苯并［b］荧蒽对小鼠血脑屏障通透性及紧密连接蛋白表达的影响

目的 探讨苯并［b］荧蒽（Benzo［b］fluoranthene, B［b］F）暴露对小鼠血脑屏障通透性和紧密连接蛋白表达的影响。方法 C57BL/6J小鼠灌胃暴露于不同剂量的苯并［b］荧蒽（20、200、2 000 μg/kg）条件下21天,测定小鼠体重、脑比重变化;使用伊文思蓝染色法（Evans Blue）测定小鼠血脑屏障通透性变化;通过H&E染色检测B［b］F对小鼠脑组织的影响;采用免疫组化检测紧密连接蛋白Occludin和ZO-1的表达。结果 在不同B［b］F暴露剂量下,小鼠体重和脑比重均无显著差异。随着B［b］F暴露剂量的增加,小鼠血脑屏障通透性增加。200 μg/kg和2 000 μg/kg染毒剂量下,海马DG区可见锥体细胞皱缩,细胞染色加深,胞核胞质分界不清。在200 μg/kg和2 000 μg/kg染毒剂量下,B［b］F降低Occludin蛋白表达（P<0.05）,而ZO-1蛋白表达水平差异无统计学意义（P>0.05）。结论 B［b］F能增加小鼠血脑屏障通透性,并降低紧密连接蛋白Occludin表达,具有潜在血脑屏障损伤毒性。     

人子宫内膜细胞基因表达谱研究

目的通过研究人子宫内膜细胞基因表达谱,分析人子宫内膜特异表达基因的水平及相关信号通路。方法通过新一代测序数字基因表达谱(DGE)方法对人子宫内膜细胞进行转录组测序,与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比获得子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果人子宫内膜细胞表达基因17 485个。其中与人脐带间充质干细胞基因表达谱对比,子宫内膜细胞特异表达基因3 651个。选取转录本定量FPKM值大于10个拷贝的627个子宫内膜特异表达基因,进行GO注释富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与细胞外区域的结构和细胞外基质、胶原蛋白代谢、细胞迁移的调控等功能相关; KEGG信号通路富集分析发现,子宫内膜特异表达基因与黏着斑、吞噬泡、脂肪酸代谢、细胞凋亡等信号通路相关。结论获取人原代子宫内膜细胞的基因表达谱,并对其差异基因进行GO注释和KEGG信号通路富集分析,可为进一步研究提高子宫内膜容受性的方法提供可靠依据。     

基于高通量测序探索粉尘暴露对巨噬细胞基因表达水平的影响

目的分析纳米粉尘暴露的巨噬细胞基因水平改变,明确巨噬细胞参与的相关疾病信号通路及潜在生物标志。方法检索GEO数据库,筛选纳米粉尘暴露的巨噬细胞基因测序芯片,研究纳入基因芯片GSE13005。匹配最新版本基因注释文件后,通过R语言Bioconductor包比对分析差异表达基因,并对巨噬细胞基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析分别进行探索。结果本文共筛选出差异表达基因(Differently Expressed Genes,DEGs)99个,其中91个基因高表达,34个基因低表达。GO分析显示DEGs主要参与平滑肌细胞分裂增殖、细胞脂质应答、p53信号通路、ROS应答、NF-κB信号通路、低氧应答、激酶应答等。经功能富集,GO、KEGG相关功能项可分为14组,病毒细胞周期的负向调节及平滑肌细胞的增值分裂占比较大,提示巨噬细胞染尘后可能主要与相关生物学进程的激活有关。结论巨噬细胞染尘可导致基因表达异常,相关基因主要发挥抑病毒和促纤维化作用。     

