黄芪-生地治疗糖尿病肾病作用机制的网络药理学研究

目的:应用网络药理学方法探讨黄芪-生地干预糖尿病肾脏疾病(diabetic kidney disease, DKD)的物质基础及作用机制。方法:应用TCMSP及TCMID数据库及结合相关文献筛选黄芪、生地药物成分,运用Swiss Target Prediction分析平台获取活性成分关键靶点,GeneCards数据库获取疾病靶点信息;利用韦恩图获取药物和疾病交集靶点,String数据库对交集靶点进行PPI分析;将交集靶点上传至Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,应用Cytoscape3.8.2软件构建“成分-靶点-信号通路”网络。结果:共查找符合筛选条件药物成分33个,活性药物靶点263个,疾病靶点756个,药物和疾病交集靶点67个,设定条件下,GO功能富集分析共得到53个条目,涉及分子功能、细胞组成及生物过程,KEGG富集分析筛选18条信号通路,关键靶点VEGFA、JUN、MET、EGFR、IGF等主要富集在肿瘤信号途径、c型凝集素受体信号通路、白介素17信号途径等相关信号通路。结论:黄芪-生地可通过多靶点、多途径干预DKD进展,预测中药潜在作用机制,为进一步...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN数据库检索聚精丸中药成分并获取成分对应的靶点;在“GeneCards”“DISGENET”“OMIM”“HPO”数据库检索“varicocele”、“male infertility”,获得精索静脉曲张性男性不育的潜在靶点;利用jvenn工具绘制韦恩图,获得中药靶点与疾病靶点的交集靶点;筛选出与交集靶点相对应的成分及中药,在Cytoscape3.8.2构建中药-活性成分-靶点网络图;应用STRING平台构建病药交集靶点的蛋白-蛋白相互作用网络(PPI);将病药交集靶点导入DAVID数据库进行GO富集分析并进行基于KEGG的通路富集分析;再将病药交集靶点上传至KEGG数据库,选择与本课题最为相关的通路,使用mapper工具构建KEGG通路图;进一步使用FDR值排名前15的通路与其相关靶点、成分绘制核心成分-靶点-通路图;最后,利用AutoDock及PyMol软件对核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共筛选出聚精丸207种成分和1...     

枸杞子治疗骨质疏松症的分子机制

目的 运用网络药理学方法分析枸杞子治疗骨质疏松症的药理学机制。方法 从TCMSP分析平台上获取枸杞子药物的活性成分及潜在的作用靶点,运用Citespace3.7.1软件绘制“有效成分-靶点”网络图;同时分别在OMIM、Drugbank和Genecards三种数据库平台上获取骨质疏松疾病的相关基因,并取并集作为疾病的潜在作用靶点。将枸杞子和骨质疏松疾病的潜在作用靶点取交集,得到中药-疾病共同作用靶点。运用STRING数据分析平台对共同作用靶点进行PPI网络分析,利用cytohubba插件选取前20位显著性基因并取交集即可得到核心基因。对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富分析,而后使用R语言软件对上述的富集结果进行可视化绘图。结果 共筛选获得枸杞子中主要有效成分36个,其中主要核心有效成分有槲皮素、黄豆黄素、β-谷固醇、豆甾醇、谷甾醇α1。活性成分所对应的靶点基因有117个,其中核心基因16个：IL-6、JUN、TNF等。GO富集所得的生物过程主要与调控成骨细胞和破骨细胞的增殖、分化有关。KEGG信号通路富集结果提示,枸杞子治疗骨质疏松疾病作用集中于IL-17、TNF、AGE-RAGE、MAPK等信号通路。结论 枸杞子可能通过多种有效成分、多靶点作用于免疫炎性反应、细胞分化等多方面来发挥抗骨质疏松症的作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气养阴汤治疗甲状腺癌术后的作用机制

目的：利用网络药理学和分子对接技术探讨益气养阴汤治疗甲状腺癌术后的作用机制。方法：通过本草组鉴（HERB）数据库检索益气养阴汤10味药物化学成分,通过PubChem、SwissADNE筛选药物活性成分,Swiss target prediction预测活性成分作用靶点。在Gene Cards、OMIM、DisGeNET、Drug Bank数据库检索获得甲状腺癌术后的疾病靶点。Venny2.1.0平台获得药物与疾病的交集靶点,使用String数据库构建交集靶点蛋白互作网络,并导入Cytoscape3.9.1筛选得到核心靶点蛋白;借助Cytoscape3.9.1构建药物-活性成分-靶点网络图,并获取关键活性成分;使用Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析;对关键靶点和关键成分进行分子对接验证。结果：得到益气养阴汤活性成分157种,预测活性成分作用靶点507个,甲状腺癌术后相关疾病靶点1817个,药物活性成分—疾病交集靶点154个。PPI分析得到SRC、HSP90AA1、PIK3R1、PIK3CA、AKT1为关键靶点基因,槲皮素、山柰酚、木犀草素为关键活性成分,分子对接显示关键靶...     

