胰腺癌相关糖尿病的血清蛋白质组学分析

目的 检测胰腺癌相关糖尿病的血清蛋白标志物,并建立诊断模型.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱( SELDI-TOF-MS)技术检测17例胰腺癌相关糖尿病与17例新发2型糖尿病、17例健康对照者血清的差异表达蛋白,用Biomarker Patterns Software 5.0软件建立胰腺癌相关糖尿病诊断模型并验证.结果 在胰腺癌相关糖尿病、新发2型糖尿病,健康者各10例的蛋白指纹图谱中筛选出12个差异表达蛋白峰,其中质荷比为6116、6695、8936 Da的蛋白峰被选为建立胰腺癌相关糖尿病诊断模型的蛋白峰.该诊断模型的诊断正确率为90％.盲法验证各组另7例样本,正确诊断胰腺癌相关糖尿病患者达100％,新发2型糖尿病患者为71％,健康人群为86％.经检索蛋白质数据库,与以上3种差异表达蛋白分子质量最为接近的蛋白分别为金属硫蛋白、胰腺干细胞增殖分化因子和成纤维细胞生长因子 1.结论 通过SELDI方法筛选出3种胰腺癌相关糖尿病的血清蛋白标志物,建立了可靠的胰腺癌相关糖尿病的诊断模型.     

慢性阻塞性肺疾病的血清蛋白质组学研究

目的 利用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption ionizationtime-of-flight mass spectrometrv,SELDI-TOF-MS)技术研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)血清蛋白质指纹图谱.方法 应用SELDI-TOF-MS技术检测30例COPD患者和18名健康人血清蛋白质质谱,筛选出COPD血清差异蛋白.结果 COPD患者血清蛋白图谱与对照组相比,存在25个差异表达蛋白(P<0.05),包括9个高表达蛋白,其中质荷比为2 152、3 287、3 533、3 614、4 924、5 887、6 729的7个蛋白质其含量由对照组、COPD稳定期、COPD急性加重期依次升高(P<0.05);16个低表达蛋白,其中质荷比为4 313、4 380、8 634、8 765、8 842、13 878、14 086的7个蛋白质其含量由对照组、COPD稳定期、COPD急性加蕈期依次升高(P<0.05).经蛋白质数据库搜索,初步确立特定相对分子质量所对应的蛋白.结论 SELDI-TOF-MS技术为研究COPD提供了可行的技术平台,COPD患者血清和对照组血清中存在明显差异蛋白,这些差异蛋白可能与COPD的发生发展密切相关.     

应用SELDI-TOF-MS技术建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型

目的:建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型．方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片获得新发肝癌、肝硬化患者和正常人血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立肝癌的筛选模型．结果:肝癌患者与健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有5个标志蛋白(4477,8943,5181, 8617,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,肝癌患者与肝硬化患者血清蛋白质指纹图谱之间2个标志蛋白(4477,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,1个标志蛋白(4097 Da)在肝癌患者血清中低表达．SELDI-TOF-MS技术的特异性(60／60,100％);敏感度(18／20,90％)．分析系统筛选出4477,8943,13 761,4097 Da标志蛋白建立的肝癌诊断模型．结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分肝癌与非肝癌患者,SELDI-TOF-MS在肝癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值．     

原发性肝癌血清蛋白质谱图人工神经网络诊断模型研究

目的建立早期有效检测原发性肝癌的实验指标。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI—TOF—MS）技术及其配套的金芯片（GoldChip）检测435份血清蛋白质谱数据,并将其分为训练集和验证集两组。训练集用于筛选原发性肝癌的差异蛋白标志物并建立ANN诊断模型,验证集用于模型诊断效度的盲法验证。结果共发现7个有明显表达差异的标志蛋白。用其建立ANN诊断模型对原发性肝癌进行盲法验证,诊断的灵敏度和特异度分别为84．00％和81．25％,受试者工作特征曲线（ROC曲线）下面积（AUC）为0．847,阴性预测值94．20％,阳性预测值58．33％,准确度为81．90％。结论原发性肝癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,据其建立的人工神经网络模型可为原发性肝癌的诊断提供新方法,有重要的参考价值。     

