基于乳酸代谢基因的结肠腺癌风险模型构建及其预后价值

目的 基于乳酸代谢的差异表达基因(DEGs)构建结肠腺癌(COAD)的风险模型,并评价其预后价值。方法 自GeneCards数据库获取乳酸代谢相关基因信息,自癌症基因组图谱(TCGA)获取COAD转录组数据及临床信息。采用“limma”包筛选乳酸代谢DEGs,进行单因素Cox回归及Lasso回归构建风险模型,通过Kaplan-Meier曲线及受试者工作特征(ROC)曲线验证风险模型的预测能力。对临床性状和风险模型进行单因素、多因素Cox分析,独立的预后因素用于构建列线图模型。分析风险模型与免疫细胞浸润程度的相关性。对高、低风险组进行差异性分析获取风险DEGs,用于基因本体(GO)及京都基因组基因百科全书(KEGG)富集分析。结果 成功构建包含17个乳酸代谢DEGs的风险模型。高风险组较低风险组的总生存期(OS)及无进展生存期(PFS)明显缩短,均P<0.05。风险模型的ROC曲线下面积(AUC)>0.60。年龄(HR=1.031,95%CI为1.010～1.053,P=0.004)、临床分期(HR=2.193,95%CI为1.674～2.873,P<0.001)和风险...     

弥漫性大B细胞淋巴瘤预后相关microRNA筛选及其预后价值

目的 识别与弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma ,DLBCL)预后相关的microRNA,并结合临床数据评估其预后价值。方法 从GEO (gene expression omnibus)数据库中获取116例DLBCL患者的MicroRNA表达谱数据与临床数据。采用lasso - logistic回归模型识别与DLBCL预后相关的miRNAs,卡方和Fisher确切概率检验筛选与DLBCL患者总生存期(overall survival,OS)相关的临床指标,再利用logistic逐步回归法筛选出预测因子并构建其单因素及多因素Cox比例风险模型。采用时依ROC (time - dependent receiver operating characteristic)曲线评价各模型的预测能力,各模型预测准确性用一致性统计量C评价。结果 Hsa - miR - 23a (HR = 0.20, 95%CI: 0.10～0.39, P＜0.001)和hsa - miR - 566 (HR = 6.69, 95%CI: 2.40～18.65, P＜0.001)与DLBCL患者的OS相关。单因素Cox回归模型与多因素Cox回归模型相比,C统计量差异具有统计学意义(IPI与IPI + hsa - miR - 23a + hsa - miR - 566: Z = 36.2, P＜0.001, hsa - miR - 23a + hsa - miR - 566与IPI +hsa - miR - 23a + hsa - miR - 566: Z = 7.0, P＜ 0.001)。结论 Hsa - miR - 23a高表达是DLBCL患者预后的保护因素,hsa - miR - 566高表达是DLBCL患者预后的危险因素,IPI、Hsa - miR - 23a和hsa - miR - 566这3个指标联合建模可提高DLBCL患者5年生存预测的准确性。     

IL-6启动子区域遗传变异rs1800796与原发性肝癌预后的关联研究

目的探讨白介素6 (IL-6)基因启动子区域遗传变异rs1800796与原发性肝癌预后的关系。方法采用队列研究,对510例原发性肝癌患者进行随访。采用ABI 7900HT的Taqman基因分型技术对遗传变异位点进行检测;采用Kaplan-Meier法和log-rank检验用来估计和比较不同基因型的生存曲线,应用Cox回归分析rs1800796对原发性肝癌预后的影响。采用Breslow-Day法对基因-环境交互作用的一致性检验进行定性分析。结果遗传变异位点rs1800796 GG基因型携带者发生肝癌死亡的风险显著高于CC基因型携带者(HR=1.65, 95%CI:1.09～2.51)。每增加一个G等位基因,携带者发生肝癌死亡的风险增加22%(HR=1.22; 95%CI:1.01～1.46),且IL-6 rs1800796与发病年龄、肿瘤分期之间存在显著的交互作用。结论 IL-6基因启动子区域的遗传变异位点rs1800796与原发性肝癌患者的死亡风险有显著关联。     

