散发性扩张型心肌病相关TBX20基因突变谱分析

目的:分析散发性扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)相关TBX20基因突变谱。方法:从中国汉族人群中选择105例散发性DCM患者和130名健康对照者,采集静脉血并使用核酸纯化试剂盒纯化基因组DNA,采用PCR试剂扩增TBX20基因的全部编码外显子,对扩增的TBX20基因片段进行测序,将所得序列与GenBank数据库中的TBX20基因序列进行对比,借助MUSCLE分析突变氨基酸在进化上的保守性,应用MutationTaster和PolyPhen-2预测突变的致病性。结果:在1例散发性DCM患者识别出了1个新的杂合性TBX20基因变异c.832GA,即p.D278N突变,但该突变在130名对照者和其他散发性DCM患者中均未检出。跨物种TBX20蛋白序列比对分析表明,第278位的天冬氨酸在进化上保守,该TBX20基因突变具有致病性。结论:发现散发性DCM相关TBX20基因新致病性突变c.832GA,将有助于DCM患者的遗传咨询和个体化处理。     

姐妹2人同患家族性高胆固醇血症家系LDL-R基因突变分析

目的：对临床确诊的家族性高胆固醇血症（FH）两姐妹及其家系成员进行低密度脂蛋白受体（LDL-R）基因突变分析,探讨其发病机制。方法：提取患者外周血基因组DNA,聚合酶链反应分别扩增启动子和18个外显子片断,采用单链构象多态性（PCR-SSCP）结合银染技术,对异常电泳条带进行核苷酸序列分析。结果：姐妹2人及其父亲,叔叔,祖母均发现LDL-R基因第13外显子存在一个错义突变,与GeneBank对照证实第1879位G→A碱基置换,氨基酸的改变为丙氨酸→苏氨酸（A606T突变）,其母亲和女儿经测序并未发现此突变位点。结论：姐妹2人均为LDL-R基因存在A606T杂合错义突变,并均来自其父系亲属；可能是该家系发病的分子基础。     

中国散发Brugada综合征患者SCN5A基因突变位点的检测

目的 对5例中国散发Brugada综合征患者进行SCN5A基因突变位点检测.方法 采用直接测序法对5例散发Brugada综合征患者进行SCN5A基因碱基突变位点的检测,测序结果用Chromas软件进行BLAST分析,再将测序峰与网上检索结果重新比对.结果 1例Brugada患者发现了一个同义杂合变异,即SCN5A基因第20外显子上发现一个碱基变异（C3549T）,其所编码的第1 183位苏氨酸没有发生改变（T1183T）.结论 在中国散发Brugada综合征患者的SCN5A基因上发现了1个新的碱基杂合同义突变.     

特发性心房颤动相关TBX5基因新突变的识别

目的:识别特发性心房颤动(房颤)相关TBX5基因新突变。方法:入选特发性房颤患者116例及健康对照者200名,获取临床资料和外周静脉血标本,抽提全部研究对象的基因组DNA,扩增TBX5基因的全部编码外显子及其侧翼内含子,对扩增片段进行测序以寻找变异。检索PubMed和SNP数据库以明确所发现基因变异的新颖性。应用MUSCLE软件分析多物种TBX5蛋白,以显示被改变氨基酸在进化上的保守性,并应用在线程序MutationTaster和PolyPhen-2分析基因变异的致病性。结果:在1例家族史阴性的特发性房颤患者发现了1个TBX5基因变异,其TBX5基因编码核苷酸序列第314位的腺嘌呤变成了胸腺嘧啶(c.314AT),所编码蛋白的氨基酸序列第105位的天冬氨酸变成了缬氨酸(p.D105V)。该突变不存在于200名对照者,也不存在于PubMed和SNP数据库中。多序列比对分析显示第105位的天冬氨酸在进化上完全保守。在线程序分析表明所识别的基因变异具有致病性。结论:发现了1个特发性房颤相关TBX5基因新突变,提示TBX5基因突变可能是特发性房颤的少见遗传病因。     

