2007-2013年上海市HIV-1感染者毒株耐药监测

目的 了解上海市2007-2013年HIV-1感染者的原发耐药基因突变情况,掌握耐药毒株变化趋势。 方法 随机选取2007-2013年随访的常住上海未经抗病毒治疗的HIV-1感染者血浆标本1296例,进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增、DNA测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐药数据库比对分析。 结果 获得1085例pol区基因片段,其中亚型分布显示,CRF01_AE 651例(60.0%),其次为CRF07_BC 253例(23.3%)、B亚型97例(8.9%)、CRF08_BC 52例(4.8%)、C亚型12例(1.1%)、CRF01_B 10例(0.9%)、F2亚型2例(0.2%)、G亚型2例(0.2%)、CRF02_AG 5例(0.5%)和CRF03_AB 1例(0.2%)。原发耐药率平均为1.4%,其中核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)耐药相关突变率为0.3%(3/1085),非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药相关突变率为0.9%(9/1085),整合酶抑制剂(IN)耐药相关突变率为0.2%(2/1085)。同时发生对蛋白酶抑制剂(PIs)和NNRTIs的耐药相关突变1例。 结论 2007-2013年上海市HIV-1感染者中存在原发耐药基因变异,耐药率呈下降趋势,从2007年的4.5%下降到2013年的1.1%。耐药基因型以CRF01_AE为主,男男同性传播为主,极少数HIV感染者同时存在对2种主要治疗药物耐药,应加强CRF01_AE耐药毒株的动态监测和研究,尤其是在男男性接触人群中的变化趋势。     

我国237例未接受抗病毒治疗的HIV/AIDS患者中原发性基因型耐药监测和病毒亚型分析

目的 分析237例HIV/AIDS患者中原发性耐药的发生率和病毒亚型分布情况.方法 从河南、云南、上海等20个地区采集237例未经抗病毒治疗的HIV/AIDS患者血浆HIV-1进行基因测序,通过病毒亚型分析软件REGA HIV-1 Subtyping Tool确定测序样本的HIV-1亚型,并与斯坦福大学HIV耐药数据库比对确定测序样本HIV-1耐药相关突变位点.采用b-DNA方法检测患者血浆病毒载量,采用流式细胞仪检测CD4+ T淋巴细胞计数.结果 237例未接受抗病毒治疗的HIV/AIDS患者感染的HIV-1毒株分布为A1、B、C、CRF01-AE、CRF02-AG、CRY7-BC、CRF08-BC、CRF12-BF、G等9个不同亚型,可能的感染时间分布在1990-2006年.237例患者中仅有3例分别对核苷类逆转录酶抑制剂高度耐药、蛋白酶类抑制剂低度耐药和非核苷类逆转录酶抑制剂高度耐药,原发性耐药的发生率为1.3%(3/237).结论我国部分地区未经抗病毒治疗的HIV/AIDS患者中HIV-1原发性基因型耐药的发生比例处于较低水平,病毒亚型分布在9个亚型.     

上海市卢湾区人免疫缺陷病毒-1型分子流行病学和耐药监测

目的:了解上海市卢湾区2010年确认的未经抗病毒治疗HIV-1感染者亚型分布和原发性耐药的流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法:随机选取确认HIV-l感染者血浆标本77份,运用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,进行DNA测序及系统进化树分析,同时与国际HIV耐药数据库比对,并结合流行病学资料进行分析。结果:获得45份pol区基因片段,其中亚型分布显示,CRF01_AE亚型占68.9%(31/45),CRF07_BC亚型占22.2%(10/45)、B亚型占6.7%(3/45)和C亚型为2.2%(1/45)。CRF01_AE亚型以性传播途径为主,其中男男同性接触(MSM)和异性性传播分别占为66.7%(20/30)和33.3%(10/30),在异性性传播、MSM和注射毒品中均存在CRF07_BC;B亚型均为MSM人群,C亚型为异性性接触者。本研究共发现3例耐药者,包括同时发生对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的原发耐药、只对NNRTIs的原发耐药和对整合酶抑制剂(INIs)的原发耐药各1例。测得的耐药突变位点为L74IL、V179D及V179E、E92Q和L74M。结论:上海市卢湾区2010年新确认HIV-1感染者中以CRF01_AE和CRF07_BC为主,在耐药监测中发现NRTIs、NNRTIs和INIs耐药突变株;加强对HIV-1分子流行病学和耐药的监测具有公共卫生意义。     

