基于TCGA数据库分析TUBA1C在肺腺癌中的表达及临床意义

目的 研究α-微管蛋白特异性1 c链(TUBA1 C)在肺腺癌组织中的表达及临床意义.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载535例肺腺癌组织与59例癌旁组织RNA-seq数据及对应患者的临床资料;比较其表达与肺腺癌患者临床特征的相关性及对预后的影响;Cox风险比例模型评估肺腺癌患者预后的危险因素.结果 与癌旁组...     

基于生物信息学分析WNT7B基因在肺腺癌中的表达及其临床意义

目的:基于生物信息学分析WNT7B基因在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。方法:应用生物信息学方法评价WNT7B在LUAD中的诊断和预后预测价值。通过TCGA、GEO数据库研究WNT7B基因在肺癌中表达情况,并分析WNT7B基因在肺癌和非癌组织中表达差异及其表达与生存率、免疫细胞浸润之间的关系。应用STRING数据库筛选共表达基因并构建调控网络,将共表达基因进行基因本体论(GO)以及京东基因和基因组(KEGG)富集分析,同时应用cBioportal探究WNT7B基因突变对肺癌患者生存期的影响。结果:与正常肺组织相比,LUAD组织中WNT7B基因表达水平明显升高(P<0.01),WNT7B基因作为标志物的灵敏度为0.628。K-M生存分析显示,高表达WNT7B组预后较差(P<0.05)。GSEA揭示了5条与WNT7B基因相关的信号通路,WNT7B基因突变的LUAD患者总生存期(P=0.035 8)的预后预测作用不佳。此外,还发现WNT7B基因表达与免疫显著相关。结论:WNT7B基因有望成为LUAD诊断、预后评估和治疗的新靶点,但仍须进一步开展临床相关研究。     

基于TCGA和GEO数据挖掘分析PRC1在肺腺癌中的表达及预后意义

目的探讨肺腺癌（LUAD）组织中胞质分裂蛋白调节因子1（PRC1）的表达及其对LUAD患者预后的影响。方法通过肿瘤免疫评估资源（TIMER）数据库分析PRC1mRNA在33种肿瘤中的表达情况,并用人类蛋白质图谱（HPA）数据库的免疫组化结果验证PRC1蛋白在LUAD中的表达。通过肿瘤基因图谱（TCGA）和基因表达综合（GEO）数据库获得PRC1在LUAD中的表达数据及相关临床特征参数,分析PRC1mRNA表达水平与LUAD患者的临床特征、总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）的关系。采用基因集富集分析（GSEA）预测PRC1相关的基因通路。结果TIMER数据库分析结果显示,17种肿瘤组织中PRC1mRNA表达水平均高于正常对照组织。TCGA数据库、GSE31210和GSE75037数据集结果提示,LUAD组织中PRC1mRNA表达水平均明显高于正常对照组织或癌旁正常组织,差异均有统计学意义（均P＜0.01）。HPA数据库的免疫组化结果提示,PRC1蛋白在LUAD组织中呈高表达。TCGA数据库分析结果提示,PRC1mRNA表达水平与LUAD患者的性别、吸烟、T分期、N分期和TNM分期均有关（均P＜0.01）。TCGA数据库、GSE31210和GSE68465数据集结果提示,除GSE68465数据集中的PFS外,其余PRC1高表达组患者PFS和OS均差于低表达组（均P＜0.05）。单因素和多因素Cox分析表明,PRC1mRNA表达水平是影响LUAD患者OS和PFS的独立危险因素（均P＜0.05）。GSEA结果提示,PRC1高表达样本富集在有丝分裂纺锤体、G2M检查点、E2F信号通路、DNA修复等基因集中。结论LUAD中PRC1mRNA表达水平上调,PRC1高表达提示LUAD患者的预后差,可作为LUAD患者治疗的潜在靶点。     

