LRP1基因突变与壮族人群前列腺癌相关性的初步研究

目的 通过对壮族前列腺癌患者癌组织和癌旁组织进行全外显子组测序，探讨可能与前列腺癌易感性有关的基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）突变基因。方法 取26例壮族前列腺癌患者癌组织及癌旁组织，提取DNA后进行全外显子组检测，筛选排在前60（TOP 60）的突变基因。在DAVID在线功能通路富集数据库和人类基因变异与临床信息整合数据库中查找TOP 60突变基因中与人类疾病发生相关的基因突变。结果 共突变结果显示，26例前列腺癌患者中，23.1%的患者低密度脂蛋白受体相关蛋白1基因（low density lipoprotein receptor-related protein 1，LRP1）突变；其中检索到LRP1基因的chr12：57556206位点为致病位点，发现 chr12：57603908、chr12：57548363、chr12：57567636、chr12：57554683、chr12：57549979位点可能与前列腺癌发生有关，且各位点均与 chr12：57556206位点相互独立（r ²<0.7）。结论 LRP1基因突变可能与壮族人群前列腺癌发生有关。     

基于数据挖掘分析GOLM1基因在前列腺癌中的表达及其临床意义

目的 探讨GOLM1基因在前列腺癌中的表达及临床意义。方法 利用Oncomine数据库分析GOLM1基因在前列腺癌与其癌旁正常组织组织中的表达情况，从TCGA数据库中下载相关的RNA-Seq数据和临床资料，分析GOLM1基因表达与患者临床病理学特征及预后的关系。结果 Oncomine及TCGA数据库分析结果显示，GOLM1基因在前列腺癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织（P<0.001）。相关分析结果显示，TCGA数据库中547例前列腺癌患者GOLM1 mRNA表达水平与其年龄、临床T分期、病理学T分期及Gleason评分的相关性不大；低表达GOLM1基因的患者总生存期显著较高表达者长（HR=4.50，95%CI：3.77~5.37，P=0.038）；ROC曲线分析显示最佳截断点为8.889，灵敏度为80.5%，特异度为80.8%，ROC曲线下面积为0.862（95%CI：0.813~0.912）。结论 GOLM1基因在前列腺癌组织中高表达，且与患者不良预后相关，可作为前列腺癌较好的诊断标志物。     

IL-17基因多态性与胃癌易感性的关系

目的 探讨白介素-17（Interleukin-17,IL-17）基因rs2275913、rs763780多态性与胃癌易感性的关系。方法 收集青岛地区355例汉族胃癌患者为胃癌组,同期进行健康体检的300名正常者为对照组,采集两组患者外周血,提取全血基因组DNA,PCR扩增目的基因片段,采用DNA直接测序法检测IL-17基因rs2275913、rs763780位点基因型,分析其位点多态性与胃癌易感性的关系。结果 胃癌组与对照组IL-17基因 rs2275913位点基因型分布差异有统计学意义（χ²=17.192,P＜0.001）。与GG基因型相比,携带AA基因型的个体胃癌发病风险增加,差异有统计学意义（χ²=16.829,P＜0.05;OR=2.891,95%CI=1.721~4.857）;携带GA基因型的个体胃癌发病风险增加,但差异无统计学意义（χ²=0.878,P＞0.05）。胃癌组与对照组相比,IL-17基因 rs763780位点基因型分布差异无统计学意义（χ²=1.381,P=0.501）。结论 IL-17基因 rs2275913 A等位基因的携带会增加青岛地区汉族人群胃癌发病风险,IL-17基因 rs763780位点多态性与胃癌发病风险无明显相关性。     