未接受蛋白酶抑制剂治疗者的HIV-1基因的多态性及蛋白酶抑制剂耐药相关性变异

目的:研究未接受蛋白酶抑制剂(PIs)治疗的人类获得性免疫缺陷病毒1(HIV-1)感染者HIV-1多态性以及PIs耐药相关性变异的分布情况.方法:取自中国4个省市(上海、安徽、河南和云南)81例未接受PIs治疗的HIV-1感染者中分离的病毒株,经反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HIV-1病毒的pol基因,并进行测序及进化分析.结果:HIV-1病毒株基因最多的为B'亚型(82.7%),其他分别为CRF01-AE亚型(11%)、CRF07_BC或CRF08_BC亚型(3.7%)、CRF02-AG亚型(1.2%)以及B亚型(1.2%).B'亚型主要存在于有偿助血员以及经输血感染的患者中.R41K、K70Q/R/E和L89M变异在非B亚型中比在B'和B亚型中更为常见.次要PIs耐药相关性变异I15M/V、K20M/R/I、M361和H69K在非B亚型中比在B和B'亚型中更为常见.相对于非B亚型,次要PIs耐药相关性变异I62V、L63P、A71V/T、V77I和193L则在B和B'亚型中更为常见.在3例(3.7%)感染B亚型的患者中发现了主要PIs耐药相关性变异M46I.结论:在未接受PIs治疗的患者中,HIV-1病毒基因多态性及次要PIs耐药相关性变异的出现率较高.而主要PIs耐药相关性变异的流行率则较低.     

江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统分析

目的:了解江苏省HIV-1流行株env和pol基因亚型及其系统.方法:收集42份血清抗-HIV阳性者的血浆标本并提取RNA,逆转录为模版DNA后采用巢式 PCR法扩增env及 pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,比对确定基因亚型,分析不同途径感染者的基因亚型,构建系统进化树.结果:42份标本中,扩增出env及pol基因片段27份(64%);共发现5种 HIV-1亚型,其中 CRF01-AE亚型 19份、C亚型 2份、B亚型3份、CRF08-BC 2份、G亚型1份.经静脉药瘾感染者基因型多为CRF01-AE亚型;经性接触感染者HIV-1基因亚型包括检出的全部亚型,经性接触及吸毒感染者基因亚型均为CRF01-AE亚型.两基因构建系统进化树高度一致,主要有CRF-01AE、B-07、G、C和CRF-08BC 5种HIV亚型在流行,而以CRF-01AE为主要流行株.结论:江苏省 HIV-1基因亚型至少有5种,其中 CRF01-AE为主要亚型.     

2011年浙江省台州地区新发现HIV-1感染者分子流行病学调查

目的 了解2011年浙江省台州地区新发现艾滋病病毒（HIV）感染者的基本情况以及不同HIV-1基因亚型的分布情况。方法 选取台州市2011年新发现未经抗病毒治疗的HIV感染者抗凝全血标本140份,提取血浆中的病毒RNA,通过RT-PCR扩增HIV-1 pol 区的蛋白酶基因全序列与反转录酶基因部分序列,使用HIV-Blast软件判定亚型。结果 2011年台州地区新发现的未经抗病毒治疗的HIV感染者男女性别比为3.24:1,感染者中92.86%为性传播感染,3.57%为注射毒品感染;共检测出5种HIV-1基因亚型,分别为CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B和C亚型。性传播感染人群中57.14%为CRF01_AE亚型,注射毒品人群中以CRF07_BC亚型为主。结论 台州地区艾滋病患者以性传播途径感染为主,HIV-1基因亚型呈多样性特点,CRF01_AE亚型流行于性传播感染人群,而CRF07_BC亚型流行于毒品注射感染人群。     