MALDI-TOF-MS技术应用于非肝癌肝病蛋白质组学的研究进展

蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象的一门新兴学科,其研究技术主要包括双向凝胶电泳、质谱（主要包括MALDI-TOF-MS和SELDI-TOF-MS技术）和生物信息学技术。目前我国慢性肝病主要是以乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒感染所导致的慢性肝炎、肝纤维化、肝硬化以及肝癌等为主,蛋白质组学技术在肝癌中的研究较多,而对非肝癌肝病文献较少也比较零散。因此,本文从MALDI-TOF-MS技术在该领域研究应用方面对肝病蛋白质组学研究作一综述。     

应用SELDI-TOF-MS技术建立SLE患者血清蛋白质指纹图谱筛选模型

目的筛选系统性红斑狼疮（SLE）血清蛋白质指纹图谱模型,并探讨其意义。方法用表面加强激光解析电离飞行时间质谱（SEIDI-TOF-MS）技术获得SLE、类风湿关节炎患者（RA组）、健康人群（对照组）血清中的蛋白质谱,用计算机软件比较分析,建立SLE血清蛋白质指纹图谱筛选模型,并验证该模型诊断SLE的灵敏度和特异性。结果SLE组与非SLE组共有11种蛋白质表达有显著性差异;以其中4个蛋白质生物标志物（5 739 Da、10 832 Da、4 650 Da、15 797 Da）组建的筛选模型,经双盲法验证其灵敏度为84.4%,特异性为90.3%。结论应用SEIDI-TOF-MS技术建立的血清蛋白质指纹图谱模型在SLE的早期诊断中具有一定价值。     

用飞行质谱技术筛选肝棘球蚴病患者血清蛋白质组学标记物

目的 筛选肝棘球蚴病患者血清蛋白质组学标记物,建立血清蛋白质指纹图诊断模型,评价其应用价值.方法 肝棘球蚴病患者68例,对照组73例(其他肝病患者33例,健康人40例),将全部样品分为训练组(37例)和测试组(67例).用弱阳离子交换蛋白芯片结合表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测肝棘球蚴病患者和对照者的血清蛋白质谱.分别比较训练组中37例肝棘球蚴患者和37例对照者、5例肝囊型棘球蚴病(HCE)患者和5例肝泡球蚴病(HAE)患者、8例肝棘球蚴病患者手术前后两组血清蛋白质峰的差异.利用ZJU-PDAS软件进行数据处理,通过支持向量机(SVM)运算建立蛋白质指纹图诊断模型,并用测试组标本采用盲法对模型的灵敏度和特异度进行验证.结果 肝棘球蚴病组和对照组共筛选出9个差异蛋白峰,其中相对分子质量为1044、1047、1073、1075、1338、6453、6649、8714 m/z的8个蛋白质峰在病例组中下调,相对分子质量为5651 m/z的蛋白峰在病例组中上调(P<0.05),盲法验证表明所建模型对肝棘球蚴病诊断的灵敏度为77.4%(24/31),特异度为66.7%(24/36);阳性预测值为66.7%(24/36),阴性预测值为77.4%(24/31).HCE和HAE患者之间筛选出2个差异表达蛋白峰,质荷比分别为8716和2751 m/z(P<0.05);8例肝棘球蚴病患者手术前后两组共筛选出6个差异表达蛋白质峰,相对分子质量分别为1297、1505、1525、1534、5921,5941 m/z(P<0.05).结论 SELDI-TOF-MS技术结合生物信息学方法能筛选出肝棘球蚴病患者血清蛋白质组学标记物,对肝棘球蚴病诊断及预后判断具有潜在的应用价值.     

肝癌与肝硬化患者血清及腹水多项指标联合检测的意义

本文选择铁蛋白(FeP)、癌胚抗原(CEA)及甲胎蛋白(AFP)3项肿瘤标志物,对肝癌及肝硬化患者血清及腹水进行检测,现将结果分析报道如下。 材料与方法 一、研究对象 原发性肝癌并腹水患者30例,其中男性26例,女性4例,平均年龄49.2岁;肝硬化并腹水患者30例,其中男性27例,女性3例,平均年龄47.5岁。所有患者均为我院住院患者,经病     

