人类博卡病毒基因组序列与进化分析

目的 对人类博卡病毒的基因组结构、系统进化以及突变规律进行分析.方法 利用生物信息学方法如BLAST、CLUSTALW等程序对已经提交到GenBank数据库中的人类博卡病毒全基因组序列进行比对分析和系统进化分析.结果 人类博卡病毒基因组短小、结构简单;与其它博卡病毒基因组同源性高,尤其是犬细小病毒;目前GenBank中的5株人类博卡病毒根据进化关系分析可分为两群(CRD2、st2、CZ643和st1组成一群,WLL-1单独成群);统计突变发现人类博卡病毒NS1基因突变频率最小,VP1/2基因突变频率高.结论 人类博卡病毒很可能是动物博卡病毒传染给人后的变种;稳定的NS1基因很可能成为开发疫苗和防治药物的重要靶点.     

新疆地区维、汉民族乙型肝炎病毒耐药基因型分布与变异研究

目的 探讨新疆地区维吾尔族与汉族乙型肝炎病毒耐药基因型分布及耐药变异情况.方法 采用基因芯片对来自维族、汉族人群乙型肝炎病毒核酸阳性的927份标本进行与乙型肝炎病毒耐药相关的rtL180M、rtM204I/V、rtA181T/V和rtN236T的耐药突变和基因型分析.结果 维吾尔族与汉族的乙型肝炎病毒耐药突变率分别为53.26％和59.28％,差异无统计学意义;在4个耐药变异位点中,rtL180M、rtM204I/V、rtN236T 3个位点的突变在两个民族之间差异无统计学意义;rtA181T/V在两个民族中的突变率分别为13.04％和31.74％,差异有统计学意义(x2=13.8204,P＜0.05).结论 维吾尔族与汉族的乙型肝炎病毒耐药突变不存在差异,4个突变位点的6种突变中,只有rtA181T/V在两个民族之间有差异,且维吾尔族低于汉族,rtL180M、rtM204I/V和rtN236仍是维吾尔族乙型肝炎病毒耐药的常见变异.     

乙型肝炎病毒前基因组RNA检测在乙型肝炎治疗中的临床研究

目的探讨乙型肝炎病毒前基因组RNA(HBV-pgRNA)的检测在乙型肝炎治疗中的临床价值。方法选取怀化市第一人民医院2017年5月-2018年10月收治的乙型肝炎患者80例,采用定量聚合酶链式反应(qPCR)检测不同感染阶段及治疗期间患者血清HBV pgRNA、HBV DNA水平,用化学发光法检测血清乙肝表面抗原(HBsAg)滴度,肝活检组织中提取DNA后检测共价闭合环状DNA(cccDNA),分析HBV pgRNA与HBV DNA、HBsAg、cccDNA的相关性及预测患者治疗的价值。结果血清HBV pgRNA、HBV DNA在乙肝e抗原(HBeAg)阳性慢性HBV感染期(Ⅰ+Ⅱ)最高,HBeAg阴性慢性HBV感染期(Ⅲ+Ⅳ)最低,血清HBsAg水平和肝内cccDNA水平在四个阶段保持相对稳定。对总体患者、Ⅰ期和II期患者,HBV pgRNA与HBV DNA、HBsAg、cccDNA均成正相关(P<0.05);HBV pgRNA、HBV DNA、HBsAg、cccDNA水平治疗后均下降,除HBsAg治疗后12个月与6个月无统计学差异外,其他各指标治疗后与前一治疗阶段差异均有统计学意义(P<0.05);HBV cccDNA水平(AUC=0.773)是HBsAg血清转换的最佳预测指标,其次是HBV pgRNA水平(AUC=0.743)。HBV pgRNA水平对HBsAg血清转换预测敏感度89.11%,特异度81.23%,准确度85.72%。结论HBV pgRNA的动态变化可以作为一种新的标志物来预测HBeAg阳性患者治疗。     

