HLA-DRB1高分辨测序分型与48例非亲缘性脐血移植者GVHD相关性分析

1998年6月至2003年7月，广州脐血库向国内21家移植中心提供非亲缘异基因脐血移植54例。本研究采用PCR产物直接测序法对HLA—DRB1进行高分辨分型（PCR—sequencing based typingPCR—SBT），并结合HLA—SSP低分辨分型结果，探讨非亲缘性脐血移植供／受者HLA—DRB1等位基因及其亚型与脐血移植GVHD发生率的关系。利用盐析或柱提法提取48例非亲缘性脐血及移植患者全血DNA，采用HLA—SBT方法分别对HLA—DRB1等位基因进行高分辨分型，并与HLA—SSP（HLA—sequencing specific primers）低分辨结果进行比较分析。结果表明：采用双盲法对48例非亲缘性脐血移植供／受者样本HLA—DRB1进行高分辨分型，结果HLA—DRB1等位基因亚型匹配全相合病例的GVHD发生率（25％）显著低于不完全相合病例的GVHD发生率（65．6％）（P=0．008）。结论：对HLA—DRB1采用高分辨分型方法在非亲缘性脐血移植HLA分型方面具有重要的临床应用价值。     

等位基因频率在鉴别模棱两可HLA基因型中的应用价值分析

本研究探讨采用等位基因频率直接鉴别模棱两可HLA基因型的应用价值。应用聚合酶链式反应（PCR）-测序分型方法（SBT）对658名汉族供者HLA-A、B、DRB1基因进行测序分型，并分别采用PCR-序列特异性引物法（SSP）和杂合性歧义引物分离法（HAPRs）对其中的模棱两可标本进行精确分型，进而利用等位基因频率计算真基因型的相对概率并与真实结果进行比对。结果表明：222个HLA-A，238个HLA-B和107个HLA-DRB1基因的模棱两可标本中，真基因型的相对概率高于95％的比例分别为99．5％（221／222）、95．8％（228／238）和97．7％（104／107）；与PCR—SSP和HAPRs分型结果相比，3个基因座的吻合率分别为100％（222／222）、99．6％（237／238）和99．1％（106／107），仅有B％3501／5501和DRB1＊1201／1504不同，其相对概率值分别为40．3％和2．1％。结论：在大规模供者HLA基因的PCR—SBT分型中，应用等位基因频率直接鉴别模棱两可基因型的方法不仅具有较高的准确率和可信度，而且更加经济、简便、快捷，但在移植前供、患者HLA基因的确认试验中必须慎重应用。     

中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA基因分型中模棱两可结果解决方案的探讨

目的 探讨中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA基因分型中模棱两可结果的解决方案。方法 采用聚合酶链式反应(PCR)-测序分型技术(SBT)对20621名中华骨髓库供者的HLA-A、B、DRB1基因进行高分辨分型，并对其中的模棱两可分型结果进行精确分型。根据精确分型后的HLA等位基因频率计算模棱两可结果中真基因型的相...     

山东鲁西地区汉族人群HLA—A、B、DRB1座位高分辨等位基因多态性分析

目的了解山东鲁西地区汉族人群HLA—A、B、DRB1座位高分辩水平的基因多态性特点。方法采用PCR—SBT对647例山东鲁西地区汉族造血干细胞志愿捐献者进行HLA—A、B、DRB1座位高分辨分型,直接计数法计算各等位基因频率。结果本研究共检出HLA—A、B、DRB1等位基因139种,其中,常见基因为HLA—A＊02：01（0．097372）、A＊11：01（0．165379）、A＊24：02（0．156105）;HLA—B＊13：02（0．084235）、B＊51：01（0．072643）、B＊40：01（0．065688）;HLA—DRB1＊15：01（0．139104）、DRB1＊07：01（0．138331）、DRB1＊09：01（0．125966）。结论山东鲁西地区汉族人群HLA—A、B、DRB1座位高分辨水平等位基因表现为高度多态性特点,常见基因的种类和频率分布与中国北方汉族近似,与中国南方汉族存在明显差异。     