孤立性房颤相关SCN4B基因突变谱分析

目的：发现孤立性房颤相关SCN4B基因新突变. 方法：收集160例孤立性房颤患者和200名健康对照者的临床资料和血标本,抽提基因组DNA.通过聚合酶链反应扩增房颤候选基因SCN4B的编码区和剪接位点,采用双脱氧核苷链末端合成终止法测序以发现SCN4B基因突变.应用ClustalW软件评估突变氨基酸的保守性,应用MutationTaster软件预测突变的致病性. 结果：在2例孤立性房颤患者各发现1个新的SCN4B基因杂合错义突变,突变率为1.25％.其中1个是SCN4B基因编码核苷酸序列第409位的腺嘌呤（adenine,A）变为鸟嘌呤（guanine,G）,即c.409A＞G突变；另一个是SCN4B基因编码核苷酸序列第511位的G变为A,即c.511G＞A突变.多序列比对显示2种突变氨基酸在进化上均高度保守.致病性预测表明2种突变均有致病性.结论：本研究发现孤立性房颤相关SCN4B基因新突变,有助于揭示房颤新的分子机制.     

先天性房间隔缺损相关GATA4基因新突变的筛查

目的 筛查先天性房间隔缺损相关GATA4基因的新突变.方法 收集85例先天性房间隔缺损患者和200名健康者的临床资料及外周静脉血标本.应用聚合酶链反应扩增GATA4基因的全部外显子,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序.以BLAST程序将所测序列与GenBank中的已知序列进行比对,以识别基因突变.采用Clustal W软件分析突变氨基酸的保守性.结果 在其中3例先天性房间隔缺损患者的GATA4基因各识别出1个新的杂合错义突变,即第267、354和407位的密码子分别由GTG、ACC和CCA变为ATG、GCC和CAA,亦即c.799G>A、c.1060A>G和c.1220C>A突变,相应地导致第267、354和407位的氨基酸分别由缬氨酸、苏氨酸和脯氨酸变为蛋氨酸、丙氨酸和谷氨酰胺,也称为p.V267M、p.T354A和p.P407Q突变.200名健康对照者均无上述突变.多物种GATA4序列比对显示,第267位的缬氨酸和第407位的脯氨酸在进化上完全保守.结论 在先天性房间隔缺损患者的GATA4基因识别出3个新的杂合错义突变,揭示了先天性房间隔缺损新的分子病因,有助于先天性房间隔缺损的早期防治.     

姐妹2人同患家族性高胆固醇血症家系LDL-R基因突变分析

目的:对临床确诊的家族性高胆固醇血症(FH)两姐妹及其家系成员进行低密度脂蛋白受体(LDL-R)基因突变分析,探讨其发病机制。方法:提取患者外周血基因组DNA,聚合酶链反应分别扩增启动子和18个外显子片断,采用单链构象多态性(PCR-SSCP)结合银染技术,对异常电泳条带进行核苷酸序列分析。结果:姐妹2人及其父亲,叔叔,祖母均发现LDL-R基因第13外显子存在一个错义突变,与GeneBank对照证实第1879位G→A碱基置换,氨基酸的改变为丙氨酸→苏氨酸(A606T突变),其母亲和女儿经测序并未发现此突变位点。结论:姐妹2人均为LDL-R基因存在A606T杂合错义突变,并均来自其父系亲属;可能是该家系发病的分子基础。     