基于TCGA数据库分析代谢限速酶相关基因对胃癌患者预后的影响及生存模型预测

目的 采用生物信息学方法,构建胃癌(Gastric Cancer,GC)患者代谢限速酶表达的预后评估模型,并判断对GC患者预后情况。方法 从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)数据库中下载375例GC和32例正常组织标本的RNA测序数据,使用R语言筛选得到差异表达的代谢限速酶。采用Lasso回归模型分析并构建差异代谢限速酶预后模型并对该预后模型的有效性进行验证。此外,使用单因素和多因素COX分析评估临床特征、风险评分是否可以作为GC预后的独立风险因素。结果 筛选得到5个差异表达的代谢限速酶(DCK、GAD1、UCK2、GNE和SOAT1),并建立GC代谢限速酶相关的预后模型,该模型的ROC曲线下面积为0.777,证实该模型具有较好的预后预测价值。多因素COX回归分析表明构建的风险评分是影响GC患者总体生存时间的独立因素(HR=8.889,P＜0.001)。结论 采用TCGA数据库成功构建了GC代谢限速酶相关基因的预后模型,并为判断GC患者的生存预后情况提供帮助。     

基于WGCNA分析和风险评分建模的骨肉瘤转移标志物筛选和预后研究

目的应用WGCNA分析筛选骨肉瘤转移标志物,通过风险评分建立骨内瘤预后的预测模型,为评估骨内瘤转移和预后提供方法指导。方法基于GSE14359数据集(n=20),WGCNA法确定骨内瘤转移模块中的中心基因;获取TARGET公共数据库骨内瘤样本(n=86),在单因素Kaplan-Meier预后分析基础上,Cox多因素计算风险评分构建评估患者生存的预测模型。结果中心基因HLA-DRA和FLI1与骨内瘤转移密切相关(P0.05);风险评分=0.149×G0S2-0.572×ARHGDIB+0.048×CD74+0.242×HLA-DMA-0.473×MGAT1-0.813×PLD3+0.230×EPAS1,有较好的预后评估能力(P0.001;HR=2.72)。结论 WGCNA分析能够有效筛选OS转移标志物,风险评分能识别更灵敏的预后模型。     

CD55启动子区rs2564978多态性影响肝癌遗传易感性

目的 探讨CD55在肝癌中表达及预后影响,并分析CD55 rs2564978遗传变异对肝癌遗传易感性的影响。方法 通过数据库GEO和Kaplan-Meier plotter分析CD55在肝癌中表达及预后影响;随机抽取中国北方汉族334例肝癌患者和940例健康对照进行成组设计病例对照研究。PCR-RFLP法进行基因多态检测,卡方检验比较分类变量的分布,非条件logistic校正混杂因素,OR及其95%CI评价各基因型与肝癌易感性的关系。结果 CD55在肝癌组织中表达上调（t=-3.130,P=0.003）且CD55高表达与携带肝炎病毒的肝癌患者不良预后相关（HR=2.28,95%CI:1.10～4.72,P=0.022）。与TT基因型携带者相比,CT基因型（OR=1.45,95%CI:1.08～1.96,P=0.014）与CC基因型（OR=1.55,95%CI:1.08～2.22,P=0.018）携带者肝癌易感性均上升。分层分析显示,rs2564978 T>C变异增加男性肝癌易感性（OR=1.58,95%CI:1.03～2.41,P=0.036）;高年龄组（>60岁）CC携带者具有更高的肝癌易感性（OR=2.46,95%CI:1.35～4.47,P=0.003）;吸烟人群和饮酒人群中,CC携带者肝癌易感性上升（吸烟:OR=1.91,95%CI:1.02～3.58,P=0.042;饮酒:OR=2.37,95%CI:1.20～4.67,P=0.013）。结论 CD55在肝癌组织中表达上调并导致肝癌患者预后不良;CD55启动子区rs2564978遗传变异可能与肝癌易感性相关。     

