在分子遗传学基础上研制新脊髓灰质炎病毒疫苗

本文报道用电子计算机分析3个型的脊髓灰质炎病毒(PV)Sabin疫苗株和Ⅰ型Mahoney株[PVI(M)]毒粒RNA全部核苷酸序列的结果,并讨论病毒的基因结构与其生物学性质之间的关系。病毒基因组序列分析方法:从纯化的PV毒粒RNA合成病毒基因组的双链cDNA,经HindⅢ酶处理,并嵌入到PBR322克隆载体的适宜位置,筛选克隆,用Maxam等法测定克隆cDNA核昔酸序列,对非克隆DNA基因组的5′末端序列也作了测定。结果:Ⅰ型脊髓灰质炎Sabin株[PV1(sab)]的毒粒RNA分子有7,441个核苷酸长度,PV2(sab)有7,439个,PV3(sab)有7,434     

CYP1A1基因cDNA全长的T载体克隆及序列分析

目的构建含KpnI、XhoI双酶切位点的人细胞色素(CYP1A1)基因cDNA全长的pGEM-T载体,为以后的亚克隆和毒理学研究提供实验材料。方法从培养的人乳腺癌细胞(MCF-7)中抽提总RNA,RT-PCR扩增CYP1A1基因cDNA全长,与pGEM-T载体连接后转化DH5α,筛选阳性克隆,抽提重组质粒并进行PCR及酶切鉴定,再行测序分析。结果重组质粒pGEM-T-1A1 PCR后获得了1 568 bp产物,酶切鉴定证实目的片段成功插入至pGEM-T,测序分析也进一步证明了目的片段与GeneBank中CYP1A1mRNA的序列同源性为99.9%。结论成功地构建了含CYP1A1基因cDNA全长区域的T载体。     

人再生肝脏蛋白磷酸酶-3基因的克隆与测序

目的:从人结肠癌肝转移病灶标本中提取染色体RNA,PCR扩增及克隆人PRL-3基因.方法:收集人结肠癌肝转移标本,提取总RNA,逆转录为cDNA,PCR扩增PRL-3序列,A-T克隆于pMD-18T载体中,转化大肠杆菌JM109株,提取质粒,对重组质粒进行酶切与测序鉴定.结果:通过酶切、PCR与测序三种方法证实所获得的基因片断为PRL-3基因.结论:克隆到序列正确的人源性PRL-3基因,为实现PRL-3基因的高效表达及制备相应抗体奠定了基础.     

人再生肝脏蛋白磷酸酶-3基因的克隆与测序

目的:从人结肠癌肝转移病灶标本中提取染色体RNA,PCR扩增及克隆人PRL-3基因.方法:收集人结肠癌肝转移标本,提取总RNA,逆转录为cDNA,PCR扩增PRL-3序列,A-T克隆于pMD-18T载体中,转化大肠杆菌JM109株,提取质粒,对重组质粒进行酶切与测序鉴定.结果:通过酶切、PCR与测序三种方法证实所获得的基因片断为PRL-3基因.结论:克隆到序列正确的人源性PRL-3基因,为实现PRL-3基因的高效表达及制备相应抗体奠定了基础.     

hPARP-1基因cDNA翻译起始区域的T载体克隆

目的 克隆及构建含限制性内切酶位点BamHⅠ、SacⅠ的人聚腺苷二磷酸核糖聚合酶-1(hPARP-1)基因cDNA翻译起始区域的pGEM-T-S载体，为以后的亚克隆和毒理学研究提供实验材料。方法 采用RT-PCR方法，用正常人胚肺成纤维细胞(HLF)抽提的总RNA逆转录成cDNA，再以cDNA为模板，扩增hPARP-1基因片段，并直接与T载体连接后转化大肠埃希菌DH5α，用蓝(白)斑试验筛选出阳性克隆，抽提重组质粒并进行PCR及酶切鉴定，再行序列分析。结果 经RT-PCR获得507bp含限制性内切酶位点的阳性产物，T载体克隆、PCR及酶切鉴定和序列分析后证实，克隆片段与Genbank中该基因的序列同源性为99．9％。结论 该实验成功地构建了含hPAR-1基因cDNA翻译起始区域的T载体克隆，为亚克隆及缺陷细胞株的建立提供工具。     