Dnmt1基因单核苷酸多态性与胃癌的关系

目的 探讨Dnmt1基因rs16999593、rs2228611位点单核苷酸多态性与胃癌发病易感性的关系。方法 采用病例-对照的研究方法,采集青岛地区310例胃癌患者（胃癌组）与420名健康体检者（对照组）外周血液样本,提取基因组DNA,PCR扩增目的基因片段,用DNA直接测序法对Dnmt1基因rs16999593、rs2228611位点进行基因分型,分析其与胃癌发病易感性的关系。 结果 Dnmt1基因rs16999593位点TT型、CT型和CC型在胃癌组中的频率分别为58.1%、36.1%和5.8%,在对照组中分别为66.9%、27.9%和5.2%。与野生型TT型相比,携带CT基因型者胃癌发病的风险性增加（OR＝1.494, 95%CI=1.086~2.057,P<0.05）,CC基因型虽可增加胃癌发病风险,但差异无统计学意义（OR=1.277,95%CI=0.677~2.448,P>0.05）。rs2228611位点的各基因型在胃癌组和对照组间分布频率的差异无统计学意义（P>0.05）。 结论 Dnmt1基因rs16999593位点CT基因型可能增加青岛地区汉族人群胃癌发病的易感性。     

中国人群PSCA基因rs2976392多态位点与胃癌易感性Meta分析

目的 评价前列腺干细胞抗原（prostate stem cell antigen,PSCA）基因rs2976392多态位点与中国人群胃癌易感性的关联。方法 通过计算机检索中国知网、万方数据库、维普数据库、NCBI、Embase、Web of Science等数据库获取关于胃癌与PSCA基因rs2976392多态位点相关的文献,检索时间为自建库起至2020年3月22日。对纳入文献进行质量评价后,使用RevMan 5.3和Stata 12.0软件进行Meta分析。 结果 最终纳入13篇文献共14项病例对照研究,包含6 618例胃癌患者和6 952例对照者。Meta分析显示,等位基因模型（A vs G）、显性基因模型（AA+GA vs GG）和1个共显性基因模型（AA vs GG）均显示PSCA基因rs2976392多态位点与中国人群胃癌发病风险增加有关（OR=1.28,95%CI：1.08~1.52,P=0.004;OR=1.35,95%CI：1.27~1.45,P＜0.001;OR=1.51,95%CI：1.03~2.20,P=0.030）。亚组分析结果显示,所有基因模型均与汉族人群胃癌发病风险增加有关（均P＜0.001）,但与藏族人群胃癌发病风险无关（均P＞0.05）。 结论 PSCA基因rs2976392多态位点与中国人群胃癌发病风险升高有关,且以纯合AA基因型汉族人群的胃癌发病风险最高。     

基于生物信息学方法探讨Her-2基因表达对胃癌免疫细胞浸润的影响

目的 探讨人类表皮生长因子受体2（human epidermal growth factor receptor-2,Her-2）对胃癌组织中免疫细胞浸润的影响及可能的机制。方法 从癌症基因组图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库下载胃癌转录测序数据及临床资料。采用CIBERSORT反卷积算法获得胃癌微环境中浸润的免疫细胞占比,分析其与Her-2表达的关系,筛选Her-2基因潜在的调控浸润免疫细胞的类型。采用基因集变异分析（gene set variation analysis,GSVA）评估与胃癌组织Her-2表达相关的信号通路集合,利用GEO（gene expression omnibus）收录的胃癌转录组数据验证Her-2基因表达与胃癌免疫细胞浸润程度的关系。结果 CIBERSORT分析TCGA数据库胃癌样本发现CD8⁺T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞在Her-2高表达及低表达组中的浸润程度差异有统计学意义（P=0.029,0.049,0.027,0.008）。GEO数据库与TCGA数据库分析结果均显示,Her-2基因高表达与CD8⁺ T细胞、静息状态记忆性CD4⁺T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞的发育、诱导分化、迁移调控有关（P<0.05）,并影响胃癌组织中部分免疫细胞的浸润能力和程度。结论 在胃癌中Her-2基因高表达可能对部分免疫细胞形成和功能发挥具有抑制作用。     