浙江省绍兴市46例男男性行为者HIV感染基因特征分析及流行病相关因素分析

目的 了解浙江省绍兴市男男性行为者(MSM)人群中HIV-1感染者的亚型类型和特征 。方法 分析2013年1月至2014年7月本地区新确证未经抗病毒治疗的50例MSM感染者样本,采用RT-PCR和nest-PCR方法扩增HIV-1的gag和pol全长基因区,成功扩增46份样品,构建系统进化树分析基因亚型。结果 46份样品中发现CRF01_AE、CRF07_BC和B三种亚型和1株AE、BC重组亚型,各占52.17%、39.13%、6.52%和2.17%。结论 绍兴市 HIV-1感染的MSM人群中主要流行的亚型为CRF01_AE和CRF07_BC,该人群感染率高,应加强监测。     

云南省德宏和昆明地区高效抗逆转录病毒治疗后HIV-1流行毒株pol区基因变异分析

目的 调查云南省德宏和昆明两个地区HIV-1流行毒株pol区基因在接受HAART后的变异情况.方法 选择接受HAART 1年以上血浆HIV-1病毒载量＞1 000拷贝/ml的139例HIV/AIDS患者,提取血浆中HIV-1 RNA,采用RT-nested-PCR扩增HIV-1的pol区基因蛋白酶(PR)和逆转录酶(RT)基因片段,测定DNA序列.经拼接整理后与美国斯坦福大学网站提供的HIV耐药数据库(Stanford HIV Drug Resistance Database)进行比对,分析耐药突变位点,采用MEGA 4.1构建系统进化树以确定HIV的亚型,结合HIV/AIDS患者流行病学资料进行综合分析.结果 昆明地区患者HIV以T215F/NY/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变较多,突变率分别为39%(24/62)、27%(17/62)和27%(17/62),高于德宏地区患者HIV的相应突变率[分别为16%(11/69)、13%(9/69)和9%(6/69)],差异有统计学意义(x2值分别为8.646、4.242和7.909,P均＜0.05).德宏地区HIV-1流行毒株pol区基因亚型主要为CRF01_AE亚型为32%(22/69)、C亚型为25%(17/69)、B亚型19%(13/69).而昆明地区主要是08_BC亚型60%(37/62)、CRF01_AE亚型21%(13/62)和07_BC亚型15%(9/62).结论 云南省德宏、昆明两地区HIV-1流行毒株pol区基因PR、RT基因突变频率存在部分差异,昆明地区T215F/N/Y/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变率高于德宏地区.两地共检出HIV-1流行毒株pol区基因CRF01_AE、B、C、BC、08_BC和07_BC共6种基因亚型.

Abstract：

Objective To investigate the variations in the pol region of HIV-1 strain in treatment failed patients in Yunnan province's Dehong prefecture and Kunming. Methods Blood samples were collected from 139 patients who experienced treatment failure ( HAART treatment ＞ 1 years and HIV-1 RNA Viral load ＞ 1 000 copies/ml). HIV-1 RNA was extracted from plasma, and nested-PCR was performed for amplification of PR and RT genes on the HIV-1 pol region. The PCR products were then sequenced and submitted to Stanford HIV Drug Resistance Database for comparison. The evolution tree was built up with MEGA 4. 1 system, combined with patients' demographics. Results The most prevalent mutation in Kunming patients were T215F/N/Y/I, M41L/M, and T69G/N/I/S/A/D, the mutation rates were 39%(24/62), 27% (17/62) and 27% (17/62) , respectively, which were higher than the corresponding mutations in the Dehong prefecture [16% ( 11/69), 13% (9/69) and 9% (6/69)]. The rate differences were statistically significant ( x2 = 8.646, 4.242 and 7. 909, all P ＜ 0.05 ). The most common HIV-1 pol region subtype in the Dehong patients were CRF01_AE subtype (32%, 22/69), followed by C subtype (25% ,17/69), and B subtype ( 19%, 13/69). Major subtypes in Kunming patients were 08_BC (60%,37/62 ), CRF01_AE subtype(21% , 13/62 ) and 07_BC ( 15% ,9/62). Conclusions Partial differences of the point mutations of the HIV-1 strain pol region and frequency of their occurrences exist among Dehong and Kunming patients, HIV-1 strains in Dehong prefecture for the NNRTIs mutations at the T215 Y/N/T, M41L and T69G/N/I/S/A/D are significantly higher than those in Kunming. Six isoforms are found respectively:CRF01_AE, B, C, BC, 08_BC and 07_BC from the epidemic strains of HIV-1 pol region subtype in Dehong and Kunming areas.     