老年冠心病患者经皮冠状动脉介入治疗术后1年预后及相关影响因素

目的探讨老年冠心病患者经皮冠状动脉介入治疗(percutaneous coronary intervention,PCI)术后1 a预后及相关影响因素。方法前瞻性纳入2010年1月—2014年6月在重庆市长寿区人民医院成功行PCI的老年(年龄65岁)冠心病患者128例,随访其术后1 a死亡及主要不良心血管事件发生情况,采用COX比例风险回归模型筛选影响老年冠心病患者预后的主要影响因素。结果 PCI术后患者共128例,年龄在65~77岁之间,平均(75.7±6.8)岁;男性患者73例,占57.0%。术后1 a患者随访率为98.4%,术后1 a一级终点事件发生率为9.5%,二级终点事件发生率为11.9%。多因素COX比例风险回归模型分析结果显示,高血压(HR=1.619,95%CI:1.047~2.505,P=0.022)、不稳定型心绞痛(HR=2.905,95%CI:2.222~3.799,P=0.007)是术后1 a不良心血管事件发生风险升高的独立危险因素,而使用β-受体阻滞剂(HR=0.117,95%CI:0.051~0.276,P0.01)和使用血管紧张素转酶抑制剂/血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂(ACEI/ARB)(HR=0.379,95%CI:0.158~0.911,P=0.003)则是术后1 a不良心血管事件发生风险降低的独立预测因素。结论加强危险因素控制,加强PCI术后充分药物治疗,可在PCI手术基础上改善老年冠心病患者1 a的预后。     

基于TCGA数据库构建肺腺癌预后相关的微小RNAs风险模型

目的寻找肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性的预后相关微小RNAs(microRNAs, miRNAs),为LUAD患者预后预测及个性化治疗方案制定提供依据。 方法下载TCGA数据库中522例LUAD患者组织标本的miRNA-Seq数据和临床病理及生存时间数据,用R语言对LUAD与癌旁组织中差异miRNAs进行分析。采用LASSO & COX回归模型在训练集(245例LUAD)中进行LUAD预后相关miRNAs筛选,并构建基于7个miRNAs表达谱的线性风险模型。根据风险值的高低,以中位风险值为界将患者分为高、低风险组,并分别在测试集(245例LUAD)和总体标本(490例LUAD)中对风险模型预测患者预后的有效性进行验证。采用COX回归分析miRNAs风险模型是否是独立的预后因子。 结果LUAD组织与癌旁组织中共有72个差异表达的miRNAs(上调45个、下调27个)。从训练集中确定miR-101-3p、miR-148a-3p、miR-192-5p、miR-193b-3p、miR-505-3p、miR-584-5p和miR-99a-5p 7个与总生存期相关的miRNAs构建预后风险模型。在训练集、测试集及总体标本中,高风险组患者与低风险组患者相比,总体生存时间均显著降低(P均<0.05)。经多因素COX回归分析,风险模型在训练集、测试集及总体样本中均是一个独立的预后因子(训练集HR=1.97,P=0.02;测试集HR=1.927,P=0.009;总体HR=1.909,P=0.001)。 结论研究确定了7个与LUAD患者预后相关的miRNAs,基于7个miRNAs构建的风险模型是1个独立的预后因子。     

抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者预后影响因素研究及生存分析

目的 探究抗黑色素瘤分化相关基因5（MDA5）抗体阳性皮肌炎患者的预后影响因素及生存分析。方法 选取四川大学华西医院2018年1月至2021年9月期间确诊的178名抗MDA5抗体阳皮肌炎患者,收集相关临床资料并进行随访,根据随访期内是否死亡将入选患者分为生存组和死亡组,采用 Cox 回归分析影响患者预后的因素,Kaplan-Meier法比较在快速进展型间质性肺病、吸烟情况、乳酸脱氢酶及白蛋白水平几种因素影响下的生存情况。结果 共纳入抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者178例,其中生存组136例,死亡组42例,两组患者平均年龄（49.56±11.63）岁。多因素Cox回归结果显示,吸烟（HR=2.23,95%CI:1.06~4.66,P=0.033）、白蛋白<30g/L（HR=2.47,95%CI:1.15~5.31,P=0.021）、乳酸脱氢酶≥400IU/L（HR=2.70,95%CI:1.26~5.76,P=0.010）、合并快速进展型间质性肺病（HR=20.56,95%CI:2.64~159.97,P=0.004）是影响抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者预后的因素。结论 吸烟、低白蛋白血症、高乳酸脱氢酶血症、合并快速进展型间质性肺病都可能是影响抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者不良预后的因素,应密切关注患者患病期间各因素的变化情况,积极采取治疗措施,以改善患者预后。     