基于GEO数据库对亚急性皮肤型红斑狼疮差异基因的筛选及生物信息学分析

目的 运用生物信息学方法探讨亚急性皮肤型红斑狼疮(subacute cutaneous lupus erythematosis,SCLE)组织中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法 从GEO数据库下载数据集并筛选出SCLE组织中的DEGs,利用GO和KEGG分析对DEGs进行功能和通路注释,同时使用String数据库构建互作网络并筛选出Hub基因,选择和SCLE显著相关的前10个Hub基因并进行验证。结果 对芯片数据集GSE112943进行DEGs分析后共得到显著上调的基因175个,显著下调的基因167个。GO富集分析DEGs主要富集于对病毒的防御反应、免疫反应、病毒基因组复制的负调控、I型干扰素信号通路及炎症反应等生物学进程,KEGG通路富集分析DEGs主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞黏附分子、氨基酸代谢、细胞外基质和受体相互作用等通路。PPI网络中ISG15、RSAD2、IFIT3、IRF7、IFI44、IFI6、IFI44L、OAS1、OAS2和OAS3是SCLE的关键基因。相对于正常皮肤组织,SCLE患者皮...     

双相情感障碍与非酒精性脂肪肝的共表达差异基因分析

目的 通过生物信息学方法寻找双相情感障碍(BD)与非酒精性脂肪肝(NAFLD)之间的共表达差异基因。方法 选取GSE5388、GSE63067、GSE49541数据集作为在线数据库研究对象,在BD和NAFLD数据集中筛选疾病组与正常对照组的差异表达基因(DEG),并获得这2种疾病的共同表达的DEG。运用Web Gestalt数据库对2组间的交叉基因进行GO/KEGG分析,通过STRING数据库分析与共表达DEG有关的枢纽基因及蛋白,利用SPSS 23.0软件分别分析BD和NAFLD数据集中枢纽基因的诊断价值。结果 共筛选出59个共表达的DEG,GO/KEGG富集分析显示共表达的DEG主要在细胞代谢、生物调控等多种基因功能上发生富集。KEGG通路富集显示共表达DEG主要涉及神经活性配体-受体相互作用,神经退行性变的通路,炎症介质对TRP通道的调节、WNT信号通路、钙信号通路等多种机制通路。GAP43、ANO2、GABRG1、HTR2A和NGF 5个枢纽基因均对BD和NAFLD具有诊断价值。结论 BD和NAFLD之间具有共表达差异基因,在BD和NAFLD的发生和进展中起重要作用。     

基于公共数据库挖掘的ACE2肺部表达差异及与新型冠状病毒肺炎的相关性的功能预测

目的金属肽酶中的血管紧张素转换酶2(Angiotensin-converting enzyme 2,ACE2)被确定为新型冠状病毒的功能性受体。本研究旨在探究ACE2在新型冠状病毒引起肺炎(以下简称"新冠肺炎")中的表达差异。方法对GSE42834数据集获得的112个新冠肺炎患者的新冠肺炎组织和18个肺炎患者的正常肺组织的测序结果进行差异分析,设定差异分析的条件是logFC绝对值1,P0.05。使用人蛋白质数据库进一步验证ACE2在正常肺组织的表达情况。Coexpedia数据库进行ACE2共表达基因的检索。Metascape对共表达基因进行GO和KEGG富集分析,以便进行预测ACE2在机体发挥的功能以及可能参与的信号通路。结果 GSE42834数据库获得具有差异性表达的基因共有249个,其中上调的基因有156个,下调的基因有93个。上调变化较大的基因有VNN1,ACE2, OLFM4,CD67, CD64,下调变化较大的基因有GNLY,FGFBP2,CLIC3,D4S234E和KLRB1。差异结果分析可见ACE2属于上调基因。组间表达结果提示与正常肺组织相比,ACE2在新冠肺炎组织中的确表达上调,人蛋白质数据库免疫组化结果提示,ACE2在正常肺组织表达阴性。GO和KEGG富集分析和可视化发现ACE2参与介导I型干扰素信号通路和Toll样受体信号通路。结论 ACE2在新冠肺炎患者中可能高表达,有望成为治疗新冠肺炎的新靶点。     