膜联蛋白Ⅰ在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：检测肺腺癌组织中膜联蛋白Ⅰ（annexinⅠ,Anx-A1）的表达水平,探讨其临床意义。方法：采用免疫组化法检测40例肺腺癌及其相应癌旁正常组织中AnnexinⅠ表达水平,分析不同性别、年龄,不同分期、不同分化程度肺腺癌组织中的表达水平及其与临床病理分期、分化程度的对应关系。结果：40例肺腺癌组织中,32例（80.0%）AnnexinⅠ高表达;主要为包膜表达或包膜与胞浆均有表达,但以包膜表达为主。AnnexinⅠ表达水平与性别、年龄均无明显相关性（P〉0.05）。肺腺癌组织中AnnexinⅠ表达水平均高于癌旁正常组织,在低分化肺腺癌组织中的表达水平高于中、高分化肺腺癌组织,差异具有统计学意义（P〈0.05）。AnnexinⅠ在Ⅰ、Ⅱ期肺腺癌组织和Ⅲ、Ⅳ期癌组织中表达水平的差异无统计学意义（P〉0.05）。结论：AnnexinⅠ在肺腺癌中表达上调,特别是在低分化肺腺癌组织中尤为明显,可能与肺腺癌的发生、发展相关,对确定肺腺癌的恶性程度及制定治疗方案有所帮助。     

基于数据挖掘及免疫组织化学技术分析EPHA5在肺腺癌中的表达

目的 探索促红细胞生成素产生型人肝细胞受体A5(erythropoietin-producing hepatocellular receptor A5,EPHA5)在肺腺癌中的表达。方法 通过网络数据库获得EPHA5在不同肿瘤中的变异情况,构建EPHA5蛋白互作网络图,分析EPHA5在肺腺癌中的预后情况。收集肺腺癌患者的手术标本及临床资料,采用免疫组织化学方法检测EPHA5的表达情况,分析肺腺癌中EPHA5表达与患者临床特征的相关性。结果 EPHA5在肺腺癌中的突变频率最高,以错义突变为主。除EPH家族的配体之外,EPHA5与RhoA、ADAM10蛋白密切相关。EPHA5的高表达与肺腺癌患者的总生存时间和首次进展时间相关。EPHA5在肺腺癌组织中表达上调,与患者淋巴结转移、分化程度、TNM分期显著相关。结论 EPHA5在肺腺癌组织中高表达,可以作为预测肺腺癌预后的一个因素。     

基于数据库分析ASF1B在胃癌中的表达与预后的关系

〔目的〕研究ASF1B基因在胃癌中的表达水平,进而分析ASF1B基因表达水平与预后的关系.〔方法〕从TCGA(the cancer genome atlas)数据库和GEO(Gene ExPession Omnibus)数据库中下载胃癌的RNA?seq和临床数据;分析TCGA数据库中ASF1B在胃癌组织与癌旁组织的差异表达;采用KaPlan?Meier方法分析GEO数据库和TCGA数据库中ASF1B表达量与患者总生存期的关系,并采用COX回归分析基因表达和其他临床相关因素与预后的关系;应用GSEA软件分析ASF1B在胃癌中的作用通路;绘制预后相关列线图并计算C?指数.〔结果〕胃癌组织中ASF1B的表达量显著高于癌旁组织;K?M生存分析显示ASF1B低表达的总生存率较差,多因素COX分析表明ASF1B为患者总体生存率的独立预后因素,验证集显示相似的结果,绘制列线图预测胃癌患者1a、2a、3a的生存率并验证C指数表明模型准确度良好;ASF1B高表达主要在细胞周期、同源重组、错配修复、碱基切除修复等通路存在富集,ASF1B低表达主要在ECM受体相互作用和Hedgehog信号通路上富集.〔结论〕ASF1B低表达水平可作为胃癌患者预后不佳的独立因素,评估ASF1B的表达可能有助于预测患者预后.     

基于数据库分析TRIM31在肺腺癌中表达及临床意义

目的阐明TRIM31在肺腺癌中表达及临床意义。方法通过Oncomine数据库获取和分析TRIM31在肺腺癌和正常组织中的表达。从UALCAN数据库分析TRIM31表达和与之相关的临床病理特征关系。在Kaplan-Meier Plotter数据库分析TRIM31基因表达和肺腺癌预后的关系。结果 TRIM31在肺腺癌的癌组织和正常组织中的表达存在差异(P<0.01)。TRIM31表达在肺腺癌各个分期之间有显著差异,男性患者的表达水平高于女性患者(P<0.01)。TRIM31表达越高,生存状态较差。此外,TRIM31高表达的女性患者预后较差(P<0.01)。结论 TRIM31在肺腺癌组织中表达高于正常组织,与患者性别、肺腺癌分期和预后有关。     