单核细胞与淋巴细胞比值及其与上皮性卵巢癌患者预后的关系

目的探讨单核细胞与淋巴细胞比值(MLR)及其与上皮性卵巢癌(EOC)患者预后的关系。方法选择2005年1月至2015年1月,于川北医学院第二临床医学院接受治疗的214例初治EOC患者为研究对象。采用回顾性分析方法,采集所有受试者的临床病例资料。绘制MLR预测EOC患者总体生存(OS)期的受试者工作特征(ROC)曲线,确定MLR预测EOC患者OS期的最佳临界值,并按照MLR最佳临界值,对EOC患者进行分组。统计学比较其临床病理特征和OS期。采用单因素和多因素Cox回归分析方法,对可能影响EOC患者OS期的因素进行分析。结果 (1)根据MLR预测EOC患者OS期的ROC曲线,MLR预测EOC患者OS期的最佳临界值为0.26。按照MLR最佳临界值,将纳入研究的214例EOC患者分为高MLR组(n=128,MLR≥0.26)和低MLR组(n=86,MLR0.26)。2组患者年龄、体重、人体质量指数(BMI)等基本临床资料比较,差异均无统计学意义(P0.05)。(2)高MLR组患者年龄≥62岁、EOC组织病理学类型为浆液性卵巢癌、国际妇产科联盟(FIGO)临床分期为Ⅲ~Ⅳ期所占比例,患者病死率,以及血清糖类抗原125(CA125)水平、白细胞计数、中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)、血小板与淋巴细胞比值(PLR),均显著高于低MLR组,并且差异均有统计学意义(P0.05)。2组患者满意卵巢癌细胞减灭术及合并腹水所占比例,以及血红蛋白水平分别比较,差异均无统计学意义(P0.05)。(3)低MLR组EOC患者的中位OS期为87个月,显著长于高MLR组的38个月,二者比较,差异有统计学意义(χ2=67.166,P0.001)。(4)EOC患者OS期影响因素的多因素Cox回归分析结果显示,FIGO临床分期为Ⅲ~Ⅳ期、EOC组织病理学类型为浆液性卵巢癌、非满意卵巢癌细胞减灭术、血清CA125水平≥35U/mL、MLR≥0.26、NLR、PLR,均为EOC患者OS期的独立危险因素(HR=8.370,95%CI:5.094~13.753,P0.001;HR=1.851,95%CI:1.171~2.924,P=0.008;HR=0.345,95%CI:0.234~0.507,P0.001;HR=2.434,95%CI:1.538~3.851,P0.001;HR=3.364,95%CI:2.145~5.276,P0.001;HR=1.106,95%CI:1.020~1.199,P=0.015;HR=0.998,95%CI:0.996~1.000,P=0.021)。结论 MLR可作为EOC患者预后的预测指标。因本研究为回顾性研究,纳入样本量相对较小,MLR预测EOC患者预后的真实性和准确性,仍有待多中心、大样本、随机对照研究证实。     