乙型肝炎病毒基因型和前C及基本核心启动子突变与乙型肝炎疫苗阻断母婴传播的关系

目的探讨乙型肝炎（乙肝）病毒（HBV）基因型和前C及基本核心启动子（BCP）突变与乙肝疫苗阻断母婴传播的关系。方法采集江苏省16对乙肝疫苗阻断失败的母婴血清样本32份,以及88对阻断成功的母婴血清样本176份。以型特异性引物PCR法检测16对乙肝疫苗阻断失败的母婴和88例阻断成功的母亲血清样本中HBV基因型,用PCR产物直接测序法检测HBV前C/ BCP突变,采用Clustal W 1．8软件进行序列分析。结果在16例阻断失败的母亲中,15例（93．8%）为HBeAg阳性,且均为C型（15/15,100%）;88例阻断成功的母亲中,51例（58．0%）为HBeAg阳性,其中C基因型占45．1%（23／51）。在HBeAg阳性母亲中,阻断失败组的C基因型检出率明显高于阻断成功组（X~2=14．3,P=0．003）。但在C基因型HBeAg阳性母亲中,阻断成功组与失败组的T1762/ A1764突变率差异无统计学意义（分别为13．3%和33．3%,P=0．4）,且均无A1896突变。结论感染HBV基因C型的母亲可能更易导致乙肝疫苗阻断失败,而前C/BCP基因突变与阻断母婴传播无关。     

肺炎克雷伯菌单基因分子进化分析及多位点序列分型与基因组系统学研究

目的比较7株已完成全基因组测序的肺炎克雷伯菌单基因分子进化分析及多位点序列(MLST)分型与基因组系统学研究的结果,研究其亲缘关系。方法采用Roche 454高通量测序技术对1株泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株做全基因组测序(完成图),再与NCBI已完成全基因组测序的6株肺炎克雷伯菌9种看家基因进行单个基因分子进化分析,将该9个基因序列串联作MLST分型,并将7株肺炎克雷伯菌的全基因组序列作聚类分析(为Fast Minimum Evolutin法)。结果 JM45株测得一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列;因为不同的基因进化率不同,7株肺炎克雷伯菌9种看家基因单个基因序列的分子进化图并不一致;7株肺炎克雷伯菌MLST分型可见JM45株与HS11286株相同(即为同一型),1084株与NTUH-K2044株相同,但7株肺炎克雷伯菌基因组系统学分析可见,JM45株与HS11286株并不相同(即非为同一型),JM45株与HS11286株距离最近,与342株距离最远,其他各株介于二者之间。结论采用单个基因序列的分子进化分析法及MLST分型用作菌株亲缘性关系分析法并不可靠,本研究为国内首个单个看家基因分子进化分析及MLST分型与基因组系统学研究的比较报道。     

生存选择压力与乙型肝炎病毒基因的变异

HBV逆转录酶是易错酶,易导致HBV复制过程中出现核苷酸的变异,其变异可以分为基因型变异和表型变异.HBV对于各种生存选择压力,如宿主免疫应答反应、抗病毒药物治疗及疫苗免疫接种等,做出适应性改变形成了不同的HBV基因表型变异.此文就生存选择压力下HBV基因变异的最新研究进展进行综述.     

乙型肝炎病毒表面抗原的突变及其影响

随着乙肝疫苗的普及、高效乙肝免疫球蛋白的使用和核苷类似物的临床应用等,近年来各种具有不同临床意义的HBsAg突变株不断出现。部分HBsAg突变能显著降低HBsAg试剂的检测能力甚至漏检,而HBsAg的免疫逃避突变还可能突破个体的免疫防护发生HBV感染,导致临床上免疫阻断措施失败。本文综述了HBsAg突变株的流行现状和流行趋势,及这些突变株对乙肝诊断试剂和乙肝疫苗有可能带来的影响。     

乙型肝炎病毒突变与隐匿性感染的相关性

隐匿性HBV感染(OBI)指在机体肝组织中存在HBV DNA,血清HBsAg阴性,伴或不伴有血清HBV DNA阳性的感染状态.OBI与隐源性肝硬化和肝细胞癌有关,是输血、器官移植播散HBV的潜在危险因素,也是目前疫苗接种失败的主要原因之一.OBI的形成与多种机制有关,其中病毒突变是重要因素.此文就HBV基因不同区域突变与OBI感染的关系作一综述.     