江西地区先心病患者46例EVC等4个已知致病基因筛查报告——4个EVC基因突变与先心病室缺和房缺相关

目的江西地区先心病发病率相对较高,危害百姓健康。江西省政府已从2010年始,将先心病儿童免费救治工作作为一项重要为民工程。虽然先心病病因尚不完全清楚,但近年研究发现某些基因突变与先心病发生密切相关。本课题组对局部地区(江西地区)的先心病患者进行已知致病基因(EVC,TLL1,TBX5和PTPN11)筛查,以发现与疾病密切相关和显性率高的致病基因,为将来个体化治疗提供理论基础,必将有助于局部地区乃至中国先心病出生缺陷的控制。方法从先心病DNA样本库,按照编号随机按序抽取患者DNA标本46份和100个遗传背景匹配的健康对照。根据PubMed文献报道,选择已知的4个致病基因EVC,TLL1,TBX5和PTPN11,并设计相关引物,利用DNA直接测序法四个基因的外显子及外显子-内含子进行双向测序。若核苷酸变异未在100个正常人群中发现,则定为基因突变。结果散发先心病室缺,房缺,动脉导管未闭、复杂先心分别为24例,12例,5例和5例。基因筛查发现EVC基因突变4个,分别是位于3号染色体的L115V突变,6号染色体的Y258H突变,10号染色体的K445Q突变,15号染色体的R760CQ突变,其中Y258H突变出现在房缺患者,其它3个突变见于室缺患者。发现TLL1基因多态性2个,分别是位于7号染色体的E719E,19号染色体的1991A,在房缺、室缺和PDA中均有存在。在房缺和室缺患者中发现PTPN11多态性1个,位于3号染色体的F19L。46个筛查对象中未发现TBX5基因突变和多态性。基因突变患者的临床表型与非基因突变者比,症状和体征的严重程度、发病年龄均无明显差异。结论 EVC基因是江西地区间隔缺损患者的常见致病基因。突变患者的临床症状严重程度与非突变者相比无差异。由于是基因筛查工作中的前期结果,还需要后期工作中进一步增大样本量,以便对先心病患者基因型和表型的关联研究加以客观分析。     

江西地区先心病患者46例EVC等4个已知致病基因筛查报告——4个EVC基因突变与先心病室缺和房缺相关

目的江西地区先心病发病率相对较高,危害百姓健康。江西省政府已从2010年始,将先心病儿童免费救治工作作为一项重要为民工程。虽然先心病病因尚不完全清楚,但近年研究发现某些基因突变与先心病发生密切相关。本课题组对局部地区(江西地区)的先心病患者进行已知致病基因(EVC,TLL1,TBX5和PTPN11)筛查,以发现与疾病密切相关和显性率高的致病基因,为将来个体化治疗提供理论基础,必将有助于局部地区乃至中国先心病出生缺陷的控制。方法从先心病DNA样本库,按照编号随机按序抽取患者DNA标本46份和100个遗传背景匹配的健康对照。根据PubMed文献报道,选择已知的4个致病基因EVC,TLL1,TBX5和PTPN11,并设计相关引物,利用DNA直接测序法四个基因的外显子及外显子-内含子进行双向测序。若核苷酸变异未在100个正常人群中发现,则定为基因突变。结果散发先心病室缺,房缺,动脉导管未闭、复杂先心分别为24例,12例,5例和5例。基因筛查发现EVC基因突变4个,分别是位于3号染色体的L115V突变,6号染色体的Y258H突变,10号染色体的K445Q突变,15号染色体的R760CQ突变,其中Y258H突变出现在房缺患者,其它3个突变见于室缺患者。发现TLL1基因多态性2个,分别是位于7号染色体的E719E,19号染色体的1991A,在房缺、室缺和PDA中均有存在。在房缺和室缺患者中发现PTPN11多态性1个,位于3号染色体的F19L。46个筛查对象中未发现TBX5基因突变和多态性。基因突变患者的临床表型与非基因突变者比,症状和体征的严重程度、发病年龄均无明显差异。结论 EVC基因是江西地区间隔缺损患者的常见致病基因。突变患者的临床症状严重程度与非突变者相比无差异。由于是基因筛查工作中的前期结果,还需要后期工作中进一步增大样本量,以便对先心病患者基因型和表型的关联研究加以客观分析。     