逆转录PCR（RT-PCR）实验操作要点

RT-PCR是将RNA的反转录（RT）和cDNA的聚合酶链式扩增（PCR）相结合的技术。以RNA为模板,首先在依赖于RNA的DNA聚合酶的催化作用下体外合成cDNA的第一条链。以此条cDNA链为模板,又可继续进行PCR。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA．要得到理想的结果．关键是确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染。而确保RNA中无RNA酶和基因组DNA的污染,关键是要做好实验前的准备,注意实验操作的一些细节。     

抗人膀胱癌单克隆抗体重链可变区基因的克隆及原核表达载体的构建

目的 克隆抗人膀胱癌单克隆抗体重链可变区基因(VH),并构建其原核表达载体.方法 从能分泌抗人膀胱癌单克隆抗体的杂交瘤细胞BDI-1中提取总RNA,通过RT-PCR扩增出VH cDNA,用HindⅢ和XhoⅠ酶切纯化的RT-PCR产物和原核表达载体pET28a( ),在T4 DNA连接酶作用下室温连接.重组质粒经酶切鉴定,阳性克隆测序并进行序列分析.结果 扩增出VH cDNA片段,大小约为370bp,重组质粒的酶切鉴定结果与预期一致.VH基因序列长度为366bp,编码122个氨基酸.VH基因属于鼠免疫球蛋白重链Ⅱ亚类.结论 成功克隆出抗人膀胱癌单克隆抗体重链可变区基因,并成功构建其原核表达载体.     

人Prp8蛋白基因片段的克隆

目的：构建人Prp8基因全长真核表达质粒。方法：从HeLa细胞中提取总体RNA,两步法合成cDNA,利用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）法,扩增出人Prp8基因的四段序列,首先克隆至pTZ57R/T载体,再定向克隆至真核表达载体pcDNA3.1（＋）,构建pcDNA3.1（＋）-Prp8重组质粒。结果：RT-PCR法获得Prp8基因的4段序列,长度分别为2025、1090、1966、1963bp,分别与pTZ57R/T载体连接后,选择合适的酶切位点再连接成全长序列,然后将全长序列和pcDNA3.1（＋）真核表达载体连接、转化、酶切鉴定及序列分析后,证实pcDNA3.1（＋）-Prp8重组质粒构建成功。结论：成功克隆了人Prp8的编码基因,并构建了表达载体pcDNA3.1（＋）-Prp8。     

豚鼠钙调蛋白1基因的克隆及序列分析

目的克隆豚鼠钙调蛋白1(CaM1)基因,对所克隆基因进行生物信息学分析。方法从豚鼠心室肌组织提取总RNA,应用RT-PCR方法扩增CaM1基因编码区447bp的cDNA片段,插入克隆载体构建重组质粒后基因测序及序列分析。结果克隆出的基因片段编码CaM1全部149个氨基酸,核苷酸序列与多种哺乳动物相应基因的同源性大于90%。获得了该序列的限制性内切酶酶切位点等信息。结论成功获得了豚鼠CaM1基因编码区序列,为进一步重组表达CaM及其功能研究奠定基础。     

克隆异青霉素N合成酶的纯化与特性

在丝状真菌和链霉菌中,异青霉素N合成酶(简称IPS)是在青霉素和头孢菌素的生物合成中负责将LLD-氨基己二酸-半胱氨酸-缬氨酸(简称ACV)转化成异青霉素N的酶.IPS已经从产黄顶孢霉,产黄青霉和棒状链霉菌中获得提纯并表明具有广泛的底物特异性.产黄顶孢霉和产黄青霉的IPS基因已经在大肠杆菌RV308中被克隆和表达.本文报道克隆产黄顶孢霉IPS的纯化,N-末端序列,动力学及底物特异性的研究.     

