阿尔茨海默病患者皮质额叶基因表达谱研究

目的：通过研究阿尔茨海默病(Alzheimerdisease，AD)患者皮质额叶中发生差异表达的基因，揭示AD发生、发展的分子基础。方法：利用基因芯片分析3例AD患者皮质额叶中基因表达谱，通过与4例正常对照间的比对，寻找存在表达差异的基因。结果：所检测的5000个基因中，共有49个基因存在着差异表达。在患者中13个基因表达水平升高，36个基因表达水平降低。上述基因与多种生理过程，如氧化应激、胆固醇平衡、钙信号转导、炎症反应等密切相关。结论：AD的发生、发展涉及多种基因表达水平和多个生理过程的改变。     

延边地区膝骨性关节炎患者滑膜组织基因谱的表达

背景：原发性骨性关节炎的发展是多种相关基因表达失常的缘故。采用mRNA基因表达谱芯片技术,检测膝关节骨性关节炎滑膜差异表达基因,有助于阐明骨性关节炎病理过程的相关机制。目的：比较延边地区膝关节骨性关节炎和正常关节滑膜的基因表达谱变化,筛选出与膝关节骨性关节炎相关的差异表达基因,并探讨其在骨性关节炎发病机制中的意义。方法：选择延边地区原发性膝关节骨性关节炎患者9例及正常对照者3例,应用mRNA基因表达谱芯片技术检测所获得的滑膜组织中表达差异的基因,筛选出表达差异基因并对其进行GO分析。结果与结论：膝关节骨性关节炎及正常对照者滑膜的差异表达基因分析结果显示,延边地区膝关节骨关节炎滑膜中的差异表达基因共有1261个,其中上调的基因有451个,下调的基因有810个。差异表达基因GO统计分析显示,信号转导、翻译调节、趋化作用、炎症应答、细胞增殖等多种基因的表达有差异。基因芯片技术能有效地筛选出骨性关节炎差异表达的基因,并进一步证实了骨性关节炎的病理过程是多种功能基因参与的复杂的病理过程。     

膀胱移行细胞癌细胞周期相关基因的筛选

[目的]探讨人膀胱移行细胞癌细胞周期相关基因的表达变化口[方法]使用人肿瘤基因表达谱芯片检测11例膀胱移行细胞癌组织基因表达谱的变化，以寻找与细胞周期相关的差异表达基因。[结果]以正常膀胱黏膜组织为对照，11例膀胱肿瘤组织中有87个基因表达明显下调，102个基因表达明显上调。其中与细胞周期相关的差异表达基因有10个，其中明显上调基因7个，明显下调基因3个。[结论]膀胱肿瘤的发生与发展与多种细胞周期相关基因的异常表达有关。     

散发性阿尔茨海默病患者脑内sorLA水平与淀粉样斑块数量的关系

目的:研究散发性阿尔茨海默病(AD)患者脑内sorLA蛋白表达水平,并探讨其与脑内淀粉样斑块数量的关系.方法:随机选择15例尸检明确诊断的散发性AD患者(AD组)和15例非AD患者(对照组),采用Western-blot测定2组颞叶皮质组织中sorLA蛋白表达水平,并分析AD组脑内sorLA水平与淀粉样斑块数量的关系.结果:2组性别、年龄、死后尸检时间等匹配.AD组颞叶皮质内sorLA蛋白表达水平较对照组下降达63%(P<0.05),线性回归分析显示AD组脑内sorLA水平与淀粉样斑块数量明显呈反比.结论:散发性AD患者脑内sorLA蛋白表达显著下降,且其表达量与淀粉样β蛋白(Aβ)的沉积量直接相关,提示sorLA可能涉及散发性AD的发病机制.     

