快速PCR方法在金银花真伪鉴别中的应用

建立简单快速的金银花真伪分子鉴别方法。该研究依据金银花trn L-trn F 625位G/T SNP位点设计快速位点特异性PCR引物,优化位点特异性PCR条件,对金银花及其9种混淆品进行扩增及检测。当在87℃预变性1 min;87℃变性5s,68℃延伸5 s,30个循环时,通过加入SYBR Green I染料染色,金银花样品显绿色荧光,混淆品无荧光。整个PCR反应可在30 min内完成。该研究结果说明快速位点特异性PCR能简单快速鉴别金银花及其混淆品。     

快速PCR方法在蛇类药材真伪鉴别中的应用

为优化获得一种准确、快速、高效鉴别药典所载蛇类药材(乌梢蛇,金钱白花蛇,蕲蛇)真伪品的方法。该研究以蛇类药材经典PCR鉴定方法为基础,采用碱裂解法提取基因组总DNA,加入特异性PCR引物,采用两步法进行PCR扩增,从而对蛇类药材及其混淆品进行鉴别。通过对影响PCR反应时间的退火温度、变性温度、退火时间、变性时间、循环次数等因素进行优化,并对不同型号PCR仪和Taq酶进行考察,分别获得乌梢蛇、金钱白花蛇、蕲蛇快速PCR反应程序。在PCR产物中加入SYBR Green I染料,正品显示出明亮绿色荧光,而混淆品不显示荧光。所建立的蛇类药材快速PCR真伪检测方法可在30~45 min完成,为蛇类药材现场快速鉴定提供技术支持。     

基于快速PCR方法的人参属药用植物鉴别研究北大核心CSCD

目的:建立一种准确、快速、高效鉴别人参属药用植物的分子鉴别方法。方法:采集不同产地的人参、西洋参及同属近缘种植物,所有样品进行总DNA的提取并使用mat K片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计西洋参特异性鉴别引物,人参以文献报道的特异鉴别引物为基础,分别采用两步法进行PCR扩增,从而对人参、西洋参及同属近缘种进行鉴别。结果:通过对影响PCR反应时间的退火温度、变性温度、退火时间、变性时间、循环次数等因素进行优化,并对不同型号PCR仪进行考察,分别获得人参、西洋参快速PCR反应程序。在PCR产物中加入SYBR GreenⅠ染料,正品显示出明亮绿色荧光,而近缘种不显示荧光。结论:快速PCR方法可以简单快速鉴别人参、西洋参,为实现药材分子鉴别的现场运用提供技术支撑。     

快速PCR方法在哈蟆油真伪鉴别中的应用研究

该研究依据哈蟆油Cyt b基因155位SNP位点设计位点特异性PCR引物,采用碱裂解法提取基因组DNA,2步循环PCR程序进行PCR反应,并对PCR反应条件进行优化,从而建立起一种哈蟆油及其4种常见混伪品的快速PCR鉴别方法。该方法在90℃变性3 s,62℃退火延伸20 s进行32个循环时,加入2μL 100×SYBR GreenⅠ染料,正品显示出明亮绿色荧光,而混淆品不显示荧光。该方法准确、简便,40 min内即可完成鉴别,为哈蟆油药材现场快速鉴定提供技术支持。     

木通与川木通及关木通的快速PCR鉴别

目的:建立一种准确、快速、高效鉴别木通、川木通及关木通的分子鉴别方法。方法:采集不同产地的木通、川木通及关木通基原植物,所有样品进行总DNA的提取,通过对木通、川木通及关木通样品trn L-trn F片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异性鉴别引物,采用2步法进行PCR扩增,从而对木通、川木通及关木通进行鉴别。结果:通过对影响PCR反应时间的退火温度、变性温度、退火时间、变性时间、循环次数等因素进行优化,并对不同型号PCR仪进行考察,分别获得木通、川木通及关木通快速PCR反应程序。在PCR产物中加入SYBR Green I染料,正品显示出明亮绿色荧光,而混淆品不显示荧光。结论:快速PCR方法可以简单快速鉴别木通、川木通及关木通,为实现药材分子鉴别的现场运用提供技术支撑。     