HLA PCR-SSP及SBT高分辨方法定型结果的对比研究

目的在HLA等位基因的高分辨鉴定中,对应用顺序特异性引物PCR扩增(PCR-SSP)和以测序为基础的分型技术(SBT)而出现模棱两可结果的标本进行分析,寻找出现模棱两可鉴定结果的主要原因,确保HLA高分辨配型的精确度。方法对78例UCLA(美国加利福尼亚大学洛杉矶分校)质控标本采用PCR-SSP和SBT方法进行HLA-A、B、DR位点高分辨定型,与UCLA结果相比较。结果采用PCR-SSP方法,有16例标本出现模棱两可定型结果,分布比例分别为HLA-A 7．7％,HLA-B 9．0％,HLA-DRB1 6．4％;采用SBT方法,有23例标本出现模棱两可定型结果,分布比例分别为HLA-A 7．6％,HLA-B 12．8％,HLA-DRB1 19．2％。结论HLA等位基因分型若使用单一技术,包括PCR-SSP及SBT方法,均会有相当比例的结果是模棱两可、不能确定的;若配合使用,则能大大提高定型能力和定型结果的精确度。     

HLA测序技术在非亲缘性脐血移植应用价值探讨

1998年6月至2004年7月，广州脐血库向国内21家移植中心54例患者提供了非亲缘性异基因脐血。为了探讨非亲缘性脐血移植供／受者HLA等位基因及其亚型与脐血移植GVHD发生率的关系，对54例非亲缘性脐血移植病例中，半年后有反馈随访资料的48例，利用盐析或柱提法提取移植的非亲缘性脐血的DNA及移植病例的全血DNA，采用HLA—SBT方法分别对HLA—A、B、DRB1位点进行了高分辨分型，并与我库脐血收集常规采用的HLA—SSP（HLA—Sequencing specific primers）低分辨结果进行了比较分析。结果发现，HLA不合位点不多于2个和HLA不合位点不少于3个的病例GVHD的发生率具有统计学显著性差异（P〈0．05）。在对HLA—A、B、DRB1等位基因高分辨单因素分型结果中，HLA—B和HLA-DRB1等位基因匹配全相合的病例GVHD发生率显著低于不完全相合病例GVHD的发生率（P=0．000，P=0．005）。结论：PCR—SBT技术在非亲缘性脐血移植HLA配型方面具有重要的临床应用价值。     

应用反向斑点杂交技术进行脐血HLA-DRB基因分型方法的建立

HLA分子的多态性对于移植有十分重要的意义。常用的HLA基因分型方法中SSOP基因分型方法有较高分辨率，但操作过程复杂，仅适于大样本的HLA分型。PCR－SSP基因分型方法分辨率较低，但操作过程简单，适于临床要求。有必要建立一种简便、快速、价廉、高分辨率的基因分型方法。本研究取63份已知HLA－DRB型的脐血标本，经盐酸胍方法提取DNA用于反向斑点杂交（RDB）基因分型，同时采用SSOP和PCR－SSP方法进行比较。结果表明，所有样本用RDB方法基因分型均获得成功，可准确地分辨60个HLA－DRB等位基因，且结果与用SSOP和PCR－SSP方法的结果完全一致。结论提示，RDB方法可准确地分辨HLA－DRB等位基因，分辨率高，操作简单，适用于各种情况的HLA分型。     

中国汉族人群HLA-B*40组的多态性研究

为了研究中国汉族人群HLA—B^*40等位基因的分布特点，探讨其可能对临床供者选择的影响，从中华骨髓库深圳分库中随机抽取381名志愿供者，用PCR—SSO方法进行HLA—B基因分型；另从已分型的1270例供者中选出低分辨率结果为B^*40纯合子的样本。所有B^*40阳性标本采用PCR—SBT及PCR—SSP方法进行高分辨率分型。结果表明：随机抽取的381例样本通过Hardy—Weinberg平衡检验，HLA—B^*40的基因频率为0．1692。在实验中仅检测到B^*4001，B^*4002，B^*4003，B^*4006，其血清学特异性分属B60，B61。各等位基因相对频率B^*4001为0．1192，B^*4002为0．0154，B^*4003为0．0038．B^*4006为0．0308。B^*40纯合子在高分辨水平上检测，其等位基因表现出一定的规律性，低分辨结果为B^*40XX(B^*4001组)，一，高分辨都是B^*4001；低分辨为B^*40XX(B^*4002组)．一，高分辨则为B^*4002或B^*4006或二者杂合子。结论：中国汉族人群B^*40基因家族中B^*4001占绝对优势。为了选择最适供者，建议临床配型中使用高分辨率基因分型。     