lncRNA SH3PXD2A-AS1在结肠癌组织中的表达及其临床意义

目的 探讨长链非编码RNA（lncRNA） SH3PXD2A-AS1在结肠癌组织中的表达及其临床意义。方法 收集于广西医科大学附属肿瘤医院手术切除的40例结肠癌患者的癌组织及相应癌旁正常组织。采用RT-PCR法检测lncRNA SH3PXD2A-AS1的表达水平。下载TCGA数据库中的结肠癌数据，验证lncRNA SH3PXD2A-AS表达水平与结肠癌临床病理特征及预后的关系。结果 lncRNA SH3PXD2A-AS1在结肠癌组织中的表达水平高于癌旁正常组织（6.53±1.62 vs 4.37±0.96，t=3.445，P=0.002），其在M1期患者中的表达水平高于M0期，在Ⅲ~Ⅳ期患者中患者中的表达水平亦高于Ⅰ~Ⅱ期 （P<0.05），但与患者总生存期无关（χ²=0.326，P=0.586）。TCGA数据库验证结果显示，lncRNA SH3PXD2A-AS1在结肠癌组织中呈高表达，但与患者的总生存期无关（P>0.05）。结论 lncRNA SH3PXD2A-AS1在结肠癌组织中呈高表达，且与肿瘤远处转移有关，可能是判断肿瘤进展程度的指标。     

DNA修复基因RAD52 miRNA靶序列单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性研究

目的 探讨DNA修复基因RAD52 3'非翻译区（3'- untranslated region,3'-UTR）miRNA靶序列单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与广西地区人群肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）遗传易感性的关系。方法 采用病例- 对照研究,对1 002例确诊的HCC新发病例和1 013例非肿瘤患者RAD52基因3'-UTR区域miRNA靶序列SNPs （rs1051669、rs1051672、rs7301931和rs7310449）进行基因分型,并分析其基因型频率分布及其与HCC遗传易感性的关系。结果 RAD52基因各SNP基因型在病例组和对照组中的分布频率差异均无统计学意义（P>0.05）。调整年龄、性别、吸烟、饮酒和HBV感染等因素后,未发现各SNP与HCC易感性有关联;分层分析发现,在女性人群中,与携带rs1051669 C等位基因相比,TT基因型可显著降低个体罹患HCC的风险（TT vs CT/CC：OR=0.03,95%CI：0.00~0.62,P=0.03）;与携带rs1051672 G等位基因相比,AA基因型可显著降低个体罹患HCC的风险（AA vs GA/GG：OR=0.03,95%CI：0.01~0.88,P=0.04）。结论 RAD52基因3'- UTR区域miRNA靶序列SNPs rs1051669、rs1051672位点可能与广西地区女性人群HCC易感性有关。     

人mcl1不同亚型在结肠癌组织中表达变化的临床意义

目的 探讨人mcl1基因不同亚型在结肠癌组织中差异表达的临床意义。方法 采用RT-PCR和Western blot分别检测正常结肠组织、结肠腺瘤、结肠腺癌组织以及相应的癌旁组织各20例中mcl1基因三种mRNA剪接异构体和三种蛋白亚型的表达水平,进而分析这些亚型表达差异与肿瘤临床病理特征之间的相关性。结果 mcl1基因亚型1在结肠肿瘤组织及相应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.009, P=0.022）,且腺癌组中的mRNA和蛋白质水平表达亦高于腺瘤组（P=0.004, P=0.034）。亚型2在结肠肿瘤组织及对应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.002, P=0.011）,且腺癌组中的mRNA和蛋白质水平表达亦高于腺瘤组（P<0.001, P=0.007）。亚型3在结肠肿瘤组织及对应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.027, P=0.045）,但肿瘤组与相应旁组织之间以及腺癌组与腺瘤组之间的比较差异均无统计学意义。结论 研究表明mcl1亚型1和亚型2对结肠癌肿瘤恶性程度呈正相关,可以作为临床评估结肠癌恶性程度有效的诊断指标之一。而亚型3可以作为肿瘤早期诊断的标志物,但其表达水平与恶性程度无明显相关性。     