蛇足石杉鲨烯合酶HsSQS1基因克隆和序列分析

鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)是植物萜类化合物生物合成途径的关键酶。本研究根据课题组已获得的蛇足石杉(Huperzia serrata)转录组数据中的SQS1转录本序列,设计基因全长扩增引物,利用RT-PCR方法获得蛇足石杉SQS1基因的全长cDNA序列;利用实时荧光定量PCR方法检测了HsSQS1基因在蛇足石杉根、茎、叶中的表达情况;对HsSQS1基因进行生物信息学分析,并预测HsSQS1编码蛋白的结构与功能。研究结果表明,克隆获得的蛇足石杉SQS1基因长为1 263 bp,编码420个氨基酸,命名为HsSQS1,GenBank登录号JQ004938。HsSQS1基因在蛇足石杉的根中表达丰度高于茎和叶。本研究成功克隆并分析了蛇足石杉SQS1的全长序列,为进一步阐明蛇足石杉三萜代谢途径奠定基础。     

人类U5·116 ku蛋白基因片段的克隆

目的:构建人类U5·116 ku基因全长真核表达质粒。方法:从HeLa细胞中提取总体RNA,一步法合成单链cDNA,利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法,扩增出人类U5·116 ku基因两段连续的序列,首先分别克隆至pTZ57R/T载体,两段序列连接成全长后再定向克隆至真核表达载体pcDNA3.1(-),构建pcDNA3.1(-)-U5·116 ku重组质粒。结果:RT-PCR法获得U5·116 ku基因两段连续的序列,长度分别为1672bp和1246bp,分别与pTZ57R/T载体连接后,选择合适的酶切位点再连接成全长序列,然后将全长序列和pcDNA3.1(-)真核表达载体进行连接、转化、酶切鉴定及序列分析后,证实pcDNA3.1(-)-U5·116 ku重组质粒构建成功。结论:成功克隆了人类U5·116 ku的编码基因,并构建了其真核表达质粒pcDNA3.1(-)-U5·116 ku。     

我国近期分离的6株狂犬病病毒的糖蛋白基因序列分析

目的  分析我国近期分离的6株代表性狂犬病病毒（rabies virus,RV）的糖（G）蛋白基因序列,了解RV街毒株与疫苗株在核苷酸和氨基酸序列水平的差异。方法  对6个RV街毒株G基因进行逆转录和PCR扩增,经纯化、克隆、测序后获得6条G基因全长序列,采用生物信息学软件对G基因序列进行分析。结果  6个街毒株的G蛋白在核苷酸水平的同源性为97.7％～100％,在氨基酸水平的同源性为97.9%~100%;与CTN-181疫苗株的核苷酸序列同源性最高,为86.7%~87.2%,氨基酸序列同源性为92.7%~93.1%。结论  6个RV街毒株的G蛋白在核苷酸及氨基酸水平上均有变异,但与CTN-181疫苗株关系最近,表明CTN-181疫苗株可能为我国境内流行的狂犬病提供良好的预防作用。     

表达腮腺炎病毒和猴免疫缺陷病毒抗原的重组麻疹病毒

麻疹病毒 ( MV )是含非节段性负链RNA基因组的包膜病毒。作者构建了一组重组麻疹病毒 ( r MV) ,分别在基因组中不同部位表达腮腺炎病毒 ( Mu V)的 HN或 F表面糖蛋白或猴免疫缺陷病毒 ( SIV)的 env、gag或 pol蛋白。具体方法为 :采用聚合酶链反应法将编码 Mu V的 HN、F糖蛋白以及 SIV的gag、pol、env蛋白的解读框架扩增后 ,分别克隆进载体 P( + ) MPr GFPV(位于 MV P基因下游 )及 P( + ) MHr GFPV(位于 H基因下游 )中 ,得到了一系列不同的含 Mu V及 SIV蛋白基因的真核表达载体。将它们转染 2 93-3- 46辅助细胞系 ,获得 r …     