311份脐血样本HLA基因型无法判读原因探讨

本研究探讨影响脐血样本HLA分型结果的因素。采用序列特异性引物PCR反应（sequence—specific priming,SSP）对3II份经过PCR—SS0和PCR—SSP方法仍无法判读HLA型别的脐血进行HLA低分辨重新分型,并对其中7份仍然无法确定HLA型别的脐血样本进行直接测序（sequence—based typing,SBT）,分析无法判读的原因。结果显示：311份脐血样本中99．4％样本不能判定是因为当时HLA分型方法本身的限制性所造成的,0．6％样本不能判定的原因怀疑是脐血中存在母血污染所致。结论：HLA基因分型方法中序列特异性寡核苷酸探针杂交法（sequence—specifi coligonucleotide probe hybridization,SSO）探针设计不足及PCR—SSP等位基因特异性引物的缺乏是影响HLA分型结果无法判读的主要因素。     

PCR-SBT技术在山东骨髓分库HLA高分辨分型工作中的初步应用

目的将基于测序分型(SBT)技术应用于中华骨髓库山东分库建设的探讨。方法使用ABI 3730 xlDNA测序仪,采用SBT直接测序法,对山东地区的3 500份志愿者血液标本进行DNA测序,其中HLAⅠ类基因对第2、3和4外显子双向测序,Ⅱ类基因对第2外显子双向测序,以得到其HLA高分辨分型结果;对部分呈现中分辨分型结果的标本,通过SSSP技术确认。结果 HLA-A、B、DRB1位点分别有48.23%、42.86%和76.91%得到高分辨结果。此3个位点均获得高分结果的比例为15.91%。在随机增选的760例中分辨标本中,659例(86.71%)经SSSP技术后,获得高分辨结果。结论 SBT技术是骨髓分库开展HLA高分辨分型工作的有力工具。     

HLA高分辨分型模棱两可组合研究和问题解决的进展

人类白细胞抗原(HLA)是迄今所知人类最复杂的免疫遗传多态性系统,准确的HLA分型对于临床造血干细胞移植、HLA与疾病相关性等研究有着重要的意义。聚合酶链反应-直接测序分型法(PCR-SBT)因达到高分辨水平和能鉴定新等位基因而被广泛应用,但PCR-SBT法的一个大问题是该法在分型判断时存在较高比例的模棱两可组合的结果,对HLA分型数据的精确判断带来了很大程度的困扰。本文对HLA高分辨基因分型模棱两可组合存在的原因和问题解决方法的研究进展进行了综述,并对研究前景作了简单的展望。     

中国人群HLA-DRB1＊1454等位基因和HLA-DRB1第3外显子鉴定意义

目的:在中国人群中鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB11454等位基因,分析供受者HLA-DRB1第3外显子DNA序列信息对器官移植、细胞移植及人类遗传学研究的重要现实意义.方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型方法对58例等待造血干细胞移植供受者进行人类白细胞抗原测序分型,1 268例广东地区随机健康供者采用聚合酶链式反应-序列特异寡核苷酸探针反向杂交法进行HLA-DRB1中高分辨基因分型,部分模棱两可结果采用聚合酶链式反应-序列特异引物PCR-SSPHLA-DRB14高分辨方法分型法.结果:在1 268例广东地区随机健康人群中检出HLA-DRB11403,1406,1410,1412,1418,1425和1454等位基因,HLA-DRB1401/1434/1454等位基因模棱两可结果的8例样本被确认为HLA-DRB11454等位基因,DRB11454等位基因可能是广东人群最为常见的HLA-DRB114 基因. 中国人群HLA-DRB114第3外显子存在多态性.结论:中国人群HLA-DRB11454等位基因确认了DRB1等位基因第3外显子多态性的存在,进一步明确了开展中国汉族人群及少数民族HLA-DRB1第3外显子检测的意义.     