表面增强的激光解析电离飞行时间质谱技术在肝细胞癌血清学诊断中的应用

目的:检测HBV感染携带者与肝细胞癌(HCC)患者血清蛋白质的差异性表达,以发现HCC的肿瘤诊断标志物.方法:用表面增强的激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测27例HCC患者,27例HBV感染携带者,25例健康对照血清中的蛋白质谱,并用Biomarker Patterns System 5．0软件分析,建立诊断模型．结果:检测HCC患者与HBV感染携带者。正常对照与HCC患者,正常对照与HBV感染携带者的差异性蛋白分子,据此构建分类模型,得到的灵敏度和特异度分别为93％,85％; 96％,96％;84％,89％．其中相对分子质量为8141 Da的蛋白峰在HCC组明显高于HBV感染组(p<10-5);相对分子质量为3448 Da的蛋白峰在HCC及HBV感染携带组表达均较正常组显著增高(P<10-5),而在HCC-HBV组无明显差异(P>0．05),提示其可能为HBV感染的一种标志蛋白;相对分子质量为777) Da的蛋白峰在3组中均有差异性表达．结论:SELDI蛋白芯片技术检测血清蛋白质谱法诊断HCC具有较高的灵敏度和特异度,操作简单快捷,临床应用前景广阔,为HCC诊断提供了新的血清学方法．     

SELDI-TOF-MS技术及其在糖尿病研究中的应用

表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱（SELDI-TOF-MS）技术是蛋白质组学的重要检测技术之一，不同性质的芯片能捕获各种不同性质的蛋白质。该技术具有高通量、高灵敏度、自动化等特点，可直接应用于临床，在基础研究和临床应用方面发展迅速。但是，在糖尿病及其并发症的研究中应用不多。本文就其技术原理和目前在糖尿病研究中应用的现状作一介绍。SELDI-TOF-MS技术将为糖尿病及其并发症的研究和防治提供新的平台。     

鳞癌与腺癌患者血清差异蛋白质组分析

目的为鉴定鳞癌与腺癌的血清标志物和病理分型提供依据。方法采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术及其配套的金芯片（Gold Chip）对254份血清（鳞癌120份、腺癌82份,健康人52份）进行蛋白质谱指纹图分析,筛选鳞癌与腺癌的差异蛋白。结果 254份血清共筛选出83个差异表达的蛋白,其中5个差异表达最明显的蛋白质峰的质荷比（m/z）分别为2953、3285、6625、6646、9257。对5个峰强度分别进行F检验,P均〈0.05。结论鳞癌、腺癌患者血清具有明显表达差异的特征蛋白,为癌症的诊断和病理分型研究提供了新思路。     

Analysis of variabilities of serum proteomic spectra in patients with gastric cancer before and after operation

AIM: To study the variabilities of serum proteomic spectra in patients with gastric cancer before and after operation in order to detect the specific protein markers that can be used for quick diagnosis of gastric cancer. METHODS: Proteomic spectra of 46 serum samples from patients with gastric cancer before and after operation and 40 from normal individuals were generated by IMAC-Cu protein chip and surface-enhanced laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry. RESULTS: Fourteen differentially expressed proteins in serum were screened by analysis of proteomic spectra of preoperative patients and normal individuals. We obtained 4 proteins (heat shock protein 27, glucoseregulated protein, prohibitin, protein disulfide isomerase A3) making up marker pattern which was able to class the patient-team and normal-team. These marker patterns yielded 95.7% sensitivity and 92.5% specificity, respectively. The proteins over-expressed in serum of preoperative patients were obviously down-regulated. CONCLUSION: Specific protein markers of gastric cancer can be used for the quick diagnosis of gastric cancer and judgment of prognosis. SELDI-TOF-MS is a useful tool for the detection and identification of new protein markers in serum.     

遗传性非息肉病性结直肠癌血清的蛋白质组学

目的:研究遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)与散发性结直肠癌患者术前血清蛋白质的表达差异,以期发现可用于HNPCC诊断的生物学指标.方法:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术结合蛋白质芯片分别检测20例HNPCC和25例散发性结直肠癌患者术前血清蛋白质组分.将获得的蛋白质谱采用美国C...     