云南省2006年HIV-1流行毒株的基因测定

目的为了研究在中国云南流行的艾滋病毒Ⅰ型（HIV-1）流行毒株的亚型类型与变异特征，进行分子流行病学研究，为艾滋病预防控制工作提供参考。方法血浆来源于云南省监测系统中的19例HIV-1感染者。采用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）法，从19例患者血清中扩增HIV-1pol—gag共同拥有区片段并直接进行序列测定，所得序列用BioEdit和Mega软件进行亚型及系统发生树分析。结果19例标本结果显示，12例为CRF08-BC、3例为CRF07-BC、1例为B型、3例为CRF01-AE型。19例毒株间的基因离散率都比较小，CRF08-BC亚型毒株间的基因离散率为2．45％，CRF07-BC亚型毒株间的基因离散率为2．16％；B亚型毒株为5．00%；CRF0-1AE亚型毒株与来自泰国的流行CRF01-AE毒株AB032741、U51189的基因离散率分别为3．12％、3．22％。结论上述结果表明，云南地区CRF—BC重组亚型已成为HIV-1流行病学优势亚型，结果基本上反映了我国HIV-1分子流行病学现状。     

上海市常住人口HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变横断面研究

目的:采用分层整群随机抽样原则,对本市95例已确诊的人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)感染者进行基因亚型和耐药性突变研究,以了解上海市HIV-1基因亚型及耐药性HIV-1的流行情况。方法:应用巢式RT-PCR扩增HIV-1聚合酶基因,经DNA测序后进行进化系统树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点,结合流行病学资料进行分析。结果:①在95例本市HIV感染者中经RT-PCR扩增并获得基因亚型序列70例,基因分型以CRF01_AE重组体30例(42.9%)为主,其余分别为B亚型6例(8.6%)、B’亚型10(4.3%)、G亚型2例(2.9%)、K亚型1例(1.4%)、CRF02_AG3例(4.3%)、CRF07_BC8例(11.4%)和CRF08_BC7例(10.0%),亚型间或重组体间二重重组体(CRF02_AG/CRF01_AE、B/CRF01_AE、K/G)3例(4.3%);②耐药分析结果表明,本组人群的蛋白酶抑制剂(PIs)原发耐药突变率为4.3%。在抗病毒治疗的HIV感染者15例中,11例(73.3%)发生反转录酶抑制剂(RTIs)耐药基因突变,其中核苷和非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变率分别为10例和11例(66.7%和73.3%),远高于未治疗者。结论:本研究分析了上海市HIV-1基因亚型和耐药突变的流行与变迁情况,对HIV-1遗传变异多样性和耐药监测体系的建立及上海市的艾滋病预防和控制工作有重要指导意义。     

