2016年浙江省急性胃肠炎患者诺如病毒的分子流行病学特征分析

摘要：目的：探讨2016年浙江省急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学和基因特征。 方法：收集2016年1月至12月共1 308份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便标本,用一步法双重荧光RT-PCR技术检测诺如病毒GⅠ和GⅡ型,用分层抽样抽取阳性标本核酸进行普通RT-PCR扩增,并对扩增产物进行测序分析。 结果：诺如病毒阳性率为10.55%（138/1 308）,其中GⅠ型12例,GⅡ型118例,GⅠ/GⅡ型混合感染8例。诺如病毒在不同年龄组的阳性率随患者年龄上升而下降,以≥60岁组最低;不同性别组间的阳性率差异无统计学意义;诺如病毒感染全年分布,其中12月阳性率达到顶峰,为37.50%。测序结果显示GⅠ的基因亚型主要是GⅠ.6;GⅡ的基因亚型以GⅡ.4与GⅡ.17为主,分别占40.91%（18/44）和34.09%（15/44）。 结论：诺如病毒是引起2016年浙江省急性胃肠炎的重要病原体,且GⅡ.4和GⅡ.17是主要的基因亚型。     

北京市门头沟区2018-2020年急性胃肠炎患者诺如病毒基因型分析

目的 了解北京市门头沟区急性胃肠炎患者诺如病毒基因型.方法 采用实时荧光定量PCR方法对急性胃肠炎患者粪便标本进行诺如病毒核酸检测,普通RT-PCR法对诺如病毒GⅡ基因群标本的多聚酶和衣壳蛋白区域扩增,对扩增产物序列测定.结果 粪便标本诺如病毒阳性检出率为10.75％,其中GⅡ基因群占95.89％,GI基因群占4.11...     

2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究

目的 分析2018—2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征。方法 收集2018—2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份。采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应（real-time RTPCR）对提取的GⅠ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测。采用RT-PCR进行GⅠ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序。用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06软件构建进化树。结果 6所学校（18,S1～S4和19,S5～S6）发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,GⅠ诺如病毒核酸阳性率为83.78%(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与GⅠ.Pd参考株和GⅠ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与GⅠ.Pb参考株和GⅠ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%。双区分型合并结果,1起疫情由GⅠ.Pd-GⅠ.3b引起,该重组株与GⅠ.3[P13]/H...     

2018年甘肃省兰州市诺如病毒GⅠ胃肠炎暴发疫情病原学分析

目的了解2018年5-6月甘肃省兰州市发生的2起学校急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒分子特征,并进行溯源分析。方法采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应对标本进行诺如病毒检测,对阳性标本聚合酶区–衣壳蛋白区核苷酸进行测序和同源性分析,采用MEGA 6.0软件进行遗传进化分析。结果 2起学校胃肠炎疫情均为诺如病毒GⅠ引起,5月28日至6月4日的一起疫情发病50例,罹患率为3.24%。6月1-13日的疫情发病35例,罹患率为4.76%;流行病学调查提示,2起疫情均与小饭桌就餐和密切接触相关。33份标本中检出诺如病毒GⅠ核酸阳性标本13份。对阳性样本的RdRP和VP1区的部分基因片段进行测序和比对,第1起疫情为诺如病毒GⅠ.3[P13]基因型,第2起疫情为GⅠ.6[P11]基因型。结论兰州市城关区2起学校急性胃肠炎疫情分别由GⅠ.3[P13]型和GⅠ.6[P11]型诺如病毒引起,应加强诺如病毒监测,强化中小学附近小饭桌等集中就餐场所的管理。     

