SARS冠状病毒S蛋白抗原表位串联基因的设计和表达

目的:表达严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒S蛋白的抗原表位序列,为研制新型的SARS病毒疫苗提供新思路。方法:应用生物信息学分析软件分析SARS冠状病毒S蛋白的抗原表位序列,设计全新的抗原表位编码基因序列,构建表达载体并在大肠杆菌中表达该基因。结果:设计并合成了SARS冠状病毒S蛋白的抗原表位序列的新基因序列,在大肠杆菌中实现了该基因的高表达。结论:可以重新设计新基因产生新型候选重组疫苗。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒S蛋白启动急性肺损伤的可能机制

目的:研究严重急性呼吸综合征(SARS)冠状病毒(CoV)S蛋白作用于呼吸道上皮及免疫细胞后对趋化因子IP-10和其他细胞因子生成的影响。方法:通过昆虫-杆状病毒表达系统表达SARS-CoV的S蛋白,并经镍亲和磁珠纯化,将重组的S蛋白分别作用于人支气管上皮细胞16HBE、外周血单个核细胞和单核细胞、肺泡单核-巨噬细胞,观察其形态学变化,并检测IP-10和其他细胞因子的变化。结果:基础状态下16HBE并不生成IP-10,S蛋白作用于人支气管上皮细胞16HBE,引起部分细胞变圆、空泡形成并裂解,12h后即可见IP-10生成达(79.97±13.81)pg/ml,呈显著量效关系。但对其他参与免疫反应的Th1/Th2细胞因子及趋化因子影响不明显。S蛋白并不诱导外周血单核细胞和单个核细胞(主要为淋巴细胞)合成释放IP-10。比较而言,干扰素-γ(IFN-γ)不仅能诱导16HBE,而能诱导免疫细胞生成IP-10。结论:①SARS-CoV可通过其S蛋白早期诱导肺上皮细胞合成释放IP-10,从而启动免疫病理过程。②SARS-CoVS蛋白诱导IP-10在宿主细胞的生成不依赖IFN-γ。     

SARS冠状病毒M蛋白二级结构和B细胞抗原表位的稳定性分析

目的预测具有代表性的3株SARS冠状病毒M蛋白二级结构和B细胞抗原表位,探讨基因变异对M蛋白二级结构和B细胞抗原表位的影响。方法采用Chou-Fasman方法、Garnier-Robson方法和Karplus-Schulz方法预测SARS冠状病毒M蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案预测B细胞抗原表位。结果3株SARS冠状病毒M蛋白的二级结构和B细胞抗原表位完全一致。结论SARS冠状病毒M蛋白的二级结构和抗原表位比较稳定,提示利用某一毒株的M蛋白制备单克隆抗体和疫苗可应用于SARS的诊断和防治。     

北京地区传播的严重急性呼吸综合征冠状病毒S区基因变异分析

严重急性呼吸综合征(SARS)是一种严重的急性自限性传染性疾病，主要通过呼吸道传播，具有传染性强、病程发展快、致死率较高等特点。2003年3月以来，国内外相继报道了引起SARS的冠状病毒基因序列，该病毒含有完整的5′末端序列、编码序列和3′末端序列，全长RNA基因组长度近30000个核苷酸，基因编码区的组成结构与其他冠状病毒类似，包括多个开放阅读框架，病毒表达的蛋白主要包括复制酶蛋白(R蛋白)、表面棘突糖蛋白(S蛋白)、小膜蛋白(E蛋白)、囊膜蛋白(M蛋白)和核衣壳蛋白(N蛋白)，其中s蛋白为病毒最大的结构蛋白，编码基因全长3768个核苷酸，编码的S蛋白含1255个氨基酸残基，相对分子质量为180000，它以单体结构方式在病毒的包膜蛋白表面排列，形成具有特征性的冠状突起。     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2检测方法的研究进展

2019年底,严重急性呼吸综合征冠状病毒2感染疫情引起全球关注,已影响180多个国家和地区,2020年3月11日,世界卫生组织(WHO)宣布将新型冠状病毒肺炎列为全球性大流行病.早诊断、早隔离、早治疗可降低病毒传播的风险,因此快速准确的实验室诊断尤为重要.文章就严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸检测和免疫学检测方法进行...     