HIV-1新型重组毒株近似全长基因组结构鉴定分析

目的 对3条人类免疫缺陷病毒(HIV)-1亚型不确定的近似全长基因组序列(NFLG)进行基因镶嵌结构分析。方法 用近末端稀释法、系统发育树和基因重组断点分析等方法对3例男男同性恋(MSM)HIV-1感染病例进行HIV-1 NFLG扩增、基因亚型分析和基因重组图谱分析。结果 Neighbor-joining进化树分析结果显示,3条HIV-1序列均为单独分支,可能是新型重组毒株。jpHMM在线软件和SimPlot v3.5.1软件综合分析结果显示,NFLG 110和NFLG 171分别为CRF07＿BC和CRF01＿AE,NFLG 150为CRF01＿AE和CRF07＿BC二代重组毒株。基因重组断点分析结果显示,NFLG 150的重组模式是以CRF07＿BC全长基因组为骨架,在gag区和env区分别插入了1个长度约为60和80 bp的CRF01＿AE基因片段。结论 在MSM人群中发现1株HIV-1 CRF01＿AE/CRF07＿BC二代重组毒株,建议持续监测相关性传播,特别是MSM人群HIV-1新型基因重组毒株。     

北京市一例HIV-1 CRFl5_01B亚型类似毒株的鉴定

目的 通过对一例HIV-1毒株env、gag和pol基因的序列分析,表明HIV-1 CRF15_01B亚型类似毒株已在北京市出现.方法 从一例在北京居住的四川籍女性HIV-l感染者(BJ06108,通过性途径感染)血浆中提取病毒RNA,使用套式PCR方法扩增env、gag和pol基因,并进行序列测定和亚型分析.结果 病例BJ06108在env、gag和pol基因区与CRF15_01B亚型参考株1501B.TH.99.99TH_MU2079基因离散率较近,基因离散率分别为8.8%、6.1%和7.2%.系统进化树分析表明BJ06108与CRF15_01B亚型参考株1501B.TH.99.99TH_MU2079聚在一起.结论 CRF15_01B亚型类似毒株已在北京市出现,应该加强HIV-1毒株亚型变异的监测.     

沈阳市新诊断HIV感染者整合酶抑制剂原发耐药分析

目的明确沈阳市新诊断的HIV-1感染者整合酶抑制剂(integrase inhibitors, InIs)耐药株的传播情况。方法回顾性收集2018年6月至2019年3月沈阳市新诊断的HIV感染者80例,扩增血浆病毒RNA的整合酶编码基因,系统进化分析病毒基因型,以Stanford HIV耐药数据库解读耐药基因突变,计算原发耐药率并分析不同亚型毒株耐药相关自然多态性。结果 80例HIV-1感染者中共检出CRF01_AE感染者51例,占63.8%;CRF07_BC感染者14例,占17.5%,B亚型感染者6例,占7.5%;其他不典型重组9例,占11.3%。2例CRF01_AE感染者检出R263K突变,1例B亚型感染者检出E138A突变,总体耐药率为3.8%。CRF01_AE感染者在整合酶耐药相关位点50、74、119、153位氨基酸具有多态性,频率分别为5.9%、2.0%、13.7%和4.0%;而CRF07_BC感染者在整合酶耐药相关位点50、74、157位上氨基酸具有多态性,频率均为7.1%。结论沈阳市新诊断HIV感染者InIs原发耐药率较低,但部分感染者在HIV整合酶耐药相关位点具有氨基酸多态性。需要加强HIV整合酶耐药监测及对我国常见HIV流行株的耐药基因型和表型研究,更好地解读HIV整合酶耐药突变的意义。     

2017-2019年广西钦州市部分新报告HIV/AIDS感染者病毒亚型及细胞嗜性研究

目的 了解2017-2019年广西壮族自治区(广西)钦州市新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病患者(AIDS)中病毒基因亚型、耐药及细胞嗜性情况.方法 选取2017-2019年钦州市部分新报告HIV/AIDS,检测CD4+T淋巴细胞数量,并对HIV的pol、env基因区进行扩增、测序,构建系统进化树判定基因亚...     