2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化研究

目的 通过定点监测了解2009-2015年福建省福州市急性腹泻儿童中诺如病毒基因多样性及动态变化趋势。方法 采集2009-2015年福州市儿童医院因急性腹泻入院的5岁以下儿童的粪便标本,应用实时荧光定量聚合酶链反应（Real-time PCR）筛查诺如病毒阳性标本。应用反转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法扩增完整的VP1区和部分RdRp区并测序,应用在线基因分型工具和种系进化分析方法了解福州市5岁以下儿童中诺如病毒基因型/亚型的分布。结果 在随机抽取的93份标本中,Real-time PCR法检测阳性有91份;共获得其中73份完整VP1区和72份部分RdRp区基因序列。在完整的VP1分型中,GⅡ.4_2006b型43份,GⅡ.4 Syndeny_2012型16份,GⅡ.3型10份,GⅡ.4 New Orleans_2009型2份,GⅡ.12型1份,GⅡ.7型1份。在部分RdRp区分型中,共发现GⅡ.P4_2006b型43份,GⅡ.Pe型16份,GⅡ.P12型10份,GⅠ.P4型1份,GⅠ.Pa型1份,GⅡ.P21型1份。结论 应用双命名系统分型的方法,发现2009-2015年福州市急性腹泻儿童中诺如病毒具有遗传多样性,其中2009-2012年流行的优势毒株为GⅡ.P4_2006b/GⅡ.4_2006b型,2013-2015年流行的优势毒株为GⅡ.Pe/GⅡ.4 Sydney_2012型。此外,GⅡ.P12/GⅡ.3为福州市持续流行的型别。     

一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学调查

目的了解2018年河北省一起诺如病毒暴发疫情的流行特点及暴发原因，探讨疫情处置经验。方法采用现场流行病学方法，收集2018年河北省一起疫情发生学校的基本情况，搜索病例并进行回顾性问卷调查，描述疾病流行特征，开展病例对照研究及危险因素探索，同时采集患者粪便或肛拭子、食物和水等环境标本进行肠道病毒及肠道致病菌的检测。结果本次疫情持续6 d，累计发病55例，涉及16个班级，罹患率为1.60%。 其中男性34例，女性21例，男女性别比为1.62∶1，年龄为6～37岁，平均年龄9.13岁。 患者症状以呕吐（92.73%）、腹泻（65.45%）为主，无重症死亡病例，病程1～2 d。 危险因素调查显示，高发病班级与无病例班级学生饮食及饮水构成比差异无统计学意义。 本次调查共采集病例标本19份，11份标本GⅡ组诺如病毒阳性，1份标本星状病毒阳性。 采集食品及水样本41份，检测肠道病毒均阴性，细菌学指标亦在正常范围内。结论该起暴发疫情由GⅡ组诺如病毒感染引起，人–人接触或呕吐物形成的气溶胶传播在疫情中起关键作用，首发病例发现、隔离不及时及呕吐物处理消毒不规范是导致疫情扩展蔓延并最终暴发的促发因素。     

2017-2019年新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒分子流行病学特征

目的 了解2017-2019年新疆维吾尔自治区(新疆)乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿诺如病毒的分子流行病学特征.方法 收集2017-2019年乌鲁木齐市5岁以下腹泻住院患儿粪便标本和相应临床资料,应用实时荧光反转录聚合酶链式反应(real time RT-PCR)进行诺如病毒核酸检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序...     

散发性诺如病毒性胃肠炎临床观察及护理

[目的]对散发性诺如病毒性胃肠炎病人的流行病学特征和临床特征进行观察并分析其护理对策。[方法]2007年12月～2008年1月连续抽取以呕吐或腹泻等消化道症状为主诉、发病3d以内的就诊病人100例,从周一开始,每周连续抽取20个满足上述条件的病例。对收集病例进行流行病学调查,同时用逆转录聚合酶链反应（ELISA）方法对便标本进行诺如病毒检测并进行护理指导。[结果]100例病人中56例感染诺如病毒为感染组,44例为未感染组。两组病人临床症状腹痛差异有统计学意义（P〈0．05）;实验室检查两组血常规中性粒细胞的变化差异有统计学意义（P〈0．05）,便常规镜检红细胞、白细胞差异有统计学意义（P〈0．05）,感染诺如病毒病人中有3例（5．35％）诊断急性细菌性痢疾。多数病人给予对症治疗3d恢复,考虑合并细菌感染病人给予抗生素治疗3d～7d恢复。[结论]诺如病毒是冬季散发性急性胃肠炎的主要病原体,病人易合并细菌感染,使用正确的护理指导及对症治疗可痊愈。     

