2021年武汉市一起肠炎沙门菌引起的跨区食源性疾病暴发的病原学分析

  目的  对2021年武汉市一起跨区食源性疾病暴发事件进行病原菌的鉴定和溯源分析,查明事件暴发原因。  方法  采集此次食源性疾病暴发事件中相关人员的肛拭子样本、粪便样本和食品样本进行分离培养,用VITEK 2 Compact 全自动微生物鉴定系统鉴定分离到的菌株,并进行血清学分型,耐药性敏感试验;采用脉冲场凝胶电泳法（PFGE）对本次事件的检出菌及近两年本地区临床散发病例的同型别菌株进行分子分型和聚类分析;提取本次事件病原菌和本地区同型别菌株的核酸进行全基因组测序,通过基因注释和序列比对分析病原菌的毒力因子与耐药基因,结合多位点序列分型,变异位点检测和不同地区同型别菌株的全基因组序列构建基于单核苷酸多态性的系统发育树对病原菌进行溯源。   结果  共分离出5株肠炎沙门菌,其中2株来自食物样本,3株来自患者粪便和肛拭子样本。 5株检出菌的PFGE带型完全相同,均对抗生素阿米卡星、庆大霉素、妥布霉素、头孢唑啉、头孢西丁、头孢呋辛、甲氧苄啶–磺胺甲恶唑耐药,携带相同的耐药基因和毒力因子,均为ST11型。 本次事件检出菌株的序列间仅存在1个突变位点。 检出菌的全基因组序列与本地肠炎沙门菌序列高度相似。   结论  肠炎沙门菌为本次事件的致病菌。经同源性分析,此株病原菌为本地区肠炎沙门菌流行株。 全基因组测序技术可作为PFGE分子分型的补充应用于病原菌的监测和暴发事件调查。     

2008-2018年四川省肠炎沙门菌暴发的分子分型比较

  目的  比较四川省肠炎沙门菌暴发菌株的分子分型方法,为暴发溯源提供快速可靠的依据。  方法  采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）、多位点可变数目重复序列分析（MLVA）、规律间隔成簇短回文重复序列（CRISPR）、多位点序列分型（MLST）和基于全基因组测序的单核苷酸多态性（WGS-SNP）对2008 — 2018年四川省肠炎沙门菌暴发分离株进行分型。 以辛普森多样性指数（DI）为指征,比较单一方法及方法联用的分型能力差异。  结果  PFGE、MLVA、CRISPR和MLST单独使用时,其DI值均＜0.9,PFGE_XbaⅠ和MLVA联合使用DI值能提高到0.9以上,WGS-SNP的DI 值最高,可达0.971。  结论  对四川省肠炎沙门菌暴发菌株进行分子分型的最适方法为WGS-SNP,在缺乏基因组分析能力的情况下,推荐使用PFGE_XbaⅠ与MLVA联合的方法。     

一起鼠伤寒沙门菌暴发疫情快速诊断和溯源分析

2013年6月四川省眉山市发生一起以发热、乏力、头痛、腹泻为主要症状的暴发疫情。为快速诊断致病因子,查找污染来源,控制疫情,结合流行病学调查,采集患者、食堂员工相关样本和食堂留样食品进行检测分析,从6份病例样本检出鼠伤寒沙门菌,2份食品样本检出鼠伤寒沙门菌;来自患者和食品的鼠伤寒沙门菌菌株经XbaⅠ酶切后脉冲场凝胶电泳图谱完全一致,快速准确诊断疫情,为及时有效的控制疫情发展提供技术支持。     