2011年～2020年大连市无偿献血人群HIV-1分子流行病学分析

目的 探究2011～2020年大连地区无偿献血人群的HIV-1基因型分布和变化趋势,为临床用血安全、艾滋病防治提供基础数据。方法 提取大连市2011～2020年确认HIV感染的无偿献血者标本HIV RNA,并对其pol片段进行扩增、测序,分析标本HIV-1基因型和系统进化关系。结果 共完成174份HIV感染标本的基因型分析。大连无偿献血人群HIV-1的流行基因型包括CRF01＿AE(69.5%)、CRF07＿BC(17.2%)、B(5.2%)、CRF02＿AG(2.9%)、C(1.1%)、 CRF55＿01B(1.1%)、CRF08＿BC(0.6%)、 CRF59＿01B(0.6%)、CRF79＿0107(0.6%),以及2例未确定基因型(1.1%)。各基因型分布与全国数据有显著区别;在此10年间,CRF01＿AE占比整体呈现波动下降趋势,而CRF07＿BC占比明显上升。CRF02＿AG感染人群与本地主要基因型相比,女性感染者更多(占比分别为40.0%、2.4%),年龄偏大(中位数分别为35岁、26岁),并且教育水平更低(主要为初中及以下学历)。96.7%的本地CRF01＿AE型标本,...     

沈阳市新诊断HIV感染者整合酶抑制剂原发耐药研究

目的 明确沈阳市新诊断的HIV-1感染者整合酶抑制剂（Integrase inhibitors, InIs）耐药株的传播情况。方法 回顾性收集2018年6月至2019年3月沈阳市新诊断的HIV感染者80例，扩增血浆病毒RNA的整合酶编码基因，系统进化分析病毒基因型，以Stanford HIV耐药数据库解读耐药基因突变，计算原发耐药率并分析不同亚型毒株耐药相关自然多态性。结果 80例HIV-1感染者中共检出CRF01_AE感染者51例，占63.8%；CRF07_BC感染者14例，占17.5%，B亚型感染者6例，占7.5%；其他不典型重组9例，占11.3%。2例CRF01_AE感染者检出R263K突变，1例B亚型感染者检出E138A突变，耐药率3.8%。CRF01_AE感染者在整合酶耐药相关位点 50、74、119、153位氨基酸具有多态性，频率分别为5.9%、2.0%、13.7%和4.0%；而CRF07_BC感染者在在整合酶耐药相关位点50、74、157位上氨基酸具有多态性，频率均为7.1%。结论 沈阳市新诊断HIV感染者InIs原发耐药率较低，但少数感染者在整合酶耐药相关位点具有氨基酸多态性。需要加强整合酶耐药监测，并加强对我国常见HIV流行株的耐药基因型及表型研究，更好地解读耐药突变的意义。     

陕西省新发现艾滋病感染者HIV耐药警戒线调查研究

目的分析新发现且尚未治疗的艾滋病病毒(HIV)感染人群的耐药基因序列,了解陕西省HIV耐药毒株的传播情况和流行特点。方法根据世界卫生组织推荐的艾滋病病毒耐药警戒线调查方法(HIVDR-TS),对47例16~25岁新确证HIV感染者的阳性血清,用In-house方法测定pol基因区部分序列,采用在线CPR软件判断是否存在传播性耐药基因突变,并提交至美国斯坦福大学HIV在线耐药数据库中进行耐药程度分析,使用MEGA5.0软件构建进化树,分析亚型。结果 47份样本中没有发现传播性耐药基因突变,但有14份样本发现有与耐药相关的基因突变位点,包括蛋白酶区的T69N,E138A和V179D/E突变位点,反转录酶区的A71T/V和L10I/V突变位点;其中在CRF01_B亚型的一份样本中出现了K103R位点,其与V179E存在协同作用,导致对依非韦伦(EFV)和奈韦拉平(NVP)等药物的中度耐药。其余13份样本中发现的突变位点或可引起部分药物的低度潜在耐药,没有实际临床意义。基于pol区基因型分型,共有四种亚型,其中以CRF01_AE为主(26/47),其次为CRF07_BC(17/47)。结论陕西省HIV耐药株流行率5%,属于低度流行水平,个体治疗前尚不需要进行耐药性检测,同时还需定期进行耐药警戒线调查研究。     