HLA-Cw位点低分辨基因分型"纯合子"的等位基因特性研究

目的 研究HLA-Cw位点低分辨基因分型"纯合子"的等位基因特性,为临床移植配型提供精确资料.方法 在43例血缘关系造血干细胞移植(HSCT)供受者中,对中国最常见的低分辨基因分型Cw*03和Cw*07的"纯合子"个体采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)高分辨基因分型方法 进行等位基因定型,并采用自主研制的三维结构匹配软件系统(HLA StrucMark version1.0)对其等位基因产物进行三维结构匹配,以预测不同分辨率分型结果 对移植物抗宿主病(GVHD)发生的影响.结果 低分辨基因分型Cw*03、Cw*07"纯合子"个体的高分辨基因分型结果 显示Cw*03及Cw*07的纯合子分别为14%和43%,其余均为Cw*03及Cw*07杂合子个体.可见其低分辨基因分型易造成供受者问等位基因的错配;在有家系校正的情况下,标本的低分辨模糊结果 可以通过家系遗传分析来校正定型;在无家系校正的情况下,应通过高分辨基因分型来确定等位基因,三维结构差异分析则显示这些错配有可能造成HSCT后GVHD的发生.结论 当低分辨基因分型结果 只出现Cw位点"纯合子"时,有家系的标本应当以家系分型结果 校正定型,无家系校正的标本应当用高分辨基因分型方法 进行核实,从而为临床移植提供准确的配型报告,以防止无关供-受者HSCT后因等位基因错配而引起的严重GVHD.     

PCR-SSO流式荧光微珠法HLA-A*02高分辨分型检测模棱两可结果的统计分析

背景:由于HLA的复杂多态性,实际分型过程中难免会出现一些结果判读模棱两可现象.目的:统计分析基于PCR-SSO 流式荧光微珠HLA-A*02高分辨分型方法的模棱两可组合结果种类、比例,探讨解决模棱两可解决方法,提高高分辨分型比例.方法:对河南骨髓库捐献者 1 100人份HLA分型结果进行统计分析,计数法进行分类统计分析软件给出的包含HLA-A*02:01\02:09模棱两可组合代码,计算百分比;与确认为A*02:09的基因多态性分布进行比对,找出与A*02:09关联性较强的等位基因,用补充实验进行复核、确认,建立A*02:01\02:09模棱两可组合的判读方法.结果与结论:1 039例有效数据中包含A*02:01\02:09模棱两可组合279例(279/1 039,26.853%),代码种类19种,检出比例较高的有DMDC,DYVK,GMDD,GMDE;34例确认为A*0209的基因多态性统计显示A*0209的出现与A*11:01 (0.147 1)B*07:02(0.264 7)、DRB1*01:01(0.264 7 )、DRB1*03:01(0.117 6)有较强关联,选出高风险标本38例,经检测外显子1~7,并用SBT复核确认有1例结果为A*02:09(代码组合为GMDC),其余241例未检出A*02:09.提示 A*02:09的出现与B*07:02、DRB1*01:01、DRB1*03:01有较强关联,重点对这些关联标本进行外显子1~7检测,可有效地检出A*02:09.通过统计分析制定合理的判定规则和必要的复核实验可有效地简化操作程序,节省时间,降低费用,提高高分辨比例.     

HLA-Cw基因常规检测区外第1、5、6、7外显子核苷酸序列测定的研究及临床应用

目的 研究中国人群HLA-Cw基因第1、5、6、7外显子的分子遗传多态性,探讨增加第1、5 6 7外显子核苷酸序列测定在临床组织配型工作中的重要性及意义.方法 应用PCR-SBT法,对324份样本的HLA-Cw基因第2、3、4外显子作常规测序分型.对检出的模棱两可结果,设计HLACw第1、5 6 7外显子序列测序引物并优化测序反应条件,增加第1、5、6、7外显子核苷酸序列分析.结果 对HLA-Cw基冈第2、3、4外显子常规检测,一次性获得等位基因前4位数分型结果 的样本占23.8%(77/324);出现模棱两可结果的样本数占76.2%(247/324),检出的模棱两可等位基因组合有73种;增加HLA-Cw基因的第1、5、6、7外显子多态性检测,可解决Cw* 030201/030202、030301/0320N、Cw* 040101/0409N/0430、Cw* 070201/0750、Cw* 0403/0409N/0430和Cw* 080101/0822等10种常见的模棱两可等位基因组合.结论 在临床HLA-Cw基因配型中增加第1、5、6、7外显子多态性检测,有助于解决测序分型中的模棱两可的结果 和提高HLA-Cw基因分型精确度,对临床组织配型工作具有重要意义.     

