贵州省B3基因型麻疹病毒分子特征

目的 分析贵州省2014年首次发现B3基因型麻疹病毒分子特征。方法 采集咽拭子经实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(real-time RT-PCR)筛查麻疹病毒核酸。用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒核酸筛查阳性咽拭子,对麻疹病毒N基因羧基末端634个核苷酸片段进行扩增,对扩增产物进行序列测定和分析,构建基因亲缘性关系树。结果 Guizhou14-06(MVs/Guizhou.CHN/11.14/01)在亲缘关系上与WHO B3基因型参考株MVi/Ibadan.NGA/0.97/1(AJ232203)同属一个分支,与MVi/Ibadan.NGA/0.97/1(AJ232203)的核苷酸和氨基酸差异分别为2.00%和2.67%;与中国目前的优势流行参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7(AF045212)的核苷酸和氨基酸差异分别为10.8%和12.0%;与其他WHO 22个基因型参考株的核苷酸和氨基酸差异分别为4.40%~11.0%和4.67%~12.0%。结论 B3基因型麻疹病毒是贵州省首次发现的新基因型麻疹病毒,丰富贵州省麻疹病毒分子流行病学基线数据,并有助于麻疹病毒的控制和消除工作。     

我国首例输入性D_9基因型麻疹病毒的分离和鉴定

目的分离并鉴定我国首例输入性D9基因型麻疹病毒。方法使用Vero/SLAM细胞（非洲绿猴肾细胞/淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞）分离病毒,使用逆转录-聚合酶链反应扩增出编码核蛋白羧基末端450个核苷酸片段,通过对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,构建基因亲缘性关系树,进行遗传距离分析。结果四川省D9基因型麻疹病毒分离株MVi/Sichuan.CHN/07.09/1和世界卫生组织D9基因型代表株Victoria.AUS（维多利亚？澳大利亚）/12.99在基因亲缘性关系树上同属一个分支,核苷酸同源性为96.9%;和2008年流行于泰国和荷兰的D9基因型麻疹野病毒的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%～100%和99.3%～100%;和中国大陆目前所使用的麻疹疫苗株沪191相比对,其核苷酸和氨基酸同源性分别为92.3%和90.7%;和中国目前流行的麻疹病毒绝对优势本土基因型H1基因型代表株相比对,其核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8%和92.1%。结论输入中国四川省的麻疹病毒株为D9基因型。     

河北省D8基因型麻疹病毒输入性疫情监测及基因型特征分析

目的:分析河北省D8基因型麻疹病毒输入性疫情流行及基因型特征。方法:对麻疹监测病例的流行特征进行分析,对采集的急性期咽拭子标本进行荧光定量RT-PCR鉴定、病毒分离培养及核苷酸序列测定和分析。结果:监测到输入性D8基因型麻疹病例36例,主要集中在邯郸市的8个县（区）,其中成安县确诊病例数最多,占报告病例数的58.33%...     

贵州省首例输入性B_3基因型麻疹病例的流行病学调查

目的了解输入性B_3基因型麻疹病例的流行病学特征和传播情况。方法对1例输入性B_3基因型麻疹病例进行流行病学调查,并采集病例血清和咽拭子标本检测麻疹免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)M和提取麻疹病毒核酸并测序。结果 2014年在兴仁县发现贵州省首例输入性B_3基因型麻疹病例,该基因型非我国本土流行株。病例血清标本检测结果为麻疹IgM阳性;咽拭子检测到麻疹病毒核酸,测序结果为麻疹病毒B_3基因型。结论此次输入尚未引起进一步的传播,我国目前使用的麻疹减毒活疫苗在人群中的免疫对阻止B_3基因型麻疹病毒传播有效。     

上海闵行区首次发现输入性B3基因型麻疹病例

为了解闵行区麻疹野毒株新基因型流行病学特征,对2013年到上海市闵行区就诊的1例麻疹病毒新基因型病例的发病情况进行描述性流行病学分析。结果显示,该例患儿的鼻咽拭子检测中分离到麻疹病毒株,经鉴定基因型为B3型。该病例无麻疹免疫史,其家属也没有前往过B3基因型流行的国家,也无明确外籍人员接触史,不能判断病毒是国外输入。该病例的发现提示闵行区麻疹监测系统敏感,发现了首例输入性B3基因型麻疹病例。掌握麻疹基因型的动态分布可确定病毒传播途径,有利于阻断麻疹病毒传播,为评估麻疹控制策略效果提供了依据。     

