蝙蝠相关的冠状病毒

2019年12月,新型冠状病毒肺炎（COVID-19）暴发,继2003年严重急性呼吸综合征（SARS）暴发后又给人类敲响了一记警钟。研究者通过溯源分析,发现COVID-19病原体严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的自然宿主可能是中华菊头蝠。21世纪以来,全球共出现4次冠状病毒[严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）、猪急性腹泻综合征冠状病毒（SADS-CoV）、SARS-CoV-2]的暴发,给人类健康、公共卫生、经济发展及社会稳定造成了巨大的威胁与损失。大量证据表明,这4种冠状病毒的自然宿主可能均为蝙蝠。本文对蝙蝠相关冠状病毒的种类、全球地理分布及引起暴发的蝙蝠相关冠状病毒作一综述。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2与新型冠状病毒肺炎

目前正在暴发流行的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的病原体是严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）,这是近年来继严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERSCoV）之后发现的能够感染人的第7种冠状病毒。SARS-CoV-2系单股正链RNA病毒,传染性强,人群普遍对其缺乏免疫力,疫情目前仍在持续。2020年1月30日（当地时间）,WHO将此次疫情列为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。本文就SARS-CoV-2病原学、致病性及COVID-19的检测诊断、预防控制和临床治疗等领域的进展进行讨论。     

核酸检测持续阳性且病程>45 d新型冠状病毒肺炎1例报告

<正>2019新型冠状病毒性肺炎（corona virus disease 2019,COVID-19）是2019年人类发现的一种新型疾病[1],引起COVID-19的病毒为严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acuter espiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2）,目前人类对SARS-CoV-2的生物特性还未完全了解,包括针对此病毒的疫苗、特效药和COVID-19的病程最长时     

北京地区传播的严重急性呼吸综合征冠状病毒S区基因变异分析

严重急性呼吸综合征(SARS)是一种严重的急性自限性传染性疾病，主要通过呼吸道传播，具有传染性强、病程发展快、致死率较高等特点。2003年3月以来，国内外相继报道了引起SARS的冠状病毒基因序列，该病毒含有完整的5′末端序列、编码序列和3′末端序列，全长RNA基因组长度近30000个核苷酸，基因编码区的组成结构与其他冠状病毒类似，包括多个开放阅读框架，病毒表达的蛋白主要包括复制酶蛋白(R蛋白)、表面棘突糖蛋白(S蛋白)、小膜蛋白(E蛋白)、囊膜蛋白(M蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白)，其中s蛋白为病毒最大的结构蛋白，编码基因全长3768个核苷酸，编码的S蛋白含1255个氨基酸残基，相对分子质量为180000，它以单体结构方式在病毒的包膜蛋白表面排列，形成具有特征性的冠状突起。     

用于新型冠状病毒肺炎防治的生物制品研究策略

新型冠状病毒,又称严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）,它引起的新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019, COVID-19）目前已成为全球关注的突发公共卫生事件。SARS-CoV-2感染人数众多,传播性极强,病死率较高,亟需寻求安全高效的特异制剂用于病毒感染的防治。目前在烈性传染病防治中广泛应用的生物制品,在阻断SARS-CoV-2感染上同样极具潜力。本文根据严重急性呼吸综合征（severe acute respiratory syndrome, SARS）和中东呼吸综合征（Middle East respiratory syndrome, MERS）已有的防治策略及研发进展,对干扰素、恢复期血浆、肠道微生态调节剂、疫苗、抗体等生物制品的应用经验和研发命运进行综述,为早日攻克COVID-19提供依据。     

SARS冠状病毒辅助蛋白的研究进展

严重急性呼吸道综合征冠状病毒（SARS-CoV）2002～2003年在全球范围内引起了SARS的大规模暴发。其基因组约30kb,含14个潜在的开放阅读框（ORF）,其中6个ORF编码病毒复制的必需蛋白如复制酶（ORF 1a和1b）和4个结构蛋白：核衣壳、刺突、膜和包膜。其余8个ORF编码SARS-CoV特有的辅助蛋白。本文主要在3个方面概述了SARS-CoV辅助蛋白的研究进展：检测感染病人辅助蛋白的抗体;辅助蛋白的表达、加工和定位;辅助蛋白对细胞功能的影响,从而揭示SARS-CoV辅助蛋白的分子和生化特征,为研究SARS-CoV为何有如此强大的致病力提供线索。     

SARS冠状病毒与实验室诊断

引起严重急性呼吸综合征(SARS)的病原是一种新型冠状病毒。作者对其结构、致病性、抵抗力以及实验室诊断的现状与不足进行了综述。     

SARS-CoV基因组及其产物的生物学功能(I)

严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome, SARS)在2003年我国南方爆发流行,波及众多国家和地区,引起了全球关注. 在确证SARS病原体为继Group1,2,3后的一类新冠状病毒SARS Coronavirus(SARS-CoV)之后,全球对SARS相关冠状病毒进行了广泛的研究. 至目前为止,SARS-CoV的基因组已在多个实验室中测定,并通过多种途径分析了其基因结构特征. 本文综述了SARS-CoV的基因组成与结构、病毒的复制、转录和翻译调控等方面研究进展.     