2014－2016年浙江省余姚市外环境和食源性疾病患者粪便中沙门菌分布特征和耐药情况分析

目的 了解浙江省余姚市水灾后沙门菌在外环境和食源性疾病患者粪便中的分布特征和耐药情况,为食源性疾病防治和临床治疗提供科学依据。 方法 对浙江省余姚市主城区外环境、食源性疾病患者粪便进行沙门菌增菌、分离培养、生化鉴定、血清分型及药敏试验。 结果 共检出32种血清型、沙门菌283株,鼠伤寒沙门菌占总数的40.28%。 对氨苄西林、哌拉西林耐药率最高,分别为51.59%和42.05%,多重耐药菌36株。 结论 余姚市沙门菌污染率高、菌型繁多、耐药率高、多重耐药高,优势菌为鼠伤寒沙门菌。 水灾后余姚市外环境和食源性疾病患者粪便中沙门菌血清分布和耐药既有相关性又各有特点。      

2007－2018年浙江省余姚市沙门菌血清型变迁及耐药分析

目的了解浙江省余姚市腹泻监测哨点医院腹泻患者沙门菌感染情况、血清型变迁及药物敏感情况,为制订预防措施和临床治疗提供参考依据。方法对2007 — 2018年从余姚市腹泻患者中分离出的295株沙门菌进行复苏、血清分型、药敏试验及分析,采用χ2检验对不同年份沙门菌检出率进行比较。结果2007 — 2018年余姚市腹泻监测哨点医院腹泻患者沙门菌检出率为8.60%,男女性别比为1.07∶1,各年龄段均可感染沙门菌,以＜5岁儿童为主,夏季检出率最高（10.20%）,冬季最低（1.64%）。 分为10个群39种血清型,前4位优势血清型分别为4,5,12:i:-沙门菌（24.41%）、鼠伤寒沙门菌（15.25%）、肠炎沙门菌（9.83%）和斯坦利沙门菌（8.14%）。 295株沙门菌对青霉素类、四环素、磺胺甲恶唑耐药率较高,其余均较敏感,2014 — 2018年对头孢类耐药率比2007 — 2013年明显上升;多重耐药菌多集中于优势菌型,共107株（36.27%）。 2007 — 2018年余姚市沙门菌检出率、血清型和耐药性均发生了变迁。 2007 — 2013年检出率低,为3.08%（34/1 103）,菌型少,检出14种血清型,以鼠伤寒沙门菌（38.24%,13/34）和肠炎沙门菌为主（20.59%,7/34）;2014 — 2018年检出率高,为11.22%（261/2 307）,菌型多,检出34种血清型,4,5,12:i:-沙门菌取代鼠伤寒沙门菌成为第1位常见血清型,鼠伤寒沙门菌居于第2位,之后是斯坦利沙门菌和肠炎沙门菌。结论余姚市沙门菌的优势菌主要以4,5,12:i:-沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,多重耐药严重,应进一步加强耐药监测。     

北京市昌平区布利丹沙门菌引起的食源性疾病1例调查报告

对一起疑似食物中毒患者和食品从业人员采样进行病原学检测和分析，参考食品微生物检测国家标准进行病原分离鉴定。 在1 份患者肛拭标本中分离到疑似菌落，通过系统生化反应及血清学试验，确认该菌为布利丹沙门菌。其血清型为O9，12:H:g，m，q。这是北京市昌平区首次在食源性疾病患者样本中检出该菌，该菌的检出为北京市昌平地区食源性疾病细菌谱增加了新的成员。     

浙江省富阳市一起沙门菌引起的食品安全事件调查

目的 为查明浙江省富阳市中学(大青校区)一起腹泻暴发事件的疫情规模、致病因子及其污染来源,控制疫情蔓延。 方法 制定统一的病例搜索一览表,采用查阅学校医务室门诊日志、富阳市人民医院和市中医医院门诊日志及住院记录等方式搜索该校在10月17-20日期间出现恶心、呕吐、发热(≥37.5 ℃)、腹痛、腹胀等临床症状的疑似病例,同时通过中国疾病预防控制中心的传染病自动预警信息系统等网络搜索该校在10月17-20日期间出现类似症状的病例。根据1:4的比例分别选取疾病暴发期间食用过学校副食店销售的食物的病例和无任何临床症状的学生作为病例组和对照组,同时收集学生食物史、饮用水情况等信息进行病例对照研究。 结果 学校副食店销售的鸡蛋三明治面包为本次食品安全事件的致病因素,男女生罹患率差异有统计学意义(χ2=5.24,P=0.02);职业分布罹患率差异有统计学意义(χ2=6.54,P=0.01)。10份病例肛拭样本中检出O1,9,12:Hg,p,抗原模式为都柏林血清型沙门菌。经脉冲场凝胶电泳同源性检测,10株菌株条带完全一致。 结论 该起疫情为鸡蛋三明治面包中鸡蛋被都柏林沙门菌污染所致。     