基于网络药理学及分子对接探讨桂龙护瘘酊治疗自体动静脉内瘘血管内膜增生的作用机制

目的基于网络药理学方法以及分子对接探讨桂龙护瘘酊(GT)治疗自体动静脉内瘘(AVF)血管内膜增生(IH)的作用机制。方法:本研究基于HERB数据库并查阅相关文献,筛选GT方中药物的活性成分,按Lipinsk五原则筛选有效成分,并使用PubChem数据库获取成分的Smile,再用Swiss TargetPrediction数据库预测成分靶点。利用GeneCards、Pharmgkb、OMIM数据库收集AVF血管内膜增生相关靶点。利用Venn在线网站得到GT-AVF血管内膜增生的交集靶点Venn图。利用String平台构建以药物、活性成分、潜在靶点的PPI网络,利用DAVID数据库中对其进行GO富集分析和KEGG信号通路分析,采用分子对接进行验证。结果:通过网络药理学研究,GT方中共获取到主要活性成分81个、关键成分预测靶点30个,应用PPI网络得到ACE、NOS3等关键交集靶点。富集分析后得到221个GO相关条目、47条相关KEGG信号通路,GO分析结果主要集中在异种生物分解代谢过程、外源性药物分解代谢过程等,KEGG富集分析关键通路是钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等,关键靶点主要富集在ADRB3,NOS3,ADRB1等。分子对接显示(-)-Limonene、(-)-alpha-Pinene、Tridecnoic acid核心成分与NOS3蛋白(PDB: 1d0c)核心靶点具有非常好的结合构象。结论:本研究采用网络药理学与分子对接技术,为GT治疗AVF血管内膜增生提供了(-)-Limonene、(-)-alpha-Pinene及Tridecnoic acid等多靶点;钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路的作用特点,主要与调控NOS3蛋白表达水平有关,为后期进一步实验、临床研究提供了理论依据,也是对AVF瘘管处局部外用中药复方防治IH进行的新探索。     

采用网络药理学和分子对接技术探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌的潜在分子机制

目的 采用网络药理学与分子对接技术,探讨“补肾解毒散结方”治疗结直肠癌（Colorectal cancer,CRC）的潜在分子作用机制。方法 采用网络药理学与分子对接技术,利用TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction数据库检索“补肾解毒散结方”主要组方生地黄、女贞子、肉苁蓉和山慈菇的活性成分及潜在靶点,通过Genecards、OMIM数据库检索结直肠癌的治疗靶点。利用Venny2.1.0软件构建药物与疾病交集靶点,STRING数据库建立靶点蛋白相互作用关系,Cytoscape3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。基于Bioconductor数据库运用R语言分析软件对核心靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。通过AutoDockTools-1.5.6等软件预测核心靶点与核心成分的分子对接。结果 “补肾解毒散结方”共有20种活性成分和37个“药物-疾病”交集靶点。GO功能分析得到957条生物学过程、20个细胞组分、76个分子功能,KEGG富集分析得到涉HIF-1、PI3K-Akt、病毒感染、p53、细胞凋亡等102条信号通路,同时,分子对接...     

基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1 817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。     

滋肾降糖丸治疗糖尿病骨质疏松的作用机制探索

目的 通过网络药理学及分子对接的方法探讨滋肾降糖丸治疗糖尿病骨质疏松的作用机制。方法 首先分别在TCMSP及BATMAN-TCM数据库中检索滋肾降糖丸(Zishen Jiangtang Pill, ZJP)的活性成分及作用靶点,GeneCards和OMIM数据库中检索DOP的相关靶点,并利用Venny系统获取ZJP作用于DOP的靶点;然后通过String数据库制作蛋白互作网络,运用Cytoscape软件构建“有效成分-靶点”网络图并利用插件CytoNCA获取网络核心靶点;再通过DAVID数据库对靶点进行GO功能及KEGG富集分析;最后通过PubChem数据库、PDB数据库、ChemOffice软件,进行分子对接,分析结合活性。结果ZJP中主要活性成分236个,关键活性成分5个,ZJP作用于DOP的靶点151个,核心靶点16个,GO富集条目66条,KEGG通路富集条目104条,分子对接良好。结论 ZJP可能作用于TNF、IL-6、VEGF、mTOR、ESR1、PPARG等靶点,通过糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、Wnt/β-cat...     

基于网络药理学和分子对接探讨补肾活血汤“从虚从瘀”治疗骨质疏松症的分子机制

目的采用网络药理学和分子对接技术探索补肾活血汤"从虚从瘀"治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的内在分子机制。方法将补肾活血汤中的药物在TCMSP、Batman-TCM、化学数据库、TCMID数据库和知网上收集相关化学成分及作用靶点,然后对靶点进行基因注释;对Gene Cards和OMIM数据库进行疾病相关靶点检索,获取其对应靶点;然后通过Cytoscape3.7.2软件将药物成分、疾病及靶点的对应关系构建"中药-成分-靶点-疾病"网络可视化,并从String数据库获取交集靶点数据,构建蛋白互作网络;利用R语言软件对基因进行GO和KEGG富集分析;最后对核心化合物及靶点进行分子对接。结果共获取补肾活血汤活性化合物171种,共筛选出11个核心成分,预测出对应靶点166个; OP相关靶点1 335个,两者的交集基因共54个;利用PPI蛋白网络共筛选到13个核心靶点蛋白; GO和KEGG富集分析分别得到279个、63个富集结果;分子对接结果显示补肾活血汤治疗骨质疏松过程中,其核心化合物豆甾醇与MAPK1、PPARG以及β-谷甾醇与PPARG具有良好的结合性能。结论补肾活血汤通过营养支持、免疫调节和抗炎、损伤修复等方面发挥其重要作用,通过网络药理学和分子对接阐释了其"从虚从瘀"治疗骨质疏松的内在分子机制。     