三七甲羟戊酸激酶PnMVK1基因的克隆和生物信息学分析

药用植物三七通过甲羟戊酸途径(mevalonic acid pathway)合成三萜皂苷生物合成的前体。甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MVK)则是甲羟戊酸合成途径中ATP依赖的限速酶之一。本研究根据课题组已获得的三七[Panax notoginseng(Burk.)F.H.Chen]转录组数据中的MVK1转录本序列,利用RT-PCR方法获得三七MVK1(PnMVK1)基因的全长cDNA序列;对PnMVK1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测了该蛋白的结构与功能;利用实时荧光定量PCR方法检测了PnMVK1基因在三七的根、茎、叶、花中的表达情况。序列分析表明,克隆获得的三七PnMVK1基因长为1 164 bp,编码387个氨基酸,GenBank登录号JQ957844。生物信息学预测PnMVK1蛋白不含跨膜区,不含信号肽,具有GHMP激酶等保守结构域。PnMVK1基因在三七的根中表达丰度最高。本研究成功克隆并分析了三七MVK1的全长序列,为进一步阐明三七三萜代谢途径奠定基础。     

hMSH2基因cDNA保守区域的T载体克隆及序列分析

目的：构建含限制性内切酶位点PstⅠ、KpnⅠ的hMSH2基因cDNA保守区域的pGEM-T-S载体,比较分析序列的变化,为以后的毒理学研究提供实验材料,方法：从人胚肺成纤维细胞HLF中抽提总RNA进行RT－PCR扩增,直接与T载体连接转化大肠杆蓖DH5α,用蓝／白斑试验筛选阳性克隆,抽提质粒进行酶切鉴定,再行序列分析。结果：经RT－PCR获得631bp含量制性内切酶位点的阳性产物,T载体克隆、酶切鉴定及序列分析后证实,克隆片段与genbank中该基因的序列同源性为99．5％。结论本文成功地构建了含hMSH2基因cDNA保守区域的T载体克隆,该克隆可为DNA错配修复缺陷与致癌关系研究提供工具。     

用ssRNA探针检测水中的甲型肝炎病毒和其他肠道病毒

检测饮用水和食物中的甲型肝炎病毒(HAV)和其他肠道病毒需要敏感而特异的方法。将编码HAV和柯萨奇病毒B3(CB3)基因组5′端1个Kb的cDNA克隆亚克隆到T7/SP6 RNA转录载体上,从T7启动子转录的     

人脐静脉内皮细胞Caveolin-1基因沉默模型的建立

目的:利用小干扰RNA(siRNA)技术建立人脐静脉内皮细胞(ECV304)小凹蛋白(Caveolin-1)基因沉默模型,为研究Caveolin-1基因在人脐静脉内皮细胞中的作用.方法:通过Ambion专用软件对Caveolin-1基因编码区分析,设计合成短发夹RNA(shRNA)单链.通过T4连接酶将退火反应合成的shRNA双链克隆入含RNA PollII聚合酶表达元件的pENTRTM/U6入门载体,并利用Gateway技术构建相应的慢病毒RNA干扰(RNAi)表达载体.用REAL-TIME RT-PCR、蛋白印迹法分析沉默效率.结果:测序结果显示pENTRTM/U6载体插入的Cavelin-1基因shRNA序列大小及阅读框架正确.LR重组反应后成功构建了针对Caveolin-1基因的RNAi慢病毒表达系统.转染ECV-304细胞获得对Caveolin-1的沉默效率大于85%.结论:成功地构建了针对Caveolin-1基因的RNAi慢病毒表达系统,获得了长期稳定的基因剔除效应.人脐静脉内皮细胞Caveolin-1基因沉默模型能长期保种及传代,为进一步研究Cav-eolin-1基因的功能奠定了基础.