2014-2018年浙江省余姚市非伤寒沙门菌监测及其耐药谱分析

目的了解2014 — 2018年浙江省余姚市非伤寒沙门菌（NTS）的血清型流行趋势和耐药情况,为NTS的临床治疗和防控提供科学依据。方法2014 — 2018年,利用亚硒酸盐煌绿（SBG）对余姚市哨点医院采集的腹泻患者样本进行增菌,采用选择性培养基分离培养NTS,并对NTS分离株进行血清型分型和药敏试验。结果从2 327份腹泻患者标本中共检出NTS 299株（12.85%）,鉴定出35个血清型和1个未分型,前4位优势血清型为4,5,12:i:-沙门菌、鼠伤寒沙门菌、斯坦利沙门菌和肠炎沙门菌。 NTS在夏季检出率最高（16.29%）,冬季最低（2.33%）。 ＜5岁的儿童在感染病例中占比59.87%。 药敏结果显示NTS对青霉素类和头孢类抗生素耐药率高,对环丙沙星耐药率低,多重耐药菌株111株（37.12%）。 对氨苄西林、氯霉素、链霉素、磺胺甲恶唑、四环素同时耐药（ACSSuT）的耐药模式主要存在于4,5,12:i:-沙门菌和鼠伤寒沙门菌中。结论余姚市NTS优势血清型为4,5,12:i:-沙门菌和鼠伤寒沙门菌。＜5岁的儿童易感染NTS,应当加强5岁以下儿童的监测。 NTS多重耐药现象严重,医疗机构应慎重选择临床病例的用药。     

2018－2019年浙江省余姚市河水环境中沙门菌多样性及耐药性分析

目的了解浙江省余姚地区河水中沙门菌的分布和污染情况。方法2018 — 2019年采集余姚市12个监测点的河水,进行增菌、分离、生化鉴定、血清分型、药敏试验及耐药基因检测。结果采集河水样品192份,检出含有沙门菌样品116份,检出率为60.42%,其中姚江姚江桥点检出率最高（87.50%）。 阳性水样共检出菌株177株,分为25个血清型,其中鼠伤寒沙门菌（16.38%）、德尔卑沙门菌（12.43%）和鼠伤寒单相变种（11.30%）位居前3位,各监测点中以姚江三管堂点血清型检出最多。 春季分离到的血清型别更丰富。 39株表现为对所测试的16种抗生素泛敏感,而其他菌株则表现为至少对1种抗生素表现出耐药性。 耐药率较高的为青霉素类和四环素类抗生素,其中氨苄西林耐药率为72.31%,哌拉西林为51.41%,四环素为66.10%。 对3种及以上的抗生素耐药的多重耐药菌菌株有34株。 β-内酰胺类抗生素相关耐药基因tem检出率为67.23%,oxa为6.78%,ctx-M为12.43%;四环素类抗生素相关耐药基因则分别为tetA型（55.37%）、tetB型（11.30%）和tetG型（7.91%）。结论余姚地区河水中沙门菌检出率高、菌型丰富、耐药率严重、耐药机制复杂,食源性防控中应注意环境来源的沙门菌的危害。     

一起由沙门菌引起食物中毒的检测分析

2010年10月25日15时52分,本中心值班室接本辖区某医院报告,该医院收治分布在本辖区四所高校66名患者出现高热、腹泻、呕吐、腹痛等急性胃肠炎症状,疑似食物中毒.本中心立即组织专业人员赶赴现场进行流行病学调查,同时采集患者呕吐物、腹泻物及剩余食物等标本进行实验室检测.综合临床表现、流行病学调查及实验室检测结果分析,判定是一起由肠炎沙门菌污染糕点制品引起食物中毒.     