上海2株严重急性呼吸综合征冠状病毒2的分离与鉴定

目的 从新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者鼻/咽拭子样本中分离、培养严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）。方法 将来自上海市COVID-19患者的3份鼻/咽拭子样本以TPCK胰酶处理,然后接种Vero E6细胞;待大部分细胞出现明显病变时,取细胞培养上清用qRT-PCR法检测病毒核酸,并用反转录PCR扩增病毒受体结合区（RBD）基因片段;将病毒扩增培养后感染接种于96孔板中的Vero E6细胞,观察细胞病变效应,并用免疫荧光法检测病毒蛋白。结果 2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本接种的Vero E6细胞出现明显细胞病变效应,细胞培养上清中检测出新复制产生的SARS-CoV-2核酸,扩增出的RBD序列与早期分离出的SARS-CoV-2相应序列完全一致;病毒感染的Vero E6细胞病变迅速,并能与SARS-CoV-2核衣壳蛋白（N蛋白）单克隆抗体、刺突蛋白（S蛋白）单克隆抗体及COVID-19患者恢复期血清发生反应。结论 从2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本中成功分离出SARS-CoV-2,为后续开展SARS-CoV-2感染与致病机制研究、防治药物与疫苗的研发奠定了基础。     

巨胞饮途径介导的新冠原始株病毒蛋白入胞的细胞水平初步研究

目的·探讨严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)原始株的几种关键蛋白对多种细胞模型巨胞饮途径的影响。方法·(1)利用免疫共沉淀技术探索SARS-COV-2原始株的刺突蛋白受体结合域（spike protein receptor-binding domain,S-RBD）、核衣壳蛋白（nucleocapsid protein,N）和非结构蛋白7 (nonstructural protein-7,NSP7)等病毒蛋白与HEK-293T细胞内蛋白的相互作用。(2)于体外,将SARS-CoV-2原始株的S-RBD、N、NSP7病毒蛋白分别与HEK-293T/bEnd.3/Beas-2b细胞（正常细胞模型）共孵育,利用巨胞饮标志物——异硫氰酸荧光素（fluorescein isothiocyanate,FITC）标记的70 kDa葡聚糖（FITC-70 kDa-葡聚糖）水平的变化观察上述细胞巨胞饮水平的改变。(3)利用脂多糖（lipopolysaccharide,LPS）诱导的炎症细胞...     

Functional mutations of SARS-CoV-2: implications to viral transmission,pathogenicity and immune escape

The pandemic of coronavirus disease 2019 caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has led to major public health challenges globally. The increasing viral lineages identified indicate that the SARS-CoV-2 genome is evolving at a rapid rate. Viral genomic mutations may cause antigenic drift or shift, which are important ways by which SARS-CoV-2 escapes the human immune system and changes its transmissibility and virulence. Herein, we summarize the functional mutations in SARS-CoV-2 genomes to characterize its adaptive evolution to inform the development of vaccination, treatment as well as control and intervention measures.     

冠状病毒肺炎的细胞因子风暴与治疗研究进展

冠状病毒肺炎的主要临床表现为乏力、干咳、发热,少数严重者可引发重症肺炎。细胞因子风暴(CS)是造成重症冠状病毒肺炎患者死亡的重要原因。过度激活的免疫炎症反应引起大量炎性细胞浸润和促炎细胞因子、趋化因子的极度升高,会导致急性肺损伤(ALI)和急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。本文对CS在几种高致病性、传染性冠状病毒感染中的作用和相应治疗策略研究进展进行综述,以期为冠状病毒肺炎的临床治疗提供指导。     

SARS流行病学研究

传染性非典型肺炎是通过近距离空气飞沫或密切接触等途径迅速传播的一种急性呼吸道传染病 ,世界卫生组织将这种急性呼吸道传染病称为严重急性呼吸综合征 (SARS)。作者主要是对 2 0 0 3年初在中国流行的SARS的传染源、传播途径、流行模式以及流行特征等方面的初步情况进行综述。     