基于大数据对宫颈癌缺氧生物标志物的分析

目的 在GEO（gene expression omnibus）和TCGA（the cancer genome atlas）数据库中挖掘宫颈癌缺氧标志物并对其预后进行生存分析。方法 利用GEO数据库中宫颈癌表达谱（GSE75034）缺氧组织和非缺氧组织中的数据进行差异性分析,再运用基因功能分析（gene ontology,GO）与通路富集分析（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）筛选出相关的通路和相关功能的基因,结合TCGA数据库中宫颈癌的数据对其预后运用Kaplan-Meier与Log-rank检验方法进行生存分析。结果 显示有337个基因表达存在差异,缺氧组织中上调的基因有184个,下调的有153个。GO分析显示这些基因与免疫反应、炎症反应、细胞增殖、血管形成等有关;KEGG分析显示主要富集在TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等。生存分析显示富集在HIF-1通路上的PAI-1、BCL-2、HK-2与宫颈癌病人预后相关,其中PAI-1、HK-2是预后的危险因素（均有P<0.05）,高表达组与患者生存期缩短相关,BCL-2是保护因素（χ2=6.508,P=0.011）,高表达组与患者生存期延长相关。结论 PAI-1、BCL-2、HK-2可以作为宫颈癌缺氧生物标志物,与宫颈癌病人的预后相关,为后续的研究提供新思路。     

甲型流感病毒感染小鼠肺组织中环状RNA的表达变化及其靶基因功能分析

目的：明确参与甲型流感病毒（IAV）感染小鼠肺组织中环状RNA（circRNA）的表达变化,并分析其靶基因生物学功能。方法采用高通量测序的方法,测定并鉴定了IAV感染组和正常对照组小鼠肺组织中circRNA 的表达差异及其靶基因。利用 Gene Ontology （GO）和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes （KEGG）软件分析差异表达的circRNA靶基因生物学功能。结果共获得12个显著差异表达的circRNAs（差异倍数>2）,其中circRNA5828表达量显著下调,circRNA13602和circRNA13853表达量显著上调。生物信息学软件分析表明,12个circRNA靶基因在生物过程、细胞组成和分子功能三方面均发挥作用,并影响抗原加工提呈、Toll样受体、维甲酸诱导基因-Ⅰ样受体和心肌功能等相关信号通路。结论 circRNA可能通过宿主免疫调控参与IAV的感染过程。     

致病性大肠埃希菌感染小鼠肾脏的基因表达谱分析

目的了解尿道致病性大肠埃希菌(UPEC)感染小鼠肾脏的基因表达谱差异变化,探究宿主早期免疫和炎症反应过程。方法 2013年8月分别利用UPEC132菌株和磷酸缓冲液(PBS)经尿道逆行感染小鼠各20只,感染后于4和8h处死并解剖取其肾脏,随机取两组中4和8h各2只小鼠单侧肾,提取其RNA,利用基因表达谱芯片筛选其差异表达基因,并利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行信号通路分析。结果与PBS对照组相比,UPEC感染组小鼠肾脏在4和8h分别有204个和1 323个基因差异表达,KEGG通路分析共有59个差异表达基因直接与宿主细胞的6条炎症和免疫信号通路相关,包括细胞因子与其受体相互作用信号通路、抗原加工与呈递信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样受体信号通路、白细胞跨内皮迁移信号通路及自然杀伤性细胞介导细胞毒作用信号通路。结论利用表达谱芯片筛选得到的59个差异表达基因成为研究宿主早期免疫防御UPEC感染的潜在目的基因,为进一步揭示宿主与UPEC相互作用机制奠定基础。     

基于生物信息学途径研究CLDN4基因在卵巢癌中的作用及机制

目的 基于生物信息学途径,研究紧密连接蛋白4(CLDN4)在卵巢癌中的作用机制。方法 从GEO数据库获取含有12个卵巢癌组织和正常组织的基因芯片,结合Oncomine数据库进行CLDN4 mRNA表达差异分析,筛选出差异基因109个,利用Cytoscape 3.8.2软件进行GO富集和KEGG富集分析,String数据库进行蛋白相互作用网络分析,找到关键节点蛋白16个,选取差异最大的CLDN4基因进行深入探讨,进行表达分析和GeneMANIA功能预测。结果 筛选109个差异基因进行GO富集和KEGG信号通路分析,发现参与Wnt/β-catenin、MAPK、MEK-ERK等信号通路;构建功能模块,找到关键蛋白16个,其中CLDN4 mRNA在卵巢癌中高表达,CLDN4表达与临床分期和生存状态有相关性;预测CLDN4基因在功能上与顶端连接复合体、细胞-细胞连接、内皮屏障的建立、内皮细胞发育与分化等有关。结论 CLDN4在卵巢癌中高表达,在癌细胞的增殖、转移中有一定作用,有望成为诊断和治疗卵巢癌的新生物标记物。     