与严重急性呼吸综合征有关的一种新型冠状病毒

背景　严重急性呼吸综合征 (SARS)的世界性暴发与暴露于中国广东省 1例发病的医务人员有关。我们进行了多项研究以确定引起这次发病的病原体。方法　我们收集了 7个国家的患者的临床标本 ,然后利用病毒分离技术、电子显微镜和组织学检查 ,以及分子和血清学分析 ,试图来确定各种可能的病原体。结果　任何一种以前描述过的呼吸系统病原体都与鉴定结果不一致 ,但是一种新型的冠状病毒从符合SARS定义的患者身上分离了出来。我们观察了用患者咽拭子标本接种的VeroE6细胞的细胞病变特征 (图 1) ,电子显微镜检查显示有冠状病毒所特有的超微结构…     

严重急性呼吸综合征冠状病毒2与新型冠状病毒肺炎

目前正在暴发流行的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的病原体是严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）,这是近年来继严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERSCoV）之后发现的能够感染人的第7种冠状病毒。SARS-CoV-2系单股正链RNA病毒,传染性强,人群普遍对其缺乏免疫力,疫情目前仍在持续。2020年1月30日（当地时间）,WHO将此次疫情列为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC）。本文就SARS-CoV-2病原学、致病性及COVID-19的检测诊断、预防控制和临床治疗等领域的进展进行讨论。     

新型冠状病毒肺炎与严重急性呼吸综合征的回顾对比分析

21世纪以来全球曾暴发多种流行性疾病,给世界多个国家的人力、物力、财力造成巨大的损失。本文通过分析国内外文献,对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)与严重急性呼吸综合征(SARS)在流行病学、临床症状和影像学特征方面进行系统分析比较,总结两者在临床表现的异同,为全球医务人员科学做好疫情防控提供参考。     

两种严重急性呼吸综合征冠状病毒S蛋白结构特征及抗原表位比较

目的通过严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）-2与SARS-CoV S蛋白结构特征及抗原表位的比较分析，从分子水平为SARS-CoV-2致病机制研究提供数据支持，并为疫苗、抗体及药物研发寻找合适的候选靶点。方法利用生物信息学方法和工具，基于S蛋白参考序列进行理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、结构域、二级结构、三级结构分析及抗原表位预测，同时对受体血管紧张素转换酶2（ACE2）、C型凝集素（CLEC4M）的组织表达及关联通路、途径进行分析。结果SARS-CoV-2、SARS-CoV S蛋白氨基酸序列一致性为75.80%，两者结构特征具有较高一致性，但SARS-CoV-2高级结构特征不如SARS-CoV明显。受体ACE2、CLEC4M在消化系统及心脏、肾脏、肺、胎盘中均有表达，主要关联的肾素-血管紧张素系统、蛋白质消化吸收通路及血管紧张素前体转化、G蛋白偶联受体（GPCR）配体结合途径与2019冠状病毒病典型症状相关。分析获得S蛋白三对高度或完全同源的抗原表位，即SARS-CoV-2 S蛋白第600~605位氨基酸残基与SARS-CoV第586~591位高度一致，SARS-CoV-2 S蛋白第695~703位、第888~896位氨基酸残基分别与SARS-CoV第677~685位、第870~878位高度或完全一致。结论SARS-CoV-2与SARS-CoV S蛋白结构上的相似性决定了两者具有相近的感染模式和临床表现。筛选获得的高可信度的SARS-CoV-2候选抗原表位可为病毒诊断和疫苗研制提供参考。     

Similarities and Differences of Early Pulmonary CT Features of Pneumonia Caused by SARS-CoV-2, SARS-CoV and MERS-CoV: Comparison Based on a Systemic Review