散发性诺如病毒性胃肠炎临床观察及护理

[目的]对散发性诺如病毒性胃肠炎病人的流行病学特征和临床特征进行观察并分析其护理对策.[方法] 2007年12月-2008年1月连续抽取以呕吐或腹泻等消化道症状为主诉、发病3 d以内的就诊病人100例,从周一开始,每周连续抽取20个满足上述条件的病例.对收集病例进行流行病学调查,同时用逆转录聚合酶链反应(ELISA)方法对便标本进行诺如病毒检测并进行护理指导.[结果]100例病人中56例感染诺如病毒为感染组,44例为未感染组.两组病人临床症状腹痛差异有统计学意义(P＜0.05);实验室检查两组血常规中性粒细胞的变化差异有统计学意义(P＜0.05),便常规镜检红细胞、白细胞差异有统计学意义(P＜0.05),感染诺如病毒病人中有3例(5.35%)诊断急性细菌性痢疾.多数病人给予对症治疗3 d恢复,考虑合并细菌感染病人给予抗生素治疗3 d～7 d恢复.[结论]诺如病毒是冬季散发性急性胃肠炎的主要病原体,病人易合并细菌感染,使用正确的护理指导及对症治疗可痊愈.     

2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

目的 了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016-2019年中国诺如病毒分子流行特征.方法 收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,...     

广州市腹泻监测病例诺如病毒分子流行病学特征

目的 了解广州市腹泻监测病例中诺如病毒分子流行病学特征。方法 2014-2015年选取广州市两家医院的门诊科室作为监测哨点,每间哨点医院每周采集5岁以下和5岁及以上腹泻病例粪便样本各3份,将采集的标本送至广州市疾病预防控制中心检测诺如病毒。阳性标本进行基因序列测定并进行同源性分析。通过中国传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统收集2014-2015年广州市报告的诺如病毒感染引起的暴发疫情数据,开展流行病学分析。结果 共收集腹泻标本732份,诺如病毒阳性136份,阳性率为18.58%。各年龄组诺如病毒阳性率不同（2=20.39,P=0.001）,其中5岁以下年龄组最高（24.21%）。基因分型结果显示GⅡ组133份（97.80%）,GⅠ组3份（2.20%）。分别对2014年（4份）及2015年（5份）阳性标本进行测序,结果提示,2014年诺如病毒流行株以GⅡ.4 Sydney_2012变异株（75.00%）为主,2015年以GⅡ.17变异株（55.60%）为主。2014-2015年共报告诺如病毒感染性腹泻暴发疫情23起,其中14（60.80%）起由GⅡ组引起。结论 广州市诺如病毒感染性腹泻流行毒株仍以GⅡ组为主,其中2014年优势毒株为GⅡ.4 Sydney_2012变异株,2015优势毒株为GⅡ.17变异株。     

镇江地区诺如病毒分子流行病学特点及基因型分析

目的分析2015-2016年镇江地区诺如病毒(No V)的分子流行病学特点及基因型分布。方法收集镇江地区腹泻患者粪便标本,逆转录PCR(RT-PCR)检测No V衣壳蛋白基因的表达水平,并对PCR产物行基因测序验证;Mega软件构建系统进化树,并进行序列进化和基因型分析。结果 No V总阳性率为5.30%(85/1 605),GⅠ组检出率为0.87%(14/1 605),GⅡ组检出率为4.55%(73/1 605),其中2份样本同时检出感染GⅠ/GⅡ。GⅡ组在10~20岁组中的阳性率最高(17.80%)。2015年No V的检出率以1月最高,11月、2月次之;2016年以12月最高,3月、4月次之。2015年No V的基因型以新GII.17型变异株为主(63.89%),2016年以GII.4 Sydney_2012株为主(35%)。结论镇江地区的No V以GII组为主,青少年患者阳性率高,主要流行季节为11月至次年4月,主要流行基因型为GII.17型变异株和GII.4 Sydney_2012株。     

2016年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒感染状况及其基因型别特征

目的 调查浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒的感染状况、基因型别及其动态变化趋势。方法 于2016年采集湖州市食源性疾病主动监测哨点医院的急性胃肠炎病例粪便标本。采用特异性引物探针,应用real-time RT-PCR对标本进行诺如病毒核酸检测。同时对阳性标本衣壳蛋白基因片段进行扩增和测序,结合在线分型工具和序列系统进化分析诺如病毒基因型别。结果 501份急性胃肠炎患者粪便标本检出诺如病毒阳性101份,阳性率20.16%,以GⅡ基因组为主（86.14%）;男性检出率为20.75%（50/241）,女性检出率为19.54%（51/260）,差异无统计学意义。不同年龄段病例均检出诺如病毒,5岁儿童检出率最高。诺如病毒感染全年均有发生,但6-9月呈低流行状态。2016年湖州市流行的诺如病毒基因型别多样,包括GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.13、GⅠ.6、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅠ.7共8种基因型别。GⅡ.17和GⅡ.4 Sydney_2012呈月份交替流行。结论 湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因型别多样,且呈交替流行现象,应进一步加强监测各型别诺如病毒在本地的流行范围及型别分布变化情况。     

