分布的差别。方法采用单碱基延伸的聚合酶链反应(PCR)技术和DNA测序法,检测303例广西人AVP基因多态性,分析广西人群3个位点的基因型和等位基因的分布频率,并与人类基因组计划(Hap Map)公布的欧洲人、中国北京汉族人、日本人和非洲人的基因多态性分型数据比较,分析这5个人群人类的基因型及等位基因的分布频率。结果我国广西人群AVP基因rs2282018、rs3787482及rs1887854位点各自具有3种基因型,基因型和等位基因分布与性别无关。与人类基因组计划(Hap Map)公布的欧洲人、非洲人、日本人和中国北京人的单核苷酸多态性分型数据进行比较,广西人群AVP基因不同多态性位点的基因型和等位基因频率在不同地区人群的分布存在差异。结论广西地区人群中存在AVP基因多态性。广西人群AVP基因多态性的分布频率与其他不同地区种族人群比较存在差异。     

VEGF基因及KDR基因多态性与妊娠期高血压病的相关性研究

目的探讨VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点,与中国北方妇女妊娠期高血压疾病(HDCP)遗传易感性的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分型技术(PCR-RFLP)对164例中国北方地区妊娠期高血压病人和114例正常对照病人。结果 VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点中,病例组与对照组比较,P值均大于0.05,提示3个位点均无统计学意义。结论 VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点多态性与东北地区妇女HDCP遗传易感性可能无关。     

剥脱综合征与LOXL1基因多态性相关性的meta分析*

 目的：研究类赖氨酰氧化酶1（LOXL1）基因多态性与剥脱综合征（XFS）和剥脱综合征性青光眼（XFG）的关系。方法：以LOXL1、多态性和XFS/XFG为关键词进行meta分析,在PubMed和Embase检索2013年5月前发表的相关文献,应用随机效应模式和固定效应模式研究LOXL1基因多态性（rs1048661、rs2165241和rs3825942)与XFS/XFG发病风险的优势比（OR）和95%可信区间。结果：在高加索人群中LOXL1基因多态性（rs1048661、 rs2165241和rs3825942) 同XFS/XFG的发生呈正相关,OR值分别是 2.19(1.96~2.45)、 8.80(6.05~12.79) 和3.41(3.11~3.73)。而在亚洲人群中,LOXL1基因多态性（rs1048661和rs2165241）同 XFS/XFG 的发生呈负相关, OR值分别是 0.06 (0.02~0.18)和0.15 (0.09~0.25)。结论：LOXL1基因多态性同XFS/XFG发生密切相关,但各种群之间相关性有所不同。