大细胞肺癌列线图预后模型构建及验证

目的 探讨大细胞肺癌患者预后影响因素并构建列线图,提高患者生存率。方法 下载SEER数据库2010—2015年诊断为大细胞肺癌患者2 196例,使用多因素Cox比例风险模型筛选患者预后影响因素并构建列线图模型,C指数和ROC曲线验证模型区分度,校准图验证一致性,决策曲线分析验证临床应用价值。结果 年龄、性别、种族、骨转移、肝转移、脑转移、AJCC分期、手术、化疗、肿瘤大小和婚姻是大细胞肺癌患者预后的重要影响因素（P＜0.05）,训练集和验证集的C指数分别为0.765和0.769,训练集1年和3年AUC分别为0.848(95%CI:0.832～0.865)和0.859(95%CI:0.839～0.877),验证集1年和3年AUC分别为0.840(95%CI:0.810～0.869)和0.857(95%CI:0.823～0.891),表明列线图有较高的区分度,校准图表明其一致性较好,决策曲线分析表明列线图的临床应用价值较高。结论 基于大细胞肺癌预后影响因素AJCC分期、手术、化疗等构建的列线图模型,预测价值较高,可评估患者预后,有利于提高患者生存率。     

医院获得性肺炎继发脓毒症患者的预后分析

目的 分析医院获得性肺炎继发脓毒症患者临床特征及90d生存情况,探讨影响预后因素。方法 回顾性分析89例医院获得性肺炎继发脓毒症患者资料,Cox比例风险模型分别对预后行单因素与多因素分析,Kaplan-Meier法进行生存曲线比较。结果 随访率100%。90d生存(OS)率为60.7%,平均生存时间64.0d(95%CI:56.5d~71.5d)。单因素分析显示影响90dOS的因素为APACHE-Ⅱ评分(P<0.001)、血Cre(P=0.003)、△PCT(P<0.001)、心搏骤停(P=0.037)、MODS(P=0.014)。多因素分析显示APACHE-Ⅱ评分(P=0.002)与△PCT(P<0.001)是影响90dOS的独立预后因素。结论 医院获得性肺炎继发脓毒症患者生存率低,APACHE-Ⅱ评分与PCT变化程度是影响生存的独立因素。     

Keap1 rs11668429和 AHSA2 rs728825与延边地区原发性肝癌发病风险的研究

目的 探讨Keap1 rs11668429和AHSA2rs728825与延边地区肝癌易感性的关系.方法 选取延边地区192名肝癌患者为病例组、190名健康人为对照组进行研究.采用PCR-RFLP方法检测基因型及基因频率.采用二元logistic回归模型分析Keap1 rs11668429位点和AHSA2rs728825...     

华裔女性生殖系统肿瘤的预后分析: 基于SEER数据库的回顾性研究

目的 利用 SEER 数据库中华裔女性生殖系统肿瘤的患者数据,展开预后因素研究,以指导临床预后判断和治疗决策。 方法 从 SEER 数据库中提取出患者的人口统计学指标,分期指标,肿瘤特征、诊断治疗指标和生存结果。采用 Kaplan-Meier 法构建生存曲线,利用 long-Rank 检验评估曲线之间的统计学差异;并使用VIF 指标,逐步回归对预后因素进行选择,依据选择的重要预后因素,建立 COX 多因素风险回归模型,依据建模结果绘制列线图和 ROC 曲线,从而量化预后因素,进而帮助临床判断和决策。 结果 年龄增加 (OS: HR =7.543 95% CI : 2.672~21.290 P <0.05),进入更年期 (OS: HR =1.024 95% CI : 0.454~2.312 P <0.05),无伴侣 (OS: HR =1.273 95% CI : 0.931~1.742 P <0.05),春秋季发病 (OS: HR =0.532 95% CI : 0.327~0.867 P <0.05),肿瘤大于6 cm(OS: HR =1.656 95% CI : 1.075~2.551 P <0.05),未手术治疗 (OS: HR =2.554 95% CI : 0.911~7.159 P <0.05),AJCC分期为Ⅳ分期 (OS: HR =8.406 95% CI : 5.980~11.816 P <0.05),病理类型为腺鳞癌 (OS: HR =3.399 95% CI : 1.526~7.571 P <0.05),肿瘤低分化 (OS: HR =1.228 95% CI : 0.868~1.738 P <0.05), 双侧均发病 (OS: HR =1.513 95% CI : 1.051~2.179 P <0.05) 是降低华裔女性生殖系统常见恶性肿瘤总生存率的独立预后因素。 结论 年龄增加、进入更年期、无伴侣、春秋季发病、肿瘤分化、腺鳞癌、Ⅳ分期、肿瘤过大会增加华裔女性生殖系统恶性肿瘤的死亡风险,有伴侣、接受手术治疗、Ⅰ分期对于生殖系统肿瘤的总体生存状况有一定的保护作用。     