潜伏结核感染者CD4+T细胞miR-29家族、靶基因IFN-γ的表达及生物信息学分析

目的 探讨潜伏结核感染和活动性肺结核感染对患者外周血CD4+T细胞内miR-29家族及其靶基因IFN-γ表达的影响.方法 于2012年3-12月,在山东省潍坊市某两家医院选取调查对象并分为3组:活动性肺结核组(30例)、潜伏结核感染(LTBI)组(25例)和健康对照组(30名).分离纯化3组受试者外周血中的CD4+T细胞;用核酸杂交与荧光定量PCR检测CD4+T细胞内miR-29a、miR-29b和miR-29c的表达;用定量PCR检测miR-29靶基因IFN-γ的表达;用TargetScan与PicTar联合预测miR-29家族的靶基因;用David数据库和Cytoscape软件对miR-29家族的预测靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析.结果 miR-29a、miR-29b和miR-29c在活动性肺结核组、LTBI组和健康对照组CD4+T细胞中的表达水平均不同(P ＜0.05):miR-29b和miR-29c在活动性肺结核组的表达(561.63±65.36,281.85±42.78)高于健康对照组(260.74±38.69,128.21±19.98),低于LTBI组(2030.29±321.68,620.93±79.14);miR-29a在对照组的表达水平(913.95±104.73)高于活动性结核组(323.37±54.38),低于LTBI组(4782.13±567.81).靶基因IFN-γ在3组之间的表达水平亦不同(P ＜0.05):LTBI组(0.45±0.09)低于健康对照组(1.00),而高于活动性结核组(0.11±0.03).miRNA-29家族的预测靶基因的GO功能富集于细胞外基质结构成分、转录调节活性等分子功能方面;在KEGG的通路数据库中,miR-29家族预测靶基因集合显著富集于局部黏附信号通路、调节细胞骨架与mTOR信号通路等方面.结论 LTBI和活动性结核感染明显增加了患者外周血CD4+T细胞内miR-29家族的表达,降低了其靶基因IFN-γ的表达,从而影响了信号通路等生物学过程.     

大气细颗粒物致C57BL/6和C3H/He品系小鼠肺损伤过程中信号通路的差异

目的探讨暴露于大气细颗粒物后,C57BL/6和C3H/He两种品系小鼠在肺损伤过程中信号通路是否存在差异。方法采用气管滴注的染毒方法,两种品系的小鼠(C57BL/6小鼠和C3H/He小鼠)均予大气细颗粒物染毒,连续染毒2天,最后一次染毒24小时后,处死小鼠,取肺组织,并且立即置于液氮中保存。然后运用AffymetrixMouse4302.0表达谱基因芯片,分析挖掘在两种品系小鼠肺部有差异的信号通路。结果在染毒前,基因Igh-6、Mmp2、Timp1、Col1a1、Col1a2、C4和Hc的表达在C57BL/6和C3H/He小鼠之间的比值分别为:0.00、-2.40、0.00、-4.42、-4.92、6.65和-1.93,但是在染毒后,比值变为:-2.83、2.15、-2.18、2.40、2.86、4.23和2.18。通过数据挖掘,找到3条有差异的信号通路,包括:炎症反应通路、基质金属蛋白酶通路和经典的补体激活通路。结论3条有差异的信号通路都直接和炎症反应相关,而且最终都表现为在C57BL/6品系小鼠肺部的炎症反应比C3H/He品系小鼠更加剧烈,提示由于遗传背景的不同导致了这种差异的产生。     