PET脑皮质分区法在AD诊断中的应用

目的：采用PET脑皮质分区法，在目视法基础上，结合脑皮质/小脑计数比值半定量分析对AD进行研究。方法：研究对象分为4组：正常对照组、轻、中、重度AD各15例。全部受检者行PET脑静态显像，经计算机处理获得横断面影像。在横断面影像上将脑皮质进行分区，即上额叶、中额叶、下额叶、上颞叶、中颞叶、下颞叶、上顶叶和下顶叶，双侧脑皮质共16个脑区。应用目视法观察各脑区的横断层影像，并将脑皮质各区放射性计数与小脑放射性计数相除，获得各脑区/小脑计数比值。结果：15例正常人可见大脑皮质各区放射性摄取呈双侧对称性均匀分布，并计算出了正常人各脑区计数比值。45例AD均可见脑内有放射性减低区。AD病人大脑皮质放射性减低区的范围随痴呆程度加重而扩大。轻度AD脑代谢比值仅在下顶叶和中颞叶与正常对照组有显著性差异；中度AD则扩大到上、下顶叶，上额叶和上、中颞叶；重度AD则整个脑区都有显著性差异。结论：脑皮质分区法对AD诊断较传统脑叶法更为精确，尤其对AD早期诊断更有意义。     

弥漫型胃癌基因表达谱聚类分析

目的:从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生、发展的机制。方法:收集22例弥漫型胃癌患者的胃癌组织及其相应远切端的正常胃黏膜。采用含14592个点的cDNA表达谱芯片建立胃癌基因表达谱。差异表达基因筛选标准为该基因在50%以上样本中肿瘤比正常组织荧光强度大2倍或以上(P<0.05)。采用系统聚类、方差分析(P<0.05)等方法进行差异表达分析,实时定量RT-PCR方法验证芯片结果。结果:胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个;表达下调者204个。上调基因的功能主要与细胞骨架运动、基质重建和细胞黏附、细胞周期调控及信号传导相关;下调基因主要与消化功能、细胞免疫防御、代谢、凋亡抑制及电子传递相关。实时定量PCR验证结果与芯片结果一致。结论:运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位理解弥漫型胃癌发病机制及生物学特性,也有助于发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标。     

hGPR 87基因表达与宫颈癌发生及浸润转移的关系

目的:通过检测宫颈癌及宫颈上皮内瘤变(CIN)患者宫颈组织hGPR 87基因表达水平来分析基因表达与宫颈癌发生及浸润转移的关系.方法:采用SYBR Green I实时定量PCR方法分别检测30例宫颈癌、30例重度宫颈上皮内肿瘤(HCIN)、30例轻度宫颈上皮内肿瘤(LCIN)患者和15例正常对照(子宫肌瘤)新鲜宫颈组织的hGPR 87基因表达情况,以β2微球蛋白基因(β2M)作为内参,根据相对定量公式(2-△(α)×100%)计算hGPR 87基因相对表达量.结果:宫颈癌患者组的表达量最高,HCIN组次之,正常对照组的表达量最低,四组比较差异有统计学意义(P=0.02).宫颈癌患者中有淋巴结转移的比无淋巴结转移的宫颈组织中hGPR 87的mRNA含量要高(P=0.002).结论:本研究揭示了不同宫颈疾病发展阶段hGPR 87基因表达的变化特点,hGPR 87基因表达水平在宫颈癌及伴淋巴结转移患者以升高为主,可能与宫颈癌发生及浸润转移有一定关系.     