乙型肝炎病毒基因变异与免疫逃逸的研究进展

HBV感染机体后,为了达到长期在宿主体内存在的目的,在机体的免疫压力、药物和其他因素的作用下可发生基因变异,来逃避宿主的免疫监视和清除,不同读码框的不同幕因变异导致免疫逃逸的机制也不相同.此文就HBV不同读码框的基因变异与免疫逃逸的关系进行综述.     

乙型肝炎病毒前基因组启动子的调节机制

乙型肝炎病毒(HBV)是一种DNA病毒,但其基因组的复制是通过DNA-RNA-DNA的途径来实现的。作为从RNA逆转录为前基因组DNA的模板,3.5千的RNA的转录非常重要。目前的研究证实,前基因组启动子和核心启动子(CP)是2段位置相近,但结构与调节机制又不相同的启动子,虽然均指导3.5千核苷酸的RNA转录,但作为前基因组和翻译模板的RNA,其5′末端序列不同。前基因组启动子序列活性受到一系列不同的蛋白质因子的调节,增强子对于HBV前基因组启动子的活性也有重要的调节作用。     

Impact of HBV genotypes A and D genetic variability on infection evolution

HBV is characterized by a high genetic variability, which is the basis of its classification into eight genotypes (A–H). HBV infection is associated with different outcomes, from self-limiting acute hepatitis to active chronic hepatitis, asymptomatic carriage, and occult infection.The aim of this study was to analyze the genetic variability of HBV genotypes A and D isolates from 79 cases of self-limiting acute hepatitis and chronic hepatitis, in order to identify HBV variants associated with resolution or chronicity of acute HBV infection. The entire preS–S sequence and a fragment of 346 bp of the preC–C region, containing Enhancer II and Basal Core Promoter sequences, were analyzed. A phylogenetic analysis of preS/S region showed that the 45.45% (15/33) of isolates from acute hepatitis cases were genotype A compared to 8.69% (4/46) of chronic hepatitis cases. (p = 0.0002). Mutations associated with immune-escape (T131N, D144A/E, G145K), amino acid polymorphisms in “a determinant” domain of S protein and mutations/deletions in preC/C region were found in isolates from acute and chronic hepatitis B cases. In this study mutations/deletions in preS–S and preC–C regions, usually associated with fulminant acute hepatitis, advanced forms of liver disease and increased risk for HCC, were identified in HBV strains of genotype A and D obtained both from patients with self-limiting acute HBV infection and from persistent infected patients. This founding probably is due to the natural viral evolution under host immune response and to the circulation of a wide variety of HBV strains in our geographic area because of the ancient introduction of genotype D and the migrant fluxes from North Africa. Moreover, the analysis of circulation of new HBV antigenic variants is fundamental for the epidemiological surveys and for the evaluation of the impact of viral evolution on vaccine prophylaxis strategies.     

乙肝疫苗免疫失败者中乙型肝炎病毒感染及S基因变异研究

目的研究乙肝疫苗免疫失败者中乙型肝炎病毒(HBV)隐匿性感染及编码S基因(surface)变异状况。方法选择乙肝疫苗免疫后抗-HBs阴性的儿童血清标本167份,利用聚合酶链反应(PCR)扩增HBVS基因片段,对PCR阳性产物进行脱氧核糖核酸(DNA)序列测定和基因片段分析。结果在167份标本中,HBV核酸阳性63份,在测序42份标本中11份标本S基因片段出现氨基酸变异,共有5个氨基酸位点发生变异,其中一个在"a"决定簇片段内。结论免疫失败儿童HBV隐匿性感染率较高,HBVS基因存在不同位点的变异。     