HLA-Cw基因常规检测区外第1、5、6、7外显子核苷酸序列测定的研究及临床应用

目的 研究中国人群HLA-Cw基因第1、5、6、7外显子的分子遗传多态性,探讨增加第1、5 6 7外显子核苷酸序列测定在临床组织配型工作中的重要性及意义.方法 应用PCR-SBT法,对324份样本的HLA-Cw基因第2、3、4外显子作常规测序分型.对检出的模棱两可结果,设计HLACw第1、5 6 7外显子序列测序引物并优化测序反应条件,增加第1、5、6、7外显子核苷酸序列分析.结果 对HLA-Cw基冈第2、3、4外显子常规检测,一次性获得等位基因前4位数分型结果 的样本占23.8%(77/324);出现模棱两可结果的样本数占76.2%(247/324),检出的模棱两可等位基因组合有73种;增加HLA-Cw基因的第1、5、6、7外显子多态性检测,可解决Cw* 030201/030202、030301/0320N、Cw* 040101/0409N/0430、Cw* 070201/0750、Cw* 0403/0409N/0430和Cw* 080101/0822等10种常见的模棱两可等位基因组合.结论 在临床HLA-Cw基因配型中增加第1、5、6、7外显子多态性检测,有助于解决测序分型中的模棱两可的结果 和提高HLA-Cw基因分型精确度,对临床组织配型工作具有重要意义.     

HLA-Cw基因常规检测区外第1、5、6、7外显子核苷酸序列测定的研究及临床应用

目的 研究中国人群HLA-Cw基因第1、5、6、7外显子的分子遗传多态性,探讨增加第1、5 6 7外显子核苷酸序列测定在临床组织配型工作中的重要性及意义.方法 应用PCR-SBT法,对324份样本的HLA-Cw基因第2、3、4外显子作常规测序分型.对检出的模棱两可结果,设计HLACw第1、5 6 7外显子序列测序引物并优化测序反应条件,增加第1、5、6、7外显子核苷酸序列分析.结果 对HLA-Cw基冈第2、3、4外显子常规检测,一次性获得等位基因前4位数分型结果 的样本占23.8%(77/324);出现模棱两可结果的样本数占76.2%(247/324),检出的模棱两可等位基因组合有73种;增加HLA-Cw基因的第1、5、6、7外显子多态性检测,可解决Cw* 030201/030202、030301/0320N、Cw* 040101/0409N/0430、Cw* 070201/0750、Cw* 0403/0409N/0430和Cw* 080101/0822等10种常见的模棱两可等位基因组合.结论 在临床HLA-Cw基因配型中增加第1、5、6、7外显子多态性检测,有助于解决测序分型中的模棱两可的结果 和提高HLA-Cw基因分型精确度,对临床组织配型工作具有重要意义.     

应用PCR—SSP进行HLA—AB基因分型及与血清学方法的比较

目的 建立HLAⅠ类基因分型技术并应用于骨髓七配型。方法 采用序列特异性聚合酶链反应（PCR－SSP）进行HLA－AB基因分型，并与HLAⅠ类血清学分型（微量淋巴细胞毒试验）进行比较。结果 运用PCR－SSP技术共对22例需骨髓移植的病人和48例供者进行基因分型，2例病人确认了HLA 新缘骨髓供者，其中1 已成功进行了骨髓移植；基因分型和血清分型比较，43例结果完全一致（61.4%），血清分型错误率高达38.6%(27/70)。结论 PCR－SSP分型技术具有准确性高，简便快速等优点，将取代传统的血清学方法。