利用蛋白组学技术探讨骨肉瘤肺转移患儿血清中蛋白表达情况

目的 利用iTRAQ标记的蛋白组学技术探讨骨肉瘤肺转移患儿血清中蛋白的表达。方法 纳入10例骨肉瘤患儿和10例骨肉瘤肺转移患儿作为研究对象，收集所有研究对象血清5 ml,采用iTRAQ标记的蛋白组学技术分析2组血清中的差异表达蛋白，并对差异表达蛋白进行GO富集分析、KEGG通路富集及蛋白-蛋白互作分析。外科手术后获取2例骨肉瘤肺转移患儿及2例骨肉瘤患儿瘤体组织，采用Western blot验证2组患儿癌组织中CDK1、hnRNP A2/B1、ITGAV和SRSF10的蛋白表达水平。结果 与骨肉瘤患儿相比，骨肉瘤肺转移患儿血清中高表达的蛋白共477种，低表达的蛋白共235种。KEGG通路富集显示，ECM及受体的相互作用、黏着力及PI3K-Akt信号通路等可能是骨肉瘤肺转移的主要发病机制。骨肉瘤肺转移患儿血清中差异蛋白前10种为CDK1、CTNNB1、ITGB1、SNRPE、SNRPG、HNRNPH1、SNRPD3、HNRNPC、ITGAV和SRSF1。与骨肉瘤患儿的癌组织相比，骨肉瘤肺转移患儿癌组织中CDK1、hnRNP A2/B1、ITGAV和SRSF10蛋白表达水平升高(P<0...     

亚砷酸钠致人肝星状细胞纤维化及自噬中DNA甲基化位点筛查及差异甲基化谱构建

目的分析亚砷酸钠(NaAsO2)致人肝星状细胞(LX-2细胞)纤维化及自噬相关的DNA甲基化位点, 筛选与纤维化及自噬相关的特异性甲基化基因。方法采用DNA甲基化芯片Illumina Infinium Methylation EPIC BeadChips(850K甲基化芯片)对LX-2细胞(对照组)及NaAsO2干预(低、中、高剂量组:终浓度分别为5、10、15 μmol/L NaAsO2, 干预48 h)致LX-2细胞纤维化及自噬模型进行全基因组DNA检测, 寻找差异甲基化位点。对筛选出的差异甲基化基因进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析, 了解基因功能。结果高剂量组细胞纤维化及自噬模型构建成功。850K甲基化芯片检测结果显示, 高剂量组与对照组间存在25 817个显著差异甲基化位点, 其中高甲基化位点12 083个、低甲基化位点13 734个。GO功能富集分析显示, 差异甲基化基因参与的分子功能主要包括蛋白结合、离子结合、催化活性、酶结合。KEGG信号通路富集分析显示, 差异甲基化基因参与的通路主要包括代谢通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt...     

支气管肺发育不良基因表达调控异常研究进展

支气管肺发育不良(BPD)是早产儿最常见的慢性肺部疾病。BPD由多种因素引起,其本质是在遗传易感性的基础上,各种环境因素引起的肺损伤和发育中的未成熟肺修复之间的不平衡。研究显示BPD致病分子机理多涉及炎症细胞因子、非编码RNA和各种信号通路因子的异常表达调控。这些相关基因的异常表达,不仅影响了胚胎或早期胎儿肺的正常发育,并阻碍了新生肺损伤后肺的修复,或导致肺功能不全。单独或协同影响了BPD的发生发展。同时研究发现环境风险因素如高氧暴露、炎症导致基因表达异常也是BPD发生的原因之一,环境和基因共同作用推动了BPD的发生发展。     

双相情感障碍与2型糖尿病的共表达差异基因分析

目的 通过生物信息学方法寻找双相情感障碍（BD）与2型糖尿病（T2DM）之间的共表达差异基因。方法 选取GSE5388、GSE161355、GSE25724数据集作为在线数据库研究对象,在BD和T2DM数据集中筛选疾病组与正常对照组的差异表达基因（DEG）,并获得这2种疾病的共同表达的DEG。运用WebGestalt数据库对2组间的交叉基因进行GO/KEGG分析,通过STRING数据库分析与共表达DEG有关的枢纽基因及蛋白,利用SPSS 23.0软件分别分析BD和T2DM数据集中枢纽基因的诊断价值。结果 共筛选出362个共表达的DEG,GO/KEGG富集分析显示共表达的DEG主要在细胞代谢、生物调控等多种基因功能上发生富集。KEGG通路富集显示共表达DEG主要参与脊髓小脑性共济失调、自噬、鞘脂信号通路、沙门菌感染、蛋白质输出、柠檬酸循环、蛋白酶体、AMPK信号等通路。CYCS、BUB3、COPS5、ATP5C1、BTBD1 5个枢纽基因均对BD和T2DM具有诊断价值。结论 BD和T2DM之间具有共表达差异基因,在BD和T2DM的发生和进展中起重要作用。     