Objective To compare the similarities and differences of early CT manifestations of three types of viral pneumonia induced by SARS-CoV-2 (COVID-19), SARS-CoV (SARS) and MERS-CoV (MERS) using a systemic review.Methods Electronic database were searched to identify all original articles and case reports presenting chest CT features for adult patients with COVID-19, SARS and MERS pneumonia respectively. Quality of literature and completeness of presented data were evaluated by consensus reached by three radiologists. Vote-counting method was employed to include cases of each group. Data of patients’ manifestations in early chest CT including lesion patterns, distribution of lesions and specific imaging signs for the three groups were extracted and recorded. Data were compared and analyzed using SPSS 22.0.Results A total of 24 studies were included, composing of 10 studies of COVID-19, 5 studies of MERS and 9 studies of SARS. The included CT exams were 147, 40, and 122 respectively. For the early CT features of the 3 pneumonias, the basic lesion pattern with respect to “mixed ground glass opacity (GGO) and consolidation, GGO mainly, or consolidation mainly” was similar among the 3 groups (χ²=7.966, P>0.05). There were no significant differences on the lesion distribution (χ²=13.053, P>0.05) and predominate involvement of the subpleural area of bilateral lower lobes (χ ²=4.809, P>0.05) among the 3 groups. The lesions appeared more focal in COVID-19 pneumonia at early phase (χ ²=23.509, P<0.05). The proportions of crazy-paving pattern (χ ²=23.037, P<0.001), organizing pneumonia pattern (P<0.05) and pleural effusions (P<0.001) in COVID-19 pneumonia were significantly lower than the other two. Although rarely shown in the early CT findings of all three viral pneumonias, the fibrotic changes were more frequent in SARS than COVID-19 and MERS (χ ²=6.275, P<0.05). For other imaging signs, only the MERS pneumonia demonstrated tree-in-buds, cavitation, and its incidence rate of interlobular or intralobular septal thickening presented significantly increased as compared to the other two pneumonia (χ ²=22.412, P<0.05). No pneumothorax, pneumomediastinum and lymphadenopathy was present for each group.Conclusions Imaging findings on early stage of these three coronavirus pneumonias showed similar basic lesion patterns, including GGO and consolidation, bilateral distribution, and predominant involvement of the subpleural area and the lower lobes. Early signs of COVID-19 pneumonia showed less severity of inflammation. Early fibrotic changes appeared in SARS only. MERS had more severe inflammatory changes including cavitation and pleural effusion. The differences may indicate the specific pathophysiological processes for each coronavirus pneumonia.     

新型冠状病毒S蛋白B细胞表位的预测与分析

目的：分析新型冠状病毒（SARS-CoV-2）S刺突蛋白的二级结构并预测其可能的B细胞表位。方法：基于SARS-CoV-2 S蛋白氨基酸序列,分别采用SOPMA、GOR方法预测S蛋白的二级结构,并结合其跨膜区、亲水性、表面可及性和抗原性参数等综合分析,预测SARS-CoV-2 S蛋白可能的B细胞表位。结果：对SARS-CoV-2 S蛋白二级结构的预测表明,其二级结构中柔性区域以无规卷曲为主,少见转角。多种参数综合分析推测,其可能的优势B细胞表位位于354～360、437～445、454～471、527～537、567～582、678～685、772～779和806～818位氨基酸。结论：采用多参数预测SARS-CoV-2 S蛋白的B细胞表位,为深入研究S蛋白的功能奠定基础。     

成都市147例新型冠状病毒感染者的流行病学特征

目的分析成都市新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染者的流行病学特征及变化趋势。方法收集2020年1—4月成都市公共卫生临床医疗中心收治的诊断为新型冠状病毒肺炎患者或新型冠状病毒无症状感染者资料,回顾性分析流行病学特征和临床分型。结果共收集新型冠状病毒肺炎患者或新型冠状病毒无症状感染者147例,其中男性77例,女性70例,年龄2个月~87岁。入院时间在1月有52例,2月61例,3月25例,4月9例。1月和2月以湖北暴露型和本地暴露型为主,3月和4月以境外输入型为主,差异有统计学意义(P<0.001)。聚集性病例以2月份最多,为39例,显著高于1月(22例)、3月(8例)和4月(1例)(均P<0.05)。1月入院的重型和危重型病例分别为9例和6例,2月入院分别为5例和12例,显著高于3月和4月,差异有统计学意义(P<0.05)。结论成都市新型冠状病毒肺炎入院重型和危重型病例患者出现在疫情初期1—2月份,暴露类型由早期的湖北暴露转为本地暴露再转为境外暴露,防控境外输入型病例是今后的工作重点。     