DDIT4基因在结直肠癌组织中的突变及其临床意义

目的探讨DDIT4基因突变在的临床意义。方法应用PCR-直接测序方法检测23份结直肠癌（CRC）、22份结直肠腺瘤（CRA）和18份正常结直肠粘膜组织中DNA损伤诱导转录子4（DDIT4）基因突变情况。结果 CRC标本中共发现两类杂合性突变,均位于DDIT4基因的第2外显子。其中1例为15密码子TCT→ACT,即丝氨酸变为苏氨酸;3例为68密码子GAA→AAA,即谷氨酸变为赖氨酸。22份CRA和18分正常黏膜中均未检测到这两类突变。DDIT4基因在CRC中的基因突变率显著高于CRA和正常组织,P〈0.05。结论 DDIT4基因突变在诱导CRC细胞凋亡过程中发挥一定作用。     

野生型和A294G突变型血管紧张素转换酶2基因真核表达质粒构建与鉴定

目的构建人野生型和突变型（A294G）血管紧张素转换酶2（angiotensin converting enzyme2,ACE2）基因真核表达载体。方法采用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）方法扩增人ACE2基因,与pcDNA3．1真核表达载体连接,构建pcDNA3．1-hACE2重组质粒,通过酶切和测序进行鉴定;以此野生型ACE2真核表达载体为模板,在pyrobestDNA高保真聚合酶的作用下利用体外定点突变法构建ACE2基因突变型重组质粒,用DpnI限制性内切酶处理聚合酶链反应产物,直接转化DH5a感受态细胞,挑取克隆并提取相应质粒,测序加以验证。结果测序结果证实,野生型和突变型ACE2基因分别插入到pcDNA3．1＋中,野生型ACE2基因序列与NCBI网站人ACE2基因全长编码序列（NCBI参考序列：NM_021804．2）相应片段一致,突变型（A294G）ACE2基因除第294位碱基A被G替代以外,其余序列与野生型一致。结论成功构建了人野生型和突变型ACE2的真核表达质粒,为下一步研究突变型ACE2的生物学功能以及ACE2在疾病发病机制中的作用奠定了基础．     

毛细管电泳和聚丙烯酰胺电泳法检测肺癌组织p53基因突变效果分析

目的筛选检测肺癌组织p53基因突变的优良方法，为临床早期诊断肺癌提供依据。方法分别运用毛细管电泳（CE）与聚丙烯酰胺电泳（PAGE）-限制性片段长度多态性（RFLP）两种方法对38例肺癌及癌旁正常组织p53基因第249位密码子点突变进行检测。结果RFLP—CE可检测到p53基因第249位密码子的野生型26bp片段，用时〈20rain；RFLP—CE和RFLP-PAGE均能检测到基因突变，对29例非小细胞肺癌组织p53基因第249位密码子检测的突变率分别为31．03％（9／29）、20．69％（6／29），P〈0．05。结论RFLP-EE可为大规模进行肺癌的早期诊断提供简便可靠的方法。     

TRβ基因突变致甲状腺激素抵抗综合征

目的 研究一甲状腺激素抵抗综合征家系的甲状腺激素受体β( thyroid hormone reecptorβ)的基因突变情况.方法 提取患者及其家系5名成员的外周血基因组DNA,PGR分段扩增TRβ基因1-10号外显子,产物直接进行DNA测序检测突变位点.结果 测序结果显示,该家系中有2名成员TRβ基因第10外显子1642位核苷酸发生C转换为A的错义突变,使该位点所编码的氨基酸由脯氨酸变为苏氨酸(P453T),此种突变为杂合子突变.结论 经基因测序检测诊断证实患者TRβ基因第10外显子存在P453T突变,该突变可能导致了甲状腺激素抵抗综合征发生.     