肾衰患者肾纤维化发展的关键候选基因和通路的生物信息学分析

目的肾脏纤维化是各种原发或继发性肾脏病持续进展,导致正常肾脏组织结构被细胞外基质所取代,伴肾功能进行性不可逆性损害的病理过程,是引起终末期肾衰竭的主要原因和病理基础之一。ESRD患者需要接受RRT以延长生命,消耗大量医学资源。近年来对肾脏纤维化机制的有关研究很多,但涉及的信号通路和驱动基因在很大程度上还不清楚。利用生物信息学方法分析影响肾脏纤维化发病的关键基因和通路,为进一步动物实验研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法在公共基因芯片数据库(GEO)中下载肾脏纤维化相关基因表达谱数据(GSE66494)。该芯片包括53例肾脏纤维化患者组织样本及8例正常人肾脏组织。我们利用GEO2R工具对肾纤维化患者组织与正常组织中表达的基因进行差异分析,并利用DAVID工具对差异表达基因进行功能和通路富集分析(GO、KEGG)。我们还通过生物信息学工具STRING v10.5构建差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用Cytoscape对蛋白质互作网络进行可视化并筛选核心基因。结果通过对53例肾纤维化组织与正常组织基因表达谱数据进行差异分析,我们从GSE66494数据集中共筛选出514个差异表达的基因,其中138个在肾纤维化组织中上调,376个在肾纤维化组织中下调。GO分析结果显示,差异表达基因主要富集在细胞外组成成分,急性期反应以及物质运输相关生物学过程等。KEGG结果显示差异表达的基因参与调控的显著的信号通路主要包括:胰腺分泌,蛋白质的消化和吸收,非洲锥虫病,PPAR信号通路,PI3K-Akt信号通路以及疟疾通路。通过构建差异表达基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络,我们从差异表达基因中筛选出了10个核心基因包括ALB,TOP2A,MYC,FOS,PLG,IL10,CCNB2,REN,PTGS2,TAC1。结论我们通过生物信息学方法发现了在正常组织与肾纤维化组织中差异表达的514个基因,并发现了其调控的重要的信号通路。以上这些差异基因尤其是核心基因,和信号通路,可能是参与肾纤维化发生,发展的关键基因和通路,这为肾脏纤维化的诊断和治疗提供了新的思路或新靶点。     

基于网络药理学与分子对接探讨参芪白石汤治疗胃癌的机制

目的 运用网络药理学方法、GEO数据库与分子对接,探讨参芪白石汤(SBD)治疗胃癌(gastric cancer, GC)的作用机制。方法 SBD有效成分及相应靶点通过TCMSP数据库、Pubchem获取,根据《中药大辞典》补充成分,GC差异表达基因从GEO数据库搜索,筛选出GSE118916探针芯片数据集,采用STRING数据库构建PPI蛋白-蛋白互作网络,借助Metascape数据库对核心靶点进行GO和KEGG通路富集分析,利用THPA数据库获得核心基因的免疫组化结果及基因蛋白表达,再运用AutoDock分子对接软件对主要活性成分与核心靶点间的相互作用进行验证。结果 获得参芪白石汤9味中药,经OB、DL初步筛选得到63种活性成分,对应930个潜在靶点。GO和KEGG功能富集分析显示,SBD通过平滑肌细胞增殖的调节、对肽的反应、凋亡过程的正向调节、血管相关平滑肌细胞增殖的调节等14个生物过程发挥作用,涉及癌症通路、肿瘤坏死因子信号通路、脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路等。核心基因蛋白的免疫组化显示ICAM1、PTGS2、PPARG在GC组织中呈强阳性表达,...     