四川省1株输入性麻疹病毒基因特征分析

目的分析四川省1麻疹病毒分离株的基因特征。方法病毒分离和核苷酸测序后,与麻疹病毒基因型参考株编码核蛋白羧基末端的456个核苷酸序列做进化树分析。结果该病毒分离株（MVi/Sichuan.CHN/7.09/1）与D9基因型参考株聚集在同一进化分枝上,bootstrap值为91%。与D9基因型参考株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为96.9%和96.6%;与其他22个基因型参考株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为89.9%～96.2%和90.7%～98.0%。结论现有的麻疹实验室网络数据表明,该病毒分离株为我国大陆首次分离到的D9基因型麻疹病毒,证实为输入性病毒。     

输入性新型麻疹病毒D9基因型密切接触者中和抗体水平检测

目的了解输入性新型麻疹病例密切接触者血清对D9基因型病毒的中和抗体水平,探讨正常健康人群对感染新型麻疹病毒的抵抗力。方法采集D9基因型输入病例接触者血清和选择2008年四川省健康人群血清,分别用D9基因型输入病毒和本土流行株H1基因型病毒进行中和抗体滴度测定。结果 D9基因型输入病例接触者和四川健康人群血清的中和抗体滴度较高,对D9基因型输入病毒的中和抗体的几何平均滴度（以下简称GMT）分别为44.02和54.57,对四川本土流行株H1基因型病毒中和抗体的GMT分别为39.12和41.36,抗体滴度均达到保护水平（≥16）。结论无论四川省本土流行株感染产生的抗体和疫苗免疫诱生的抗体对D9基因型输入病毒都有抵抗力。     

山西省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒疫情调查

目的 调查山西省首起境外输入性D8基因型麻疹病毒疫情暴发的原因,评价防控措施效果.方法 对病例进行个案调查,采用酶联免疫吸附试验(EL1SA)对血清学样本进行麻疹IgM抗体检测.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法对咽拭子样本进行核酸检测.采用Vero/slam细胞培养麻疹核酸阳性咽拭子样本,分离出麻疹病毒后进行...     

晋江市2018-2019年输入性B3基因型麻疹疫情防控状况分析

目的 了解晋江市输入性B3基因型麻疹确诊病例流行病学特征,总结其防控措施,为消除麻疹工作提供依据.方法 用描述流行病学方法,对晋江市2018-2019年输入性B3基因型麻疹确诊病例进行分析.结果 晋江市2018-2019年输入性B3基因型麻疹确诊数占总发病数67.7％(21/31),其中2018年发生1起医院内暴发;发...     

麻疹病毒血凝蛋白基因的序列分析

目的 探讨深圳市麻疹病毒的基因型别和特征。方法 对深圳市专科医院2000～2002年的19例临床诊断为麻疹病例的咽拭子和尿液提取RNA，通过 RT-PCR方法扩增麻疹病毒血凝索(H)基因序列，并克隆到PMD18-Tvector进行序列测定；分析麻疹病毒和Genebank中麻病毒的各基因型代表株序列的同源性。结果 19株麻疹病毒H基因之间的同源性为96．2％～100％，和H1基因型代表株相比同源性为96．4％～99．3％。结论 深圳市麻疹流行株属于H1基因型。     

Novel measles virus genotype,East Timor and Australia

Measles outbreaks in 1999 in Queensland and Victoria, Australia, were caused by a novel strain of clade G virus (proposed name g3). Epidemiologic and molecular evidence supports independent circulation of this virus in Queensland, northern Australia, in addition to importation of the virus by East Timor refugees seeking safe haven in Australia.     

New measles genotype, Uganda

We report the first genetic characterization of wildtype measles viruses from Uganda. Thirty-six virus isolates from outbreaks in 6 districts were analyzed from 2000 to 2002. Analyses of sequences of the nucleoprotein (N) and hemagglutinin (H) genes showed that the Ugandan isolates were all closely related, and phylogenetic analysis indicated that these viruses were members of a unique group within clade D. Sequences of the Ugandan viruses were not closely related to any of the World Health Organization reference sequences representing the 22 currently recognized genotypes. The minimum nucleotide divergence between the Ugandan viruses and the most closely related reference strain, genotype D2, was 3.1% for the N gene and 2.6% for the H gene. Therefore, Ugandan viruses should be considered a new, proposed genotype (d10). This new sequence information will expand the utility of molecular epidemiologic techniques for describing measles transmission patterns in eastern Africa.     