菟丝子、莱菔子与其易混淆品的快速PCR法鉴别研究

完善快速PCR鉴定检测体系,并建立菟丝子或莱菔子的分子鉴别方法。收集不同地区的菟丝子、莱菔子及其易混淆品材料,所有样品进行总DNA的提取,通过对菟丝子、莱菔子及其易混淆样品ITS片段进行扩增、测序,进行同源比对后根据其变异位点设计特异性鉴别引物,采用2步法进行PCR扩增,从而对菟丝子或莱菔子进行鉴别。通过对影响PCR退火温度、变性温度、退火时间、变性时间、循环次数等因素进行优化,并对不同型号PCR仪进行考察,分别获得菟丝子、莱菔子快速PCR反应程序。在稀释后的PCR产物中加入SYBR GreenⅠ染料,正品显示出明亮绿色荧光,而混淆品不显示荧光,且可有效的避免因引物二聚体而存在的假阳性问题。快速PCR方法可以简单快速鉴别菟丝子、莱菔子,为实现药材分子鉴别的现场运用提供技术支撑。     

蛤蚧及其伪品的粘度鉴别

本文用蛋白粘度法对蛤蚧及其伪品壁虎、多疣壁虎、红瘰疣螈、西藏沙蜥进行了鉴别研究。结果表明,蛤蚧及其伪品的蛋白粘度均值有极显著性差异(P<0.01),为蛤蚧的真伪鉴别增加了一项理化质控指标。     

荧光定量PCR法鉴别蛤蚧定喘丸中醋鳖甲

目的 建立蛤蚧定喘丸中醋鳖甲的DNA分子鉴定方法。方法 根据鳖、佛罗里达鳖线粒体基因序列的差异设计特异性引物TS和AF,进行荧光定量PCR和方法学考察,然后对市售蛤蚧定喘丸中醋鳖甲进行鉴定。结果 含有鳖、佛罗里达鳖的DNA样品仅与相应引物扩增后可检测到荧光信号,有特定温度单一峰,T_m分别为77.45、79.72℃。该方法的检测限为10 copies/μL,重复性较高(CV<1%)。10批蛤蚧定喘丸中有9批仅检出鳖DNA,被鉴定为正品;1批同时检出鳖DNA和佛罗里达鳖DNA,被鉴定为掺伪品。结论 本研究所建立的方法可快速、可靠地鉴定蛤蚧定喘丸中醋鳖甲炮制品成分,有助于监管含醋鳖甲成方制剂的质量,并为成方制剂中动物药成分的专属性鉴定研究提供新途径。     

快速PCR方法在山药真伪鉴别中的应用

目的:采用快速聚合酶链式反应(PCR)方法建立快速、准确、有效的山药药材真伪分子鉴定方法。方法:收集不同地区山药正品及其混伪品材料,对所有样品进行总DNA的提取,通过对山药及其混淆品DNA条形码rbc L片段进行同源对比分析,根据鉴别位点,设计中药山药的鉴别引物,引物序列为Sy89:5'-AAGGACGATGCTACCACATCGACAC-3',Sy90:5'-ATCCCAATAGGGGACGGCCA-3'。采用2步法进行PCR扩增,并对PCR反应体系和反应程序影响因素进行考察,从而对山药进行真伪鉴别。结果:通过对影响PCR退火温度、退火时间、变性时间、循环次数等因素进行反应程序的优化,并对不同Mix进行考查,获得了山药快速特异性PCR反应程序。PCR扩增反应液为50μL,包括Premix TaqTM25μL,上、下游引物各1.5μL,DNA模板1.5μL,加无菌双蒸水至50μL。PCR扩增程序为98℃预变性1 min,98℃变性10 s,68℃复性15 s,30个循环,72℃后延伸30 s。以1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物在250 bp附近处有一清晰条带,而混淆品无条带。结论:快速特异性PCR方法可以简单快速鉴别山药的真伪,为实现中药材分子鉴别的现场运用提供技术支撑。     

