蛋白质组和蛋白质组学

(接第 9卷第 3期 )“蛋白质是我们理解细胞功能和疾病过程的核心 ,如果在蛋白质组学方面没有共同的努力 ,基因组学的成果将不会成为现实” .何为蛋白质组和蛋白质组学 .蛋白质组被定义为细胞 ,器官或组织型的蛋白质成分的总称 ,而蛋白质组学是研究这些成分在指定的时间或特定的环境条件下的表达 .蛋白质组学体现了基因组学的工作和它的动态过程 .蛋白质组学可分为表达蛋白质组学 ,研究蛋白质表达的整体变化 .细胞图谱蛋白质组学 ,通过蛋白质复合物的分离系统地研究蛋白质与蛋白质的相互作用 ,在生长 ,疾病和细胞及组织的死亡过程中机体变化…     

蛋白质组学在生殖医学中的应用

蛋白质组学是在人类基因组计划研究发展的基础上形成的新兴学科，蛋白质组主要是指一个基因组、一种生物或一种细膨组织所表达的全套蛋白质，它主要研究蛋白质的特性，包括蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相互作用，在蛋白质水平上了解细胞的各种功能、生理生化及疾病的病理过程等。蛋白质组学集中于动态描述基因调节，对基因表达的蛋白质水平进行定量测定，鉴定疾病、药效对生命过程的影响，以及解释基因表达调控的机制。     

蛋白质组学(Proteomics)——后基因组时代生命科学研究的重点之一

蛋白质组是在研究人类基因组计划 (HGP)完成后的后基因组计划中一个很重要的内容 .基因的主要功能是通过其表达产物蛋白质来完成的 ,而蛋白质亦具有相对独立的修饰、转运和相互间作用的能力、具有对外界因素反应的协调能力 ,有其独特的自身活动规律 ,蛋白质组学研究 ,才能更加贴近对生命现象和生命本质的了解 .蛋白质组学研究不仅对了解生命现象和生命本质有重要意义 ,在疾病诊断、药物基因组研究、药物靶点、药物筛选等方面均有广泛的应用前景 .蛋白质组学是研究细胞内全部蛋白质的表达方式和功能方式的一门学科 .通过蛋白质组学研究 ,从…     

血浆蛋白组学技术及其应用进展

生命的各项活动都依赖于蛋白质,蛋白质是机体各种功能的执行者。蛋白组学（proteomics）为“一种细胞、组织或有机体所表达的全部蛋白质”,已经成为当今生命科学研究领域的重点。2001年的Science杂志已把蛋白质组学列为六大研究热点之一,其“热度”仅次于干细胞研究,也被誉为生命科学中的分析化学。     

蛋白质组学在肿瘤诊断及治疗中的进展

蛋白质组(proteom e)指的是由一个基因组表达的全部蛋白质,由马克.威尔金斯(M arc W ilk ins)于1994年首先提出,旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式,鉴定蛋白质的存在方式(修饰形式),研究其结构、功能、定量和相互作用等。蛋白质组学研究的技术主要有双向凝胶电泳技术(2-DE),质谱技术(MS),以及生物信息学技术。目前认为恶性肿瘤的发生是由环境与遗传因素相互作用而导致许多基因突变,从而导致蛋白质的表达、结构和功能改变。蛋白质组学在肿瘤高危人群的筛选,肿瘤标志物的鉴定,肿瘤细胞的蛋白质分子变化的分析,以及肿瘤的预防、…     

蛋白质学(Proteome)和蛋白质组学(Protemics)(2)

蛋白质组学是在人类基因组计划 (ＨＧＰ)研究发展的基础上形成的交叉学科 ,主要是从整体水平研究细胞内蛋白质的组成及其调控、活动规律 .蛋白质组的研究不仅为生命活动规律提供物质基础 ,探索生命奥秘也为某些疾病发生发展机理的阐明和解决途径提供理论根据 .通过对个体生理或病理的蛋白质组分析比较 ,可以找到“疾病特异性的蛋白分子———可提供疾病的早期诊断的分子标志 ,又可成为新药物设计的分子靶点 .质白质组学和药物蛋白组学　蛋白质组学研究迅速地向“纵深”发展 ,研究项目在大规模地增长 ,本期介绍了蛋白质的折叠方式过程与疾病…     