YEATS2在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨YEATS2在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）中的表达及其与预后的关系。方法 收集我院2010年1月至2014年1月112例手术切除的HCC癌组织和癌旁组织石蜡标本，采用Real-time PCR检测HCC癌组织及癌旁组织中YEATS2 mRNA的表达，Western blot和免疫组化染色检测YEATS2蛋白水平，免疫荧光染色检测YEATS2在HCC癌组织中的表达定位，并分析YEATS2与HCC患者临床病理特征和预后的关系，同时采用TCGA数据库数据验证。结果 Real-time PCR结果显示，YEATS2 mRNA在HCC癌组织中的表达较癌旁组织上调（P<0.001）；Western blot检测结果显示，YEATS2在约66.67%（12/18）的HCC癌组织表达升高；免疫组化染色分析发现，约71.43%（80/112）的HCC患者中YEATS2表达上调，其表达与TNM分期明显相关（P<0.001）；YEATS2主要在HCC癌组织细胞核中表达；多因素分析结果显示YEATS2高表达是患者不良预后的独立危险因素（HR=2.204，95%CI：1.388~3.500，P=0.001）。TCGA中HCC队列分析也表明YEATS2高表达的患者OS更差（HR=1.751，95%CI:1.107~2.770，P=0.017）。 结论 YEATS2在HCC组织中高表达，且与患者不良预后相关。     

A2M介导Fas信号传导途径提高卵巢癌对铂类化疗的敏感性研究

目的 探讨A2M基因的表达与卵巢癌患者耐药及预后的关系及其对Fas信号传导通路的影响。方法 利用癌症基因图集（The Cancer  Genome Atlas,TCGA）数据库中铂类敏感和耐药的卵巢癌患者的基因表达谱,分析A2M基因在铂类敏感和耐药患者中的表达差异。利用已构建的带有绿色荧光标记的卵巢癌SKOV3敏感细胞（SKOV3-GFP）和顺铂耐药细胞（SKOV3-GFP/DDPⅡ）进行裸鼠皮下种植,成瘤后分次予以顺铂体内干预,以实时荧光定量PCR（real-time quantitative PCR,qRT-PCR）技术检测不同次数顺铂干预后的肿瘤组织中A2M mRNA与Fas信号传导通路上重要节点基因的表达水平。用双变量线性回归分析A2M mRNA与所检测基因的表达量的相关性。结果 相对于铂类敏感病例,A2M mRNA在铂类耐药患者中的表达下降（P<0.05）,A2M mRNA的表达与耐药相关（P=0.02）,与卵巢癌患者总生存期、化疗间隔生存期和无疾病进展生存期高度相关（P均<0.001）,其表达量越高,患者生存期越长。A2M mRNA以及细胞凋亡相关的Fas信号传导通路上重要节点基因Fas、FADD、caspase10、caspase9 和caspase3随顺铂注射次数的增加,在耐药的移植瘤组织中相对低表达（P<0.001）;而其下游与DNA修复相关的基因PARP1随顺铂注射次数的增加,在耐药的移植瘤组织中相对高表达（P<0.05）。A2M mRNA的表达与Fas信号传导通路上节点基因的表达存在线性相关（P<0.05）。结论 A2M可能是卵巢癌顺铂耐药的潜在信号分子,它可能维持肿瘤细胞对铂类药物的敏感性。其在耐药细胞中的低表达可能通过某种机制抑制下游的Fas信号传导通路,使其传导失调,最终引起PARP1的表达上调,促进DNA修复,抑制细胞凋亡,诱发卵巢癌细胞对顺铂的耐药。     