吲哚美辛抗人结肠癌细胞系HCT116的功能蛋白质组研究

目的　探讨吲哚美辛 (IN)对人结肠癌细胞系HCT116蛋白质表达谱的影响及其抗结肠癌的作用机制。方法　应用固相 pH梯度双向凝胶电泳 (2 DE)技术分离IN治疗组和对照组HCT116细胞的总蛋白 ,银染显色 ,采用ImageScan扫描获取电子图像 ,ImageMaster 2D图像分析软件分析 2组的2 DE图谱并识别差异表达的蛋白质。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI TOF MS)得到相应的肽质量指纹图谱 ,分析并鉴定差异蛋白质。结果　获得了背景清晰、分辨率高、重复性好的HCT116细胞系 2 DE图谱 ,对照组蛋白质点数为 12 99± 5 5 ,其匹配率为 94 .2 % ;IN治疗组蛋白质点数为 12 0 8± 4 7,其匹配率为 91.0 %。两组共有 4 5个差异蛋白质点 ,其中 ,治疗组有 9个蛋白质点表达上调 ,34个蛋白质点表达下调 ,2个蛋白质点仅在对照组表达。对差异蛋白质点进行了肽质指纹图分析发现 ,IN可通过BfL 1蛋白诱导HCT116细胞凋亡 ,并鉴定出一些与细胞凋亡、细胞周期及信号转导相关的蛋白质。结论　IN可通过BfL 1等多种途径诱导HCT116细胞的凋亡并抑制其增殖。     

SELDI-TOF MS技术在胰腺癌早期诊断中的应用

胰腺癌是目前预后最差的恶性肿瘤,早期诊断被认为是改善胰腺癌预后的重要出路之一.表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI- TOF MS)技术,是近年来发展起来一种新的高通量蛋白质组学研究方法,本文就SELDI-TOF MS技术相关的原理、特点,在胰腺癌早期诊断中的应用新进展和未来的发展趋势作一综述.     

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱快速鉴定沙门菌临床分离株

目的评估基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在沙门菌鉴定中的临床应用,并研究其影响因素。方法用传统血清学方法鉴定沙门菌的血清型,用MALDI-TOF MS对哥伦比亚血平板、HE平板、SS平板和麦康凯平板分别培养24h、72h、120h和168h的179株沙门菌进行鉴定。结果 179株沙门菌可分为38种血清型,肠炎沙门菌(21.2%)、斯坦利沙门菌(17.3%)和Ⅰ4,5,12:i:-沙门菌(16.2%)居前3位。所有菌株在血平板、HE平板、SS平板和麦康凯平板分别培养24h和72h均能被MALDI-TOF MS准确鉴定为沙门菌。MALDI-TOF MS的耗材成本约为微生物自动生化鉴定系统(Vitek 2)的1/3,检测时间约为Vitek 2的1/7。结论在血平板、HE平板、SS平板和麦康凯平板培养3d以内的沙门菌,MALDI-TOF MS均可以准确鉴定。与Vitek 2相比,MALDI-TOF MS检测的速度更快,消耗的成本更低,并且可以直接鉴定生长在选择性培养基的沙门菌。     

HBV相关性肝细胞癌及肝硬化患者外周血单个核细胞质谱分析

目的:建立HBV相关性肝细胞癌(HCC)及肝硬化(LC)患者外周血单个核细胞(PBMC)的双向凝胶电泳图谱,并识别鉴定其差异表达的蛋白质.方法:利用固相pH梯度双向凝胶电泳分离HBV相关性HCC(n=16)及LC患者(n=12)PBMC的总蛋白质,凝胶经蓝银显色后,PDQuest图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)得到相应的肽质指纹图谱,然后搜索数据库鉴定部分差异蛋白质点.结果:得到了分辨率较高、重复性较好的HBV相关性HCC及LC患者PBMC双向凝胶电泳图谱,HBV相关性HCC及LC患者PBMC凝胶的平均蛋白质点数分别为1186±43及1013±41;组内的平均匹配率分别为91.6%,90.2%.对27个差异蛋白质点进行了质谱分析,鉴定出16个蛋白质,在HBV相关性HCC患者PBMC中表达明显增强的有热休克蛋白质(HSP)27、ras癌基因家族(RAB14)、肌动蛋白、α1-抗胰蛋白及RNA结合蛋白调节亚基等13个蛋白点;而PDX6、HSPA8及锰超氧化物歧化酶(MnSOD)在HCC患者PBMC中低表达.这些差异蛋白质点包括蛋白质合成与分解、分子伴侣、解毒和DAN修复相关蛋白质、三大代谢相关酶类、细胞结构相关蛋白质以及信号传导相关蛋白质六类.结论:建立了分辨率高且重复性较好的HBV相关性HCC及LC患者PBMC双向凝胶电泳图谱,并识别鉴定出了一些与HBV相关性HCC癌变相关的差异表达的蛋白质.