凋亡相关蛋白(eIF-5A)-双向电泳分离、编码基因克隆和表达、多抗制备

蛋白质组是指特定细胞、组织或生物体在特定时间所表达的全部蛋白,对其进行分析的学科被称为蛋白质组学。在蛋白质组学的诸多研究方法中,出现最早且目前仍能提供蛋白质组分析所要求的高分辨率的唯一技术,是双向电泳(2-D PAGE),由于其可提高分辨率、重复性和简易性良好,已成为蛋白质组研究的核心技术。2-D PAGE用于蛋白质组蛋白表达的全面分析时,能够分离特定细胞和组织中成百上千的蛋白形式(包括翻译后的变异体)。本研究中,我们以     

基因组医学、染色体组和人类疾病基因(7)

细胞信号转导(Signal Transduction)的研究是当前细胞生命活动研究的重要课题.细胞信号转导蛋白质组学是功能蛋白质组学的重要组成部分.     

差异表达蛋白质的分离鉴定及其应用

蛋白质组（proteome）的概念由Wilkins和Williams于1994年首先提出。它源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合,指一个基因组（genOME）或一个细胞、组织表达的所有蛋白质（PROTein）。蛋白质组学（proteomics）是以蛋白质组为研究对象,阐释所有蛋白质在不同时空的表达谱和功能谱,全景式地揭示生命活动的本质,特别是人体健康与疾病的机制。     

信号转导的功能蛋白质组学研究

随着人类基因组图谱的完成、蛋白质组学技术的飞速发展以及用于蛋白质鉴定的生物信息学的不断完善,蛋白质组学研究已经成为鉴定疾病相关标记和治疗靶点的有效工具。根据研究目的和研究手段的不同,蛋白质组学又分为表达蛋白质、结构蛋白质和功能蛋白质组学。表达蛋白质组学研究细胞内表达的蛋白质种类,双向凝胶电泳是主要的研究方法。     

蛋白质组学在肺癌研究中的应用进展

蛋白质组学(proteomics)指的是在大规模水平上研究细胞内动态变化的蛋白质的翻译后修饰、组成与表达水平,探究蛋白质之间的相互作用,揭示蛋白质功能与细胞活动规律的学科.蛋白质组学技术主要包括蛋白质的分离、质谱鉴定及生物信息学等技术.     

基因组医学、染色体组和人类疾病基因（7）

细胞信号转导(Signal Transduction)的研究是当前细胞生命活动研究的重要课题．细胞信号转导蛋白质组学是功能蛋白质组学的重要组成部分．系统地研究多条细胞信号转导通路中蛋白质及蛋白质问相互关系及其作用规律、细胞信号转导通路网络化，其作用模式、通路、功能机制、调控多样化．细胞信号转导结构、功能、途径的异常在癌症、心血管疾病、糖尿病和大多数疾病中起重要作用。     

比较蛋白质组学在肝癌研究中的进展

随着人类全基因组计划的完成,生命科学的研究重点由基因转移到蛋白质上来,蛋白质组学(proteomics)应运而生.后者以蛋白质组为研究对象,以全面蛋白质的性质为研究基础,在蛋白质水平探讨对疾病机制、细胞模式和功能联系的科学[1].采用高分辨率的蛋白质分离手段,结合高通量的蛋白质鉴定技术,全面研究特定情况下蛋白质的表达谱.蛋白质具有动态性、多样性、时间性、空间性和特异性,其合成受多因素的调控.不同的组织细胞蛋白质的合成、表达的种类和数量有很大的差异,即使细胞发育的不同阶段,其蛋白质组的构成也在不断的变化.因此,蛋白质组是在空间和时间上动态变化着的整体,分析不同条件下蛋白质组的变化,发现和鉴定不同生理条件下蛋白质组的成分差异,是比较蛋白质组学的研究内容[2,3],即比较不同蛋白质组之间蛋白质在表达数量、表达水平和修饰状态上的差异.本文就比较蛋白质组学及其在肝细胞癌研究中的进展进行综述.     