HBV宫内传播和HBV前S／S基因突变的关系的初步分析

目的研究宫内传播中乙型肝炎病毒前S／S基因的突变，探讨宫内感染乙型肝炎病毒与HBV基因突变的关系。方法根据随访确定新生儿是否发生宫内感染，将HBsAg阳性母亲分为病例组和对照组，经PCR扩增HBVDNA，基因克隆、测序，分析前S／S基因的突变。结果共得到60株HBV病毒株序列，所有毒株均属于C基因亚型、adr亚型；16个位点的突变在宫内感染组母亲及其新生儿中没有或很少发生，在对照组母亲中发生率较高，其中nt2749、3086、309、676、684、3114、70、161、308、213、373、405位点突变在3组中的发生率差异有统计学意义。结论所有病毒株前S／S基因均存在突变，某些突变位点在非宫内感染组母亲中的发生率较高，HBV宫内感染的发生可能与某些位点基因是否发生突变或其所在的功能区是否发生变化有关。     

烹饪专业大学生HBV感染的流行病学及3年追踪调查结果分析

目的　探讨乙肝病毒 (HBV)感染在烹饪专业大学生这个特定群体中的感染状况 ,为制定乙肝预防对策提供科学依据。方法　对 2 64名烹饪工艺系大学生进行HBV血清流行病学调查 ,并对其中 16例乙肝表面抗原 (HBsAg)携带者的HBV血清感染标志作了 3年的动态追踪观察。全部受检者首先用反向间接血凝法 (RPHA)测定HBsAg ,阳性者则用酶联免疫吸附试验 (ELISA)复查其它感染标志。用改良赖氏法测肝功 (ALT)。结果　HBsAg累计平均携带率为 6 3 0 % ,各年级阳性率差异有非常显著性意义。 (χ2 =12 0 6　P <0 0 0 5 )。HBsAg乙肝e抗原 (HBeAg)或乙肝核心抗体 (抗 -HBc)同时阳性血清占HBsAg阳性血清份数的 12 77%。 结论　对烹饪专业大学生定期进行健康检查 ,并同时开展HBsAg及其它HBV感染标志的动态监测 ,加强对具传染性检出者的卫生管理及门诊随访 ,在乙肝传染源管理中具有一定的指导意义。在制定今后的乙肝预防策略时 ,应当把杜绝医源性传播和乙肝免疫预防作为重点。     

武汉市乙型肝炎病毒母婴传播阻断现况研究

我国是HBV感染的高发区,≥3岁人群中HBsAg阳性率约占9.09%[1].宫内感染是HBV母婴传播的主要途径,乙型肝炎(乙肝)疫苗和HBIG联合免疫可有效阻断HBV母婴传播的产时(后)感染,但采用主被动联合免疫后HBsAg阳性母亲的婴儿免疫失败率仍然有20%～30%[2].本研究对近年武汉市江岸区HBsAg阳性孕妇采取的乙肝母婴传播阻断措施的实施状况及干预后婴幼儿HBV感染情况进行调查.     

垂直传播中乙型肝炎病毒S区变异株检出及其流行病学意义

目的　研究垂直传播中乙型肝炎病毒Ｓ基因变异的流行病学意义。方法　以配偶无乙型肝炎病毒（ＨＢＶ） 标志的４ 名女性携带者与６ 名男性携带者及其子宫内感染ＨＢＶ 的胎儿为对象,以双脱氧链末端终止法检测母子、父子所携ＨＢＶＳ区４５１ ～６６０ 位核苷酸序列。结果　母子、父子间同源性９８ ％ ～１００ ％ ,检出４９１ 、４９４、５３０ 、５４６、５８１ 位点变异致使１１３ 、１１４、１２６ 、１３１、１４３ 位氨基酸替代,其中２ 对父母与胎儿检出１２６ 位变异。４ 例胎儿检出１３１ 位变异,其中２ 例胎儿合并检出１４３ 位变异。结论　ＨＢＶ垂直传播中存在Ｓ基因变异株,可能以１２６、１３１、１４３ 位氨基酸变异株为主,这些变异株可能使ＨＢ疫苗免疫失败。     