基于生物信息学分析SGOL1在肺腺癌中的表达及预后价值

目的 通过生物信息学方法分析Shugoshin-1（SGOL1）在肺腺癌中的表达及预后价值。方法 从癌症基因组图谱数据库中下载肺腺癌组织和正常组织的表达谱数据和临床资料,并对SGOL1进行表达差异分析和临床相关性分析。使用R包“pROC”绘制受试者操作特征曲线（receiver operator characteristic curve,ROC曲线）评估SGOL1表达对肺腺癌患者临床诊断预测的准确性;利用R包“survival”“survminer”和单因素及多因素Cox回归分析评估SGOL1表达对肺腺癌患者预后的影响;通过检索肿瘤免疫单细胞中心和TIMER2.0数据库,分析肺腺癌中SGOL1的表达分布及与免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库对SGOL1及其共表达进行功能富集分析;利用交互作用基因/蛋白质检索工具构建SGOL1的蛋白质–蛋白质相互作用网络。结果 与正常组织比较,肿瘤组织的SGOL1表达量显著上调（P<0.001）;与癌旁组织比较,肿瘤组织的SGOL1表达量显著上调（P<0.001）。在肺腺癌的不同临床病理分期中,与Ⅰ期比较,Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期的SGOL1显著高表达（P<0.05）。ROC曲线显示,SGOL1对肺腺癌患者具有良好的诊断效能,曲线下面积为0.959（95%CI：0.942~0.975）。SGOL1高表达组患者的总生存期、疾病特异生存期、无病生存期和无瘤间期均较SGOL1低表达组显著缩短（P<0.05）。单因素及多因素Cox回归分析结果表明,临床分期（HR=1.629,P<0.001）和SGOL1表达水平（HR=1.447,P=0.002）与肺腺癌患者的预后较差相关,可作为肺腺癌患者预后的独立危险因素。SGOL1表达水平与B细胞、CD4+T细胞和树突状细胞的浸润水平呈显著负相关（P<0.05）,与巨噬细胞、CD8+T细胞和中性粒细胞的浸润水平呈显著正相关（P<0.05）。富集分析显示,SGOL1可能在有丝分裂、细胞周期、p53信号通路和氨基酸代谢等途径中发挥作用。蛋白质-蛋白质相互作用网络分析提示SGOL1与CBX1、PPP2CA、PPP2R5C、CDCA8、ESPL1、PPP2R1A、BUB1、PPP2R5A、SGO2、CDC20等多个分子关系密切。结论 SGOL1在肺腺癌组织中高表达,且与肺腺癌患者的预后较差相关。SGOL1可作为预测肺腺癌患者预后的生物标志物之一。     

基于生物信息学分析乳酸脱氢酶A在肺腺癌中的表达及其临床意义

目的 探讨乳酸脱氢酶A(LDHA)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义.方法 利用GE-PIA2和Oncomine数据库挖掘LDHA基因在LUAD中的表达信息;人类蛋白质表达图谱(HPA)数据库分析LDHA蛋白表达;Ucalcan平台分析LDHA与LUAD临床病理特征的关系;Kaplan-Meier法分析该基因与L...     

B7-H3上调IL-22表达在肺腺癌中的临床意义

目的 探讨协同信号分子B7-H3对白介素22(IL-22)的表达调控及其在肺腺癌中的临床意义.方法 采用CRISPR/Cas9技术敲除肺腺癌A549细胞B7-H3基因(A549/KO),同时收集56例肺腺癌患者血清,酶联免疫吸附实验(ELISA)分别检测A549/KO培养上清液和患者血清中的IL-22水平,并检测患者血清中可溶性B7-H3(sB7-H3)含量.分析sB7-H3与IL-22的相关性,建立Logistic回归模型对肺腺癌的危险因素进行预测,并采用受试者工作特征曲线(ROC)探讨sB7-H3、IL-22在肺腺癌诊断中的价值.结果 A549/KO细胞上清液IL-22表达水平较野生型A549降低(P＜0.05).肺腺癌患者血清sB7-H3和IL-22的表达水平高于健康对照组(P＜0.05).肺腺癌患者血清sB7-H3和IL-22的表达水平与pT分期、淋巴结是否转移及pTNM分期有关(P＜0.05),且sB7-H3和IL-22的表达水平呈正相关(rs=0.316,P＜0.05).通过多因素Logistic回归分析鉴定sB7-H3(OR=1.423,95％ CI:1.139～1.778)、IL-22(OR=1.108,95％ CI:1.001～1.228)为肺腺癌的危险因素,两者可作为肺腺癌诊断指标.ROC曲线分析表明,IL-22和sB7-H3联合检测(AUC =0.827,95％CI:0.727～0.903)对肺腺癌的诊断性能高于sB7-H3 (AUC=0.795,95％ CI:0.690～0.877)和IL-22 (AUC=0.766,95％CI:0.658～0.853)单项检测.结论 B7-H3可通过上调IL-22表达在肺腺癌的发生与发展中发挥作用,联合检测血清sB7-H3和IL-22有助于肺腺癌的诊断与监测.     