编者栏

蛋白质学 (Ｐｒｏｔｅｏｍｅ)和蛋白质组学 (Ｐｒｏｔｅｏｍｉｃｓ) (1 )蛋白质组学是在人类基因组计划 (ＨＧＰ)研究发展的基础上形成的交叉学科 ,主要是从整体水平研究细胞内蛋白质的组成及其调控、活动规律 人类基因组序列图的完成 ,人类了解了自身生命的遗传信息 ,为了破译这些信息 ,揭示生命活动的规律 ,生命科学的重点转移到以阐明人类基因组整体功能为目标的功能基因组学方面 蛋白质是生命活动中多种功能的体现者 ,蛋白质组成为功能基因组中最前沿的领域 人类细胞中的全部基因称为基因组 ,由基因编码控制的全部蛋白质相应称为蛋白…     

“医学生物信息学专题杂志”专栏

基因组医学、染色体组和人类疾病基因 (7)细胞信号转导 (SignalTransduction)的研究是当前细胞生命活动研究的重要课题 .细胞信号转导蛋白质组学是功能蛋白质组学的重要组成部分 .系统地研究多条细胞信号转导通路中蛋白质及蛋白质间相互关系及其作用规律、细胞信号转导通路网络化 ,其作用模式、通路、功能机制、调控多样化 .细胞信号转导结构、功能、途径的异常在癌症、心血管疾病、糖尿病和大多数疾病中起重要作用 .对细胞信号转导机制的了解 ,已成为创新药物、防病治病的关键 .细胞信号转导不是一门单一学科 ,而是多种学科 ,如细胞学、生…     

蛋白质组学研究技术及其联合应用

蛋白质组学是研究细胞、组织和器官内所有蛋白质的组成及其动态变化的科学,是在蛋白质水平上定量的、动态的、整体的研究生物体。目前蛋白质组学技术分为样品制备、分离和鉴定3个方面,其新技术主要有激光捕捉显微解剖法、离心超滤法、双向凝胶电泳、同位素亲和标签技术、色谱技术以及质谱技术等。然而,任何一种蛋白质组学研究技术都有其缺陷。因此多种技术的联合应用能使蛋白质组研究更精确和完整,是蛋白质组学的发展趋势。     

蛋白质组和蛋白质组学

“蛋白质是我们理解细胞功能和疾病过程的核心 ,如果在蛋白质组学方面没有共同的努力 ,基因组学的成果将不会成为现实” .现在人类的基因组已被排序 ,我们要面对更大的挑战 ,利用这方面的信息来提高卫生保健和发现新的药物 .现在蛋白的基因表达技术日益受到关注 ,因为DNA序列的信息仅仅提供了细胞利用蛋白质的各种不同方式的静止快相 ,而细胞的生命是一种动态的过程 .在这种背景下 ,DNA或RNA(核糖核酸 )序列是不足以清晰地确认治疗目标的 ,因为蛋白质才是药物作用模式的基础而不是DNA或RNA .结构基因组学决定了蛋白质 ,RNA和其它生…     

规模化蛋白质相互作用的研究技术

蛋白质相互作用既是蛋白质执行功能的主要方式,也是细胞功能调控网络的结构基础.蛋白质间异常的相互作用及其连锁网络的紊乱是引起许多病理改变的原因.作为功能基因组和蛋白质组研究的重要内容,规模化蛋白质相互作用研究已成为近年国际上研究的热点之一.文章综述了当前规模化蛋白质相互作用研究中的常用技术和常用蛋白质相互作用数据库,研究者可根据研究需要和技术特点利用这些资源.     

细胞培养稳定同位素标记技术与肿瘤标志分子研究

以质谱为基础的定量蛋白质组学分析技术的发展,大大加快了肿瘤标志分子的研究进程。细胞培养稳定同位素标记技术,已成为目前定量蛋白质组学的主要策略之一,它将不同来源或不同状态的细胞分别培养于含轻/重型稳定同位素标记必需氨基酸的培养基中,经过若干次细胞倍增后,稳定同位素按照序列特异的方式,完全掺入到新合成的蛋白质中。通过比较标记前后同一肽段的质谱峰值变化,可以实现对蛋白质的精确定量。它具有样本需求量少、简单、直接、高效及定量准确等特点,不仅可以定性和定量地分析差异表达蛋白质,而且可以分析蛋白质翻译后修饰和蛋白质相互作用,已逐渐成为研究差异蛋白质组的重要工具之一,在肿瘤分子标志研究中发挥重要作用。     

比较蛋白质组学研究与应用进展

蛋白质组学研究细胞内蛋白质组成及其活动规律是对不同时间和空间发挥功能的特定蛋白质群体的研究。通过比较分析不同条件蛋白质组的差异表达,着眼发现和鉴定出有差异的蛋白质或蛋白质群,即比较蛋白质组学。介绍比较蛋白质组学研究内容适用于比较蛋白质组学研究的相关技术及其在疾病研究中的应用进展。