中国法乐四联症患儿HEY2基因突变筛查的初步研究

目的探讨中国法乐四联症患儿HEY2基因突变的情况。方法应用递减聚合酶链反应方法及DNA测序技术，对我院52例非综合征型法乐四联症患儿及50例健康人HEY2基因5个外显子及其侧翼序列进行直接测序，并分析HEY2基因突变的情况。结果在HEY2基因的全部5个外显子中，未发现可引起氨基酸序列改变的突变位点，但我们发现了2个新的杂合性突变位点：1例患者的cDNA621位碱基为A—T杂合性突变，3例患者及3例健康对照的cDNA222位碱基存在一个T—G杂合性突变，但上述两个突变均为同义突变，不影响蛋白质序列。结论HEY2基因可能不是中国法乐四联症发病的相关基因。     

海南恶性疟原虫分离株Pfcrt和Pfmdr1基因点突变的研究

目的 分析海南省恶性疟原虫分离株氯喹抗性转运蛋白编码基因(Pfcrt)及其P-糖蛋白同系物1（Pgh1)编码基因(Pfmdr1)的点突变特征， 为探讨抗性分子标记用于氯喹抗性监测提供参考。 方法 采用巢式PCR（nested-PCR）和限制性酶切片段长度多态性（RFLP）方法， 检测Pfcrt基因编码第76位氨基酸的密码子和Pfmdr1基因编码第86、1246位氨基酸的密码子发生点突变情况。按世界卫生组织（WHO）推荐的体外微量法测定恶性疟原虫对氯喹的敏感性。 结果 检测的36份血样中， 28份成功扩增Pfcrt基因， 导致第76位氨基酸由赖氨酸（K）变为苏氨酸（T）的突变型占64.3%， 混合型占14.3%， 野生型占21.4%； 29份成功扩增Pfmdr1基因， 导致第86位氨基酸由天冬酰胺（N）变为酪氨酸（Y）的突变型占3.4%， 混合型占6.9%, 野生型占89.7%。未发现编码第1246位氨基酸的密码子发生点突变。体外氯喹敏感试验结果显示, 72.2%(26/36)分离株存在抗性。 治疗前恶性疟原虫Pfcrt 76T突变发生率在体外微量测定法显示的氯喹抗性与敏感株中的差异有统计学意义（P＜0.05）， 而Pfmdr1点突变发生率在氯喹抗性与敏感株中的差异无统计学意义（P＞0.05）。 结论 恶性疟原虫Pfcrt 基因76T可以作为监测氯喹抗性的一个分子标记。     

先天性心脏病相关HAND1基因新突变研究

目的:研究先天性心脏病(congenital heart disease,CHD)相关HAND1基因新突变。方法:入选CHD患儿136例及健康对照儿童200名,抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应测序筛查HAND1基因突变。应用计算机软件评估突变氨基酸的保守性并预测突变的致病性,应用双荧光素酶报告基因分析系统分析突变对HAND1功能的影响。结果:在1例法洛四联征患儿发现1种新的HAND1基因杂合突变,其编码核苷酸序列第389位的胸腺嘧啶突变为鸟嘌呤(c.389TG),相应氨基酸序列的第130位亮氨酸变为精氨酸(p.L130R)。该突变改变了进化上保守的氨基酸序列并被预测为有致病性,功能研究揭示突变型HAND1的转录激活功能显著降低。结论:该HAND1基因功能缺失性新突变可能是CHD的少见分子病因。     

耐亚胺培南铜绿假单胞菌外膜蛋白D基因突变检测

目的探讨耐亚胺培南铜绿假单胞菌临床分离株外膜蛋白D（oprD）基因突变与耐药关系.方法应用随机扩增DNA多态性分析（RAPD）技术对10株耐亚胺培南铜绿假单胞菌临床分离株进行DNA分型,并对不同克隆耐药株oprD基因编码区进行全基因扩增测序和金属酶检测.结果 10株耐亚胺培南铜绿假单胞菌均不产金属酶,可分为4个不同克隆.与X63152序列比较,所有耐药菌株oprD基因发生显著变异,变异率大于50%.30、11、9、20、31号克隆株编码区276～387 bp之间发生多处点突变,其中308 bp G→C突变使其编码的苏氨酸被丝氨酸代替,344 bp C→A突变使其编码的赖氨酸被苏氨酸代替,393～412位有20 bp DNA片段缺失,其后的核苷酸序列发生移码突变.13、21号克隆株编码区264～273位有10 bp DNA片段缺失,产生移码突变,形成终止密码子TAA（319～321 bp）.1号克隆株和22号克隆株oprD基因分别发生大片段的碱基置换和多处点突变,变异率分别为54.03%和74.89%.结论耐亚胺培南铜绿假单胞菌临床分离株oprD基因变异具有多样性.     