ZNF224和DEPDC1在肺腺癌中的表达及其临床意义

目的探究锌指蛋白224(ZNF224)、DEP结构域蛋白1(DEPDC1)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。 方法收集73例LUAD组织及相应的癌旁组织。采用qRT-PCR法测定LUAD组织、癌旁组织ZNF224、DEPDC1 mRNA相对表达量。免疫组化法测定LUAD组织、癌旁组织ZNF224、DEPDC1蛋白表达情况。分析LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA及其蛋白与LUAD临床病理特征的关系；Pearson相关性分析LUAD组织ZNF224 mRNA及其蛋白分别与DEPDC1 mRNA及其蛋白的相关性；Kaplan-Meier生存曲线法分析LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA表达与LUAD预后的关系；COX回归法分析影响LUAD患者预后的因素。 结果LUAD组织ZNF224、DEPDC1 mRNA表达及其蛋白表达阳性率均高于癌旁组织(P＜0.05)。LUAD组织TNM分期、分化程度、淋巴结转移,ZNF224低表达组与高表达组、DEPDC1低表达组与高表达组比较,差异均有显著性(P＜0.05)。LUAD组织中ZNF224 mRNA和蛋白表达分别与DEPDC1 mRNA和蛋白表达呈正相关(P＜0.05)；ZNF224、DEPDC1 mRNA低表达组LUAD患者累积生存率分别高于其高表达组(P＜0.05)。TNM分期、ZNF224 mRNA、DEPDC1 mRNA、淋巴结转移是影响LUAD患者不良预后的独立危险因素(P＜0.05)。 结论LUAD组织ZNF224、DEPDC1表达较高,二者呈正相关,且均与LUAD患者预后关系密切,有望作为评估LUAD患者预后的潜在标志物。     

白细胞介素-32在肺腺癌中的表达及临床意义

 【目的】检测人肺腺癌组织中白细胞介素-32 (IL-32) 的表达,并探讨其表达的临床意义。 【方法】采用免疫组化（IHC）的方法检测60例肺腺癌患者的肿瘤组织IL-32的表达情况,分析其表达水平与患者临床病理因素及预后的关系。【结果】免疫组化结果显示IL-32在肺腺癌组织中的强阳性率及总阳性率分别为48.3%（29/60）和85%（51/60）,IL-32表达水平与患者的临床分期、淋巴结及远处转移正相关（P<0.05）,生存分析显示IL-32高表达组与低表达组相比,5年生存率显著降低（P<0.01）,Cox 比例风险回归模型显示,IL-32表达状态是影响肺腺癌患者总体生存期的独立危险因素之一（P<0.01）。【结论】肺腺癌组织中IL-32表达与侵袭转移及预后有关,可能成为判断肺腺癌患者预后的有效分子标志物。     

Pax-9在肺腺癌患者血清中的表达及临床意义

目的 探讨配对盒基因9 (Pax-9)在肺腺癌患者血清中的表达及临床意义.方法 采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定30例肺腺癌患者血清中Pax-9的浓度,同时检测48例良性肺病变(慢性阻塞性肺疾病、肺炎)患者和32例健康者血清中Pax-9的浓度以作为对照.并分析其表达与患者临床病理特征及患者预后的关系.结果 肺腺癌患者血清中Pax-9的浓度[(147.9±91.7)ng/mL]明显高于肺良性病变患者血清中Pax-9的浓度[(95.2±42.4)ng/mL]和健康对照组血清中的浓度[(103.6±56.4)ng/mL],差异有统计学意义(P＜0.05).Pax-9的表达水平与患者性别、年龄、吸烟史及淋巴转移等临床病理特征无关(P＞0.05),与肿瘤TNM分期显著相关,血清中Pax-9的浓度随TNM分期而升高,Ⅲ～Ⅳ期[(173.0±94.7)ng/mL]明显高于Ⅰ～Ⅱ期[(97.6±63.2)ng/mL] (P＜0.05).Kaplan-Meier分析显示,Pax-9高表达组患者的中位生存时间为22.5个月,低于低表达组患者的中位生存时间24.0个月,差异有统计学意义(P＜0.05).COX回归分析显示,TMN分期和Pax-9表达对肺腺癌患者预后具有显著意义(P＜0.05).结论 Pax-9在肺癌的发生发展中起一定作用,检测其血清含量对肺癌的诊断具有一定的临床意义,其过高表达有可能作为腺癌预后不良的评估指标.     