慢性乙型肝炎病毒感染者前C区变异及HBV DNA载量的临床意义

目的探讨慢性HBV感染者前C区A1896变异及HBVDNA载量与肝炎病情进展的关系。方法检测116例慢性HBV感染者前C区A1896变异,比较不同临床类型前C区A1896变异阳性率,再根据前C区变异不同,比较不同临床类型HBVDNA含量的差异。结果不同临床类型前C区变异株检出率差异无统计学意义(χ2=2.863,P=0.581)。在慢性HBV携带者中,变异阳性率同时伴有较高水平的HBVDNA量(P=0.003),其余各临床类型均未见明显差异;但变异情况相同的条件下,HBVDNA载量似随着病情的加重呈降低趋势。结论影响肝炎病情进展的因素错综复杂,前C区A1896变异可能不起作用,但前C区A1896变异可能是影响HBVDNA复制的一个因素。     

乙型肝炎免疫球蛋白阻断乙肝病毒母婴传播过程中病毒S区基因变异的研究

目的了解乙型肝炎免疫球蛋白（HBIG）在阻断母婴传播过程中S基因变异的特点,比较与未予阻断者的差异,探讨基因变异与宫内传播的关系,协助评价HBIG的治疗安全性.方法将18对乙型肝炎病毒（HBV）携带母亲及其宫内感染新生儿按母亲产前处理分为HBIG组8对,母亲于产前3月起肌肉注射HBIG 200～400IU至分娩前;对照组10对,母亲产前不接受HBIG者.巢式PCR扩增HBV S基因片段并直接测序.以每对病例第一份（母亲孕中期）血清HBV株S基因区氨基酸（或核苷酸）作为标准,对每对病例第二份血清（母亲分娩前）和第三份血清（新生儿）HBV株进行分析.结果HBV S区碱基替代突变率和氨基酸变异数在HBIG组和对照组之间的差异均无统计学意义;18例宫内感染儿17例其病毒株与母亲分娩前的优势株一致,其中4例为S区变异株;18例宫内感染儿病毒株分型B型adw2 12例,C型adrq^＋6例.结论无症状携带HBV孕妇产前使用现有剂量HBIG至临产并未增加HBV S区的变异.HBV S区变异株和未变异株均可经宫内传播,宫内感染发生于孕后期;HBV S区变异并非发生宫内感染的主要原因.     

分娩方式对乙型肝炎母婴传播阻断效果的影响

目的探讨乙型肝炎(乙肝)病毒携带孕妇不同的分娩方式对乙肝母婴传播的影响。方法51例HBV感染但无临床症状的孕妇分成2组,实验组(联合免疫组):孕妇产前及新生儿均注射乙肝免疫球蛋白(HBIG);对照组(单用乙肝疫苗组):孕妇产前及新生儿均不注射HBIG;上述所有新生儿均注射乙肝疫苗。随访3 a,每年检测新生儿HBsAg和抗-HBs,同时询问所观察婴儿的生产方式。结果3 a中剖宫产和经阴道分娩的两组婴儿HBsAg携带率和抗-HBs阳性率差异均无显著性(P>0.05)。结论不同分娩方式对乙肝母乳传播的阻断效果影响不大。     

浙江省常山县幼儿园中小学生乙型病毒性肝炎感染情况分析

目的:了解常山县学生乙型肝炎病毒感染情况及表面抗体(HBsAb)阳性率,为制订和评价防治措施提供科学依据。方法:随机抽取735名小学生、503名初中生、1029名高中生和608名岁幼儿园学生,用ELISA法测定HBsAg和HBsAb。结果:2875名体检者血清标本中,HBsAg阳性率为2.54%,其中幼儿园学生阳性率0.66%,小学生阳性率为0.95%,初中生阳性率为1.59%,高中生的阳性率为5.25%。幼儿园、小学生、初中生、高中生HBsAg阳性率呈逐阶段上升趋势,差异有统计学意义(P<0.01)。HBsAb幼儿园学生阳性率最高,四个组HBsAb阳性率差异有统计学意义(P<0.01)。结论:乙肝病毒疫苗纳入儿童计划免疫取得了效果,1990年代以后出生人群,HBsAg携带率已呈逐步降低;应继续严格的乙型肝炎计划免疫,在人群中建立有效乙型肝炎免疫屏障。