蛤蚧的真伪鉴别

蚧为壁虎科动物蛤蚧Gekko gecko(Linnaeus)除去内脏的干燥全体。主产于广西、广东、云南等地,其具有补肾温肺、壮阳益精血、止喘咳之功效。常用于治疗虚劳喘咳、气喘、咯血、消渴、肺结核、神经衰弱、老人脚冷膝软、阳痿早泄、小便频繁、心脏性气喘、肾虚喘促等症。近年来,广西     

高特异性PCR方法鉴别乌梢蛇及其混淆品

 目的建立一种简便、准确的乌梢蛇药材DNA分子标记鉴别方法。方法根据乌梢蛇及10种常见混淆品线粒体12SrRNA基因序列,设计一对专用于乌梢蛇的鉴别引物HWL-1和HWH-1,用不同的复性温度PCR扩增,确立特异性反应条件,并利用此方法鉴别从市场上购买的各种乌梢蛇药材。结果PCR结果是在65℃复性温度下,正品乌梢蛇得到约320 bp的扩增带,而混淆品在同样的条件下无扩增带。为检验该方法的准确性,对市售乌梢蛇炮制品随机选取13块进行PCR鉴别验证,其中正品9块,混淆品4块,检出率达100%。结论所设计的鉴别引物对正品乌梢蛇有高度的特异性。PCR方法稳定性高,同种不同个体间的种内差异对鉴定结果无影响。本方法简单、准确、快速、灵敏度高、重现性好。     

羚羊角塞特异性PCR鉴别方法研究

目的:为解决中药羚羊角塞与羚羊角相比因失去"通天眼"等传统鉴别特征而鉴别困难的问题,建立准确鉴别鉴定羚羊角塞的方法。方法:通过比对羚羊角塞基原动物赛加羚羊与其7种常见混伪品的细胞色素C氧化酶亚基I(Cytochrome coxidase I,COI)序列,根据差异位点设计出仅扩增赛加羚羊DNA的特异性鉴别引物。结果:进行PCR时,当退火温度为64℃,循环数为33个时,仅羚羊角塞正品扩增获得约300 bp大小的条带,混伪品无条带。结论:该方法可作为准确有效检测待检样品是否来源于赛加羚羊的方法,用于羚羊角类样品的DNA鉴别。     

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??OBJECTIVE To design specific identification primers based on ribosomal DNA ITS sequences and accurate identification of Dendrobium huoshanensis and its adultments.METHODS Phylogenetic tree of D. huoshanense and D. officinale and D. henanense by maximum parsimony (MP) and Bayesian inference (BI) were constructed. Specific primers SH-CP9s/SH-CP9a, SH-CP25s/SH-CP25a, SH-CP29s/SH-CP29a for PCR identification of D. huoshanensis based on mutation sites on ITS sequences were designed.RESULTS In the phylogenetic tree, D. huoshanense and D. officinale and D. henanense were clustered into monophyletic group. The specific PCR reaction procedure of D. huoshanense was obtained by investigating the annealing temperature and the amount of DNA template, and different types of PCR and Taq enzymes. In the PCR product, D. huoshanense appearance of the band, and adultments with no band.CONCLUSION The ITS sequences can be used as DNA Barcoding identification of D. huoshanensis, and identify D. huoshanense and its adultments by the designed primers.     

基于ITS2序列及二级结构对连钱草与其地方习用品及易混品的鉴别研究

目的 利用ITS2(Internal Transcribed Spacer 2)序列及其二级结构对传统中药连钱草与其地方习用品及易混品进行分类鉴定.方法 提取连钱草药材基原植物活血丹基因组DNA,扩增ITS序列并测序;同时从GenBank数据库中下载活血丹等共8个物种42条ITS序列,基于隐马尔可夫模型注释到ITS2序...     