基于生物信息学途径探究卵巢癌关键预后基因

目的应用生物信息学途径探究卵巢癌关键预后基因,有助于了解卵巢癌发生发展的分子机制,为卵巢癌患者提供新的治疗靶点。方法从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载浆液性卵巢癌上皮细胞和正常卵巢上皮细胞芯片数据GSE14407、GSE18520、GSE54388和GSE66957,用R语言软件筛选差异基因并得到共同差异基因。应用clusterProfiler软件对共同差异基因进行GO功能分析及KEGG通路富集分析。使用STRING建立蛋白互作用网络并使用cytoscape选出关键基因。采用survival包、survimner包对关键基因进行预后生存分析。结果经过筛选得到305个共同差异基因,其中250个基因表达上调,55个基因表达下调。共同差异基因主要富集于染色体分离、细胞周期G1/S转变、细胞黏附、细胞间连接、磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶(PI3K-AKT)信号通路、Rap1信号通路、细胞增殖调控和粘附斑激酶信号通路等。蛋白互作用网络筛选得到14个关键基因,生存分析显示UBE2C基因的高表达导致卵巢癌患者的总生存率明显降低。结论UBE2C基因的表达与卵巢癌患者的总生存率密切相关,有望成为提高卵巢癌患者预后的新的生物学靶点。     

福建省牙龈癌患者预后风险预测模型的构建

  目的  探讨福建地区牙龈癌患者预后影响因素并构建预后风险预测模型。  方法  收集福建医科大学附属第一医院口腔颌面外科2005年1月―2017年6月经病理确诊的牙龈癌患者共198例,对其进行随访。利用多因素COX回归分析模型分析计算死亡风险比值（hazard rate,HR）及其95%置信区间（95% confidence interval,95% CI）,筛出牙龈癌患者预后的影响因素,并基于β系数构建每个个体的预后指数（prognostic index,PI）。运用X-tile软件确定PI的最佳截断点,并根据最佳截断点把研究对象分成低、中、高危组。  结果  在牙龈癌患者中,年龄≥60岁（HR=1.668,95% CI:1.002~2.777,P=0.049）,有复发转移（HR=3.996,95% CI:2.295~6.959,P < 0.001）的患者预后更差;临床Ⅳ期与临床Ⅰ期相比预后更差（HR=3.002,95% CI:1.134~7.947,P=0.027）;经手术治疗的患者与未经手术治疗的相比预后更好（HR=0.246,95% CI:0.118~0.511,P < 0.001）。此外,构建的PI预后预测模型预测性能良好（AIC=611.605,C-index=0.747,AUC=0.765）。  结论  本研究发现年龄（≥60岁）、临床分期高、未进行手术治疗及存在复发转移均是影响牙龈癌患者预后的危险因素,且构建的PI预后预测模型能够较好的预测患者预后。     

Predicting the Prognosis of Gastric Cancer by Albumin/Globulin Ratio and the Prognostic Nutritional Index

Abstract

Background: Albumin-to-globulin ratio (AGR) and the prognostic nutrition index (PNI) are used to assess the nutritional status and severity of disease for a cancer patient. However, the clinical significance of combining these two predictors in gastric cancer (GC) remains unclear. This study evaluated the prognostic value of pretreatment serum AGR and the PNI for GC.

Methods: A total of 273 patients with GC, diagnosed between January 2010 and January 2014, were enrolled. The association of AGR, PNI with clinicopathological characters and prognosis were assessed by Cox regression and Kaplan–Meier methods.

Results: Both low AGR group and low PNI group had poor overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) (all p?<?0.001), while patients with low AGR and PNI had the lowest OS rate. Multivariate analyses revealed that AGR (for OS HR?=?0.657, 95%CI: 0.449–0.962, p?=?0.031; for PFS HR?=?0.684, 95%CI: 0.528–0.895, p?=?0.035) was an independent prognostic factor for OS and PFS in patients with GC, and PNI was verified as a predictor for OS (HR?=?0.782, 95%CI: 0.503 –0.997, p?=?0.048).