GPRC5A基因在肺腺癌中的表达及临床意义

目的了解G蛋白偶联受体C型家族5A（GPRC5A）基因在肺腺癌组织及癌旁正常组织中的表达,并探讨其临床意义。方法分别采用Real-timePCR和Westernblot法检测25例肺腺癌组织及癌旁正常组织GPRC5AmRNA和蛋白表达水平。应用免疫组化法检测93例肺腺癌组织及癌旁正常组织GPRC5A蛋白的表达情况,并分析GPRC5A蛋白的表达与临床病理特征及预后的关系。结果25例肺腺癌组织中GPRC5AmRNA和蛋白表达水平均明显低于癌旁正常组织（均P＜0.05）。93例肺腺癌中GPRC5A蛋白低表达率为55.9％,均表达在胞质和胞膜中。GPRC5A蛋白的表达与肿瘤分化程度、TNM分期及淋巴结转移均有关（均P＜0.05）,而与性别、年龄、肿瘤大小均无关（均P＞0.05）。Kaplan-Meier生存曲线显示,GPRC5A高表达的患者3年生存率为73.7%,高于低表达患者的39.4%,差异有统计学意义（P＜0.01）。结论GPRC5A在肺腺癌组织中低表达,其低表达与肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结转移及预后密切相关,可作为估计生存率的独立指标。     

NDRG1、P21及VEGF在肺腺癌组织中的表达及临床意义

目的: 观察N-myc下游调节基因1(N-myc downstream regulated gene1,NDRG1)、P21及血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)基因在肺腺癌中的表达及在肺腺癌发生、发展中的作用及意义。方法: 应用免疫组织化学法检测20例正常肺组织和94例肺腺癌组织中NDRG1、P21及VEGF蛋白的表达情况,并分析三者表达与临床病理参数及患者预后的相关性。结果：在正常肺组织及肺腺癌组织中,NDRG1阳性率分别为90.0%(18/20)和52.1%(49/94),P21阳性率分别为80.0%(16/20)和33.0%(31/94),VEGF阳性率分别为20.0%(4/20)和53.2%(50/94),3种蛋白阳性率比较差异均具有统计学意义(P均<0.05)。肺腺癌组织中NDRG1、P21及VEGF的表达与肺腺癌患者年龄、性别、组织分化程度及TNM分期均无相关性(P均＞0.05),而与淋巴结转移明显相关(P＜0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示,NDRG1、P21和VEGF表达与生存明显相关(P均＜0.01)。结论：肺腺癌组织中NDRG1和P21表达下调,而VEGF表达上调,联合检测三者的表达可能对判断预后具有重要价值。     

B7-H1在卵巢浆液性囊腺癌中的表达及临床意义

探讨B7-H1蛋白的表达水平与卵巢浆液性囊腺癌患者临床病理学特征及预后的关系,及其对卵巢浆液性肿瘤的早期诊断和临床靶向治疗的应用前景。方法应用免疫组织化学(IHC)PV-9000二步法检测80例卵巢浆液性肿瘤标本中(40例浆液性囊腺癌、20例浆液性交界性囊腺瘤、20例浆液性囊腺瘤)B7-H1蛋白的表达水平。结果 B7-H1蛋白在浆液性囊腺癌、浆液性交界性囊腺瘤、浆液性囊腺瘤标本中阳性表达率分别为77.5%、30.0%、15.0%,三者比较差异有统计学意义(χ2=25.10,P=0.000)。B7-H1蛋白在浆液性囊腺癌中的表达与临床分期有关(P<0.05),与患者年龄、病理分级、肿瘤大小、腹水细胞学和淋巴结转移无关(P>0.05)。Kaplan-Meier单因素生存分析表明临床分期(P=0.021)、B7-H1蛋白(P=0.000)为影响卵巢浆液性囊腺癌患者预后的因素。结论 B7-H1蛋白与卵巢浆液性囊腺癌的发生、发展有关,可作为对其进行早期诊断及预后评估的重要参考指标。更多还原