多菌型副溶血性弧菌共感染引起集中事件调查分析

目的 分析一起副溶血性弧菌（VP）集中感染事件的菌株特征,明确该起感染事件的性质。方法 在2017年9月,广西某乡镇发生一起疑似食源性疾病暴发,现场采集13例患者肛拭子,分离到10株VP,利用O和K诊断血清对分离株进行玻片凝集实验分型,采用TaqMan水解探针荧光PCR检测分离株毒力相关tlh、tdh、trh和ORF8基因,并分别用Not Ⅰ和Sfi Ⅰ两种酶进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型,导入Bionumerics 6.6软件进行聚类分析。结果 10株VP有5种血清型,6株为O3∶K6,其余4株血清型分别为O4∶K8、O1∶KUT、O2∶KUT和O10∶K19。所有菌株tlh基因均呈阳性,而trh基因呈阴性;6株O3∶K6血清型菌株和1株O4∶K8血清型菌株tdh基因均呈阳性;其余3株tdh基因呈阴性。经Bionumerics 6.6软件聚类分析,Not Ⅰ和Sfi Ⅰ酶切PFGE有8种型别,同为O3∶K6血清型的6株菌可分为4种型别。综合以上3个指标进行分析,该事件分离的10株菌中仅2株菌完全相同。结论 该起集中暴发事件由多种血清、不同PFGE型别的致病和非致病性VP多菌型共感染引起。     

一起由斯坦利沙门菌引起食源性疾病暴发疫情的调查研究

对3起聚集性腹泻、1起疑似食物中毒事件进行调查,并采集部分病例及从业人员生物标本、涉事单位食品和加工场所环境样品共19份进行沙门菌分离鉴定和基因分型。10份样品检出斯坦利沙门菌, 4株食品样品分离株和5株病例粪便、1株从业人员肛拭分离株的PFGE带型完全一致,由此证实本起事件为一起由斯坦利沙门菌引起的食源性疾病暴发疫情。     

一起弗氏柠檬酸杆菌所致食源性疾病调查

本文用描述性流行病学分析方法,对一起集体聚餐所致食源性疾病进行分析,根据流行病学调查资料、病例临床特点和实验室检验结果, 证实该起食源性疾病由食用受弗氏柠檬酸杆菌污染的食品所致。     

浙江省台州市一起生食醉蟹引起的急性肺吸虫病暴发疫情

2008年6月浙江省台州市发生一起生食溪蟹引起的急性肺吸虫病暴发事件。16例患者有生食醉蟹史,罹患率为87.5%,平均潜伏期5 d,临床特征以腹胀、腹泻、外周血白细胞总数和嗜酸性细胞百分比明显增高为主。     

2013-2017年浙江省温州市产超广谱β-内酰胺酶沙门菌的血清型及耐药性分析

目的 研究2013 — 2017年温州地区产超广谱 β-内酰胺酶（ESBLs）沙门菌的血清型分布及耐药性,为临床病情的预防、诊断与治疗提供依据。 方法 对2013年1月 至2017年12月本单位及各区疾病预防控制中心上送的294株沙门菌菌株进行E-test定量法确认产ESBLs菌株的血清分型、药物敏感性及其流行病学特征分析。 结果 294株沙门菌筛查出产ESBLs菌株68株,检出率为 23.13%,共有3种血清型。 产ESBLs鼠伤寒沙门菌41株（60.29%,41/68）、产ESBLs肠炎沙门菌19株（27.94%,19/68）、产ESBLs德比沙门菌8株（11.76%,8/68）。 患者年龄以3 ~ 5岁幼儿（61.76%,42/68）和0 ~ 2岁婴儿（17.65%,12/68）为主。 而标本类型以肠道标本为主,占69.12%（47/68）,其次来源自血液,占30.88%（21/68）。 产ESBLs沙门菌对头孢吡肟、复方新诺明、四环素的耐药率分别为41.18%、52.94%和47.06%;未发现亚胺培南、环丙沙星、左氧氟沙星耐药株。 结论 产ESBLs沙门菌菌株传播较严重,主要血清型为鼠伤寒沙门菌,在婴幼儿中多见;产ESBLs沙门菌对抗生素耐药性不同,尤其头孢吡肟、复方新诺明、四环素等敏感性较差,临床上应加强多重耐药监控。      