Conclusions: Low level of pretreatment AGR and PNI may be independent prognostic factors for patients with GC, and patients with both factors indicated the worst OS.     

中性粒细胞与淋巴细胞比率评估胃癌预后的Meta分析

目的分析探讨中性粒细胞与淋巴细胞比率(neutrophil-lymphocyte ratio, NLR)对胃癌患者预后评估的价值。 方法采用循证医学的meta分析研究。首先,从Embase、Medline和Web of Science数据库中检索关键词gastric cancer、stomach cancer、gastric carcinoma、stomach carcinoma、gastric neoplasm、stomach neoplasm、neutrophil和lymphocyte。然后,根据各纳入研究的总生存率(overall survival, OS)和无进展生存期(progression-free survival, PFS)/无疾病生存期(disease-free survival, DFS)合并生存危险比(hazard ratio, HR)的异质性,决定用固定或随机效应模型计算OS和PFS/DFS的合并HR。若合并HR>1,且其95%可信区间(confidence interval, CI)也>1, 则为NLR升高与胃癌患者OS或PFS/DFS的降低有显著联系。 结果收集18篇文献共纳入5 065例胃癌患者进行meta分析。升高的NLR与OS降低存在显著关联(HR为1.79,95%CI 1.54~2.08)。亚组分析中,胃癌多种治疗方案组和化疗组NLR升高均与OS降低存在显著关联[HR分别为1.84, (95% CI 1.48~2.29)和1.69, (95% CI 1.41~2.03)];而NLR≤3.2组和NLR>3.2组亦均与OS的降低存在显著关联[HR分别为1.80, (95% CI 1.46~2.23)和1.93, (95% CI 1.58~2.36)]。在胃癌患者OS的单因素meta回归分析中, 发表年份、种族、NLR临界值、治疗方案、患者数、进展期患者比例和男性比例都不是引起胃癌患者异质性来源的可能原因(P值分别为0.585、0.887、0.731、0.697、0.613、0.877、0.775)。 结论胃癌患者中升高的NLR与OS降低存在显著的关联,NLR可作为评价胃癌患者预后的标志物。     

可变剪接事件结合剪接因子预测乳头状肾细胞癌生存模型的建立

目的 探讨可变剪接事件结合剪接因子对乳头状肾细胞癌患者预后的预测作用。方法 从TCGA数据库下载乳头状肾细胞癌患者的临床相关资料（性别、年龄、分期等）及转录组数据，并从TCGASpliceSeq数据库获得可变剪接事件信息。通过R语言软件及程序包，使用LASSO、Cox回归模型筛选相关可变剪接事件及相关特异剪接因子，建立乳头状肾细胞癌预后模型，进行独立预后分析，并绘制剪接事件相关的调控网络。结果 通过单因素Cox比例风险回归模型确定1 405个可变剪接事件与乳头状肾细胞癌相关，包括可变受体位点（AA）事件98个、可变供体位点（AD）事件101个、可变启动子（AP）事件333个、可变终止子（AT）事件346个、外显子跳跃（ES）事件448个、外显子互斥（ME）事件3个和内含子保留（RI）事件76个。经过LASSO、多因素Cox比例风险回归分析，并结合临床数据，显示可变剪接事件（C16orf13|32924|ES、TSFM|22759|ES、MACF1|1881|ES、ATP5C1|10726|ES、UNG|24277|AP、UNKL|33077|AP）可能是乳头状肾细胞癌的独立预后风险因素（HR=1.028，95%CI：1.018～1.039，P<0.01）。通过相关性分析寻找乳头状肾细胞癌中可变剪接事件与剪接因子之间的潜在调控关系，构建调控网络，共116个剪接因子及1 059个可变剪接事件纳入分析，其中正、负相关调控事件分别为553、506个。结论 可变剪接事件结合相关临床数据对预测乳头状肾细胞癌患者预后具有一定意义，对探索乳头状肾细胞癌的研究具有重要作用。