2014－2018年浙江省江山市中老年HIV/AIDS的HIV-1亚型和分子簇特征研究

目的了解浙江省江山市中老年人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者（HIV/AIDS）的HIV亚型分布情况和分子传播簇特征,为该市HIV流行趋势分析和疫情防控提供技术支持。方法对江山市2014 — 2018年新诊断的中老年HIV/AIDS开展分子流行病学研究,从94例感染者（含3例暗娼）血浆中提取RNA,通过反转录–聚合酶链式反应和巢式PCR扩增pol区基因并进行核酸测序,运用MEGA 6.0软件构建Neighbor-Joining系统进化树分析亚型,利用Cytoscape 3.6.0软件对遗传距离≤0.01的序列构建HIV分子簇。结果HIV毒株序列成功获得率为86.2%（81/94）,毒株亚型以CRF01_AE为主（93.8%,76/81）,其余分别为CRF07_BC型3例（3.7%）和B亚型2例（2.5%）;共发现3个分子传播簇,均由CRF01_AE亚型构成,总成簇比例为84.0%（68/81）,大簇包含64例病例（含1例阳性暗娼）,2个小簇均由2例病例组成。结论江山市中老年HIV/AIDS亚型以CRF01_AE为主且种类较为单一,存在与阳性暗娼紧密关联的传播簇,应加强对簇内病例的流行病学调查,以便实施有针对性的公共卫生干预。     

广州市孕产妇人群HIV-1亚型分布和耐药特征分析

目的 了解广州市孕产妇人群艾滋病病毒1型（HIV-1）亚型和耐药情况。 方法 收集广州市2009 — 2014年孕产妇人群HIV-1抗体阳性样本,扩增蛋白酶（PR）和反转录酶（RT）基因序列,测序后构建系统进化树确定亚型,并与斯坦福大学HIV耐药数据库比对进行耐药分析。 结果 成功获得178份基因片段,其中10份为外籍病例;中国籍病例以CRF01_AE ［42.86%（72/168）］ 和CRF07_BC ［31.55%（53/168）］为主,外籍病例以C和CRF01_AE为主,各占30.00%（3/10）。 中、外籍病例的亚型分布差异有统计学意义（P＜0.001）。 样本总体耐药突变率为12.36%（22/178）,低度以上耐药率为5.62%（10/178）,蛋白酶抑制剂（PIs）、核苷酸反转录酶抑制剂（NRTIs）和非核苷酸反转录酶抑制剂（NNRTIs）耐药率分别为2.81%（5/178）、1.12%（2/178）和2.25%（4/178）。 耐药突变率最高的亚型为C亚型［50.00%（3/6）］。 5例外籍病例携带耐药突变,其中3例为耐药病例。 3.37%（6/178）样本被预测对单类药物呈高度耐药,未发现对多类药物呈高度耐药的样本。 结论 广州市HIV感染的孕产妇人群中有12种病毒亚型,以CRF01_AE和CRF07_BC为主,耐药突变率及耐药率低,但存在PIs或NRTIs或NNRTIs的高度耐药毒株且外籍病例具有较高耐药突变率和耐药率。      

云南省2006年HIV-1流行毒株的基因测定

目的 为了研究在中国云南流行的艾滋病毒I型(HIV=1)流行毒株的亚型类型与变异特征,进行分子流行病学研究,为艾滋病预防控制工作提供参考.方法 血浆来源于云南省监测系统中的19例HIV-1感染者.采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法,从19例患者血清中扩增HIV-1pol-gag共同拥有区片段并直接进行序列测定,所得序列用BioEdit和Mega软件进行亚型及系统发生树分析.结果 19例标本结果显示,12例为CRF08-BC、3例为CRF07-BC、1例为B型、3例为CRF01-AE型.19例毒株间的基因离散率都比较小,CRF08-BC亚型毒株间的基因离散率为2.45%,CRF07-BE亚型毒株间的基因离散率为2.16%;B亚型毒株为5.00%;CRF01-AE亚型毒株与来自泰国的流行CRF01-AE毒株AB032741、U51189的基因离散率分别为3.12%、3.22%.结论 上述结果表明,云南地区CRF-BC重组亚型已成为HIV-1流行病学优势亚型,结果基本上反映了我国HIV-1分子流行病学现状.