非职业人群多环芳烃暴露对血脂代谢的影响

目的了解非职业人群血液中多环芳烃的暴露水平,探索其与血脂代谢异常的关系。方法于2016年3—7月,在哈尔滨市体检人群中随机选取447名研究对象并对其进行问卷调查,检测身高、体重,采集静脉血进行血脂相关指标检测,使用气相色谱-质谱联用仪测定血清中PAHs浓度。结果血清中苊烯、苊、蒽、芘、荧蒽、二苯并[a,h]蒽检出率小于50%,苯并[g,h,i]苝未检出,萘、苯并[j]荧蒽、苯并[b/k]荧蒽、苯并[a]芘、苯并[e]芘均检出,芴、菲、屈、苯并[a]蒽、茚并[1,2,3-cd]芘检出率大于50%。与血脂正常组比较,血脂异常组人群血清中屈、苯并[b/k]荧蒽、苯并[a]芘、茚并[1,2,3-cd]芘的浓度较高,差异均有统计学意义(P0.05)。与血脂正常组比较,血脂异常组人群FBG、TC、TG、LDL-C、BMI水平均较高,而HDL-C水平较低,差异均有统计学意义(P0.05)。Spearman相关分析结果显示,萘与BMI之间呈正相关(P0.05);芴与TG、LDL-C呈正相关(P0.05);屈与FBG、TC、TG、HDL-C、LDL-C呈正相关(P0.05);苯并[j]荧蒽与FBG、TC、TG、LDL-C、BMI呈正相关(P0.05);苯并[b/k]荧蒽与FBG、TC、TG、LDL-C呈正相关(P0.05);苯并[a]芘与TC、LDL-C呈正相关(P0.05);苯并[e]芘与FBG、TG、BMI呈正相关(P0.05);茚并[1,2,3-cd]芘与FBG、TG呈正相关(P0.05)。在控制了年龄、性别、BMI、文化程度、婚姻状况、体育锻炼、居住地、吸烟饮酒情况、含PAHs食物食用频次、相关病史等混杂因素后进行多因素Logistic回归分析,结果显示,屈、苯并[b/k]荧蒽可能为血脂异常的危险因素(P0.05),其OR值分别为1.639(95%CI:1.314～2.044),1.517(95%CI:1.140～2.020)。结论屈和苯并[b/k]荧蒽的暴露可能会导致人体血脂代谢异常。     

锰中毒大鼠差异基因功能注释及代谢通路分析

目的 探讨锰中毒差异基因表达的功能分类及代谢通路,为研究锰中毒机制以及基因调控防治锰中毒提供依据。 方法 选取SPF级健康雄性SD大鼠6只,按体重随机分为对照组和实验组,每组3只。实验组大鼠给予25 mg/kg MnCl2 · 4H2O,按0.2 ml/100 g进行腹腔注射,每48 h注射1次;对照组按相同注射剂量注射PBS缓冲液。暴露1个月后,将大鼠麻醉后经心脏采血法处死,冰上取大脑纹状体,提取组织RNA并建立DNA数据文库,采用全基因组测序的方法,筛选锰中毒差异基因并分别进行GO功能富集分析、Pathway富集分析,探讨差异基因可能参与的代谢途径。 结果 大鼠大脑纹状体共检测到18 439条基因,筛选出17个锰中毒差异表达基因,其中10个基因为上调基因,7个基因为下调基因;根据基因功能分析,共筛选出富集程度较高的164条基因功能分支以及26条代谢通路。基因功能较多富集在突触信号、信号传导等功能,其中富集效果最为显著的是行为功能;代谢通路中基因富集较多的通路为胞吞途径、PI3K-Akt通路以及神经活性配体-受体相互作用通路,其中PI3K-Akt信号通路与筛选出的FoxO信号通路及mTOR信号通路有同一差异基因(29517基因)富集,神经活性配体-受体相互作用通路与谷氨酸能突触通路有同一差异基因(24415基因)富集。 结论 锰中毒差异基因可能通过PI3K-Akt信号通路、mTOR信号通路或FoxO信号通路影响锰中毒易感性,并且可能参与行为学的改变。