北京市顺义区三起关联性副溶血弧菌食源性疾病暴发事件的识别与分析

目的分析3起由副溶血弧菌（VP）导致的食源性疾病暴发事件，利用国家致病菌识别网（China PIN）对其进行关联性分析。方法收集2018年8月北京市顺义区3起食源性疾病暴发事件的流行病学资料，采集可疑食品、环境和病例样本48份，进行菌株分离和鉴定，对分离的VP菌株进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型，获得的指纹图谱通过致病菌识别网进行比对分析。结果3起暴发事件中，共从12份病例样本和3份可疑食品样本中分离出15株O3:K6血清型VP，其种特异性基因和毒力基因检测结果为:toxR+/tdh+/trh-，根据PFGE指纹图谱可以将15株VP分成2个簇，每个簇中的指纹图谱相似度为100%。 2个指纹图谱簇之间的相似度为93.94%；且与2014 — 2017年本地区China PIN分子分型数据库中分离自腹泻病例的VP菌株带型不成簇。结论VP引起的3起食源性疾病暴发事件由共同的传染源导致，China PIN在食源性疾病暴发识别、溯源和关联性分析中有良好的应用前景。     

2013-2015年安徽省合肥市食源性疾病患者分离沙门菌的病原学特征分析

目的分析安徽省合肥市食源性疾病患者所分离沙门菌的血清型别以及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子型别特点。方法对2013 — 2015年在合肥市2家哨点医院就诊的2 618例食源性疾病患者，进行沙门菌的分离鉴定以及血清学分析，并用Xba Ⅰ酶切进行PFGE分析其分子型别特征。结果在2 618份患者标本中，共检测出76株沙门菌，总检出率为2.9%，共分为17种血清型，鼠伤寒沙门菌检出率最高，其次为肠炎沙门菌。 69株沙门菌经Xba Ⅰ酶切，共产生53种PFGE带型，每种带型包含1 ~ 5株沙门菌，其中鼠伤寒沙门菌共产生20种带型，肠炎沙门菌共产生10种带型。结论初步了解合肥市食源性疾病沙门菌感染是一种以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主、多血清型长期共存的散发性感染，获得了本地区食源性疾病沙门菌感染的基线水平的血清型别和PFGE分子分型数据库，为后续暴发监测奠定了基础。     

学校发生一起因进食辣木籽引起的食源性疾病调查

2017年5月,广东省深圳市宝安区水田实验学校发生一起食源性疾病事件,调查发现,辣木籽为本次事件的致病食品,该辣木籽通过网络购得。提示一方面要加强学校食品安全管理,另一方面要加强网络销售食品的安全管理。     

一例印地安纳沙门菌致小儿败血症的鉴定溯源分析

目的对不明原因发热患儿外周血及粪便病原菌分离鉴定,明确感染病因。方法2018年9月9日,对浙江省嘉兴市第一医院接诊的1例发热患儿血培养及粪便培养的沙门菌进行血清分型和耐药、毒力基因（hilA、ssrA、mgtC、siiD、sopB、spvC）检测及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型。结果患者外周血及粪便中病原菌为印地安纳沙门菌,携带hilA、ssrA、mgtC、siiD、sopB毒力基因,血流和粪便株PFGE聚类相似性为100%。结论该病例是印地安纳沙门菌引起的肠源败血症,应加强本地区基于实验室诊断的沙门菌血清型病例的监测能力。