2000-2013年我国诺如病毒感染性胃肠炎暴发流行病学特征分析

目的 了解我国诺如病毒的流行病学特征及变化趋势,为制定有效的防控措施提供依据。方法 以诺如病毒、诺瓦克样病毒以及暴发、调查为关键词检索,收集整理2000-2013年在CNKI、万方和维普等中文数据库中的文献并进行分析。结果 共收集符合要求的文献52篇,涉及诺如病毒暴发疫情72起,累计报道病例11 778例,平均164例/起,疫情持续时间平均8.57 d。报道疫情数居前3位的省份依次是广东省28起（占38.89%）,浙江省18起（占25.00%）,广西壮族自治区6起（占8.33%）。暴发场所以学校及托幼机构为主,有53起,占73.61%,其中中学25起、小学及幼儿园17起,大学11起;其次是养老/医疗机构10起,占13.89%。传播途径以经水传播为主,有27起,占37.50%,人-人接触传播24起,占33.33%,食源性传播17起,占23.61%。不同场所疫情传播途径差异有统计学意义（2=48.899,P=0.000）。在经水传播的疫情中,由桶装水污染引起的暴发最多,占48.15%。基因组别分布GⅡ24起,占72.73%,GⅠ6起,占18.18%。结论 需加强关注我国诺如病毒感染性胃肠炎暴发,特别是学校和幼托机构等人群聚集的场所。建议加强高危场所管理和水质监测,提高菌株检测鉴定水平。     

2019年浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

目的 了解浙江省学校诺如病毒感染暴发疫情的流行特征,提出当前防控特点.方法 收集2019年1月1日至12月31日浙江省学校发生的诺如病毒胃肠炎暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法.结果 2019年报告173起学校诺如疫情,涉及170所学校,累计3172例病例,波及161711人,总罹患率为1.96％.诺如病毒疫情主要发...     

2019年陕西省西安市一起医院内诺如病毒感染暴发疫情调查

目的调查2019年西安市X大学第一附属医院住院患者腹泻暴发疫情的致病因子或危险因素,提出针对性防控措施和建议。方法开展病例搜索和现场流行病学、卫生学调查,采集病例及相关人员、医院水及环境表面等标本,并通过反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）进行病原学检测。结果调查住院患者、家属陪护、医院职工169人,累计发病22例,总罹患率为13.02%。 病例临床表现以腹泻、腹胀、呕吐等为主。 病区住院患者罹患率明显高于家属陪护（χ2=16.341,P<0.01）;与首发病例共用厕所的住院患者及其家属陪护罹患率明显高于不共用厕所者（χ2 =3.907,P< 0.05）。 尚未发现水源性和食源性可疑危险因素。 20份病例标本和1份病房拖把表面涂抹标本检测结果为诺如病毒GⅡ型核酸阳性。结论该起急性胃肠炎暴发疫情属于医院感染事件,由诺如病毒GⅡ型引起。 传染源为隐性感染者或病毒携带者, 病毒通过病房污染拖把（共同介质）以人–环境–人的模式造成传播, 采取针对性措施后疫情得以控制。     

急性下消化道出血的临床外科诊治分析

目的:探讨下消化道出血的病因及临床外科诊治策略。方法:回顾性分析复旦大学附属中山医院普通外科2012年1月至2017年12月收治的59例下消化道出血患者的临床资料。结果:59例患者经急诊胃肠镜、腹部CT、DSA及急诊剖腹探查等手段,全部明确出血原因及部位,共发现小肠血管畸形19例、小肠间质瘤(GIST)17例、结直肠肿瘤/息肉22例,49例患者行手术治疗。结论:术前采用急诊胃肠镜、腹部CT及DSA检查明确诊断是提高下消化道出血外科治疗效果的关键。     

一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

目的 分析2020年一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒基因特征,为加强学校诺如病毒感染暴发疫情防控提供依据.方法 收集2020年9月2-10日甘肃省某高校一起诺如病毒感染暴发疫情中有呕吐腹泻症状在校人员的232份粪便标本,初步采用实时荧光PCR法进行初筛和基因组鉴定,随后采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如病毒...