Brugada综合征SCN5A基因的三个新突变

目的 研究Brugada综合征相关基因SCN5A突变情况。方法 以4例Brugada综合征患者和9例临床可疑Brugada综合征患者为研究对象,采用聚合酶链反应和双脱氧末端终止测序法对所有患者进行SCNSA基因扫描。对阳性结果者进行家系中其他成员的筛查。结果 在1个Brugada综合征家系发现两个杂合突变,即SCN5A基因第3外显子上发现一错义突变（G283A）,导致代表缬氨酸残基的第95位密码子突变为异亮氨酸残基（V95I）,第28外显子上也发现一错义突变（CA946T）,导致代表丙氨酸的第1649位密码子突变为缬氨酸（A1649V）。在1个临床可疑Brugada综合征家系发现一杂合突变,即SCN5A基因第28外显子缺失3个碱基（TCT）,导致代表苯丙氨酸残基的第1617位密码子缺失（delF1617）。结论 在Brugada综合征患者发现了3个SCN5A基因新突变（V95I、A1649V、delF1617）。     

先天性心脏病相关GATA5基因突变研究

目的:识别先天性心脏病(CHD)相关GATA5基因新突变。方法:收集100例无血缘关系的CHD患者和200名无血缘关系且种族匹配的健康对照者的临床资料和血标本。抽提基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增GATA5基因的编码外显子及其剪接位点,采用双脱氧核苷链末端合成终止法对全部扩增片段进行测序。将所测的序列与GenBank数据库中的GATA5基因序列进行比对以发现GATA5基因突变。应用多序列比对软件ClustalW评估突变氨基酸的保守性,应用致病性预测软件MutationTaster预测突变的致病性。结果:在2例CHD患者各发现1个新的GATA5基因杂合错义突变,突变率为2%。其中1个是GATA5基因编码核苷酸序列第395位的鸟嘌呤(guanine,G)变为胸腺嘧啶(thymine,T),即c.395G>T突变;另一个是GATA5基因编码核苷酸序列第991位的胞嘧啶(cytosine,C)变为腺嘌呤(adenine,A),即c.991C>A突变。多序列比对显示2种突变氨基酸在进化上均高度保守。致病性预测显示2种突变均有致病性。结论:本研究发现了CHD相关GATA5基因新突变,有助于揭示CHD新的分子机制。     

结核分枝杆菌DNA促旋酶基因突变与耐氟喹诺酮类药物的相关性研究

目的 分析MDR TB结核分枝杆菌临床分离株的DNA促旋酶（gyr）基因突变特点,初步探究MDR-TB对氟喹诺酮类药物耐药与gyr基因突变的相关性.方法 采用最低抑菌浓度（MIC）法筛选MDR-TB,对17株临床MDRTB菌株应用DNA直接测序法检测gyr基因的突变情况,分析细菌基因突变与耐药产生的相关性.结果 Mtb 1株标准菌株（H37Rv）未见gyr A亚单位基因（gyrA）和gyr B亚单位基因（gyrB）基因突变,所有17株临床菌株gyrA均存在95位AGC→ACC.12株耐环丙沙星和左氧氟沙星菌株中,10株gyrA产生了错义突变,突变率为83.3％;突变位点位于89位、90位、91位和94位;1株发生了gyrB突变,突变位点位于500位.耐莫西沙星的9株耐药株中,8株gyrA发生突变,占88.9％.结论 gyrA基因突变是Mtb对氟喹诺酮类药物产生耐药的机制之一;gyrA的错义突变主要发生在第89位、90位、91位、94位密码子上.