新型冠状病毒感染疫情下县域高血压管理的专家建议

目前,我国各省份及境外均出现了新型冠状病毒（SARS-CoV-2）感染疫情。针对我国庞大的高血压患者群体,尤其是更多分布于基层的高血压患者,现提出县域SARS-CoV-2感染下的高血压管理的专家建议。本建议仅限于没有合并SARS-CoV-2感染的高血压患者。     

SARS-CoV-2对神经系统损害的研究进展

由严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)所引起 的2019 冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)疫情在全球大暴发。SARS-CoV-2 感染除了可累及呼吸系统 外,还可导致严重的神经系统损伤。研究表明SARS-CoV-2 可通过血行和跨神经元途径入侵神经系统,并可能通过抑 制细胞免疫、低氧血症及炎症作用,诱导神经元变性与细胞凋亡,以及血管紧张素转化酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)机制造成COVID-19 患者的神经系统损害,导致患者颅内感染、中毒性脑病、急性脑血管疾病、肌 肉损害、周围神经系统损伤、急性脊髓炎、脱髓鞘疾病或其他神经系统疾病。     

SARS相关冠状病毒S2基因的克隆及其DNA疫苗的免疫效果

目的：构建抗原基因为SARS相关冠状病毒(severe acute resplratory syndrome coronavtrus，SARS—CoV)S2基因的DNA疫苗，将其接种小鼠后观察病毒特异性抗体产生情况。方法：将合成的S2基因片段克隆至真核表达载体，随之将质粒进行小鼠肌内接种免疫，定期检测血清中抗SARS—CoV的病毒特异性抗体水平。结果：疫苗接种后第2周就能检测出病毒特异性抗体，随着时间的延续，抗体水平逐步升高，而空质粒对照组未检测出明显的特异性抗体。结论：以S2为抗原基因的DNA疫苗能诱导SARS病毒特异性抗体。     

三种人类高致病性冠状病毒的增殖和传播机制研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）和严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）是目前已知的三种人类高致病性冠状病毒,由非结构蛋白、结构蛋白、附属蛋白和核糖核酸组成。病毒粒子通过冠状病毒的刺突糖蛋白（S蛋白）识别宿主受体,以膜融合方式进入宿主细胞,通过大型复制转录复合体在宿主细胞内复制,并通过干扰和抑制宿主的免疫应答来促进增殖。人类高致病性冠状病毒的宿主是人和脊椎动物,病毒粒子通过飞沫、接触、气溶胶等途径感染肺部细胞,也可能通过消化道、尿液、眼部等其他途径传播。本文基于现有研究结果讨论人类高致病性冠状病毒的增殖和传播机制,以期为阻断其传播和致病提供依据。     

三种人类高致病性冠状病毒的增殖和传播机制研究进展

严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）和严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）是目前已知的三种人类高致病性冠状病毒，由非结构蛋白、结构蛋白、附属蛋白和核糖核酸组成。病毒粒子通过冠状病毒的刺突糖蛋白（S蛋白）识别宿主受体，以膜融合方式进入宿主细胞，通过大型复制转录复合体在宿主细胞内复制，并通过干扰和抑制宿主的免疫应答来促进增殖。人类高致病性冠状病毒的宿主是人和脊椎动物，病毒粒子通过飞沫、接触、气溶胶等途径感染肺部细胞，也可能通过消化道、尿液、眼部等其他途径传播。本文基于现有研究结果讨论人类高致病性冠状病毒的增殖和传播机制，以期为阻断其传播和致病提供依据。