组织激肽释放酶7在不同前列腺组织中的表达

目的通过测定组织激肽释放酶7 mRNA（KLK7）在正常前列腺、良性增生前列腺及前列腺癌组织中的表达量,探讨KLK7与前列腺良、恶性病变之间的关系,并阐明其在肿瘤发生发展中的表达状态。方法利用荧光实时定量PCR（quantitative real-time PCR）的方法,检测15例正常前列腺、25例良性增生前列腺和53例前列腺癌组织中KLK7的表达量。比较其在上述前列腺组织中表达量的差异;比较KLK在不同临床分期以及是否存在骨转移的前列腺癌组织间的表达差异。结果KLK7在前列腺癌组织中的平均表达量低于正常或良性病变的前列腺组织,差异有统计学意义（P＜0.05）;在晚期前列腺癌组织中的表达低于局限性前列腺癌,差异有统计学意义（P＜0.05）,在有或无骨转移的前列腺癌组织中的表达差异无统计学意义（P＞0.05）。结论KLK7在前列腺癌组织中呈低表达,在晚期前列腺癌组织中的表达低于局限性前列腺癌,提示该基因可能是潜在的诊断前列腺癌及判断预后的分子标志。     

泛癌整合分析miR-200家族靶标肿瘤基因异质性的研究

目的 探讨miR-200家族对不同肿瘤预后的影响及其靶标基因调控异质性的机制。方法 从癌症基因图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）下载泛癌研究项目（PanCanAtlas）中21种不同组织病理学恶性实体瘤样本的转录组数据和临床表型,并分析miR-200家族与肿瘤预后的关系。进一步选择生存风险评估结果互相矛盾的5种肿瘤进行miR-200家族靶标基因的WGCNA聚类分析。收集膀胱癌组织标本,采用免疫组织化学法和荧光定量PCR验证肿瘤组织中与miR-200家族表达显著相关的靶标基因的表达,并分析其对患者生存的影响。结果 miR-200家族高表达是膀胱癌和胃腺癌预后的保护因素（HR=0.55~0.68,P=0.0001~0.0340;HR=0.61~0.72,P=0.0055~0.0170）,是肝细胞癌和胸腺瘤预后的不利因素（HR=1.46~1.65,P=0.0061~0.0120;HR=7.44~13.04,P=0.0002~0.0210）;miR-141和miR-429对肾乳头状细胞癌生存的影响相反。基因聚类分析显示,miR-200家族靶标TIMP2基因表达可延长膀胱癌患者生存时间,miR-141负调控肾乳头状细胞癌EPHA2基因而延长患者生存时间。膀胱癌组织的TIMP2蛋白与miR-200家族表达呈负相关,miR-200家族高表达患者预后较好。结论 miR-200家族对不同肿瘤预后的影响存在异质性,可能是miR-200家族靶标分子在不同肿瘤的表达存在差异,导致miR-200家族调控生物学功能的异质性。     

基于Oncomine数据库分析Pygopus2基因在乳腺癌组织中的表达及其临床意义

目的 探讨Pygopus2（PYGO2）基因在乳腺癌组织中的表达及临床意义。方法 收集Oncomine数据库中关于PYGO2的信息,利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析PYGO2与乳腺癌患者预后的关系。结果 Oncomine数据库中共收集了45项研究（包括3 730个样本）涉及PYGO2在乳腺癌组织和正常组织中表达的比较。与正常组织相比,PYGO2在乳腺癌组织中高表达（P<0.05）。PYGO2高表达组乳腺癌患者的总体生存率（HR=0.69,95%CI：0.51~0.95,P=0.021）、无复发生存率（HR=0.60,95%CI：0.51~0.70,P<0.001）以及无远处转移生存率（HR=0.61,95%CI：0.43~0.87,P=0.005）均优于低表达组。结论 PYGO2在乳腺癌组织中高表达,且与乳腺癌患者不良预后有关,可能是评估乳腺癌患者预后的潜在生物标志物。