SARS-CoV-2对神经系统损害的研究进展

由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)所引起 的2019 冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情在全球大暴发。SARS-CoV-2 感染除了可累及呼吸系统 外,还可导致严重的神经系统损伤。研究表明SARS-CoV-2 可通过血行和跨神经元途径入侵神经系统,并可能通过抑 制细胞免疫、低氧血症及炎症作用,诱导神经元变性与细胞凋亡,以及血管紧张素转化酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)机制造成COVID-19 患者的神经系统损害,导致患者颅内感染、中毒性脑病、急性脑血管疾病、肌 肉损害、周围神经系统损伤、急性脊髓炎、脱髓鞘疾病或其他神经系统疾病。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2主要蛋白质分子的氨基酸变异分析

目的 应用生物物理学方法鉴定分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）中主要蛋白质分子的关键氨基酸变异。方法 通过氨基酸序列同源比对、突变氨基酸残基分类、蛋白质三维结构重建和氨基酸残基静电相互作用测量,以同源性最高的蝙蝠冠状病毒RaTG13为参照,进行SARS-CoV-2中主要蛋白质分子的关键氨基酸变异分析。结果 初步分析确定SARS-CoV-2中RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp）、核糖核酸外切酶（ExoN）、尿苷酸特异性核糖核酸内切酶（NendoU）和刺突蛋白（S蛋白）上至少发生了10处影响静电相互作用的氨基酸变异,这些变异可能影响蛋白质分子的空间构象及其生物学功能。结论 初步确定了SARS-CoV-2中主要蛋白质分子的关键氨基酸变异,为理解SARS-CoV-2的遗传特性、致病性和流行病学特征提供了有用线索。     

感染Vero细胞中SARS病原体的电镜观察

目的 用透射电子显微镜(TEM)观察严重急性呼吸综合征(SARS)患者感染的Vero细胞，为SARS病原体的分离鉴定提供形态学资料。方法 标本为上海市疾病控制中心送检的SARS患者鼻咽拭子接种感染的Vero细胞．对培养液负染色标本和vero细胞超薄切片标本进行TEM观察。结果 在负染色标本和超薄切片标本中均可观察到病毒．病毒颗粒为圆形或椭圆形，外周有冠状排列的纤突，病毒颗粒直径约80～160nm，纤突长度约20～40nm、感染细胞的病毒颗粒分布在细胞质中，主要在内质网和空泡内，可见群集的大小较一致的病毒颗粒。结论 本例电镜所见病毒颗粒大小、形态与文献报道的SARs冠状病毒(SARS—CoV)相符。     

湖南省新生儿新型冠状病毒感染防治方案

为防控新型冠状病毒（SARS-CoV-2）感染流行,国家卫生健康委员会连续发布了一系列规范 化文件。由于目前缺乏胎儿及新生儿SARS-CoV-2 感染的实验室和临床研究资料,SARS-CoV-2 是否可由 感染母亲垂直传播致新生儿感染尚不明确。鉴于孕产妇是病毒性疾病的易感人群之一,湖南省新生儿医疗质 量控制中心以保护新生儿和医护人员为目的,经过湖南省新生儿专家多次讨论及修订了《湖南省新生儿新型 冠状病毒感染防治方案》,旨在加强防范措施,切实阻断母源性、医源性和社区源性SARS-CoV-2 的医院感 染传播途径。     

Pathogenesis of severe acute respiratory syndrome

Severe acute respiratory syndrome （SARS） first emerged in Guangdong province, China in November 2002. During the following 3 months, it spread rapidly across the world, resulting in approximately 800 deaths. In 2004, subsequent sporadic cases emerged in Singapore and China. A novel coronavirus, SARS-CoV, was identified as the etiological agent of SARS.1＇2 This virus belongs to a family of large, positive, single-stranded RNA viruses. Nevertheless, genomic characterization shows that the SARS-CoV is only moderately related to other known coronaviruses.3 In contrast with previously described coronaviruses, SARS-CoV infection typically causes severe symptoms related to the lower respiratory tract. The SARS-CoV genome includes 14 putative open reading frames encoding 28 potential proteins, and the functions of many of these proteins are not known.4 A number of complete and partial autopsies of SARS patients have been reported since the first outbreak in 2003. The predominant pathological finding in these cases was diffuse alveolar damage （DAD）, This severe pulmonary injury of SARS patients is caused both by5 direct viral effects and immunopathogenetic factors, Many important aspects of the pathogenesis of SARS have not yet been fully clarified. In this article, we summarize the most important mechanisms involved in the complex pathogenesis of SARS, including clinical characters, host and receptors, immune system response and genetic factors.