2000年东莞市麻疹病毒流行株基因型分析

目的 了解东莞市麻疹病毒（measles virus,MV)流行株的基因型。方法 2000年4-7月间东莞市发生有55例患者的麻疹流行,采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法直接检测麻疹病人急性期唾液中的麻疹病毒核糖核酸（RNA）的N基因和M基因,对任意选取的5份RT-PCR阳性标本和疫苗株沪-191的N基因扩增片段进行核酸序列测定,并进行序列系统树分析。结果 用RT-PCR方法直接检测的阳性率为87.3%;用血清抗-MV-IgM ELISA方法检测的阳性率为70.9%,抗MV-IgM阴性的病人唾液中有68.8%的标本MV-RNA阳性。序列分析结果表明此流行株的基因型与世界麻疹病毒流行株不同,差异为1.4%-11.7%,可归属于H基因型。结论 2000年东莞市麻疹病毒流行核酸序列完全相同,为H基因型,说明本次流行的麻疹病毒具有同源性,来源于同一传染源。     

2015年黔东南地区麻疹病毒分离株基因特征分析

目的 分析2015年黔东南地区麻疹病毒基因型别和特征。方法 采集疑似麻疹病例临床咽拭子标本,经Real - time RT - PCR初筛为麻疹病毒核酸阳性,使用Vero/SLAM细胞进行病毒分离,对阳性分离物提取病毒RNA,采用RT - PCR方法扩增麻疹病毒N基因羧基末端编码的634个核苷酸片段,并进行测序与分析。结果 35例疑似麻疹病例中检测到4例麻疹病毒阳性核酸,经分离得到2株麻疹病毒。基因亲缘关系显示2株为H1基因型中的H1a基因亚型。2株麻疹病毒株与H1基因型参考株MVi/Hunan.CHN/0.93/7(AF045212)比较,核苷酸和氨基酸同源性分别为97.7%和98.0%;与H1a基因亚型参考株Chin9322比较,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.9%和99.3%;2株H1a基因亚型与往年及本省流行的麻疹病毒的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.2%～100%和98.0%～100%。结论 黔东南地区2015年分离到的麻疹病毒为H1a基因亚型,与贵州省本土麻疹流行的优势基因亚型一致。     

浙江省平湖市2017年由D8基因型麻疹病毒引起的暴发调查

目的 调查浙江省由D8基因型麻疹病毒引起暴发的流行病学特征,为麻疹疫情防控工作提供参考依据。方法 资料来源于中国疾病预防控制信息系统报告的麻疹监测病例,对D8基因型麻疹病例发生地浙江省平湖市开展现场流行病学调查,查阅门诊记录和出入院记录,现场个案调查和疫情处置,采集病例急性期血标本、咽拭子标本。实验室检测包括血清学检测、RNA提取和扩增、麻疹病毒分离和基因型鉴定,采用SPSS 17.0和Excel 2016软件进行数据分析。结果 2017年浙江省平湖市报告一起麻疹暴发疫情,确诊病例10例,>40岁成年人8例。采集病原学标本6例,其中D8基因型5例,1例病原学培养阴性。10例病例之间存在3条传播链同时传播,涉及工厂、医院、家庭内3个场所的传播链。D8和H1a基因型麻疹病例临床表现的差异无统计学意义。及时开展应急接种后,疫情得到有效控制。结论 由D8基因型麻疹病毒引起的暴发疫情,早期病例不易发现,未及时发现和处置首例麻疹病例,形成院内感染传播,成年人麻疹免疫屏障薄弱是本起疫情暴发的原因。应急接种可以阻断传播,说明目前使用的麻疹疫苗对预防D8基因型麻疹病毒感染有效。     

2006年长春市儿童野生型麻疹病毒基因序列分析

目的:研究吉林省长春市0~12周岁儿童野生型麻疹病毒的基因型别及核蛋白(N)基因序列特征,探讨控制麻疹发生的措施。方法:采用Vero/SLAM细胞分离培养麻疹病毒,通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法从分离的麻疹病毒中扩增核蛋白(N)基因羧基端450个核苷酸片段(bp)并进行核苷酸测序分析,对基因库中麻疹病毒的22个代表株基因序列的同源性进行比较。结果:分离得到9株野生型麻疹病毒,N基因与H1基因型代表株相比同源性为98.3%。结论:吉林省长春市麻疹流行株属于H1基因型。     

杭州地区乙型肝炎病毒基因型分析

目的:建立多重荧光PCR技术检测乙肝病毒(HBV)基因型,并了解杭州地区乙型肝炎病毒感染者基因型分布特点。方法:首先优化TaqM an探针多重荧光PCR的反应体系,然后采用该法检测杭州地区150例慢性乙肝患者的HBV基因型,并用测序方法进行确认。结果:B基因型65例(43.3%),C基因型53例(35.3%),B+C混合型24例(16%),未分型8例(5.3%)。结论:杭州地区乙型肝炎病毒感染者基因型以B、C型为主,B、C混合型感染比例较其他地区高,TaqM an探针多重荧光PCR简单经济,可以应用于大规模HBV基因型研究。