基于网络药理学探讨柚皮苷治疗骨质疏松症的潜在机制

目的基于网络药理学探讨柚皮苷治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的潜在机制。方法根据TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库和Uniprot数据库得到柚皮苷的结构及其靶点,利用Gene Cards、OMIM数据库获取OP相关靶点,将交集靶点输入到STRING数据库以获取蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)信息,借助Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络、"柚皮苷-交集靶标-骨质疏松"网络,并使用Cytoscape 3.7.2软件、R软件进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果筛选得到柚皮苷105个作用靶标,其中与OP相关靶标44个,GO功能富集分析获得607个结果(P0.05),KEGG通路富集分析获得43个结果,其中相关信号通路有11条(P0.05),涉及p53、IL-17、NF-κB、Estrogen、Prolactin等信号通路。结论柚皮苷可能通过多靶点、多通路调节炎症反应、细胞周期和激素代谢来治疗OP。     

纳豆提取物对预防骨质疏松作用的研究

目的 探讨纳豆提取物对骨质疏松症的预防作用,为进一步研究纳豆提取物对骨质疏松的预防和治疗提供理论依据.方法 通过大鼠实验研究纳豆提取物对低钙饲料喂养大鼠体重、身长、钙吸收率、股骨质量、骨密度和骨钙含量的影响.结果 (1)高剂量组(P<0.05)、碳酸钙组(P<0.05)的体重显著大于低钙对照组.高剂量组(P<0.05)...     

鼻整形术对整形美容受术者体像影响的初步研究

目的：探讨鼻整形术对受术者体像的影响,研究体像障碍检出者鼻整形手术前后的体像变化。方法：采用体像障碍自评量表,对108名受术者于鼻整形手术前后进行问卷调查,分析结果。结果：受术者鼻整形手术前体貌关注度、情绪受损度和社会交往度三组指标的平均分值位于前列。体像障碍在鼻整形术受术者中的检出率为16.7%。全部受术者手术前的量表评分为19.23±11.69,手术后下降为15.89±10.26（P〈0.01）;体像障碍检出者的术前量表评分为45.36±5.27,手术后下降为31.08±9.14（P〈0.05）,术后评分降低的指标集中反映在躯体缺陷感、情绪受损度和社会交往度三个方面。结论：鼻整形术受术者手术前对自身体像极为关注,情绪受损严重,鼻整形术能够明显改善受术者的体像状态。体像障碍在鼻整形术受术者中的检出率较高,鼻整形术有助于体像障碍受术者消除消极体像。     

肾气汤对肾硬化大鼠生存影响的研究

目的探讨肾气汤、活血化淤汤及健脾益肾解毒汤对阿霉素肾病、肾小球硬化模型大鼠生存的影响。方法使用肾气汤、活血化淤汤及健脾益肾解毒汤对肾小球硬化模型进行干预,观测各组大鼠在做模型前、药物干预后的尿蛋白、尿糖、血浆白蛋白（ALB）、尿素氮（BUN）、肌酐（CR）、血脂（TG、CH0）的变化。并在用药干预2月后处死大鼠,留取左肾标本,常规石蜡包埋,用来做HE、Masson染色,观察肾脏组织中肾小球硬化和其它病理损伤程度。比较各组大鼠的生存情况,寻找能延长阿霉素肾病、肾小球硬化大鼠生存的药物。结果活血化淤汤能提高大鼠的生存率,而金匮肾气汤可能会加速。肾硬化大鼠的死亡,缩短肾硬化大鼠的生存期。结论肾气汤加速肾硬化大鼠的死亡很可能是阿霉素与附子两者合用的结果。     

围手术期炎症对胃肠肿瘤预后影响的研究进展

胃肠肿瘤术后常发生复发和远处转移，严重影响患者预后，是外科亟待解决的重要问题。目前研究已揭示炎症与肿瘤发生发展的密切联系。炎症伴随着整个围手术期，包括术前肿瘤微环境相关炎症、创伤相关炎症及术后感染相关炎症，这些炎症可表现为促瘤和抑瘤的双重作用。促瘤炎症成为主导时，则可刺激肿瘤原位复发，降低总体生存率。因此有必要对围手术期相关炎症的倾向进行评估。本文综述了国内外基础及临床研究的相关最新进展，简要阐述了炎症作用机制及相应评价指标。