基因芯片研究卵巢癌细胞系HO-8910差异基因表达

目的用基因芯片技术研究人卵巢癌细胞系HO-8910和正常卵巢上皮的基因表达谱,分析其基因表达变化,探讨卵巢癌发生、发展过程中与肿瘤相关的基因群及其功能,有助于从分子水平全面了解细胞癌变机理,为卵巢癌的临床诊断和治疗提供分子标记和靶基因.方法用一步法抽提人卵巢癌细胞和对照正常卵巢组织的总RNA并纯化mRNA;将等量的人卵巢癌细胞及对照组织的mRNA逆转录合成以Cy5和Cy3标记的cDNA链做探针,混合后在含有4096条双点人类全长基因的芯片上进行杂交.经洗片后用ScanArray 3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,用ImaGene 3.0软件对扫描图像进行数字化处理,分析高低转移人卵巢癌细胞系之间及与正常卵巢上皮基因表达谱差异.结果人卵巢癌细胞系HO-8910细胞与正常卵巢上皮比较,差异3倍以上共有355个基因,其中表达上调＞3倍有88个,表达下调＜0.33有267个.差异6倍以上共有75个基因,其中表达上调＞6倍有13个,表达下调＜0.17有62个.结论通过基因谱平行比较表明:人卵巢癌细胞系与正常卵巢上皮细胞基因表达谱存在差异:人卵巢癌细胞系HO-8910细胞与正常卵巢上皮比较差异3倍以上共有355个基因.提示这些基因与卵巢癌的发生和发展有关.本实验说明利用基因芯片对基因表达谱的检测可以为人体卵巢癌的基因诊断、治疗和预防提供新的方向.     

低压缺氧对大鼠脑皮质基因表达谱及其TAC1和MT1A变化的影响

目的:研究低压缺氧对大鼠脑皮质基因表达谱及其TAC1和MT1A变化的影响.方法:将24只Wistar大鼠随机分为对照组、3000m缺氧组和7000m缺氧组,每组8只.采用低压缺氧舱建立急性高原缺氧模型,应用基因芯片检测缺氧24h大鼠脑皮质差异表达基因,应用qRT-PCR定量检测TAC1和MT1A基因表达水平.结果:3000m缺氧组共有已知差异表达基因215个,其中29个上调,186个下调.上调基因主要有TAC1、Rgs9、Serpinb6a、Adora2a、Penk1,下调基因主要有Siah1a、Acvr1、Btbd1、Cir、Abi1,差异表达最明显的基因是TAC1.7000m缺氧组共有已知差异表达基因205个,其中21个上调,184个下调.上调基因主要有MT1A、Cml3、Wfdc1、Tfpi、Vwf,下调基因主要有Zfp238、Atad1、Leprotl1、Tpm4、Fxr1,差异表达最明显的基因是MT1A.两组差异表达基因中共表达基因有120个,其中7个上调,113个下调.上调基因主要有TAC1、Serpinb6a、Ephx1、Cml3、Olr606,下调基因主要有Acvr1、Btbd1、Leprotl1、Unc119、Canx.qRT-PCR实验证实低压缺氧脑皮质TAC1和MT1A上调.结论:低压缺氧程度不同,脑皮质基因表达谱亦不同.TAC1对缺氧较为敏感,轻、重度高原缺氧表达均上调;MT1A对缺氧反应较为迟钝,轻度缺氧下MT1A基因表达水平不变甚至下降,而重度缺氧时MT1A基因显著上调.     

结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤的基因表达谱分析

目的:应用寡聚核苷酸基因表达谱芯片研究鼻型NK/T细胞淋巴瘤基因表达谱的变化.方法:应用包括人类全基因组47 000个转录本的Affymetrix U133plus 2.0 Array基因表达谱芯片,检测3例鼻型NK/T细胞淋巴瘤组织,3例正常鼻黏膜组织的基因表达谱,并对差异基因进行基因功能和路径分析.结果:基因芯片筛选出大量差异表达的基因,显著上调的基因数有912个,下调的基因数有1 174个,一些参与重要细胞功能的基因路径中的多种基因呈现明显的差异表达,包括细胞因子-细胞因子相互作用、自然杀伤细胞介导细胞毒作用、Jak-STAT信号转达通路等.结论:鼻型NK/T细胞淋巴瘤基因表达谱与正常对照组织间存在明显差异,一些基因及其涉及的基因路径的表达失调可能与疾病发病机制相关.