应用ITS2序列鉴定垂盆草及其混伪品△

目的：通过对药食同源植物垂盆草及其混伪品进行分子鉴定,以保证该植物的临床药效及食用安全。方法：通过对样品DNA进行PCR扩增,获得ITS2基因片段,纯化后的PCR产物进行双向测序,运用CodonCode Aligner进行序列的拼接、MEGA5.0软件进行序列分析并构建K2P模型的NJ树。结果：垂盆草与其混淆品ITS2序列间存在明显变异,种内遗传距离小于种间遗传距离,从NJ树中可以明显看出不同来源垂盆草聚为一支,与混伪品可以很好地区分。结论：ITS2序列可有效地鉴别药用植物垂盆草及其混淆品,对中药鉴定具有潜在的应用价值。     

应用ITS2序列鉴定垂盆草及其混伪品

目的：通过对药食同源植物垂盆草及其混伪品进行分子鉴定,以保证该植物的临床药效及食用安全。方法：通过对样品DNA进行PCR扩增,获得ITS2基因片段,纯化后的PCR产物进行双向测序,运用CodonCode Aligner进行序列的拼接、MEGA5．0软件进行序列分析并构建K2P模型的NJ树。结果：垂盆草与其混淆品ITS2序列间存在明显变异,种内遗传距离小于种间遗传距离,从NJ树中可以明显看出不同来源垂盆草聚为一支,与混伪品可以很好地区分。结论：ITS2序列可有效地鉴别药用植物垂盆草及其混淆品,对中药鉴定具有潜在的应用价值。     

虻虫的PCR-RFLP鉴别研究

目的:建立简单、准确的虻虫DNA分子标记鉴别方法。方法:扩增并分析虻虫及7种常见伪品的细胞色素C氧化酶I亚基基因(CO I)序列,根据差异片段设计聚合酶链反应-限制性内切酶酶切长度多态性(PCR-RFLP)引物,使用限制性内切酶进行酶切鉴别。结果:引物对Meng Chong-Dig.F/Meng Chong-Dig.R可扩增虻虫及其伪品CO I序列,产生约490 bp条带,限制性内切酶Dra I可以识别虻虫及其伪品的差异序列,仅虻虫的CO I片段可被酶切形成两个片段,从而特异性鉴别是否为虻虫。结论:本实验建立的PCR-RFLP可以作为虻虫的DNA鉴定方法。     

高良姜及其混淆品的分子鉴定

目的:探讨基于ITS2条形码序列鉴定高良姜及其混淆品的新方法.方法:本研究对高良姜及其混淆品6个物种9份样品的ITS2序列进行PCR扩增和测序,同时扩大研究范围从GenBank上下载同属共15个物种37个样本.用MEGA4.1计算其种间、种内的K2P距离,并分析各样本间ITS2序列二级结构的差异,最后利用ITS2序列重构其系统发育树.结果:高良姜基源植物种内最大K2P距离为0.0171,与混伪品的种间最小K2P距离为0.0469;高良姜及其混淆品的ITS2二级结构存在明显差异;重构的系统发育树显示高良姜的不同来源聚在一支,能较好与混淆品区分.结论:ITS2序列能够成功鉴定高良姜及其易混淆品,可以作为高良姜及其混淆品的分子鉴定工具.     

鳖甲及其混伪品的DNA分子鉴定

目的:探讨快速、准确鉴定鳖甲及其混伪品的方法.方法:本文对中华鳖及其混伪品的COI序列用MEGA 4.0等软件进行遗传距离等分析,并构建中华鳖及其混伪品的NJ树.结果:中华鳖种内COI序列变异很小,种间存在较多的变异位点,种间的遗传距离显著大于种内的遗传距离.由所构建的系统聚类树图可以看出,同属聚在一起,且各物种又形成相对独立的支.结论:基于COI序列的DNA条形码技术可以很好地鉴定鳖甲及其混伪品.     

应用等位基因特异聚核酶链式反应鉴别半夏类药材

 目的建立能区分半夏正、伪品的分子鉴定方法。方法下载GenBank中半夏属、犁头尖属及天南星属相关序列,利用DNAMAN进行比对分析,根据ITS序列中半夏的SNP位点设计引物PtITS178F和PtITS555R,采用等位基因特异PCR进行扩增。结果对半夏5个产地的新鲜样品、10个产地的药材以及5批虎掌、水半夏样品进行PCR检测。引物PtITS178F和PtITS555R只对半夏类药材扩增395 bp片段,虎掌和水半夏均无扩增条带。结论等位基因特异PCR能准确检测半夏的SNP位点,达到准确鉴别半夏正伪品的目的,是一种有前途的中药材分子鉴定方法。